#Contains_Novel_or_Only_Known(Annotated)_Junctions as_event_type gene_name chr strand exclusion_junctions inclusion_junctions exclusion_exons inclusion_exons intron-exon_junctions neighboring_constitutive_exons virtual Untreated CG10203 CG10851 CG17136 CG1987 CG4602 CG5442 CG5655 CG10377 CG12749 CG13425 CG16901 CG17838 CG18426 CG30122 CG31000 CG6946 CG7437 CG9373 CG9983 CG10279 CG1646 CG3312 CG6227 CG5836 CG6841 CG8241 CG8749 CG1101 CG1559 CG16788 CG8781 CG10128 CG10328 CG11266 CG18350 CG3584 CG4262 CG5422 CG6049 CG7878 CG7971 CG8019 CG8912 CG9412 CG31716 CG32423 CG3249 CG33106 CG4760 CG4816 CG4878 CG5170 CG5821 CG6203 CG6779 CG8636 combined_pval K alternative_last_exon cpx,RI_chr3R_124308_128247,I_chr3R_125269_125511 chr3R + chr3R_124308_128247 chr3R_124308_125511 chr3R_128248_129383 chr3R_125512_127409 chr3R_124243_124307 50.00 NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02299 K alternative_last_exon Bet3,Nf-YA chr3L - chr3L_9432661_9435223 chr3L_9435067_9435223 chr3L_9432250_9432660 chr3L_9433156_9435066 chr3L_9435224_9435352 53.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.85 NA 42.42 NA NA 65.62 NA NA NA NA 70.00 73.73 NA NA 39.29 34.29 40.91 66.22 73.33 NA NA NA 75.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.37 NA NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon mav,RI_chr4_645290_646129 chr4 - chr4_645290_646129 chr4_645568_646129 chr4_643677_645289 chr4_645398_645567 chr4_646130_646229 66.67 NA NA NA NA NA NA 94.12 84.00 NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA 90.00 NA NA 37.50 NA 40.00 NA 40.00 44.44 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA 42.86 NA 3.1815743497238837e-28 K alternative_last_exon CG31064,RI_chr3R_23056388_23064246,I_chr3R_23069667_23070365 chr3R - chr3R_23056388_23058194 chr3R_23057831_23058194,chr3R_23057922_23058194 chr3R_23056290_23056387 chr3R_23056483_23057830 chr3R_23058195_23058597 15.38 NA NA 33.33 NA NA 37.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.8166321919999987e-21 K alternative_last_exon spn-B,RI_chr3R_10154615_10155360 chr3R + chr3R_10154615_10155360 chr3R_10154615_10154667 chr3R_10155361_10155771 chr3R_10154668_10155346 chr3R_10154515_10154614 60.00 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.67 77.78 NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0907232928000003e-15 K alternative_last_exon 4EHP,RI_chr3R_19927769_19928262,Syx1A chr3R - chr3R_19890053_19932546 chr3R_19927769_19932546 chr3R_19889904_19890052 chr3R_19927017_19927768 chr3R_19932547_19933006 14.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon mbl,CEI_chr2R_13153717_13238598,I_chr2R_13163569_13203579 chr2R + chr2R_13163569_13193491;chr2R_13163569_13238598 chr2R_13163569_13183339 chr2R_13193492_13193737;chr2R_13238599_13238769 chr2R_13183340_13186065 chr2R_13163469_13163568 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG1407,RI_chr2R_5918952_5919093 chr2R - chr2R_5916563_5918589 chr2R_5917764_5918589 chr2R_5915948_5916562 chr2R_5916731_5917763 chr2R_5918590_5918719 80.00 NA NA NA NA NA 68.66 NA NA 91.11 NA NA NA 69.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon gpp,I_chr3R_2271795_2272181 chr3R + chr3R_2270033_2272181 chr3R_2270033_2271256 chr3R_2272182_2273729 chr3R_2271257_2271735 chr3R_2269544_2270032 33.63 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 46.73 65.31 45.61 NA 49.02 45.83 NA 48.33 NA 44.44 15.52 NA NA NA NA NA NA 19.32 NA NA NA NA NA NA NA 23.46 NA NA NA NA NA 46.00 NA 18.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG17490,RI_chr2L_22433057_22433102 chr2L + chr2L_22433057_22433102;chr2L_22433057_22440271 chr2L_22433057_22433109 chr2L_22440272_22441190 chr2L_22433110_22434093 chr2L_22432957_22433056 64.29 NA NA 75.86 NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA 75.00 NA 84.29 NA NA NA 78.12 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA 28.57 NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.51 83.33 NA NA NA NA NA NA 83.33 NA 0.0 K alternative_last_exon CdGAPr,fs(2)ltoPP43,E_chr2L_19794633_19794811 chr2L - chr2L_19793403_19794582 chr2L_19794309_19794582 chr2L_19793224_19793402 chr2L_19793486_19794308 chr2L_19794583_19794632 21.88 NA NA 45.45 NA NA 33.87 37.50 NA 9.09 35.71 NA 36.36 35.29 NA 45.90 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 34.78 39.47 NA NA NA NA NA 32.26 NA NA 11.59 NA 8.47 NA NA NA NA NA NA NA NA 9.82 NA 32.73 NA NA NA NA NA NA NA 10.32 0.0 K alternative_last_exon CG6364,I_chr3R_20116610_20116825 chr3R + chr3R_20116875_20118559 chr3R_20116875_20117233 chr3R_20118560_20118691 chr3R_20117234_20118452 chr3R_20116826_20116874 96.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0226880000000001e-06 K alternative_last_exon CG31619 chr2L + chr2L_21717673_21719513 chr2L_21717673_21717740 chr2L_21719514_21719643 chr2L_21717741_21718083 chr2L_21717561_21717672 4.48 NA NA NA NA NA 17.11 NA NA NA 50.00 NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon stai,I_chr2L_6110225_6121773 chr2L + chr2L_6122411_6122977 chr2L_6122411_6122697 chr2L_6122978_6124729 chr2L_6122698_6122853 chr2L_6122264_6122410 95.35 NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.75 NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA 84.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Sin3A,I_chr2R_8465791_8466633,I_chr2R_8473578_8480185,RI_chr2R_8479951_8480233 chr2R - chr2R_8465791_8466633;chr2R_8465159_8466633,chr2R_8465215_8466633 chr2R_8466057_8466633 chr2R_8464959_8465158 chr2R_8465875_8466056 chr2R_8466634_8466733 44.44 NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016458 K alternative_last_exon CG6151,RI_chr3L_15803949_15805547,I_chr3L_15806727_15808816 chr3L - chr3L_15804494_15806345;chr3L_15803949_15806345 chr3L_15805342_15806345,chr3L_15805998_15806345 chr3L_15804425_15804493;chr3L_15803213_15803948 chr3L_15805029_15805341 chr3L_15806346_15806453 4.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG3566 chrX - chrX_6169204_6170260 chrX_6169424_6170260 chrX_6169003_6169203 chrX_6169263_6169423 chrX_6170261_6170329 10.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.2463369999999997e-06 K alternative_last_exon CG12163,I_chr3R_1068862_1077145,RI_chr3R_1069977_1077139 chr3R - chr3R_1065342_1077139 chr3R_1069977_1077139 chr3R_1065214_1065341 chr3R_1068874_1069976 chr3R_1077140_1077239 16.67 NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00059847393000000005 K alternative_last_exon I_chr3R_17177101_17200781,mod(mdg4),RI_chr3R_17183087_17183726,I_chr3R_17183481_17200781 chr3R - chr3R_17183087_17183726 chr3R_17183481_17183726 chr3R_17182777_17183086 chr3R_17183198_17183480 chr3R_17183727_17183826 97.70 NA NA NA NA NA 85.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7636400000000001e-12 K alternative_last_exon sgg,I_chrX_2565856_2566099,I_chrX_2566157_2566946 chrX + chrX_2567652_2571133 chrX_2567652_2568629 chrX_2571134_2572136 chrX_2568630_2570701 chrX_2567208_2567651 94.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0029940000000000001 N alternative_last_exon CG6701,RI_chr2R_9866896_9867532,noncoding_6685 chr2R - chr2R_9866896_9867532,chr2R_9866924_9867532 chr2R_9867449_9867532 chr2R_9866689_9866895 chr2R_9867114_9867448 chr2R_9867533_9867623 18.07 NA NA 29.03 NA NA 32.28 31.25 NA NA NA NA 33.71 28.72 NA 40.13 NA NA 30.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.14 NA NA 6.42 NA 6.67 NA NA NA 30.00 NA 6.45 NA NA NA 28.65 NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon RI_chr3R_5165997_5180143,CG33936,noncoding_15544,I_chr3R_5167726_5180143,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5167726_5180143 chr3R_5167726_5167941 chr3R_5180144_5180805 chr3R_5167942_5168213 chr3R_5167626_5167725 91.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 71.43 NA NA NA NA 80.00 56.52 NA NA NA 71.43 70.27 NA NA NA 44.44 68.75 55.56 NA NA NA NA NA 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA 72.00 NA NA 66.67 NA 0.0 K alternative_last_exon RI_chr3L_21188731_21188785,CG33054,CG33056,noncoding_13933 chr3L - chr3L_21191204_21195847 chr3L_21193615_21195847 chr3L_21190860_21191203 chr3L_21193095_21193614 chr3L_21195848_21195859 62.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 73.68 NA 40.91 NA NA 41.18 NA 83.33 NA 40.00 NA NA 75.00 46.15 NA NA NA 48.08 NA NA 36.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.94 NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon alpha-Cat,I_chr3L_23319861_23321813,I_chr3L_23327841_23328002 chr3L - chr3L_23319861_23320593 chr3L_23320425_23320593 chr3L_23319788_23319860 chr3L_23320164_23320424 chr3L_23320594_23320745 2.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0019940000000000001 K alternative_last_exon CG7029,CG7023 chr3R + chr3R_18592449_18612727 chr3R_18592449_18600470 chr3R_18612728_18614239 chr3R_18600471_18602096 chr3R_18592333_18592448 20.29 NA NA NA NA NA 9.36 NA NA 10.10 NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA 7.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.78 NA NA 33.94 NA NA NA 43.66 NA 35.29 32.76 NA 0.0 K alternative_last_exon skpA chrX + chrX_550433_551131 chrX_550433_550492 chrX_551132_551981 chrX_550493_550817 chrX_550426_550432 12.50 NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.93 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA 81.25 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 28.12 29.17 NA NA NA NA 32.35 NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.08 0.0 K alternative_last_exon noncoding_16269,I_chr3R_8192634_8193249,GstD1 chr3R - chr3R_8192634_8194924 chr3R_8194298_8194924,chr3R_8194316_8194924 chr3R_8191413_8192633 chr3R_8193539_8194297 chr3R_8194925_8194962 97.10 NA NA 82.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon ird1 chr3R - chr3R_5068175_5068554 chr3R_5068423_5068554 chr3R_5067541_5068174 chr3R_5068252_5068422 chr3R_5068555_5068768 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0044869999999999997 K alternative_last_exon Not1,I_chr2R_5463624_5463682 chr2R - chr2R_5455592_5456067 chr2R_5455881_5456067 chr2R_5455002_5455591 chr2R_5455668_5455880 chr2R_5456068_5456427 7.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG30115 chr2R - chr2R_14448674_14498185 chr2R_14488891_14498185 chr2R_14447029_14448673 chr2R_14488607_14488890 chr2R_14498186_14498559 4.76 NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018322611999999999 K alternative_last_exon Pi3K68D,F_chr3L_11781319_11782640 chr3L - chr3L_11778216_11780157 chr3L_11779740_11780157 chr3L_11777502_11778215 chr3L_11779077_11779739 chr3L_11780158_11780210 9.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA 21.05 NA 27.78 26.32 NA 2.2615312500000001e-14 K alternative_last_exon mura,I_chr3R_5373093_5376618,RI_chr3R_5373093_5377292,CR42549,noncoding_15610,I_chr3R_5375533_5376618,RI_chr3R_5380786_5380850 chr3R - chr3R_5373093_5377037 chr3R_5375533_5377037 chr3R_5372520_5373092 chr3R_5373826_5375532 chr3R_5377038_5377079 66.67 NA NA 40.00 NA NA NA 40.00 20.00 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA 46.15 NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG7341,noncoding_13313,CG32195 chr3L + chr3L_18106282_18112890,chr3L_18106282_18112871;chr3L_18106282_18106718 chr3L_18106282_18107468 chr3L_18112891_18114107;chr3L_18106719_18107164 chr3L_18107469_18107857 chr3L_18106149_18106281 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG33691_CG33692,CG33691,noncoding_22320 chrX + chrX_6766955_6771946 chrX_6766955_6768354 chrX_6771947_6772516 chrX_6768355_6768589 chrX_6766749_6766954 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA 35.59 NA 34.92 NA NA 33.96 7.35 NA NA 8.70 NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA 7.59 9.72 NA 10.26 NA NA NA NA NA NA 36.11 NA NA NA 38.03 NA NA NA NA NA NA 34.09 39.51 0.0 K alternative_last_exon CG8290 chr2R + chr2R_7860546_7862860 chr2R_7860546_7861062 chr2R_7862861_7865261 chr2R_7861063_7862013 chr2R_7860092_7860545 37.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.50 NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon shi,RI_chrX_15786633_15786860,RE_chrX_15793108_15795563 chrX + chrX_15796366_15799806 chrX_15796366_15797822 chrX_15799807_15800799 chrX_15797823_15799280 chrX_15796223_15796365 25.93 NA NA 41.00 NA NA NA 43.10 39.74 11.63 NA NA 46.43 39.68 NA 42.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.49 NA NA 12.24 10.92 36.52 NA 14.29 NA NA NA NA 10.68 NA 37.25 NA 11.65 14.29 NA 12.86 38.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 9.94 0.0 K alternative_last_exon mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179,CE_chr3L_21915743_21915791 chr3L + chr3L_21914428_21918279 chr3L_21914428_21915678 chr3L_21918280_21922977 chr3L_21915679_21917258 chr3L_21914193_21914427 72.00 NA NA 61.36 NA NA 58.82 NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA 85.00 NA NA NA 57.14 58.82 NA NA NA NA 82.14 NA NA 54.55 NA NA NA 59.09 55.88 NA 51.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.16 0.0 K alternative_last_exon ttk,I_chr3R_27554202_27554334,I_chr3R_27554601_27555353 chr3R + chr3R_27554202_27558641 chr3R_27554202_27555353 chr3R_27558642_27562961 chr3R_27555354_27558585 chr3R_27554114_27554201 67.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.72 NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA 56.32 NA 0.0 K alternative_last_exon olf186-F,CG30323 chr2R + chr2R_13738966_13746762;chr2R_13738966_13742644 chr2R_13738966_13745146 chr2R_13746763_13748712;chr2R_13742645_13743293 chr2R_13745147_13745302 chr2R_13738563_13738965 86.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 70.00 NA 67.39 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Idh,I_chr3L_8351006_8351949,I_chr3L_8351036_8351655 chr3L - chr3L_8351006_8351949 chr3L_8351816_8351949 chr3L_8348244_8351005 chr3L_8351656_8351815 chr3L_8351950_8351962 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA 28.57 77.27 NA NA 80.00 NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2234323065669616e-15 K alternative_last_exon ETHR chr3R + chr3R_17085610_17089741 chr3R_17085610_17087541 chr3R_17089742_17090954 chr3R_17087542_17089738 chr3R_17085600_17085609 35.71 NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 23.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0059663400000001e-09 K alternative_last_exon CREG,RI_chr3R_13220037_13220257 chr3R - chr3R_13219323_13219537 chr3R_13219477_13219537 chr3R_13216812_13219322 chr3R_13219329_13219476 chr3R_13219538_13219983 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA 1.0782693000000001e-07 K alternative_last_exon CG11876,CG11877 chr3R + chr3R_24939878_24940815 chr3R_24939878_24940150 chr3R_24940816_24941227 chr3R_24940151_24940729 chr3R_24939716_24939877 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.07 0.0 K alternative_last_exon Hrs,I_chr2L_2740474_2741107 chr2L + chr2L_2740474_2741107 chr2L_2740474_2740519 chr2L_2741108_2741482 chr2L_2740520_2741097 chr2L_2740389_2740473 95.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon AP-1sigma,I_chr3R_19786283_19787772 chr3R + chr3R_19785316_19787772;chr3R_19785316_19785614 chr3R_19785316_19786619 chr3R_19787773_19788299;chr3R_19785615_19785954 chr3R_19786620_19787225 chr3R_19785178_19785315 52.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Pax,RI_chr2L_19401373_19409403,RI_chr2L_19404683_19426205,RI_chr2L_19404823_19409403 chr2L - chr2L_19401373_19403998 chr2L_19403717_19403998 chr2L_19400737_19401372 chr2L_19402994_19403716 chr2L_19403999_19404682 18.01 NA NA 4.09 NA NA NA NA NA 33.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.35 NA NA NA NA NA 7.26 NA 7.69 4.63 NA 0.0 K alternative_last_exon Nf1 chr3R + chr3R_21819207_21820288 chr3R_21819207_21819386 chr3R_21820289_21821459 chr3R_21819387_21819934 chr3R_21819041_21819206 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 68.00 NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 0.0 K alternative_last_exon fru chr3R - chr3R_14252889_14256553;chr3R_14243023_14256553 chr3R_14248905_14256553 chr3R_14251658_14252888;chr3R_14241177_14243022 chr3R_14245340_14248904 chr3R_14256554_14256686 26.39 NA NA 40.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Psi,I_chr2R_12751549_12752073,I_chr2R_12753387_12753659 chr2R - chr2R_12751557_12752073,chr2R_12751549_12752073;chr2R_12749115_12752073 chr2R_12751609_12752073 chr2R_12748962_12749114 chr2R_12749604_12751608 chr2R_12752074_12752173 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035119999999999999 K alternative_last_exon RI_chr3R_19759126_19759198,Gdh,E_chr3R_19762765_19768309 chr3R - chr3R_19762368_19763144 chr3R_19762742_19763144 chr3R_19759199_19762367 chr3R_19762673_19762741 chr3R_19763145_19763349 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0078440000000000003 K alternative_last_exon alpha-Spec,dlt chr3L - chr3L_1789102_1795198 chr3L_1793501_1795198 chr3L_1789017_1789101 chr3L_1789625_1793500 chr3L_1795199_1795295 18.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 30.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.18 NA NA NA 29.03 NA NA NA 6.06 31.37 37.50 35.42 NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA 36.36 NA 0.0 K alternative_last_exon AnnIX chr3R + chr3R_16894742_16896445,chr3R_16894742_16895999 chr3R_16894742_16895034 chr3R_16896446_16896707 chr3R_16895035_16895629 chr3R_16894560_16894741 37.43 NA NA NA NA NA NA NA NA 51.25 47.86 NA 72.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.99 NA 55.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.52 NA NA NA NA NA NA NA 47.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon spi,I_chr2L_19569183_19577185,I_chr2L_19569227_19572142,I_chr2L_19569227_19577173 chr2L - chr2L_19569227_19572499 chr2L_19571768_19572499 chr2L_19567812_19569226 chr2L_19571572_19571767 chr2L_19572500_19572711 65.79 85.48 76.32 50.94 81.25 NA NA NA 50.00 22.00 NA NA 52.00 41.03 NA 78.43 86.67 88.46 NA 78.65 89.66 42.11 NA 77.27 50.00 NA NA 36.84 51.28 84.91 NA 54.76 NA NA NA 81.08 36.67 NA NA 38.79 NA NA 84.62 47.37 NA NA NA NA NA 51.81 78.90 NA 44.44 51.04 NA NA NA 84.31 0.0 K alternative_last_exon lola,I_chr2R_6375932_6376866,RI_chr2R_6376649_6376866,I_chr2R_6421474_6423519,I_chr2R_6421904_6422354 chr2R - chr2R_6375932_6376866 chr2R_6376649_6376866 chr2R_6374902_6375931 chr2R_6376160_6376648 chr2R_6376867_6376966 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00016337389200000001 K alternative_last_exon Nhe2,I_chr2L_21122390_21122912 chr2L + chr2L_21129083_21132033 chr2L_21129083_21131230 chr2L_21132034_21135233 chr2L_21131231_21131463 chr2L_21128779_21129082 19.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.10 NA NA 32.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 3.70 NA NA 7.50 NA 0.0 N alternative_last_exon FI_chr3R_217971_221193,CG34112,I_chr3R_223384_223429 chr3R - chr3R_217971_219549 chr3R_219491_219549 chr3R_217902_217970 chr3R_219263_219490 chr3R_219550_220119 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 0.0076249999999999998 K alternative_last_exon CG18170,CG33230,ABCB7 chr3L + chr3L_1618618_1620427 chr3L_1618618_1618847 chr3L_1620428_1621042 chr3L_1618848_1620269 chr3L_1618392_1618617 60.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.19 NA 81.25 NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA 76.17 NA NA NA NA NA NA NA NA 49.29 48.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG8043,CG11755 chr3R + chr3R_4502770_4503994 chr3R_4502770_4502843,chr3R_4502770_4502834,chr3R_4502770_4502817,chr3R_4502770_4502810 chr3R_4503995_4504677 chr3R_4502844_4503955 chr3R_4502645_4502769 74.00 NA NA 58.02 NA NA NA NA NA 84.85 NA NA NA NA NA 57.33 NA NA NA NA NA NA 62.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.21 84.95 84.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Atf6,noncoding_4459 chr2R + chr2R_1032364_1040293 chr2R_1032364_1035705,chr2R_1032364_1035679 chr2R_1040294_1044872 chr2R_1035706_1036661 chr2R_1032236_1032363 93.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Spargel,RI_chr3R_252723_254271,noncoding_14534 chr3R - chr3R_252723_254696 chr3R_254346_254696 chr3R_252604_252722 chr3R_254272_254345 chr3R_254697_254925 38.10 NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 80.33 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG32521,I_chrX_21077138_21082106,I_chrX_21077612_21082713,EI_chrX_21080561_21082106,I_chrX_21080906_21082713,CREF_chrX_21082827_21152068,EF_chrX_21094675_21152068 chrX - chrX_21080561_21082106;chrX_21077612_21082106 chrX_21080906_21082106 chrX_21076245_21077611 chrX_21080124_21080905 chrX_21082107_21082206 7.72 NA NA NA NA NA 19.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon rdgB chrX + chrX_13668012_13668718;chrX_13668012_13670708 chrX_13668012_13669465 chrX_13670709_13670860 chrX_13669466_13670309 chrX_13667839_13668011 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA 4.35 NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA 10.00 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA 8.4761662098116071e-18 K alternative_last_exon br,I_chrX_1517022_1518170,chrX_1531825_1532171.0,chrX_1532359_1533289.0,chrX_1533577_1534629.0,chrX_1535554_1536485.0 chrX + chrX_1531368_1548424;chrX_1531368_1552820;chrX_1531368_1541397 chrX_1531368_1537100,chrX_1531368_1536917 chrX_1548425_1550023;chrX_1552821_1559444;chrX_1541398_1544171 chrX_1537101_1539195 chrX_1531317_1531367 23.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_last_exon CG12576,RI_chrX_21878289_21882347,I_chrX_21882735_21883714 chrX - chrX_21880638_21882347;chrX_21878289_21882347 chrX_21879320_21882347 chrX_21873185_21878288 chrX_21879015_21879319 chrX_21882348_21882447 84.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon PGRP-LC,E_chr3L_9335847_9338977 chr3L + chr3L_9338168_9339690;chr3L_9338168_9338708 chr3L_9338168_9340739 chr3L_9339691_9339845;chr3L_9338709_9338860 chr3L_9340740_9341541 chr3L_9338000_9338167 12.50 NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00022492344 K alternative_last_exon CG17598 chrX - chrX_21935505_21938689 chrX_21936673_21938689 chrX_21934692_21935504 chrX_21936107_21936672 chrX_21938690_21938827 4.88 NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000222 K alternative_last_exon CG33232,I_chr3L_2484838_2495010,CG1146,noncoding_10153 chr3L + chr3L_2489010_2490979 chr3L_2489010_2489122 chr3L_2490980_2492659 chr3L_2489123_2489442 chr3L_2488983_2489009 10.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA 0.039086000000000003 K alternative_last_exon CG32579,RI_chrX_16218635_16218688,I_chrX_16218930_16219644 chrX + chrX_16218635_16218688;chrX_16218635_16219644 chrX_16218635_16218709 chrX_16219645_16220700 chrX_16218710_16219210 chrX_16218535_16218634 31.34 NA NA NA NA NA 48.61 NA NA NA NA NA 54.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.90 NA NA NA 19.82 NA NA NA 42.62 NA NA NA NA NA NA NA NA 48.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG34039,noncoding_12577 chr3L + chr3L_14553189_14554958 chr3L_14553189_14553282 chr3L_14554959_14555099 chr3L_14553283_14553864 chr3L_14553171_14553188 32.45 NA NA 5.00 NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA 8.00 NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 70.00 62.50 NA NA 70.00 NA NA NA 66.67 70.00 58.33 NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA 63.64 1.0559751854235924e-36 K alternative_last_exon CG42231,chif,CaBP1 chr2L - chr2L_16343305_16351926 chr2L_16349473_16351926 chr2L_16342428_16343304 chr2L_16343592_16349472 chr2L_16351927_16352093 69.86 NA NA 53.19 NA NA 42.17 NA NA 81.82 NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.94 NA 80.00 NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.95 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.98 NA 0.0 K alternative_last_exon sina chr3L + chr3L_16847053_16849396 chr3L_16847053_16847119 chr3L_16849397_16852050 chr3L_16847120_16847625 chr3L_16846848_16847052 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA 0.0 K alternative_last_exon CG6340,I_chrX_15402291_15403750 chrX + chrX_15377454_15379154 chrX_15377454_15378562 chrX_15379155_15379301 chrX_15378563_15379150 chrX_15377232_15377453 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012400000000000001 K alternative_last_exon Nak chr2L - chr2L_18960681_18962884 chr2L_18962792_18962884,chr2L_18962834_18962884 chr2L_18957720_18960680 chr2L_18961111_18962791 chr2L_18962885_18963115 46.15 NA NA 88.46 NA NA 64.29 62.96 NA 10.00 85.71 57.69 NA NA NA 67.74 NA NA NA NA 62.50 25.00 NA NA NA NA NA 61.54 NA 35.71 NA NA 30.77 56.67 NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA 56.67 NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG3842 chrX + chrX_6233625_6236095 chrX_6233625_6235092 chrX_6236096_6237819 chrX_6235093_6235376 chrX_6233556_6233624 0.00 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01324 K alternative_last_exon CG10512,noncoding_13930,EF_chr3L_21197939_21198776 chr3L + chr3L_21196423_21200535 chr3L_21196423_21198776 chr3L_21200536_21201198 chr3L_21198777_21199726 chr3L_21196220_21196422 97.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K alternative_last_exon CG32425,I_chr3L_20490581_20505036,CG18281,CG17637,CG5078,I_chr3L_20502617_20503129,I_chr3L_20504930_20505036 chr3L + chr3L_20490526_20505036 chr3L_20490526_20503129 chr3L_20505037_20505485 chr3L_20503130_20504251 chr3L_20490481_20490525 15.38 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA 3.33 NA NA 45.45 NA NA NA NA 31.58 NA NA NA 37.50 4.00 35.71 5.26 NA NA 4.17 NA NA NA NA NA NA 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3124113075706186e-30 K alternative_last_exon 5PtaseI,RI_chr3R_20866598_20868366,I_chr3R_20870012_20870243 chr3R - chr3R_20866598_20868947 chr3R_20868404_20868947 chr3R_20866121_20866597 chr3R_20866784_20868403 chr3R_20868948_20869187 75.00 NA NA NA 90.91 NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3201252327828321e-09 K alternative_last_exon CG13784,I_chr2L_7209439_7209522,I_chr2L_7219131_7219918 chr2L - chr2L_7208582_7218908;chr2L_7218854_7218908 chr2L_7209654_7218908 chr2L_7208417_7208581;chr2L_7218643_7218853 chr2L_7209349_7209653 chr2L_7218909_7219130 71.43 NA NA NA NA NA NA NA 53.12 NA NA NA NA 41.18 NA 37.50 NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6805973961864943e-17 K alternative_last_exon plx,noncoding_14842 chr3R + chr3R_1511993_1512878,chr3R_1511993_1512866,chr3R_1511993_1512762 chr3R_1511993_1512510 chr3R_1512879_1513091 chr3R_1512511_1512761 chr3R_1511864_1511992 41.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023229 K alternative_last_exon CG2747,ImpE3 chr3R - chr3R_3850792_3856366 chr3R_3855342_3856366 chr3R_3850375_3850791 chr3R_3853932_3855341 chr3R_3856367_3856455 8.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 27.78 NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA 37.50 NA NA NA NA 42.86 NA NA 20.00 40.00 NA 25.00 20.00 30.00 0.0 K alternative_last_exon CG32177,Krn chr3L - chr3L_17642347_17647091 chr3L_17643727_17647091 chr3L_17640539_17642346 chr3L_17642664_17643726 chr3L_17647092_17647376 30.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.17 45.35 NA NA NA NA NA NA 52.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.91 NA NA NA NA NA NA NA NA 41.79 NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16070910_16073858 chr3L_16070910_16071919 chr3L_16073859_16075246 chr3L_16071920_16072826 chr3L_16070823_16070909 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000100855769 K alternative_last_exon Msp-300,I_chr2L_5197634_5197866,snoRNA:Psi18S-525k,noncoding_1106 chr2L + chr2L_5202303_5203115 chr2L_5202303_5202764 chr2L_5203116_5203742 chr2L_5202765_5202833 chr2L_5199343_5202302 24.49 NA NA NA NA NA 13.97 NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.68 59.49 NA NA NA NA NA 65.08 NA 44.53 NA NA NA NA NA NA 39.82 42.19 NA 42.11 10.87 NA NA 52.86 NA NA NA 12.82 NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA 14.06 0.0 K alternative_last_exon nrm,CG32458 chr3L + chr3L_23023032_23031111 chr3L_23023032_23023918 chr3L_23031112_23031379 chr3L_23023919_23025301 chr3L_23022968_23023031 87.50 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 60.00 NA NA 75.00 NA NA NA 66.67 NA 60.00 60.00 NA 1.6679619539928358e-24 K alternative_last_exon Sug,noncoding_12057 chr3L + chr3L_11677746_11679169 chr3L_11677746_11678378 chr3L_11679170_11679308 chr3L_11678379_11678776 chr3L_11677723_11677745 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010349999999999999 K alternative_last_exon Mvl,E_chr3R_16880765_16881066 chr3R - chr3R_16878968_16881066,chr3R_16879341_16881066;chr3R_16879657_16881066;chr3R_16877965_16881066 chr3R_16880764_16881066 chr3R_16878926_16878967;chr3R_16879584_16879656;chr3R_16877097_16877964 chr3R_16880370_16880763 chr3R_16881067_16881137 4.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG8709,I_chr2R_4026143_4026205,I_chr2R_4027128_4027182,I_chr2R_4027682_4027747,RI_chr2R_4029534_4029599,I_chr2R_4030580_4030746,I_chr2R_4035901_4043493 chr2R - chr2R_4026308_4026442;chr2R_4025188_4026442 chr2R_4026098_4026442 chr2R_4024423_4025187 chr2R_4025458_4026097 chr2R_4026443_4026546 12.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3800000000000001e-10 K alternative_last_exon dlg1,I_chrX_11281967_11282030 chrX + chrX_11281967_11282048;chrX_11281967_11289272 chrX_11281967_11282024,chrX_11281967_11282018 chrX_11289273_11289824 chrX_11282025_11283324 chrX_11281957_11281966 50.00 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA 33.33 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9071966326038385e-10 K alternative_last_exon fru chr3R - chr3R_14256687_14258285 chr3R_14257757_14258285 chr3R_14256430_14256686 chr3R_14256949_14257756 chr3R_14258286_14258540 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA 44.00 NA NA NA 31.82 NA 31.37 38.30 NA 0.0 K alternative_last_exon CG17124,I_chr2L_10753685_10755903,noncoding_2470 chr2L - chr2L_10746079_10755903 chr2L_10754015_10755903 chr2L_10745782_10746078 chr2L_10753677_10754014 chr2L_10755904_10756003 50.00 NA NA NA NA NA NA 72.22 70.37 20.00 NA NA NA 72.22 NA 75.00 NA NA 69.57 67.86 NA 25.53 NA NA 30.43 NA NA 21.88 31.82 NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA 31.25 NA 25.00 NA NA NA 19.23 NA 30.43 NA 69.57 28.00 NA NA NA 18.75 NA 30.00 24.00 NA 8.2526169076020234e-57 K alternative_last_exon Su(var)2-10,RI_chr2R_5006333_5006392 chr2R + chr2R_5006553_5009240;chr2R_5006553_5007257 chr2R_5006553_5008598,chr2R_5006553_5008568,chr2R_5006553_5008282,chr2R_5006553_5007804 chr2R_5009241_5009953;chr2R_5007258_5007336 chr2R_5008599_5008637 chr2R_5006405_5006552 32.43 NA NA 10.34 17.65 NA NA 18.18 NA NA NA NA 15.79 15.79 NA 19.35 NA NA NA NA NA NA 43.59 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.90 NA 45.45 NA NA NA 21.05 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.86 0.0 N alternative_last_exon CG33097,I_chr3R_2191538_2191675,I_chr3R_2199103_2199426 chr3R - chr3R_2188953_2190725 chr3R_2190448_2190725 chr3R_2188560_2188952 chr3R_2190209_2190447 chr3R_2190726_2190876 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_last_exon CG3774,I_chrX_6114220_6114292 chrX + chrX_6114220_6115412 chrX_6114220_6114347,chrX_6114220_6114292 chrX_6115413_6116869 chrX_6114348_6114450 chrX_6114120_6114219 71.43 53.85 NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 58.33 58.82 58.82 NA 61.11 NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 38.10 NA NA NA 57.14 50.00 57.14 56.52 NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA 37.04 0.0 K alternative_last_exon cwo,noncoding_15870,chr3R_6215619_6216520.0,chr3R_6216827_6217291.0,chr3R_6217556_6219555.0,chr3R_6219984_6221958.0 chr3R + chr3R_6215160_6222426,chr3R_6215160_6222423,chr3R_6215160_6222418 chr3R_6215160_6221958 chr3R_6222427_6222542 chr3R_6221959_6222030 chr3R_6214846_6215159 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA 47.83 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9957477234557957e-08 K alternative_last_exon CG8112,RI_chr3R_4539493_4539602,I_chr3R_4545118_4545525 chr3R + chr3R_4539493_4539602;chr3R_4539493_4539867 chr3R_4539493_4539553 chr3R_4539868_4542290 chr3R_4539554_4539826 chr3R_4539393_4539492 3.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_last_exon mmd chrX - chrX_15852624_15856018;chrX_15854946_15856018 chrX_15848478_15856018 chrX_15852351_15852623;chrX_15854840_15854945 chrX_15848319_15848477 chrX_15856019_15856024 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034833999999999997 K alternative_last_exon l(2)03709,I_chr2R_14707617_14707700,I_chr2R_14708048_14708095 chr2R + chr2R_14708789_14709480 chr2R_14708789_14708997,chr2R_14708789_14708994 chr2R_14709481_14709793 chr2R_14708998_14709344 chr2R_14708689_14708788 64.59 NA NA NA NA NA 77.46 NA NA 32.94 75.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA 75.74 78.01 NA NA NA NA NA 52.11 44.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.55 NA NA 52.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_last_exon CG3091,I_chrX_2147635_2147990 chrX - chrX_2145388_2146756 chrX_2146699_2146756 chrX_2145046_2145387 chrX_2145705_2146698 chrX_2146757_2146893 98.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023159999999999999 K alternative_last_exon mRpS5 chr3L + chr3L_24530716_24535509 chr3L_24530716_24531009 chr3L_24535510_24536967 chr3L_24531010_24531353 chr3L_24530497_24530715 28.26 NA NA NA NA NA 13.21 NA NA NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA 46.15 NA NA NA 9.76 1.4583355731647999e-14 K alternative_last_exon CG8165,CG8176,I_chr3R_5348614_5348964 chr3R + chr3R_5341890_5346774 chr3R_5341890_5343982 chr3R_5346775_5347072 chr3R_5343983_5346660 chr3R_5341790_5341889 30.77 NA NA 19.25 NA NA 14.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA 59.32 NA NA NA 46.67 51.02 NA NA NA NA NA 41.76 NA NA NA NA NA 58.00 NA 41.79 NA NA NA NA NA NA 44.68 NA NA 45.88 42.11 0.0 N alternative_last_exon CG14235,noncoding_24847,CG18809,noncoding_24848 chrX - chrX_19635199_19638032 chrX_19637740_19638032 chrX_19634580_19635198 chrX_19637477_19637739 chrX_19638033_19638057 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG33129,I_chr2L_10966410_10967142,noncoding_2515,I_chr2L_10966622_10967108 chr2L - chr2L_10966410_10968133 chr2L_10966622_10968133 chr2L_10965993_10966409 chr2L_10966502_10966621 chr2L_10968134_10968152 97.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.7319490500000001e-08 K alternative_last_exon Sec16,I_chrX_12501913_12502010,I_chrX_12502899_12502973 chrX + chrX_12499422_12501730 chrX_12499422_12499835,chrX_12499422_12499737 chrX_12501731_12501912 chrX_12499836_12499961 chrX_12498897_12499421 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0047200000000000002 K alternative_last_exon kay,noncoding_19957,E_chr3R_25616137_25617114 chr3R + chr3R_25593310_25617114 chr3R_25593310_25603466 chr3R_25617115_25617442 chr3R_25603467_25603993 chr3R_25593214_25593309 11.63 NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.47 NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG4365 chr3L + chr3L_20791819_20792242 chr3L_20791819_20791876,chr3L_20791819_20791867 chr3L_20792243_20793250 chr3L_20791877_20792088 chr3L_20791802_20791818 22.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.2103600000000001e-07 N alternative_last_exon I_chrX_10148341_10149525,CG34319,noncoding_22888,I_chrX_10152994_10153223 chrX - chrX_10148341_10149525,chrX_10148427_10149525 chrX_10149206_10149525 chrX_10148036_10148340 chrX_10148505_10149205 chrX_10149526_10149619 51.85 NA NA NA NA NA 33.33 40.00 NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4763231257784001e-11 K alternative_last_exon lola,I_chr2R_6380094_6419543,I_chr2R_6380747_6419543,I_chr2R_6421474_6423519,I_chr2R_6421904_6422354 chr2R - chr2R_6389565_6389862 chr2R_6389735_6389862 chr2R_6387703_6389564 chr2R_6389602_6389734 chr2R_6389863_6389967 11.54 NA NA NA NA NA 29.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043933 K alternative_last_exon CG10602,mRpL13 chr2L - chr2L_18857404_18858951 chr2L_18858463_18858951 chr2L_18857177_18857403 chr2L_18858023_18858462 chr2L_18858952_18859075 96.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG5004,noncoding_24336,E_chrX_17024712_17024996 chrX + chrX_17002092_17018935 chrX_17002092_17007672 chrX_17018936_17019050 chrX_17007673_17007841 chrX_17001775_17002091 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_last_exon Su(var)3-9,I_chr3R_11088444_11088825 chr3R - chr3R_11088194_11088268;chr3R_11085409_11088268 chr3R_11087620_11088268 chr3R_11085172_11085408 chr3R_11085583_11087619 chr3R_11088269_11088443 7.55 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG31108,RI_chr3R_20940642_20940700,CG31510 chr3R - chr3R_20941880_20948282 chr3R_20946869_20948282 chr3R_20941834_20941879 chr3R_20943147_20946868 chr3R_20948283_20948615 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA 2.1507491486930664e-10 K alternative_last_exon bol,I_chr3L_9095908_9105733,RI_chr3L_9117011_9118271 chr3L - chr3L_9095908_9105733 chr3L_9101292_9105733 chr3L_9094048_9095907 chr3L_9101232_9101291 chr3L_9105734_9105833 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012181000000000001 K alternative_last_exon vtd,F_chr3LHet_2248642_2276770 chr3LHet + chr3LHet_2255060_2263373 chr3LHet_2255060_2255133 chr3LHet_2263374_2263535 chr3LHet_2255134_2255455 chr3LHet_2254309_2255059 3.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG1674,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_264375_265043;chr4_264375_265805 chr4_264375_264441 chr4_265044_265460;chr4_265806_266712 chr4_264442_264510 chr4_264260_264374 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 12.12 NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.14975056548352e-09 K alternative_last_exon CG34126,I_chr2L_4984636_4984712 chr2L + chr2L_4988849_4990307 chr2L_4988849_4989389 chr2L_4990308_4990450 chr2L_4989390_4989458 chr2L_4988734_4988848 71.96 NA NA 93.75 NA NA NA NA NA 37.84 NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.77 NA NA 50.00 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 6.4781019631048569e-15 K alternative_last_exon CG1646,I_chr3R_24640561_24640869,I_chr3R_24641816_24641874 chr3R + chr3R_24641449_24641874 chr3R_24641449_24641521,chr3R_24641449_24641497 chr3R_24641875_24642520 chr3R_24641522_24641815 chr3R_24641204_24641448 81.58 68.38 NA NA NA NA NA NA NA 58.21 NA NA 65.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.30 NA NA 62.58 65.37 NA NA NA NA NA NA 71.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon nonA,I_chrX_16256088_16259237,I_chrX_16265109_16265346 chrX + chrX_16259676_16265346 chrX_16259676_16260936 chrX_16265347_16265596 chrX_16260937_16262659 chrX_16259620_16259675 71.43 NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 NA 85.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 2.6854253606544954e-13 N alternative_last_exon Clc,CG6951 chr3L + chr3L_20234785_20237264 chr3L_20234785_20235884 chr3L_20237265_20237677 chr3L_20235885_20236927 chr3L_20234707_20234784 33.33 NA 71.43 NA NA 14.29 NA 59.26 14.29 NA NA 69.23 NA NA 12.50 78.26 NA 12.50 12.50 72.73 NA 14.29 70.00 71.43 NA 16.67 14.29 90.00 NA NA 11.11 84.62 NA 11.11 66.67 NA 73.68 72.22 75.00 74.07 92.11 68.57 NA NA NA 85.29 14.29 86.67 64.29 65.22 14.29 NA NA 66.67 NA 70.00 11.11 87.50 0.0 K alternative_last_exon RpL22,noncoding_21234,snoRNA:Psi18S-531 chrX - chrX_657025_657473 chrX_657267_657473 chrX_656466_657024 chrX_657027_657266 chrX_657474_657843 35.00 NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA 22.58 57.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 63.77 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA 58.06 0.0 K alternative_last_exon nudE chr3L + chr3L_9894535_9895250 chr3L_9894535_9894660 chr3L_9895251_9896789 chr3L_9894661_9894988 chr3L_9894443_9894534 16.22 NA NA 4.55 NA NA 5.77 5.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.56 NA 4.55 33.33 NA NA NA NA NA 39.39 28.21 NA NA NA NA 3.64 NA NA 27.03 NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.71 NA 0.0 K alternative_last_exon CkIIbeta,I_chrX_11689220_11690898 chrX + chrX_11689220_11689764,chrX_11689220_11690898;chrX_11689220_11694025 chrX_11689220_11689633 chrX_11694026_11695678 chrX_11689634_11691961 chrX_11689138_11689219 81.25 NA NA 64.71 NA NA 68.75 NA NA NA NA NA 65.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon eRF1,CG5618,I_chr3L_20346714_20347106,I_chr3L_20346738_20347058,I_chr3L_20348230_20348404 chr3L + chr3L_20344831_20346544,chr3L_20344831_20345906 chr3L_20344831_20344998 chr3L_20346545_20347505 chr3L_20344999_20345571 chr3L_20344683_20344830 11.11 NA NA 51.11 NA NA 28.00 NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon MESK2,RI_chr2R_17398771_17398908,I_chr2R_17401067_17401713 chr2R + chr2R_17399683_17401021;chr2R_17399683_17399897 chr2R_17399683_17403481,chr2R_17399683_17403392,chr2R_17399683_17401733,chr2R_17399683_17401713 chr2R_17401022_17401310;chr2R_17399898_17400225 None chr2R_17399598_17399682 70.21 NA NA 53.75 83.33 83.67 32.88 44.44 NA NA 46.34 43.42 58.62 NA NA 56.82 54.84 58.82 NA NA NA NA 81.18 NA NA NA NA NA 56.90 NA NA NA NA NA NA NA 84.52 81.13 82.19 NA 52.78 NA NA NA NA NA NA 57.65 NA NA 83.70 NA 81.97 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Csp,RI_chr3L_22262215_22262452,I_chr3L_22264863_22266536,I_chr3L_22273037_22275661 chr3L + chr3L_22263021_22264657 chr3L_22263021_22264013 chr3L_22264658_22266938 chr3L_22264014_22264076 chr3L_22262889_22263020 57.89 NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA 44.68 NA NA 27.91 NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 70.31 NA NA 40.51 NA NA 47.24 NA NA 72.36 71.62 73.11 NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA 47.69 NA NA NA NA NA 41.46 NA NA 45.80 0.0 K alternative_last_exon Fit1,noncoding_10535,Ack chr3L + chr3L_4104119_4110497 chr3L_4104119_4104202 chr3L_4110498_4111639 chr3L_4104203_4107121 chr3L_4103647_4104118 78.26 88.71 NA NA 90.74 90.32 NA NA NA NA NA 64.89 61.40 NA NA 91.01 NA NA NA NA 67.39 NA NA NA NA NA NA 90.38 35.94 63.86 NA NA NA NA 90.57 NA NA NA NA 60.00 67.09 NA 88.68 60.61 66.67 NA NA 43.31 NA 90.16 NA NA 61.97 NA NA NA NA 66.96 0.0 K alternative_last_exon CG31120,I_chr3R_20743232_20743287 chr3R - chr3R_20741458_20743430 chr3R_20743232_20743430 chr3R_20741367_20741457 chr3R_20741559_20743231 chr3R_20743431_20743491 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.47 NA NA NA 88.89 NA NA NA 88.89 NA 86.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.19 NA 87.50 NA NA NA NA 5.9933177488800003e-23 K alternative_last_exon I_chrX_5796578_5796722,CG4020,CG12236,noncoding_22111,CG3726 chrX + chrX_5804095_5806458 chrX_5804095_5804465 chrX_5806459_5811660 chrX_5804466_5806364 chrX_5803945_5804094 14.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA 31.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon RN-tre chr2R - chr2R_9873550_9875877,chr2R_9873601_9875877 chr2R_9874977_9875877 chr2R_9873495_9873549 chr2R_9873834_9874976 chr2R_9875878_9875942 59.74 NA NA 44.91 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA 77.09 NA 47.06 NA NA NA 41.48 NA NA NA 43.37 NA 44.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.26 75.91 0.0 K alternative_last_exon CG6043,I_chr2L_13267973_13268086 chr2L + chr2L_13274377_13276246 chr2L_13274377_13274690,chr2L_13274377_13274651,chr2L_13274377_13274642 chr2L_13276247_13276512 chr2L_13274691_13274850 chr2L_13274310_13274376 88.89 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 71.43 NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 75.00 NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0217925762984222e-12 K alternative_last_exon CG34376 chr3R + chr3R_18283200_18283300;chr3R_18283200_18285563 chr3R_18283200_18284042 chr3R_18285564_18286455 chr3R_18284043_18285254 chr3R_18282273_18283199 80.49 NA NA 69.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.39 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.7330600606047994e-14 K alternative_last_exon hts,I_chr2R_15286599_15294119,I_chr2R_15293594_15294119,RI_chr2R_15294446_15295345,I_chr2R_15294825_15295345,I_chr2R_15295410_15295479,I_chr2R_15311185_15312327,I_chr2R_15311303_15312026 chr2R - chr2R_15294825_15295345;chr2R_15288861_15295345;chr2R_15294662_15295345;chr2R_15286599_15295345 chr2R_15293594_15295345 chr2R_15287023_15288860;chr2R_15294405_15294661;chr2R_15286527_15286598 chr2R_15293525_15293593 chr2R_15295346_15295409 27.00 NA NA NA 14.81 NA 10.96 NA NA NA NA NA 7.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.98 NA 10.45 NA NA 37.61 NA NA NA 38.03 41.03 NA NA NA NA NA NA NA 1.40211672924942e-22 K alternative_last_exon Tequila,F_chr3L_9070061_9077585 chr3L + chr3L_9068723_9068771;chr3L_9068723_9069957 chr3L_9068723_9080948 chr3L_9068772_9069365;chr3L_9069958_9070727 chr3L_9080949_9083048 chr3L_9068164_9068722 31.25 NA NA 75.41 NA NA 18.18 NA NA 52.94 NA 3.45 17.86 NA NA 18.18 NA NA NA 3.85 NA 45.45 NA NA 42.86 57.14 NA 55.56 72.73 NA NA NA 54.84 NA NA NA 20.00 NA NA 42.50 46.15 NA NA NA 62.50 NA 46.67 44.12 NA 85.00 NA NA 50.00 62.50 NA NA NA 61.54 0.0 K alternative_last_exon fau,I_chr3R_6597190_6602898,I_chr3R_6599728_6602898,RI_chr3R_6601017_6602898 chr3R - chr3R_6598884_6602898 chr3R_6599741_6602898,chr3R_6600788_6602898 chr3R_6597839_6598883 chr3R_6598919_6599740 chr3R_6602899_6602998 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000107 K alternative_last_exon scrib,I_chr3R_22381374_22399575,I_chr3R_22406745_22416162,I_chr3R_22416440_22420970,I_chr3R_22425016_22429281 chr3R + chr3R_22401171_22404442 chr3R_22401171_22402078 chr3R_22404443_22404553 chr3R_22402079_22402897 chr3R_22400887_22401170 21.21 NA NA 11.11 NA 10.53 10.87 NA NA NA NA NA 6.25 NA NA NA NA 8.89 NA NA NA 7.96 NA NA NA NA NA 42.22 37.29 NA NA NA 35.29 NA NA 40.00 NA NA NA NA 44.00 NA NA NA 43.14 NA NA NA NA 36.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_last_exon lola,I_chr2R_6380094_6419543,I_chr2R_6380747_6419543,I_chr2R_6394546_6419543,I_chr2R_6403557_6406705,I_chr2R_6421474_6423519,I_chr2R_6421904_6422354 chr2R - chr2R_6398510_6403339 chr2R_6403164_6403339 chr2R_6398030_6398509 chr2R_6402519_6403163 chr2R_6403340_6403556 80.85 NA 93.02 66.39 NA NA 67.80 NA NA NA NA 94.19 NA NA NA 91.84 NA 64.29 92.59 66.99 NA NA NA 58.70 52.63 44.90 NA NA 60.53 66.67 92.50 NA 96.15 NA NA 90.91 70.83 NA 51.28 NA 57.14 NA NA NA 37.04 68.57 NA NA NA NA 91.67 NA NA NA 66.67 NA 48.48 NA 0.0 K alternative_last_exon CoRest,I_chrX_19418197_19418377,CE_chrX_19418197_19419948,F_chrX_19418197_19421609,RF_chrX_19418197_19422673 chrX + chrX_19418197_19422667 chrX_19418197_19419211 chrX_19422668_19422856 chrX_19419212_19419889 chrX_19418097_19418196 1.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon app,RI_chr3L_12201038_12201989,I_chr3L_12259361_12259754 chr3L - chr3L_12201038_12206192 chr3L_12205868_12206192 chr3L_12199329_12201037 chr3L_12204371_12205867 chr3L_12206193_12206397 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA 1.3305887999999998e-05 K alternative_last_exon BEAF-32,I_chr2R_10658570_10659304,noncoding_6875 chr2R + chr2R_10658335_10659304 chr2R_10658335_10658826 chr2R_10659305_10660149 chr2R_10658827_10659147 chr2R_10657939_10658334 47.22 NA NA 61.26 NA NA NA NA NA 28.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.76 NA 33.96 NA NA 33.33 28.81 NA 57.81 36.54 NA NA NA NA 27.88 22.58 NA NA NA NA 23.53 NA NA 35.00 32.00 60.78 NA NA NA NA 27.59 26.32 NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon Hcf,I_chr4_391984_392875 chr4 + chr4_387389_391716 chr4_387389_390132 chr4_391717_391983 chr4_390133_390370 chr4_386486_387388 70.37 NA NA 34.62 40.91 NA NA NA NA NA NA 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_last_exon CG8920 chr2R + chr2R_16211917_16212352 chr2R_16211917_16212002 chr2R_16212353_16212835 chr2R_16212003_16212350 chr2R_16211798_16211916 11.90 NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA 24.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.2782079549999998e-08 K alternative_last_exon I_chrX_15223901_15223968,HDAC6,I_chrX_15232958_15233665 chrX + chrX_15232738_15233659 chrX_15232738_15232869 chrX_15233660_15234394 chrX_15232870_15233125 chrX_15232706_15232737 70.00 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.31 NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8808489519997659e-11 K alternative_last_exon chn chr2R + chr2R_11027601_11029341 chr2R_11027601_11027975 chr2R_11029342_11032291 chr2R_11027976_11028245 chr2R_11026584_11027600 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011742000000000001 K alternative_last_exon Atf-2 chr2R + chr2R_20758769_20765661 chr2R_20758769_20758821 chr2R_20765662_20766625 chr2R_20758822_20759083 chr2R_20757624_20758768 93.75 NA NA 82.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA 77.78 NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9103001773080011e-10 K alternative_last_exon CG4615,CG4617 chrX - chrX_6996421_6996867 chrX_6996743_6996867 chrX_6996109_6996420 chrX_6996583_6996742 chrX_6996868_6997762 10.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002078 K alternative_last_exon CG30338,CG1902,CG30000,I_chr2R_5495525_5495581 chr2R + chr2R_5481665_5491373 chr2R_5481665_5486086 chr2R_5491374_5493709 chr2R_5486087_5487010 chr2R_5481588_5481664 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette F_chr3LHet_2242956_2248238,vtd,F_chr3LHet_2248430_2248476,F_chr3LHet_2248642_2276770 chr3LHet + chr3LHet_2247578_2254308 chr3LHet_2247578_2253758;chr3LHet_2253939_2253991;chr3LHet_2254248_2254308 chr3LHet_2253759_2253938;chr3LHet_2253992_2254247 chr3LHet_2247454_2247577;chr3LHet_2254309_2255059 100.00 NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6976600000000001e-07 K multi_cassette Gli chr2L - chr2L_15759846_15762568 chr2L_15759846_15760209;chr2L_15760343_15760401;chr2L_15760575_15762568 chr2L_15760210_15760342;chr2L_15760402_15760574 chr2L_15759743_15759845;chr2L_15762569_15762636 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012718999999999999 K multi_cassette CG31531,I_chr3R_523978_525892,I_chr3R_523978_526879 chr3R + chr3R_523978_526879 chr3R_523978_525438;chr3R_525582_525892;chr3R_526050_526879 chr3R_525439_525581;chr3R_525893_526049 chr3R_523878_523977;chr3R_526880_526979 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041416000000000001 K multi_cassette CG17471,I_chr4_1215995_1216053,I_chr4_1216718_1217333,I_chr4_1217104_1217410 chr4 - chr4_1216718_1217383 chr4_1216718_1216813;chr4_1216889_1216945;chr4_1217104_1217383 chr4_1216814_1216888;chr4_1216946_1217103 chr4_1216618_1216717;chr4_1217384_1217398 82.57 NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023017820369999999 K multi_cassette I_chr3L_1494947_1496080,pUf68,I_chr3L_1499710_1499771,RI_chr3L_1499880_1501350,I_chr3L_1500309_1501350,I_chr3L_1500313_1501350,RI_chr3L_1500389_1501345,RI_chr3L_1501035_1501345 chr3L - chr3L_1499338_1501798 chr3L_1499338_1499771;chr3L_1499880_1500244;chr3L_1500389_1501350;chr3L_1501398_1501798 chr3L_1499772_1499879;chr3L_1500245_1500388;chr3L_1501351_1501397 chr3L_1499043_1499337;chr3L_1501799_1501892 4.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette CG31619,I_chr2L_21725446_21728027 chr2L + chr2L_21719644_21727005 chr2L_21719644_21720358;chr2L_21720482_21725067;chr2L_21725446_21727005 chr2L_21720359_21720481;chr2L_21725068_21725445 chr2L_21719514_21719643;chr2L_21727006_21727362 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 20.00 55.00 NA NA NA 50.00 NA NA 45.00 NA 46.67 53.33 NA NA NA 50.00 NA NA 65.38 NA NA NA NA 47.83 NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.58 0.0 N multi_cassette Slip1,RI_chr4_684967_689045,I_chr4_685717_686576,RI_chr4_685717_689045,RI_chr4_687548_689045 chr4 + chr4_684967_686576 chr4_684967_685613;chr4_685932_686085;chr4_686263_686576 chr4_685614_685931;chr4_686086_686262 chr4_684914_684966;chr4_686577_686676 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette shot,I_chr2R_9754481_9757364,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9785143,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9770053_9788941 chr2R_9770053_9771599;chr2R_9782098_9782343;chr2R_9782475_9786954;chr2R_9787177_9787870;chr2R_9787955_9788941 chr2R_9771600_9782097;chr2R_9782344_9782474;chr2R_9786955_9787176;chr2R_9787871_9787954 chr2R_9769906_9770052;chr2R_9788942_9789041 75.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 59.22 NA NA NA 85.37 NA 93.22 NA NA NA 64.29 NA NA NA 86.49 NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA 56.52 64.29 NA 85.79 NA NA NA NA NA NA 64.71 46.15 NA 0.0 K multi_cassette Crk,RI_chr4_231302_233315,RI_chr4_231307_231369,RI_chr4_231307_232217,I_chr4_231307_232253 chr4 + chr4_231307_233253 chr4_231307_232479;chr4_232609_232740;chr4_232901_233253 chr4_232480_232608;chr4_232741_232900 chr4_231208_231306;chr4_233254_233355 14.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043039000000000001 N multi_cassette CG7956,CE_chr3R_17350242_17350304 chr3R + chr3R_17350238_17351248 chr3R_17350238_17350300;chr3R_17350372_17350806;chr3R_17351141_17351248 chr3R_17350301_17350371;chr3R_17350807_17351140 chr3R_17350142_17350237;chr3R_17351249_17351485 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 0.00033161508000000001 N multi_cassette CG17528,I_chr2R_705620_705713,I_chr2R_705649_705720,RI_chr2R_706735_711409,I_chr2R_706735_711443,I_chr2R_707374_711443 chr2R - chr2R_705440_711615 chr2R_705440_705502;chr2R_705649_705713;chr2R_706735_706792;chr2R_707442_711615 chr2R_705503_705648;chr2R_705714_706734;chr2R_706793_707441 chr2R_705290_705439;chr2R_711616_711627 100.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0055360000000000001 K multi_cassette drpr,I_chr3L_1718097_1718705,I_chr3L_1718154_1723579,I_chr3L_1720385_1723579,CG18171 chr3L - chr3L_1718097_1723579 chr3L_1718097_1718705;chr3L_1719746_1719922;chr3L_1720170_1723579 chr3L_1718706_1719745;chr3L_1719923_1720169 chr3L_1718054_1718096;chr3L_1723580_1723679 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 0.010836999999999999 N multi_cassette CG12065,CE_chrX_8469528_8477573 chrX + chrX_8478609_8481290 chrX_8478609_8478875;chrX_8478957_8479842;chrX_8479952_8480018;chrX_8480279_8480584;chrX_8480642_8481290 chrX_8478876_8478956;chrX_8479843_8479951;chrX_8480019_8480278;chrX_8480585_8480641 chrX_8478489_8478608;chrX_8481291_8481558 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001072 K multi_cassette Pten,I_chr2L_10256507_10256803,F_chr2L_10259663_10260253 chr2L - chr2L_10256507_10257777 chr2L_10256507_10256909;chr2L_10257123_10257394;chr2L_10257717_10257777 chr2L_10256910_10257122;chr2L_10257395_10257716 chr2L_10256469_10256506;chr2L_10257778_10257993 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014115000000000001 K multi_cassette bl,I_chr2R_16481586_16483061 chr2R + chr2R_16483320_16492200 chr2R_16483320_16485957;chr2R_16486031_16486103;chr2R_16486200_16492200 chr2R_16485958_16486030;chr2R_16486104_16486199 chr2R_16483263_16483319;chr2R_16492201_16493124 100.00 NA NA 88.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.7729948000000006e-05 K multi_cassette Tif-IA,RI_chr2L_22250854_22257652 chr2L + chr2L_22250854_22257652 chr2L_22250854_22253193;chr2L_22253333_22253421;chr2L_22253686_22253745;chr2L_22253922_22257652 chr2L_22253194_22253332;chr2L_22253422_22253685;chr2L_22253746_22253921 chr2L_22250754_22250853;chr2L_22257653_22257752 93.75 NA NA 58.88 NA NA NA NA NA NA NA NA 82.00 NA NA NA NA 83.72 NA NA NA NA NA NA 82.76 63.64 NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette CG1161,RI_chr3R_1181273_1181459,I_chr3R_1182079_1182146 chr3R + chr3R_1181273_1182146 chr3R_1181273_1181515;chr3R_1181665_1181724;chr3R_1181851_1182146 chr3R_1181516_1181664;chr3R_1181725_1181850 chr3R_1181173_1181272;chr3R_1182147_1182246 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette sol chrX + chrX_21221878_21225120 chrX_21221878_21222886;chrX_21223513_21223779;chrX_21224091_21225120 chrX_21222887_21223512;chrX_21223780_21224090 chrX_21221327_21221877;chrX_21225121_21225440 96.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.37 NA NA NA 86.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9107181999999995e-09 K multi_cassette tou,I_chr2R_7468394_7468453,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7474644_7475275 chr2R_7474644_7475042;chr2R_7475088_7475150;chr2R_7475217_7475275 chr2R_7475043_7475087;chr2R_7475151_7475216 chr2R_7474602_7474643;chr2R_7475276_7475375 94.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00015899999999999999 N multi_cassette Taf4,I_chr3L_16107821_16107893 chr3L + chr3L_16107821_16110644 chr3L_16107821_16107893;chr3L_16107944_16108768;chr3L_16108931_16109131;chr3L_16109342_16110644 chr3L_16107894_16107943;chr3L_16108769_16108930;chr3L_16109132_16109341 chr3L_16107721_16107820;chr3L_16110645_16111208 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002598 K multi_cassette trol,I_chrX_2387249_2389980,I_chrX_2389272_2395659,I_chrX_2391522_2395659 chrX - chrX_2388671_2395659 chrX_2388671_2389073;chrX_2389272_2389980;chrX_2390067_2390493;chrX_2390627_2390808;chrX_2390959_2391350;chrX_2391522_2392054;chrX_2392149_2392515;chrX_2392665_2395659 chrX_2389074_2389271;chrX_2389981_2390066;chrX_2390494_2390626;chrX_2390809_2390958;chrX_2391351_2391521;chrX_2392055_2392148;chrX_2392516_2392664 chrX_2388641_2388670;chrX_2395660_2395759 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette ssp4,I_chr2R_13409412_13410357,RI_chr2R_13409412_13411004,I_chr2R_13409412_13411328,I_chr2R_13409412_13411588,I_chr2R_13414489_13414718,I_chr2R_13414818_13414880,I_chr2R_13418952_13419022 chr2R - chr2R_13408434_13411588 chr2R_13408434_13411004;chr2R_13411077_13411328;chr2R_13411404_13411588 chr2R_13411005_13411076;chr2R_13411329_13411403 chr2R_13408151_13408433;chr2R_13411589_13411688 20.00 NA NA NA NA NA 1.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.4160000000000017e-08 K multi_cassette CG8486,I_chr2L_8182451_8183191 chr2L + chr2L_8174699_8176572 chr2L_8174699_8175175;chr2L_8175398_8175994;chr2L_8176052_8176572 chr2L_8175176_8175397;chr2L_8175995_8176051 chr2L_8174536_8174698;chr2L_8176573_8176806 6.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6999999999999999e-05 N multi_cassette CG42345,I_chr2R_1311745_1327074 chr2R + chr2R_1327260_1334039 chr2R_1327260_1328114;chr2R_1328311_1328362;chr2R_1328576_1334039 chr2R_1328115_1328310;chr2R_1328363_1328575 chr2R_1327075_1327259;chr2R_1334040_1334270 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000174 K multi_cassette Rph,I_chrX_10644396_10644958,I_chrX_10646283_10647245,I_chrX_10647710_10648325,RI_chrX_10649048_10651427 chrX - chrX_10645816_10647245 chrX_10645816_10645935;chrX_10646283_10646360;chrX_10646529_10647245 chrX_10645936_10646282;chrX_10646361_10646528 chrX_10644959_10645815;chrX_10647246_10647345 7.69 NA NA 33.33 NA NA NA 23.81 NA NA 36.36 NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9911023146188801e-14 K multi_cassette spz chr3R - chr3R_22892388_22894865 chr3R_22892388_22892450;chr3R_22892607_22892843;chr3R_22892922_22893079;chr3R_22893218_22894865 chr3R_22892451_22892606;chr3R_22892844_22892921;chr3R_22893080_22893217 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22894866_22895053 28.09 NA 42.70 13.24 NA NA NA NA NA NA 56.86 NA 50.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.33 NA 16.67 11.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.88 NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA 15.46 NA 0.0 K multi_cassette unk,I_chr3R_18980963_18981530 chr3R - chr3R_18980690_18981530 chr3R_18980690_18980853;chr3R_18980963_18981161;chr3R_18981272_18981530 chr3R_18980854_18980962;chr3R_18981162_18981271 chr3R_18980567_18980689;chr3R_18981531_18981630 9.84 NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA 24.00 NA NA 29.63 NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2745111390516693e-12 K multi_cassette CG17082,R_chr2R_642176_644740,I_chr2R_644094_644145,RI_chr2R_644671_645068,I_chr2R_644671_645137,I_chr2R_645254_645312 chr2R + chr2R_642176_644740 chr2R_642176_643675;chr2R_643765_643820;chr2R_644094_644159;chr2R_644671_644740 chr2R_643676_643764;chr2R_643821_644093;chr2R_644160_644670 chr2R_642076_642175;chr2R_644741_644840 100.00 NA NA 68.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016326 K multi_cassette cals,I_chr4_1139644_1142084,RI_chr4_1141233_1142084 chr4 - chr4_1139644_1142084 chr4_1139644_1140562;chr4_1140674_1140731;chr4_1141233_1142084 chr4_1140563_1140673;chr4_1140732_1141232 chr4_1139544_1139643;chr4_1142085_1142184 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021923000000000002 K multi_cassette unc-13,RI_chr4_892852_895828,RI_chr4_894198_895828,E_chr4_894796_894871,I_chr4_895008_895828,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_892852_895828 chr4_892852_893839;chr4_894198_894260;chr4_894553_894619;chr4_894787_894871;chr4_895094_895828 chr4_893840_894197;chr4_894261_894552;chr4_894620_894786;chr4_894872_895093 chr4_892753_892851;chr4_895829_895928 90.91 NA NA 65.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.17 NA NA 1.0692391999999999e-11 K multi_cassette PP2A-B',RI_chr3R_13993929_13994503 chr3R + chr3R_13993590_13997250 chr3R_13993590_13995205;chr3R_13995271_13995378;chr3R_13995821_13997250 chr3R_13995206_13995270;chr3R_13995379_13995820 chr3R_13993510_13993589;chr3R_13997251_13997425 75.00 NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010433 K multi_cassette CG2316,REI_chr4_205422_208622,I_chr4_206537_206603,I_chr4_208796_210623,I_chr4_209150_214298,I_chr4_209369_210623,I_chr4_209875_213969,RI_chr4_209875_214450,I_chr4_210688_213991,RI_chr4_210688_214450 chr4 - chr4_205422_208622 chr4_205422_206452;chr4_206543_206603;chr4_207467_208622 chr4_206453_206542;chr4_206604_207466 chr4_205322_205421;chr4_208623_208722 96.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023609999999999999 K multi_cassette Rad23,I_chr4_328801_328879,RI_chr4_328916_330164 chr4 + chr4_328916_330164 chr4_328916_329056;chr4_329201_329274;chr4_329706_330164 chr4_329057_329200;chr4_329275_329705 chr4_328880_328915;chr4_330165_330259 96.88 NA NA 39.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5999999999999999e-05 K multi_cassette CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1527189 chr3L_1525393_1526333;chr3L_1526399_1526659;chr3L_1526732_1527189 chr3L_1526334_1526398;chr3L_1526660_1526731 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1527190_1527240 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette mthl10 chr3L - chr3L_333641_334974 chr3L_333641_333941;chr3L_334120_334237;chr3L_334395_334974 chr3L_333942_334119;chr3L_334238_334394 chr3L_333522_333640;chr3L_334975_335169 55.00 NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.2299173116118398e-15 K multi_cassette syd,I_chr3L_7924891_7925400 chr3L - chr3L_7919938_7921016 chr3L_7919938_7920587;chr3L_7920680_7920859;chr3L_7920921_7921016 chr3L_7920588_7920679;chr3L_7920860_7920920 chr3L_7919673_7919937;chr3L_7921017_7921217 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.496808e-05 N multi_cassette CG3635,I_chr2L_22179420_22179486 chr2L + chr2L_22175603_22182737 chr2L_22175603_22179486;chr2L_22179567_22179631;chr2L_22182055_22182737 chr2L_22179487_22179566;chr2L_22179632_22182054 chr2L_22175591_22175602;chr2L_22182738_22183329 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA 0.0057320000000000001 K multi_cassette Mical,I_chr3R_5834577_5835458,RI_chr3R_5842549_5844218,I_chr3R_5843939_5844218,I_chr3R_5847106_5863537,I_chr3R_5863483_5863537,I_chr3R_5863613_5868513 chr3R - chr3R_5841649_5844218 chr3R_5841649_5842011;chr3R_5842549_5843294;chr3R_5843562_5844218 chr3R_5842012_5842548;chr3R_5843295_5843561 chr3R_5841385_5841648;chr3R_5844219_5844280 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033034000000000001 K multi_cassette heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27795508_27798223,RI_chr3R_27798276_27801169,RI_chr3R_27801288_27801517,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27784850_27805244 chr3R_27784850_27795477;chr3R_27795508_27798223;chr3R_27798276_27801169;chr3R_27801288_27801517;chr3R_27801688_27805244 chr3R_27795478_27795507;chr3R_27798224_27798275;chr3R_27801170_27801287;chr3R_27801518_27801687 chr3R_27784757_27784849;chr3R_27805245_27805341 56.35 NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.803704e-05 K multi_cassette CG40263,F_chr2RHet_1265687_1293040,F_chr2RHet_1298459_1298703,F_chr2RHet_1298459_1311408,F_chr2RHet_1298885_1299622,RI_chr2RHet_1324541_1328409 chr2RHet - chr2RHet_1265687_1324445 chr2RHet_1265687_1286307;chr2RHet_1286572_1292103;chr2RHet_1292187_1293055;chr2RHet_1293175_1293235;chr2RHet_1293394_1324445 chr2RHet_1286308_1286571;chr2RHet_1292104_1292186;chr2RHet_1293056_1293174;chr2RHet_1293236_1293393 chr2RHet_1265587_1265686;chr2RHet_1324446_1324530 51.31 NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 25.00 NA NA 20.00 22.22 NA NA NA 37.50 NA 40.00 22.22 NA NA NA NA 8.70 NA NA NA 20.00 40.00 NA NA NA 18.18 NA NA 30.00 NA NA NA 33.33 13.79 0.0 K multi_cassette CG11266,RI_chr2L_7033019_7033182,RI_chr2L_7033019_7034180,RI_chr2L_7033019_7034764,I_chr2L_7034274_7034764,I_chr2L_7034274_7035406,RI_chr2L_7034911_7035074,I_chr2L_7051093_7051366 chr2L + chr2L_7033019_7035406 chr2L_7033019_7034483;chr2L_7034694_7034764;chr2L_7034913_7035406 chr2L_7034484_7034693;chr2L_7034765_7034912 chr2L_7032919_7033018;chr2L_7035407_7035506 8.45 NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA 20.63 28.00 26.67 NA 28.57 21.05 NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA 1.6536371995812912e-26 N multi_cassette msn,I_chr3L_2558033_2560115,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2558390_2563817 chr3L_2558390_2560115;chr3L_2560296_2561931;chr3L_2562844_2563817 chr3L_2560116_2560295;chr3L_2561932_2562843 chr3L_2558293_2558389;chr3L_2563818_2563917 100.00 75.00 NA 70.27 60.00 NA 79.31 NA 73.77 NA NA NA 23.08 NA 70.83 NA NA 46.67 NA NA NA 37.62 81.40 NA NA NA 82.69 61.90 NA NA NA NA NA NA 81.63 NA 82.02 NA 81.82 NA 82.61 NA NA 83.72 77.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette CG6643,I_chr3R_20370792_20375406 chr3R + chr3R_20378379_20380423 chr3R_20378379_20379716;chr3R_20379803_20380077;chr3R_20380127_20380423 chr3R_20379717_20379802;chr3R_20380078_20380126 chr3R_20378208_20378378;chr3R_20380424_20380855 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K multi_cassette eIF-4E,RI_chr3L_9394049_9394139,RI_chr3L_9394054_9394756,I_chr3L_9394308_9394756,RI_chr3L_9394468_9394631,I_chr3L_9394468_9394659,I_chr3L_9394468_9395155,I_chr3L_9394468_9395240,I_chr3L_9394468_9395446,I_chr3L_9394685_9394756,RI_chr3L_9394707_9395016,RI_chr3L_9394707_9395198,I_chr3L_9394707_9395309,I_chr3L_9394819_9394884,I_chr3L_9394819_9395016,I_chr3L_9394819_9395198,I_chr3L_9394819_9395379 chr3L - chr3L_9394054_9395379 chr3L_9394054_9394139;chr3L_9394468_9394631;chr3L_9394707_9395379 chr3L_9394140_9394467;chr3L_9394632_9394706 chr3L_9393954_9394053;chr3L_9395380_9395409 23.29 NA NA NA NA NA 37.93 NA NA NA 45.83 37.36 NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA 52.94 NA NA 11.86 NA NA 10.71 NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 40.38 NA NA NA 0.0 K multi_cassette Haspin,F_chr2RHet_3208841_3212285,F_chr2RHet_3212408_3212898,F_chr2RHet_3213046_3213594 chr2RHet + chr2RHet_3200480_3234342 chr2RHet_3200480_3215005;chr2RHet_3215210_3215266;chr2RHet_3215563_3234342 chr2RHet_3215006_3215209;chr2RHet_3215267_3215562 chr2RHet_3200469_3200479;chr2RHet_3234343_3234575 93.75 NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5956780000000003e-06 K multi_cassette Nedd4,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17535485_17536604,I_chr3L_17536186_17536604,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17535485_17536604 chr3L_17535485_17535689;chr3L_17535913_17535990;chr3L_17536063_17536604 chr3L_17535690_17535912;chr3L_17535991_17536062 chr3L_17535417_17535484;chr3L_17536605_17536704 77.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00077183685599999986 K multi_cassette PhKgamma,I_chrX_11590183_11590435,I_chrX_11596563_11597322 chrX + chrX_11592631_11597322 chrX_11592631_11593355;chrX_11593440_11594653;chrX_11595161_11597322 chrX_11593356_11593439;chrX_11594654_11595160 chrX_11592533_11592630;chrX_11597323_11597422 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021129999999999999 K multi_cassette srp,I_chr3R_11825782_11827473,I_chr3R_11826508_11826910 chr3R + chr3R_11825782_11827473 chr3R_11825782_11826334;chr3R_11826508_11826910;chr3R_11827129_11827473 chr3R_11826335_11826507;chr3R_11826911_11827128 chr3R_11825682_11825781;chr3R_11827474_11827573 30.00 NA NA 3.70 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5728880978393868e-13 K multi_cassette put chr3R - chr3R_10448026_10450921 chr3R_10448026_10448964;chr3R_10449142_10449208;chr3R_10449395_10450921 chr3R_10448965_10449141;chr3R_10449209_10449394 chr3R_10447989_10448025;chr3R_10450922_10451371 100.00 NA NA 88.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021480000000000002 K multi_cassette zip,I_chr2R_20878796_20879147 chr2R - chr2R_20884825_20887561 chr2R_20884825_20885100;chr2R_20885221_20885800;chr2R_20885825_20887561 chr2R_20885101_20885220;chr2R_20885801_20885824 chr2R_20884732_20884824;chr2R_20887562_20887683 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041949999999999999 N multi_cassette Hr78,I_chr3L_21490089_21490390,CG33214 chr3L - chr3L_21488969_21490390 chr3L_21488969_21489526;chr3L_21489842_21489919;chr3L_21490008_21490390 chr3L_21489527_21489841;chr3L_21489920_21490007 chr3L_21488699_21488968;chr3L_21490391_21490490 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0087690000000000008 K multi_cassette ens,I_chr3L_4130719_4131120 chr3L - chr3L_4127163_4131120 chr3L_4127163_4129650;chr3L_4129792_4130388;chr3L_4130644_4131120 chr3L_4129651_4129791;chr3L_4130389_4130643 chr3L_4126989_4127162;chr3L_4131121_4131220 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette shot,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9753001_9753953 chr2R_9753001_9753323;chr2R_9753411_9753565;chr2R_9753632_9753953 chr2R_9753324_9753410;chr2R_9753566_9753631 chr2R_9752056_9753000;chr2R_9753954_9754137 98.63 NA NA NA NA NA NA NA NA 55.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette spin,I_chr2R_12013288_12013847 chr2R + chr2R_12019405_12023531 chr2R_12019405_12019813;chr2R_12020141_12020333;chr2R_12020596_12023531 chr2R_12019814_12020140;chr2R_12020334_12020595 chr2R_12019047_12019404;chr2R_12023532_12023630 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K multi_cassette gish,I_chr3R_12125412_12126290 chr3R + chr3R_12123068_12126966 chr3R_12123068_12123766;chr3R_12123845_12124191;chr3R_12124273_12126966 chr3R_12123767_12123844;chr3R_12124192_12124272 chr3R_12122897_12123067;chr3R_12126967_12127073 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00064499999999999996 N multi_cassette CG42348,I_chr3L_20149990_20151579 chr3L - chr3L_20148379_20151579 chr3L_20148379_20148637;chr3L_20148760_20148832;chr3L_20148928_20149000;chr3L_20149099_20151579 chr3L_20148638_20148759;chr3L_20148833_20148927;chr3L_20149001_20149098 chr3L_20148001_20148378;chr3L_20151580_20151679 100.00 NA NA 65.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.08241513766e-12 K multi_cassette CG8451 chr2L - chr2L_8203247_8204686 chr2L_8203247_8203313;chr2L_8203470_8203526;chr2L_8203637_8204686 chr2L_8203314_8203469;chr2L_8203527_8203636 chr2L_8203087_8203246;chr2L_8204687_8205128 97.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017579000000000001 N multi_cassette boi,I_chrX_2363445_2363896 chrX - chrX_2339627_2344702 chrX_2339627_2339893;chrX_2340215_2340443;chrX_2340611_2340674;chrX_2340858_2340922;chrX_2341631_2344702 chrX_2339894_2340214;chrX_2340444_2340610;chrX_2340675_2340857;chrX_2340923_2341630 chrX_2338205_2339626;chrX_2344703_2344871 100.00 NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000611 K multi_cassette CG40263,F_chr2RHet_1265687_1293040,RI_chr2RHet_1324541_1328409 chr2RHet - chr2RHet_1324541_1335781 chr2RHet_1324541_1333289;chr2RHet_1333469_1335106;chr2RHet_1335333_1335781 chr2RHet_1333290_1333468;chr2RHet_1335107_1335332 chr2RHet_1324446_1324540;chr2RHet_1335782_1335833 7.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA 33.33 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA 42.86 0.0 K multi_cassette Nos,I_chr2L_10826086_10826539 chr2L - chr2L_10817145_10822967 chr2L_10817145_10818391;chr2L_10818567_10822106;chr2L_10822247_10822967 chr2L_10818392_10818566;chr2L_10822107_10822246 chr2L_10816983_10817144;chr2L_10822968_10823002 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041469999999999996 K multi_cassette Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11825951 chr2R_11824086_11825183;chr2R_11825385_11825619;chr2R_11825773_11825951 chr2R_11825184_11825384;chr2R_11825620_11825772 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11825952_11826483 0.00 NA NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette Rpb4 chr3R - chr3R_14079178_14081038 chr3R_14079178_14079247;chr3R_14079515_14079574;chr3R_14080039_14080096;chr3R_14080959_14081038 chr3R_14079248_14079514;chr3R_14079575_14080038;chr3R_14080097_14080958 chr3R_14078997_14079177;chr3R_14081039_14081173 37.50 NA NA NA NA 50.00 77.78 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 80.00 52.38 NA 60.00 NA NA NA NA NA 50.00 60.00 NA 61.11 NA NA NA NA NA 70.00 50.00 50.00 NA NA NA NA 55.56 69.23 NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette spen,I_chr2L_187184_187481,I_chr2L_200676_200752 chr2L + chr2L_163002_183760 chr2L_163002_164158;chr2L_164235_175360;chr2L_175448_183760 chr2L_164159_164234;chr2L_175361_175447 chr2L_162988_163001;chr2L_183761_185082 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010106 K multi_cassette vap,RI_chrX_15897976_15899352,I_chrX_15897976_15899654,I_chrX_15898011_15899654,I_chrX_15898427_15899017,RI_chrX_15898427_15899654,RI_chrX_15899237_15899352,I_chrX_15899237_15899654 chrX - chrX_15898120_15899352 chrX_15898120_15898360;chrX_15898478_15899017;chrX_15899237_15899352 chrX_15898361_15898477;chrX_15899018_15899236 chrX_15897748_15898119;chrX_15899353_15899365 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.50963934e-10 K multi_cassette Jupiter,I_chr3R_7417030_7419354,I_chr3R_7417630_7417716,I_chr3R_7418347_7445425,RI_chr3R_7442793_7445425 chr3R - chr3R_7417030_7419354 chr3R_7417030_7418088;chr3R_7418347_7419043;chr3R_7419077_7419354 chr3R_7418089_7418346;chr3R_7419044_7419076 chr3R_7416930_7417029;chr3R_7419355_7419454 22.22 NA NA 2.61 NA NA NA NA NA NA NA 89.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.57 NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette Ppn,F_chr3R_24347009_24347078 chr3R - chr3R_24348983_24349755 chr3R_24348983_24349248;chr3R_24349420_24349501;chr3R_24349697_24349755 chr3R_24349249_24349419;chr3R_24349502_24349696 chr3R_24348417_24348982;chr3R_24349756_24349939 37.14 NA NA 22.86 NA NA 16.33 NA NA NA NA NA 16.95 NA NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.701785788026931e-14 K multi_cassette Xrp1,I_chr3R_14741648_14750799,I_chr3R_14750298_14750799 chr3R + chr3R_14741648_14750799 chr3R_14741648_14745144;chr3R_14745235_14746134;chr3R_14747042_14750799 chr3R_14745145_14745234;chr3R_14746135_14747041 chr3R_14741548_14741647;chr3R_14750800_14750899 98.55 NA NA NA NA NA 83.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.08654e-07 N multi_cassette RpL11,I_chr2R_15330246_15330292,I_chr2R_15330603_15330817,snoRNA:Psi28S-2444 chr2R + chr2R_15330246_15330817 chr2R_15330246_15330305;chr2R_15330604_15330664;chr2R_15330745_15330817 chr2R_15330306_15330603;chr2R_15330665_15330744 chr2R_15330177_15330245;chr2R_15330818_15330917 100.00 NA NA 30.00 NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.7826337695999988e-07 N multi_cassette 14-3-3zeta,I_chr2R_5987356_5991764,I_chr2R_5993610_5993957,I_chr2R_5993331_5994971 chr2R + chr2R_5993331_5994971 chr2R_5993331_5993445;chr2R_5993610_5993828;chr2R_5994303_5994971 chr2R_5993446_5993609;chr2R_5993829_5994302 chr2R_5993231_5993330;chr2R_5994972_5995071 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA 67.50 NA NA 80.00 72.22 NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 82.93 NA NA 79.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette betaTub97EF chr3R - chr3R_23794914_23798642 chr3R_23794914_23795104;chr3R_23795273_23795381;chr3R_23795550_23798642 chr3R_23795105_23795272;chr3R_23795382_23795549 chr3R_23794649_23794913;chr3R_23798643_23798872 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0076959999999999997 K multi_cassette Su(var)2-HP2 chr2R - chr2R_10499197_10504347 chr2R_10499197_10499285;chr2R_10503906_10504014;chr2R_10504267_10504347 chr2R_10499286_10503905;chr2R_10504015_10504266 chr2R_10499125_10499196;chr2R_10504348_10504372 88.00 NA NA NA NA NA NA NA 98.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 75.68 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 0.0 N multi_cassette unc-13,I_chr4_904268_904671,CRE_chr4_904268_906381,I_chr4_904268_919018,I_chr4_904747_906385,REI_chr4_906314_906385,I_chr4_906518_906708,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_904268_919018 chr4_904268_906079;chr4_906089_906385;chr4_906518_907590;chr4_913467_919018 chr4_906080_906088;chr4_906386_906517;chr4_907591_913466 chr4_904196_904267;chr4_919019_919102 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041949999999999999 K multi_cassette Nipped-B,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_615459_615937 chr2R_615459_615513;chr2R_615630_615684;chr2R_615857_615937 chr2R_615514_615629;chr2R_615685_615856 chr2R_615299_615458;chr2R_615938_615993 88.46 NA 75.68 75.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.74 NA NA NA NA NA NA NA 45.16 NA NA 51.72 75.00 NA NA 63.33 NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 0.0 K multi_cassette M(2)21AB,I_chr2L_110878_111037,I_chr2L_112022_112689,RI_chr2L_132256_132482 chr2L + chr2L_110878_112689 chr2L_110878_111004;chr2L_111118_111906;chr2L_112020_112689 chr2L_111005_111117;chr2L_111907_112019 chr2L_110778_110877;chr2L_112690_112789 29.73 NA 14.29 NA NA NA 10.67 NA 16.28 NA NA NA NA NA NA 13.16 NA NA NA NA 68.18 15.25 NA NA NA NA NA 7.41 7.84 NA 48.44 NA NA NA NA NA 12.50 NA 11.76 NA 51.43 NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 70.00 0.0 N multi_cassette Neu3,F_chr3R_10498229_10498337 chr3R - chr3R_10496565_10498144 chr3R_10496565_10497093;chr3R_10497246_10497330;chr3R_10497526_10498144 chr3R_10497094_10497245;chr3R_10497331_10497525 chr3R_10496222_10496564;chr3R_10498145_10498228 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette CG32685,CREI_chrX_9967445_9972518 chrX - chrX_9967445_9972518 chrX_9967445_9967909;chrX_9968099_9968170;chrX_9968360_9968426;chrX_9968929_9969008;chrX_9969107_9969176;chrX_9969661_9972518 chrX_9967910_9968098;chrX_9968171_9968359;chrX_9968427_9968928;chrX_9969009_9969106;chrX_9969177_9969660 chrX_9967345_9967444;chrX_9972519_9972618 89.47 NA NA NA NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.09 NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 0.0 K multi_cassette Ten-m,EI_chr3L_22298865_22299141,I_chr3L_22300015_22300646,I_chr3L_22374182_22399991 chr3L - chr3L_22296709_22300646 chr3L_22296709_22296798;chr3L_22297211_22297345;chr3L_22297630_22298066;chr3L_22298865_22300646 chr3L_22296799_22297210;chr3L_22297346_22297629;chr3L_22298067_22298864 chr3L_22296163_22296708;chr3L_22300647_22300652 90.91 NA NA NA NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.309497913077e-06 K multi_cassette Vha100-1,I_chr3R_24958227_24960770,RI_chr3R_24959152_24959582,I_chr3R_24959804_24960770,CE_chr3R_24962426_24962797 chr3R + chr3R_24959152_24960770 chr3R_24959152_24959582;chr3R_24959684_24960278;chr3R_24960321_24960770 chr3R_24959583_24959683;chr3R_24960279_24960320 chr3R_24959060_24959151;chr3R_24960771_24960870 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K multi_cassette CG33558,RI_chr2R_2813804_2816013,I_chr2R_2813804_2817753,F_chr2R_2814298_2814894,I_chr2R_2814327_2817753,I_chr2R_2815816_2816013,I_chr2R_2816342_2817327,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2813804_2817753 chr2R_2813804_2814174;chr2R_2814327_2814894;chr2R_2815654_2816013;chr2R_2816342_2817327;chr2R_2817604_2817753 chr2R_2814175_2814326;chr2R_2814895_2815653;chr2R_2816014_2816341;chr2R_2817328_2817603 chr2R_2813704_2813803;chr2R_2817754_2817762 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001923 K multi_cassette CG41378,I_chr2RHet_1545717_1605870,I_chr2RHet_1545717_1621473,I_chr2RHet_1545717_1621569,I_chr2RHet_1606049_1607768,RI_chr2RHet_1606049_1621284,noncoding_9480 chr2RHet - chr2RHet_1545717_1621473 chr2RHet_1545717_1605712;chr2RHet_1605787_1605870;chr2RHet_1606049_1621473 chr2RHet_1605713_1605786;chr2RHet_1605871_1606048 chr2RHet_1545666_1545716;chr2RHet_1621474_1621573 57.73 NA NA 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N multi_cassette Dscam,F_chr2R_3219886_3225754,I_chr2R_3219886_3226532,FI_chr2R_3219886_3227659,F_chr2R_3219886_3228449,F_chr2R_3219886_3228832,F_chr2R_3226043_3235353,F_chr2R_3227948_3235353,F_chr2R_3228738_3235353,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3219886_3235353 chr2R_3219886_3232565;chr2R_3232857_3232989;chr2R_3233281_3235353 chr2R_3232566_3232856;chr2R_3232990_3233280 chr2R_3219786_3219885;chr2R_3235354_3235453 100.00 22.22 22.22 12.50 NA NA 27.27 13.33 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.25 NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA 14.29 NA NA NA 27.27 NA NA NA 0.0 K multi_cassette unc-13,I_chr4_897821_902468,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_899619_903586 chr4_899619_902468;chr4_902576_903242;chr4_903350_903586 chr4_902469_902575;chr4_903243_903349 chr4_899519_899618;chr4_903587_903686 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0000000000000002e-06 K multi_cassette Nipped-B,I_chr2R_583116_587893,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_583116_587893 chr2R_583116_586007;chr2R_586502_586563;chr2R_586657_587893 chr2R_586008_586501;chr2R_586564_586656 chr2R_583016_583115;chr2R_587894_587993 98.51 NA NA 83.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.467648e-06 K multi_cassette CG8671,I_chr2L_21275807_21277205 chr2L + chr2L_21275807_21281131 chr2L_21275807_21277277;chr2L_21278430_21279883;chr2L_21280448_21281131 chr2L_21277278_21278429;chr2L_21279884_21280447 chr2L_21275724_21275806;chr2L_21281132_21281337 3.70 NA NA 13.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Mes2,CEF_chr3L_22939285_22939369 chr3L + chr3L_22939041_22939369 chr3L_22939285_22939369 chr3L_22939370_22939469;chr3L_22938759_22939040 15.48 NA NA 33.33 NA NA 41.94 39.39 NA NA NA NA 40.74 NA NA 36.80 NA NA 36.45 NA 35.64 NA NA NA NA NA NA NA 4.11 NA NA NA 3.92 34.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.2650727293596158e-21 K jcn_only_AD Rip11,E_chrX_18532733_18533695,RI_chrX_18530353_18530870,RI_chrX_18544139_18544185 chrX - chrX_18531820_18533496 chrX_18531820_18532278 chrX_18531668_18531819;chrX_18533497_18534230 75.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.36 NA NA NA NA 86.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG3321,RI_chr3R_10154615_10155360 chr3R + chr3R_10152850_10152974;chr3R_10152811_10152974;chr3R_10152911_10152974 chr3R_10152906_10152974 chr3R_10152975_10153473;chr3R_10152803_10152810 10.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA NA NA NA NA 25.27 27.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0817613216743999e-09 K jcn_only_AD CG9821,I_chr3R_4644986_4645248,I_chr3R_4644986_4645577,I_chr3R_4644986_4645648,I_chr3R_4644986_4646263,RI_chr3R_4644986_4646264,RI_chr3R_4645903_4646033 chr3R - chr3R_4644986_4645248;chr3R_4644986_4645577;chr3R_4644986_4646033 chr3R_4644986_4645649 chr3R_4644886_4644985;chr3R_4646034_4646133 77.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1e-05 K jcn_only_AD CG9932,I_chr2L_13025498_13027193,I_chr2L_13031395_13035824 chr2L - chr2L_13025498_13027065;chr2L_13025498_13027344 chr2L_13025498_13026528 chr2L_13025398_13025497;chr2L_13027345_13027744 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013117999999999999 K jcn_only_AD Rga,Spec2 chr3R - chr3R_1434742_1435371 chr3R_1434742_1435353 chr3R_1434172_1434741;chr3R_1435372_1435603 79.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0013420000000000001 K jcn_only_AD cul-2,RI_chr2L_21657668_21657832,noncoding_4226,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21657777_21657832;chr2L_21657742_21657832 chr2L_21657668_21657832 chr2L_21657833_21657932;chr2L_21657659_21657667 54.76 NA NA 24.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.95 81.15 NA 82.28 NA 79.37 90.32 84.17 80.99 NA NA 82.84 NA 80.49 75.50 NA NA NA 75.63 91.22 NA NA 80.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19562143_19562326 chr2R_19562175_19562326 chr2R_19562327_19562386;chr2R_19561937_19562142 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018200000000000001 K jcn_only_AD akirin,I_chr3L_7363173_7364806,I_chr3L_7363177_7364806,I_chr3L_7363177_7364831,I_chr3L_7363211_7364831,I_chr3L_7363731_7364806,I_chr3L_7364126_7364806,RI_chr3L_7364737_7364806 chr3L + chr3L_7363169_7364806 chr3L_7363285_7364806 chr3L_7364807_7364906;chr3L_7363111_7363168 73.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.77 6.3981167766999986e-08 K jcn_only_AD I_chr2L_12099367_12099435,Aats-thr chr2L + chr2L_12103835_12104491 chr2L_12104057_12104491 chr2L_12104492_12104552;chr2L_12103774_12103834 13.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015578 K jcn_only_AD Psn,RI_chr3L_20430213_20430358 chr3L + chr3L_20427346_20427647;chr3L_20427403_20427647 chr3L_20427445_20427647 chr3L_20427648_20427812;chr3L_20427187_20427345 11.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K jcn_only_AD su(f),I_chrXHet_77570_78035 chrXHet + chrXHet_77736_78035;chrXHet_77832_78035 chrXHet_77570_78035 chrXHet_78036_78135;chrXHet_77470_77569 1.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0098879999999999992 K jcn_only_AD drk,RI_chr2R_9389255_9389317,I_chr2R_9389597_9389751,I_chr2R_9389597_9389907,I_chr2R_9389597_9389940,I_chr2R_9389597_9390151,I_chr2R_9389597_9390271,I_chr2R_9389714_9390195 chr2R - chr2R_9389597_9390151;chr2R_9389597_9389907;chr2R_9389597_9389940;chr2R_9389597_9390293;chr2R_9389597_9389751;chr2R_9389597_9390264;chr2R_9389597_9389753;chr2R_9389597_9389757 chr2R_9389597_9390195 chr2R_9389497_9389596;chr2R_9390294_9390295 77.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.77 96.36 NA 95.59 NA NA NA NA NA 94.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 97.22 NA NA NA NA 1.3297668942856842e-09 K jcn_only_AD gpp,I_chr3R_2271795_2272181,CG33324 chr3R + chr3R_2270033_2272181 chr3R_2271795_2272181 chr3R_2272182_2272281;chr3R_2269544_2270032 26.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015424634720000001 N jcn_only_AD CG9646 chr2R + chr2R_12936500_12937513 chr2R_12936933_12937513 chr2R_12937514_12937680;chr2R_12936416_12936499 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0054819999999999999 K jcn_only_AD Aats-pro chr3L - chr3L_2651281_2651341 chr3L_2651281_2651333 chr3L_2651213_2651280;chr3L_2651342_2651593 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043637000000000002 N jcn_only_AD Fpps chr2R - chr2R_7194465_7194765 chr2R_7194465_7194535 chr2R_7194370_7194464;chr2R_7194766_7195007 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K jcn_only_AD stc chr2L + chr2L_15114214_15114299 chr2L_15114235_15114299 chr2L_15114300_15114310;chr2L_15114049_15114213 28.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035959999999999998 K jcn_only_AD CG7414,I_chr3L_21819515_21819581 chr3L + chr3L_21819853_21820193 chr3L_21820136_21820193 chr3L_21820194_21820958;chr3L_21819575_21819852 25.04 NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3222969999999984e-06 K jcn_only_AD mfas,I_chr3R_7811954_7812017,I_chr3R_7818597_7818853,I_chr3R_7818607_7818853,RI_chr3R_7818607_7818970 chr3R - chr3R_7818575_7818970 chr3R_7818575_7818853 chr3R_7818507_7818574;chr3R_7818971_7818995 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0054819999999999999 K jcn_only_AD RpL27A,E_chr2L_4457411_4457977,I_chr2L_4458058_4458120 chr2L - chr2L_4458058_4458274;chr2L_4458058_4458140;chr2L_4458058_4458162 chr2L_4458058_4458288 chr2L_4457978_4458057;chr2L_4458289_4458357 79.55 NA 96.01 97.70 95.42 94.79 NA 98.22 92.13 NA 94.67 90.11 93.88 NA 97.01 92.97 96.56 89.91 97.33 94.20 94.67 NA 53.23 62.65 NA 94.22 53.93 NA 44.98 56.58 NA NA NA 96.77 56.52 49.23 58.90 53.65 55.02 55.66 62.94 96.44 96.06 58.41 NA 64.29 61.37 NA 91.44 65.53 48.85 NA NA 34.88 96.65 53.29 NA NA 0.0 K jcn_only_AD Tango13,I_chrX_13480088_13480998,I_chrX_13483861_13483954 chrX + chrX_13480088_13483954 chrX_13480126_13483954 chrX_13483955_13484054;chrX_13479988_13480087 4.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038386000000000003 K jcn_only_AD Mical,I_chr3R_5834577_5835458,I_chr3R_5843939_5844218,I_chr3R_5847106_5863537,I_chr3R_5863483_5863537,I_chr3R_5863613_5868513 chr3R - chr3R_5840828_5840905 chr3R_5840828_5840896 chr3R_5840712_5840827;chr3R_5840906_5840969 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015664000000000001 N jcn_only_AD CG2003 chr3R + chr3R_27815249_27815312;chr3R_27815189_27815312 chr3R_27815253_27815312 chr3R_27815313_27816636;chr3R_27815109_27815188 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.58 NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA 15.15 15.71 NA NA NA NA NA NA NA 14.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.62 NA NA 0.0 N jcn_only_AD bchs,I_chr2L_5907926_5908312 chr2L + chr2L_5907288_5908312;chr2L_5907926_5908312 chr2L_5907644_5908312 chr2L_5908313_5908412;chr2L_5907175_5907287 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.54 7.8605905919999984e-07 K jcn_only_AD rudimentary,I_chrX_16559455_16560067,I_chrX_16561903_16561969 chrX + chrX_16559361_16560067 chrX_16559455_16560067 chrX_16560068_16560167;chrX_16559355_16559360 4.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA 26.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00071654770200000001 K jcn_only_AD RhoGDI chr3L + chr3L_19921875_19923914;chr3L_19921911_19923914 chr3L_19922009_19923914 chr3L_19923915_19924114;chr3L_19921868_19921874 94.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.2000000000000002e-05 K jcn_only_AD RpL14 chr3L + chr3L_8594138_8594413 chr3L_8594238_8594413 chr3L_8594414_8594515;chr3L_8594108_8594137 3.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.39 NA NA NA 32.79 NA NA NA 20.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA 33.33 NA 17.83 NA NA 1.7572594087125001e-22 K jcn_only_AD sax chr2R + chr2R_3694104_3694576 chr2R_3694518_3694576 chr2R_3694577_3694706;chr2R_3694102_3694103 4.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025696 K jcn_only_AD heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27805342_27811232;chr3R_27805342_27811214 chr3R_27805342_27810955 chr3R_27805247_27805341;chr3R_27811233_27811433 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049605000000000003 K jcn_only_AD CG4699 chr3R + chr3R_11624133_11624442;chr3R_11624190_11624442;chr3R_11624127_11624442 chr3R_11624200_11624442 chr3R_11624443_11624758;chr3R_11623809_11624126 55.14 NA NA 26.67 22.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4030984715120001e-06 K jcn_only_AD CG34126,I_chr2L_4984636_4984712 chr2L + chr2L_4988849_4990307 chr2L_4989411_4990307 chr2L_4990308_4990450 93.13 NA NA NA NA NA NA NA NA 55.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001142 K jcn_only_AD sec23,I_chr3R_1474873_1475080,I_chr3R_1477727_1478102 chr3R + chr3R_1477525_1478102 chr3R_1477724_1478102 chr3R_1478103_1478202 4.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.28 NA NA NA NA NA NA NA NA 21.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.27e-10 K jcn_only_AD CG10664,REI_chr2L_19958910_19959266 chr2L + chr2L_19958765_19959266 chr2L_19958769_19959266 chr2L_19959267_19959366;chr2L_19958700_19958764 14.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0033549999999999999 K jcn_only_AD mia chr3R - chr3R_1374911_1375314 chr3R_1374911_1375297 chr3R_1374048_1374910;chr3R_1375315_1375484 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012023000000000001 K jcn_only_AD kst,I_chr3L_3365752_3365816,I_chr3L_3367008_3367514 chr3L + chr3L_3367216_3367514;chr3L_3366963_3367514;chr3L_3367011_3367514;chr3L_3367008_3367514 chr3L_3366774_3367514 chr3L_3367515_3367614 58.16 NA NA NA NA 76.22 NA 41.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.50 NA NA NA NA NA NA NA 32.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD tws,I_chr3R_5960899_5960978,CG6241 chr3R - chr3R_5959310_5960163;chr3R_5959310_5960041;chr3R_5959310_5959789;chr3R_5959310_5960049;chr3R_5959310_5960182;chr3R_5959310_5960026;chr3R_5959310_5960158;chr3R_5959310_5959679 chr3R_5959310_5960101 chr3R_5958937_5959309;chr3R_5960183_5960224 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.021003000000000001 K jcn_only_AD CG11347,I_chr3L_4412551_4417819 chr3L + chr3L_4419173_4419428 chr3L_4419263_4419428 chr3L_4419429_4419663;chr3L_4418782_4419172 30.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046890000000000001 N jcn_only_AD CG34126,I_chr2L_4984636_4984712 chr2L + chr2L_4987298_4987906;chr2L_4987319_4987906 chr2L_4987241_4987906 chr2L_4987907_4988048;chr2L_4987159_4987240 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003542 K jcn_only_AD CG1622,I_chrX_13192409_13192738,EI_chrX_13192857_13192928 chrX + chrX_13192846_13192928 chrX_13192857_13192928 chrX_13192929_13192997;chrX_13192807_13192845 6.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015870000000000001 K jcn_only_AD fs(1)h,I_chrX_7947328_7948140,I_chrX_7950171_7952371,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7947328_7948155 chrX_7947328_7948140 chrX_7947228_7947327;chrX_7948156_7948240 3.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035312000000000003 K jcn_only_AD tral,I_chr3L_12511355_12511540,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12511325_12511537 chr3L_12511355_12511537 chr3L_12511538_12511767;chr3L_12511255_12511324 82.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD Tpi chr3R - chr3R_25959817_25960000;chr3R_25959817_25959887 chr3R_25959817_25959972 chr3R_25959232_25959816;chr3R_25960001_25960005 98.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3999999999999999e-05 K jcn_only_AD foi,I_chr3L_8520658_8520733,I_chr3L_8524905_8524976 chr3L + chr3L_8518753_8523659;chr3L_8518805_8523659 chr3L_8518490_8523659 chr3L_8523660_8524249;chr3L_8518407_8518489 7.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046296999999999998 K jcn_only_AD CG5805 chr3R - chr3R_20612625_20613016 chr3R_20612625_20612713 chr3R_20611695_20612624;chr3R_20613017_20613134 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0022339999999999999 K jcn_only_AD shi,RI_chrX_15786633_15786860,RE_chrX_15793108_15795563 chrX + chrX_15786474_15786860;chrX_15786603_15786860;chrX_15786615_15786860;chrX_15786200_15786860;chrX_15786394_15786860 chrX_15786285_15786860 chrX_15786861_15786960;chrX_15786192_15786199 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 0.00039548439 K jcn_only_AD CG18317,RI_chr2L_1718492_1723881 chr2L - chr2L_1718492_1718674;chr2L_1718492_1718739 chr2L_1718492_1718695 chr2L_1718421_1718491;chr2L_1718740_1718903 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG16936,RI_chr2R_20655101_20655166,I_chr2R_20660319_20660496 chr2R - chr2R_20655101_20655161;chr2R_20655101_20655476;chr2R_20655101_20655166 chr2R_20655101_20655620 chr2R_20655001_20655100;chr2R_20655621_20655665 91.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG1965,I_chr3R_2902064_2902611 chr3R + chr3R_2893812_2894429 chr3R_2893817_2894429 chr3R_2894430_2894670;chr3R_2893510_2893811 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014151 K jcn_only_AD CG9705,I_chr3L_16774043_16774562 chr3L + chr3L_16773891_16774562 chr3L_16774043_16774562 chr3L_16774563_16774662;chr3L_16773605_16773890 3.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K jcn_only_AD MAPk-Ak2,RI_chrX_5655618_5656137,I_chrX_5656715_5657427,I_chrX_5656715_5657893,I_chrX_5656715_5657974 chrX - chrX_5656715_5658141;chrX_5656715_5658101 chrX_5656715_5658126 chrX_5656615_5656714;chrX_5658142_5658214 81.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6557799999999993e-05 K jcn_only_AD I_chr2R_9844856_9845327,CG13349,RI_chr2R_9846641_9846709 chr2R - chr2R_9847615_9847752;chr2R_9847615_9847732 chr2R_9847615_9847823 chr2R_9847073_9847614;chr2R_9847824_9847834 0.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 0.014149 K jcn_only_AD Tequila chr3L + chr3L_9068723_9080948 chr3L_9080889_9080948 chr3L_9080949_9081215 89.58 NA NA 40.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.49 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.15138503e-10 K jcn_only_AD CG33156 chr2R - chr2R_9437422_9439612 chr2R_9437422_9439456 chr2R_9437104_9437421;chr2R_9439613_9439932 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000314391345 K jcn_only_AD Nacalpha,I_chr2R_8648027_8648303 chr2R - chr2R_8648027_8648309;chr2R_8648027_8648231 chr2R_8648027_8648305 chr2R_8647927_8648026;chr2R_8648310_8648314 16.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.86 NA NA NA 83.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 70.63 NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD l(2)k01209,I_chr2R_13308079_13310771,I_chr2R_13309452_13310771,RI_chr2R_13310877_13311160 chr2R + chr2R_13309417_13311160;chr2R_13308486_13311160;chr2R_13308079_13311160 chr2R_13309452_13311160 chr2R_13311161_13311260;chr2R_13307979_13308078 57.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013372999999999999 K jcn_only_AD CG3829,I_chr2R_20874677_20875710,I_chr2R_20874711_20875717,I_chr2R_20875172_20875710,I_chr2R_20875497_20875710 chr2R + chr2R_20875497_20875710;chr2R_20875172_20875710;chr2R_20875350_20875710 chr2R_20874711_20875710 chr2R_20875711_20875810;chr2R_20874611_20874710 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000618737504 K jcn_only_AD Cg25C,I_chr2L_5029811_5029873 chr2L + chr2L_5029811_5030136;chr2L_5029747_5030136 chr2L_5029637_5030136 chr2L_5030137_5030237;chr2L_5029620_5029636 16.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.37 NA NA NA NA NA 4.0781983658130001e-06 N jcn_only_AD CG8051,I_chrX_19198128_19201351 chrX - chrX_19198128_19199326;chrX_19198128_19201671 chrX_19198128_19199330 chrX_19198028_19198127;chrX_19201672_19201734 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016435000000000002 N jcn_only_AD I_chr2R_17543813_17543881,CG10320 chr2R + chr2R_17545799_17545850;chr2R_17545767_17545850;chr2R_17545781_17545850;chr2R_17545686_17545850;chr2R_17545690_17545850 chr2R_17545615_17545850 chr2R_17545851_17545985;chr2R_17545613_17545614 46.25 NA NA NA 78.82 NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA 76.79 NA 78.26 NA 82.19 NA NA NA 0.00 2.56 NA NA 10.53 NA 16.22 11.43 NA NA NA 75.70 NA 12.50 19.40 NA 16.67 16.13 NA 78.49 NA NA NA NA NA NA NA 12.20 8.93 NA NA 4.88 NA 14.29 NA NA 5.7380488737903221e-47 K jcn_only_AD heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27798276_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27691048_27691484 chr3R_27691048_27691472 chr3R_27690854_27691047;chr3R_27691485_27691758 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035149999999999999 N jcn_only_AD myoglianin,RI_chr4_712986_714006,RI_chr4_716066_716482,RI_chr4_716153_716613 chr4 - chr4_715043_716322;chr4_715043_716708;chr4_715043_716482;chr4_715043_716613 chr4_715043_715839 chr4_714007_715042;chr4_716709_716712 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0082629999999999995 N jcn_only_AD CG3191,CG3091,I_chrX_2147635_2147990 chrX - chrX_2145388_2146756 chrX_2145388_2145704 chrX_2145228_2145387;chrX_2146757_2146893 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0039199999999999999 K jcn_only_AD CG5059,I_chr3L_20509233_20511440,I_chr3L_20509985_20510360 chr3L - chr3L_20509233_20512316 chr3L_20509233_20512067 chr3L_20509133_20509232;chr3L_20512317_20512503 92.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017204000000000001 K jcn_only_AD I_chr2L_19388570_19389922,CG17544 chr2L - chr2L_19393657_19398346;chr2L_19393657_19398350 chr2L_19393657_19398334 chr2L_19393497_19393656;chr2L_19398351_19398401 44.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018699999999999999 K jcn_only_AD SdhA,I_chr2R_15283283_15283411,I_chr2R_15283319_15283369 chr2R - chr2R_15283283_15283415 chr2R_15283283_15283369 chr2R_15283219_15283282;chr2R_15283416_15283469 59.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0155719999999999e-05 K jcn_only_AD l(2)k05819,I_chr2L_4396173_4396266 chr2L + chr2L_4396128_4396809;chr2L_4396407_4396809 chr2L_4396173_4396809 chr2L_4396810_4396906;chr2L_4396073_4396127 52.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.07 NA 85.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.363725e-12 K jcn_only_AD osa chr3R - chr3R_13522309_13523386 chr3R_13522309_13523377 chr3R_13522092_13522308;chr3R_13523387_13523635 20.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010272 K jcn_only_AD Treh,I_chr2R_16972565_16972702,I_chr2R_16975359_16975442,RI_chr2R_16975359_16975842,I_chr2R_16975364_16975842 chr2R + chr2R_16974443_16975285 chr2R_16974918_16975285 chr2R_16975286_16975358;chr2R_16974405_16974442 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.37 0.00099700000000000006 N jcn_only_AD Uhg3,noncoding_4006,E_chr2L_20647810_20648188,R_chr2L_20648002_20648194,snoRNA:Me28S-C2645b chr2L + chr2L_20647789_20648188 chr2L_20648014_20648188 chr2L_20648189_20648248;chr2L_20647710_20647788 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.22 79.03 NA NA NA NA NA NA 81.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.98 NA NA 0.0 N jcn_only_AD CG15211,EF_chrX_10666660_10666923 chrX + chrX_10666660_10671993 chrX_10667200_10671993 chrX_10671994_10672161;chrX_10666577_10666659 52.01 NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA 5.26 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 3.9110327589585372e-19 K jcn_only_AD CG33170,RI_chr3L_22859073_22860499,I_chr3L_22859135_22860499 chr3L + chr3L_22859073_22860499;chr3L_22860419_22860499;chr3L_22859061_22860499 chr3L_22859135_22860499 chr3L_22860500_22860559 3.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0070600000000000003 K jcn_only_AD RpL31,CG1827 chr2R + chr2R_5474844_5474951;chr2R_5474789_5474951 chr2R_5474734_5474951 chr2R_5474952_5475211;chr2R_5474727_5474733 96.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.46 NA NA NA NA 1.0000000000000002e-10 N jcn_only_AD CG8678,RI_chr2L_21213167_21213227 chr2L - chr2L_21214648_21220259 chr2L_21214648_21215016 chr2L_21213917_21214647;chr2L_21220260_21220516 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0082990000000000008 K jcn_only_AD RpL28,RI_chr3L_3221710_3221877,I_chr3L_3221982_3222744,snoRNA:Or-CD11c chr3L - chr3L_3221982_3222787;chr3L_3221982_3222574;chr3L_3221982_3222926;chr3L_3221982_3222365;chr3L_3221982_3222847 chr3L_3221982_3222152 chr3L_3221882_3221981;chr3L_3222927_3222958 2.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.72 NA NA NA NA NA NA NA NA 14.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Gp150,I_chr2R_18205316_18205386,I_chr2R_18213233_18213308 chr2R + chr2R_18205274_18205386;chr2R_18205316_18205386;chr2R_18205282_18205386 chr2R_18205243_18205386 chr2R_18205387_18205459;chr2R_18205216_18205242 96.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.29 NA NA NA NA 0.0045970000000000004 N jcn_only_AD CG17184 chr3R - chr3R_7059293_7059643 chr3R_7059293_7059355 chr3R_7059124_7059292;chr3R_7059644_7060166 0.00 NA NA NA NA NA NA 10.47 NA NA NA NA NA NA 10.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.3780014999999997e-05 K jcn_only_AD Aldh-III,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3357578_3357898 chr2R_3357578_3357636 chr2R_3357478_3357577;chr2R_3357899_3358120 3.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD RpS27A,Ip259 chr2L + chr2L_10408387_10408738 chr2L_10408622_10408738 chr2L_10408739_10409132;chr2L_10408376_10408386 9.42 NA NA NA NA NA NA NA NA 58.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA 41.67 56.00 NA 45.24 NA NA NA NA 63.89 59.26 NA NA NA 23.68 37.78 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA 51.35 NA NA 47.73 NA NA 27.69 23.73 0.0 K jcn_only_AD Cip4,I_chr3L_4363128_4363769,I_chr3L_4363386_4363987 chr3L - chr3L_4324448_4324921 chr3L_4324448_4324861 chr3L_4324284_4324447;chr3L_4324922_4324996 31.07 NA NA NA NA NA NA NA NA 67.65 NA NA NA NA NA NA NA 64.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.46 4.5311999999999994e-13 K jcn_only_AD vkg,I_chr2L_5027222_5027297,I_chr2L_5027222_5028118 chr2L - chr2L_5027222_5028118;chr2L_5027222_5027351 chr2L_5027222_5027297 chr2L_5027122_5027221;chr2L_5028119_5028218 9.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016456999999999999 K jcn_only_AD CG17508,RI_chr2R_1496995_1497120 chr2R + chr2R_1496288_1496517;chr2R_1496337_1496517;chr2R_1496303_1496517 chr2R_1496341_1496517 chr2R_1496518_1496994;chr2R_1496153_1496287 0.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0087939999999999997 K jcn_only_AD sqh,I_chrX_6118043_6119039,I_chrX_6118150_6118725,I_chrX_6118150_6118729,I_chrX_6118150_6118790,I_chrX_6118150_6118800 chrX - chrX_6118150_6118729;chrX_6118150_6118725;chrX_6118150_6119039;chrX_6118150_6118949 chrX_6118150_6119035 chrX_6118050_6118149;chrX_6119040_6119139 1.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD noncoding_4622,CE_chr2R_2237053_2237111 chr2R - chr2R_2237036_2237093;chr2R_2237036_2237086 chr2R_2237036_2237090 chr2R_2236997_2237035;chr2R_2237094_2237159 75.13 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8033298497495345e-15 N jcn_only_AD hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16323441_16324653 chrX_16324290_16324653 chrX_16324654_16324797;chrX_16323093_16323440 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020164999999999999 K jcn_only_AD CG7816,R_chr3R_25691122_25691551,RI_chr3R_25691122_25692883,RI_chr3R_25691122_25694436 chr3R - chr3R_25691122_25694365 chr3R_25691122_25694254 chr3R_25691022_25691121;chr3R_25694366_25694618 83.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047766000000000003 K jcn_only_AD Syx4,I_chrX_2635555_2635621,I_chrX_2636831_2636971 chrX - chrX_2633579_2633652;chrX_2633579_2633742 chrX_2633579_2635455 chrX_2633330_2633578;chrX_2635456_2635529 82.03 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011809 K jcn_only_AD CG7048,I_chr3R_18313003_18313231,R_chr3R_18313119_18313234,I_chr3R_18313402_18313502 chr3R + chr3R_18313003_18313231 chr3R_18313115_18313231 chr3R_18313232_18313331;chr3R_18312937_18313002 99.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD plexA,RI_chr4_1036247_1047588,RI_chr4_1040642_1047395,RI_chr4_1044307_1046841,RF_chr4_1044307_1047399 chr4 - chr4_1044307_1047395;chr4_1044307_1047399 chr4_1044307_1047588 chr4_1044207_1044306;chr4_1047589_1047625 42.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036401000000000003 K jcn_only_AD CG6912 chr3R - chr3R_10962115_10962204 chr3R_10962115_10962193 chr3R_10962052_10962114;chr3R_10962205_10962253 95.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003088 N jcn_only_AD Pvf2 chr2L - chr2L_7083729_7084481 chr2L_7083729_7083829 chr2L_7083186_7083728;chr2L_7084482_7084625 0.00 NA NA NA NA NA 23.64 NA NA 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.34 NA NA NA NA 33.33 60.00 44.44 48.39 NA 40.00 NA NA NA 40.00 NA NA NA 34.55 36.84 NA NA 31.11 NA NA NA 38.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD zip,I_chr2R_20878796_20879147 chr2R - chr2R_20898140_20898992;chr2R_20898140_20898834 chr2R_20898140_20898898 chr2R_20897903_20898139;chr2R_20898993_20898996 73.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.23 NA NA NA NA NA 83.69 85.89 84.56 NA 83.27 51.31 32.07 30.00 37.14 NA 20.69 NA NA NA NA NA NA NA NA 48.24 55.03 35.05 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.20 NA NA 43.75 29.44 44.25 49.44 17.19 NA 46.07 NA NA 0.0 K jcn_only_AD E2f,CG6353 chr3R - chr3R_17487942_17488440 chr3R_17487942_17488436 chr3R_17486978_17487941;chr3R_17488441_17488464 3.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041671 K jcn_only_AD RpL15 chr3LHet + chr3LHet_2398018_2398127;chr3LHet_2397859_2398127;chr3LHet_2397925_2398127;chr3LHet_2397992_2398127;chr3LHet_2398060_2398127;chr3LHet_2397841_2398127;chr3LHet_2398002_2398127;chr3LHet_2398053_2398127 chr3LHet_2397820_2398127 chr3LHet_2398128_2398454;chr3LHet_2397802_2397819 71.62 NA NA 90.59 NA NA 15.38 87.63 36.62 NA NA NA 30.95 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 95.32 NA NA NA NA NA 95.26 NA NA NA 92.86 97.27 88.00 95.74 NA NA NA 30.43 98.87 91.21 NA NA 98.05 92.71 90.52 NA 96.15 NA 14.81 NA NA 98.80 NA NA NA NA 96.77 0.0 K jcn_only_AD trbd chr3R - chr3R_5535271_5535611;chr3R_5535271_5536695 chr3R_5535271_5536202 chr3R_5535110_5535270;chr3R_5536696_5536730 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0053969999999999999 N jcn_only_AD I_chrX_4000307_4003527,CG4857 chrX + chrX_4011929_4011996;chrX_4011315_4011996;chrX_4011270_4011996 chrX_4011429_4011996 chrX_4011997_4012308;chrX_4011093_4011269 0.00 NA NA 34.78 NA NA 29.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA 28.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.11 NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA 32.69 NA NA NA 6.061143433840552e-17 N jcn_only_AD Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11824186;chr2R_11824086_11825790 chr2R_11824086_11824525 chr2R_11823989_11824085 82.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6e-05 K jcn_only_AD crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11800323_11802370;chr2L_11800323_11802286;chr2L_11800323_11802343 chr2L_11800323_11802904 chr2L_11800155_11800322;chr2L_11802905_11803004 7.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.44 NA NA NA NA NA 25.45 NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD B52,F_chr3R_9488762_9491174,E_chr3R_9488770_9491174 chr3R + chr3R_9488774_9491174 chr3R_9490657_9491174 chr3R_9491175_9491248 11.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD opa1-like,I_chr2R_10119470_10120234,I_chr2R_10121848_10121900,I_chr2R_10122128_10122197,I_chr2R_10122334_10122393 chr2R - chr2R_10119470_10120234;chr2R_10119470_10120220 chr2R_10119470_10120229 chr2R_10119370_10119469;chr2R_10120235_10120334 64.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K jcn_only_AD lig,CI_chr2R_3962006_3962916,I_chr2R_3962357_3962977,RI_chr2R_3962875_3962977 chr2R + chr2R_3961577_3962977;chr2R_3961910_3962977 chr2R_3962006_3962977 chr2R_3962978_3963016;chr2R_3961479_3961576 97.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD pAbp,I_chr2R_14027838_14028996 chr2R + chr2R_14028460_14028992 chr2R_14028922_14028992 chr2R_14028993_14029177;chr2R_14028264_14028459 58.41 NA NA NA NA NA NA NA NA 81.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.16 77.94 92.37 88.51 NA 76.00 80.37 79.64 NA NA NA NA NA NA NA 86.71 NA 87.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.11 NA 0.0 N jcn_only_AD MB8.chr3R.pasa.66,alpha-Est10,I_chr3R_3314337_3319450 chr3R - chr3R_3314337_3317062 chr3R_3314337_3314410 chr3R_3314237_3314336;chr3R_3317063_3317412 0.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0029129999999999998 N jcn_only_AD CG9674,I_chr3L_16785706_16785748,I_chr3L_16793055_16800660 chr3L - chr3L_16789438_16792144 chr3L_16789438_16791271 chr3L_16788351_16789437;chr3L_16792145_16792272 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K jcn_only_AD CG5021 chr3L + chr3L_8960084_8960227 chr3L_8960093_8960227 chr3L_8960228_8960310;chr3L_8959939_8960083 37.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046917 K jcn_only_AD kis,RI_chr2L_231035_231947,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_231035_231962 chr2L_231035_231947 chr2L_230935_231034;chr2L_231963_232047 15.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.07 NA NA NA NA NA NA 37.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5266934000000001e-05 K jcn_only_AD CG31716,I_chr2L_10397648_10398034 chr2L + chr2L_10399689_10399767;chr2L_10399677_10399767 chr2L_10399713_10399767 chr2L_10399768_10400679;chr2L_10399595_10399676 25.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012241 K jcn_only_AD sop,RI_chr2L_9897132_9897211 chr2L - chr2L_9897132_9897472 chr2L_9897132_9897211 chr2L_9897032_9897131;chr2L_9897473_9897825 3.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001738 K jcn_only_AD CG31955,RI_chr2L_3712446_3712767 chr2L - chr2L_3712446_3712767 chr2L_3712446_3712497 chr2L_3712346_3712445;chr2L_3712768_3712862 86.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016997000000000002 K jcn_only_AD CG34394,I_chr2L_3365674_3365965 chr2L - chr2L_3367720_3367903 chr2L_3367720_3367850 chr2L_3367245_3367719;chr2L_3367904_3368056 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0051659999999999996 K jcn_only_AD eRF1,CG5618,I_chr3L_20346714_20347106,I_chr3L_20346738_20347058,I_chr3L_20348230_20348404 chr3L + chr3L_20341925_20342041;chr3L_20341636_20342041;chr3L_20341509_20342041;chr3L_20341865_20342041;chr3L_20341486_20342041;chr3L_20341751_20342041;chr3L_20341530_20342041;chr3L_20341629_20342041;chr3L_20341598_20342041;chr3L_20341759_20342041 chr3L_20341522_20342041 chr3L_20342042_20342306;chr3L_20341482_20341485 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040059999999999998 K jcn_only_AD LIMK1,I_chrX_12488942_12489000 chrX - chrX_12484518_12486000;chrX_12484518_12485963 chrX_12484518_12486079 chrX_12483874_12484517;chrX_12486080_12486162 1.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011036000000000001 N jcn_only_AD CG8531,RI_chr2R_10144869_10144912 chr2R + chr2R_10145138_10145276;chr2R_10145070_10145276 chr2R_10145224_10145276 chr2R_10145277_10145393;chr2R_10144926_10145069 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.79 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.17 83.33 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Vha16,I_chr2R_2519645_2520499,RI_chr2R_2519646_2519840,I_chr2R_2519646_2520292,I_chr2R_2519646_2520298,I_chr2R_2519775_2520499 chr2R - chr2R_2519646_2519828 chr2R_2519646_2519810 chr2R_2519546_2519645;chr2R_2519829_2519868 26.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7e-05 K jcn_only_AD rin,I_chr3R_9476825_9476895 chr3R + chr3R_9476782_9476895 chr3R_9476825_9476895 chr3R_9476896_9476995;chr3R_9476725_9476781 0.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000102 K jcn_only_AD None chrU + chrU_1182323_1183262;chrU_1178980_1183262 chrU_1179335_1183262 97.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0052859999999999999 K jcn_only_AD RI_chrX_1796525_1796585,mip130,I_chrX_1820956_1821011,CG11596 chrX + chrX_1821927_1822366 chrX_1821953_1822366 chrX_1822367_1822613;chrX_1821726_1821926 95.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00032311812499999999 K jcn_only_AD Abl,I_chr3L_16622304_16639909,RI_chr3L_16652567_16654512 chr3L - chr3L_16618375_16619627 chr3L_16618375_16619372 chr3L_16616737_16618374;chr3L_16619628_16619716 8.70 NA NA 41.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K jcn_only_AD CG7843,I_chr2R_1972736_1972822 chr2R - chr2R_1971513_1972012 chr2R_1971513_1971673 chr2R_1971446_1971512;chr2R_1972013_1972292 13.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD skpA chrX + chrX_550498_551131;chrX_550818_551131;chrX_550638_551131;chrX_550774_551131;chrX_550523_551131;chrX_550654_551131 chrX_550433_551131 chrX_551132_551937;chrX_550426_550432 16.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.03 NA 1.14 NA NA NA NA NA NA 3.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.8021461999999992e-11 K jcn_only_AD kuz,E_chr2L_13550294_13551106,CE_chr2L_13558833_13594255,F_chr2L_13635998_13637287,RI_chr2L_13636519_13636577,I_chr2L_13636762_13637287 chr2L + chr2L_13636762_13637287;chr2L_13636844_13637287 chr2L_13636002_13637287 chr2L_13637288_13637387 68.49 NA NA 22.58 NA NA 40.86 NA NA NA 33.82 19.05 NA NA NA 41.59 NA 32.22 NA NA 31.18 NA NA NA NA 31.63 NA NA NA NA NA NA 42.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD vlc chr2R + chr2R_1589894_1590371;chr2R_1589799_1590371;chr2R_1589805_1590371;chr2R_1590318_1590371;chr2R_1589807_1590371;chr2R_1590294_1590371;chr2R_1589722_1590371;chr2R_1589693_1590371 chr2R_1589953_1590371 chr2R_1590372_1590451;chr2R_1589612_1589692 2.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0056930000000000001 K jcn_only_AD CG10737 chr2R + chr2R_15062592_15063692;chr2R_15062754_15063692 chr2R_15062814_15063692 chr2R_15063693_15063852;chr2R_15062387_15062591 70.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.15 NA NA 83.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2908999999999997e-08 N jcn_only_AD RhoGAP18B chrX - chrX_19038625_19040000 chrX_19038625_19038713 chrX_19038597_19038624;chrX_19040001_19040175 0.00 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG42533,EI_chr2L_7473200_7473297,RI_chr2L_7473200_7473419,F_chr2L_7476906_7476978 chr2L - chr2L_7473200_7473656;chr2L_7473200_7473297;chr2L_7473200_7473770 chr2L_7473200_7473419 chr2L_7473100_7473199;chr2L_7473771_7473889 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA 10.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016077990249999999 N jcn_only_AD noncoding_14363 chr3LHet - chr3LHet_709742_709797 chr3LHet_709742_709795 chr3LHet_709691_709741;chr3LHet_709798_709832 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020382999999999998 K jcn_only_AD cul-2,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21661637_21662083 chr2L_21662021_21662083 chr2L_21662084_21662183;chr2L_21661537_21661636 2.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046768999999999998 K jcn_only_AD His4r chr3R + chr3R_10451538_10451747;chr3R_10451564_10451747 chr3R_10451640_10451747 chr3R_10451748_10451951;chr3R_10451469_10451537 7.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA 27.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.7259000000000007e-07 K jcn_only_AD chic,RI_chr2L_5976783_5980950,I_chr2L_5979705_5979818,I_chr2L_5979705_5979941,RI_chr2L_5979705_5979951,I_chr2L_5979705_5979953,I_chr2L_5979705_5980025,I_chr2L_5979705_5980213,I_chr2L_5979705_5980370,I_chr2L_5979705_5980558,I_chr2L_5979705_5980632,I_chr2L_5979705_5980639,RI_chr2L_5979705_5980734 chr2L - chr2L_5979705_5980952;chr2L_5979705_5980950 chr2L_5979705_5980846 chr2L_5979605_5979704;chr2L_5980953_5981025 5.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA 16.13 19.01 NA NA 30.39 NA 17.46 NA NA 0.0 K jcn_only_AD scrib,I_chr3R_22362324_22363015,I_chr3R_22381374_22399575,I_chr3R_22406745_22416162,I_chr3R_22416440_22420970,I_chr3R_22425016_22429281 chr3R + chr3R_22362244_22363092;chr3R_22362120_22363092;chr3R_22362315_22363092;chr3R_22362254_22363092;chr3R_22362224_22363092;chr3R_22362142_22363092 chr3R_22362324_22363092 chr3R_22363093_22363115;chr3R_22362112_22362119 19.01 NA NA NA NA NA NA NA NA 54.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.88 NA NA NA NA NA 43.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.15631560786e-07 K jcn_only_AD F_chr3R_19799277_19802225,CG5902,Rab7 chr3R + chr3R_19812438_19812753 chr3R_19812669_19812753 chr3R_19812754_19812932;chr3R_19812343_19812437 32.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.64 NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA 84.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.09 0.0 K jcn_only_AD scrib,RI_chr3R_22402364_22402676,I_chr3R_22406745_22416162,I_chr3R_22416440_22420970,I_chr3R_22425016_22429281 chr3R + chr3R_22401171_22404442 chr3R_22402364_22404442 chr3R_22404443_22404553 19.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020603 K jcn_only_AD Moe,I_chrX_8774434_8791759 chrX - chrX_8768435_8768544 chrX_8768435_8768535 chrX_8768222_8768434;chrX_8768545_8768932 32.98 NA NA NA NA NA NA 22.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD RpL12,I_chr2R_19948517_19948682 chr2R + chr2R_19947968_19948035 chr2R_19947973_19948035 chr2R_19948036_19948097;chr2R_19947923_19947967 48.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.00 NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.78 NA NA NA 5.04 NA 17.50 NA 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 26.73 0.0 K jcn_only_AD Sec16,I_chrX_12501913_12502010,I_chrX_12502899_12502973 chrX + chrX_12499422_12501730 chrX_12500187_12501730 chrX_12501731_12501912 3.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00047199999999999998 K jcn_only_AD Nedd4,I_chr3L_17532828_17532882,I_chr3L_17532828_17533787,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17532828_17533790 chr3L_17532837_17533790 chr3L_17533791_17533887;chr3L_17532728_17532827 85.92 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014924 K jcn_only_AD AnnIX chr3R + chr3R_16891137_16893167;chr3R_16891124_16893167;chr3R_16891033_16893167 chr3R_16891008_16893167 chr3R_16893168_16893221;chr3R_16890951_16891007 34.64 NA 53.87 59.63 NA 52.67 NA 57.85 NA NA NA NA NA NA 59.66 NA NA NA 52.96 51.59 NA NA 6.48 2.15 6.00 54.88 8.73 10.20 NA NA 53.52 NA 62.90 58.70 13.93 NA 5.26 5.97 6.43 NA NA 53.50 56.25 NA 66.29 NA 5.61 61.43 61.77 3.49 7.48 9.86 NA 4.72 57.39 6.06 4.71 66.22 0.0 N jcn_only_AD CG33936,CG33937,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5182946_5183705;chr3R_5180806_5183705 chr3R_5183178_5183705 chr3R_5183706_5183805 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11821325_11821703 chr2R_11821325_11821603 chr2R_11821304_11821324;chr2R_11821704_11822085 8.43 NA NA 26.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0034299999999999999 K jcn_only_AD CG32803,I_chrX_1795648_1795700,RI_chrX_1795648_1795745,I_chrX_1798310_1798525,I_chrX_1798315_1798577 chrX - chrX_1795648_1795832 chrX_1795648_1795745 chrX_1795548_1795647;chrX_1795833_1795845 9.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00057700000000000004 K jcn_only_AD EI_chr2L_13164741_13164824,Sfmbt chr2L - chr2L_13170785_13171381 chr2L_13170785_13171312 chr2L_13169657_13170784;chr2L_13171382_13171665 40.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9210399999999998e-07 N jcn_only_AD prominin-like,I_chr3L_3121200_3123087 chr3L - chr3L_3117406_3117833 chr3L_3117406_3117486 chr3L_3117346_3117405;chr3L_3117834_3117973 4.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG2818 chr2L + chr2L_3714584_3714646;chr2L_3714574_3714646 chr2L_3714492_3714646 chr2L_3714647_3716104;chr2L_3714467_3714491 60.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014308 K jcn_only_AD RpL5,I_chr2L_22428750_22428846 chr2L - chr2L_22429111_22429352 chr2L_22429111_22429268 chr2L_22428847_22429110;chr2L_22429353_22429396 99.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.93 81.71 NA NA 87.76 85.35 NA NA NA NA NA NA 58.74 72.44 NA NA 88.22 NA 88.53 NA 77.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG1622,REI_chrX_13191277_13191339,RI_chrX_13191703_13191779,I_chrX_13191916_13192167,I_chrX_13192409_13192738,EI_chrX_13192857_13192928 chrX + chrX_13191685_13191779 chrX_13191703_13191779 chrX_13191780_13191847;chrX_13191617_13191684 3.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6999999999999999e-05 N jcn_only_AD CG10353,I_chrX_11775936_11778830,I_chrX_11778617_11778830,RI_chrX_11780885_11780988 chrX - chrX_11775936_11777234;chrX_11775936_11777220;chrX_11775936_11777133;chrX_11775936_11776142 chrX_11775936_11776058 chrX_11775836_11775935;chrX_11777235_11777654 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.8083118750000004e-09 N jcn_only_AD CG6199 chr3L - chr3L_11196773_11198004 chr3L_11196773_11197305 chr3L_11196633_11196772;chr3L_11198005_11198090 42.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.21 NA NA 70.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 2.365863504e-09 K jcn_only_AD RpL27,I_chr3R_21510239_21510298,RI_chr3R_21510239_21510441,I_chr3R_21510239_21510464,I_chr3R_21510239_21510656,I_chr3R_21510239_21510726 chr3R - chr3R_21510239_21510464;chr3R_21510239_21510656;chr3R_21510239_21510739;chr3R_21510239_21510680;chr3R_21510239_21510298 chr3R_21510239_21510746 chr3R_21510139_21510238;chr3R_21510747_21510756 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.57 NA NA NA NA NA 20.31 NA 81.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.56 NA NA NA 2.0639247297343289e-12 K jcn_only_AD p53,CG17119,sav chr3R - chr3R_18876847_18878643 chr3R_18876847_18876911 chr3R_18876537_18876846;chr3R_18878644_18878670 36.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016609999999999999 N jcn_only_AD CG17760 chr2R + chr2R_8513482_8514257;chr2R_8513642_8514257 chr2R_8513731_8514257 chr2R_8514258_8514421;chr2R_8513465_8513481 0.00 NA NA NA NA NA 29.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026932999999999999 K jcn_only_AD RhoGAP15B chrX + chrX_16843485_16845017 chrX_16843611_16845017 chrX_16845018_16847301;chrX_16842887_16843484 6.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD scaf6,EI_chr3L_17037760_17037808 chr3L - chr3L_17032731_17034793;chr3L_17032731_17033538 chr3L_17032731_17033237 chr3L_17032656_17032730 52.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-05 K jcn_only_AD flr chr3L + chr3L_13406076_13406416 chr3L_13406174_13406416 chr3L_13406417_13406538;chr3L_13405928_13406075 3.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD rin,I_chr3R_9476825_9476895 chr3R + chr3R_9472923_9474639 chr3R_9473269_9474639 chr3R_9474640_9476216;chr3R_9472709_9472922 50.90 NA NA 24.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD alt,I_chr3R_13503901_13504925,RI_chr3R_13503901_13505368,I_chr3R_13503901_13507824 chr3R - chr3R_13503901_13508178;chr3R_13503901_13508123;chr3R_13503901_13508180 chr3R_13503901_13507816 chr3R_13503801_13503900;chr3R_13508181_13508234 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 0.014206999999999999 K jcn_only_AD ps,I_chr3R_5243723_5265067,I_chr3R_5243723_5270765,noncoding_15575,I_chr3R_5245770_5265067,I_chr3R_5245770_5269732,I_chr3R_5269733_5270765 chr3R + chr3R_5243723_5257750 chr3R_5245770_5257750 chr3R_5257751_5258205;chr3R_5243705_5243722 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019931000000000001 N jcn_only_AD Syx4,I_chrX_2635555_2635621,I_chrX_2636831_2636971 chrX - chrX_2636025_2636593 chrX_2636025_2636091 chrX_2635931_2636024;chrX_2636594_2636830 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027528 N jcn_only_AD CG30492,C_chr2R_3522706_3523025,CG30494,RI_chr2R_3536203_3536977,I_chr2R_3543397_3543455 chr2R + chr2R_3528123_3535801 chr2R_3533932_3535801 chr2R_3535802_3535913;chr2R_3527622_3528122 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013117999999999999 N jcn_only_AD CG32066 chr3L - chr3L_10652769_10654020 chr3L_10652769_10653882 chr3L_10652465_10652768;chr3L_10654021_10654125 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0055170000000000002 K jcn_only_AD CG32529 chrX + chrX_19781447_19793044 chrX_19781526_19793044 chrX_19793045_19793075;chrX_19781430_19781446 36.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010226000000000001 K jcn_only_AD Rab5,I_chr2L_2361586_2364444,RI_chr2L_2361586_2364627,I_chr2L_2361586_2364794 chr2L - chr2L_2361586_2364480;chr2L_2361586_2364836;chr2L_2361586_2365060;chr2L_2361586_2364302;chr2L_2361586_2364594;chr2L_2361586_2364312;chr2L_2361586_2364889 chr2L_2361586_2364640 chr2L_2361486_2361585;chr2L_2365061_2365065 34.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.14 NA NA NA NA NA 56.18 58.28 63.89 NA 64.50 72.77 NA NA NA NA NA NA 63.01 65.06 NA NA 57.83 56.94 56.60 NA 65.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.38 0.0 K jcn_only_AD stai,I_chr2L_6110225_6121773 chr2L + chr2L_6122411_6122977 chr2L_6122854_6122977 chr2L_6122978_6123837 91.18 NA NA NA NA NA 68.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.16259e-06 K jcn_only_AD CG34123,I_chr2R_11159045_11159622,RI_chr2R_11160894_11162043,I_chr2R_11167854_11168411 chr2R - chr2R_11154968_11155346 chr2R_11154968_11155310 chr2R_11154735_11154967;chr2R_11155347_11155470 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0419000000000003e-07 K jcn_only_AD CG18624,RI_chrX_7787450_7787620,RI_chrX_7787450_7787687,RI_chrX_7787524_7787687 chrX - chrX_7787524_7787782 chrX_7787524_7787620 chrX_7787424_7787523;chrX_7787783_7787787 27.70 NA 11.86 NA 11.56 7.65 NA NA 11.68 NA 10.53 NA NA NA 9.23 NA 11.39 10.43 NA 8.66 NA 67.39 NA NA NA NA 78.57 NA 79.31 NA NA NA 58.44 NA NA 71.79 NA NA NA NA NA 9.41 NA NA NA NA NA NA 11.27 NA NA NA NA NA 8.82 NA NA NA 5.8611126748292239e-42 K jcn_only_AD CG1814,Updo chr2R + chr2R_5467293_5467467 chr2R_5467342_5467467 chr2R_5467468_5467871;chr2R_5467024_5467292 63.14 NA NA NA NA NA NA 97.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0087930000000000005 K jcn_only_AD CG31650,I_chr2L_5042885_5042960,I_chr2L_5042888_5042983,I_chr2L_5042891_5042964,I_chr2L_5042891_5043016,RI_chr2L_5042935_5042983,I_chr2L_5043017_5043077 chr2L - chr2L_5042891_5043077;chr2L_5042891_5042983 chr2L_5042891_5042960 chr2L_5042835_5042890;chr2L_5043078_5043083 75.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0060280000000000004 K jcn_only_AD CG2177,I_chr4_334269_334329,I_chr4_334269_334505 chr4 - chr4_334269_334329;chr4_334269_334373 chr4_334269_334324 chr4_334169_334268;chr4_334374_334429 10.71 NA NA NA NA NA 37.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000212 N jcn_only_AD CG17255,I_chrX_10366177_10366615,RI_chrX_10366177_10367270 chrX - chrX_10366177_10367360;chrX_10366177_10367201;chrX_10366177_10367458;chrX_10366177_10367270;chrX_10366177_10366615 chrX_10366177_10368085 chrX_10366077_10366176;chrX_10368086_10368118 69.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.62 NA NA NA 83.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.61 NA 87.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.42 6.1643522970608532e-11 N jcn_only_AD Hcf,I_chr4_391984_392875 chr4 + chr4_380985_381212;chr4_380602_381212;chr4_380646_381212;chr4_380607_381212 chr4_380911_381212 chr4_381213_381632;chr4_380600_380601 51.16 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0025270000000000002 N jcn_only_AD lig3 chr3R - chr3R_8226161_8226248 chr3R_8226161_8226239 chr3R_8224994_8226160;chr3R_8226249_8227041 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA NA NA NA 18.42 NA 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 25.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.1322047878316147e-11 K jcn_only_AD path,I_chr3L_9492315_9494012,noncoding_11668 chr3L - chr3L_9490312_9492121 chr3L_9490312_9490393 chr3L_9490216_9490311 22.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012435999999999999 K jcn_only_AD RpL32,I_chr3R_25871509_25871807 chr3R - chr3R_25871509_25871851;chr3R_25871509_25871771;chr3R_25871509_25871611;chr3R_25871509_25871583 chr3R_25871509_25871855 chr3R_25871409_25871508;chr3R_25871856_25871862 94.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Pak,RI_chr3R_2181143_2181934 chr3R + chr3R_2176677_2180635 chr3R_2177074_2180635 chr3R_2180636_2180902;chr3R_2176656_2176676 66.67 NA NA 28.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044533000000000003 K jcn_only_AD n-syb,I_chr3L_1637270_1637558,metl chr3L - chr3L_1638855_1639041 chr3L_1638855_1638908 chr3L_1637903_1638854;chr3L_1639042_1639220 29.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0784000000000001e-07 K jcn_only_AD CG11790,CG11791 chr3R + chr3R_20876091_20876902;chr3R_20876340_20876902 chr3R_20875669_20876902 chr3R_20876903_20877278;chr3R_20875600_20875668 20.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.53 0.0046280000000000002 K jcn_only_AD CG8173,I_chrX_17602681_17603175 chrX - chrX_17602681_17603214 chrX_17602681_17603175 chrX_17602581_17602680;chrX_17603215_17603275 1.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030391999999999999 K jcn_only_AD Lip4 chr2L + chr2L_10530670_10530855 chr2L_10530676_10530855 chr2L_10530856_10531517;chr2L_10530314_10530669 45.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD cno,I_chr3R_999718_999986,I_chr3R_999737_999777 chr3R - chr3R_1002013_1003015 chr3R_1002013_1002087 chr3R_999987_1002012;chr3R_1003016_1003115 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045475000000000002 K jcn_only_AD CG13551,I_chr2R_19265701_19270570 chr2R - chr2R_19270646_19270887 chr2R_19270646_19270842 chr2R_19270612_19270645;chr2R_19270888_19270938 14.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.83 NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.56 NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8722955548268799e-10 N jcn_only_AD CG15908_CG9410,CG15908,CG9410 chr2R + chr2R_2556730_2556834 chr2R_2556738_2556834 chr2R_2556835_2556939;chr2R_2556598_2556729 46.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8859139e-05 K jcn_only_AD Tfb1 chr2R + chr2R_10250584_10250749 chr2R_10250627_10250749 chr2R_10250750_10251018;chr2R_10250565_10250583 20.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016490999999999999 N jcn_only_AD CG32529 chrX + chrX_19795641_19795900;chrX_19795687_19795900 chrX_19795522_19795900 chrX_19795901_19798251;chrX_19794649_19795521 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD tho2 chr2L - chr2L_2138159_2139629 chr2L_2138159_2138345 chr2L_2137984_2138158;chr2L_2139630_2139673 27.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035584999999999999 K jcn_only_AD I_chr3R_17177101_17200781,mod(mdg4),I_chr3R_17183481_17200781,I_chr3R_17183927_17184513,I_chr3R_17183927_17185306,RI_chr3R_17184319_17184513,I_chr3R_17184319_17185084,I_chr3R_17184319_17185284,noncoding_18168,RI_chr3R_17184792_17185306,F_chr3R_17187010_17200781,F_chr3R_17187861_17200781,RI_chr3R_17189607_17189988,I_chr3R_17190098_17190207,F_chr3R_17192467_17200781,F_chr3R_17193961_17200781,F_chr3R_17194785_17200781,F_chr3R_17195968_17200781,I_chr3R_17197790_17197863,RI_chr3R_17198778_17199052,RI_chr3R_17198803_17199019,RI_chr3R_17198803_17199052 chr3R - chr3R_17183927_17184513;chr3R_17183927_17184082;chr3R_17183927_17185306 chr3R_17183927_17200781 chr3R_17183827_17183926 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.5614799999999997e-07 K jcn_only_AD msn,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586265,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2585739_2586265;chr3L_2585739_2586402;chr3L_2585739_2586413 chr3L_2585739_2586036 chr3L_2585639_2585738;chr3L_2586414_2586502 4.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047357999999999997 K jcn_only_AD l(1)G0193 chrX - chrX_7837261_7839928;chrX_7837261_7837749 chrX_7837261_7837716 chrX_7836542_7837260 34.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.34 NA 23.24 NA NA NA NA NA NA 21.35 NA 1.1418512282239999e-06 K jcn_only_AD CG7530,I_chr3R_10553050_10555615,eff chr3R - chr3R_10553050_10556232 chr3R_10553050_10554503 chr3R_10552950_10553049;chr3R_10556233_10556351 19.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.84 NA NA NA NA NA 0.0040169999999999997 N jcn_only_AD CG9940 chrX - chrX_13601748_13612161 chrX_13601748_13603401 chrX_13601629_13601747;chrX_13612162_13612298 0.00 NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.14 NA NA NA NA NA 7.7353734700000015e-09 N jcn_only_AD CG1494 chrX + chrX_21159081_21159147;chrX_21159059_21159147 chrX_21158242_21159147 chrX_21159148_21159527;chrX_21157788_21158241 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023061999999999999 K jcn_only_AD larp,F_chr3R_24151542_24153876,I_chr3R_24160430_24160932,I_chr3R_24160430_24160971,RI_chr3R_24160430_24161527 chr3R - chr3R_24160430_24160932;chr3R_24160430_24160971;chr3R_24160430_24160975;chr3R_24160430_24160979;chr3R_24160430_24161939;chr3R_24160430_24161527 chr3R_24160430_24161729 chr3R_24160330_24160429;chr3R_24161940_24162125 61.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033644 K jcn_only_AD RpL36,RI_chrX_522912_523358,I_chrX_522932_523360,I_chrX_522949_523360 chrX - chrX_522912_523215;chrX_522912_523414;chrX_522912_523194;chrX_522912_523323;chrX_522912_523389 chrX_522912_523360 chrX_522849_522911;chrX_523415_523436 77.20 NA NA 51.19 NA NA NA 59.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 92.07 88.34 89.63 88.96 NA 59.92 NA NA NA 59.14 NA 62.88 NA NA 92.45 90.22 89.89 49.09 NA 54.32 NA 58.55 65.91 NA NA NA NA NA 87.43 90.13 NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD pyd,I_chr3R_4654041_4664113,I_chr3R_4749124_4756437 chr3R - chr3R_4668562_4690507 chr3R_4668562_4670637 chr3R_4668392_4668561 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.550367e-05 K jcn_only_AD Hel25E,I_chr2L_5540301_5540396 chr2L - chr2L_5540301_5540971;chr2L_5540301_5540396 chr2L_5540301_5540424 chr2L_5540201_5540300;chr2L_5540972_5541090 2.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG9331,I_chr2L_20824494_20826632,I_chr2L_20825513_20825658 chr2L + chr2L_20824602_20825271;chr2L_20824725_20825271;chr2L_20824631_20825271 chr2L_20824494_20825271 chr2L_20825272_20825366;chr2L_20824482_20824493 44.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.70 0.00072199999999999999 K jcn_only_AD I_chr2L_8029734_8029787,Cka,CG7429 chr2L + chr2L_8030840_8032059;chr2L_8031338_8032059;chr2L_8031163_8032059;chr2L_8031036_8032059 chr2L_8031309_8032059 chr2L_8032060_8032641;chr2L_8030749_8030839 17.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010889999999999999 K jcn_only_AD fs(1)h,I_chrX_7950171_7952371,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7944590_7945403 chrX_7944590_7945391 chrX_7944470_7944589;chrX_7945404_7945562 35.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00022000000000000001 N jcn_only_AD CG8229,CG33199 chr2R - chr2R_4836447_4838210;chr2R_4836447_4837350 chr2R_4836447_4836515 chr2R_4835619_4836446;chr2R_4838211_4838296 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038386000000000003 K jcn_only_AD CG14741 chr3R - chr3R_7897251_7898049 chr3R_7897251_7898007 chr3R_7897104_7897250;chr3R_7898050_7898194 79.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.13 NA NA NA 65.71 NA NA NA NA NA 89.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.72 0.0 K jcn_only_AD mys,I_chrX_7958795_7961094 chrX + chrX_7955904_7957872;chrX_7955908_7957872;chrX_7955914_7957872;chrX_7956114_7957872;chrX_7955901_7957872;chrX_7956125_7957872;chrX_7955967_7957872 chrX_7955759_7957872 chrX_7957873_7958492;chrX_7955741_7955758 61.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.81 39.89 41.18 NA 29.94 NA NA 44.75 NA NA NA NA 42.14 30.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.34 NA NA 37.97 39.18 NA NA 20.69 NA 35.23 42.25 NA 0.0 K jcn_only_AD CG31431 chr3R + chr3R_17696656_17697703;chr3R_17696581_17697703;chr3R_17696702_17697703 chr3R_17696730_17697703 chr3R_17697704_17697862;chr3R_17696406_17696580 89.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031278 N jcn_only_AD shep,RI_chr3L_5163541_5194164,I_chr3L_5177084_5177314,I_chr3L_5193467_5212049 chr3L - chr3L_5155711_5156456 chr3L_5155711_5156066 chr3L_5155556_5155710 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD unc-5,E_chr2R_11238100_11240757,I_chr2R_11252444_11252570 chr2R + chr2R_11238100_11244325 chr2R_11243996_11244325 chr2R_11244326_11244514;chr2R_11238000_11238099 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0044999999999999997 K jcn_only_AD hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16326733_16327197 chrX_16326745_16327197 chrX_16327198_16328171;chrX_16324959_16326732 62.35 NA NA NA NA NA NA NA NA 84.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0086709999999999999 K jcn_only_AD BtbVII,I_chr3L_3150858_3150927,I_chr3L_3151185_3151263 chr3L + chr3L_3150843_3150927 chr3L_3150858_3150927 chr3L_3150928_3151027;chr3L_3150758_3150842 5.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.004921 N jcn_only_AD Syb chr2R - chr2R_6137333_6137873;chr2R_6137333_6138021 chr2R_6137333_6138451 chr2R_6137005_6137332;chr2R_6138452_6138649 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00033799999999999998 K jcn_only_AD CG40228,noncoding_14406,RI_chr3LHet_2190419_2190470 chr3LHet - chr3LHet_2190419_2190556;chr3LHet_2190419_2190563;chr3LHet_2190419_2190548;chr3LHet_2190419_2190561 chr3LHet_2190419_2190470 chr3LHet_2190319_2190418;chr3LHet_2190564_2190570 4.60 NA NA NA NA NA 30.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2e-05 K jcn_only_AD M(2)21AB,I_chr2L_107839_110405,I_chr2L_107957_108587,I_chr2L_110878_111037,I_chr2L_112022_112689,RI_chr2L_132256_132482 chr2L + chr2L_108347_108587;chr2L_108102_108587;chr2L_107839_108587 chr2L_108227_108587 chr2L_108588_108687;chr2L_107833_107838 82.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.16 NA NA 65.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00019841167800000001 N jcn_only_AD boi,I_chrX_2363445_2363896 chrX - chrX_2346181_2350623 chrX_2346181_2346377 chrX_2344936_2346180;chrX_2350624_2350719 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0080020000000000004 K jcn_only_AD gem,I_chr2R_6015083_6015660,I_chr2R_6023182_6023246 chr2R + chr2R_6021523_6022972 chr2R_6022905_6022972 chr2R_6022973_6023177 0.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD ORMDL chr3L + chr3L_21628870_21629086 chr3L_21628905_21629086 chr3L_21629087_21629299;chr3L_21628718_21628869 10.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047640000000000002 K jcn_only_AD RpL11,I_chr2R_15330246_15330292,I_chr2R_15330603_15330817 chr2R + chr2R_15329995_15330122 chr2R_15330062_15330122 chr2R_15330123_15330245;chr2R_15329948_15329994 0.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG3558,RI_chr2L_2995071_2997790 chr2L + chr2L_2993464_2993544;chr2L_2993410_2993544;chr2L_2993444_2993544 chr2L_2993378_2993544 chr2L_2993545_2994408;chr2L_2993028_2993377 96.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018710000000000001 K jcn_only_AD CG1746,I_chr3R_27044771_27044867,I_chr3R_27044771_27044990,I_chr3R_27044771_27045027,RI_chr3R_27044771_27045110,I_chr3R_27044771_27045132,RI_chr3R_27044771_27045188,I_chr3R_27044771_27045193,RI_chr3R_27044771_27045268 chr3R - chr3R_27044771_27044867;chr3R_27044771_27045188;chr3R_27044771_27045132;chr3R_27044771_27045027;chr3R_27044771_27045110;chr3R_27044771_27044831;chr3R_27044771_27044990;chr3R_27044771_27044895 chr3R_27044771_27045257 chr3R_27044671_27044770;chr3R_27045258_27045273 94.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.00 65.45 70.83 NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.42 63.33 70.97 NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA 61.70 73.53 64.58 NA 59.38 NA 71.43 70.53 NA 0.0 K jcn_only_AD cryptocephal,I_chr2L_21311307_21311752,RI_chr2L_21312044_21312124,I_chr2L_21312209_21314626 chr2L + chr2L_21311033_21311752;chr2L_21311307_21311752;chr2L_21311215_21311752 chr2L_21311532_21311752 chr2L_21311753_21311852;chr2L_21310948_21311032 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.29 NA NA NA NA NA NA NA 25.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD RpL35,I_chrX_5566913_5567030,I_chrX_5567168_5567220 chrX + chrX_5566913_5567030;chrX_5566909_5567030 chrX_5566556_5567030 chrX_5567031_5567130;chrX_5566554_5566555 6.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.01 NA NA NA NA NA NA 23.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD RpL17,I_chrX_6637182_6638207,RI_chrX_6637182_6637528,I_chrX_6637182_6637973,snoRNA:Psi28S-1232 chrX - chrX_6637182_6638178;chrX_6637182_6638228;chrX_6637182_6637982 chrX_6637182_6638141 chrX_6637093_6637181;chrX_6638229_6638235 61.72 NA NA NA NA NA NA NA NA 19.44 NA NA 82.79 NA NA NA NA NA NA NA NA 29.06 NA NA NA NA NA 24.72 NA 22.30 NA 15.52 11.28 NA NA 29.90 NA NA NA 21.41 17.21 NA NA 28.02 31.10 23.32 NA 11.97 NA NA NA NA 19.84 NA NA NA 40.45 12.52 0.0 K jcn_only_AD CG2310,I_chr3R_25318474_25319142 chr3R - chr3R_25318474_25319136;chr3R_25318474_25319163;chr3R_25318474_25319142;chr3R_25318474_25318925;chr3R_25318474_25318971;chr3R_25318474_25319004;chr3R_25318474_25319167 chr3R_25318474_25319093 chr3R_25318374_25318473;chr3R_25319168_25319224 12.81 NA NA NA NA NA NA 1.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.33 NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA 24.21 NA NA 37.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG8446 chr2R + chr2R_12084078_12084196 chr2R_12084108_12084196 chr2R_12084197_12084416;chr2R_12083895_12084077 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0030230000000000001 K jcn_only_AD CG3919 chr3L + chr3L_14405237_14405355 chr3L_14405285_14405355 chr3L_14405356_14405772;chr3L_14405135_14405236 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020152 N jcn_only_AD CG32594 chrX + chrX_14927496_14927638;chrX_14927033_14927638;chrX_14927381_14927638 chrX_14926607_14927638 chrX_14927639_14928125;chrX_14925576_14926606 95.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG31999,I_chr4_240711_240769,I_chr4_243657_244182 chr4 - chr4_239517_240531;chr4_239517_239863 chr4_239517_240516 chr4_239079_239516;chr4_240532_240654 98.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD Spred,I_chr2R_10655876_10656868 chr2R - chr2R_10650580_10651335 chr2R_10650580_10650923 chr2R_10650424_10650579;chr2R_10651336_10651504 2.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AD blow,RI_chr2R_3470434_3470776 chr2R - chr2R_3472863_3474487 chr2R_3472863_3474436 chr2R_3472561_3472862;chr2R_3474488_3474581 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999994e-05 N jcn_only_AD CG16971,CG33229,I_chr3L_225856_225909,RI_chr3L_225919_226004,I_chr3L_229245_230186 chr3L + chr3L_224184_224972;chr3L_224886_224972 chr3L_224779_224972 chr3L_224973_225140;chr3L_224174_224183 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.08 NA NA NA NA NA 12.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.77 12.50 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD CG3609,I_chr2L_2373706_2374488,RI_chr2L_2373723_2374295 chr2L - chr2L_2373723_2374488 chr2L_2373723_2373935 chr2L_2373623_2373722;chr2L_2374489_2374588 6.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3294263738974998e-10 N jcn_only_AD RI_chrX_8608147_8608508,I_chrX_8608169_8608438,l(1)G0020 chrX - chrX_8610980_8611119 chrX_8610980_8611115 chrX_8610747_8610979;chrX_8611120_8612089 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.68 22.81 NA NA NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA 26.79 NA NA 22.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.8347531768886e-09 N jcn_only_AD CG31619 chr2L + chr2L_21711411_21712768 chr2L_21711681_21712768 chr2L_21712769_21712966;chr2L_21711315_21711410 0.00 NA 11.96 NA NA NA 17.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.9841165711999999e-08 K jcn_only_AD 14-3-3zeta,I_chr2R_5987356_5991764,I_chr2R_5987603_5991760,I_chr2R_5988662_5991760,I_chr2R_5988666_5991760,I_chr2R_5988919_5991760,I_chr2R_5988931_5991760,I_chr2R_5990647_5991760,I_chr2R_5991249_5991760,I_chr2R_5991689_5991760,I_chr2R_5993610_5993957,I_chr2R_5993331_5994971 chr2R + chr2R_5987244_5991760;chr2R_5987237_5991760 chr2R_5987356_5991760 chr2R_5991761_5991860;chr2R_5987235_5987236 62.60 NA NA NA 36.16 NA NA NA 45.85 NA NA NA NA NA NA NA 45.40 43.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.79 91.43 34.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 79.08 NA NA NA NA 82.76 NA 79.07 87.88 NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AD bur,I_chr2L_21177679_21177901,I_chr2L_21177679_21178250,I_chr2L_21177960_21179329 chr2L - chr2L_21177679_21179329 chr2L_21177679_21177901 chr2L_21177579_21177678;chr2L_21179330_21179429 0.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.037343000000000001 N jcn_only_AD Lag1,RI_chrX_6153758_6153930,I_chrX_6153758_6155077,RI_chrX_6153758_6161036,I_chrX_6160907_6161036 chrX - chrX_6153758_6155077;chrX_6153758_6154631;chrX_6153758_6153930;chrX_6153758_6161036;chrX_6153758_6154193;chrX_6153758_6154358 chrX_6153758_6160439 chrX_6153658_6153757;chrX_6161037_6161136 91.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.7000000000000001e-05 N jcn_only_AD CG1115,F_chr3R_1052705_1053045 chr3R + chr3R_1052705_1053045;chr3R_1052701_1053045 chr3R_1052718_1053045 chr3R_1053046_1053145;chr3R_1052605_1052700 25.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.00 0.00 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8554917179961827e-11 K jcn_only_AD None chrU - chrU_5771599_5771833;chrU_5771599_5771693 chrU_5771599_5771684 69.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002307 K mutually_exclusive Vha100-1,I_chr3R_24958227_24960770,RI_chr3R_24959152_24959582,I_chr3R_24959804_24960770,CE_chr3R_24962426_24962797 chr3R + chr3R_24958227_24959582,chr3R_24959684_24960770 chr3R_24958227_24958993,chr3R_24959152_24960770 chr3R_24959583_24959683 chr3R_24958994_24959151 chr3R_24958127_24958226;chr3R_24960771_24960870 70.49 NA NA 88.14 53.33 NA NA NA 60.36 NA NA NA 86.36 NA NA NA NA NA 89.74 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 84.13 82.14 NA NA NA NA 56.58 NA NA NA NA NA NA 82.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9932363429045243e-29 K mutually_exclusive CG42595,I_chr2RHet_3155517_3174709,RI_chr2RHet_3175044_3179353,RI_chr2RHet_3179300_3179586,I_chr2RHet_3179481_3179586 chr2RHet - chr2RHet_3175044_3179353,chr2RHet_3179494_3179586 chr2RHet_3175044_3179091,chr2RHet_3179300_3179586 chr2RHet_3179354_3179493 chr2RHet_3179092_3179299 chr2RHet_3174944_3175043;chr2RHet_3179587_3179598 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026314000000000001 K mutually_exclusive Dhc64C chr3L - chr3L_4811670_4812893,chr3L_4813090_4813327 chr3L_4811670_4812056,chr3L_4812256_4813327 chr3L_4812894_4813089 chr3L_4812057_4812255 chr3L_4811552_4811669;chr3L_4813328_4815436 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.56 NA 35.64 34.78 NA NA NA NA NA NA NA 68.42 60.66 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.86 NA NA 71.43 NA NA NA NA 34.78 NA NA 31.25 NA NA 0.0 K mutually_exclusive NFAT,RI_chrX_13543535_13546911,I_chrX_13544101_13544542 chrX + chrX_13543535_13546911,chrX_13547539_13548816 chrX_13543535_13543687,chrX_13544101_13548816 chrX_13546912_13547538 chrX_13543688_13544100 chrX_13543435_13543534;chrX_13548817_13549237 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.554384602862e-06 K mutually_exclusive Tm1,I_chr3R_11120969_11125831,I_chr3R_11121267_11122312,I_chr3R_11121267_11124998,RI_chr3R_11125070_11125831,I_chr3R_11125070_11126469 chr3R + chr3R_11120969_11122312,chr3R_11122431_11125831 chr3R_11120969_11121148,chr3R_11121267_11125831 chr3R_11122313_11122430 chr3R_11121149_11121266 chr3R_11120869_11120968;chr3R_11125832_11125902 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.21 NA 0.0 K mutually_exclusive spz chr3R - chr3R_22892388_22892450,chr3R_22892607_22894865;chr3R_22892388_22893079,chr3R_22893218_22894865 chr3R_22892388_22892843,chr3R_22892922_22894865 chr3R_22892451_22892606;chr3R_22893080_22893217 chr3R_22892844_22892921 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22894866_22895053 50.35 NA NA NA NA NA 27.14 64.96 NA 35.29 NA NA 68.85 NA NA NA NA NA NA 69.57 NA 35.09 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 64.52 NA 33.33 NA 38.89 NA NA NA 25.00 35.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N mutually_exclusive RpL3,E_chr3R_7047964_7050565,I_chr3R_7048451_7049116,I_chr3R_7048452_7048540,I_chr3R_7048452_7049579,snoRNA:Me18S-A425,snoRNA:Psi28S-291,E_chr3R_7049697_7049750,I_chr3R_7049970_7050189,snoRNA:Me28S-G2017 chr3R + chr3R_7048452_7049579,chr3R_7049970_7050212 chr3R_7048452_7048809,chr3R_7049253_7050212 chr3R_7049580_7049969 chr3R_7048810_7049252 chr3R_7048352_7048451;chr3R_7050213_7050289 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Gug,R_chr3L_8444636_8444874,I_chr3L_8455244_8456103 chr3L + chr3L_8443558_8455071,chr3L_8455189_8456103 chr3L_8443558_8444874,chr3L_8445229_8456103 chr3L_8455072_8455188 chr3L_8444875_8445228 chr3L_8443524_8443557;chr3L_8456104_8456203 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.7030450000000003e-06 K mutually_exclusive Actn,I_chrX_1922061_1924247,I_chrX_1922784_1923807,I_chrX_1922784_1923873 chrX - chrX_1922061_1923807,chrX_1923960_1924247 chrX_1922061_1922697,chrX_1922784_1924247 chrX_1923808_1923959 chrX_1922698_1922783 chrX_1921968_1922060;chrX_1924248_1924347 92.31 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Ate1 chr2R - chr2R_16143315_16143587,chr2R_16143741_16143940 chr2R_16143315_16143390,chr2R_16143541_16143940 chr2R_16143588_16143740 chr2R_16143391_16143540 chr2R_16143133_16143314;chr2R_16143941_16144113 57.69 NA NA 71.60 NA NA 81.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive lqf,I_chr3L_7522287_7522807 chr3L + chr3L_7528745_7529810,chr3L_7529870_7530075 chr3L_7528745_7529103,chr3L_7529536_7530075 chr3L_7529811_7529869 chr3L_7529104_7529535 chr3L_7528643_7528744;chr3L_7530076_7530479 33.33 NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA 66.67 54.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9743278829715418e-17 K mutually_exclusive Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3355332_3356614,chr2R_3356731_3356864 chr2R_3355332_3355926,chr2R_3356043_3356864 chr2R_3356615_3356730 chr2R_3355927_3356042 chr2R_3355296_3355331;chr2R_3356865_3357018 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.98 NA 48.94 NA NA 60.71 56.94 NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA 89.13 NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Parp,F_chr3RHet_1961200_1961357,F_chr3RHet_1961573_1962006,F_chr3RHet_1962169_1962570 chr3RHet + chr3RHet_1937281_2018687,chr3RHet_2019258_2025472 chr3RHet_1937281_1964214,chr3RHet_1964749_2025472 chr3RHet_2018688_2019257 chr3RHet_1964215_1964748 chr3RHet_1936999_1937280;chr3RHet_2025473_2025629 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0049670000000000001 K mutually_exclusive CG32638,I_chrX_13017877_13022283 chrX - chrX_13017721_13020100,chrX_13020248_13022283 chrX_13017721_13017806,chrX_13017877_13022283 chrX_13020101_13020247 chrX_13017807_13017876 chrX_13017225_13017720;chrX_13022284_13022383 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015560000000000001 K mutually_exclusive trx chr3R - chr3R_10101091_10104814,chr3R_10105264_10111930 chr3R_10101091_10102027,chr3R_10103265_10111930 chr3R_10104815_10105263 chr3R_10102028_10103264 chr3R_10099914_10101090;chr3R_10111931_10112601 33.33 NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 12.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.34542242372e-07 N mutually_exclusive RpS5a,I_chrX_17037805_17038646,I_chrX_17037805_17039048,I_chrX_17037805_17040830,snoRNA:Psi28S-1192d,snoRNA:Psi28S-1192c,snoRNA:Psi28S-1192b,snoRNA:Psi28S-1192a,I_chrX_17038786_17039048,snoRNA:Psi28S-2876,snoRNA:Psi18S-1854c,snoRNA:Psi28S-1135f,snoRNA:Psi18S-1854b,snoRNA:Psi28S-1135e,snoRNA:Psi18S-1854a,snoRNA:Psi28S-1135d,snoRNA:Psi28S-1135c,snoRNA:Psi28S-1135b,snoRNA:Psi28S-1135a,I_chrX_17041053_17041104,I_chrX_17041234_17041901,I_chrX_17041234_17041720,RI_chrX_17041234_17041750,RI_chrX_17041234_17041760,I_chrX_17041234_17041832,I_chrX_17041234_17041844,I_chrX_17041976_17042236 chrX - chrX_17037805_17040830,chrX_17041234_17042236 chrX_17037805_17039048,chrX_17039166_17042236 chrX_17040831_17041233 chrX_17039049_17039165 chrX_17037705_17037804;chrX_17042237_17042336 25.00 NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive CG11009,I_chr3L_12844823_12845526,I_chr3L_12845441_12845526 chr3L + chr3L_12844823_12845526,chr3L_12845622_12845715 chr3L_12844823_12845331,chr3L_12845378_12845715 chr3L_12845527_12845621 chr3L_12845332_12845377 chr3L_12844723_12844822;chr3L_12845716_12845816 77.78 NA NA 96.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA 5.7638450649000013e-08 K mutually_exclusive Pvr,I_chr2L_8226604_8228082,I_chr2L_8229012_8229080,I_chr2L_8230332_8238998 chr2L - chr2L_8226604_8228082,chr2L_8228258_8228493 chr2L_8226604_8227669,chr2L_8227827_8228493 chr2L_8228083_8228257 chr2L_8227670_8227826 chr2L_8226504_8226603;chr2L_8228494_8229011 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012149 K mutually_exclusive dco,RI_chr3R_26883647_26884261,I_chr3R_26883651_26883729,RI_chr3R_26883651_26886096,I_chr3R_26884350_26884670,I_chr3R_26884350_26886671,I_chr3R_26884350_26886791,RI_chr3R_26884365_26886096,I_chr3R_26884365_26886798 chr3R - chr3R_26883651_26886096,chr3R_26886187_26886798 chr3R_26883651_26884261,chr3R_26884350_26886798 chr3R_26886097_26886186 chr3R_26884262_26884349 chr3R_26883551_26883650;chr3R_26886799_26886891 88.89 NA NA 76.27 NA NA 73.47 NA NA NA NA NA 62.22 NA NA NA NA NA NA 62.50 NA 67.74 NA NA NA 65.22 NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive CRMP,I_chr3R_1401648_1403314 chr3R + chr3R_1401648_1402757,chr3R_1402982_1403314 chr3R_1401648_1401896,chr3R_1402136_1403314 chr3R_1402758_1402981 chr3R_1401897_1402135 chr3R_1401548_1401647;chr3R_1403315_1403414 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00098299999999999993 N mutually_exclusive kis,I_chr2L_228282_230537,I_chr2L_229978_230537,RI_chr2L_231035_231947,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_227548_229172,chr2L_229383_230537 chr2L_227548_228132,chr2L_228282_230537 chr2L_229173_229382 chr2L_228133_228281 chr2L_227372_227547;chr2L_230538_230627 100.00 NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005457 K mutually_exclusive rl,I_chr2RHet_199154_207044,RI_chr2RHet_203476_203577,RI_chr2RHet_203592_207044,R_chr2RHet_207162_232568,I_chr2RHet_232696_247338,RI_chr2RHet_240197_247338 chr2RHet + chr2RHet_203476_232560,chr2RHet_232696_239911 chr2RHet_203476_207044,chr2RHet_207156_239911 chr2RHet_232561_232695 chr2RHet_207045_207155 chr2RHet_203436_203475;chr2RHet_239912_239917 31.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012769999999999999 K mutually_exclusive Eb1,RI_chr2R_2640290_2642206,I_chr2R_2640494_2642206,I_chr2R_2641187_2642206,RI_chr2R_2641944_2642025,I_chr2R_2641954_2642206,I_chr2R_2642491_2642549 chr2R + chr2R_2640494_2641684,chr2R_2641944_2642209 chr2R_2640494_2640577,chr2R_2641009_2642209 chr2R_2641685_2641943 chr2R_2640578_2641008 chr2R_2640394_2640493;chr2R_2642210_2642306 12.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 32.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA 1.3428161355063842e-09 K mutually_exclusive CG34413,I_chr2R_20771136_20772048,I_chr2R_20772104_20773774,RI_chr2R_20772104_20774745,C_chr2R_20772691_20773500,I_chr2R_20773500_20774745 chr2R + chr2R_20771136_20772048,chr2R_20774668_20774745 chr2R_20771136_20771196,chr2R_20771258_20774745 chr2R_20772049_20774667 chr2R_20771197_20771257 chr2R_20771036_20771135;chr2R_20774746_20774845 87.80 NA NA 72.00 NA NA 76.00 NA NA 57.14 68.75 NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA 66.67 70.83 NA NA 76.19 NA NA NA 61.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N mutually_exclusive CG42574,I_chr3R_618802_618939,I_chr3R_621543_625413,I_chr3R_621546_625413 chr3R - chr3R_620787_622210,chr3R_623420_625413 chr3R_620787_621458,chr3R_621546_625413 chr3R_622211_623419 chr3R_621459_621545 chr3R_618940_620786;chr3R_625414_625513 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA 16.67 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.1310822189999984e-09 K mutually_exclusive fog,I_chrX_22231114_22234174,I_chrX_22231114_22237956,I_chrX_22231114_22238023,I_chrX_22246738_22255641,RE_chrX_22256169_22256990 chrX - chrX_22231114_22255642,chrX_22256169_22256878 chrX_22231114_22246594,chrX_22246738_22256878 chrX_22255643_22256168 chrX_22246595_22246737 chrX_22231014_22231113;chrX_22256879_22256918 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038282999999999998 K mutually_exclusive CG17838 chr3R + chr3R_16618278_16620860,chr3R_16620997_16622865 chr3R_16618278_16619437,chr3R_16619574_16622865 chr3R_16620861_16620996 chr3R_16619438_16619573 chr3R_16618036_16618277;chr3R_16622866_16622999 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3999999999999995e-05 K mutually_exclusive Pfk,I_chr2R_5999081_6000140,E_chr2R_6001157_6001630 chr2R + chr2R_6000676_6001630,chr2R_6001740_6002421 chr2R_6000676_6001047,chr2R_6001157_6002421 chr2R_6001631_6001739 chr2R_6001048_6001156 chr2R_6000521_6000675;chr2R_6002422_6002610 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA 45.45 NA 85.71 NA 54.95 NA 89.19 NA NA NA NA NA NA 82.81 NA NA NA NA NA NA 88.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Hrb27C,I_chr2L_6924401_6924743 chr2L + chr2L_6920862_6922734,chr2L_6922827_6923783 chr2L_6920862_6920932,chr2L_6921074_6923783 chr2L_6922735_6922826 chr2L_6920933_6921073 chr2L_6920793_6920861;chr2L_6923784_6924400 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00031399999999999999 K mutually_exclusive Gs1l,I_chr2L_4456517_4456723 chr2L - chr2L_4455739_4456113,chr2L_4456333_4456385 chr2L_4455739_4455856,chr2L_4456076_4456385 chr2L_4456114_4456332 chr2L_4455857_4456075 chr2L_4455221_4455738;chr2L_4456386_4456516 31.43 NA NA 48.91 NA NA 15.09 NA NA NA NA 20.32 20.27 NA NA 47.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.94 48.57 NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.87 NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Myo61F,mtacp1,I_chr3L_1330291_1330865,I_chr3L_1330291_1331279,RI_chr3L_1330929_1331041,l(3)02640 chr3L + chr3L_1330291_1331041,chr3L_1331171_1331279 chr3L_1330291_1330862,chr3L_1330965_1331279 chr3L_1331042_1331170 chr3L_1330863_1330964 chr3L_1330191_1330290;chr3L_1331280_1331379 47.81 NA NA 66.67 NA NA 62.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.87 NA NA NA NA NA NA 68.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive sws chrX - chrX_7852516_7854028,chrX_7854146_7855209 chrX_7852516_7853010,chrX_7853128_7855209 chrX_7854029_7854145 chrX_7853011_7853127 chrX_7852304_7852515;chrX_7855210_7855396 12.50 NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 NA NA NA NA NA 7.6555509060220816e-09 K mutually_exclusive CG8671,I_chr2L_21275807_21277205 chr2L + chr2L_21275807_21279883,chr2L_21280448_21281131 chr2L_21275807_21277196,chr2L_21278430_21281131 chr2L_21279884_21280447 chr2L_21277197_21278429 chr2L_21275724_21275806;chr2L_21281132_21281337 71.43 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00034950218399999999 N mutually_exclusive Taf4,I_chr3L_16107821_16107893 chr3L + chr3L_16107821_16109131,chr3L_16109720_16110644 chr3L_16107821_16108768,chr3L_16108931_16110644 chr3L_16109132_16109719 chr3L_16108769_16108930 chr3L_16107721_16107820;chr3L_16110645_16111208 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8992447_8994545,chrX_8994691_8995128 chrX_8992447_8993346,chrX_8993495_8995128 chrX_8994546_8994690 chrX_8993347_8993494 chrX_8992117_8992446;chrX_8995129_8995452 85.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 98.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 95.40 NA NA NA NA NA 97.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive E_chr2RHet_2881760_2912543,eIF-4B,I_chr2RHet_2903246_2904697,I_chr2RHet_2903246_2912532,I_chr2RHet_2904787_2912543,I_chr2RHet_2912605_2917250 chr2RHet + chr2RHet_2903246_2915424,chr2RHet_2915525_2917250 chr2RHet_2903246_2912543,chr2RHet_2912605_2917250 chr2RHet_2915425_2915524 chr2RHet_2912544_2912604 chr2RHet_2903146_2903245;chr2RHet_2917251_2917256 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031806000000000001 K mutually_exclusive babo chr2R + chr2R_4842357_4842463,chr2R_4842673_4846611;chr2R_4842357_4843217,chr2R_4843364_4846611 chr2R_4842357_4844533,chr2R_4844662_4846611 chr2R_4842464_4842672;chr2R_4843218_4843363 chr2R_4844534_4844661 chr2R_4842239_4842356;chr2R_4846612_4846839 42.48 NA NA NA NA NA 63.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA 5.6311749139296783e-08 K mutually_exclusive CG7945,RI_chr3L_15515681_15516932,RI_chr3L_15516824_15516932 chr3L - chr3L_15515603_15516067,chr3L_15516565_15516932 chr3L_15515603_15515659,chr3L_15515681_15516932 chr3L_15516068_15516564 chr3L_15515660_15515680 chr3L_15515581_15515602;chr3L_15516933_15517032 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015461892320000003 N mutually_exclusive unc-13,I_chr4_897821_902468,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_897821_899476,chr4_899619_903586;chr4_897821_902468,chr4_902576_903586 chr4_897821_903242,chr4_903350_903586 chr4_899477_899618;chr4_902469_902575 chr4_903243_903349 chr4_897721_897820;chr4_903587_903686 28.57 NA NA NA NA NA 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 62.07 NA NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive mys,I_chrX_7958795_7961094 chrX + chrX_7958795_7960130,chrX_7960216_7961094 chrX_7958795_7959480,chrX_7959566_7961094 chrX_7960131_7960215 chrX_7959481_7959565 chrX_7958695_7958794;chrX_7961095_7961194 81.03 NA NA NA 68.87 NA NA NA NA NA NA 91.35 56.25 NA NA NA 57.40 NA NA NA NA NA NA NA NA 59.02 NA NA 91.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.25 NA NA 94.16 NA NA NA 92.95 93.33 0.0 K mutually_exclusive B4,REI_chr2L_13509793_13534906,EI_chr2L_13513471_13534906,I_chr2L_13513474_13549131,CG15638,CG9263,I_chr2L_13547133_13549131,I_chr2L_13547162_13547692,I_chr2L_13547304_13549131 chr2L - chr2L_13509793_13534906,chr2L_13535027_13549131 chr2L_13509793_13512959,chr2L_13513474_13549131 chr2L_13534907_13535026 chr2L_13512960_13513473 chr2L_13509741_13509792;chr2L_13549132_13549231 90.67 NA NA 69.23 NA NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Slip1,RI_chr4_684967_689045,I_chr4_685717_686576,RI_chr4_685717_689045,RI_chr4_687548_689045 chr4 + chr4_684967_689045,chr4_689201_689755 chr4_684967_686576,chr4_687559_689755 chr4_689046_689200 chr4_686577_687558 chr4_684914_684966;chr4_689756_690313 100.00 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017905999999999998 K mutually_exclusive CG42321,I_chr2R_9326329_9326436,I_chr2R_9326353_9326436 chr2R - chr2R_9303121_9304079,chr2R_9305334_9306491 chr2R_9303121_9303379,chr2R_9303463_9306491 chr2R_9304080_9305333 chr2R_9303380_9303462 chr2R_9302939_9303120;chr2R_9306492_9306590 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015824000000000001 K mutually_exclusive CG11299,noncoding_8970,I_chr2R_19602423_19609308,I_chr2R_19619053_19619186 chr2R + chr2R_19601642_19609732,chr2R_19610399_19616571 chr2R_19601642_19602188,chr2R_19602423_19616571 chr2R_19609733_19610398 chr2R_19602189_19602422 chr2R_19601628_19601641;chr2R_19616572_19616757 33.33 NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8028447457000006e-06 N mutually_exclusive crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11799403_11802904,chr2L_11803675_11803784 chr2L_11799403_11800154,chr2L_11800323_11803784 chr2L_11802905_11803674 chr2L_11800155_11800322 chr2L_11799303_11799402;chr2L_11803785_11803898 0.00 NA NA 38.71 NA NA NA 20.00 29.63 NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA 42.31 NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 41.18 46.15 39.13 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive slgA,I_chrX_21247694_21251677,I_chrX_21251760_21251908,I_chrX_21253735_21253820 chrX + chrX_21247694_21250999,chrX_21251122_21251677 chrX_21247694_21250614,chrX_21250737_21251677 chrX_21251000_21251121 chrX_21250615_21250736 chrX_21247594_21247693;chrX_21251678_21251759 70.00 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.3908199999999998e-07 K mutually_exclusive CG3209,I_chr2R_19957751_19959513,RI_chr2R_19957766_19960227,I_chr2R_19959163_19959513 chr2R + chr2R_19957766_19959513,chr2R_19959748_19960227 chr2R_19957766_19958290,chr2R_19958528_19960227 chr2R_19959514_19959747 chr2R_19958291_19958527 chr2R_19957666_19957765;chr2R_19960228_19960327 6.25 NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9654835760000002e-09 K mutually_exclusive Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11825619,chr2R_11825773_11825951 chr2R_11824086_11825183,chr2R_11825385_11825951 chr2R_11825620_11825772 chr2R_11825184_11825384 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11825952_11826483 98.08 NA NA 79.59 NA NA NA NA NA 85.37 NA NA 82.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive pho,RI_chr4_1193657_1194431,I_chr4_1193830_1194784,EI_chr4_1193830_1195360,RI_chr4_1193830_1195384,I_chr4_1193830_1201673 chr4 - chr4_1193657_1194431,chr4_1194724_1194784 chr4_1193657_1193709,chr4_1193830_1194784 chr4_1194432_1194723 chr4_1193710_1193829 chr4_1193557_1193656;chr4_1194785_1194884 80.00 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 1.7601059784e-07 N mutually_exclusive CG17724,Kdm4B,seq chr2R - chr2R_9066519_9068494,chr2R_9070740_9072281 chr2R_9066519_9067092,chr2R_9067616_9072281 chr2R_9068495_9070739 chr2R_9067093_9067615 chr2R_9063672_9066518;chr2R_9072282_9072680 50.00 NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA 35.14 86.67 NA NA NA NA NA NA 75.00 18.75 4.88 NA NA NA NA NA 28.57 5.56 NA 76.92 NA 20.00 34.62 NA NA 30.77 NA NA 15.79 NA 32.50 NA NA 25.00 NA NA 20.00 25.93 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 27.27 0.0 K mutually_exclusive Nc73EF,F_chr3L_16952838_16955936,CE_chr3L_16952842_16955936,I_chr3L_16952985_16955434,I_chr3L_16953768_16954599 chr3L + chr3L_16952985_16954599,chr3L_16954703_16955434 chr3L_16952985_16953637,chr3L_16953768_16955434 chr3L_16954600_16954702 chr3L_16953638_16953767 chr3L_16952885_16952984;chr3L_16955435_16955513 43.06 NA NA 19.77 60.38 NA NA NA NA 21.57 28.57 12.50 23.91 NA NA 62.96 NA NA 21.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.37 NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA 29.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive RI_chr2L_22125119_22126416,CycK,RI_chr2L_22126776_22130098,I_chr2L_22129256_22129319,I_chr2L_22129837_22129893 chr2L - chr2L_22125119_22128497,chr2L_22129899_22130098 chr2L_22125119_22126416,chr2L_22126776_22130098 chr2L_22128498_22129898 chr2L_22126417_22126775 chr2L_22125065_22125118;chr2L_22130099_22130142 1.75 NA NA NA NA NA NA 17.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Pkn,EI_chr2R_5143544_5143611,CI_chr2R_5143544_5146344,I_chr2R_5171635_5172166 chr2R - chr2R_5143215_5144914,chr2R_5145185_5146344 chr2R_5143215_5143333,chr2R_5143544_5146344 chr2R_5144915_5145184 chr2R_5143334_5143543 chr2R_5143018_5143214;chr2R_5146345_5146444 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000505537032 K mutually_exclusive Nopp140,I_chr3L_21828330_21828566,I_chr3L_21828986_21829082 chr3L + chr3L_21827930_21828566,chr3L_21828986_21829082 chr3L_21827930_21828170,chr3L_21828330_21829082 chr3L_21828567_21828985 chr3L_21828171_21828329 chr3L_21827465_21827929;chr3L_21829083_21829182 24.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.15 NA NA NA NA 38.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.79 NA 0.0 K mutually_exclusive par-1,EFI_chr2R_15361473_15362032,RI_chr2R_15361473_15362035,I_chr2R_15361473_15366246,I_chr2R_15362147_15365120,F_chr2R_15362147_15365138,I_chr2R_15362147_15365165,RI_chr2R_15363358_15365120,I_chr2R_15363358_15366246,I_chr2R_15365210_15370456 chr2R + chr2R_15361473_15366256,chr2R_15366371_15370456 chr2R_15361473_15365138,chr2R_15365210_15370456 chr2R_15366257_15366370 chr2R_15365139_15365209 chr2R_15361373_15361472;chr2R_15370457_15370556 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026804999999999999 K mutually_exclusive bbc,I_chr2R_9376554_9377246,REI_chr2R_9379401_9381986 chr2R - chr2R_9375638_9376421,chr2R_9376554_9378939;chr2R_9375638_9377246,chr2R_9377379_9378939 chr2R_9375638_9378244,chr2R_9378377_9378939 chr2R_9376422_9376553;chr2R_9377247_9377378 chr2R_9378245_9378376 chr2R_9375479_9375637;chr2R_9378940_9379098 93.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Atpalpha,I_chr3R_16783890_16785070,I_chr3R_16788018_16789830,I_chr3R_16792336_16798894,I_chr3R_16792925_16794113 chr3R + chr3R_16774552_16787936,chr3R_16788018_16789446 chr3R_16774552_16786447,chr3R_16786564_16789446 chr3R_16787937_16788017 chr3R_16786448_16786563 chr3R_16774539_16774551;chr3R_16789447_16789578 2.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive gish,RI_chr3R_12118557_12122383 chr3R + chr3R_12118557_12121390,chr3R_12121543_12122383 chr3R_12118557_12119708,chr3R_12119876_12122383 chr3R_12121391_12121542 chr3R_12119709_12119875 chr3R_12118496_12118556;chr3R_12122384_12122483 69.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020460000000000001 K mutually_exclusive CG8079,I_chr2R_11109323_11109403 chr2R + chr2R_11109329_11109548,chr2R_11109931_11110001 chr2R_11109329_11109403,chr2R_11109486_11110001 chr2R_11109549_11109930 chr2R_11109404_11109485 chr2R_11109233_11109328;chr2R_11110002_11110367 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000397 K mutually_exclusive CG9171,I_chr2L_5771210_5773014,RI_chr2L_5792418_5799117,I_chr2L_5799412_5800043 chr2L - chr2L_5771210_5799117,chr2L_5799412_5800043 chr2L_5771210_5787964,chr2L_5787985_5800043 chr2L_5799118_5799411 chr2L_5787965_5787984 chr2L_5771110_5771209;chr2L_5800044_5800143 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044259 K mutually_exclusive Dscam,I_chr2R_3212234_3216793,I_chr2R_3212243_3212342,F_chr2R_3219886_3228832,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3212243_3214121,chr2R_3214290_3216793 chr2R_3212243_3213656,chr2R_3213870_3216793 chr2R_3214122_3214289 chr2R_3213657_3213869 chr2R_3212143_3212242;chr2R_3216794_3216856 63.64 NA NA 52.24 NA 47.92 NA 52.17 NA NA NA NA 39.13 NA NA 44.12 NA NA NA NA NA 84.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.67 NA 86.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Rho1,I_chr2R_11990455_11992537,RI_chr2R_11991687_11992537 chr2R + chr2R_11990455_11992537,chr2R_11992688_11993221 chr2R_11990455_11991115,chr2R_11991280_11993221 chr2R_11992538_11992687 chr2R_11991116_11991279 chr2R_11990435_11990454;chr2R_11993222_11993302 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00020286345599999998 K mutually_exclusive CG10103,noncoding_10997 chr3L - chr3L_6747594_6748046,chr3L_6748224_6748519 chr3L_6747594_6747844,chr3L_6747908_6748519 chr3L_6748047_6748223 chr3L_6747845_6747907 chr3L_6747493_6747593;chr3L_6748520_6749258 77.50 NA NA NA NA NA 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA 89.66 NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive CG31243,CG42457 chr3R + chr3R_13836297_13837817,chr3R_13837873_13838869 chr3R_13836297_13836818,chr3R_13837436_13838869 chr3R_13837818_13837872 chr3R_13836819_13837435 chr3R_13836063_13836296;chr3R_13838870_13839405 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0019350557359999999 N mutually_exclusive CG17273,I_chr3R_16652066_16655997,REI_chr3R_16652421_16653701,I_chr3R_16653805_16654088 chr3R - chr3R_16651716_16653701,chr3R_16653805_16655997 chr3R_16651716_16651785,chr3R_16652066_16655997 chr3R_16653702_16653804 chr3R_16651786_16652065 chr3R_16651355_16651715;chr3R_16655998_16656097 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1999999999999998e-05 K mutually_exclusive Msp-300,I_chr2L_5154189_5154247,I_chr2L_5174808_5176751,I_chr2L_5185965_5188116,snoRNA:Psi28S-2263,I_chr2L_5197634_5197866 chr2L + chr2L_5155850_5187606,chr2L_5187718_5188116 chr2L_5155850_5158454,chr2L_5185965_5188116 chr2L_5187607_5187717 chr2L_5158455_5185964 chr2L_5155589_5155849;chr2L_5188117_5188216 25.00 NA NA NA NA NA NA NA 7.69 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 10.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 11.11 NA NA 11.11 0.00 NA NA NA 12.50 14.29 14.29 NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive PMCA,I_chr4_350028_350896,E_chr4_350055_363541,I_chr4_350064_350896,I_chr4_350959_363547,I_chr4_352629_354970,I_chr4_352629_358161,RI_chr4_355160_363547,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_350055_352023,chr4_352629_363547 chr4_350055_350896,chr4_350966_363547 chr4_352024_352628 chr4_350897_350965 chr4_349964_350054;chr4_363548_363641 31.25 NA NA 9.80 NA NA 3.54 NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.22 NA 53.12 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 56.25 NA NA NA 13.33 13.73 NA NA NA NA NA 12.00 56.00 NA 57.14 NA NA NA NA NA 14.29 12.90 NA NA NA NA 48.72 0.0 K mutually_exclusive CG6767,I_chr3L_9679564_9680329,CREI_chr3L_9679564_9687332,I_chr3L_9680354_9682364,I_chr3L_9682549_9689638,I_chr3L_9682607_9687332,RE_chr3L_9679576_9682364,RI_chr3L_9679579_9682364 chr3L - chr3L_9679564_9687332,chr3L_9687559_9689638 chr3L_9679564_9682364,chr3L_9682549_9689638 chr3L_9687333_9687558 chr3L_9682365_9682548 chr3L_9679479_9679563;chr3L_9689639_9689685 14.29 NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044672000000000003 K mutually_exclusive RhoGAP71E,I_chr3L_15583097_15589765 chr3L + chr3L_15594396_15597935,chr3L_15598381_15599758 chr3L_15594396_15594734,chr3L_15595616_15599758 chr3L_15597936_15598380 chr3L_15594735_15595615 chr3L_15594333_15594395;chr3L_15599759_15600439 88.46 NA NA 75.27 NA NA NA NA NA 98.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive M(2)21AB,I_chr2L_110878_111037,I_chr2L_112022_112689,RI_chr2L_132256_132482 chr2L + chr2L_110878_111906,chr2L_112020_112689 chr2L_110878_111004,chr2L_111118_112689 chr2L_111907_112019 chr2L_111005_111117 chr2L_110778_110877;chr2L_112690_112789 2.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive ens,I_chr3L_4130719_4131120 chr3L - chr3L_4127163_4129650,chr3L_4129789_4131120;chr3L_4127163_4130388,chr3L_4130644_4131120 chr3L_4127163_4128613,chr3L_4128974_4131120 chr3L_4129651_4129788;chr3L_4130389_4130643 chr3L_4128614_4128973 chr3L_4126989_4127162;chr3L_4131121_4131220 1.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive Cda5 chr2L - chr2L_29069_33844,chr2L_34289_34557 chr2L_29069_30393,chr2L_33271_34557 chr2L_33845_34288 chr2L_30394_33270 chr2L_29024_29068;chr2L_34558_34596 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K mutually_exclusive srp,I_chr3R_11825782_11827473,I_chr3R_11826508_11826910 chr3R + chr3R_11825782_11826910,chr3R_11827129_11827473 chr3R_11825782_11826334,chr3R_11826508_11827473 chr3R_11826911_11827128 chr3R_11826335_11826507 chr3R_11825682_11825781;chr3R_11827474_11827573 33.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 22.64 NA NA NA NA NA 45.10 NA NA 46.94 NA NA NA NA NA 21.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.25 21.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.06 NA NA NA NA 1.5855890387904001e-27 K mutually_exclusive Rm62 chr3R - chr3R_1830849_1831671,chr3R_1831837_1833758 chr3R_1830849_1830927,chr3R_1831020_1833758 chr3R_1831672_1831836 chr3R_1830928_1831019 chr3R_1829739_1830848;chr3R_1833759_1834028 93.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041710000000000002 K mutually_exclusive Mtl,I_chr3R_23462559_23463794 chr3R + chr3R_23462298_23463559,chr3R_23463726_23463794 chr3R_23462298_23462381,chr3R_23462559_23463794 chr3R_23463560_23463725 chr3R_23462382_23462558 chr3R_23462291_23462297;chr3R_23463795_23463894 20.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.2123860000000012e-06 K mutually_exclusive CG1674,F_chr4_252231_252560,I_chr4_253475_257020,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_252604_254890,chr4_254972_257020 chr4_252604_252904,chr4_253475_257020 chr4_254891_254971 chr4_252905_253474 chr4_252584_252603;chr4_257021_257101 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044581999999999997 K mutually_exclusive PhKgamma,I_chrX_11590183_11590435,I_chrX_11596563_11597322 chrX + chrX_11592631_11594653,chrX_11595161_11597322 chrX_11592631_11593355,chrX_11593440_11597322 chrX_11594654_11595160 chrX_11593356_11593439 chrX_11592533_11592630;chrX_11597323_11597422 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027119000000000001 K intron_retention CycG,I_chr3R_27427946_27436602,I_chr3R_27427953_27429034,I_chr3R_27427953_27431334,RE_chr3R_27427953_27436598 chr3R - chr3R_27427953_27428792 chr3R_27427952_27427953;chr3R_27428792_27428793 chr3R_27427853_27427952;chr3R_27428793_27428795 79.55 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.42 64.00 55.56 NA NA NA 40.24 52.63 43.21 NA NA 52.17 NA NA 57.32 35.19 NA 47.62 NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA 57.45 NA 0.0 K intron_retention CG3164,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_122995_123080 chr2L_122994_122995;chr2L_123080_123081 chr2L_122711_122994;chr2L_123081_123258 51.43 NA NA 64.24 NA NA NA NA NA 10.81 NA NA 24.66 NA NA 65.58 64.79 NA NA NA NA 23.53 64.47 NA NA NA NA 27.78 39.53 26.15 NA 34.04 23.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.30 NA NA NA NA NA NA 62.69 NA NA 30.77 0.0 K intron_retention Nup153,I_chrX_16495232_16495296 chrX + chrX_16493673_16493756 chrX_16493672_16493673;chrX_16493756_16493757 chrX_16493283_16493672;chrX_16493757_16494346 24.38 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00024176311 K intron_retention Pect,I_chr2L_13207997_13208109,E_chr2L_13208285_13210076 chr2L + chr2L_13208778_13209492 chr2L_13208777_13208778;chr2L_13209492_13209493 chr2L_13208665_13208777;chr2L_13209493_13209499 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.45 NA NA NA NA NA NA NA NA 59.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG3563,I_chr3R_10615218_10615284,F_chr3R_10620137_10620250 chr3R + chr3R_10616975_10619164 chr3R_10616974_10616975;chr3R_10619164_10619165 chr3R_10615279_10616974;chr3R_10619165_10619329 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA 8.1213458164800021e-13 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11824186 chr2R_11824085_11824086;chr2R_11824186_11824187 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11824187_11824286 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4046514400000001e-08 K intron_retention SWAP,I_chrX_935995_936292,RI_chrX_938935_938985,I_chrX_941459_982652 chrX + chrX_935437_936292 chrX_935436_935437;chrX_936292_936293 chrX_935026_935436;chrX_936293_936392 37.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.81 25.00 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention sta chrX - chrX_1376949_1377164 chrX_1376948_1376949;chrX_1377164_1377165 chrX_1376851_1376948;chrX_1377165_1377223 60.87 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA 50.00 NA NA NA NA 79.55 NA 48.39 NA NA 79.31 NA NA NA 30.77 NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention betaggt-I chr2L + chr2L_4947735_4947825 chr2L_4947734_4947735;chr2L_4947825_4947826 chr2L_4946907_4947734;chr2L_4947826_4948377 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA 59.52 NA NA NA 65.85 NA NA NA NA NA 60.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention I_chr2R_9844856_9845327,CG13349,RI_chr2R_9846641_9846709 chr2R - chr2R_9846605_9846709 chr2R_9846604_9846605;chr2R_9846709_9846710 chr2R_9846541_9846604;chr2R_9846710_9846809 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017018999999999999 K intron_retention CG5316 chr3R + chr3R_15229545_15229614 chr3R_15229544_15229545;chr3R_15229614_15229615 chr3R_15229332_15229544;chr3R_15229615_15229840 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 0.00054298119599999997 K intron_retention Gs1l,I_chr2L_4456517_4456723 chr2L - chr2L_4456076_4456385 chr2L_4456075_4456076;chr2L_4456385_4456386 chr2L_4456014_4456075;chr2L_4456386_4456516 52.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025425 K intron_retention kal-1 chr3R + chr3R_19967383_19970914 chr3R_19967382_19967383;chr3R_19970914_19970915 chr3R_19967124_19967382;chr3R_19970915_19971592 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017056000000000002 K intron_retention CG11696,CG11695 chrX + chrX_11469672_11469730 chrX_11469671_11469672;chrX_11469730_11469731 chrX_11469287_11469671;chrX_11469731_11470231 11.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 4.3666560000000004e-05 K intron_retention Elp3 chr2L + chr2L_4444833_4444894 chr2L_4444832_4444833;chr2L_4444894_4444895 chr2L_4444769_4444832;chr2L_4444895_4444963 42.14 NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 24.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA 29.17 20.83 NA NA NA 20.93 19.61 0.0 K intron_retention CG40351,CREFI_chr3LHet_606442_607073 chr3LHet + chr3LHet_600124_600179 chr3LHet_600123_600124;chr3LHet_600179_600180 chr3LHet_599490_600123;chr3LHet_600180_600636 0.00 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036724 K intron_retention Ptp99A,I_chr3R_25302126_25302175 chr3R + chr3R_25309466_25309678 chr3R_25309465_25309466;chr3R_25309678_25309679 chr3R_25309191_25309465;chr3R_25309679_25310173 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0098650000000000005 K intron_retention poe chr2L - chr2L_8054594_8054656 chr2L_8054593_8054594;chr2L_8054656_8054657 chr2L_8054380_8054593;chr2L_8054657_8056253 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Ant2,sesB chrX - chrX_10676714_10676809 chrX_10676713_10676714;chrX_10676809_10676810 chrX_10676413_10676713;chrX_10676810_10676873 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044024000000000001 K intron_retention CG10080 chr2R + chr2R_17517559_17517991 chr2R_17517558_17517559;chr2R_17517991_17517992 chr2R_17517196_17517558;chr2R_17517992_17518052 42.42 NA NA NA NA NA NA 21.57 NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2e-10 K intron_retention hfw chrX + chrX_1563971_1564848 chrX_1563970_1563971;chrX_1564848_1564849 chrX_1563625_1563970;chrX_1564849_1565762 1.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062839999999999997 K intron_retention Aldolase,I_chr3R_22083764_22086684 chr3R - chr3R_22082346_22082654 chr3R_22082345_22082346;chr3R_22082654_22082655 chr3R_22082257_22082345;chr3R_22082655_22082854 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA 3.7444932000000006e-05 K intron_retention CG3662,I_chr2L_822032_822857 chr2L + chr2L_824138_824218 chr2L_824137_824138;chr2L_824218_824219 chr2L_823637_824137;chr2L_824219_824354 88.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.93 NA NA NA NA NA 71.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Paf-AHalpha chrX - chrX_15679163_15679234 chrX_15679162_15679163;chrX_15679234_15679235 chrX_15678698_15679162;chrX_15679235_15679338 84.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA 0.00044981382599999998 K intron_retention CHKov1,CHKov2 chr3R - chr3R_21154725_21154782 chr3R_21154724_21154725;chr3R_21154782_21154783 chr3R_21154645_21154724;chr3R_21154783_21155024 7.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0043860000000000001 K intron_retention RhoBTB,RI_chr3L_20370940_20371530,I_chr3L_20374844_20374891 chr3L + chr3L_20374822_20374891 chr3L_20374821_20374822;chr3L_20374891_20374892 chr3L_20374744_20374821;chr3L_20374892_20374991 0.00 NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000204 K intron_retention Arf51F,I_chr2R_11210733_11210953 chr2R + chr2R_11210218_11210953 chr2R_11210217_11210218;chr2R_11210953_11210954 chr2R_11209979_11210217;chr2R_11210954_11211053 57.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.91 NA NA 78.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.92 4.3374576e-11 K intron_retention Myo61F chr3L + chr3L_1326317_1326372 chr3L_1326316_1326317;chr3L_1326372_1326373 chr3L_1326201_1326316;chr3L_1326373_1326835 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K intron_retention Fer1HCH,I_chr3R_26212319_26213496,I_chr3R_26212834_26213185,I_chr3R_26213132_26213185 chr3R - chr3R_26213273_26213496 chr3R_26213272_26213273;chr3R_26213496_26213497 chr3R_26213186_26213272;chr3R_26213497_26213534 46.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.38 NA 61.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.54 NA NA 35.95 NA NA NA NA 57.61 0.0 N intron_retention msn,I_chr3L_2558033_2560115,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2558390_2563817 chr3L_2558389_2558390;chr3L_2563817_2563818 chr3L_2558293_2558389;chr3L_2563818_2563917 39.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00066100000000000002 K intron_retention RI_chr2L_6471715_6473716,CG9536 chr2L - chr2L_6474652_6474707 chr2L_6474651_6474652;chr2L_6474707_6474708 chr2L_6474349_6474651;chr2L_6474708_6475270 71.88 NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.51 NA NA NA NA NA 51.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12075 chrX + chrX_8761892_8762030 chrX_8761891_8761892;chrX_8762030_8762031 chrX_8761637_8761891;chrX_8762031_8762225 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0094520000000000003 K intron_retention CG6838,I_chr3L_22709306_22709668 chr3L - chr3L_22710181_22710293 chr3L_22710180_22710181;chr3L_22710293_22710294 chr3L_22710071_22710180;chr3L_22710294_22710303 86.57 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.51 NA NA 2.6353600000000002e-13 K intron_retention I_chr2R_2754447_2755071,Spn4,CG9454 chr2R - chr2R_2764239_2764725 chr2R_2764238_2764239;chr2R_2764725_2764726 chr2R_2764101_2764238;chr2R_2764726_2764867 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 0.002761 K intron_retention spi,I_chr2L_19569183_19577185,I_chr2L_19569227_19572142,I_chr2L_19569227_19577173,mir-2a-2,mir-2a-1,mir-2b-2 chr2L - chr2L_19569227_19572499 chr2L_19569226_19569227;chr2L_19572499_19572500 chr2L_19569127_19569226;chr2L_19572500_19572711 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0000000000000001e-05 K intron_retention casp,EI_chr2R_11914764_11914841 chr2R - chr2R_11914562_11914639 chr2R_11914561_11914562;chr2R_11914639_11914640 chr2R_11914372_11914561;chr2R_11914640_11914763 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024688999999999999 K intron_retention isopeptidase-T-3 chr2R + chr2R_15559747_15559798 chr2R_15559746_15559747;chr2R_15559798_15559799 chr2R_15559411_15559746;chr2R_15559799_15560102 17.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.8848749000000004e-05 K intron_retention CG33097,I_chr3R_2191538_2191675,I_chr3R_2199103_2199426 chr3R - chr3R_2193554_2193619 chr3R_2193553_2193554;chr3R_2193619_2193620 chr3R_2192070_2193553;chr3R_2193620_2194010 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5999999999999999e-05 K intron_retention CG12945,I_chr3R_5615604_5615859,I_chr3R_5615807_5615858,RI_chr3R_5616467_5616560 chr3R - chr3R_5615988_5616041 chr3R_5615987_5615988;chr3R_5616041_5616042 chr3R_5615860_5615987;chr3R_5616042_5616182 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036068999999999997 K intron_retention CG2681,I_chrX_2609471_2609546,RI_chrX_2622435_2622577 chrX + chrX_2604935_2605003 chrX_2604934_2604935;chrX_2605003_2605004 chrX_2604867_2604934;chrX_2605004_2605072 35.71 NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.33 NA 1.296e-15 K intron_retention CG12946,noncoding_15730,I_chr3R_5599701_5600032,I_chr3R_5609682_5609889 chr3R - chr3R_5599358_5599459 chr3R_5599357_5599358;chr3R_5599459_5599460 chr3R_5599286_5599357;chr3R_5599460_5599700 63.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00041399999999999998 K intron_retention DNApol-epsilon,sec13,I_chr3R_19184824_19184875 chr3R + chr3R_19180443_19180506 chr3R_19180442_19180443;chr3R_19180506_19180507 chr3R_19174234_19180442;chr3R_19180507_19180890 2.94 NA NA 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.0000000000000007e-05 K intron_retention CG34449,I_chrX_9222628_9227416,RI_chrX_9232665_9233022,RI_chrX_9249209_9250033,RI_chrX_9249212_9250033,RI_chrX_9249212_9250244 chrX - chrX_9227656_9231026 chrX_9227655_9227656;chrX_9231026_9231027 chrX_9227417_9227655;chrX_9231027_9231270 82.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.42 NA NA NA NA NA NA 67.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG1265,I_chr3L_4255296_4255550 chr3L + chr3L_4254969_4255035 chr3L_4254968_4254969;chr3L_4255035_4255036 chr3L_4254787_4254968;chr3L_4255036_4255292 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012937000000000001 K intron_retention cora,I_chr2R_15125277_15130573,I_chr2R_15125940_15130208,I_chr2R_15129291_15129988 chr2R + chr2R_15129901_15129994 chr2R_15129900_15129901;chr2R_15129994_15129995 chr2R_15129679_15129900;chr2R_15129995_15130088 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 0.00065300000000000004 K intron_retention CG1965,I_chr3R_2902064_2902611 chr3R + chr3R_2894911_2895006 chr3R_2894910_2894911;chr3R_2895006_2895007 chr3R_2894728_2894910;chr3R_2895007_2895660 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020025999999999999 K intron_retention Zn72D,RF_chr3L_16100887_16102721,I_chr3L_16105199_16105253 chr3L - chr3L_16100887_16101951 chr3L_16100886_16100887;chr3L_16101951_16101952 chr3L_16100787_16100886;chr3L_16101952_16102016 26.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00060999999999999997 K intron_retention n-syb,I_chr3L_1637270_1637558,metl chr3L - chr3L_1638855_1638908 chr3L_1638854_1638855;chr3L_1638908_1638909 chr3L_1637903_1638854;chr3L_1638909_1638974 23.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019734000000000002 K intron_retention CG10737 chr2R + chr2R_15062754_15063752 chr2R_15062753_15062754;chr2R_15063752_15063753 chr2R_15062592_15062753;chr2R_15063753_15063852 97.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Syx13,RI_chr3L_13037959_13038017,CG11279 chr3L + chr3L_13037950_13038017 chr3L_13037949_13037950;chr3L_13038017_13038018 chr3L_13037903_13037949;chr3L_13038018_13038117 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001443876098 K intron_retention RhoGAP18B chrX - chrX_19047302_19047377 chrX_19047301_19047302;chrX_19047377_19047378 chrX_19047061_19047301;chrX_19047378_19047520 88.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG40191,I_chr2RHet_392279_392824 chr2RHet + chr2RHet_392686_392824 chr2RHet_392685_392686;chr2RHet_392824_392825 chr2RHet_391976_392685;chr2RHet_392825_392923 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00065600000000000001 K intron_retention MRP,F_chr2L_12727117_12736035 chr2L + chr2L_12737619_12737958 chr2L_12737618_12737619;chr2L_12737958_12737959 chr2L_12737550_12737618;chr2L_12737959_12738176 28.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.33 NA 6.1143178000000001e-05 K intron_retention Syx16,RI_chrX_20264319_20264376 chrX - chrX_20264319_20264380 chrX_20264318_20264319;chrX_20264380_20264381 chrX_20264219_20264318;chrX_20264381_20264476 2.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00016100000000000001 K intron_retention Nedd4,I_chr3L_17526753_17527450,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17526749_17527450 chr3L_17526748_17526749;chr3L_17527450_17527451 chr3L_17526708_17526748;chr3L_17527451_17527550 68.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.83 0.0081119999999999994 K intron_retention bur,I_chr2L_21177679_21177901,I_chr2L_21177679_21178250,I_chr2L_21177960_21179329 chr2L - chr2L_21177679_21179329 chr2L_21177678_21177679;chr2L_21179329_21179330 chr2L_21177579_21177678;chr2L_21179330_21179429 1.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00021000000000000001 K intron_retention CG3209,I_chr2R_19957751_19959513,RI_chr2R_19957766_19960227,I_chr2R_19959163_19959513 chr2R + chr2R_19957766_19959513 chr2R_19957765_19957766;chr2R_19959513_19959514 chr2R_19957666_19957765;chr2R_19959514_19959528 25.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 1.2020400000000001e-09 K intron_retention sec23,I_chr3R_1474873_1475080,I_chr3R_1474899_1475080,I_chr3R_1474960_1475051,I_chr3R_1477727_1478102 chr3R + chr3R_1474899_1475093 chr3R_1474898_1474899;chr3R_1475093_1475094 chr3R_1474877_1474898;chr3R_1475094_1475151 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.81 NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA 67.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0394148400000004e-10 K intron_retention CG6171,I_chr3R_11188806_11188873,CG34404,CG14868 chr3R - chr3R_11188820_11188873 chr3R_11188819_11188820;chr3R_11188873_11188874 chr3R_11188514_11188819;chr3R_11188874_11188973 54.72 NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 76.47 71.83 NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA 72.09 NA 42.86 43.14 NA NA NA 40.91 NA NA NA NA 43.18 NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention puc,CG7878,I_chr3R_3952846_3953762 chr3R + chr3R_3932462_3933953 chr3R_3932461_3932462;chr3R_3933953_3933954 chr3R_3932456_3932461;chr3R_3933954_3934100 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024888 K intron_retention CG30109,CG30108,I_chr2R_13557316_13557647 chr2R + chr2R_13557138_13557191 chr2R_13557137_13557138;chr2R_13557191_13557192 chr2R_13556976_13557137;chr2R_13557192_13557387 52.54 37.93 NA 75.68 NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA 37.04 NA NA 76.47 NA NA NA NA 70.21 NA NA NA NA NA NA 38.78 NA 68.00 NA 38.71 NA NA NA NA NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention AT25722,CG3376 chr2R + chr2R_20151869_20152108 chr2R_20151868_20151869;chr2R_20152108_20152109 chr2R_20151683_20151868;chr2R_20152109_20152281 74.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.67 60.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.06 NA NA NA NA NA NA 50.00 52.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.40 NA NA NA 63.25 55.88 NA NA NA NA NA NA NA 61.08 NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG5746 chr3R - chr3R_20173317_20173385 chr3R_20173316_20173317;chr3R_20173385_20173386 chr3R_20173127_20173316;chr3R_20173386_20173784 79.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.67 NA NA NA NA 63.43 NA NA 63.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention dgt1,CG7824 chr3R - chr3R_25682076_25682132 chr3R_25682075_25682076;chr3R_25682132_25682133 chr3R_25681675_25682075;chr3R_25682133_25682296 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018613000000000001 K intron_retention CG17019,I_chr2R_8821104_8821171 chr2R - chr2R_8819048_8819106 chr2R_8819047_8819048;chr2R_8819106_8819107 chr2R_8818420_8819047;chr2R_8819107_8819246 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0025929999999999998 K intron_retention Csp,RI_chr3L_22262215_22262452,I_chr3L_22264863_22266536,I_chr3L_22273037_22275661 chr3L + chr3L_22264863_22265468 chr3L_22264862_22264863;chr3L_22265468_22265469 chr3L_22264763_22264862;chr3L_22265469_22266829 30.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.65 11.65 14.29 NA NA NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA NA NA NA 15.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Sodh-2 chr3R + chr3R_6703370_6703423 chr3R_6703369_6703370;chr3R_6703423_6703424 chr3R_6703151_6703369;chr3R_6703424_6703545 75.76 59.09 NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA 8.7441024000000002e-17 K intron_retention CG9153,Myo61F chr3L + chr3L_1313909_1313974 chr3L_1313908_1313909;chr3L_1313974_1313975 chr3L_1313840_1313908;chr3L_1313975_1314090 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.49 NA NA NA NA NA NA NA 64.52 NA NA 43.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.89 0.0 K intron_retention CG4199,I_chrX_1962457_1964222 chrX - chrX_1965614_1965872 chrX_1965613_1965614;chrX_1965872_1965873 chrX_1965393_1965613;chrX_1965873_1966087 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000513 K intron_retention cul-4 chr2R - chr2R_3990050_3990112 chr2R_3990049_3990050;chr2R_3990112_3990113 chr2R_3989765_3990049;chr2R_3990113_3990411 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.28 NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9625600000000002e-13 K intron_retention Cnx99A,I_chr3R_25144335_25145173,I_chr3R_25145243_25145309,I_chr3R_25145256_25145426 chr3R - chr3R_25145256_25145309 chr3R_25145255_25145256;chr3R_25145309_25145310 chr3R_25145174_25145255;chr3R_25145310_25145319 84.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024951999999999998 K intron_retention spir,I_chr2L_20334199_20334626,I_chr2L_20336550_20339058 chr2L + chr2L_20343948_20345524 chr2L_20343947_20343948;chr2L_20345524_20345525 chr2L_20343743_20343947;chr2L_20345525_20345670 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031914999999999999 K intron_retention Ide,I_chr3L_20366301_20366354,I_chr3L_20368443_20368519 chr3L - chr3L_20368655_20368717 chr3L_20368654_20368655;chr3L_20368717_20368718 chr3L_20368520_20368654;chr3L_20368718_20368931 15.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040547 K intron_retention CG31689,I_chr2L_2730373_2736310,I_chr2L_2730470_2736310,RI_chr2L_2736137_2736310,I_chr2L_2736230_2736310,I_chr2L_2736431_2737036 chr2L + chr2L_2730373_2736173 chr2L_2730372_2730373;chr2L_2736173_2736174 chr2L_2730370_2730372;chr2L_2736174_2736229 47.22 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4022400000000001e-06 K intron_retention CG11739,RI_chr3R_205772_205830,I_chr3R_207254_207600 chr3R + chr3R_205768_205830 chr3R_205767_205768;chr3R_205830_205831 chr3R_205672_205767;chr3R_205831_205930 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017697999999999998 K intron_retention Cctgamma chr3R + chr3R_12473652_12473709 chr3R_12473651_12473652;chr3R_12473709_12473710 chr3R_12473558_12473651;chr3R_12473710_12473771 2.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.2999999999999997e-05 K intron_retention nimB1 chr2L + chr2L_13964739_13964793 chr2L_13964738_13964739;chr2L_13964793_13964794 chr2L_13964670_13964738;chr2L_13964794_13965122 52.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA 18.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA 32.35 38.10 0.0 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CE_chr2R_11826384_11826741,I_chr2R_11826763_11826990,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824089_11824525 chr2R_11824088_11824089;chr2R_11824525_11824526 chr2R_11823989_11824088;chr2R_11824526_11824611 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.97 NA NA NA NA NA 0.001503 K intron_retention CG13124,I_chr2L_9905292_9905551,I_chr2L_9905292_9905677,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9905053_9905137 chr2L_9905052_9905053;chr2L_9905137_9905138 chr2L_9904827_9905052;chr2L_9905138_9905241 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 22.45 NA 28.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1876471606999999e-06 K intron_retention Ect4,C_chr3L_8091754_8101552,I_chr3L_8091826_8092243,I_chr3L_8098397_8101385,I_chr3L_8098758_8101738,I_chr3L_8100030_8101385 chr3L + chr3L_8098758_8099115 chr3L_8098757_8098758;chr3L_8099115_8099116 chr3L_8098658_8098757;chr3L_8099116_8100029 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 65.18 NA 74.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.10 NA NA 68.84 73.39 NA NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.42 73.68 NA 71.57 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 65.38 0.0 K intron_retention BHD chr3L + chr3L_7232894_7232982 chr3L_7232893_7232894;chr3L_7232982_7232983 chr3L_7231645_7232893;chr3L_7232983_7233085 1.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000339 K intron_retention sda,I_chr3R_22742285_22742350,RI_chr3R_22750984_22752737 chr3R + chr3R_22769717_22769778 chr3R_22769716_22769717;chr3R_22769778_22769779 chr3R_22769549_22769716;chr3R_22769779_22769922 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035249999999999999 K intron_retention BM-40-SPARC,I_chr3R_22696095_22696231,I_chr3R_22696095_22696291,I_chr3R_22696095_22697413 chr3R - chr3R_22696095_22697413 chr3R_22696094_22696095;chr3R_22697413_22697414 chr3R_22695995_22696094;chr3R_22697414_22697513 53.33 NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA 36.54 NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA 36.84 NA 33.33 NA NA NA 32.00 NA NA 1.4286071307643057e-21 N intron_retention aru,I_chr2L_864795_867505,snoRNA:Me28S-U1230 chr2L - chr2L_864966_865826 chr2L_864965_864966;chr2L_865826_865827 chr2L_864877_864965;chr2L_865827_865847 100.00 NA NA 67.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.70 NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 1.7699954497415884e-13 K intron_retention BRWD3 chr3R + chr3R_20151805_20151861 chr3R_20151804_20151805;chr3R_20151861_20151862 chr3R_20151472_20151804;chr3R_20151862_20152617 83.33 NA 70.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG7816,R_chr3R_25691122_25691551,RI_chr3R_25691122_25692883,RI_chr3R_25691122_25694436 chr3R - chr3R_25691122_25694365 chr3R_25691121_25691122;chr3R_25694365_25694366 chr3R_25691022_25691121;chr3R_25694366_25694618 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9466464000000004e-05 K intron_retention I_chr3L_22859135_22860499,Ssl1,slif chr3L + chr3L_22872531_22872583 chr3L_22872530_22872531;chr3L_22872583_22872584 chr3L_22872448_22872530;chr3L_22872584_22872925 32.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA NA NA NA NA 0.0049280000000000001 K intron_retention sba,I_chr3R_19721149_19722571 chr3R - chr3R_19722331_19722784 chr3R_19722330_19722331;chr3R_19722784_19722785 chr3R_19721931_19722330;chr3R_19722785_19722913 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035249999999999999 K intron_retention CG4662 chr3R + chr3R_15673358_15675733 chr3R_15673357_15673358;chr3R_15675733_15675734 chr3R_15673115_15673357;chr3R_15675734_15675875 19.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 0.028209000000000001 K intron_retention vih chr3L + chr3L_12497753_12497818 chr3L_12497752_12497753;chr3L_12497818_12497819 chr3L_12497346_12497752;chr3L_12497819_12498965 0.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0032699999999999999 K intron_retention Gel,RI_chr3R_62662_62721,RI_chr3R_62666_63346,I_chr3R_62933_63346,I_chr3R_63962_64024,I_chr3R_66533_66599 chr3R + chr3R_62527_63346 chr3R_62526_62527;chr3R_63346_63347 chr3R_62304_62526;chr3R_63347_63446 0.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K intron_retention CG3847 chrX + chrX_6241277_6241333 chrX_6241276_6241277;chrX_6241333_6241334 chrX_6241252_6241276;chrX_6241334_6241442 90.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3e-05 K intron_retention lt,I_chr2L_22817840_22817968,RI_chr2L_22820498_22823377,I_chr2L_22831575_22832085,I_chr2L_22832038_22832092,RI_chr2L_22832567_22832623 chr2L + chr2L_22817840_22817891 chr2L_22817839_22817840;chr2L_22817891_22817892 chr2L_22817740_22817839;chr2L_22817892_22817982 30.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.50 NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA 15.52 NA 19.57 NA NA NA NA NA NA NA 12.90 8.167532006400002e-30 K intron_retention Pk61C,CE_chr3L_129889_141769,I_chr3L_136336_137121,I_chr3L_136336_141563 chr3L + chr3L_136336_137121 chr3L_136335_136336;chr3L_137121_137122 chr3L_136236_136335;chr3L_137122_137133 72.22 NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.17 NA 37.80 56.52 52.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention kst,I_chr3L_3367008_3367514 chr3L + chr3L_3367011_3367514 chr3L_3367010_3367011;chr3L_3367514_3367515 chr3L_3366444_3367010;chr3L_3367515_3367614 15.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention Ptp4E,EI_chrX_4842231_4842425 chrX + chrX_4842231_4843022 chrX_4842230_4842231;chrX_4843022_4843023 chrX_4842134_4842230;chrX_4843023_4843701 21.50 NA NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00082933765599999996 K intron_retention CG1399,I_chr2R_3574133_3574191 chr2R - chr2R_3565240_3565323 chr2R_3565239_3565240;chr2R_3565323_3565324 chr2R_3564840_3565239;chr2R_3565324_3565909 81.08 NA NA NA NA NA NA NA NA 62.71 52.17 NA NA NA 68.89 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11825183 chr2R_11824085_11824086;chr2R_11825183_11825184 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11825184_11825384 18.42 NA NA NA NA 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00040400000000000001 K intron_retention CG3774,I_chrX_6114220_6114292 chrX + chrX_6114220_6114347 chrX_6114219_6114220;chrX_6114347_6114348 chrX_6114120_6114219;chrX_6114348_6114392 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.74 NA NA NA NA 68.97 NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0097394448000013e-08 K intron_retention CG8184,I_chrX_15620707_15620769 chrX + chrX_15617158_15617265 chrX_15617157_15617158;chrX_15617265_15617266 chrX_15615597_15617157;chrX_15617266_15618411 71.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.19 NA NA 44.19 NA NA NA NA NA NA NA 87.95 NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG14642,CG34305 chr3R - chr3R_66855_66974 chr3R_66854_66855;chr3R_66974_66975 chr3R_66767_66854;chr3R_66975_67420 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0211320000000004e-06 K intron_retention I_chr3R_16141663_16144698,CG5077,I_chr3R_16144997_16145285,I_chr3R_16145228_16145285,I_chr3R_16147605_16147670 chr3R + chr3R_16144753_16145289 chr3R_16144752_16144753;chr3R_16145289_16145290 chr3R_16144699_16144752;chr3R_16145290_16145385 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 0.000195 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CE_chr2R_11826384_11826741,I_chr2R_11826763_11826990,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824089_11825183 chr2R_11824088_11824089;chr2R_11825183_11825184 chr2R_11823989_11824088;chr2R_11825184_11825384 36.84 NA NA NA 15.79 7.14 NA NA NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.93 NA NA NA NA NA 7.8982200000000016e-15 K intron_retention CG31712,I_chr2L_9935570_9935951,CREI_chr2L_9938511_9938564,RI_chr2L_9942818_9944294,I_chr2L_9944682_9947179 chr2L - chr2L_9935570_9937237 chr2L_9935569_9935570;chr2L_9937237_9937238 chr2L_9935486_9935569;chr2L_9937238_9937510 54.84 NA NA 36.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.70 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.35 0.0 K intron_retention CG7289 chr2L + chr2L_1982499_1982546 chr2L_1982498_1982499;chr2L_1982546_1982547 chr2L_1982235_1982498;chr2L_1982547_1983960 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0050509999999999999 K intron_retention CG3493 chr2R - chr2R_19259384_19259445 chr2R_19259383_19259384;chr2R_19259445_19259446 chr2R_19258869_19259383;chr2R_19259446_19259562 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017022727679999999 K intron_retention Hairless chr3R + chr3R_16448221_16448305 chr3R_16448220_16448221;chr3R_16448305_16448306 chr3R_16448012_16448220;chr3R_16448306_16449020 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010508999999999999 K intron_retention Adk2 chr2R + chr2R_19912660_19912722 chr2R_19912659_19912660;chr2R_19912722_19912723 chr2R_19912423_19912659;chr2R_19912723_19912890 4.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021632999999999999 K intron_retention wun2,I_chr2R_5304606_5304660 chr2R + chr2R_5305077_5305137 chr2R_5305076_5305077;chr2R_5305137_5305138 chr2R_5305008_5305076;chr2R_5305138_5305166 2.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.47 NA NA NA NA 25.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6921999999999999e-08 K intron_retention I_chr3L_1866804_1867140,CG13924 chr3L + chr3L_1870086_1870146 chr3L_1870085_1870086;chr3L_1870146_1870147 chr3L_1869858_1870085;chr3L_1870147_1871564 68.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00022900000000000001 K intron_retention CG6422,RI_chr3R_20863994_20864142 chr3R - chr3R_20864239_20864374 chr3R_20864238_20864239;chr3R_20864374_20864375 chr3R_20864143_20864238;chr3R_20864375_20864395 43.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.26 NA 2.86 8.47 NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA 11.11 NA NA 8.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.85 7.4098286544908076e-20 K intron_retention CG2924,I_chrX_2168373_2168893 chrX - chrX_2159519_2159580 chrX_2159518_2159519;chrX_2159580_2159581 chrX_2159443_2159518;chrX_2159581_2159849 82.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.04 NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3000000000000002e-11 K intron_retention Spase12 chr3R - chr3R_25316476_25316531 chr3R_25316475_25316476;chr3R_25316531_25316532 chr3R_25316407_25316475;chr3R_25316532_25316612 2.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG31211,I_chr3R_7777267_7777327 chr3R + chr3R_7777215_7777444 chr3R_7777214_7777215;chr3R_7777444_7777445 chr3R_7777167_7777214;chr3R_7777445_7777547 35.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA 15.09 NA NA 20.83 14.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9775,I_chr3R_464132_464367,I_chr3R_466059_466296 chr3R - chr3R_465475_465734 chr3R_465474_465475;chr3R_465734_465735 chr3R_465356_465474;chr3R_465735_466058 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention I_chr3L_2589746_2592161,CG16986 chr3L + chr3L_2600960_2601020 chr3L_2600959_2600960;chr3L_2601020_2601021 chr3L_2600822_2600959;chr3L_2601021_2601417 0.00 NA NA 32.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014014 K intron_retention CG1718 chrX - chrX_21163958_21164368 chrX_21163957_21163958;chrX_21164368_21164369 chrX_21163741_21163957;chrX_21164369_21164557 64.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 33.33 NA 4.3143432815999999e-20 K intron_retention CG13384 chr2L + chr2L_8384896_8385002 chr2L_8384895_8384896;chr2L_8385002_8385003 chr2L_8384754_8384895;chr2L_8385003_8385091 73.70 NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.17 NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3833976988000009e-08 K intron_retention CG30193,CG30190 chr2R + chr2R_18813008_18813071 chr2R_18813007_18813008;chr2R_18813071_18813072 chr2R_18812998_18813007;chr2R_18813072_18813135 80.43 NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 62.50 NA 8.241013895598946e-12 K intron_retention Lag1,I_chrX_6152540_6152929,RI_chrX_6153758_6161036,I_chrX_6160907_6161036 chrX - chrX_6152828_6152929 chrX_6152827_6152828;chrX_6152929_6152930 chrX_6152683_6152827;chrX_6152930_6153029 2.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG15814,I_chrX_17743744_17743940 chrX - chrX_17743088_17743149 chrX_17743087_17743088;chrX_17743149_17743150 chrX_17742852_17743087;chrX_17743150_17743378 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010660000000000001 K intron_retention Unc-76,RI_chrX_1983640_1985001,I_chrX_2002576_2003165 chrX + chrX_1985925_1985994 chrX_1985924_1985925;chrX_1985994_1985995 chrX_1985835_1985924;chrX_1985995_1987597 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00049299999999999995 K intron_retention CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8989685_8990798 chrX_8989684_8989685;chrX_8990798_8990799 chrX_8989428_8989684;chrX_8990799_8990858 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.86 NA NA NA NA NA 0.00066131671199999998 K intron_retention Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11820226_11820288 chr2R_11820225_11820226;chr2R_11820288_11820289 chr2R_11819695_11820225;chr2R_11820289_11821303 0.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9894,RI_chr2L_2755946_2756007 chr2L + chr2L_2756171_2756244 chr2L_2756170_2756171;chr2L_2756244_2756245 chr2L_2756008_2756170;chr2L_2756245_2756663 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG7889 chrX + chrX_19138691_19138751 chrX_19138690_19138691;chrX_19138751_19138752 chrX_19138623_19138690;chrX_19138752_19138817 1.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2e-05 K intron_retention Ptpmeg,I_chr3L_353688_353782,I_chr3L_355125_355175 chr3L + chr3L_355690_355752 chr3L_355689_355690;chr3L_355752_355753 chr3L_355438_355689;chr3L_355753_355883 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013871 K intron_retention noncoding_22267 chrX - chrX_6581336_6581395 chrX_6581335_6581336;chrX_6581395_6581396 chrX_6581126_6581335;chrX_6581396_6581415 54.92 NA NA 27.50 NA NA NA NA NA NA NA 40.48 NA 36.84 NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 34.62 0.0 K intron_retention Wwox,I_chr2L_8000434_8000497,Spn28D chr2L - chr2L_8000033_8000107 chr2L_8000032_8000033;chr2L_8000107_8000108 chr2L_7999777_8000032;chr2L_8000108_8000236 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014382000000000001 K intron_retention CG3348,RI_chr3R_23117734_23117847 chr3R - chr3R_23117716_23117847 chr3R_23117715_23117716;chr3R_23117847_23117848 chr3R_23117634_23117715;chr3R_23117848_23117947 1.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049520000000000002 K intron_retention slmo,CG34179 chr2L - chr2L_6047781_6047899 chr2L_6047780_6047781;chr2L_6047899_6047900 chr2L_6046654_6047780;chr2L_6047900_6047941 54.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0365509999999996e-06 K intron_retention sol chrX + chrX_21222794_21222886 chrX_21222793_21222794;chrX_21222886_21222887 chrX_21222781_21222793;chrX_21222887_21223512 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011374 K intron_retention CG15814,I_chrX_17743744_17743940 chrX - chrX_17744102_17744321 chrX_17744101_17744102;chrX_17744321_17744322 chrX_17743941_17744101;chrX_17744322_17744390 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.77 6.9428000000000005e-08 K intron_retention CG17119,sav chr3R - chr3R_18881861_18881920 chr3R_18881860_18881861;chr3R_18881920_18881921 chr3R_18881764_18881860;chr3R_18881921_18882048 1.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034327000000000003 K intron_retention Pax,RI_chr2L_19401373_19409403,RI_chr2L_19404683_19426205,RI_chr2L_19404823_19409403 chr2L - chr2L_19403717_19403998 chr2L_19403716_19403717;chr2L_19403998_19403999 chr2L_19403650_19403716;chr2L_19403999_19404682 52.83 NA 64.10 NA 67.74 NA NA 78.57 65.93 34.38 72.00 NA NA 65.85 NA NA NA NA 74.29 26.92 NA NA 36.11 NA 20.37 12.50 NA NA 14.04 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.78 NA NA 8.51 NA 72.73 NA 15.38 NA 33.33 NA NA NA NA NA 33.33 32.14 73.17 32.14 NA NA 0.0 K intron_retention MRP,F_chr2L_12727117_12736035 chr2L + chr2L_12722485_12722558 chr2L_12722484_12722485;chr2L_12722558_12722559 chr2L_12722355_12722484;chr2L_12722559_12724070 2.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention RI_chr3L_20370940_20371530,I_chr3L_20374844_20374891,fbl chr3L + chr3L_20383735_20383789 chr3L_20383734_20383735;chr3L_20383789_20383790 chr3L_20383558_20383734;chr3L_20383790_20383925 20.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention CG6845,I_chr3L_148414_148489 chr3L + chr3L_147399_147452 chr3L_147398_147399;chr3L_147452_147453 chr3L_147138_147398;chr3L_147453_147646 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.4597815999999997e-05 K intron_retention CG8029,I_chr2R_5095165_5095256 chr2R + chr2R_5095165_5095252 chr2R_5095164_5095165;chr2R_5095252_5095253 chr2R_5095083_5095164;chr2R_5095253_5095264 8.33 NA NA NA NA NA 36.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0089669999999999993 K intron_retention RpL3,E_chr3R_7047964_7050565,I_chr3R_7048451_7049116,I_chr3R_7048452_7048540,I_chr3R_7048452_7049579,snoRNA:Me18S-A425,snoRNA:Psi28S-291,I_chr3R_7049970_7050189 chr3R + chr3R_7048452_7049579 chr3R_7048451_7048452;chr3R_7049579_7049580 chr3R_7048352_7048451;chr3R_7049580_7049679 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention RpS27A chr2L + chr2L_10410169_10410240 chr2L_10410168_10410169;chr2L_10410240_10410241 chr2L_10408388_10410168;chr2L_10410241_10410467 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.32 NA 0.00052824523700000002 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1527189 chr3L_1525392_1525393;chr3L_1527189_1527190 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1527190_1527240 80.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA 40.00 NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.4997918073493008e-10 K intron_retention CG3499,I_chr2R_18772777_18772819 chr2R - chr2R_18773335_18773438 chr2R_18773334_18773335;chr2R_18773438_18773439 chr2R_18772937_18773334;chr2R_18773439_18773581 1.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0098289999999999992 K intron_retention BicD,Aac11,I_chr2L_17475843_17475910 chr2L - chr2L_17475355_17475534 chr2L_17475354_17475355;chr2L_17475534_17475535 chr2L_17474918_17475354;chr2L_17475535_17475615 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3820000000000001e-08 K intron_retention Aldh-III,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361451,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3361349_3361420 chr2R_3361348_3361349;chr2R_3361420_3361421 chr2R_3361249_3361348;chr2R_3361421_3361422 78.46 NA NA 60.48 NA NA NA 59.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.31 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1525641 chr3L_1525392_1525393;chr3L_1525641_1525642 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1525642_1525700 39.13 NA NA 25.00 NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8836006830360149e-08 K intron_retention CG16940,I_chr3L_212740_212843,I_chr3L_212783_212843,noncoding_9585,Kaz1-ORFA_Kaz1-ORFB chr3L + chr3L_212785_212843 chr3L_212784_212785;chr3L_212843_212844 chr3L_212761_212784;chr3L_212844_212943 66.67 NA NA NA NA 53.85 53.33 NA NA NA 52.38 NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.10 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 55.00 NA 2.6818068447239784e-33 K intron_retention CG16940,I_chr3L_212783_212843,Kaz1-ORFA_Kaz1-ORFB chr3L + chr3L_215452_215504 chr3L_215451_215452;chr3L_215504_215505 chr3L_215386_215451;chr3L_215505_215624 12.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.00 0.00034491022999999998 K intron_retention dom,I_chr2R_17217595_17218598,I_chr2R_17228865_17228924 chr2R + chr2R_17228582_17228924 chr2R_17228581_17228582;chr2R_17228924_17228925 chr2R_17228199_17228581;chr2R_17228925_17229024 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.93 NA NA 76.83 NA NA NA NA NA 73.42 70.83 NA 0.0 K intron_retention CG3626 chrX + chrX_4263145_4263206 chrX_4263144_4263145;chrX_4263206_4263207 chrX_4262847_4263144;chrX_4263207_4263413 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028240000000000001 K intron_retention CG5941,E_chrX_5932158_5932432 chrX + chrX_5932227_5932295 chrX_5932226_5932227;chrX_5932295_5932296 chrX_5932074_5932226;chrX_5932296_5932598 1.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025085 K intron_retention synj,I_chr2R_17968269_17968579 chr2R + chr2R_17972430_17972496 chr2R_17972429_17972430;chr2R_17972496_17972497 chr2R_17970210_17972429;chr2R_17972497_17973112 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1e-05 K intron_retention Tao-1,I_chrX_19471628_19472934 chrX - chrX_19471628_19471934 chrX_19471627_19471628;chrX_19471934_19471935 chrX_19471528_19471627;chrX_19471935_19472535 66.67 NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1702599999999999e-07 K intron_retention CG1416,I_chr2L_21758100_21758179,I_chr2L_21758143_21758183,I_chr2L_21758143_21758209 chr2L + chr2L_21758143_21758201 chr2L_21758142_21758143;chr2L_21758201_21758202 chr2L_21758116_21758142;chr2L_21758202_21758279 78.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.90 NA 62.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525701_1527189 chr3L_1525700_1525701;chr3L_1527189_1527190 chr3L_1525644_1525700;chr3L_1527190_1527240 68.59 NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA 52.38 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA 41.67 NA 9.5715031644769483e-19 K intron_retention Hcs,I_chr3R_1303481_1304607 chr3R + chr3R_1305505_1305567 chr3R_1305504_1305505;chr3R_1305567_1305568 chr3R_1305355_1305504;chr3R_1305568_1305711 23.53 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 5.9628379999999997e-06 K intron_retention CG7203,Rack1,RI_chr2L_7826337_7826533 chr2L - chr2L_7826337_7826533 chr2L_7826336_7826337;chr2L_7826533_7826534 chr2L_7826237_7826336;chr2L_7826534_7826633 16.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00096199999999999996 K intron_retention Inos,I_chr2R_3344353_3345211,noncoding_4874 chr2R - chr2R_3344353_3345211 chr2R_3344352_3344353;chr2R_3345211_3345212 chr2R_3344253_3344352;chr2R_3345212_3345260 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0058479999999999999 K intron_retention mfas,I_chr3R_7811954_7812017,I_chr3R_7818597_7818853,I_chr3R_7818607_7818853,RI_chr3R_7818607_7818970 chr3R - chr3R_7818575_7818853 chr3R_7818574_7818575;chr3R_7818853_7818854 chr3R_7818507_7818574;chr3R_7818854_7818892 81.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.04 2.1839999999999999e-09 K intron_retention LSm7 chr2L - chr2L_16742443_16742625 chr2L_16742442_16742443;chr2L_16742625_16742626 chr2L_16742326_16742442;chr2L_16742626_16742986 50.22 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.92 NA NA 19.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.34 NA NA NA NA NA 38.57 NA NA NA NA NA NA 35.56 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG3321,RI_chr3R_10154615_10155360 chr3R + chr3R_10152906_10152974 chr3R_10152905_10152906;chr3R_10152974_10152975 chr3R_10152858_10152905;chr3R_10152975_10153473 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011339 K intron_retention PH4alphaEFB,I_chr3R_26305150_26309614 chr3R + chr3R_26311115_26311175 chr3R_26311114_26311115;chr3R_26311175_26311176 chr3R_26310949_26311114;chr3R_26311176_26311493 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG30389,I_chr2R_17044803_17047935 chr2R - chr2R_17038429_17038487 chr2R_17038428_17038429;chr2R_17038487_17038488 chr2R_17037770_17038428;chr2R_17038488_17038589 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention CG6845,I_chr3L_148414_148489 chr3L + chr3L_147647_147699 chr3L_147646_147647;chr3L_147699_147700 chr3L_147453_147646;chr3L_147700_147729 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8958800000000002e-05 K intron_retention Hrb98DE,RI_chr3R_24429041_24431183,RI_chr3R_24430202_24430258 chr3R + chr3R_24429421_24431183 chr3R_24429420_24429421;chr3R_24431183_24431184 chr3R_24429330_24429420;chr3R_24431184_24431283 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6860000000000006e-09 K intron_retention I_chrX_16495232_16495296,mbt chrX + chrX_16506739_16507570 chrX_16506738_16506739;chrX_16507570_16507571 chrX_16506467_16506738;chrX_16507571_16508883 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0094409999999999997 K intron_retention CG4612 chr2R - chr2R_20413175_20413237 chr2R_20413174_20413175;chr2R_20413237_20413238 chr2R_20412297_20413174;chr2R_20413238_20413525 2.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.007659 K intron_retention hopscotch chrX - chrX_11258837_11259065 chrX_11258836_11258837;chrX_11259065_11259066 chrX_11258517_11258836;chrX_11259066_11259272 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012321 K intron_retention CG4822,I_chr2L_120081_120199,I_chr2L_120266_120420,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_120365_120420 chr2L_120364_120365;chr2L_120420_120421 chr2L_120168_120364;chr2L_120421_120430 36.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.02816e-07 K intron_retention Gbeta13F,I_chrX_15754284_15755184,RI_chrX_15754356_15755268,I_chrX_15754356_15755409,RI_chrX_15755345_15755409 chrX + chrX_15755345_15755409 chrX_15755344_15755345;chrX_15755409_15755410 chrX_15755269_15755344;chrX_15755410_15755509 85.71 NA NA NA NA NA 67.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.97 NA NA NA NA NA NA 2.0337548167999997e-14 K intron_retention spin,I_chr2R_12013288_12013847 chr2R + chr2R_12020141_12020333 chr2R_12020140_12020141;chr2R_12020333_12020334 chr2R_12020064_12020140;chr2R_12020334_12020372 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 0.035453999999999999 K intron_retention CG9776 chr3R - chr3R_153740_153858 chr3R_153739_153740;chr3R_153858_153859 chr3R_153532_153739;chr3R_153859_154129 10.87 NA NA 58.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001408 K intron_retention CG3635 chr2L + chr2L_22183467_22183599 chr2L_22183466_22183467;chr2L_22183599_22183600 chr2L_22183394_22183466;chr2L_22183600_22183915 82.69 NA 68.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA 63.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG10433 chr2R - chr2R_17493866_17493972 chr2R_17493865_17493866;chr2R_17493972_17493973 chr2R_17493797_17493865;chr2R_17493973_17494122 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA 32.79 NA NA NA 32.65 33.33 NA NA NA 31.67 NA NA NA 27.27 NA NA NA NA 8.3833778934360012e-19 K intron_retention CG12004 chr3L + chr3L_1573621_1573679 chr3L_1573620_1573621;chr3L_1573679_1573680 chr3L_1573546_1573620;chr3L_1573680_1573764 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K intron_retention Pabp2,I_chr2R_4020297_4020426 chr2R + chr2R_4020581_4020645 chr2R_4020580_4020581;chr2R_4020645_4020646 chr2R_4020447_4020580;chr2R_4020646_4020713 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030086000000000002 K intron_retention CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8994691_8995128 chrX_8994690_8994691;chrX_8995128_8995129 chrX_8994546_8994690;chrX_8995129_8995452 39.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 0.0067619999999999998 K intron_retention CG12206,I_chrX_3367405_3367523 chrX - chrX_3360369_3360431 chrX_3360368_3360369;chrX_3360431_3360432 chrX_3360303_3360368;chrX_3360432_3360665 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030873999999999999 K intron_retention CG5594,CG2812 chr2R + chr2R_19810380_19810444 chr2R_19810379_19810380;chr2R_19810444_19810445 chr2R_19810164_19810379;chr2R_19810445_19810552 0.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023713000000000001 K intron_retention RpS16,RI_chr2R_18493796_18494013,I_chr2R_18494146_18494441 chr2R + chr2R_18493675_18493751 chr2R_18493674_18493675;chr2R_18493751_18493752 chr2R_18493560_18493674;chr2R_18493752_18493793 26.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.71 NA NA NA NA 11.84 0.0 K intron_retention pcm chrX - chrX_19381746_19381824 chrX_19381745_19381746;chrX_19381824_19381825 chrX_19381165_19381745;chrX_19381825_19382718 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5000000000000002e-05 K intron_retention E(bx),I_chr3L_240127_240176,I_chr3L_246324_246699 chr3L - chr3L_240111_240176 chr3L_240110_240111;chr3L_240176_240177 chr3L_240027_240110;chr3L_240177_240276 80.00 NA NA NA NA NA 61.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention rdgB,noncoding_23582 chrX + chrX_13668012_13668718 chrX_13668011_13668012;chrX_13668718_13668719 chrX_13667839_13668011;chrX_13668719_13668873 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.83 NA NA NA NA 5.5824174802593756e-13 K intron_retention CG13124,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908142_9908424,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9907784_9908424 chr2L_9907783_9907784;chr2L_9908424_9908425 chr2L_9907756_9907783;chr2L_9908425_9908505 23.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA 0.015914000000000001 K intron_retention mys,I_chrX_7958795_7961094 chrX + chrX_7958795_7961094 chrX_7958794_7958795;chrX_7961094_7961095 chrX_7958695_7958794;chrX_7961095_7961194 35.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1654401156000002e-08 K intron_retention Apc chr3R - chr3R_24666548_24670281 chr3R_24666547_24666548;chr3R_24670281_24670282 chr3R_24662621_24666547;chr3R_24670282_24670491 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035239999999999998 K intron_retention CG4872,Rcp chrX + chrX_16776552_16776642 chrX_16776551_16776552;chrX_16776642_16776643 chrX_16776542_16776551;chrX_16776643_16776831 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA 0.0021069999999999999 K intron_retention CG10083 chr3L - chr3L_13478641_13478702 chr3L_13478640_13478641;chr3L_13478702_13478703 chr3L_13478189_13478640;chr3L_13478703_13479401 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01281 K intron_retention gish,RI_chr3R_12118557_12122383 chr3R + chr3R_12121543_12122383 chr3R_12121542_12121543;chr3R_12122383_12122384 chr3R_12121448_12121542;chr3R_12122384_12122483 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0022790000000000002 K intron_retention CG14442,I_chrX_6586147_6586435 chrX - chrX_6586898_6587143 chrX_6586897_6586898;chrX_6587143_6587144 chrX_6586436_6586897;chrX_6587144_6589034 80.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.45 NA NA 56.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG14253,E_chr3R_22806425_22807258 chr3R + chr3R_22806425_22807254 chr3R_22806424_22806425;chr3R_22807254_22807255 chr3R_22806325_22806424;chr3R_22807255_22807473 40.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.12 NA NA NA NA NA 0.010822999999999999 K intron_retention CG8929 chr2R + chr2R_16214899_16215371 chr2R_16214898_16214899;chr2R_16215371_16215372 chr2R_16214792_16214898;chr2R_16215372_16215639 50.00 NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3016879999999999e-11 K intron_retention eIF4G,I_chr4_948813_950447 chr4 - chr4_950650_950705 chr4_950649_950650;chr4_950705_950706 chr4_950448_950649;chr4_950706_950727 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023955000000000001 K intron_retention Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3355332_3356614 chr2R_3355331_3355332;chr2R_3356614_3356615 chr2R_3355296_3355331;chr2R_3356615_3356666 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA 26.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG6805 chr2R + chr2R_12894564_12894637 chr2R_12894563_12894564;chr2R_12894637_12894638 chr2R_12894294_12894563;chr2R_12894638_12895109 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA 64.56 56.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention syd,I_chr3L_7924891_7925400 chr3L - chr3L_7920921_7921016 chr3L_7920920_7920921;chr3L_7921016_7921017 chr3L_7920860_7920920;chr3L_7921017_7921217 46.15 NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 5.603897e-06 N intron_retention CG42394,noncoding_15936,E_chr3R_6675742_6676058 chr3R + chr3R_6677211_6677262 chr3R_6677210_6677211;chr3R_6677262_6677263 chr3R_6677007_6677210;chr3R_6677263_6677270 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG10171 chr3L - chr3L_13379639_13379700 chr3L_13379638_13379639;chr3L_13379700_13379701 chr3L_13379048_13379638;chr3L_13379701_13380698 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018578000000000001 K intron_retention CG4896,REI_chr2L_1179197_1179859,I_chr2L_1191535_1191648 chr2L + chr2L_1180124_1180212 chr2L_1180123_1180124;chr2L_1180212_1180213 chr2L_1179997_1180123;chr2L_1180213_1180449 36.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023834999999999999 K intron_retention I_chrX_1962457_1964222,CG4045 chrX - chrX_1969173_1969239 chrX_1969172_1969173;chrX_1969239_1969240 chrX_1969071_1969172;chrX_1969240_1969651 4.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012459999999999999 K intron_retention CG1021,RI_chr3R_2217711_2231463,I_chr3R_2218682_2231463,I_chr3R_2219634_2231390,I_chr3R_2231383_2231463 chr3R - chr3R_2215847_2215923 chr3R_2215846_2215847;chr3R_2215923_2215924 chr3R_2215733_2215846;chr3R_2215924_2216016 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5000000000000003e-05 K intron_retention CG1667,RI_chr2R_5731409_5731653,I_chr2R_5732410_5732504 chr2R + chr2R_5732410_5732494 chr2R_5732409_5732410;chr2R_5732494_5732495 chr2R_5732341_5732409;chr2R_5732495_5732561 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000379 K intron_retention CG9705,I_chr3L_16773492_16773604,I_chr3L_16773517_16773604,I_chr3L_16774043_16774562 chr3L + chr3L_16773521_16773604 chr3L_16773520_16773521;chr3L_16773604_16773605 chr3L_16773212_16773520;chr3L_16773605_16773704 30.00 NA NA NA NA NA 12.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Abl,I_chr3L_16622304_16639909,RI_chr3L_16652567_16654512 chr3L - chr3L_16616389_16616736 chr3L_16616388_16616389;chr3L_16616736_16616737 chr3L_16615447_16616388;chr3L_16616737_16618374 57.75 NA NA 89.02 42.50 40.74 NA 76.47 NA NA 39.56 NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA 32.44 NA NA 72.22 75.86 NA NA NA NA NA NA 19.62 NA NA 84.91 NA NA NA NA NA NA NA 75.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Sec16,I_chrX_12501913_12502010,I_chrX_12502899_12502973 chrX + chrX_12502899_12502967 chrX_12502898_12502899;chrX_12502967_12502968 chrX_12502799_12502898;chrX_12502968_12503669 13.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.044590999999999999 K intron_retention Dsp1,I_chrX_16231287_16231413 chrX + chrX_16228273_16228333 chrX_16228272_16228273;chrX_16228333_16228334 chrX_16228086_16228272;chrX_16228334_16228446 85.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.33 NA 53.85 NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA 62.96 NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.3330690358445302e-14 K intron_retention TM9SF4,I_chr2L_13774105_13774160 chr2L + chr2L_13773323_13773382 chr2L_13773322_13773323;chr2L_13773382_13773383 chr2L_13773184_13773322;chr2L_13773383_13773888 2.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0067279999999999996 K intron_retention noncoding_4282 chr2L + chr2L_22131448_22131502 chr2L_22131447_22131448;chr2L_22131502_22131503 chr2L_22131354_22131447;chr2L_22131503_22131699 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 0.049378999999999999 K intron_retention tho2 chr2L - chr2L_2138159_2139629 chr2L_2138158_2138159;chr2L_2139629_2139630 chr2L_2137984_2138158;chr2L_2139630_2139673 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0525014000000003e-05 K intron_retention CG12054 chr3R + chr3R_27052801_27054418 chr3R_27052800_27052801;chr3R_27054418_27054419 chr3R_27052289_27052800;chr3R_27054419_27055127 36.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0087349999999999997 K intron_retention CG6608,I_chr3R_6706829_6707624 chr3R - chr3R_6707526_6707624 chr3R_6707525_6707526;chr3R_6707624_6707625 chr3R_6707285_6707525;chr3R_6707625_6707724 59.38 43.59 NA NA NA NA 82.61 NA NA 44.83 NA NA NA 78.26 NA 73.33 NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA 74.29 NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA 74.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 0.0 K intron_retention CG32809,RI_chrX_1585391_1586471,a6,I_chrX_1589508_1589564 chrX - chrX_1589508_1589572 chrX_1589507_1589508;chrX_1589572_1589573 chrX_1589408_1589507;chrX_1589573_1589664 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015198 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1526333 chr3L_1525392_1525393;chr3L_1526333_1526334 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1526334_1526398 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K intron_retention Eaf,RI_chr2R_3294566_3294636,I_chr2R_3294566_3294656,RI_chr2R_3294566_3294714,I_chr2R_3294566_3295255,I_chr2R_3294591_3295244 chr2R - chr2R_3294566_3294642 chr2R_3294565_3294566;chr2R_3294642_3294643 chr2R_3294491_3294565;chr2R_3294643_3294736 58.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 7.4524015999999997e-05 K intron_retention roq,CG4753 chr3L - chr3L_16367300_16367507 chr3L_16367299_16367300;chr3L_16367507_16367508 chr3L_16366649_16367299;chr3L_16367508_16367764 95.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA 64.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4075703125e-08 K intron_retention Rnp4F,I_chrX_5214525_5214591 chrX - chrX_5215771_5215851 chrX_5215770_5215771;chrX_5215851_5215852 chrX_5215595_5215770;chrX_5215852_5216360 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040107999999999998 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659,Ir62a chr3L - chr3L_1528077_1531390 chr3L_1528076_1528077;chr3L_1531390_1531391 chr3L_1528061_1528076;chr3L_1531391_1531522 73.87 NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041120000000000002 K intron_retention Taf6 chr3L + chr3L_19594248_19594309 chr3L_19594247_19594248;chr3L_19594309_19594310 chr3L_19594013_19594247;chr3L_19594310_19594484 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5889999999999999e-08 K intron_retention MB8.chr3R.pasa.66,ref1,RI_chr3R_2904130_2904237,I_chr3R_2904452_2904543 chr3R - chr3R_2905178_2905685 chr3R_2905177_2905178;chr3R_2905685_2905686 chr3R_2904976_2905177;chr3R_2905686_2906095 33.15 NA NA 15.08 NA 18.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Lis-1 chr2R + chr2R_12070624_12070690 chr2R_12070623_12070624;chr2R_12070690_12070691 chr2R_12070488_12070623;chr2R_12070691_12071042 3.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.2000000000000001e-05 K intron_retention I_chr3R_6694098_6694160,Fdh chr3R - chr3R_6697908_6697976 chr3R_6697907_6697908;chr3R_6697976_6697977 chr3R_6697818_6697907;chr3R_6697977_6698058 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention aPKC,I_chr2R_10833552_10833654,RI_chr2R_10849347_10850391 chr2R - chr2R_10833596_10833654 chr2R_10833595_10833596;chr2R_10833654_10833655 chr2R_10833560_10833595;chr2R_10833655_10833754 28.57 NA NA 7.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.43 NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA 7.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2301576741519657e-12 K intron_retention CG6912 chr3R - chr3R_10962499_10962563 chr3R_10962498_10962499;chr3R_10962563_10962564 chr3R_10962433_10962498;chr3R_10962564_10962631 52.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 0.020781999999999998 K intron_retention Rpb7,RI_chr3R_11050688_11050804,I_chr3R_11054902_11054955 chr3R - chr3R_11048173_11048229 chr3R_11048172_11048173;chr3R_11048229_11048230 chr3R_11047945_11048172;chr3R_11048230_11048367 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014560999999999999 K intron_retention Rala chrX - chrX_3601525_3602776 chrX_3601524_3601525;chrX_3602776_3602777 chrX_3601401_3601524;chrX_3602777_3602951 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029419000000000001 N intron_retention CG17018,R_chr2L_22312023_22363414,CEI_chr2L_22325847_22356902 chr2L + chr2L_22354723_22354811 chr2L_22354722_22354723;chr2L_22354811_22354812 chr2L_22354466_22354722;chr2L_22354812_22354828 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0014729999999999999 K intron_retention CG9331,I_chr2L_20824494_20826632,I_chr2L_20825513_20825658 chr2L + chr2L_20825513_20825667 chr2L_20825512_20825513;chr2L_20825667_20825668 chr2L_20825471_20825512;chr2L_20825668_20825758 82.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention I_chrX_10148341_10149525,CG34319,noncoding_22888,I_chrX_10152994_10153223 chrX - chrX_10149206_10149525 chrX_10149205_10149206;chrX_10149525_10149526 chrX_10148718_10149205;chrX_10149526_10149619 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00041932531200000001 K intron_retention CG3770,CG12851,F_chr2R_20839778_20839843 chr2R + chr2R_20833856_20833905 chr2R_20833855_20833856;chr2R_20833905_20833906 chr2R_20833742_20833855;chr2R_20833906_20834164 1.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000134 K intron_retention CG1646,I_chr3R_24640561_24640869,I_chr3R_24641816_24641874 chr3R + chr3R_24641449_24641521 chr3R_24641448_24641449;chr3R_24641521_24641522 chr3R_24641204_24641448;chr3R_24641522_24641682 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention SWAP,RI_chrX_936466_936762,I_chrX_936466_936835,RI_chrX_936919_937245,RI_chrX_938935_938985,I_chrX_941459_982652 chrX + chrX_936466_937245 chrX_936465_936466;chrX_937245_937246 chrX_936366_936465;chrX_937246_937345 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA 27.78 6.0773832000000005e-05 K intron_retention vari,I_chr2L_20792267_20794059 chr2L - chr2L_20790721_20791166 chr2L_20790720_20790721;chr2L_20791166_20791167 chr2L_20790622_20790720;chr2L_20791167_20791664 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010392 K intron_retention I_chr2L_476332_525391,ush chr2L + chr2L_491359_525391 chr2L_491358_491359;chr2L_525391_525392 chr2L_490856_491358;chr2L_525392_525436 24.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.76 NA NA NA NA NA 0.0095890000000000003 K intron_retention CG6659 chrX - chrX_18550304_18550356 chrX_18550303_18550304;chrX_18550356_18550357 chrX_18548840_18550303;chrX_18550357_18550678 1.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017932 K intron_retention ssp4,I_chr2R_13409412_13410357,RI_chr2R_13409412_13411004,I_chr2R_13409412_13411328,I_chr2R_13409412_13411588,I_chr2R_13414489_13414718,I_chr2R_13414818_13414880,I_chr2R_13418952_13419022 chr2R - chr2R_13408434_13411588 chr2R_13408433_13408434;chr2R_13411588_13411589 chr2R_13408151_13408433;chr2R_13411589_13411688 42.48 NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA 19.05 NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5928385330199665e-11 K intron_retention bic,I_chr2R_8757835_8757907 chr2R + chr2R_8757836_8757907 chr2R_8757835_8757836;chr2R_8757907_8757908 chr2R_8757760_8757835;chr2R_8757908_8758007 0.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Atpalpha,I_chr3R_16792336_16798894,I_chr3R_16792925_16794113 chr3R + chr3R_16792336_16798894 chr3R_16792335_16792336;chr3R_16798894_16798895 chr3R_16792236_16792335;chr3R_16798895_16798994 88.56 NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033738999999999998 K intron_retention CG11753 chr3R + chr3R_4479200_4479267 chr3R_4479199_4479200;chr3R_4479267_4479268 chr3R_4479081_4479199;chr3R_4479268_4479569 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0063049999999999998 K intron_retention Taf4,I_chr3L_16107821_16107893 chr3L + chr3L_16107242_16107411 chr3L_16107241_16107242;chr3L_16107411_16107412 chr3L_16106996_16107241;chr3L_16107412_16107820 10.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014836999999999999 K intron_retention RI_chr3R_5165997_5180143,CG33936,I_chr3R_5167726_5180143,R_chr3R_5168211_5180143,RI_chr3R_5168214_5168297,I_chr3R_5168617_5180143,snoRNA:Me18S-G1358a,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5168214_5168297 chr3R_5168213_5168214;chr3R_5168297_5168298 chr3R_5168114_5168213;chr3R_5168298_5168397 33.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.98 13.21 NA NA NA NA NA NA 19.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.70 14.29 NA NA NA 5.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1138012083566912e-16 K intron_retention CG6845,I_chr3L_148414_148465,I_chr3L_148414_148475,I_chr3L_148414_148489 chr3L + chr3L_147083_147137 chr3L_147082_147083;chr3L_147137_147138 chr3L_146772_147082;chr3L_147138_147398 88.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA 66.67 72.97 NA 55.36 NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.3339343519526605e-18 K intron_retention CG9577,CG9578 chrX + chrX_20061849_20061914 chrX_20061848_20061849;chrX_20061914_20061915 chrX_20061224_20061848;chrX_20061915_20062160 1.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.95 NA NA 17.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00036249454800000002 K intron_retention CEI_chrX_17177009_17196871,CG5445,I_chrX_17196752_17196871,RI_chrX_17196772_17196871,I_chrX_17196820_17196875,I_chrX_17198393_17198730 chrX + chrX_17196820_17196871 chrX_17196819_17196820;chrX_17196871_17196872 chrX_17196720_17196819;chrX_17196872_17196971 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA 17.14 1.6767755729181597e-10 K intron_retention Df31,RE_chr2L_21628206_21629662,I_chr2L_21628206_21629666,I_chr2L_21628210_21628515,I_chr2L_21628210_21628944,I_chr2L_21628210_21629216,EI_chr2L_21628210_21629715,REI_chr2L_21628210_21629884,I_chr2L_21628224_21629666,I_chr2L_21628734_21629666 chr2L - chr2L_21628210_21629884 chr2L_21628209_21628210;chr2L_21629884_21629885 chr2L_21628124_21628209;chr2L_21629885_21629918 97.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0079030000000000003 K intron_retention I_chr3R_16141663_16144698,CG5077,I_chr3R_16147605_16147670 chr3R + chr3R_16147136_16147197 chr3R_16147135_16147136;chr3R_16147197_16147198 chr3R_16146921_16147135;chr3R_16147198_16147358 56.50 NA NA 39.13 NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA 38.89 NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Prosalpha5,RI_chr2R_13310877_13311160 chr2R + chr2R_13300349_13300409 chr2R_13300348_13300349;chr2R_13300409_13300410 chr2R_13300293_13300348;chr2R_13300410_13300548 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0063489999999999996 K intron_retention CG1233 chr3L + chr3L_361700_361752 chr3L_361699_361700;chr3L_361752_361753 chr3L_361518_361699;chr3L_361753_362341 52.63 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA 25.81 NA NA 35.00 NA NA 0.0 K intron_retention ssh,I_chr3R_20769244_20770111 chr3R - chr3R_20765527_20765594 chr3R_20765526_20765527;chr3R_20765594_20765595 chr3R_20765155_20765526;chr3R_20765595_20767503 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 60.71 NA NA NA NA NA NA 67.31 NA NA NA NA 64.52 NA NA 63.64 NA NA NA NA 65.71 NA NA NA NA 62.96 9.7177821996527988e-32 K intron_retention VhaPPA1-1,I_chr3R_10728645_10728933 chr3R - chr3R_10729614_10729672 chr3R_10729613_10729614;chr3R_10729672_10729673 chr3R_10729545_10729613;chr3R_10729673_10729699 0.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention klar,I_chr3L_462559_472609,RI_chr3L_517594_539898 chr3L - chr3L_451328_452837 chr3L_451327_451328;chr3L_452837_452838 chr3L_451127_451327;chr3L_452838_453488 79.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.5239500000000003e-07 K intron_retention Dif,dorsal,RI_chr2L_17438018_17439189,I_chr2L_17442335_17442399,FI_chr2L_17449369_17450215,noncoding_3500,RI_chr2L_17450002_17450219 chr2L - chr2L_17439298_17441800 chr2L_17439297_17439298;chr2L_17441800_17441801 chr2L_17439190_17439297;chr2L_17441801_17441879 22.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.59 NA NA 12.10 NA NA 0.0 K intron_retention CG14438 chrX + chrX_6654380_6654446 chrX_6654379_6654380;chrX_6654446_6654447 chrX_6654310_6654379;chrX_6654447_6656144 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015198 K intron_retention CG16971,CG33229,I_chr3L_225856_225909,RI_chr3L_225919_226004,I_chr3L_229245_230186 chr3L + chr3L_224184_224972 chr3L_224183_224184;chr3L_224972_224973 chr3L_224174_224183;chr3L_224973_225140 11.83 NA NA 64.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention fdl,RI_chr2R_8394261_8394315 chr2R - chr2R_8377960_8378027 chr2R_8377959_8377960;chr2R_8378027_8378028 chr2R_8377451_8377959;chr2R_8378028_8378210 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010045 K intron_retention CG8552,I_chr2L_8140779_8156516 chr2L - chr2L_8134513_8134577 chr2L_8134512_8134513;chr2L_8134577_8134578 chr2L_8134264_8134512;chr2L_8134578_8134773 98.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031799000000000001 K intron_retention mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179 chr3L + chr3L_21914088_21914141 chr3L_21914087_21914088;chr3L_21914141_21914142 chr3L_21914067_21914087;chr3L_21914142_21914427 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA 55.00 NA NA 63.16 NA 65.38 NA NA 59.26 NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 7.829839673356677e-19 K intron_retention chic,RI_chr2L_5976783_5980950,I_chr2L_5979705_5979818,I_chr2L_5979705_5979941,RI_chr2L_5979705_5979951,I_chr2L_5979705_5979953,I_chr2L_5979705_5980025,I_chr2L_5979705_5980213,I_chr2L_5979705_5980370,I_chr2L_5979705_5980558,I_chr2L_5979705_5980632,I_chr2L_5979705_5980639,RI_chr2L_5979705_5980734 chr2L - chr2L_5979705_5979818 chr2L_5979704_5979705;chr2L_5979818_5979819 chr2L_5979605_5979704;chr2L_5979819_5979887 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046205000000000003 K intron_retention Ect4,I_chr3L_8075556_8086158,C_chr3L_8091754_8101552,I_chr3L_8091826_8092243,I_chr3L_8098397_8101385,I_chr3L_8098758_8101738,I_chr3L_8100030_8101385 chr3L + chr3L_8098397_8098539 chr3L_8098396_8098397;chr3L_8098539_8098540 chr3L_8098297_8098396;chr3L_8098540_8098757 24.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG15237 chr2R - chr2R_2696862_2696928 chr2R_2696861_2696862;chr2R_2696928_2696929 chr2R_2696480_2696861;chr2R_2696929_2697016 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K intron_retention CG14782,noncoding_21360 chrX + chrX_1374893_1375040 chrX_1374892_1374893;chrX_1375040_1375041 chrX_1374745_1374892;chrX_1375041_1375343 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.19 0.0 K intron_retention Mob2,RI_chr3L_11520443_11527440,CE_chr3L_11520917_11527526,RE_chr3L_11520925_11527489,RI_chr3L_11535932_11545929 chr3L - chr3L_11520917_11527440 chr3L_11520916_11520917;chr3L_11527440_11527441 chr3L_11520825_11520916;chr3L_11527441_11527462 71.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1798176000000003e-05 K intron_retention CG4699 chr3R + chr3R_11624190_11624445 chr3R_11624189_11624190;chr3R_11624445_11624446 chr3R_11623809_11624189;chr3R_11624446_11624758 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 52.38 40.91 NA NA 55.17 NA NA NA NA NA 50.00 NA 63.16 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.3169749486314635e-23 K intron_retention MED31,CG18271,I_chr3R_468381_468483,CE_chr3R_468381_468504 chr3R + chr3R_467731_468005 chr3R_467730_467731;chr3R_468005_468006 chr3R_467702_467730;chr3R_468006_468133 41.78 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.87 25.76 NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA 16.67 25.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention ps,I_chr3R_5243723_5265067,I_chr3R_5243723_5270765,I_chr3R_5245770_5265067,I_chr3R_5245770_5269732,I_chr3R_5258562_5264836,I_chr3R_5262841_5265067,RI_chr3R_5262841_5266402,I_chr3R_5265428_5266402,I_chr3R_5265428_5269732,I_chr3R_5265428_5270765,CG16777,I_chr3R_5269733_5270765 chr3R + chr3R_5262841_5269732 chr3R_5262840_5262841;chr3R_5269732_5269733 chr3R_5262741_5262840;chr3R_5269733_5269798 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0027439999999999999 K intron_retention Gga chrX + chrX_9495210_9495286 chrX_9495209_9495210;chrX_9495286_9495287 chrX_9495093_9495209;chrX_9495287_9495402 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011205 K intron_retention Vha16,I_chr2R_2519645_2520499,RI_chr2R_2519646_2519840,I_chr2R_2519646_2520292,I_chr2R_2519646_2520298,I_chr2R_2519775_2520499 chr2R - chr2R_2519646_2519810 chr2R_2519645_2519646;chr2R_2519810_2519811 chr2R_2519546_2519645;chr2R_2519811_2519868 53.98 NA NA NA NA NA 82.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.82 73.68 NA 40.54 NA NA NA NA NA NA NA 78.43 34.85 42.57 37.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Aldh-III,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3357578_3357898 chr2R_3357577_3357578;chr2R_3357898_3357899 chr2R_3357478_3357577;chr2R_3357899_3358120 1.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034527000000000002 K intron_retention Srp14 chr3R + chr3R_16406044_16406111 chr3R_16406043_16406044;chr3R_16406111_16406112 chr3R_16405971_16406043;chr3R_16406112_16406212 1.11 NA NA NA NA NA 12.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00031161760799999999 K intron_retention l(3)neo26,Cat chr3L + chr3L_18814350_18814406 chr3L_18814349_18814350;chr3L_18814406_18814407 chr3L_18814295_18814349;chr3L_18814407_18815454 14.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0050210000000000003 K intron_retention CG42348,I_chr3L_20149990_20151579 chr3L - chr3L_20144991_20146263 chr3L_20144990_20144991;chr3L_20146263_20146264 chr3L_20144003_20144990;chr3L_20146264_20146435 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.61 NA NA NA NA NA 0.00084753652400000005 K intron_retention I_chr2R_2754447_2755071,Spn4,CG9454 chr2R - chr2R_2764032_2764100 chr2R_2764031_2764032;chr2R_2764100_2764101 chr2R_2763778_2764031;chr2R_2764101_2764238 53.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA 65.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16330538_16330620 chrX_16330537_16330538;chrX_16330620_16330621 chrX_16329178_16330537;chrX_16330621_16330698 43.87 NA NA NA NA NA NA NA NA 30.65 NA NA NA NA NA NA 56.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.41 NA NA NA 32.43 NA NA NA NA NA 27.85 NA NA NA NA 18.42 0.0 K intron_retention E2f,CG6353 chr3R - chr3R_17452347_17452413 chr3R_17452346_17452347;chr3R_17452413_17452414 chr3R_17451746_17452346;chr3R_17452414_17452572 78.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.00 NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention Rip11,E_chrX_18532733_18533695,RI_chrX_18530353_18530870,RI_chrX_18530742_18530870,RI_chrX_18544139_18544185 chrX - chrX_18530338_18530646 chrX_18530337_18530338;chrX_18530646_18530647 chrX_18530253_18530337;chrX_18530647_18530741 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K intron_retention Hsc70-3,I_chrX_11699076_11699138,I_chrX_11699076_11699158,I_chrX_11699076_11699260,EI_chrX_11699076_11699573,I_chrX_11699076_11700062 chrX - chrX_11699076_11699321 chrX_11699075_11699076;chrX_11699321_11699322 chrX_11698976_11699075;chrX_11699322_11699360 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043728000000000003 K intron_retention Gs1l,I_chr2L_4456517_4456723 chr2L - chr2L_4455739_4455856 chr2L_4455738_4455739;chr2L_4455856_4455857 chr2L_4455221_4455738;chr2L_4455857_4455924 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.019132 K intron_retention CG34413,I_chr2R_20771136_20772048,I_chr2R_20772104_20773774,RI_chr2R_20772104_20774745,C_chr2R_20772691_20773500,I_chr2R_20773500_20774745 chr2R + chr2R_20771258_20774745 chr2R_20771257_20771258;chr2R_20774745_20774746 chr2R_20771197_20771257;chr2R_20774746_20774845 40.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.21 NA 26.09 NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 0.0 K intron_retention CG31855 chr2L + chr2L_13369324_13369385 chr2L_13369323_13369324;chr2L_13369385_13369386 chr2L_13369210_13369323;chr2L_13369386_13370334 17.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0065189999999999996 K intron_retention Rpb11,I_chr2L_17410178_17410250,I_chr2L_17410178_17410317 chr2L - chr2L_17410031_17410087 chr2L_17410030_17410031;chr2L_17410087_17410088 chr2L_17409856_17410030;chr2L_17410088_17410177 2.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023713000000000001 K intron_retention Sdc,RI_chr2R_17286086_17286391,I_chr2R_17286089_17286391,I_chr2R_17286819_17367595,I_chr2R_17324594_17367595 chr2R - chr2R_17286089_17286679 chr2R_17286088_17286089;chr2R_17286679_17286680 chr2R_17286037_17286088;chr2R_17286680_17286818 10.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035018000000000001 K intron_retention MSBP,I_chrX_15783766_15784027,RI_chrX_15783766_15784064,I_chrX_15783766_15785978 chrX - chrX_15783998_15784064 chrX_15783997_15783998;chrX_15784064_15784065 chrX_15783942_15783997;chrX_15784065_15784071 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.44 NA NA 0.0 N intron_retention 4EHP,RI_chr3R_19927769_19928262,Syx1A chr3R - chr3R_19927769_19929293 chr3R_19927768_19927769;chr3R_19929293_19929294 chr3R_19927676_19927768;chr3R_19929294_19930269 40.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.34 NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.6240000000000004e-15 N intron_retention CG1622,REI_chrX_13191277_13191339,I_chrX_13191916_13192167,I_chrX_13192409_13192738,EI_chrX_13192857_13192928 chrX + chrX_13191916_13192806 chrX_13191915_13191916;chrX_13192806_13192807 chrX_13191816_13191915;chrX_13192807_13192838 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00013899999999999999 K intron_retention AGO2 chr3L + chr3L_15551439_15551493 chr3L_15551438_15551439;chr3L_15551493_15551494 chr3L_15551350_15551438;chr3L_15551494_15552103 1.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002784 N intron_retention RhoGAP18B,I_chrX_19040176_19040738 chrX - chrX_19040176_19047060 chrX_19040175_19040176;chrX_19047060_19047061 chrX_19040076_19040175;chrX_19047061_19047301 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048627999999999998 K intron_retention pan chr4 + chr4_128999_129052 chr4_128998_128999;chr4_129052_129053 chr4_128029_128998;chr4_129053_129408 93.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013867000000000001 K intron_retention I_chr3L_18664773_18665233,GNBP2,I_chr3L_18667579_18667644 chr3L - chr3L_18668376_18668437 chr3L_18668375_18668376;chr3L_18668437_18668438 chr3L_18668319_18668375;chr3L_18668438_18668454 89.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044075999999999997 K intron_retention Nedd4,I_chr3L_17536713_17536777,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17536713_17536863 chr3L_17536712_17536713;chr3L_17536863_17536864 chr3L_17536613_17536712;chr3L_17536864_17536877 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CRMP,I_chr3R_1401648_1403314 chr3R + chr3R_1401648_1401896 chr3R_1401647_1401648;chr3R_1401896_1401897 chr3R_1401548_1401647;chr3R_1401897_1402048 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046389 K intron_retention mRpL27,CG15443 chr2L - chr2L_4459208_4459265 chr2L_4459207_4459208;chr2L_4459265_4459266 chr2L_4458662_4459207;chr2L_4459266_4459429 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022186000000000001 K intron_retention RpL15 chr3LHet + chr3LHet_2397992_2398049 chr3LHet_2397991_2397992;chr3LHet_2398049_2398050 chr3LHet_2397802_2397991;chr3LHet_2398050_2398052 50.00 NA NA NA NA NA 22.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA 29.41 21.33 NA NA NA 30.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.86 0.0 K intron_retention AGO2,RE_chr3L_15547553_15549949 chr3L + chr3L_15547323_15547389 chr3L_15547322_15547323;chr3L_15547389_15547390 chr3L_15547275_15547322;chr3L_15547390_15547572 6.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0038089999999999999 K intron_retention CG4829,I_chrX_16717240_16717547 chrX + chrX_16717240_16717889 chrX_16717239_16717240;chrX_16717889_16717890 chrX_16717140_16717239;chrX_16717890_16718151 97.36 NA NA NA 66.09 59.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.4e-10 K intron_retention CG7945,RI_chr3L_15515681_15516932,RI_chr3L_15516824_15516932 chr3L - chr3L_15515603_15515659 chr3L_15515602_15515603;chr3L_15515659_15515660 chr3L_15515581_15515602;chr3L_15515660_15515680 1.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025085 K intron_retention CG30020,I_chr2R_6778098_6778140 chr2R + chr2R_6778765_6778912 chr2R_6778764_6778765;chr2R_6778912_6778913 chr2R_6778492_6778764;chr2R_6778913_6779822 63.64 NA NA 80.00 NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.57 43.18 NA 47.37 26.98 NA NA NA NA NA NA 41.89 NA NA NA NA 26.83 40.00 NA 27.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.49 0.0 K intron_retention CG11779,CG5835,I_chr3R_14982264_14982380,I_chr3R_14982295_14982380 chr3R - chr3R_14982125_14982187 chr3R_14982124_14982125;chr3R_14982187_14982188 chr3R_14981587_14982124;chr3R_14982188_14982263 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.37 NA NA NA 30.30 28.57 NA NA NA NA NA NA 33.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA 33.33 NA NA 28.57 27.06 0.0 K intron_retention Bem46,RI_chr2L_2995071_2997790 chr2L + chr2L_2988384_2988436 chr2L_2988383_2988384;chr2L_2988436_2988437 chr2L_2988129_2988383;chr2L_2988437_2988678 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018186000000000001 K intron_retention Eip63E,I_chr3L_3607397_3607501 chr3L + chr3L_3515935_3516528 chr3L_3515934_3515935;chr3L_3516528_3516529 chr3L_3515784_3515934;chr3L_3516529_3516828 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9100000000000003e-10 K intron_retention CG18749,noncoding_15296,CG33722 chr3R + chr3R_4069864_4069918 chr3R_4069863_4069864;chr3R_4069918_4069919 chr3R_4069831_4069863;chr3R_4069919_4071416 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000163 K intron_retention ttv,I_chr2R_10450891_10470424 chr2R + chr2R_10470529_10470600 chr2R_10470528_10470529;chr2R_10470600_10470601 chr2R_10470425_10470528;chr2R_10470601_10470751 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032236000000000001 K intron_retention Trf4-1,I_chrX_8459198_8459266 chrX + chrX_8457581_8457692 chrX_8457580_8457581;chrX_8457692_8457693 chrX_8457186_8457580;chrX_8457693_8458408 78.95 NA NA NA NA 58.54 NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8000000000000002e-11 K intron_retention I_chr2R_4783150_4783708,Ggamma1,noncoding_5300 chr2R + chr2R_4789028_4789641 chr2R_4789027_4789028;chr2R_4789641_4789642 chr2R_4789007_4789027;chr2R_4789642_4789782 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00026400000000000002 K intron_retention RI_chr2R_2760771_2763486,noncoding_4737 chr2R + chr2R_2763703_2763777 chr2R_2763702_2763703;chr2R_2763777_2763778 chr2R_2763667_2763702;chr2R_2763778_2763876 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00050799999999999999 K intron_retention CG14778,pck,CG14780 chrX + chrX_1365382_1365440 chrX_1365381_1365382;chrX_1365440_1365441 chrX_1365173_1365381;chrX_1365441_1365636 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0099059999999999999 K intron_retention CG17912,I_chr2L_16748617_16749055,I_chr2L_16749189_16749266 chr2L + chr2L_16746617_16749055 chr2L_16746616_16746617;chr2L_16749055_16749056 chr2L_16746227_16746616;chr2L_16749056_16749155 55.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.7349913006880003e-06 K intron_retention Taf12,RI_chr3R_7504595_7505288,I_chr3R_7504949_7505288 chr3R - chr3R_7504907_7505075 chr3R_7504906_7504907;chr3R_7505075_7505076 chr3R_7504849_7504906;chr3R_7505076_7505120 92.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.98 5.1999999999999997e-05 K intron_retention BRWD3 chr3R + chr3R_20149344_20149400 chr3R_20149343_20149344;chr3R_20149400_20149401 chr3R_20148119_20149343;chr3R_20149401_20150125 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039516999999999997 K intron_retention CG7971,I_chr3L_1659363_1659845,I_chr3L_1667736_1667806 chr3L - chr3L_1655152_1655253 chr3L_1655151_1655152;chr3L_1655253_1655254 chr3L_1654844_1655151;chr3L_1655254_1655460 5.65 NA NA NA NA NA 59.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention ChLD3 chr2L + chr2L_16741889_16741946 chr2L_16741888_16741889;chr2L_16741946_16741947 chr2L_16741366_16741888;chr2L_16741947_16742616 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0057549999999999997 K intron_retention RpL12,I_chr2R_19948517_19948682 chr2R + chr2R_19947973_19948035 chr2R_19947972_19947973;chr2R_19948035_19948036 chr2R_19947923_19947972;chr2R_19948036_19948097 20.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K intron_retention noncoding_4330 chr2L - chr2L_22736131_22736195 chr2L_22736130_22736131;chr2L_22736195_22736196 chr2L_22735486_22736130;chr2L_22736196_22736254 32.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4743400000000004e-06 K intron_retention Mes2,CEF_chr3L_22939285_22939369 chr3L + chr3L_22939285_22939369 chr3L_22939284_22939285;chr3L_22939369_22939370 chr3L_22939218_22939284;chr3L_22939370_22939469 60.00 NA NA 42.25 NA 47.50 48.65 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA 35.00 NA 75.93 NA NA 45.45 NA NA NA NA NA 74.07 76.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 76.60 NA NA 80.49 NA NA NA NA NA 73.33 NA 76.00 0.0 K intron_retention CG8468 chr2R + chr2R_10107548_10108112 chr2R_10107547_10107548;chr2R_10108112_10108113 chr2R_10107405_10107547;chr2R_10108113_10108270 21.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG6199 chr3L - chr3L_11198970_11199055 chr3L_11198969_11198970;chr3L_11199055_11199056 chr3L_11198834_11198969;chr3L_11199056_11199135 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029437000000000001 K intron_retention CG8031 chr3R - chr3R_8834869_8834925 chr3R_8834868_8834869;chr3R_8834925_8834926 chr3R_8834219_8834868;chr3R_8834926_8835037 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012 K intron_retention Bj1 chr3L - chr3L_5925565_5925624 chr3L_5925564_5925565;chr3L_5925624_5925625 chr3L_5925506_5925564;chr3L_5925625_5925725 82.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001021 K intron_retention Sodh-2 chr3R + chr3R_6703546_6703603 chr3R_6703545_6703546;chr3R_6703603_6703604 chr3R_6703424_6703545;chr3R_6703604_6703988 75.00 42.86 NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.12 NA NA NA 52.00 NA 0.0 N intron_retention CG3635 chr2L + chr2L_22182055_22182737 chr2L_22182054_22182055;chr2L_22182737_22182738 chr2L_22181845_22182054;chr2L_22182738_22183329 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.16 9.2869324306000003e-08 K intron_retention dpr17 chr3R + chr3R_7936756_7936825 chr3R_7936755_7936756;chr3R_7936825_7936826 chr3R_7936554_7936755;chr3R_7936826_7937080 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00057139227599999998 K intron_retention Mmp1,E_chr2R_20560380_20562585,I_chr2R_20564123_20565214,I_chr2R_20569965_20572193 chr2R - chr2R_20559830_20562585 chr2R_20559829_20559830;chr2R_20562585_20562586 chr2R_20559732_20559829;chr2R_20562586_20562664 91.80 NA NA NA NA NA NA NA NA 67.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Myo31DF,I_chr2L_10506249_10506683,I_chr2L_10506446_10506542 chr2L - chr2L_10506107_10506542 chr2L_10506106_10506107;chr2L_10506542_10506543 chr2L_10505926_10506106;chr2L_10506543_10506598 64.50 NA NA NA NA NA NA 40.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017597999999999999 K intron_retention CG40127,I_chr2R_75348_75450 chr2R - chr2R_75198_75264 chr2R_75197_75198;chr2R_75264_75265 chr2R_74940_75197;chr2R_75265_75347 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG16940,I_chr3L_212783_212843,Kaz1-ORFA_Kaz1-ORFB chr3L + chr3L_215625_215682 chr3L_215624_215625;chr3L_215682_215683 chr3L_215505_215624;chr3L_215683_215751 17.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041359999999999999 K intron_retention Fis1,I_chr2R_1491917_1492087,I_chr2R_1492154_1492214 chr2R - chr2R_1492156_1492214 chr2R_1492155_1492156;chr2R_1492214_1492215 chr2R_1492094_1492155;chr2R_1492215_1492311 16.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention tho2 chr2L - chr2L_2137927_2137983 chr2L_2137926_2137927;chr2L_2137983_2137984 chr2L_2137883_2137926;chr2L_2137984_2138155 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001562 K intron_retention CG16838,I_chr3L_16125390_16125510 chr3L + chr3L_16125390_16125639 chr3L_16125389_16125390;chr3L_16125639_16125640 chr3L_16125290_16125389;chr3L_16125640_16126338 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.32 NA NA NA NA NA 54.17 NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 6.9113333889599991e-21 K intron_retention CG3209,RI_chr2R_19957766_19960227 chr2R + chr2R_19959748_19960227 chr2R_19959747_19959748;chr2R_19960227_19960228 chr2R_19959680_19959747;chr2R_19960228_19960327 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.74 NA NA NA NA 12.00 10.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.3191042722699981e-07 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1526732_1527189 chr3L_1526731_1526732;chr3L_1527189_1527190 chr3L_1526660_1526731;chr3L_1527190_1527240 88.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Dcp2,F_chr3L_15815909_15816023,F_chr3L_15817090_15817547 chr3L - chr3L_15816282_15816346 chr3L_15816281_15816282;chr3L_15816346_15816347 chr3L_15816063_15816281;chr3L_15816347_15816855 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010089999999999999 K intron_retention Lag1,RI_chrX_6153758_6161036,I_chrX_6160751_6160887,I_chrX_6160907_6161036 chrX - chrX_6160751_6161036 chrX_6160750_6160751;chrX_6161036_6161037 chrX_6160651_6160750;chrX_6161037_6161136 80.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.56 0.0 K intron_retention Dcp2,F_chr3L_15815909_15816023,F_chr3L_15817090_15817547 chr3L - chr3L_15815112_15815170 chr3L_15815111_15815112;chr3L_15815170_15815171 chr3L_15814221_15815111;chr3L_15815171_15815908 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG1021,I_chr3R_2217711_2231099,I_chr3R_2217711_2231390,RI_chr3R_2217711_2231463,I_chr3R_2217742_2218601,I_chr3R_2217742_2219453,I_chr3R_2218465_2231390,RI_chr3R_2218465_2231463,I_chr3R_2218682_2231463,I_chr3R_2219634_2231390,RI_chr3R_2231206_2231270,I_chr3R_2231271_2231390,I_chr3R_2231285_2231463,I_chr3R_2231383_2231463 chr3R - chr3R_2217711_2231463 chr3R_2217710_2217711;chr3R_2231463_2231464 chr3R_2217642_2217710;chr3R_2231464_2231490 84.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.00 68.97 NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4761857249920001e-06 K intron_retention AP-50,CG7054 chr3R + chr3R_18288253_18288312 chr3R_18288252_18288253;chr3R_18288312_18288313 chr3R_18288233_18288252;chr3R_18288313_18288501 87.50 NA 73.33 NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1997007597356002e-10 K intron_retention CG8620,RI_chr3L_7151615_7151666 chr3L + chr3L_7151615_7151678 chr3L_7151614_7151615;chr3L_7151678_7151679 chr3L_7151515_7151614;chr3L_7151679_7151766 81.36 NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.10 57.69 NA 59.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA 66.67 NA 2.72001080673e-22 K intron_retention CG9467,E_chr3R_5625618_5626502 chr3R - chr3R_5626313_5626390 chr3R_5626312_5626313;chr3R_5626390_5626391 chr3R_5623432_5626312;chr3R_5626391_5626773 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.66 30.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.1005000000000009e-07 K intron_retention crol,snoRNA:Me18S-A934,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11797742_11797828 chr2L_11797741_11797742;chr2L_11797828_11797829 chr2L_11797682_11797741;chr2L_11797829_11798041 2.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0036960000000000001 K intron_retention CG2811,I_chr2R_20828961_20829772 chr2R - chr2R_20827378_20827428 chr2R_20827377_20827378;chr2R_20827428_20827429 chr2R_20827302_20827377;chr2R_20827429_20827526 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6077844302000003e-07 K intron_retention CG9154 chr2L - chr2L_6070393_6070448 chr2L_6070392_6070393;chr2L_6070448_6070449 chr2L_6070233_6070392;chr2L_6070449_6070669 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.47 6.1089540000000008e-05 K intron_retention CG7834,I_chr3R_25628402_25628511,I_chr3R_25632049_25632125,RI_chr3R_25658089_25658914 chr3R - chr3R_25627589_25627649 chr3R_25627588_25627589;chr3R_25627649_25627650 chr3R_25627357_25627588;chr3R_25627650_25628381 85.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Taf12,RI_chr3R_7504595_7505288,I_chr3R_7504949_7505288 chr3R - chr3R_7505121_7505288 chr3R_7505120_7505121;chr3R_7505288_7505289 chr3R_7505076_7505120;chr3R_7505289_7505388 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024032999999999999 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1526399_1526659 chr3L_1526398_1526399;chr3L_1526659_1526660 chr3L_1526334_1526398;chr3L_1526660_1526731 90.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000108 K intron_retention Nedd4,I_chr3L_17532828_17532882,I_chr3L_17532828_17533787,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17532828_17533790 chr3L_17532827_17532828;chr3L_17533790_17533791 chr3L_17532728_17532827;chr3L_17533791_17533887 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0088339999999999998 K intron_retention GM130,CG34205 chr2R - chr2R_18014710_18014810 chr2R_18014709_18014710;chr2R_18014810_18014811 chr2R_18014650_18014709;chr2R_18014811_18014999 2.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044781000000000001 K intron_retention MED6,CG9471,CG12946,I_chr3R_5599701_5600032,I_chr3R_5609682_5609889 chr3R - chr3R_5592845_5592898 chr3R_5592844_5592845;chr3R_5592898_5592899 chr3R_5592670_5592844;chr3R_5592899_5593366 2.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026002999999999998 K intron_retention CG4294 chr2R - chr2R_18488653_18488717 chr2R_18488652_18488653;chr2R_18488717_18488718 chr2R_18488006_18488652;chr2R_18488718_18488869 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018822999999999999 K intron_retention CG1358,I_chr2R_3485171_3489936 chr2R - chr2R_3485863_3489936 chr2R_3485862_3485863;chr2R_3489936_3489937 chr2R_3485721_3485862;chr2R_3489937_3490036 1.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001168 K intron_retention hkl chr2L + chr2L_19046143_19046206 chr2L_19046142_19046143;chr2L_19046206_19046207 chr2L_19045522_19046142;chr2L_19046207_19047047 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA 70.49 0.0 K intron_retention CG11266,RI_chr2L_7033019_7033182,RI_chr2L_7033019_7034180,RI_chr2L_7033019_7034764,I_chr2L_7034274_7034764,I_chr2L_7034274_7035406,RI_chr2L_7034911_7035074,I_chr2L_7051093_7051366 chr2L + chr2L_7033019_7035406 chr2L_7033018_7033019;chr2L_7035406_7035407 chr2L_7032919_7033018;chr2L_7035407_7035506 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.10 1.6531199999999999e-12 K intron_retention CG18012 chr3R - chr3R_13635522_13635579 chr3R_13635521_13635522;chr3R_13635579_13635580 chr3R_13635117_13635521;chr3R_13635580_13636140 2.59 NA NA 20.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001474 K intron_retention Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19562143_19562326 chr2R_19562142_19562143;chr2R_19562326_19562327 chr2R_19561937_19562142;chr2R_19562327_19562386 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0049519999999999998 K intron_retention CG6498,EI_chr3L_15559245_15561305,I_chr3L_15561224_15561305 chr3L + chr3L_15561200_15561305 chr3L_15561199_15561200;chr3L_15561305_15561306 chr3L_15561183_15561199;chr3L_15561306_15561405 57.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030086000000000002 K intron_retention unc-13,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_903350_903586 chr4_903349_903350;chr4_903586_903587 chr4_903243_903349;chr4_903587_903686 48.15 NA NA NA 35.00 NA 29.29 NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.78 NA NA 33.33 NA NA NA 30.91 NA 30.16 NA NA NA NA NA NA NA 29.03 NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 32.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention RhoGAP71E,I_chr3L_15583097_15589765 chr3L + chr3L_15582377_15582458 chr3L_15582376_15582377;chr3L_15582458_15582459 chr3L_15581999_15582376;chr3L_15582459_15583096 79.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.42 NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA 62.16 NA 57.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7851000000000006e-25 K intron_retention Nop60B,RI_chr2R_20063248_20063455,I_chr2R_20063248_20063949,snoRNA:Psi18S-1820,F_chr2R_20073291_20073744 chr2R + chr2R_20063248_20063455 chr2R_20063247_20063248;chr2R_20063455_20063456 chr2R_20063148_20063247;chr2R_20063456_20063555 93.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023400000000000001 K intron_retention msn,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586265,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2585733_2586402 chr3L_2585732_2585733;chr3L_2586402_2586403 chr3L_2585639_2585732;chr3L_2586403_2586502 77.50 NA 65.22 NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7409547267680007e-06 K intron_retention lok,RI_chr2L_20063248_20063377 chr2L + chr2L_20061721_20061781 chr2L_20061720_20061721;chr2L_20061781_20061782 chr2L_20061530_20061720;chr2L_20061782_20062012 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010810999999999999 K intron_retention I_chr3L_2589746_2592161,CG16985 chr3L + chr3L_2599381_2599435 chr3L_2599380_2599381;chr3L_2599435_2599436 chr3L_2599302_2599380;chr3L_2599436_2599501 13.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017682 K intron_retention Fis1,I_chr2R_1491917_1492087,I_chr2R_1492154_1492214 chr2R - chr2R_1491267_1491404 chr2R_1491266_1491267;chr2R_1491404_1491405 chr2R_1491125_1491266;chr2R_1491405_1491517 32.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA 2.4622764263999999e-08 K intron_retention olf186-F,CG30323 chr2R + chr2R_13738966_13745146 chr2R_13738965_13738966;chr2R_13745146_13745147 chr2R_13738563_13738965;chr2R_13745147_13745244 50.94 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG4133 chr2L + chr2L_456898_456972 chr2L_456897_456898;chr2L_456972_456973 chr2L_456797_456897;chr2L_456973_457338 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00034600000000000001 K intron_retention RhoGAP71E,I_chr3L_15583097_15589765 chr3L + chr3L_15594396_15599758 chr3L_15594395_15594396;chr3L_15599758_15599759 chr3L_15594333_15594395;chr3L_15599759_15600439 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00059437090999999993 K intron_retention phtf,I_chr2R_2629598_2630209 chr2R + chr2R_2632283_2632342 chr2R_2632282_2632283;chr2R_2632342_2632343 chr2R_2632108_2632282;chr2R_2632343_2632699 12.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 0.043812999999999998 K intron_retention sbr,RI_chrX_10731248_10731484 chrX - chrX_10728731_10728913 chrX_10728730_10728731;chrX_10728913_10728914 chrX_10728501_10728730;chrX_10728914_10728950 18.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012179999999999999 K intron_retention CG18659,E_chr2R_5011363_5019110,I_chr2R_5016147_5016997 chr2R - chr2R_5018864_5018987 chr2R_5018863_5018864;chr2R_5018987_5018988 chr2R_5018669_5018863;chr2R_5018988_5019370 8.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5e-05 K intron_retention CG15881,RI_chr3L_19799338_19799408,Kap-alpha1 chr3L + chr3L_19799553_19799609 chr3L_19799552_19799553;chr3L_19799609_19799610 chr3L_19799406_19799552;chr3L_19799610_19799732 11.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025628000000000001 K intron_retention RI_chrX_1954878_1955077,CG4281,CG14054,I_chrX_1962457_1964222 chrX - chrX_1958854_1958906 chrX_1958853_1958854;chrX_1958906_1958907 chrX_1958580_1958853;chrX_1958907_1959155 14.55 NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0091929999999999998 K intron_retention nes chr3L - chr3L_19253331_19253648 chr3L_19253330_19253331;chr3L_19253648_19253649 chr3L_19253215_19253330;chr3L_19253649_19253699 67.55 NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA 8.902716267400001e-08 K intron_retention CG9548 chr2L - chr2L_6490374_6490438 chr2L_6490373_6490374;chr2L_6490438_6490439 chr2L_6490288_6490373;chr2L_6490439_6490629 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033903999999999997 K intron_retention CG1969 chr3R + chr3R_25567092_25567489 chr3R_25567091_25567092;chr3R_25567489_25567490 chr3R_25566873_25567091;chr3R_25567490_25567631 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4920999999999997e-06 K intron_retention CG2698,I_chr3R_3828169_3828941,I_chr3R_3828880_3828941,I_chr3R_3829483_3829715,I_chr3R_3830586_3830981 chr3R + chr3R_3829483_3829697 chr3R_3829482_3829483;chr3R_3829697_3829698 chr3R_3829383_3829482;chr3R_3829698_3829900 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3334000000000005e-07 K intron_retention I_chr3R_17177101_17200781,mod(mdg4),I_chr3R_17183481_17200781,I_chr3R_17183927_17184513,I_chr3R_17183927_17185306,RI_chr3R_17184319_17184513,I_chr3R_17184319_17185084,I_chr3R_17184319_17185284,noncoding_18168,RI_chr3R_17184792_17185306,F_chr3R_17187010_17200781,F_chr3R_17187861_17200781,RI_chr3R_17189607_17189988,I_chr3R_17190098_17190207,F_chr3R_17192467_17200781,F_chr3R_17193961_17200781,F_chr3R_17194785_17200781,F_chr3R_17195968_17200781,I_chr3R_17197790_17197863,RI_chr3R_17198778_17199052,RI_chr3R_17198803_17199019,RI_chr3R_17198803_17199052 chr3R - chr3R_17183927_17184082 chr3R_17183926_17183927;chr3R_17184082_17184083 chr3R_17183827_17183926;chr3R_17184083_17184264 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA NA NA 13.16 NA NA NA NA NA 0.0016192900999999998 K intron_retention Adar,I_chrX_1668256_1682696,I_chrX_1674594_1674717 chrX + chrX_1672733_1672847 chrX_1672732_1672733;chrX_1672847_1672848 chrX_1672645_1672732;chrX_1672848_1672993 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017000999999999999 K intron_retention I_chr3R_25875159_25875219,CG7946,CG15526 chr3R + chr3R_25880069_25880131 chr3R_25880068_25880069;chr3R_25880131_25880132 chr3R_25879266_25880068;chr3R_25880132_25880201 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045574000000000003 K intron_retention gbb chr2R + chr2R_19739125_19739205 chr2R_19739124_19739125;chr2R_19739205_19739206 chr2R_19739106_19739124;chr2R_19739206_19740772 97.67 NA NA NA NA NA 84.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001358 K intron_retention RpS19a chrX + chrX_16531983_16532265 chrX_16531982_16531983;chrX_16532265_16532266 chrX_16531912_16531982;chrX_16532266_16532336 43.10 NA NA NA NA NA 76.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention vir-1,I_chr2L_12404178_12407208,RE_chr2L_12409622_12421640,noncoding_2764,I_chr2L_12421830_12423260 chr2L - chr2L_12421830_12423333 chr2L_12421829_12421830;chr2L_12423333_12423334 chr2L_12421816_12421829;chr2L_12423334_12423360 73.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 41.86 NA NA NA 54.84 NA NA 47.83 NA NA NA NA NA 50.00 45.16 NA NA NA NA NA NA 55.10 NA NA NA NA NA 51.85 NA 41.86 60.00 56.52 NA 45.65 55.38 NA 0.0 K intron_retention I_chr3L_3223943_3224313,CG11505 chr3L + chr3L_3232240_3232297 chr3L_3232239_3232240;chr3L_3232297_3232298 chr3L_3231909_3232239;chr3L_3232298_3232406 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024303000000000002 K intron_retention bbc,REI_chr2R_9379401_9381986 chr2R - chr2R_9379099_9379159 chr2R_9379098_9379099;chr2R_9379159_9379160 chr2R_9378940_9379098;chr2R_9379160_9379400 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG7530,I_chr3R_10556352_10557136,eff chr3R - chr3R_10556352_10557126 chr3R_10556351_10556352;chr3R_10557126_10557127 chr3R_10556252_10556351;chr3R_10557127_10557231 46.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.43 NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention endoA chr3R + chr3R_14734173_14734227 chr3R_14734172_14734173;chr3R_14734227_14734228 chr3R_14732922_14734172;chr3R_14734228_14736070 84.21 NA NA 64.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.2533000000000007e-14 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659,Ir62a chr3L - chr3L_1529229_1531390 chr3L_1529228_1529229;chr3L_1531390_1531391 chr3L_1529106_1529228;chr3L_1531391_1531522 38.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA 18.52 NA NA NA NA 20.00 8.2505307323020462e-15 K intron_retention Pde1c,esc,I_chr2L_11838774_11925541 chr2L - chr2L_11829104_11829175 chr2L_11829103_11829104;chr2L_11829175_11829176 chr2L_11828970_11829103;chr2L_11829176_11829364 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA NA 68.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4694370000000003e-06 K intron_retention pygo,noncoding_20344 chr3R - chr3R_27405608_27405674 chr3R_27405607_27405608;chr3R_27405674_27405675 chr3R_27403028_27405607;chr3R_27405675_27406426 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 5.9317442160000009e-09 K intron_retention kis,I_chr2L_228282_230537,RI_chr2L_231035_231947,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_227548_228132 chr2L_227547_227548;chr2L_228132_228133 chr2L_227372_227547;chr2L_228133_228281 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.64 NA NA NA NA NA 9.8039999999999996e-09 K intron_retention CG32549,I_chrX_18286289_18286367,RI_chrX_18301919_18303082 chrX - chrX_18298427_18298506 chrX_18298426_18298427;chrX_18298506_18298507 chrX_18298018_18298426;chrX_18298507_18298596 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.75 NA 46.23 NA NA NA NA NA 45.76 NA NA NA NA NA NA 36.28 45.83 52.38 NA NA NA NA 41.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.28 NA NA 0.0 K intron_retention dco,RI_chr3R_26883651_26886096,I_chr3R_26884350_26886671,I_chr3R_26884350_26886791,RI_chr3R_26884365_26886096,I_chr3R_26884365_26886798 chr3R - chr3R_26886187_26886791 chr3R_26886186_26886187;chr3R_26886791_26886792 chr3R_26886097_26886186;chr3R_26886792_26886798 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 16.67 9.3256315963331223e-10 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525704_1527189 chr3L_1525703_1525704;chr3L_1527189_1527190 chr3L_1525642_1525703;chr3L_1527190_1527240 58.62 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.53 44.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA 35.29 NA NA NA 37.04 NA 2.3652223568423711e-22 K intron_retention sqd,I_chr3R_9462248_9471474,CR33328,I_chr3R_9468150_9468236,I_chr3R_9470417_9471474 chr3R - chr3R_9462801_9468020 chr3R_9462800_9462801;chr3R_9468020_9468021 chr3R_9462777_9462800;chr3R_9468021_9468149 83.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0000000000000001e-11 K intron_retention cact,RI_chr2L_16314859_16315116,I_chr2L_16323518_16323594,I_chr2L_16324901_16326020 chr2L - chr2L_16323518_16324332 chr2L_16323517_16323518;chr2L_16324332_16324333 chr2L_16323418_16323517;chr2L_16324333_16324900 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0031549999999999998 K intron_retention Rab27,sta chrX - chrX_1368926_1370288 chrX_1368925_1368926;chrX_1370288_1370289 chrX_1368708_1368925;chrX_1370289_1370963 73.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA 0.016059 K intron_retention RpS26 chr2L - chr2L_18442439_18442504 chr2L_18442438_18442439;chr2L_18442504_18442505 chr2L_18442370_18442438;chr2L_18442505_18443070 86.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032139000000000001 K intron_retention Clc,CG6951 chr3L + chr3L_20235768_20235884 chr3L_20235767_20235768;chr3L_20235884_20235885 chr3L_20235590_20235767;chr3L_20235885_20236816 1.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00025799999999999998 K intron_retention CG6340,I_chrX_15402291_15403750 chrX + chrX_15377454_15379154 chrX_15377453_15377454;chrX_15379154_15379155 chrX_15377232_15377453;chrX_15379155_15379301 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00049600000000000002 K intron_retention GXIVsPLA2,I_chr3L_15948429_15948487,I_chr3L_15950680_15950738 chr3L + chr3L_15948648_15948710 chr3L_15948647_15948648;chr3L_15948710_15948711 chr3L_15948493_15948647;chr3L_15948711_15949498 6.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002457 K intron_retention CG1832,I_chr2L_22167179_22167302,I_chr2L_22168644_22168740 chr2L - chr2L_22167254_22167302 chr2L_22167253_22167254;chr2L_22167302_22167303 chr2L_22167243_22167253;chr2L_22167303_22167402 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012459999999999999 K intron_retention Adf1,CG15908_CG9410 chr2R + chr2R_2549942_2550073 chr2R_2549941_2549942;chr2R_2550073_2550074 chr2R_2549797_2549941;chr2R_2550074_2550262 46.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA 0.00149 K intron_retention CG31601 chr2L - chr2L_22042348_22042401 chr2L_22042347_22042348;chr2L_22042401_22042402 chr2L_22042107_22042347;chr2L_22042402_22043034 29.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.52 NA 3.561604e-06 K intron_retention CG14442,I_chrX_6586147_6586435 chrX - chrX_6583646_6583704 chrX_6583645_6583646;chrX_6583704_6583705 chrX_6583354_6583645;chrX_6583705_6585387 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.00 NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3948083827339989e-06 K intron_retention CtBP chr3R + chr3R_8842742_8845063 chr3R_8842741_8842742;chr3R_8845063_8845064 chr3R_8842716_8842741;chr3R_8845064_8845536 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.31 38.46 39.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 1.1347047002249281e-14 K intron_retention nrv2,I_chr2L_6791842_6791904,I_chr2L_6791842_6792033,I_chr2L_6791842_6794492,I_chr2L_6793397_6794492,I_chr2L_6793405_6793916,I_chr2L_6793405_6794499,I_chr2L_6793684_6794492 chr2L - chr2L_6791842_6791904 chr2L_6791841_6791842;chr2L_6791904_6791905 chr2L_6791742_6791841;chr2L_6791905_6791938 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 0.038026999999999998 K intron_retention CG32758 chrX - chrX_5615236_5615299 chrX_5615235_5615236;chrX_5615299_5615300 chrX_5613769_5615235;chrX_5615300_5615729 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.39 NA NA 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9641,I_chr2L_2976765_2976818,I_chr2L_2986815_2987511 chr2L - chr2L_2976555_2976818 chr2L_2976554_2976555;chr2L_2976818_2976819 chr2L_2975151_2976554;chr2L_2976819_2976918 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6420780000000002e-05 K intron_retention I_chr2L_11009331_11009442,dUTPase,I_chr2L_11011380_11011453 chr2L + chr2L_11011380_11011471 chr2L_11011379_11011380;chr2L_11011471_11011472 chr2L_11011335_11011379;chr2L_11011472_11011553 52.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.26 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG3847 chrX + chrX_6241443_6241499 chrX_6241442_6241443;chrX_6241499_6241500 chrX_6241334_6241442;chrX_6241500_6241502 88.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.05e-09 K intron_retention Rtnl1,I_chr2L_4994995_5006383,RE_chr2L_4994997_5008180,I_chr2L_4999312_5000248,I_chr2L_4999386_4999670,I_chr2L_4999386_5000201,I_chr2L_5027222_5028118 chr2L - chr2L_4999386_5000248 chr2L_4999385_4999386;chr2L_5000248_5000249 chr2L_4999376_4999385;chr2L_5000249_5000301 28.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.26 0.014338 K intron_retention Eb1,I_chr2R_2642491_2642549 chr2R + chr2R_2642350_2642403 chr2R_2642349_2642350;chr2R_2642403_2642404 chr2R_2642210_2642349;chr2R_2642404_2642486 0.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Pros45 chrX + chrX_21187223_21187285 chrX_21187222_21187223;chrX_21187285_21187286 chrX_21187054_21187222;chrX_21187286_21187430 0.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CLIP-190,I_chr2L_17394493_17404060,I_chr2L_17401291_17404060,F_chr2L_17401582_17401681,I_chr2L_17401582_17402303 chr2L + chr2L_17401291_17401515 chr2L_17401290_17401291;chr2L_17401515_17401516 chr2L_17401191_17401290;chr2L_17401516_17401581 18.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038996000000000003 K intron_retention sol chrX + chrX_21224091_21225120 chrX_21224090_21224091;chrX_21225120_21225121 chrX_21223780_21224090;chrX_21225121_21225440 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0078869999999999999 K intron_retention klett chrX - chrX_21499782_21499874 chrX_21499781_21499782;chrX_21499874_21499875 chrX_21499389_21499781;chrX_21499875_21499937 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026096000000000001 K intron_retention RpL36,RI_chrX_522912_523358,I_chrX_522932_523360,I_chrX_522949_523360 chrX - chrX_522912_523358 chrX_522911_522912;chrX_523358_523359 chrX_522849_522911;chrX_523359_523436 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.95 NA NA 45.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.39 0.0 K intron_retention Mvl chr3R - chr3R_16883674_16883737 chr3R_16883673_16883674;chr3R_16883737_16883738 chr3R_16883509_16883673;chr3R_16883738_16883922 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0061549999999999999 K intron_retention CG30122,I_chr2R_14526123_14526189 chr2R - chr2R_14522447_14523647 chr2R_14522446_14522447;chr2R_14523647_14523648 chr2R_14522312_14522446;chr2R_14523648_14523776 12.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040398999999999997 K intron_retention Ppn,F_chr3R_24347009_24347078 chr3R - chr3R_24348983_24349755 chr3R_24348982_24348983;chr3R_24349755_24349756 chr3R_24348417_24348982;chr3R_24349756_24349939 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033756000000000001 K intron_retention I_chr3R_22696095_22697413,Rb97D chr3R - chr3R_22699278_22699581 chr3R_22699277_22699278;chr3R_22699581_22699582 chr3R_22698253_22699277;chr3R_22699582_22699720 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.30 42.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Top3beta chrX - chrX_6179401_6179464 chrX_6179400_6179401;chrX_6179464_6179465 chrX_6179007_6179400;chrX_6179465_6180515 1.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000328 K intron_retention noncoding_16922 chr3R - chr3R_11116170_11116223 chr3R_11116169_11116170;chr3R_11116223_11116224 chr3R_11116026_11116169;chr3R_11116224_11116516 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000192 K intron_retention I_chrX_1757755_1757801,Pgam5,I_chrX_1793073_1794406,RI_chrX_1795648_1795745 chrX - chrX_1766940_1767005 chrX_1766939_1766940;chrX_1767005_1767006 chrX_1766389_1766939;chrX_1767006_1767583 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02068 K intron_retention I_chr2R_19695638_19696332,Nxt1,RI_chr2R_19699261_19699317,CG4797 chr2R - chr2R_19699405_19699461 chr2R_19699404_19699405;chr2R_19699461_19699462 chr2R_19699318_19699404;chr2R_19699462_19699529 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01001 K intron_retention Tre1,I_chrX_5569518_5570588 chrX - chrX_5568907_5568972 chrX_5568906_5568907;chrX_5568972_5568973 chrX_5568804_5568906;chrX_5568973_5569073 5.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026901999999999999 K intron_retention CG14741 chr3R - chr3R_7897251_7898049 chr3R_7897250_7897251;chr3R_7898049_7898050 chr3R_7897104_7897250;chr3R_7898050_7898194 46.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020609999999999999 K intron_retention Patj,CG12022 chr3L + chr3L_1798954_1799009 chr3L_1798953_1798954;chr3L_1799009_1799010 chr3L_1798788_1798953;chr3L_1799010_1800699 45.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention foi,I_chr3L_8520658_8520733,I_chr3L_8524905_8524976 chr3L + chr3L_8518805_8523659 chr3L_8518804_8518805;chr3L_8523659_8523660 chr3L_8518753_8518804;chr3L_8523660_8524249 4.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00096100000000000005 K intron_retention btz,I_chr3R_23526114_23526320 chr3R + chr3R_23526248_23526320 chr3R_23526247_23526248;chr3R_23526320_23526321 chr3R_23526188_23526247;chr3R_23526321_23526420 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02341 K intron_retention CG12084,I_chr3L_1494947_1496080,RI_chr3L_1499880_1501350 chr3L - chr3L_1492230_1492313 chr3L_1492229_1492230;chr3L_1492313_1492314 chr3L_1491984_1492229;chr3L_1492314_1492463 62.39 NA NA NA NA NA 75.81 44.76 NA NA 75.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA 86.67 NA 44.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.64 47.65 NA 0.0 K intron_retention cul-2,RI_chr2L_21657668_21657832,noncoding_4226,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21657742_21657832 chr2L_21657741_21657742;chr2L_21657832_21657833 chr2L_21657690_21657741;chr2L_21657833_21657932 51.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 34.78 NA NA 0.0 K intron_retention Pde1c,esc,I_chr2L_11838774_11925541 chr2L - chr2L_11828908_11828969 chr2L_11828907_11828908;chr2L_11828969_11828970 chr2L_11828736_11828907;chr2L_11828970_11829103 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0092490000000000003 K intron_retention fw chrX - chrX_11889154_11889217 chrX_11889153_11889154;chrX_11889217_11889218 chrX_11889027_11889153;chrX_11889218_11889279 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012799999999999999 K intron_retention Xe7,RI_chr3R_1493064_1493414,CRI_chr3R_1493111_1493414 chr3R - chr3R_1493028_1493414 chr3R_1493027_1493028;chr3R_1493414_1493415 chr3R_1493011_1493027;chr3R_1493415_1493514 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA 13.89 3.1192998442386002e-05 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824832_11825183 chr2R_11824831_11824832;chr2R_11825183_11825184 chr2R_11824765_11824831;chr2R_11825184_11825384 28.57 NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA NA 10.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 0.0 K intron_retention key,I_chr2R_20674247_20674291,I_chr2R_20674567_20674813,I_chr2R_20674654_20674897,RI_chr2R_20676692_20676888 chr2R - chr2R_20673207_20673258 chr2R_20673206_20673207;chr2R_20673258_20673259 chr2R_20673138_20673206;chr2R_20673259_20673618 1.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005757 K intron_retention DnaJ-1 chr3L - chr3L_5744701_5744945 chr3L_5744700_5744701;chr3L_5744945_5744946 chr3L_5743126_5744700;chr3L_5744946_5745193 0.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035973999999999999 K intron_retention CG8359 chr3R + chr3R_4632302_4632354 chr3R_4632301_4632302;chr3R_4632354_4632355 chr3R_4632014_4632301;chr3R_4632355_4633200 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040155999999999997 K intron_retention CG14225,I_chrX_19569702_19569879,I_chrX_19573364_19573474 chrX - chrX_19569702_19569836 chrX_19569701_19569702;chrX_19569836_19569837 chrX_19569602_19569701;chrX_19569837_19569924 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.20 NA NA NA NA NA 0.00036999999999999999 K intron_retention Gga chrX + chrX_9496709_9496777 chrX_9496708_9496709;chrX_9496777_9496778 chrX_9496114_9496708;chrX_9496778_9497496 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00628 K intron_retention CG6359 chr3R + chr3R_8455477_8455540 chr3R_8455476_8455477;chr3R_8455540_8455541 chr3R_8454944_8455476;chr3R_8455541_8455790 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016889999999999999 K intron_retention vlc chr2R + chr2R_1591722_1591790 chr2R_1591721_1591722;chr2R_1591790_1591791 chr2R_1590976_1591721;chr2R_1591791_1591887 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035001999999999998 K intron_retention CG3635,I_chr2L_22179420_22179486 chr2L + chr2L_22179420_22179486 chr2L_22179419_22179420;chr2L_22179486_22179487 chr2L_22179368_22179419;chr2L_22179487_22179566 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012400000000000001 K intron_retention CG3065,mr chr2R + chr2R_19858209_19858278 chr2R_19858208_19858209;chr2R_19858278_19858279 chr2R_19858176_19858208;chr2R_19858279_19859714 90.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.14 NA NA NA NA NA 74.47 NA NA 6.8583923568000005e-08 K intron_retention CG10462 chr2L - chr2L_19732469_19732572 chr2L_19732468_19732469;chr2L_19732572_19732573 chr2L_19732184_19732468;chr2L_19732573_19732670 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030324 K intron_retention Pitslre,I_chr3L_20764965_20765781,I_chr3L_20764965_20766192,I_chr3L_20764965_20766212,I_chr3L_20766064_20766192,I_chr3L_20766064_20766215,RI_chr3L_20766064_20766893,I_chr3L_20766311_20766664,I_chr3L_20766311_20766893,I_chr3L_20766773_20766893 chr3L + chr3L_20764709_20764767 chr3L_20764708_20764709;chr3L_20764767_20764768 chr3L_20764640_20764708;chr3L_20764768_20764964 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG30085,I_chr2R_11756325_11756380 chr2R - chr2R_11756325_11756409 chr2R_11756324_11756325;chr2R_11756409_11756410 chr2R_11756225_11756324;chr2R_11756410_11756480 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049626999999999998 K intron_retention scaf6,EI_chr3L_17037760_17037808 chr3L - chr3L_17033702_17034793 chr3L_17033701_17033702;chr3L_17034793_17034794 chr3L_17033539_17033701;chr3L_17034794_17035140 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.007685 K intron_retention CG1681 chrX + chrX_13302825_13302895 chrX_13302824_13302825;chrX_13302895_13302896 chrX_13302689_13302824;chrX_13302896_13303422 1.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Pcmt,I_chr3R_1379398_1379947 chr3R - chr3R_1379790_1379850 chr3R_1379789_1379790;chr3R_1379850_1379851 chr3R_1379653_1379789;chr3R_1379851_1380033 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017000999999999999 K intron_retention bbc,I_chr2R_9376554_9377246,REI_chr2R_9379401_9381986 chr2R - chr2R_9375638_9378939 chr2R_9375637_9375638;chr2R_9378939_9378940 chr2R_9375479_9375637;chr2R_9378940_9379098 49.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.77 NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA 30.30 NA NA NA 26.92 NA NA 61.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention cryptocephal,noncoding_4181,I_chr2L_21312209_21314626 chr2L + chr2L_21311018_21311192 chr2L_21311017_21311018;chr2L_21311192_21311193 chr2L_21310948_21311017;chr2L_21311193_21311214 52.13 NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.31 NA NA NA NA 64.71 79.73 NA NA NA 65.67 65.81 NA NA NA 67.82 NA NA 69.07 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.24 0.0 K intron_retention RpS26 chr2L - chr2L_18443074_18443152 chr2L_18443073_18443074;chr2L_18443152_18443153 chr2L_18442505_18443073;chr2L_18443153_18443237 2.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.89 46.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention JTBR chr3L - chr3L_1802744_1802803 chr3L_1802743_1802744;chr3L_1802803_1802804 chr3L_1802008_1802743;chr3L_1802804_1802835 52.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017378000000000001 K intron_retention noncoding_18164,F_chr3R_17192061_17200781 chr3R + chr3R_17192061_17192171 chr3R_17192060_17192061;chr3R_17192171_17192172 chr3R_17191961_17192060;chr3R_17192172_17192272 20.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030463 K intron_retention CG31211 chr3R + chr3R_7777961_7778362 chr3R_7777960_7777961;chr3R_7778362_7778363 chr3R_7777954_7777960;chr3R_7778363_7778390 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4554491127e-07 K intron_retention CG2219,noncoding_20558,RI_chr4_202143_202194 chr4 - chr4_202143_202194 chr4_202142_202143;chr4_202194_202195 chr4_202043_202142;chr4_202195_202294 0.00 NA NA 23.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047385999999999998 K intron_retention mRpL33,I_chrX_4216068_4216134 chrX - chrX_4215901_4215963 chrX_4215900_4215901;chrX_4215963_4215964 chrX_4215782_4215900;chrX_4215964_4216067 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0089809999999999994 K intron_retention Cct1,Cct2 chr3L + chr3L_1546307_1546598 chr3L_1546306_1546307;chr3L_1546598_1546599 chr3L_1546118_1546306;chr3L_1546599_1546676 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.00 NA 2.1846819324e-06 K intron_retention CG17159,CG17162,noncoding_25215 chrXHet - chrXHet_66049_66121 chrXHet_66048_66049;chrXHet_66121_66122 chrXHet_64549_66048;chrXHet_66122_66324 73.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention None chrU + chrU_1179335_1184082 chrU_1179334_1179335;chrU_1184082_1184083 84.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.36 NA 4.3693184e-05 K intron_retention CG4822,I_chr2L_120081_120199,I_chr2L_120266_120420,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_119376_119430 chr2L_119375_119376;chr2L_119430_119431 chr2L_119292_119375;chr2L_119431_119554 17.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4e-05 K intron_retention I_chr2L_114992_156735,RI_chr2L_114992_155545,RI_chr2L_114992_155566,I_chr2L_114992_155637,I_chr2L_114992_156175,RI_chr2L_155430_155637,CG11455,CG3436 chr2L + chr2L_155430_155566 chr2L_155429_155430;chr2L_155566_155567 chr2L_155424_155429;chr2L_155567_155645 39.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention AP-1sigma,I_chr3R_19786283_19787772 chr3R + chr3R_19785316_19786619 chr3R_19785315_19785316;chr3R_19786619_19786620 chr3R_19785178_19785315;chr3R_19786620_19787186 62.50 NA NA NA NA NA 80.00 NA NA 36.84 38.89 NA 76.00 NA NA NA NA NA NA NA 35.85 NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA 44.00 NA NA 78.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Hcs,I_chr3R_1303481_1304607 chr3R + chr3R_1303270_1303331 chr3R_1303269_1303270;chr3R_1303331_1303332 chr3R_1302263_1303269;chr3R_1303332_1303480 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00147 K intron_retention CG18324,I_chr2R_10068194_10068715 chr2R + chr2R_10056609_10056891 chr2R_10056608_10056609;chr2R_10056891_10056892 chr2R_10056291_10056608;chr2R_10056892_10057027 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5000944000000005e-05 K intron_retention CG4250,I_chr2R_18551419_18551493,E_chr2R_18551558_18551756 chr2R + chr2R_18551627_18551679 chr2R_18551626_18551627;chr2R_18551679_18551680 chr2R_18551494_18551626;chr2R_18551680_18551701 7.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention Clic chrX - chrX_13708019_13715957 chrX_13708018_13708019;chrX_13715957_13715958 chrX_13707908_13708018;chrX_13715958_13716374 100.00 NA NA 20.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention LamC chr2R - chr2R_10458817_10458964 chr2R_10458816_10458817;chr2R_10458964_10458965 chr2R_10458387_10458816;chr2R_10458965_10459687 48.48 28.89 NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA 28.33 9.38 17.14 26.92 NA NA 8.24 NA NA 33.33 7.69 NA 16.67 8.33 NA 0.0 K intron_retention Amph,I_chr2R_8498227_8498492 chr2R + chr2R_8497142_8498083 chr2R_8497141_8497142;chr2R_8498083_8498084 chr2R_8496734_8497141;chr2R_8498084_8498226 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039053999999999998 K intron_retention I_chr2L_6956220_6956307,sip2_CG9188 chr2L - chr2L_6963856_6963938 chr2L_6963855_6963856;chr2L_6963938_6963939 chr2L_6963845_6963855;chr2L_6963939_6964073 89.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.51 NA NA NA 70.97 78.05 NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA 4.7795860225891016e-08 K intron_retention eIF2B-beta chrX + chrX_2598957_2599025 chrX_2598956_2598957;chrX_2599025_2599026 chrX_2598870_2598956;chrX_2599026_2599482 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0083870000000000004 K intron_retention CG14463 chr3R + chr3R_3826386_3826445 chr3R_3826385_3826386;chr3R_3826445_3826446 chr3R_3826339_3826385;chr3R_3826446_3826512 41.94 NA NA NA NA 31.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA 4.1472645480000003e-09 K intron_retention RhoBTB,RI_chr3L_20370940_20371530,I_chr3L_20374844_20374891 chr3L + chr3L_20372949_20373010 chr3L_20372948_20372949;chr3L_20373010_20373011 chr3L_20372412_20372948;chr3L_20373011_20373269 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062909999999999997 K intron_retention CG7956 chr3R + chr3R_17352625_17352984 chr3R_17352624_17352625;chr3R_17352984_17352985 chr3R_17351551_17352624;chr3R_17352985_17353123 90.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.46 NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA 2.6231519999999997e-06 K intron_retention CG17233,RI_chr3L_20232898_20232962 chr3L - chr3L_20229429_20229533 chr3L_20229428_20229429;chr3L_20229533_20229534 chr3L_20229350_20229428;chr3L_20229534_20231010 88.14 NA NA 74.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.03886e-07 K intron_retention I_chr3L_834336_834491,CG13887,Gr61a chr3L + chr3L_837946_838048 chr3L_837945_837946;chr3L_838048_838049 chr3L_837877_837945;chr3L_838049_838624 20.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.34 6.9999999999999993e-12 K intron_retention CG2034 chr3L + chr3L_2258518_2258579 chr3L_2258517_2258518;chr3L_2258579_2258580 chr3L_2257872_2258517;chr3L_2258580_2258934 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020539999999999998 K intron_retention tou,I_chr2R_7468394_7468453,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7468368_7468453 chr2R_7468367_7468368;chr2R_7468453_7468454 chr2R_7468294_7468367;chr2R_7468454_7468553 47.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.53 0.0 K intron_retention CG6923 chr3R - chr3R_7574457_7574511 chr3R_7574456_7574457;chr3R_7574511_7574512 chr3R_7571080_7574456;chr3R_7574512_7574681 29.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 14.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.82 NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2767524260782198e-10 K intron_retention I_chrX_13751182_13777268,mamo,C_chrX_13795677_13808662 chrX - chrX_13764437_13764502 chrX_13764436_13764437;chrX_13764502_13764503 chrX_13764353_13764436;chrX_13764503_13764568 89.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0040720000000000001 K intron_retention hkl chr2L + chr2L_19045437_19045521 chr2L_19045436_19045437;chr2L_19045521_19045522 chr2L_19045385_19045436;chr2L_19045522_19046142 77.42 NA NA NA NA NA NA 64.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 54.55 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 52.17 NA 1.1243145304755001e-14 K intron_retention glo,I_chr3R_7643675_7643727,REI_chr3R_7644679_7644932,RI_chr3R_7644683_7644880,I_chr3R_7647556_7647628 chr3R - chr3R_7642480_7643727 chr3R_7642479_7642480;chr3R_7643727_7643728 chr3R_7642334_7642479;chr3R_7643728_7643827 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026408000000000001 K intron_retention Myo61F,mtacp1,I_chr3L_1330291_1330865,I_chr3L_1330291_1331279,RI_chr3L_1330929_1331041,l(3)02640 chr3L + chr3L_1330291_1330865 chr3L_1330290_1330291;chr3L_1330865_1330866 chr3L_1330191_1330290;chr3L_1330866_1330928 84.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA 0.036267000000000001 K intron_retention yellow-f2,CG17327 chr3R - chr3R_8820042_8820149 chr3R_8820041_8820042;chr3R_8820149_8820150 chr3R_8819386_8820041;chr3R_8820150_8820539 64.00 52.50 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA 50.79 NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA 82.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.78 NA NA 50.94 46.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Elp3 chr2L + chr2L_4445137_4445192 chr2L_4445136_4445137;chr2L_4445192_4445193 chr2L_4445068_4445136;chr2L_4445193_4445259 31.46 NA NA 8.57 NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.95 NA NA 9.09 NA NA NA 13.25 NA 0.0 K intron_retention prel chr2R + chr2R_5311772_5311833 chr2R_5311771_5311772;chr2R_5311833_5311834 chr2R_5311616_5311771;chr2R_5311834_5311930 21.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention lark,noncoding_11093,REI_chr3L_7332718_7333975,RI_chr3L_7334219_7334452 chr3L + chr3L_7332718_7333061 chr3L_7332717_7332718;chr3L_7333061_7333062 chr3L_7332618_7332717;chr3L_7333062_7333870 36.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.52 NA 1.3061454999999999e-05 K intron_retention MCPH1,RI_chr2R_7790917_7791377 chr2R - chr2R_7784320_7784613 chr2R_7784319_7784320;chr2R_7784613_7784614 chr2R_7784277_7784319;chr2R_7784614_7785982 87.32 NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.09 NA NA NA 73.33 70.00 1.3697019000000001e-19 K intron_retention kuz,F_chr2L_13635998_13637287,I_chr2L_13636762_13637287 chr2L + chr2L_13636844_13637287 chr2L_13636843_13636844;chr2L_13637287_13637288 chr2L_13636505_13636843;chr2L_13637288_13637387 28.87 NA NA 10.38 NA NA NA NA NA NA NA 12.90 NA NA NA NA NA 14.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1243132010000001e-07 K intron_retention sina chr3L + chr3L_16847053_16847119 chr3L_16847052_16847053;chr3L_16847119_16847120 chr3L_16846848_16847052;chr3L_16847120_16847625 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001176 K intron_retention Ranbp16,I_chrX_15826655_15827277 chrX - chrX_15827572_15827633 chrX_15827571_15827572;chrX_15827633_15827634 chrX_15827176_15827571;chrX_15827634_15827691 15.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048735000000000001 K intron_retention CG11266,RI_chr2L_7033019_7034764,I_chr2L_7034274_7035406,I_chr2L_7051093_7051366 chr2L + chr2L_7032840_7032903 chr2L_7032839_7032840;chr2L_7032903_7032904 chr2L_7032779_7032839;chr2L_7032904_7033018 73.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.67 NA NA NA NA NA 60.87 58.33 NA NA 54.17 NA 56.00 NA NA NA NA 60.71 NA 6.3490223584004735e-24 K intron_retention CG34133,F_chr3R_25696884_25696960 chr3R + chr3R_25695777_25696960 chr3R_25695776_25695777;chr3R_25696960_25696961 chr3R_25695572_25695776;chr3R_25696961_25697060 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019892 K intron_retention tai,I_chr2L_9191814_9206231 chr2L + chr2L_9243546_9243611 chr2L_9243545_9243546;chr2L_9243611_9243612 chr2L_9243235_9243545;chr2L_9243612_9243900 0.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0000000000000002e-06 K intron_retention Map205,I_chr3R_27891135_27892050 chr3R - chr3R_27884492_27884653 chr3R_27884491_27884492;chr3R_27884653_27884654 chr3R_27882314_27884491;chr3R_27884654_27884867 79.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.41 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.83 0.0 K intron_retention Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19548057_19552816 chr2R_19548056_19548057;chr2R_19552816_19552817 chr2R_19548042_19548056;chr2R_19552817_19553410 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2475694e-05 K intron_retention CG5850,I_chr2L_9963013_9963451 chr2L - chr2L_9961615_9961728 chr2L_9961614_9961615;chr2L_9961728_9961729 chr2L_9961359_9961614;chr2L_9961729_9961775 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0048469999999999997 K intron_retention CG34413,RI_chr2R_20769295_20770153,I_chr2R_20771136_20772048,I_chr2R_20773500_20774745 chr2R + chr2R_20769150_20770153 chr2R_20769149_20769150;chr2R_20770153_20770154 chr2R_20769141_20769149;chr2R_20770154_20770253 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0068110000000000002 K intron_retention CG11790,CG11791 chr3R + chr3R_20876340_20876902 chr3R_20876339_20876340;chr3R_20876902_20876903 chr3R_20875859_20876339;chr3R_20876903_20877278 53.93 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.05 NA NA 38.46 NA NA NA 39.47 NA 0.0 K intron_retention ras chrX + chrX_10640260_10640453 chrX_10640259_10640260;chrX_10640453_10640454 chrX_10640109_10640259;chrX_10640454_10641105 3.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0064390000000000003 K intron_retention CG9684 chr3R - chr3R_4188104_4188160 chr3R_4188103_4188104;chr3R_4188160_4188161 chr3R_4187630_4188103;chr3R_4188161_4188266 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040336999999999998 K intron_retention B4,I_chr2L_13513474_13549131,I_chr2L_13547133_13549131,I_chr2L_13547162_13547692,I_chr2L_13547304_13549131 chr2L - chr2L_13547162_13549131 chr2L_13547161_13547162;chr2L_13549131_13549132 chr2L_13547062_13547161;chr2L_13549132_13549231 34.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7190201999999998e-05 K intron_retention CG1407,RI_chr2R_5918919_5919093,I_chr2R_5918925_5919213,RI_chr2R_5918952_5919084,RI_chr2R_5918952_5919093 chr2R - chr2R_5918925_5919093 chr2R_5918924_5918925;chr2R_5919093_5919094 chr2R_5918852_5918924;chr2R_5919094_5919184 44.44 NA NA 27.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.8135979999999998e-06 K intron_retention Arp14D,RE_chrX_16445264_16446372 chrX - chrX_16443182_16443251 chrX_16443181_16443182;chrX_16443251_16443252 chrX_16442302_16443181;chrX_16443252_16443445 96.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020823000000000001 K intron_retention CG32138 chr3L + chr3L_14062497_14062991 chr3L_14062496_14062497;chr3L_14062991_14062992 chr3L_14062186_14062496;chr3L_14062992_14063021 25.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.25 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 1.4799160834444798e-10 K intron_retention su(r),I_chrX_9094230_9095181 chrX - chrX_9094107_9094165 chrX_9094106_9094107;chrX_9094165_9094166 chrX_9091302_9094106;chrX_9094166_9094229 0.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00038099999999999999 K intron_retention CG31301,I_chr3R_11172776_11172930,RI_chr3R_11173123_11173185 chr3R + chr3R_11172875_11172930 chr3R_11172874_11172875;chr3R_11172930_11172931 chr3R_11172810_11172874;chr3R_11172931_11172995 19.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001359 K intron_retention kermit,I_chr2R_4035901_4043493 chr2R - chr2R_4035901_4043559 chr2R_4035900_4035901;chr2R_4043559_4043560 chr2R_4035801_4035900;chr2R_4043560_4043593 24.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.77 1.9722000000000002e-07 K intron_retention I_chr2R_20828961_20829772,CG15861,CG2790,E_chr2R_20851190_20852094 chr2R - chr2R_20831457_20831541 chr2R_20831456_20831457;chr2R_20831541_20831542 chr2R_20831346_20831456;chr2R_20831542_20832368 16.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012800000000000001 K intron_retention oho23B,I_chr2L_2856176_2856244,I_chr2L_2856573_2856630,RI_chr2L_2856673_2856772 chr2L + chr2L_2856306_2856391 chr2L_2856305_2856306;chr2L_2856391_2856392 chr2L_2856279_2856305;chr2L_2856392_2856568 99.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1e-05 K intron_retention Myb,RI_chrX_15752571_15753225 chrX - chrX_15751579_15751673 chrX_15751578_15751579;chrX_15751673_15751674 chrX_15749823_15751578;chrX_15751674_15751694 32.56 NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.60 NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA 16.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12582 chr3R + chr3R_29885_29987 chr3R_29884_29885;chr3R_29987_29988 chr3R_29816_29884;chr3R_29988_30053 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention ps,I_chr3R_5269733_5270765 chr3R + chr3R_5272220_5273350 chr3R_5272219_5272220;chr3R_5273350_5273351 chr3R_5271691_5272219;chr3R_5273351_5275004 42.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 0.0 K intron_retention CtBP chr3R + chr3R_8847365_8851110 chr3R_8847364_8847365;chr3R_8851110_8851111 chr3R_8847142_8847364;chr3R_8851111_8851987 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021718000000000001 K intron_retention CG12065,CE_chrX_8469528_8477573 chrX + chrX_8480642_8481290 chrX_8480641_8480642;chrX_8481290_8481291 chrX_8480585_8480641;chrX_8481291_8481558 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024893999999999999 K intron_retention oho23B,I_chr2L_2856176_2856244,I_chr2L_2856573_2856630,E_chr2L_2856577_2856641,RI_chr2L_2856673_2856772 chr2L + chr2L_2856569_2856630 chr2L_2856568_2856569;chr2L_2856630_2856631 chr2L_2856480_2856568;chr2L_2856631_2856641 91.29 NA NA 59.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG7192,RI_chrX_17993756_17994097 chrX - chrX_17992545_17992611 chrX_17992544_17992545;chrX_17992611_17992612 chrX_17992463_17992544;chrX_17992612_17992679 1.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022356000000000001 K intron_retention SdhA,I_chr2R_15283283_15283411,I_chr2R_15283319_15283369 chr2R - chr2R_15283283_15283369 chr2R_15283282_15283283;chr2R_15283369_15283370 chr2R_15283219_15283282;chr2R_15283370_15283469 29.17 NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024001000000000001 K intron_retention Su(var)205,RI_chr2L_8212717_8212766 chr2L - chr2L_8210862_8210978 chr2L_8210861_8210862;chr2L_8210978_8210979 chr2L_8210730_8210861;chr2L_8210979_8211205 8.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5999999999999998e-05 K intron_retention exd chrX + chrX_15886650_15887520 chrX_15886649_15886650;chrX_15887520_15887521 chrX_15886529_15886649;chrX_15887521_15887806 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020343 K intron_retention dbo chr3L + chr3L_15823559_15823678 chr3L_15823558_15823559;chr3L_15823678_15823679 chr3L_15823371_15823558;chr3L_15823679_15824009 92.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016112000000000001 K intron_retention Syx7,I_chr3L_21439901_21439962 chr3L + chr3L_21439124_21439297 chr3L_21439123_21439124;chr3L_21439297_21439298 chr3L_21439033_21439123;chr3L_21439298_21439475 1.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015647999999999999 K intron_retention Nhe3,I_chr2L_6680525_6680670 chr2L - chr2L_6680115_6680174 chr2L_6680114_6680115;chr2L_6680174_6680175 chr2L_6679986_6680114;chr2L_6680175_6680283 1.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.88 NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2446480000000001e-06 K intron_retention Mob4 chr2R - chr2R_2583349_2583396 chr2R_2583348_2583349;chr2R_2583396_2583397 chr2R_2582619_2583348;chr2R_2583397_2583465 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.03585 K intron_retention CG16791 chr3R - chr3R_17148070_17148142 chr3R_17148069_17148070;chr3R_17148142_17148143 chr3R_17147895_17148069;chr3R_17148143_17148288 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002356 N intron_retention Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11821304_11821703 chr2R_11821303_11821304;chr2R_11821703_11821704 chr2R_11820289_11821303;chr2R_11821704_11822085 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Cp1,Aats-phe chr2R + chr2R_9853291_9854259 chr2R_9853290_9853291;chr2R_9854259_9854260 chr2R_9853110_9853290;chr2R_9854260_9854474 51.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.36 NA 35.38 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 26.00 NA 0.0 K intron_retention bocksbeutel chr3R - chr3R_5415505_5415604 chr3R_5415504_5415505;chr3R_5415604_5415605 chr3R_5415190_5415504;chr3R_5415605_5416709 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00031500000000000001 K intron_retention CG14741 chr3R - chr3R_7900593_7900895 chr3R_7900592_7900593;chr3R_7900895_7900896 chr3R_7900525_7900592;chr3R_7900896_7901144 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA 68.52 NA NA 55.88 NA 66.67 NA 61.19 NA NA NA 66.67 NA NA NA 59.57 NA NA 64.77 NA NA NA NA 67.44 NA NA NA 69.44 51.28 0.0 K intron_retention rump,RI_chr3R_5335093_5335157,I_chr3R_5338175_5338299 chr3R - chr3R_5333109_5335157 chr3R_5333108_5333109;chr3R_5335157_5335158 chr3R_5331980_5333108;chr3R_5335158_5335257 18.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012869 K intron_retention CG31216 chr3R + chr3R_15522379_15523033 chr3R_15522378_15522379;chr3R_15523033_15523034 chr3R_15522274_15522378;chr3R_15523034_15523168 1.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5000000000000002e-05 K intron_retention sbr,RI_chrX_10731248_10731484 chrX - chrX_10728951_10730552 chrX_10728950_10728951;chrX_10730552_10730553 chrX_10728914_10728950;chrX_10730553_10730662 53.19 NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 31.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7026647999999999e-16 K intron_retention Doa,I_chr3R_24715823_24718923,I_chr3R_24747391_24747896 chr3R + chr3R_24746992_24747062 chr3R_24746991_24746992;chr3R_24747062_24747063 chr3R_24746878_24746991;chr3R_24747063_24747080 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039629999999999999 K intron_retention CG16971,I_chr3L_225856_225909,RI_chr3L_225919_226004,noncoding_9600,RI_chr3L_229245_229590,I_chr3L_229245_229599,I_chr3L_229245_230186,I_chr3L_229653_229708 chr3L + chr3L_229245_229588 chr3L_229244_229245;chr3L_229588_229589 chr3L_229145_229244;chr3L_229589_229652 92.62 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.57 79.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG18659,E_chr2R_5011363_5019110,I_chr2R_5016147_5016997 chr2R - chr2R_5015816_5015875 chr2R_5015815_5015816;chr2R_5015875_5015876 chr2R_5015762_5015815;chr2R_5015876_5016146 33.33 NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.64 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA 2.7756000000000001e-18 K intron_retention CG2862 chr2L + chr2L_2770192_2770258 chr2L_2770191_2770192;chr2L_2770258_2770259 chr2L_2770181_2770191;chr2L_2770259_2770400 8.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention l(1)G0196,I_chrX_21900456_21904601 chrX + chrX_21904142_21904471 chrX_21904141_21904142;chrX_21904471_21904472 chrX_21904031_21904141;chrX_21904472_21904538 90.67 NA NA NA 75.00 77.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4332319999999999e-12 K intron_retention Adf1,CG15908_CG9410 chr2R + chr2R_2554519_2554577 chr2R_2554518_2554519;chr2R_2554577_2554578 chr2R_2554225_2554518;chr2R_2554578_2555592 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.004777 K intron_retention CG13124,RI_chr2L_9906444_9907607,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9907548_9907607 chr2L_9907547_9907548;chr2L_9907607_9907608 chr2L_9907051_9907547;chr2L_9907608_9907707 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG16721 chrX + chrX_5776269_5776329 chrX_5776268_5776269;chrX_5776329_5776330 chrX_5775968_5776268;chrX_5776330_5776496 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0029619999999999998 K intron_retention Vrp1,I_chr2R_17996482_17997091,I_chr2R_17996511_17997091,I_chr2R_17997529_17997692 chr2R - chr2R_17996286_17996355 chr2R_17996285_17996286;chr2R_17996355_17996356 chr2R_17995991_17996285;chr2R_17996356_17996416 28.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044954000000000001 K intron_retention I_chr2R_19265701_19270570,CG3530,CG3520 chr2R - chr2R_19276942_19277003 chr2R_19276941_19276942;chr2R_19277003_19277004 chr2R_19276529_19276941;chr2R_19277004_19277181 96.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014864 K intron_retention VhaM9_7-2,I_chr3L_21533183_21533251,RI_chr3L_21533183_21533368,I_chr3L_21533305_21533368 chr3L + chr3L_21533183_21533252 chr3L_21533182_21533183;chr3L_21533252_21533253 chr3L_21533088_21533182;chr3L_21533253_21533300 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001201 K intron_retention CG18659,E_chr2R_5011363_5019110,RI_chr2R_5013572_5014531,I_chr2R_5016147_5016997 chr2R - chr2R_5011651_5014923 chr2R_5011650_5011651;chr2R_5014923_5014924 chr2R_5011194_5011650;chr2R_5014924_5015382 89.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0028289999999999999 K intron_retention CG5802 chr3R + chr3R_16964788_16964839 chr3R_16964787_16964788;chr3R_16964839_16964840 chr3R_16964277_16964787;chr3R_16964840_16965301 0.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K intron_retention CG5224 chr2R + chr2R_14391167_14391245 chr2R_14391166_14391167;chr2R_14391245_14391246 chr2R_14391098_14391166;chr2R_14391246_14391354 3.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029023 K intron_retention Akap200,I_chr2L_8426446_8426873 chr2L + chr2L_8428068_8428319 chr2L_8428067_8428068;chr2L_8428319_8428320 chr2L_8427615_8428067;chr2L_8428320_8428325 19.71 NA NA 57.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018900000000000001 K intron_retention Neb-cGP,CG2889 chrX + chrX_10354882_10354952 chrX_10354881_10354882;chrX_10354952_10354953 chrX_10354790_10354881;chrX_10354953_10355029 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention spz chr3R - chr3R_22892388_22892450 chr3R_22892387_22892388;chr3R_22892450_22892451 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22892451_22892606 87.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001338 K intron_retention CG8108,EI_chr3L_9859462_9859590,chr3L_9859594_9859878.0 chr3L + chr3L_9859462_9860413 chr3L_9859461_9859462;chr3L_9860413_9860414 chr3L_9859414_9859461;chr3L_9860414_9860844 18.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA 1.5e-05 K intron_retention CG2818 chr2L + chr2L_3716105_3716156 chr2L_3716104_3716105;chr2L_3716156_3716157 chr2L_3714647_3716104;chr2L_3716157_3716303 31.11 NA 18.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8199999999999995e-10 K intron_retention kay,E_chr3R_25616137_25617114 chr3R + chr3R_25616577_25617114 chr3R_25616576_25616577;chr3R_25617114_25617115 chr3R_25614671_25616576;chr3R_25617115_25617214 23.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA NA NA NA 0.0033769999999999998 N intron_retention CG2681,I_chrX_2609471_2609546,RI_chrX_2622435_2622577 chrX + chrX_2604274_2604352 chrX_2604273_2604274;chrX_2604352_2604353 chrX_2604142_2604273;chrX_2604353_2604934 44.50 NA NA 12.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K intron_retention lola,I_chr2R_6380094_6419543,I_chr2R_6380747_6419543,I_chr2R_6394546_6419543,I_chr2R_6404486_6419543,R_chr2R_6408775_6419537,I_chr2R_6409616_6419543,I_chr2R_6413368_6414281,I_chr2R_6419625_6419686,I_chr2R_6421474_6423519,I_chr2R_6421904_6422354 chr2R - chr2R_6410475_6419543 chr2R_6410474_6410475;chr2R_6419543_6419544 chr2R_6410419_6410474;chr2R_6419544_6419624 53.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.56 NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA 36.76 NA NA NA NA 27.59 26.83 25.93 37.31 NA 21.43 NA NA 31.03 32.14 NA NA 32.00 31.67 0.0 K intron_retention LamC chr2R - chr2R_10460353_10462729 chr2R_10460352_10460353;chr2R_10462729_10462730 chr2R_10459758_10460352;chr2R_10462730_10463307 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 1.6889327000000002e-05 K intron_retention CG6695 chr3R + chr3R_20484327_20484382 chr3R_20484326_20484327;chr3R_20484382_20484383 chr3R_20484221_20484326;chr3R_20484383_20485086 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041846000000000001 K intron_retention CG42490,RI_chr2L_18666413_18666474,CREI_chr2L_18666629_18666680 chr2L + chr2L_18666629_18666691 chr2L_18666628_18666629;chr2L_18666691_18666692 chr2L_18666560_18666628;chr2L_18666692_18666739 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035782000000000001 K intron_retention CG12054 chr3R + chr3R_27051799_27051862 chr3R_27051798_27051799;chr3R_27051862_27051863 chr3R_27051535_27051798;chr3R_27051863_27051971 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6e-05 K intron_retention CG2701,RI_chrX_2612780_2612845,ttm50 chrX - chrX_2613801_2613859 chrX_2613800_2613801;chrX_2613859_2613860 chrX_2613718_2613800;chrX_2613860_2613954 17.52 NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00088599999999999996 K intron_retention CG2658 chrX - chrX_2591822_2591881 chrX_2591821_2591822;chrX_2591881_2591882 chrX_2591372_2591821;chrX_2591882_2592219 1.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.24 NA NA NA NA NA NA 11.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1296999999999999e-08 K intron_retention noncoding_20850,CG11093,RF_chr4_983355_984342 chr4 - chr4_983355_983859 chr4_983354_983355;chr4_983859_983860 chr4_983255_983354;chr4_983860_983907 29.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.56 NA 0.0033210000000000002 K intron_retention CG12703 chrX + chrX_19644924_19645380 chrX_19644923_19644924;chrX_19645380_19645381 chrX_19644833_19644923;chrX_19645381_19645579 87.14 NA NA NA NA NA NA 70.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0019870000000000001 K intron_retention Acyp2,CG4699 chr3R + chr3R_11618874_11618931 chr3R_11618873_11618874;chr3R_11618931_11618932 chr3R_11618764_11618873;chr3R_11618932_11619070 12.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 0.00141127404 K intron_retention CG1902,CG30000,I_chr2R_5495525_5495581 chr2R + chr2R_5492117_5492174 chr2R_5492116_5492117;chr2R_5492174_5492175 chr2R_5491750_5492116;chr2R_5492175_5493222 48.05 NA NA 25.26 30.00 NA NA NA NA 24.00 59.26 60.68 33.33 60.34 NA NA NA NA NA NA NA NA 32.38 NA NA NA NA 31.88 NA NA 74.84 NA NA NA NA NA NA 22.67 NA NA 61.36 NA NA 30.88 NA NA NA 66.67 NA NA NA 32.88 NA NA NA NA NA 63.27 0.0 K intron_retention CG4119 chrX + chrX_5560347_5560409 chrX_5560346_5560347;chrX_5560409_5560410 chrX_5560114_5560346;chrX_5560410_5560501 52.54 NA NA 69.57 NA NA 69.57 65.38 NA 37.04 NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA 40.74 NA 37.25 NA NA NA NA 79.07 NA NA 35.29 NA NA NA 67.44 NA NA 36.67 NA NA NA 66.67 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 37.50 NA 39.13 NA NA 0.0 K intron_retention CG17490 chr2L + chr2L_22431301_22431358 chr2L_22431300_22431301;chr2L_22431358_22431359 chr2L_22431022_22431300;chr2L_22431359_22431462 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.29 36.14 NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA 56.25 NA NA NA NA 52.17 NA NA NA NA NA NA NA 58.62 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659,Ir62a chr3L - chr3L_1528077_1529105 chr3L_1528076_1528077;chr3L_1529105_1529106 chr3L_1528061_1528076;chr3L_1529106_1529206 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.55 1.3913900000000001e-07 K intron_retention CG33097,I_chr3R_2191538_2191675,I_chr3R_2199103_2199426 chr3R - chr3R_2190448_2190725 chr3R_2190447_2190448;chr3R_2190725_2190726 chr3R_2190382_2190447;chr3R_2190726_2190876 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA 22.73 NA 23.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA 32.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3667894446387836e-13 K intron_retention Fur2,RI_chrX_16267905_16268958,I_chrX_16270205_16270272,I_chrX_16274795_16274867 chrX + chrX_16270201_16270272 chrX_16270200_16270201;chrX_16270272_16270273 chrX_16270138_16270200;chrX_16270273_16270372 83.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Aldh-III,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3356731_3356864 chr2R_3356730_3356731;chr2R_3356864_3356865 chr2R_3356615_3356730;chr2R_3356865_3357018 53.06 NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA 38.10 NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA 24.24 NA 73.53 NA 37.50 NA NA 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention KdelR,CG5188 chr2L + chr2L_10427004_10427075 chr2L_10427003_10427004;chr2L_10427075_10427076 chr2L_10426867_10427003;chr2L_10427076_10428159 2.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0065929999999999999 K intron_retention Shawn_Tyler,Shawn chrX + chrX_19509139_19509216 chrX_19509138_19509139;chrX_19509216_19509217 chrX_19509057_19509138;chrX_19509217_19509641 50.00 NA NA 62.96 NA 70.00 63.16 NA NA NA NA 67.44 NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA 29.63 NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 73.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.36 NA NA 0.0 K intron_retention CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8992447_8994545 chrX_8992446_8992447;chrX_8994545_8994546 chrX_8992117_8992446;chrX_8994546_8994553 43.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA 0.035324000000000001 K intron_retention CG8455 chr2L + chr2L_8200281_8200345 chr2L_8200280_8200281;chr2L_8200345_8200346 chr2L_8200102_8200280;chr2L_8200346_8200652 85.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.7292386524999992e-08 K intron_retention CG42593,F_chrX_7841357_7841447 chrX + chrX_7835229_7835288 chrX_7835228_7835229;chrX_7835288_7835289 chrX_7834816_7835228;chrX_7835289_7835447 22.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6866984000000002e-05 K intron_retention Tequila chr3L + chr3L_9084921_9084981 chr3L_9084920_9084921;chr3L_9084981_9084982 chr3L_9084837_9084920;chr3L_9084982_9085228 17.71 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00069888849999999989 K intron_retention I_chr2R_20828961_20829772,CG15861,CG2790,E_chr2R_20851190_20852094 chr2R - chr2R_20831289_20831345 chr2R_20831288_20831289;chr2R_20831345_20831346 chr2R_20830876_20831288;chr2R_20831346_20831456 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.5214100000000001e-06 N intron_retention CG17018,R_chr2L_22312023_22363414,CEI_chr2L_22325847_22356902 chr2L + chr2L_22354970_22356902 chr2L_22354969_22354970;chr2L_22356902_22356903 chr2L_22354872_22354969;chr2L_22356903_22357002 21.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0097890000000000008 K intron_retention CG34183,CG5924 chr2L - chr2L_9890484_9890541 chr2L_9890483_9890484;chr2L_9890541_9890542 chr2L_9890386_9890483;chr2L_9890542_9890622 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024114 K intron_retention Hel25E,I_chr2L_5540301_5540396 chr2L - chr2L_5540301_5540424 chr2L_5540300_5540301;chr2L_5540424_5540425 chr2L_5540201_5540300;chr2L_5540425_5540496 69.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.91 NA NA NA 49.23 NA NA NA NA NA NA 50.00 50.00 NA NA NA NA 48.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Atg18,I_chr3L_8182683_8182941 chr3L + chr3L_8181681_8182386 chr3L_8181680_8181681;chr3L_8182386_8182387 chr3L_8180913_8181680;chr3L_8182387_8182393 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3760296910720005e-05 K intron_retention Mi-2 chr3L - chr3L_19875398_19875464 chr3L_19875397_19875398;chr3L_19875464_19875465 chr3L_19875146_19875397;chr3L_19875465_19875688 88.89 NA NA NA NA 70.21 NA NA NA NA NA NA 73.08 NA NA NA NA 75.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2809999999999998e-13 K intron_retention noncoding_9335 chr2R + chr2R_20682246_20682317 chr2R_20682245_20682246;chr2R_20682317_20682318 chr2R_20682214_20682245;chr2R_20682318_20682737 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.59 0.0050860000000000002 K intron_retention CG6695 chr3R + chr3R_20484134_20484220 chr3R_20484133_20484134;chr3R_20484220_20484221 chr3R_20484043_20484133;chr3R_20484221_20484326 1.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011875 K intron_retention CEI_chr3R_10927927_10937314,CG6934 chr3R - chr3R_10935837_10937314 chr3R_10935836_10935837;chr3R_10937314_10937315 chr3R_10935632_10935836;chr3R_10937315_10937414 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG13398 chr2L - chr2L_8414889_8414960 chr2L_8414888_8414889;chr2L_8414960_8414961 chr2L_8412140_8414888;chr2L_8414961_8415235 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00060304702500000001 K intron_retention Tao-1 chrX - chrX_19465927_19465998 chrX_19465926_19465927;chrX_19465998_19465999 chrX_19465808_19465926;chrX_19465999_19466220 0.98 NA NA NA NA NA 12.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0365455999999999e-05 K intron_retention CoRest,I_chrX_19416977_19417035 chrX + chrX_19416423_19417035 chrX_19416422_19416423;chrX_19417035_19417036 chrX_19416201_19416422;chrX_19417036_19417135 14.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017058 K intron_retention CG31211 chr3R + chr3R_7776734_7776971 chr3R_7776733_7776734;chr3R_7776971_7776972 chr3R_7776580_7776733;chr3R_7776972_7777214 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.95 NA NA NA NA 17.46 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.001011e-12 K intron_retention norpA,I_chrX_4219265_4219380 chrX + chrX_4254739_4255998 chrX_4254738_4254739;chrX_4255998_4255999 chrX_4254649_4254738;chrX_4255999_4256951 42.59 NA NA NA NA 22.22 NA 32.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 29.41 NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.24 5.7333972422422113e-12 K intron_retention Rm62,I_chr3R_1828444_1829394,I_chr3R_1828476_1829394 chr3R - chr3R_1828821_1829394 chr3R_1828820_1828821;chr3R_1829394_1829395 chr3R_1828656_1828820;chr3R_1829395_1829494 49.08 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA 29.63 NA 23.17 NA 33.33 26.32 NA NA NA NA 27.59 NA NA NA 27.27 NA NA NA NA 29.41 NA NA 27.59 26.32 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG31216 chr3R + chr3R_15497251_15497308 chr3R_15497250_15497251;chr3R_15497308_15497309 chr3R_15497235_15497250;chr3R_15497309_15497465 90.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.79 NA 68.97 NA NA 73.08 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5160014654310401e-10 K intron_retention Su(z)12 chr3L - chr3L_19912391_19912458 chr3L_19912390_19912391;chr3L_19912458_19912459 chr3L_19911385_19912390;chr3L_19912459_19912507 59.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 25.71 NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.70 42.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA 42.86 0.0 K intron_retention CG17549,I_chr2L_19387937_19387993,I_chr2L_19388570_19389922 chr2L - chr2L_19387770_19387861 chr2L_19387769_19387770;chr2L_19387861_19387862 chr2L_19387538_19387769;chr2L_19387862_19387936 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.30 NA NA NA NA NA 7.55 7.25 NA 0.0 K intron_retention mfrn,I_chr3R_23770737_23770817,I_chr3R_23771063_23771153,I_chr3R_23771063_23772599 chr3R - chr3R_23770924_23770973 chr3R_23770923_23770924;chr3R_23770973_23770974 chr3R_23770799_23770923;chr3R_23770974_23771062 1.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.13 NA NA NA NA NA NA 14.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7210323999999999e-05 K intron_retention eIF4AIII chr3R + chr3R_4139867_4139927 chr3R_4139866_4139867;chr3R_4139927_4139928 chr3R_4139675_4139866;chr3R_4139928_4140629 1.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 0.012999 K intron_retention CG7414,I_chr3L_21819515_21819581 chr3L + chr3L_21820136_21820193 chr3L_21820135_21820136;chr3L_21820193_21820194 chr3L_21820050_21820135;chr3L_21820194_21820958 1.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02189 K intron_retention CG14435 chrX - chrX_6734295_6734396 chrX_6734294_6734295;chrX_6734396_6734397 chrX_6734147_6734294;chrX_6734397_6734467 60.00 73.08 NA NA NA NA NA 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 34.78 NA 44.83 NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA 0.0 K intron_retention CG18177,I_chr3L_9723741_9723833 chr3L + chr3L_9721250_9721312 chr3L_9721249_9721250;chr3L_9721312_9721313 chr3L_9721085_9721249;chr3L_9721313_9721317 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 NA NA NA NA NA 8.8523764000000003e-05 K intron_retention CG14642,CG34305 chr3R - chr3R_67810_67879 chr3R_67809_67810;chr3R_67879_67880 chr3R_67700_67809;chr3R_67880_67958 20.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.021821 K intron_retention CG6613 chr2R + chr2R_17992501_17992556 chr2R_17992500_17992501;chr2R_17992556_17992557 chr2R_17992337_17992500;chr2R_17992557_17992564 14.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039771000000000001 K intron_retention CG31678 chr2L - chr2L_20675571_20675636 chr2L_20675570_20675571;chr2L_20675636_20675637 chr2L_20674995_20675570;chr2L_20675637_20676010 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0072110000000000004 K intron_retention qkr58E-2,I_chr2R_18305142_18305207 chr2R + chr2R_18305142_18305197 chr2R_18305141_18305142;chr2R_18305197_18305198 chr2R_18305042_18305141;chr2R_18305198_18305536 83.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 54.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.35 NA NA NA NA NA NA NA 67.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention ksr chr3R - chr3R_1306259_1306324 chr3R_1306258_1306259;chr3R_1306324_1306325 chr3R_1306075_1306258;chr3R_1306325_1309607 78.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA 63.64 NA NA 1.154445263946e-05 K intron_retention CG17754 chrX + chrX_9147605_9147683 chrX_9147604_9147605;chrX_9147683_9147684 chrX_9146561_9147604;chrX_9147684_9147891 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014663000000000001 K intron_retention CG2519 chr3R - chr3R_1367216_1367275 chr3R_1367215_1367216;chr3R_1367275_1367276 chr3R_1367051_1367215;chr3R_1367276_1367558 4.92 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019556 K intron_retention Trf4-1,I_chrX_8459198_8459266 chrX + chrX_8460090_8460329 chrX_8460089_8460090;chrX_8460329_8460330 chrX_8459410_8460089;chrX_8460330_8461303 19.61 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.56 NA NA 5.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1304800000000002e-07 K intron_retention CG9065 chrX - chrX_14978596_14978658 chrX_14978595_14978596;chrX_14978658_14978659 chrX_14978386_14978595;chrX_14978659_14978664 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036850000000000001 K intron_retention itp chr2R + chr2R_20431614_20432949 chr2R_20431613_20431614;chr2R_20432949_20432950 chr2R_20431285_20431613;chr2R_20432950_20432976 32.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010337603 K intron_retention CG14478 chr2R + chr2R_13350011_13350065 chr2R_13350010_13350011;chr2R_13350065_13350066 chr2R_13349499_13350010;chr2R_13350066_13352421 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA 66.67 62.50 67.86 NA 67.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 2.0209716482615039e-15 K intron_retention CG1308,CG1295 chr3L + chr3L_4195716_4195840 chr3L_4195715_4195716;chr3L_4195840_4195841 chr3L_4195666_4195715;chr3L_4195841_4195990 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00029399999999999999 K intron_retention CG3689,I_chr3L_9405436_9406302 chr3L + chr3L_9405083_9405254 chr3L_9405082_9405083;chr3L_9405254_9405255 chr3L_9404917_9405082;chr3L_9405255_9405315 22.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041419999999999998 K intron_retention Doa,I_chr3R_24715823_24718923,I_chr3R_24747391_24747896 chr3R + chr3R_24713971_24714030 chr3R_24713970_24713971;chr3R_24714030_24714031 chr3R_24713819_24713970;chr3R_24714031_24714256 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.76 NA NA NA NA NA 51.22 NA NA 56.25 NA NA 0.0 K intron_retention Irbp chr3R + chr3R_7236841_7236941 chr3R_7236840_7236841;chr3R_7236941_7236942 chr3R_7236778_7236840;chr3R_7236942_7238112 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017058 K intron_retention akirin,I_chr3L_7363173_7364806,I_chr3L_7363177_7364806,I_chr3L_7363177_7364831,I_chr3L_7363211_7364831,I_chr3L_7363731_7364806,I_chr3L_7364126_7364806,RI_chr3L_7364737_7364806 chr3L + chr3L_7363169_7364831 chr3L_7363168_7363169;chr3L_7364831_7364832 chr3L_7363111_7363168;chr3L_7364832_7364906 88.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.23 NA NA 48.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG12112,CG12111 chrX - chrX_8453892_8453953 chrX_8453891_8453892;chrX_8453953_8453954 chrX_8453812_8453891;chrX_8453954_8454022 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013908 K intron_retention klett chrX - chrX_21497280_21497339 chrX_21497279_21497280;chrX_21497339_21497340 chrX_21497037_21497279;chrX_21497340_21497917 1.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043671000000000001 K intron_retention CG3566 chrX - chrX_6170492_6170564 chrX_6170491_6170492;chrX_6170564_6170565 chrX_6170403_6170491;chrX_6170565_6170760 4.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.56 NA NA NA NA NA NA 28.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00068506815300000009 K intron_retention CG12030 chr3L + chr3L_649052_649178 chr3L_649051_649052;chr3L_649178_649179 chr3L_648517_649051;chr3L_649179_649419 2.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention CG7206 chrX - chrX_17983958_17984015 chrX_17983957_17983958;chrX_17984015_17984016 chrX_17983328_17983957;chrX_17984016_17984270 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.39 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.05 NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention tud,I_chr2R_17086183_17086333 chr2R + chr2R_17074553_17074607 chr2R_17074552_17074553;chr2R_17074607_17074608 chr2R_17073474_17074552;chr2R_17074608_17075437 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001003 K intron_retention CG3353,RI_chr3R_17043671_17044394 chr3R - chr3R_17043434_17043492 chr3R_17043433_17043434;chr3R_17043492_17043493 chr3R_17043050_17043433;chr3R_17043493_17043670 12.33 NA 0.00 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.5361710000000006e-05 K intron_retention crm,I_chrX_2635555_2635621,I_chrX_2636831_2636971 chrX - chrX_2631447_2631502 chrX_2631446_2631447;chrX_2631502_2631503 chrX_2629870_2631446;chrX_2631503_2631706 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000444 N intron_retention MAPk-Ak2,RI_chrX_5655618_5656137,I_chrX_5656715_5657427,I_chrX_5656715_5657893,I_chrX_5656715_5657974 chrX - chrX_5656678_5658141 chrX_5656677_5656678;chrX_5658141_5658142 chrX_5656615_5656677;chrX_5658142_5658214 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.58 NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6828000000000001e-08 K intron_retention wts chr3R - chr3R_26626686_26632009 chr3R_26626685_26626686;chr3R_26632009_26632010 chr3R_26626373_26626685;chr3R_26632010_26632317 45.10 NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA 27.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.61 NA NA 26.09 23.91 NA 27.03 NA NA NA NA NA 28.81 NA NA NA NA 28.30 NA 27.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention I_chr2R_7165832_7165906,CG9062,I_chr2R_7171366_7171418 chr2R - chr2R_7168656_7168778 chr2R_7168655_7168656;chr2R_7168778_7168779 chr2R_7167919_7168655;chr2R_7168779_7168884 82.61 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA 66.67 61.76 NA NA NA NA NA NA NA 1.5309297169831406e-11 K intron_retention RpL22,noncoding_21234,snoRNA:Psi18S-531,snoRNA:Psi28S-2179 chrX - chrX_657025_657473 chrX_657024_657025;chrX_657473_657474 chrX_656593_657024;chrX_657474_657843 30.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000002e-11 K intron_retention CG15747 chrX + chrX_13234461_13234519 chrX_13234460_13234461;chrX_13234519_13234520 chrX_13234198_13234460;chrX_13234520_13235036 50.00 NA NA 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012571000000000001 K intron_retention CG11180 chr2R - chr2R_16508823_16508964 chr2R_16508822_16508823;chr2R_16508964_16508965 chr2R_16508401_16508822;chr2R_16508965_16510679 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA 6.1084704257280009e-12 K intron_retention Rab39 chrX + chrX_7629369_7629796 chrX_7629368_7629369;chrX_7629796_7629797 chrX_7628958_7629368;chrX_7629797_7630876 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042093999999999999 K intron_retention Gp150,I_chr2R_18205316_18205386,I_chr2R_18213233_18213308 chr2R + chr2R_18205316_18205386 chr2R_18205315_18205316;chr2R_18205386_18205387 chr2R_18205216_18205315;chr2R_18205387_18205459 91.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002359 K intron_retention Atg1,I_chr3L_12790957_12792478 chr3L - chr3L_12780637_12780696 chr3L_12780636_12780637;chr3L_12780696_12780697 chr3L_12780487_12780636;chr3L_12780697_12780833 43.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA 56.76 NA NA NA NA 30.91 NA NA NA NA NA 26.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.3436800000000011e-18 K intron_retention ena chr2R + chr2R_15029276_15029711 chr2R_15029275_15029276;chr2R_15029711_15029712 chr2R_15029150_15029275;chr2R_15029712_15029859 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA 30.23 NA NA 32.26 NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA 0.0 K intron_retention PHGPx chr3L + chr3L_3326368_3327859 chr3L_3326367_3326368;chr3L_3327859_3327860 chr3L_3326358_3326367;chr3L_3327860_3328183 22.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K intron_retention Pvr,I_chr2L_8226604_8228082,I_chr2L_8229012_8229080,I_chr2L_8230332_8238998 chr2L - chr2L_8227827_8228493 chr2L_8227826_8227827;chr2L_8228493_8228494 chr2L_8227758_8227826;chr2L_8228494_8229011 15.38 NA NA 84.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Ca-P60A,RI_chr2R_19820338_19820541,I_chr2R_19820338_19821424,CEI_chr2R_19820338_19821830,I_chr2R_19820338_19823289 chr2R - chr2R_19820338_19820765 chr2R_19820337_19820338;chr2R_19820765_19820766 chr2R_19820238_19820337;chr2R_19820766_19820779 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010583 K intron_retention CG7720 chr3R - chr3R_14587460_14587553 chr3R_14587459_14587460;chr3R_14587553_14587554 chr3R_14587324_14587459;chr3R_14587554_14587728 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040077000000000002 K intron_retention RpL27A,E_chr2L_4457411_4457977,I_chr2L_4458058_4458120 chr2L - chr2L_4457290_4457374 chr2L_4457289_4457290;chr2L_4457374_4457375 chr2L_4457180_4457289;chr2L_4457375_4457410 0.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG18249 chr3R + chr3R_4047582_4047641 chr3R_4047581_4047582;chr3R_4047641_4047642 chr3R_4046021_4047581;chr3R_4047642_4047889 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.6000000000000005e-05 K intron_retention C3G chrX - chrX_6677812_6677922 chrX_6677811_6677812;chrX_6677922_6677923 chrX_6677643_6677811;chrX_6677923_6678587 2.96 NA NA NA NA NA 22.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00025000000000000001 K intron_retention Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,RI_chr3L_16045275_16045854,RI_chr3L_16045275_16046111,RI_chr3L_16045277_16046104,I_chr3L_16045316_16046104,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16045251_16046111 chr3L_16045250_16045251;chr3L_16046111_16046112 chr3L_16045216_16045250;chr3L_16046112_16046204 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 2.1309591548123849e-12 K intron_retention Aats-ile chr3L + chr3L_22281841_22281894 chr3L_22281840_22281841;chr3L_22281894_22281895 chr3L_22281691_22281840;chr3L_22281895_22282039 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA NA NA NA 25.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.95 NA NA NA NA NA 31.67 NA NA NA NA NA 25.93 27.78 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Sap47,I_chr3R_11761076_11761674,I_chr3R_11761436_11761674,F_chr3R_11761635_11761698,E_chr3R_11761635_11761703 chr3R + chr3R_11761307_11761674 chr3R_11761306_11761307;chr3R_11761674_11761675 chr3R_11761299_11761306;chr3R_11761675_11761774 77.78 NA 65.38 NA NA NA 62.79 NA NA NA 45.00 NA 58.62 NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA 54.17 NA NA NA 64.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9776,CG9772 chr3R - chr3R_161452_161507 chr3R_161451_161452;chr3R_161507_161508 chr3R_161143_161451;chr3R_161508_161635 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028257000000000001 K intron_retention CG32529 chrX + chrX_19798711_19798771 chrX_19798710_19798711;chrX_19798771_19798772 chrX_19798542_19798710;chrX_19798772_19799645 1.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG2186 chrX + chrX_10753438_10753632 chrX_10753437_10753438;chrX_10753632_10753633 chrX_10753231_10753437;chrX_10753633_10754930 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.032327000000000002 K intron_retention CG1516,I_chr2R_5743716_5743899,I_chr2R_5746990_5747874,RI_chr2R_5752988_5757801 chr2R - chr2R_5747958_5748029 chr2R_5747957_5747958;chr2R_5748029_5748030 chr2R_5747875_5747957;chr2R_5748030_5748063 52.05 NA 35.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9471,CG12946,I_chr3R_5599701_5600032,I_chr3R_5609682_5609889 chr3R - chr3R_5597104_5597167 chr3R_5597103_5597104;chr3R_5597167_5597168 chr3R_5597018_5597103;chr3R_5597168_5597221 94.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0056109999999999997 K intron_retention nct,I_chr3R_20679262_20679308 chr3R + chr3R_20680025_20680083 chr3R_20680024_20680025;chr3R_20680083_20680084 chr3R_20679947_20680024;chr3R_20680084_20680151 89.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention wge chr3R - chr3R_18542354_18542655 chr3R_18542353_18542354;chr3R_18542655_18542656 chr3R_18540256_18542353;chr3R_18542656_18542685 23.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.019132 K intron_retention CoRest chrX + chrX_19423635_19423706 chrX_19423634_19423635;chrX_19423706_19423707 chrX_19422927_19423634;chrX_19423707_19424349 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00064300000000000002 K intron_retention CG34133,F_chr3R_25696884_25696960 chr3R + chr3R_25698373_25698426 chr3R_25698372_25698373;chr3R_25698426_25698427 chr3R_25698263_25698372;chr3R_25698427_25698986 97.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038356000000000001 K intron_retention CG10103,noncoding_10997 chr3L - chr3L_6747908_6748519 chr3L_6747907_6747908;chr3L_6748519_6748520 chr3L_6747845_6747907;chr3L_6748520_6749258 42.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 6.5377000000000004e-08 K intron_retention r-l chr3R - chr3R_16898728_16898787 chr3R_16898727_16898728;chr3R_16898787_16898788 chr3R_16898211_16898727;chr3R_16898788_16899200 8.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5999999999999999e-05 K intron_retention yki chr2R - chr2R_19953701_19953783 chr2R_19953700_19953701;chr2R_19953783_19953784 chr2R_19953553_19953700;chr2R_19953784_19953836 1.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000115 K intron_retention B52,F_chr3R_9488762_9491174,E_chr3R_9488770_9491174,RI_chr3R_9489655_9489713 chr3R + chr3R_9488774_9489733 chr3R_9488773_9488774;chr3R_9489733_9489734 chr3R_9488692_9488773;chr3R_9489734_9489796 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA 22.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG31999,I_chr4_240711_240769,I_chr4_243657_244182 chr4 - chr4_244368_244443 chr4_244367_244368;chr4_244443_244444 chr4_244183_244367;chr4_244444_244512 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.26 NA NA NA NA 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8076208999999999e-05 K intron_retention CG33691_CG33692,CG33691,noncoding_22320 chrX + chrX_6766955_6771946 chrX_6766954_6766955;chrX_6771946_6771947 chrX_6766749_6766954;chrX_6771947_6772516 60.00 NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9030400000000003e-07 K intron_retention CG9674,I_chr3L_16785451_16785540,I_chr3L_16785706_16785748,I_chr3L_16793055_16800660 chr3L - chr3L_16785436_16785540 chr3L_16785435_16785436;chr3L_16785540_16785541 chr3L_16785351_16785435;chr3L_16785541_16785640 36.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 14.04 NA NA NA NA NA 16.67 16.22 NA 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3551734321172096e-14 K intron_retention Nrx-IV chr3L + chr3L_12144508_12144919 chr3L_12144507_12144508;chr3L_12144919_12144920 chr3L_12144452_12144507;chr3L_12144920_12145116 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039902 K intron_retention CG5273 chrX + chrX_653719_653808 chrX_653718_653719;chrX_653808_653809 chrX_653471_653718;chrX_653809_654561 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0061679999999999999 K intron_retention meso18E,I_chrX_19601491_19601568 chrX - chrX_19601498_19601568 chrX_19601497_19601498;chrX_19601568_19601569 chrX_19601429_19601497;chrX_19601569_19601635 6.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000121 K intron_retention Dlic chrX + chrX_11048699_11049066 chrX_11048698_11048699;chrX_11049066_11049067 chrX_11048472_11048698;chrX_11049067_11049261 2.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021446 K intron_retention CG3368,Hmu chr3R + chr3R_23109627_23109679 chr3R_23109626_23109627;chr3R_23109679_23109680 chr3R_23109482_23109626;chr3R_23109680_23111749 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048383000000000002 K intron_retention alphaCop chr3L - chr3L_1645062_1645169 chr3L_1645061_1645062;chr3L_1645169_1645170 chr3L_1644012_1645061;chr3L_1645170_1645223 49.09 NA NA NA 17.74 NA NA NA NA NA 22.83 NA 16.25 NA 26.09 NA NA 16.88 NA 28.11 14.08 NA NA NA NA NA NA 76.83 87.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.16 NA 0.0 K intron_retention Zn72D,RF_chr3L_16100887_16102721,I_chr3L_16105199_16105253 chr3L - chr3L_16102155_16102721 chr3L_16102154_16102155;chr3L_16102721_16102722 chr3L_16102090_16102154;chr3L_16102722_16102821 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0054359999999999999 K intron_retention Cirl,R_chr2R_4502755_4503407 chr2R + chr2R_4503584_4503831 chr2R_4503583_4503584;chr2R_4503831_4503832 chr2R_4503575_4503583;chr2R_4503832_4504021 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.89 NA NA NA NA NA NA NA 2.5264400378216998e-10 K intron_retention Pxn,I_chr3L_2629527_2629921 chr3L - chr3L_2629597_2629913 chr3L_2629596_2629597;chr3L_2629913_2629914 chr3L_2629141_2629596;chr3L_2629914_2629921 48.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention ns3,CG32808 chrX - chrX_1356346_1356405 chrX_1356345_1356346;chrX_1356405_1356406 chrX_1356002_1356345;chrX_1356406_1356489 1.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0037880000000000001 K intron_retention Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3354822_3354978 chr2R_3354821_3354822;chr2R_3354978_3354979 chr2R_3354726_3354821;chr2R_3354979_3354987 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA NA NA NA NA 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.52 18.52 NA NA NA NA NA 7.9359703280000004e-09 K intron_retention yuri,F_chr2L_15260838_15261717 chr2L - chr2L_15264096_15264150 chr2L_15264095_15264096;chr2L_15264150_15264151 chr2L_15263770_15264095;chr2L_15264151_15264227 84.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention HP5 chrX + chrX_11351798_11352262 chrX_11351797_11351798;chrX_11352262_11352263 chrX_11350688_11351797;chrX_11352263_11352661 19.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035018000000000001 N intron_retention CG1673 chrX + chrX_13294195_13294879 chrX_13294194_13294195;chrX_13294879_13294880 chrX_13294040_13294194;chrX_13294880_13295313 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030235999999999999 K intron_retention R_chr2R_4502755_4503407,Vps25 chr2R + chr2R_4513081_4513132 chr2R_4513080_4513081;chr2R_4513132_4513133 chr2R_4512956_4513080;chr2R_4513133_4513793 12.12 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9758077100000004e-07 K intron_retention coro,I_chr2R_2754447_2755071 chr2R - chr2R_2751039_2751782 chr2R_2751038_2751039;chr2R_2751782_2751783 chr2R_2750853_2751038;chr2R_2751783_2752076 1.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K intron_retention Art8 chr2L - chr2L_11010898_11010953 chr2L_11010897_11010898;chr2L_11010953_11010954 chr2L_11009879_11010897;chr2L_11010954_11011077 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA 0.010822999999999999 N intron_retention CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1529105 chr3L_1525392_1525393;chr3L_1529105_1529106 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1529106_1529206 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000475 K intron_retention CG4360 chr3R - chr3R_16151951_16152037 chr3R_16151950_16151951;chr3R_16152037_16152038 chr3R_16150089_16151950;chr3R_16152038_16152520 57.58 NA NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA 80.65 NA NA NA NA NA NA NA 80.41 NA NA NA 41.57 NA NA 29.41 NA NA NA 46.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.55 NA 0.0 K intron_retention PMCA,I_chr4_350028_350896,E_chr4_350055_363541,I_chr4_350064_350896,I_chr4_350959_363547,I_chr4_352629_354970,I_chr4_352629_358161,RI_chr4_355160_363547,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_350055_350896 chr4_350054_350055;chr4_350896_350897 chr4_349964_350054;chr4_350897_350958 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035097999999999997 N intron_retention CG2765,RI_chr2R_20849027_20852094,E_chr2R_20849271_20852090,E_chr2R_20851190_20852094 chr2R - chr2R_20851822_20852094 chr2R_20851821_20851822;chr2R_20852094_20852095 chr2R_20851782_20851821;chr2R_20852095_20852190 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.78 NA 83.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0903189459999997e-09 K intron_retention CG3500,RI_chr2R_19244231_19244378 chr2R - chr2R_19244681_19244741 chr2R_19244680_19244681;chr2R_19244741_19244742 chr2R_19244379_19244680;chr2R_19244742_19245088 12.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0356560000000001e-06 K intron_retention CrebB-17A,I_chrX_18261213_18269281,I_chrX_18265640_18266039,I_chrX_18265640_18266060,I_chrX_18265982_18266063 chrX + chrX_18265216_18266063 chrX_18265215_18265216;chrX_18266063_18266064 chrX_18265206_18265215;chrX_18266064_18266139 78.18 NA NA 59.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024215 K intron_retention CG10732,I_chr3L_13438999_13439071 chr3L + chr3L_13438740_13438835 chr3L_13438739_13438740;chr3L_13438835_13438836 chr3L_13437468_13438739;chr3L_13438836_13438998 90.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0024359999999999998 K intron_retention CG10158 chr2L - chr2L_6945070_6945133 chr2L_6945069_6945070;chr2L_6945133_6945134 chr2L_6943508_6945069;chr2L_6945134_6945341 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0056169999999999996 K intron_retention CG8229,CG33199 chr2R - chr2R_4838297_4838415 chr2R_4838296_4838297;chr2R_4838415_4838416 chr2R_4838211_4838296;chr2R_4838416_4838558 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.7999999999999999e-05 K intron_retention I_chr3L_1494947_1496080,pUf68,I_chr3L_1499710_1499771,RI_chr3L_1499880_1501350,I_chr3L_1500309_1501350,I_chr3L_1500313_1501350,RI_chr3L_1500389_1501345,RI_chr3L_1501035_1501345 chr3L - chr3L_1499338_1500244 chr3L_1499337_1499338;chr3L_1500244_1500245 chr3L_1499043_1499337;chr3L_1500245_1500308 67.82 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention rok,RI_chrX_16526333_16526477 chrX - chrX_16520281_16520602 chrX_16520280_16520281;chrX_16520602_16520603 chrX_16519712_16520280;chrX_16520603_16520827 26.47 NA NA 12.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention Rap2l chr2R + chr2R_19952634_19952705 chr2R_19952633_19952634;chr2R_19952705_19952706 chr2R_19952516_19952633;chr2R_19952706_19952928 2.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014685 K intron_retention I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_927771_929704,CG32021,RI_chr4_928180_928245,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_928177_928245 chr4_928176_928177;chr4_928245_928246 chr4_928109_928176;chr4_928246_928314 50.00 NA NA NA NA NA 31.43 NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA 62.07 NA 67.43 NA NA NA NA 68.87 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.67 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Ge-1,Reps,I_chr2L_11105525_11105656 chr2L - chr2L_11100575_11100657 chr2L_11100574_11100575;chr2L_11100657_11100658 chr2L_11100294_11100574;chr2L_11100658_11100866 9.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention PMCA,I_chr4_350028_350896,E_chr4_350055_363541,I_chr4_350064_350896,I_chr4_350959_363547,I_chr4_352629_354970,I_chr4_352629_358161,RI_chr4_355160_363547,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_350966_352023 chr4_350965_350966;chr4_352023_352024 chr4_350897_350965;chr4_352024_352628 84.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011181 K intron_retention CG15445,REI_chrX_20988432_20988485,RI_chrX_20988432_20988489,REI_chrX_20988439_20988489,I_chrX_20988439_20988552 chrX + chrX_20988432_20988485 chrX_20988431_20988432;chrX_20988485_20988486 chrX_20988339_20988431;chrX_20988486_20988585 71.43 NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA 50.88 1.5393234560000001e-21 K intron_retention RI_chrX_6482284_6482336,Pat1,I_chrX_6489999_6490050,APC7 chrX + chrX_6489994_6490050 chrX_6489993_6489994;chrX_6490050_6490051 chrX_6489899_6489993;chrX_6490051_6490150 66.13 NA NA NA NA 77.14 NA NA NA NA 29.03 NA NA NA 77.50 NA NA NA NA NA 40.00 32.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.43 NA NA NA NA NA NA 46.75 NA NA NA NA 45.33 NA NA 47.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG31955,RI_chr2L_3712446_3712767 chr2L - chr2L_3712446_3712767 chr2L_3712445_3712446;chr2L_3712767_3712768 chr2L_3712346_3712445;chr2L_3712768_3712862 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 32.26 56.14 NA NA NA NA 51.11 NA NA NA NA NA 59.76 NA NA 60.32 58.62 NA 47.30 60.49 NA 0.0 K intron_retention unc-13,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_923209_923451 chr4_923208_923209;chr4_923451_923452 chr4_919019_923208;chr4_923452_923908 37.04 NA NA NA NA NA 18.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.31 NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA 20.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.7936000000000001e-22 K intron_retention wech,I_chr2R_3373673_3377000,I_chr2R_3373673_3377045,I_chr2R_3373673_3377324,I_chr2R_3376705_3376837 chr2R - chr2R_3377076_3377150 chr2R_3377075_3377076;chr2R_3377150_3377151 chr2R_3377046_3377075;chr2R_3377151_3377248 0.00 NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026408000000000001 K intron_retention Hr78,I_chr3L_21490089_21490390 chr3L - chr3L_21489842_21489919 chr3L_21489841_21489842;chr3L_21489919_21489920 chr3L_21489527_21489841;chr3L_21489920_21489977 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020161999999999999 K intron_retention CG30389,CEF_chr2R_17041552_17043191,I_chr2R_17044803_17047935 chr2R - chr2R_17043036_17043109 chr2R_17043035_17043036;chr2R_17043109_17043110 chr2R_17042909_17043035;chr2R_17043110_17043173 55.77 NA NA NA NA NA 76.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.74 70.37 NA 41.94 70.27 79.12 NA NA NA NA NA NA NA 83.64 NA NA 73.12 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG9947,eIF-2alpha chrX - chrX_16333548_16333629 chrX_16333547_16333548;chrX_16333629_16333630 chrX_16333481_16333547;chrX_16333630_16333795 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6913529999999998e-06 K intron_retention CG32521,I_chrX_21077138_21082106,I_chrX_21077612_21082713,EI_chrX_21080561_21082106,I_chrX_21080906_21082713,CREF_chrX_21082827_21152068,EF_chrX_21094675_21152068 chrX - chrX_21080561_21082106 chrX_21080560_21080561;chrX_21082106_21082107 chrX_21080549_21080560;chrX_21082107_21082206 39.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA 26.92 NA NA 15.15 NA 16.55 0.0 K intron_retention CG32582,I_chrX_15730402_15730457 chrX + chrX_15730431_15730557 chrX_15730430_15730431;chrX_15730557_15730558 chrX_15730315_15730430;chrX_15730558_15730707 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0056299999999999996 K intron_retention Jhebp29,RI_chr2R_20857941_20857992,RI_chr2R_20857941_20858127 chr2R + chr2R_20857941_20858182 chr2R_20857940_20857941;chr2R_20858182_20858183 chr2R_20857841_20857940;chr2R_20858183_20858227 97.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG7028,I_chr3L_207277_208117 chr3L - chr3L_210400_210475 chr3L_210399_210400;chr3L_210475_210476 chr3L_209784_210399;chr3L_210476_210738 72.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA 43.10 55.56 NA NA NA 41.86 NA NA 56.36 NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention RI_chr2L_8218680_8218853,Pvr,I_chr2L_8229012_8229080,I_chr2L_8230332_8238998 chr2L - chr2L_8221968_8222225 chr2L_8221967_8221968;chr2L_8222225_8222226 chr2L_8221488_8221967;chr2L_8222226_8222376 80.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Spx chrX + chrX_6150136_6150193 chrX_6150135_6150136;chrX_6150193_6150194 chrX_6150052_6150135;chrX_6150194_6151659 1.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002356 N intron_retention stc chr2L + chr2L_15114214_15114448 chr2L_15114213_15114214;chr2L_15114448_15114449 chr2L_15114049_15114213;chr2L_15114449_15115753 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041099999999999999 K intron_retention Or43b,Kdm4A chr2R - chr2R_3808557_3808619 chr2R_3808556_3808557;chr2R_3808619_3808620 chr2R_3808509_3808556;chr2R_3808620_3808977 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.65 NA NA NA 71.43 NA NA NA NA 66.67 NA NA 4.0305466828130546e-08 K intron_retention Su(var)2-10,RI_chr2R_5006333_5006392 chr2R + chr2R_5006553_5007804 chr2R_5006552_5006553;chr2R_5007804_5007805 chr2R_5006405_5006552;chr2R_5007805_5007864 91.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.42 NA NA NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG10948,I_chr3L_12840257_12841136 chr3L - chr3L_12838954_12841469 chr3L_12838953_12838954;chr3L_12841469_12841470 chr3L_12838834_12838953;chr3L_12841470_12842195 22.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.460504000000001e-05 K intron_retention CG6091,E_chr3L_11600447_11600553 chr3L - chr3L_11599572_11599635 chr3L_11599571_11599572;chr3L_11599635_11599636 chr3L_11599357_11599571;chr3L_11599636_11600183 27.03 NA NA NA NA NA NA 14.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA NA NA NA 1.1604758720000001e-08 K intron_retention I_chr3L_20306985_20307177,CG6680 chr3L + chr3L_20310517_20310578 chr3L_20310516_20310517;chr3L_20310578_20310579 chr3L_20310328_20310516;chr3L_20310579_20310888 31.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.85 14.61 1.1393797799999999e-16 K intron_retention CG3744,I_chr3R_20701248_20701968 chr3R - chr3R_20701722_20701968 chr3R_20701721_20701722;chr3R_20701968_20701969 chr3R_20701428_20701721;chr3R_20701969_20702068 70.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.54 NA 55.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.26 NA NA NA NA NA NA NA 54.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 0.0 K intron_retention dlg1,I_chrX_11298230_11299306 chrX + chrX_11283815_11284263 chrX_11283814_11283815;chrX_11284263_11284264 chrX_11283738_11283814;chrX_11284264_11284573 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7400000000000002e-09 K intron_retention I_chrX_1962457_1964222,CG4045 chrX - chrX_1969005_1969070 chrX_1969004_1969005;chrX_1969070_1969071 chrX_1968805_1969004;chrX_1969071_1969172 3.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034875999999999997 K intron_retention CG7375 chr3L - chr3L_8190803_8190878 chr3L_8190802_8190803;chr3L_8190878_8190879 chr3L_8190622_8190802;chr3L_8190879_8190964 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5999999999999998e-05 K intron_retention CG14782,mei-38 chrX + chrX_1371322_1371408 chrX_1371321_1371322;chrX_1371408_1371409 chrX_1371127_1371321;chrX_1371409_1372262 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003359 K intron_retention l(2)k05819,I_chr2L_4396173_4396266 chr2L + chr2L_4396128_4396809 chr2L_4396127_4396128;chr2L_4396809_4396810 chr2L_4396073_4396127;chr2L_4396810_4396906 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021150000000000001 N intron_retention Aldolase,I_chr3R_22083764_22086684 chr3R - chr3R_22082030_22082256 chr3R_22082029_22082030;chr3R_22082256_22082257 chr3R_22081992_22082029;chr3R_22082257_22082345 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA 62.50 5.2055791843815796e-09 K intron_retention scra,EI_chr2R_3480349_3480405 chr2R + chr2R_3478931_3479011 chr2R_3478930_3478931;chr2R_3479011_3479012 chr2R_3478451_3478930;chr2R_3479012_3479378 75.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.31 NA 60.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Nipped-B,I_chr2R_580301_580515,I_chr2R_580453_580515,I_chr2R_580989_582555,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_580301_580367 chr2R_580300_580301;chr2R_580367_580368 chr2R_580236_580300;chr2R_580368_580452 88.57 NA NA NA NA NA 74.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6319999999999995e-09 K intron_retention TMS1 chr3L + chr3L_16407594_16407920 chr3L_16407593_16407594;chr3L_16407920_16407921 chr3L_16407384_16407593;chr3L_16407921_16408056 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.09 0.037318999999999998 K intron_retention Tpi chr3R - chr3R_25959817_25959972 chr3R_25959816_25959817;chr3R_25959972_25959973 chr3R_25959232_25959816;chr3R_25959973_25960005 20.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000102 K intron_retention tub,CRE_chr3R_214119_214182 chr3R + chr3R_214115_214180 chr3R_214114_214115;chr3R_214180_214181 chr3R_214019_214114;chr3R_214181_215535 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016309000000000001 K intron_retention Moca-cyp chr3R + chr3R_24167182_24167906 chr3R_24167181_24167182;chr3R_24167906_24167907 chr3R_24167094_24167181;chr3R_24167907_24167936 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 7.84 NA 29.17 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.81 NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.41 0.0 K intron_retention Best1,I_chr3R_5991957_5995913,RI_chr3R_5993184_5995905 chr3R - chr3R_5989579_5990440 chr3R_5989578_5989579;chr3R_5990440_5990441 chr3R_5988921_5989578;chr3R_5990441_5990683 9.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002496 K intron_retention CG42518,F_chr2R_14055227_14055470 chr2R + chr2R_14055227_14055277 chr2R_14055226_14055227;chr2R_14055277_14055278 chr2R_14055163_14055226;chr2R_14055278_14055643 3.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018643 K intron_retention vsg,I_chr3L_9707724_9708265 chr3L + chr3L_9707500_9707605 chr3L_9707499_9707500;chr3L_9707605_9707606 chr3L_9707380_9707499;chr3L_9707606_9707723 7.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000825 K intron_retention cdc2c,RI_chr3R_16562395_16562445 chr3R + chr3R_16562652_16562706 chr3R_16562651_16562652;chr3R_16562706_16562707 chr3R_16562454_16562651;chr3R_16562707_16562906 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015847 K intron_retention CycG,I_chr3R_27427946_27436602,I_chr3R_27427953_27429034,I_chr3R_27427953_27431334,RE_chr3R_27427953_27436598 chr3R - chr3R_27428796_27436602 chr3R_27428795_27428796;chr3R_27436602_27436603 chr3R_27428793_27428795;chr3R_27436603_27436698 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017730000000000001 K intron_retention E(bx),I_chr3L_236428_236553,RI_chr3L_236428_236858,RI_chr3L_236451_239054,RI_chr3L_236508_236862,I_chr3L_239004_239054,I_chr3L_239186_239264,I_chr3L_246324_246699 chr3L - chr3L_236428_239054 chr3L_236427_236428;chr3L_239054_239055 chr3L_236408_236427;chr3L_239055_239154 35.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 21.95 NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8745039999999989e-10 K intron_retention CG9945,CG16742 chr2R + chr2R_16506933_16506984 chr2R_16506932_16506933;chr2R_16506984_16506985 chr2R_16506786_16506932;chr2R_16506985_16507524 23.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039940000000000003 K intron_retention CG11504 chr3R + chr3R_25823929_25823992 chr3R_25823928_25823929;chr3R_25823992_25823993 chr3R_25823519_25823928;chr3R_25823993_25825473 39.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029128999999999999 K intron_retention RI_chrX_7172561_7252693,CG1677,I_chrX_7178792_7252693,Atg5 chrX - chrX_7209284_7216399 chrX_7209283_7209284;chrX_7216399_7216400 chrX_7208648_7209283;chrX_7216400_7216505 24.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043619999999999999 K intron_retention del chr2L - chr2L_21146886_21146948 chr2L_21146885_21146886;chr2L_21146948_21146949 chr2L_21145134_21146885;chr2L_21146949_21147823 33.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA 1.7249530225119999e-05 K intron_retention RI_chr2L_1170364_1170429,CG4887,REI_chr2L_1179197_1179859 chr2L + chr2L_1174571_1174909 chr2L_1174570_1174571;chr2L_1174909_1174910 chr2L_1174497_1174570;chr2L_1174910_1174987 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024454 K intron_retention Atg2 chr3L + chr3L_2774487_2774567 chr3L_2774486_2774487;chr3L_2774567_2774568 chr3L_2774319_2774486;chr3L_2774568_2780718 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010213 K intron_retention CG8671,I_chr2L_21275807_21277205 chr2L + chr2L_21278430_21281131 chr2L_21278429_21278430;chr2L_21281131_21281132 chr2L_21277782_21278429;chr2L_21281132_21281337 2.86 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036518000000000002 K intron_retention CG1943,I_chr3R_2900855_2902611,I_chr3R_2901072_2902611,I_chr3R_2901508_2902611,I_chr3R_2902064_2902611 chr3R + chr3R_2902559_2902611 chr3R_2902558_2902559;chr3R_2902611_2902612 chr3R_2902529_2902558;chr3R_2902612_2902711 82.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.87 NA 4.8566232040795563e-08 K intron_retention CG11357,I_chr3L_4542781_4542858,C_chr3L_4563905_4578759 chr3L + chr3L_4542249_4542642 chr3L_4542248_4542249;chr3L_4542642_4542643 chr3L_4542167_4542248;chr3L_4542643_4542907 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA 56.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG13551,I_chr2R_19265696_19270137,I_chr2R_19265701_19270570 chr2R - chr2R_19265701_19270570 chr2R_19265700_19265701;chr2R_19270570_19270571 chr2R_19265601_19265700;chr2R_19270571_19270645 72.73 NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000136 K intron_retention dare chr2R - chr2R_7179924_7180310 chr2R_7179923_7179924;chr2R_7180310_7180311 chr2R_7179551_7179923;chr2R_7180311_7180611 41.42 NA NA NA NA NA NA 22.22 NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.010787623850047e-15 K intron_retention CG31211 chr3R + chr3R_7778778_7778834 chr3R_7778777_7778778;chr3R_7778834_7778835 chr3R_7778549_7778777;chr3R_7778835_7779756 47.56 NA NA 64.29 59.09 NA NA 62.07 NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA 62.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.94 NA NA NA 63.89 30.56 NA NA 29.70 NA NA NA 28.21 34.09 NA 31.51 28.57 NA NA NA NA 27.03 NA NA NA NA 30.34 0.0 K intron_retention E_chr2RHet_2881760_2912543,eIF-4B,I_chr2RHet_2903246_2904697,I_chr2RHet_2903246_2912532,I_chr2RHet_2904787_2912543,I_chr2RHet_2912605_2917250 chr2RHet + chr2RHet_2903246_2903321 chr2RHet_2903245_2903246;chr2RHet_2903321_2903322 chr2RHet_2903146_2903245;chr2RHet_2903322_2903592 81.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.23 NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.67 NA NA 57.14 NA NA NA 53.85 66.67 NA NA NA NA NA NA 64.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.025415184010065e-24 K intron_retention I_chr2L_4834257_4835246,CG15626,I_chr2L_4837691_4837844,I_chr2L_4837780_4837844 chr2L - chr2L_4837640_4837844 chr2L_4837639_4837640;chr2L_4837844_4837845 chr2L_4837602_4837639;chr2L_4837845_4837944 19.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023618 K intron_retention cul-2,I_chr2L_21658962_21659119,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21658855_21659094 chr2L_21658854_21658855;chr2L_21659094_21659095 chr2L_21658557_21658854;chr2L_21659095_21659272 61.90 NA NA NA NA NA 75.79 41.41 NA 75.68 47.06 NA 39.68 NA NA 44.63 NA 42.19 NA 43.12 37.50 82.76 75.81 75.93 83.56 NA 78.17 89.74 75.00 76.60 NA 72.97 NA NA NA 78.67 NA NA NA NA 83.58 NA NA NA NA NA NA NA 44.88 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.36 0.0 K intron_retention CG9346 chr2R + chr2R_16899784_16899839 chr2R_16899783_16899784;chr2R_16899839_16899840 chr2R_16899667_16899783;chr2R_16899840_16900126 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0038630000000000001 K intron_retention R_chr2L_8083458_8089184,R_chr2L_8083458_8089393,Bsg,I_chr2L_8088454_8089057,I_chr2L_8107426_8107747 chr2L + chr2L_8083522_8089393 chr2L_8083521_8083522;chr2L_8089393_8089394 chr2L_8083444_8083521;chr2L_8089394_8089493 65.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA 39.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9427059999999986e-06 K intron_retention CG30046 chr2R + chr2R_8202797_8202857 chr2R_8202796_8202797;chr2R_8202857_8202858 chr2R_8202597_8202796;chr2R_8202858_8203112 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043721999999999997 K intron_retention Upf1,I_chrX_11799010_11799076 chrX - chrX_11798981_11799067 chrX_11798980_11798981;chrX_11799067_11799068 chrX_11798910_11798980;chrX_11799068_11799388 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.94 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 44.00 0.0 K intron_retention crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11803675_11803784 chr2L_11803674_11803675;chr2L_11803784_11803785 chr2L_11803284_11803674;chr2L_11803785_11803898 27.72 NA NA 8.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention CG1902,CG30000,I_chr2R_5495525_5495581 chr2R + chr2R_5491686_5491749 chr2R_5491685_5491686;chr2R_5491749_5491750 chr2R_5491374_5491685;chr2R_5491750_5492116 31.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.26 0.0 K intron_retention CG41511 chr3LHet - chr3LHet_2198746_2198800 chr3LHet_2198745_2198746;chr3LHet_2198800_2198801 chr3LHet_2198346_2198745;chr3LHet_2198801_2199123 4.21 NA NA 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K intron_retention CG10260 chrX + chrX_2519147_2519604 chrX_2519146_2519147;chrX_2519604_2519605 chrX_2519051_2519146;chrX_2519605_2519818 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014079 K intron_retention CG15356 chr2L - chr2L_1980428_1980551 chr2L_1980427_1980428;chr2L_1980551_1980552 chr2L_1980253_1980427;chr2L_1980552_1980747 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0047089999999999996 K intron_retention LanB1,RI_chr2L_7820401_7820448,RI_chr2L_7820405_7820461 chr2L + chr2L_7820401_7820448 chr2L_7820400_7820401;chr2L_7820448_7820449 chr2L_7820305_7820400;chr2L_7820449_7820548 14.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0029090000000000001 K intron_retention CG5537,I_chr3L_5804425_5804485 chr3L + chr3L_5805080_5805164 chr3L_5805079_5805080;chr3L_5805164_5805165 chr3L_5804486_5805079;chr3L_5805165_5805330 54.84 NA NA 74.68 NA NA 85.37 NA NA 78.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.44 NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K intron_retention Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11824525 chr2R_11824085_11824086;chr2R_11824525_11824526 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11824526_11824611 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.35 49.12 NA NA 52.54 NA NA 1.2338169480000002e-09 K intron_retention Ets97D chr3R - chr3R_22738041_22738095 chr3R_22738040_22738041;chr3R_22738095_22738096 chr3R_22737326_22738040;chr3R_22738096_22738165 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014626 K intron_retention CG32276,I_chr3L_3199079_3199219 chr3L - chr3L_3198867_3198992 chr3L_3198866_3198867;chr3L_3198992_3198993 chr3L_3198752_3198866;chr3L_3198993_3199078 5.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.7999999999999999e-05 K intron_retention Nipped-B,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_614591_614662 chr2R_614590_614591;chr2R_614662_614663 chr2R_614353_614590;chr2R_614663_614712 22.22 NA NA NA NA NA 9.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.55e-10 K intron_retention dwg,RI_chrX_2622297_2622355,RI_chrX_2622297_2622430,RI_chrX_2622435_2622577,RI_chrX_2627170_2627263 chrX + chrX_2622297_2622577 chrX_2622296_2622297;chrX_2622577_2622578 chrX_2622197_2622296;chrX_2622578_2622677 20.83 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.93 9.5757787000000011e-05 K intron_retention endos,I_chr3L_14024099_14024488,I_chr3L_14024103_14024158,I_chr3L_14024103_14024546,noncoding_12505,I_chr3L_14024496_14024546 chr3L - chr3L_14024103_14024546 chr3L_14024102_14024103;chr3L_14024546_14024547 chr3L_14024003_14024102;chr3L_14024547_14024588 93.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000435 K intron_retention RI_chr2L_22735482_22741701,CG17715,I_chr2L_22737141_22741701,I_chr2L_22742106_22746918 chr2L + chr2L_22737141_22737199 chr2L_22737140_22737141;chr2L_22737199_22737200 chr2L_22737072_22737140;chr2L_22737200_22737268 38.03 NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.68 NA NA NA 19.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.81 NA 0.0 K intron_retention CG5382,CG5380 chr3R - chr3R_18190680_18190740 chr3R_18190679_18190680;chr3R_18190740_18190741 chr3R_18190245_18190679;chr3R_18190741_18190942 1.82 NA NA 25.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00032872784399999995 K intron_retention th,I_chr3L_16033166_16034018,I_chr3L_16033166_16035885,I_chr3L_16036172_16039584,I_chr3L_16036172_16043557,RI_chr3L_16038514_16039584,RI_chr3L_16038543_16039584,RI_chr3L_16039065_16039584 chr3L - chr3L_16033166_16037613 chr3L_16033165_16033166;chr3L_16037613_16037614 chr3L_16033066_16033165;chr3L_16037614_16037682 45.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00114 K intron_retention mib2 chr2L + chr2L_19035866_19037803 chr2L_19035865_19035866;chr2L_19037803_19037804 chr2L_19035761_19035865;chr2L_19037804_19037971 1.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0047790000000000003 K intron_retention CG4572,FI_chr3R_15689914_15690042 chr3R - chr3R_15689914_15689997 chr3R_15689913_15689914;chr3R_15689997_15689998 chr3R_15689814_15689913;chr3R_15689998_15690036 83.33 60.00 NA NA NA NA 62.86 NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.11282399126e-06 K intron_retention pyd,I_chr3R_4654041_4664113,I_chr3R_4749124_4756437 chr3R - chr3R_4654041_4657863 chr3R_4654040_4654041;chr3R_4657863_4657864 chr3R_4653941_4654040;chr3R_4657864_4657996 13.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA 0.00034573966000000004 K intron_retention Ntf-2,RI_chrX_20906749_20906857,I_chrX_20906749_20909772 chrX + chrX_20906749_20906857 chrX_20906748_20906749;chrX_20906857_20906858 chrX_20906649_20906748;chrX_20906858_20906957 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011875 K intron_retention CG9153,Myo61F chr3L + chr3L_1314321_1314472 chr3L_1314320_1314321;chr3L_1314472_1314473 chr3L_1314158_1314320;chr3L_1314473_1314709 37.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.70 25.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N intron_retention Rpn5 chr3R + chr3R_1615349_1615402 chr3R_1615348_1615349;chr3R_1615402_1615403 chr3R_1615211_1615348;chr3R_1615403_1615415 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.2000000000000001e-05 K intron_retention Arf102F,RI_chr4_1144958_1145393,I_chr4_1152220_1152710,I_chr4_1152585_1152687 chr4 + chr4_1145520_1145575 chr4_1145519_1145520;chr4_1145575_1145576 chr4_1145453_1145519;chr4_1145576_1145637 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020379000000000001 K intron_retention Trc8 chr3R - chr3R_25325038_25325093 chr3R_25325037_25325038;chr3R_25325093_25325094 chr3R_25324969_25325037;chr3R_25325094_25325221 79.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.71 NA NA NA NA NA NA 60.78 NA 65.62 NA NA NA NA 0.0 K intron_retention RPA2,RI_chr2L_20925851_20925909 chr2L - chr2L_20925851_20925913 chr2L_20925850_20925851;chr2L_20925913_20925914 chr2L_20925751_20925850;chr2L_20925914_20925975 2.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011827000000000001 K intron_retention Prat chr3R - chr3R_3737339_3737415 chr3R_3737338_3737339;chr3R_3737415_3737416 chr3R_3735310_3737338;chr3R_3737416_3737540 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001289 K intron_retention norpA,I_chrX_4219265_4219380 chrX + chrX_4248057_4251072 chrX_4248056_4248057;chrX_4251072_4251073 chrX_4247997_4248056;chrX_4251073_4251309 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.52 NA NA NA NA NA NA NA 2.3046511053600001e-06 K intron_retention CG12581,I_chr3R_488_577,I_chr3R_519_577,I_chr3R_9380_9438 chr3R + chr3R_510_577 chr3R_509_510;chr3R_577_578 chr3R_419_509;chr3R_578_677 75.00 NA NA NA NA NA 64.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA 57.69 NA NA NA NA NA NA 55.00 2.1917970567811818e-12 K alternative_donor mle chr2R - chr2R_1867143_1867547 chr2R_1867143_1867205 chr2R_1866824_1867142;chr2R_1867548_1867556 63.64 NA 47.37 NA 46.15 NA 47.62 NA NA NA 41.18 NA 50.00 NA 50.00 40.00 NA 36.84 NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA 50.00 NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA 50.00 NA 3.5086284857386866e-31 K alternative_donor RI_chr3R_5165997_5180143,CG33936,noncoding_15544,I_chr3R_5167726_5180143,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5167648_5167941;chr3R_5167726_5167941 chr3R_5167693_5167941 chr3R_5167942_5167998;chr3R_5167626_5167647 17.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.47 7.84 NA NA NA NA NA 6.67 NA NA 32.91 NA NA NA NA 6.85 NA NA 7.41 NA NA NA NA 6.82 NA NA NA NA NA 30.38 NA 0.0 K alternative_donor n-syb,I_chr3L_1637270_1637558,metl chr3L - chr3L_1638855_1639041 chr3L_1638855_1638908 chr3L_1637903_1638854;chr3L_1639042_1639220 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.29 NA NA NA NA 10.84 NA NA NA NA NA NA NA 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5469767195811201e-10 N alternative_donor Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11824525;chr2R_11824086_11825790 chr2R_11824086_11824186 chr2R_11823989_11824085 37.68 NA NA NA 57.58 26.00 NA NA NA NA 25.00 63.01 NA NA NA 57.95 NA NA 58.33 NA 27.50 71.43 NA NA 50.00 50.00 NA 57.75 61.40 50.88 NA NA 60.24 NA NA NA NA NA NA NA 65.12 NA NA 50.00 62.37 48.05 NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor Hcf,I_chr4_391984_392875 chr4 + chr4_380602_381212;chr4_380911_381212;chr4_380646_381212;chr4_380607_381212 chr4_380985_381212 chr4_381213_381632;chr4_380600_380601 14.29 NA NA 43.48 NA NA NA NA 37.04 NA NA 50.00 NA 44.44 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6859090152258699e-19 K alternative_donor skpA chrX + chrX_550498_551131;chrX_550818_551131;chrX_550638_551131;chrX_550774_551131;chrX_550523_551131;chrX_550654_551131 chrX_550433_551131 chrX_551132_551937;chrX_550426_550432 34.44 NA NA NA NA NA NA NA 50.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA 1.64 NA NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA 15.12 13.64 NA NA NA NA 14.29 NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.91 0.0 K alternative_donor CG10359,CG10357 chr3L + chr3L_3613883_3614069 chr3L_3613961_3614069 chr3L_3614070_3614253;chr3L_3613749_3613882 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018568000000000001 K alternative_donor Npc1a chr2L - chr2L_10218890_10220868;chr2L_10218890_10220796;chr2L_10218890_10220834 chr2L_10218890_10220692 chr2L_10218779_10218889;chr2L_10220869_10220873 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.2285000000000001e-07 K alternative_donor CG15738,RI_chrX_11786544_11786762 chrX + chrX_11786437_11786762 chrX_11786544_11786762 chrX_11786763_11786862;chrX_11786322_11786436 0.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.580012e-06 K alternative_donor wdb,I_chr3R_23394314_23406731,I_chr3R_23394314_23406794,I_chr3R_23394314_23407159,RI_chr3R_23394314_23407186,I_chr3R_23394314_23407412,I_chr3R_23394314_23407715,I_chr3R_23394314_23407721,RI_chr3R_23406048_23406731,RI_chr3R_23406048_23406794,I_chr3R_23406048_23406928,RI_chr3R_23406048_23407402 chr3R - chr3R_23406048_23406928;chr3R_23406048_23407402;chr3R_23406048_23407723 chr3R_23406048_23406865 chr3R_23405948_23406047;chr3R_23407724_23407815 16.67 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA 34.57 NA 6.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RI_chr2R_12912984_12913058,RhoGEF2 chr2R + chr2R_12914849_12916177;chr2R_12914834_12916177;chr2R_12914845_12916177 chr2R_12914941_12916177 chr2R_12916178_12916526;chr2R_12914830_12914833 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00031599999999999998 K alternative_donor lig,CI_chr2R_3962006_3962916,RI_chr2R_3962875_3962977 chr2R + chr2R_3963608_3963797 chr2R_3963614_3963797 chr2R_3963798_3963953;chr2R_3963365_3963607 60.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022633 K alternative_donor CG5021 chr3L + chr3L_8960084_8960227 chr3L_8960093_8960227 chr3L_8960228_8960310;chr3L_8959939_8960083 22.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0079539999999999993 K alternative_donor crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11800323_11802904;chr2L_11800323_11802370;chr2L_11800323_11802343 chr2L_11800323_11802286 chr2L_11800155_11800322;chr2L_11802905_11803004 46.37 NA NA 28.31 NA NA NA NA NA 62.26 NA NA NA NA NA NA NA 34.86 NA NA NA 32.19 NA NA NA NA NA 29.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Crag,I_chrX_8487355_8487512,I_chrX_8494280_8494352 chrX + chrX_8486625_8487512 chrX_8487355_8487512 chrX_8487513_8487612;chrX_8486279_8486624 2.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor p53,CG17119,sav chr3R - chr3R_18876847_18878643 chr3R_18876847_18876911 chr3R_18876537_18876846;chr3R_18878644_18878670 53.85 NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA 26.32 5.1049222773711837e-08 N alternative_donor CG15908_CG9410,CG15908,CG9410 chr2R + chr2R_2556730_2556834 chr2R_2556738_2556834 chr2R_2556835_2556939;chr2R_2556598_2556729 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000216721086 K alternative_donor Rho1,I_chr2R_11990455_11992537,RI_chr2R_11991687_11992537 chr2R + chr2R_11990362_11991115;chr2R_11990326_11991115;chr2R_11990814_11991115 chr2R_11990398_11991115 chr2R_11991116_11991279;chr2R_11990232_11990325 54.35 NA NA NA NA NA NA 66.86 NA NA NA NA 64.62 42.69 NA 65.09 NA NA NA NA NA 31.52 NA NA 42.86 NA NA NA NA 19.61 NA NA 42.55 NA 65.06 NA NA NA NA 41.41 NA NA 66.06 42.67 26.00 41.24 NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.32 0.0 K alternative_donor MB8.chr3R.pasa.66,CG1091,RI_chr3R_2910204_2910255,RI_chr3R_2910490_2910686,RI_chr3R_2911041_2911135,RI_chr3R_2946518_2946663 chr3R - chr3R_2910204_2910264 chr3R_2910204_2910255 chr3R_2910104_2910203;chr3R_2910265_2910355 2.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041876999999999998 K alternative_donor nes chr3L - chr3L_19253331_19253632;chr3L_19253331_19253636;chr3L_19253331_19253609;chr3L_19253331_19253676;chr3L_19253331_19253745;chr3L_19253331_19253764 chr3L_19253331_19253648 chr3L_19253215_19253330;chr3L_19253765_19253779 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042081 K alternative_donor CG2258,I_chrX_7993647_7995101,I_chrX_7993647_7995119,I_chrX_7993650_7995126,I_chrX_7994188_7995101 chrX - chrX_7993650_7995978;chrX_7993650_7995119 chrX_7993650_7995101 chrX_7993643_7993649;chrX_7995979_7996028 44.44 NA NA 66.67 NA NA NA 54.55 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA 2.060497895550298e-16 K alternative_donor CG33129,I_chr2L_10966410_10967142,noncoding_2515,I_chr2L_10966622_10967108 chr2L - chr2L_10966622_10968104;chr2L_10966622_10968083;chr2L_10966622_10967855 chr2L_10966622_10968133 chr2L_10966522_10966621;chr2L_10968134_10968152 93.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA 1.2430759834349999e-12 N alternative_donor CG34126,I_chr2L_4984636_4984712 chr2L + chr2L_4987241_4987906;chr2L_4987319_4987906 chr2L_4987298_4987906 chr2L_4987907_4988048;chr2L_4987159_4987240 7.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG7048,I_chr3R_18313003_18313231,R_chr3R_18313119_18313234,I_chr3R_18313402_18313502 chr3R + chr3R_18313003_18313231 chr3R_18313115_18313231 chr3R_18313232_18313331;chr3R_18312937_18313002 99.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Psn,RI_chr3L_20430213_20430358 chr3L + chr3L_20427346_20427647;chr3L_20427403_20427647 chr3L_20427445_20427647 chr3L_20427648_20427812;chr3L_20427187_20427345 11.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor lt,I_chr2L_22831575_22832085,I_chr2L_22832038_22832092,RI_chr2L_22832567_22832623 chr2L + chr2L_22832742_22832804 chr2L_22832746_22832804 chr2L_22832805_22832867;chr2L_22832624_22832741 82.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.007038 K alternative_donor Hairless chr3R + chr3R_16447945_16448305;chr3R_16447850_16448305 chr3R_16448221_16448305 chr3R_16448306_16449020;chr3R_16447843_16447849 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00016273443199999997 K alternative_donor Atet,chr2L_4334987_4335394.0,chr2L_4335788_4336447.0 chr2L + chr2L_4334440_4336449;chr2L_4334111_4336449;chr2L_4334031_4336449 chr2L_4334105_4336449 chr2L_4336450_4336957;chr2L_4333936_4334030 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG15625 chr2L + chr2L_4890368_4890428 chr2L_4890372_4890428 chr2L_4890429_4891378;chr2L_4889995_4890367 0.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013913999999999999 K alternative_donor Best1,I_chr3R_5991957_5995913,RI_chr3R_5993184_5995905 chr3R - chr3R_5989579_5990296;chr3R_5989579_5990440 chr3R_5989579_5990058 chr3R_5988921_5989578;chr3R_5990441_5990683 6.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Moe,I_chrX_8774434_8791759 chrX - chrX_8785657_8785766 chrX_8785657_8785727 chrX_8785595_8785656;chrX_8785767_8785791 95.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Art3,I_chr3R_11054902_11054955 chr3R - chr3R_11054902_11054972;chr3R_11054902_11054965 chr3R_11054902_11054955 chr3R_11054802_11054901;chr3R_11054973_11055055 2.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0030040000000000002 N alternative_donor MAPk-Ak2,RI_chrX_5655618_5656137,I_chrX_5656715_5657427,I_chrX_5656715_5657893,I_chrX_5656715_5657974 chrX - chrX_5656678_5658141 chrX_5656678_5658126 chrX_5656615_5656677;chrX_5658142_5658214 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4941581199999999e-15 K alternative_donor RI_chrX_6482284_6482336,Pat1,I_chrX_6489999_6490050,APC7 chrX + chrX_6489994_6490050 chrX_6489999_6490050 chrX_6490051_6490150;chrX_6489899_6489993 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000257024274 K alternative_donor Apc chr3R - chr3R_24666548_24670281 chr3R_24666548_24667940 chr3R_24662621_24666547;chr3R_24670282_24670491 1.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RhoGAPp190,I_chrX_17544272_17544863,I_chrX_17546225_17546531 chrX - chrX_17544272_17546531;chrX_17544272_17546421 chrX_17544272_17546123 chrX_17544172_17544271;chrX_17546532_17546535 34.43 NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 2.9819022245212333e-11 K alternative_donor PNUTS,I_chr2L_870553_871317 chr2L + chr2L_870553_871340 chr2L_871275_871340 chr2L_871341_871417;chr2L_870478_870552 31.94 20.00 NA NA NA NA NA NA 19.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA 21.67 NA NA NA 12.20 16.07 NA NA NA NA NA 15.12 NA NA 21.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Akt1 chr3R + chr3R_11926502_11926621;chr3R_11924988_11926621;chr3R_11925318_11926621;chr3R_11925014_11926621 chr3R_11925383_11926621 chr3R_11926622_11926719;chr3R_11924974_11924987 40.00 NA 53.45 NA NA 21.05 NA NA 27.27 NA NA NA NA 20.75 14.29 58.62 NA 62.50 NA 54.33 20.00 26.67 NA 54.84 NA NA NA 28.26 22.22 25.00 NA NA 25.68 NA 62.75 NA 26.51 59.09 29.17 NA NA NA NA NA 14.29 52.00 64.15 NA NA 56.00 77.14 NA 54.84 54.55 NA NA 60.00 64.10 0.0 K alternative_donor I_chr2L_8213024_8213227,CG8360 chr2L + chr2L_8213261_8213336 chr2L_8213283_8213336 chr2L_8213337_8213402;chr2L_8213228_8213260 87.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023796000000000001 K alternative_donor RpL36,RI_chrX_522912_523358,I_chrX_522932_523360,I_chrX_522949_523360 chrX - chrX_522912_523360;chrX_522912_523215;chrX_522912_523194;chrX_522912_523323;chrX_522912_523389 chrX_522912_523414 chrX_522849_522911;chrX_523415_523436 44.35 NA NA 72.56 NA NA 27.61 65.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.78 16.38 24.56 23.33 21.82 NA 62.73 NA NA NA 66.67 NA 60.16 NA NA 15.05 20.00 23.40 75.72 NA 69.67 NA 68.16 60.85 NA NA NA 59.44 NA 20.62 24.10 NA NA NA NA NA 58.03 0.0 N alternative_donor CG2003 chr3R + chr3R_27815249_27815312;chr3R_27815189_27815312 chr3R_27815253_27815312 chr3R_27815313_27816636;chr3R_27815109_27815188 2.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.82 NA NA NA NA NA 12.96 12.50 NA NA NA NA NA NA NA 12.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.96 NA NA 0.0 K alternative_donor CG34394,I_chr2L_3365674_3365965 chr2L - chr2L_3367720_3367903 chr2L_3367720_3367850 chr2L_3367245_3367719;chr2L_3367904_3368056 2.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001338 K alternative_donor CycT,I_chr3L_17548631_17550687 chr3L - chr3L_17548631_17549473 chr3L_17548631_17549242 chr3L_17548531_17548630;chr3L_17549474_17549519 24.07 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.5662374000000007e-10 K alternative_donor CG2926,I_chr3R_1410401_1410501,I_chr3R_1410558_1410893,I_chr3R_1410841_1410893 chr3R - chr3R_1410401_1410893 chr3R_1410401_1410501 chr3R_1410301_1410400;chr3R_1410894_1410993 0.00 NA NA 12.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K alternative_donor Myo31DF,I_chr2L_10506249_10506683,I_chr2L_10506446_10506542 chr2L - chr2L_10506107_10506683 chr2L_10506107_10506542 chr2L_10505926_10506106;chr2L_10506684_10506780 16.50 NA NA NA NA NA 36.26 NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.98 NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA 28.95 NA NA NA NA 27.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3629459300245504e-20 K alternative_donor alpha-Adaptin,I_chr2L_413655_413722 chr2L - chr2L_413655_414442 chr2L_413655_413722 chr2L_413555_413654;chr2L_414443_414852 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.2362000000000003e-08 K alternative_donor CG31999,I_chr4_240711_240769,I_chr4_243657_244182 chr4 - chr4_239007_239078 chr4_239007_239071 chr4_238874_239006;chr4_239079_239137 95.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046343000000000002 N alternative_donor noncoding_14363 chr3LHet - chr3LHet_709742_709797 chr3LHet_709742_709795 chr3LHet_709691_709741;chr3LHet_709798_709832 53.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031403 K alternative_donor CG31431 chr3R + chr3R_17696730_17697703;chr3R_17696581_17697703;chr3R_17696702_17697703 chr3R_17696656_17697703 chr3R_17697704_17697862;chr3R_17696406_17696580 7.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Eps-15,I_chr2R_20660319_20660496 chr2R - chr2R_20660319_20660496 chr2R_20660319_20660463 chr2R_20660219_20660318;chr2R_20660497_20660521 96.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0085929999999999999 K alternative_donor CG32758 chrX - chrX_5615236_5615299 chrX_5615236_5615294 chrX_5613769_5615235;chrX_5615300_5615729 61.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00054600000000000004 K alternative_donor I_chr2R_9844856_9845327,CG13349,RI_chr2R_9846641_9846709 chr2R - chr2R_9847615_9847752;chr2R_9847615_9847732 chr2R_9847615_9847823 chr2R_9847073_9847614;chr2R_9847824_9847834 2.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 0.0035119999999999999 K alternative_donor I_chr3R_17177101_17200781,mod(mdg4),RI_chr3R_17178359_17178534 chr3R - chr3R_17178359_17200781 chr3R_17178359_17178534 chr3R_17178259_17178358;chr3R_17200782_17200881 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 16.67 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG2177,I_chr4_334269_334329,I_chr4_334269_334505 chr4 - chr4_334269_334329;chr4_334269_334373 chr4_334269_334324 chr4_334169_334268;chr4_334374_334429 9.94 NA NA NA NA NA 26.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.2999999999999998e-05 K alternative_donor I_chr2R_5999081_6000140,E_chr2R_6001157_6001630,CG11866 chr2R + chr2R_6005374_6005536 chr2R_6005405_6005536 chr2R_6005537_6006047;chr2R_6005198_6005373 8.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0071650000000000004 K alternative_donor CG9705,I_chr3L_16774043_16774562 chr3L + chr3L_16773891_16774562 chr3L_16774043_16774562 chr3L_16774563_16774662;chr3L_16773605_16773890 6.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG4290,RI_chrX_1954878_1955077,I_chrX_1962457_1964222 chrX - chrX_1954878_1955654 chrX_1954878_1955077 chrX_1954809_1954877;chrX_1955655_1955758 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010938417599999999 K alternative_donor CG13124,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908142_9908424,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9907784_9908531;chr2L_9907784_9908307;chr2L_9907784_9908405 chr2L_9907784_9908424 chr2L_9907756_9907783;chr2L_9908532_9908619 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0057840000000000001 K alternative_donor fws,CG6453 chr2L - chr2L_17480920_17480972;chr2L_17480920_17481149;chr2L_17480920_17480983 chr2L_17480920_17480968 chr2L_17480825_17480919;chr2L_17481150_17481199 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 0.018279 K alternative_donor CG6236 chr3R - chr3R_11153785_11153849;chr3R_11153785_11153869 chr3R_11153785_11153876 chr3R_11153649_11153784;chr3R_11153877_11153988 79.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049059999999999999 N alternative_donor CG17760 chr2R + chr2R_8513482_8514257;chr2R_8513731_8514257 chr2R_8513642_8514257 chr2R_8514258_8514421;chr2R_8513465_8513481 85.71 NA NA NA NA NA 72.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031440000000000003 N alternative_donor Uhg3,noncoding_4006,E_chr2L_20647810_20648188,R_chr2L_20648002_20648194,snoRNA:Me28S-C2645b chr2L + chr2L_20647789_20648188 chr2L_20648014_20648188 chr2L_20648189_20648248;chr2L_20647710_20647788 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.29 52.63 NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA 0.0 K alternative_donor Mct1 chrX + chrX_2089073_2092664;chrX_2088826_2092664 chrX_2089096_2092664 chrX_2092665_2092972;chrX_2088634_2088825 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034014999999999997 K alternative_donor Eaf,RI_chr2R_3294566_3294636,I_chr2R_3294566_3294656,RI_chr2R_3294566_3294714,I_chr2R_3294566_3295255,I_chr2R_3294591_3295244 chr2R - chr2R_3294566_3295176;chr2R_3294566_3295244;chr2R_3294566_3294636;chr2R_3294566_3294638;chr2R_3294566_3295280;chr2R_3294566_3294642;chr2R_3294566_3294714 chr2R_3294566_3294634 chr2R_3294491_3294565;chr2R_3295281_3295302 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA 8.1973671064824012e-09 K alternative_donor Pino,I_chr2L_1115944_1117443,I_chr2L_1116691_1116908,I_chr2L_1117918_1118565 chr2L - chr2L_1116691_1117443 chr2L_1116691_1116908 chr2L_1116591_1116690;chr2L_1117444_1117516 5.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA 16.00 NA NA 24.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.61 0.0 K alternative_donor RpL27,I_chr3R_21510239_21510298,RI_chr3R_21510239_21510441,I_chr3R_21510239_21510464,I_chr3R_21510239_21510656,I_chr3R_21510239_21510726 chr3R - chr3R_21510239_21510464;chr3R_21510239_21510656;chr3R_21510239_21510739;chr3R_21510239_21510680;chr3R_21510239_21510298 chr3R_21510239_21510746 chr3R_21510139_21510238;chr3R_21510747_21510756 75.00 NA NA 86.27 90.32 NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA 90.48 NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA 92.00 NA 53.12 38.78 NA 92.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA 89.86 NA 91.21 NA NA NA 1.3450336777902962e-38 K alternative_donor CG42533,EI_chr2L_7473200_7473297,RI_chr2L_7473200_7473419,F_chr2L_7476906_7476978 chr2L - chr2L_7473200_7473656;chr2L_7473200_7473297;chr2L_7473200_7473770 chr2L_7473200_7473419 chr2L_7473100_7473199;chr2L_7473771_7473889 50.00 NA NA 24.53 NA NA NA 35.82 38.46 84.00 32.00 36.76 37.50 14.29 65.12 NA NA 31.25 NA NA NA NA 61.02 NA NA NA NA 32.00 68.89 NA 65.38 NA 60.42 NA NA 64.10 60.42 NA NA 62.90 NA NA NA NA 71.05 64.29 NA 69.70 39.24 NA NA NA 65.38 NA NA NA NA 64.18 0.0 K alternative_donor LIMK1,I_chrX_12488942_12489000 chrX - chrX_12484518_12486000;chrX_12484518_12485963 chrX_12484518_12486079 chrX_12483874_12484517;chrX_12486080_12486162 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034960999999999999 K alternative_donor CG17883,I_chr2R_560147_560511,I_chr2R_560547_560618 chr2R + chr2R_560568_560618;chr2R_560147_560618;chr2R_560565_560618 chr2R_560547_560618 chr2R_560619_560642;chr2R_560047_560146 9.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.00 NA 26.92 NA NA NA 23.33 NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Nak chr2L - chr2L_18960681_18962884 chr2L_18960681_18962645 chr2L_18960150_18960680;chr2L_18962885_18963115 58.33 NA NA 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024135 K alternative_donor CG1814,Updo chr2R + chr2R_5467293_5467467 chr2R_5467342_5467467 chr2R_5467468_5467871;chr2R_5467024_5467292 57.58 NA NA NA NA NA NA 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0045240000000000002 K alternative_donor CG3287,I_chr2R_2698891_2699406,I_chr2R_2700203_2700285 chr2R + chr2R_2698891_2699406;chr2R_2699349_2699406;chr2R_2698654_2699406 chr2R_2698681_2699406 chr2R_2699407_2699506;chr2R_2698533_2698653 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.16 NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7171880999999999e-05 K alternative_donor CREF_chr3R_5589662_5589762,CG8481 chr3R + chr3R_5594185_5594466;chr3R_5593863_5594466 chr3R_5594297_5594466 chr3R_5594467_5594493;chr3R_5593583_5593862 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00056599999999999999 N alternative_donor CG31216 chr3R + chr3R_15522379_15523033 chr3R_15522974_15523033 chr3R_15523034_15523168;chr3R_15522274_15522378 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.89 NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27798276_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27691048_27691484 chr3R_27691048_27691472 chr3R_27690854_27691047;chr3R_27691485_27691758 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001088 K alternative_donor Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3354822_3354987 chr2R_3354822_3354978 chr2R_3354726_3354821;chr2R_3354988_3355138 12.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014633999999999999 K alternative_donor CG6294,CG6299,I_chrX_15358771_15359763,I_chrX_15359667_15359763 chrX + chrX_15358459_15359763 chrX_15359505_15359763 chrX_15359764_15359863;chrX_15357988_15358458 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0784580213145603e-08 K alternative_donor by,RI_chr3R_5373093_5377292 chr3R - chr3R_5354681_5356461 chr3R_5354681_5354979 chr3R_5354623_5354680;chr3R_5356462_5358734 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8859881600000001e-09 K alternative_donor Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19546851_19547916;chr2R_19547223_19547916 chr2R_19546876_19547916 chr2R_19547917_19547942;chr2R_19546810_19546850 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00093999999999999997 K alternative_donor rudimentary,I_chrX_16559455_16560067,I_chrX_16561903_16561969 chrX + chrX_16559361_16560067 chrX_16559455_16560067 chrX_16560068_16560167;chrX_16559355_16559360 3.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.428032e-06 K alternative_donor CG34413,RI_chr2R_20769295_20770153,I_chr2R_20771136_20772048,I_chr2R_20773500_20774745 chr2R + chr2R_20769150_20770153;chr2R_20769206_20770153;chr2R_20769295_20770153 chr2R_20769471_20770153 chr2R_20770154_20770253;chr2R_20769141_20769149 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.07 NA NA NA NA 17.19 NA NA NA NA 25.00 22.86 NA NA 26.09 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG14777,CG14778 chrX + chrX_1360963_1361835 chrX_1360967_1361835 chrX_1361836_1361997;chrX_1360741_1360962 4.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00843 K alternative_donor Syx4,I_chrX_2635555_2635621,I_chrX_2636831_2636971 chrX - chrX_2633579_2633652;chrX_2633579_2633742 chrX_2633579_2635455 chrX_2633330_2633578;chrX_2635456_2635529 90.48 NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027574999999999999 K alternative_donor glob1,I_chr3R_11723738_11727000 chr3R - chr3R_11723738_11726929 chr3R_11723738_11726731 chr3R_11723638_11723737;chr3R_11726930_11727083 91.67 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6206976e-05 K alternative_donor for,I_chr2L_3627621_3631522 chr2L - chr2L_3627636_3631976;chr2L_3627636_3631522;chr2L_3627636_3631962 chr2L_3627636_3631804 chr2L_3626337_3627635;chr2L_3631977_3632151 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023889000000000001 K alternative_donor CG32809,I_chrX_1585391_1585462,RI_chrX_1585391_1586329,F_chrX_1585391_1586404,RI_chrX_1585391_1586471,I_chrX_1589508_1589564 chrX - chrX_1585391_1586408 chrX_1585391_1585462 chrX_1585291_1585390;chrX_1586409_1586429 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9625064453519991e-06 K alternative_donor CG15134 chr2L + chr2L_16904611_16905298;chr2L_16904662_16905298 chr2L_16904713_16905298 chr2L_16905299_16905389;chr2L_16904460_16904610 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA 100.00 NA NA 96.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5967633584691381e-06 K alternative_donor S2P,I_chr2R_7731333_7731381 chr2R - chr2R_7731333_7731383 chr2R_7731333_7731381 chr2R_7731233_7731332;chr2R_7731384_7731481 2.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0079539999999999993 K alternative_donor MB8.chr3R.pasa.66,Alh,REI_chr3R_2921238_2921297,RI_chr3R_2921566_2921658,I_chr3R_2927820_2933442,RI_chr3R_2946518_2946663 chr3R - chr3R_2921566_2922237 chr3R_2921566_2922013 chr3R_2921558_2921565;chr3R_2922238_2922542 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016101000000000001 K alternative_donor RpL15 chr3LHet + chr3LHet_2398018_2398127;chr3LHet_2397859_2398127;chr3LHet_2397925_2398127;chr3LHet_2397992_2398127;chr3LHet_2397841_2398127;chr3LHet_2398002_2398127;chr3LHet_2397820_2398127;chr3LHet_2398053_2398127 chr3LHet_2398060_2398127 chr3LHet_2398128_2398454;chr3LHet_2397802_2397819 11.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.87 NA NA NA NA NA NA NA 0.95 NA NA NA 0.44 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.99 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor scny,I_chr3L_5763034_5768288 chr3L + chr3L_5767947_5768288 chr3L_5768114_5768288 chr3L_5768289_5768388;chr3L_5767514_5767946 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0094549999999999999 N alternative_donor CG32594 chrX + chrX_14927496_14927638;chrX_14927381_14927638;chrX_14926607_14927638 chrX_14927033_14927638 chrX_14927639_14928125;chrX_14925576_14926606 0.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Hph chr3R + chr3R_1090925_1092474 chr3R_1091360_1092474 chr3R_1092475_1092754;chr3R_1090787_1090924 88.46 NA NA 72.34 NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2388929433919999e-06 K alternative_donor F_chrX_15764251_15765393,CG16952,RI_chrX_15764587_15765393,I_chrX_15766003_15766047 chrX + chrX_15764432_15765393;chrX_15764522_15765393;chrX_15764247_15765393;chrX_15764620_15765393 chrX_15764599_15765393 chrX_15765394_15765493;chrX_15764236_15764246 15.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 50.00 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.2719546315743794e-14 N alternative_donor lig3 chr3R - chr3R_8226161_8226248 chr3R_8226161_8226239 chr3R_8224994_8226160;chr3R_8226249_8227041 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA 13.16 NA NA NA NA 10.53 NA NA 12.50 20.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA 10.81 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.4658836918401187e-23 K alternative_donor plexB,I_chr4_61912_62843 chr4 - chr4_61912_63539 chr4_61912_62843 chr4_61812_61911;chr4_63540_64403 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_donor CG33558,I_chr2R_2813804_2817753,I_chr2R_2814327_2817753,I_chr2R_2816342_2817327,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2816779_2817354;chr2R_2816779_2817459 chr2R_2816779_2817327 chr2R_2816679_2816778;chr2R_2817460_2817510 93.48 NA NA NA 81.25 NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.3876495000000008e-05 K alternative_donor CG1640,RI_chrX_13265127_13267895,I_chrX_13265553_13267895,I_chrX_13265618_13267895,RI_chrX_13266680_13267895,RI_chrX_13267529_13267895,I_chrX_13271541_13271890 chrX + chrX_13265560_13267895;chrX_13265401_13267895;chrX_13265248_13267895;chrX_13265295_13267895 chrX_13265094_13267895 chrX_13267896_13267973;chrX_13265065_13265093 64.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.61 0.00025677845999999999 K alternative_donor CG7028,I_chr3L_207277_208117 chr3L - chr3L_210400_210475 chr3L_210400_210453 chr3L_209784_210399;chr3L_210476_210738 56.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.26 NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.152942063932e-05 K alternative_donor CG31716,I_chr2L_10397648_10398034 chr2L + chr2L_10398741_10399316 chr2L_10398750_10399316 chr2L_10399317_10399535;chr2L_10398654_10398740 17.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045990000000000003 K alternative_donor Rab23,I_chr3R_1508710_1508882 chr3R - chr3R_1508710_1510597;chr3R_1508710_1511119 chr3R_1508710_1508882 chr3R_1508610_1508709;chr3R_1511120_1511186 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036725000000000001 K alternative_donor tna chr3L + chr3L_10851787_10863140 chr3L_10852155_10863140 chr3L_10863141_10863453;chr3L_10851215_10851786 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.69 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.56 7.69 7.69 NA NA NA NA NA NA 8.2773718686915377e-13 K alternative_donor PhKgamma,I_chrX_11590179_11590249,I_chrX_11590183_11590435,I_chrX_11596563_11597322 chrX + chrX_11590345_11590435;chrX_11589973_11590435 chrX_11590179_11590435 chrX_11590436_11590535;chrX_11589857_11589972 5.56 NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4031377999999998e-05 K alternative_donor CG3829,I_chr2R_20874677_20875710,I_chr2R_20874711_20875717,I_chr2R_20875172_20875710,I_chr2R_20875497_20875710 chr2R + chr2R_20875497_20875710;chr2R_20875350_20875710;chr2R_20874711_20875710 chr2R_20875172_20875710 chr2R_20875711_20875810;chr2R_20874611_20874710 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 33.33 NA NA 3.51013458432e-07 K alternative_donor kar,I_chr3R_8510258_8513437,I_chr3R_8513840_8514930,I_chr3R_8514177_8514930 chr3R - chr3R_8513844_8514930 chr3R_8513844_8513900 chr3R_8513500_8513843;chr3R_8514931_8515030 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048281999999999999 K alternative_donor CG1965,I_chr3R_2902064_2902611 chr3R + chr3R_2893812_2894429 chr3R_2893817_2894429 chr3R_2894430_2894670;chr3R_2893510_2893811 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023479999999999998 K alternative_donor CG14544,I_chr3R_21886081_21886658 chr3R + chr3R_21885984_21886658 chr3R_21886081_21886658 chr3R_21886659_21886758;chr3R_21885981_21885983 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012534 K alternative_donor mbc,I_chr3R_19615584_19615649,I_chr3R_19625220_19625288 chr3R + chr3R_19608111_19615649 chr3R_19615584_19615649 chr3R_19615650_19615749;chr3R_19607533_19608110 2.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Amun,I_chrX_11607839_11608272,I_chrX_11607842_11608105,I_chrX_11607842_11608125,RI_chrX_11607842_11608272 chrX - chrX_11607842_11608590 chrX_11607842_11608507 chrX_11607788_11607841;chrX_11608591_11608810 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.53 NA NA 28.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.21 2.8782316171266655e-07 K alternative_donor Nmda1,R_chr2R_8766216_8766562,I_chr2R_8766652_8766956,I_chr2R_8766728_8766791,I_chr2R_8766728_8767623 chr2R - chr2R_8766652_8766956 chr2R_8766652_8766727 chr2R_8766628_8766651;chr2R_8766957_8766983 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013697000000000001 K alternative_donor CG4365 chr3L + chr3L_20791960_20792242;chr3L_20792089_20792242;chr3L_20792100_20792242;chr3L_20792077_20792242 chr3L_20791819_20792242 chr3L_20792243_20793181;chr3L_20791802_20791818 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.0475047011999991e-07 K alternative_donor CG3714,I_chr2L_4190825_4191774,I_chr2L_4192969_4193324,I_chr2L_4195905_4196470,I_chr2L_4196780_4197306,RI_chr2L_4196780_4197951,I_chr2L_4196815_4197306,I_chr2L_4196815_4197951 chr2L - chr2L_4196780_4197146 chr2L_4196780_4197095 chr2L_4196715_4196779;chr2L_4197147_4197191 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00042099999999999999 K alternative_donor sax,CG1882 chr2R + chr2R_3700197_3700785;chr2R_3700238_3700785 chr2R_3700498_3700785 chr2R_3700786_3702250;chr2R_3700011_3700196 90.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001477 K alternative_donor None chrU - chrU_5771599_5771833;chrU_5771599_5771693 chrU_5771599_5771684 61.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7e-05 K alternative_donor ptr,I_chrX_2243281_2243373,I_chrX_2243647_2248215,I_chrX_2243647_2248739 chrX - chrX_2243647_2248219 chrX_2243647_2247736 chrX_2243547_2243646;chrX_2248220_2248298 36.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017910000000000001 N alternative_donor CG9339,RE_chr2L_20903555_20916904,I_chr2L_20903560_20918638,I_chr2L_20922613_20922685 chr2L - chr2L_20917121_20918798;chr2L_20917121_20918093 chr2L_20917121_20918638 chr2L_20916905_20917120;chr2L_20918799_20918888 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.048136999999999999 N alternative_donor CG17233,RI_chr3L_20232898_20232962 chr3L - chr3L_20233633_20234944;chr3L_20233633_20234218;chr3L_20233633_20234418 chr3L_20233633_20234374 chr3L_20232963_20233632;chr3L_20234945_20234989 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3999999999999995e-05 K alternative_donor CG4272 chr2L + chr2L_2365902_2366274;chr2L_2365391_2366274 chr2L_2365729_2366274 chr2L_2366275_2368213;chr2L_2365332_2365390 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9630000000000013e-08 N alternative_donor CG8531,RI_chr2R_10144869_10144912 chr2R + chr2R_10145138_10145276;chr2R_10145070_10145276 chr2R_10145224_10145276 chr2R_10145277_10145393;chr2R_10144926_10145069 98.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.63 NA NA NA NA NA NA 88.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.49 84.96 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RpS27,I_chr3R_21072390_21072647,I_chr3R_21072390_21072710,I_chr3R_21072390_21073049 chr3R - chr3R_21072390_21073154 chr3R_21072390_21072710 chr3R_21072290_21072389;chr3R_21073155_21073223 1.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.24 NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Trf4-1,I_chrX_8455293_8457185,RI_chrX_8455791_8457185,R_chrX_8455801_8457185,I_chrX_8455902_8457185,I_chrX_8459198_8459266 chrX + chrX_8454992_8457185;chrX_8454847_8457185 chrX_8455100_8457185 chrX_8457186_8457285;chrX_8454674_8454846 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA 36.36 33.33 NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 2.1213175207052962e-20 K alternative_donor gw,RI_chr4_679135_679703,I_chr4_679135_680299,RI_chr4_679135_680693,I_chr4_679135_681047,I_chr4_679135_681671 chr4 - chr4_679135_680594;chr4_679135_680546;chr4_679135_680270;chr4_679135_680503 chr4_679135_680185 chr4_679035_679134;chr4_680595_680603 54.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1368965319999995e-09 K alternative_donor sax chr2R + chr2R_3694104_3694576 chr2R_3694518_3694576 chr2R_3694577_3694706;chr2R_3694102_3694103 3.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.81 NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.4615155964000018e-08 N alternative_donor CG30438 chr2R + chr2R_1426935_1435132 chr2R_1435078_1435132 chr2R_1435133_1435429;chr2R_1426917_1426934 16.66 NA NA NA NA NA NA 50.00 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0303997070499999e-06 K alternative_donor I_chr2L_12099367_12099435,Aats-thr chr2L + chr2L_12103835_12104491 chr2L_12104057_12104491 chr2L_12104492_12104552;chr2L_12103774_12103834 13.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.35 NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7719999999999997e-15 K alternative_donor CG32250,RI_chr3L_4319452_4320137 chr3L + chr3L_4319260_4320137 chr3L_4319452_4320137 chr3L_4320138_4320237;chr3L_4319199_4319259 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039650999999999999 N alternative_donor Strn-Mlck,I_chr2R_11838019_11838662 chr2R - chr2R_11837971_11838112;chr2R_11837971_11838672 chr2R_11837971_11838662 chr2R_11837919_11837970;chr2R_11838673_11838762 97.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001939 K alternative_donor CG13923,CG12022 chr3L + chr3L_1803568_1803794 chr3L_1803734_1803794 chr3L_1803795_1804355;chr3L_1803433_1803567 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012475999999999999 K alternative_donor Mes2,CEF_chr3L_22939285_22939369 chr3L + chr3L_22939041_22939369 chr3L_22939285_22939369 chr3L_22939370_22939469;chr3L_22938759_22939040 20.00 NA 34.21 36.72 NA NA 45.83 47.06 34.72 7.81 NA 33.14 43.21 37.21 NA 50.00 NA NA 40.96 31.22 NA NA NA NA NA NA NA 7.95 NA NA NA NA 7.79 40.69 NA NA NA NA NA NA 8.64 NA NA NA 9.89 NA NA 8.75 38.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Spred,I_chr2R_10655876_10656041,I_chr2R_10655876_10656193,I_chr2R_10655876_10656868 chr2R - chr2R_10655876_10656848;chr2R_10655876_10656878;chr2R_10655876_10656526;chr2R_10655876_10656871 chr2R_10655876_10656782 chr2R_10655776_10655875;chr2R_10656879_10656886 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9310680775652e-05 K alternative_donor homer chr2L - chr2L_6722431_6723192 chr2L_6722431_6722796 chr2L_6722142_6722430;chr2L_6723193_6723254 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2236623999999998e-08 K alternative_donor CG9331,I_chr2L_20824494_20826632,I_chr2L_20825513_20825658 chr2L + chr2L_20824602_20825271;chr2L_20824725_20825271;chr2L_20824494_20825271 chr2L_20824631_20825271 chr2L_20825272_20825366;chr2L_20824482_20824493 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 0.0079889999999999996 N alternative_donor CG42533,F_chr2L_7474506_7474872,F_chr2L_7476906_7476978 chr2L - chr2L_7474506_7476978 chr2L_7474506_7474622 chr2L_7474406_7474505;chr2L_7476979_7477078 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG31999,I_chr4_240711_240769,I_chr4_243657_244182 chr4 - chr4_239517_240531;chr4_239517_239863 chr4_239517_240516 chr4_239079_239516;chr4_240532_240654 97.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG14408,RI_chrX_14722065_14722693 chrX - chrX_14722065_14723168 chrX_14722065_14722693 chrX_14721965_14722064;chrX_14723169_14724380 12.50 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044679999999999997 K alternative_donor Cip4,I_chr3L_4363128_4363769,I_chr3L_4363386_4363987 chr3L - chr3L_4324448_4324921 chr3L_4324448_4324861 chr3L_4324284_4324447;chr3L_4324922_4324996 37.31 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA 68.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.91 0.0 K alternative_donor CG3566 chrX - chrX_6169204_6170260 chrX_6169204_6170086 chrX_6169003_6169203;chrX_6170261_6170329 53.59 NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016455283340000002 K alternative_donor RpS3A,I_chr4_87364_87465,I_chr4_87533_87717,I_chr4_87549_87717,I_chr4_87549_87769 chr4 - chr4_87533_87673;chr4_87533_87769;chr4_87533_87717 chr4_87533_87757 chr4_87466_87532;chr4_87770_87817 19.58 NA NA NA NA NA 33.11 NA 31.54 NA NA NA NA 31.83 NA NA NA 32.56 37.20 38.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.17 NA NA NA NA NA 41.21 NA 8.77 NA NA NA NA NA NA 32.32 0.0 K alternative_donor CG17912,I_chr2L_16748617_16749055,I_chr2L_16749189_16749266 chr2L + chr2L_16746617_16749055 chr2L_16748617_16749055 chr2L_16749056_16749155;chr2L_16746227_16746616 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.04 48.65 34.48 50.00 NA NA 28.57 26.32 NA NA 45.45 NA NA NA NA 26.67 33.33 24.14 41.67 40.00 NA NA 47.83 41.67 NA 36.84 NA NA 42.86 NA NA 30.77 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG17159,CG17162,noncoding_25215 chrXHet - chrXHet_69232_75250;chrXHet_69232_75430 chrXHet_69232_75279 chrXHet_69195_69231;chrXHet_75431_75453 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7039693316792008e-05 K alternative_donor CG6912 chr3R - chr3R_10962115_10962204 chr3R_10962115_10962193 chr3R_10962052_10962114;chr3R_10962205_10962253 92.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA 65.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA 82.54 NA 3.657533904388e-12 K alternative_donor CG10277,I_chr3R_2211644_2211724,I_chr3R_2211939_2212057 chr3R + chr3R_2211644_2211724 chr3R_2211664_2211724 chr3R_2211725_2211824;chr3R_2211544_2211643 95.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00027399999999999999 K alternative_donor CG13197,RI_chr2R_7580554_7581978 chr2R + chr2R_7580051_7581978 chr2R_7580554_7581978 chr2R_7581979_7582078;chr2R_7580004_7580050 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020247999999999999 K alternative_donor Rox8,I_chr3R_19872211_19872659,I_chr3R_19872214_19872630,I_chr3R_19872214_19872636,I_chr3R_19872214_19872838,I_chr3R_19876189_19876240 chr3R - chr3R_19872214_19873834;chr3R_19872214_19873682;chr3R_19872214_19873550 chr3R_19872214_19873540 chr3R_19872114_19872213;chr3R_19873835_19873903 72.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001688493794 K alternative_donor CG14478 chr2R + chr2R_13345529_13349498;chr2R_13345952_13349498 chr2R_13345960_13349498 chr2R_13349499_13349990;chr2R_13345525_13345528 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038463999999999998 K alternative_donor CG32000,RI_chr4_153025_153811,I_chr4_154340_157504,I_chr4_154551_155461,I_chr4_157794_157864 chr4 + chr4_153025_153811;chr4_152998_153811 chr4_152914_153811 chr4_153812_153855;chr4_152891_152913 82.16 NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031852999999999999 K alternative_donor CG5805 chr3R - chr3R_20612625_20613016 chr3R_20612625_20612713 chr3R_20611695_20612624;chr3R_20613017_20613134 5.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.7999999999999997e-05 K alternative_donor east,CR_chrX_1912038_1912737 chrX + chrX_1912120_1912737 chrX_1912243_1912737 chrX_1912738_1912837;chrX_1912113_1912119 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021839999999999998 N alternative_donor 4EHP,RI_chr3R_19927769_19928262,Syx1A chr3R - chr3R_19927769_19932546;chr3R_19927769_19928262 chr3R_19927769_19929293 chr3R_19927676_19927768;chr3R_19932547_19933006 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.80 NA NA NA NA 34.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor dia chr2L + chr2L_20758386_20760524 chr2L_20758664_20760524 chr2L_20760525_20760841;chr2L_20758126_20758385 78.26 NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022860999999999999 N alternative_donor CG6199 chr3L - chr3L_11196773_11198004 chr3L_11196773_11197305 chr3L_11196633_11196772;chr3L_11198005_11198090 30.00 NA 19.23 15.48 14.29 19.05 NA 17.82 NA NA NA NA 18.00 17.02 18.18 NA 18.00 NA 16.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.99 NA NA NA NA NA NA NA NA 19.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA 18.64 NA NA 19.44 0.0 K alternative_donor CG9821,I_chr3R_4644986_4645248,I_chr3R_4644986_4645577,I_chr3R_4644986_4645648,I_chr3R_4644986_4646263,RI_chr3R_4644986_4646264,RI_chr3R_4645903_4646033 chr3R - chr3R_4644986_4645248;chr3R_4644986_4645577;chr3R_4644986_4646033 chr3R_4644986_4645649 chr3R_4644886_4644985;chr3R_4646034_4646133 74.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.05 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG17224,RI_chr2L_3017869_3017958,RI_chr2L_3018025_3018085,RI_chr2L_3018082_3018278,RI_chr2L_3022346_3022422,CG3605 chr2L - chr2L_3018025_3018081;chr2L_3018025_3018274;chr2L_3018025_3018085;chr2L_3018025_3018278 chr2L_3018025_3018163 chr2L_3017982_3018024;chr2L_3018279_3018287 50.00 NA NA NA NA NA 16.67 20.00 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.1760694637599995e-07 K alternative_donor fs(1)h,I_chrX_7947328_7948140,I_chrX_7950171_7952371,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7947328_7948155 chrX_7947328_7948140 chrX_7947228_7947327;chrX_7948156_7948240 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005306 K alternative_donor eRF1,CG5618,I_chr3L_20346714_20347106,I_chr3L_20346738_20347058,I_chr3L_20348230_20348404 chr3L + chr3L_20341925_20342041;chr3L_20341636_20342041;chr3L_20341509_20342041;chr3L_20341865_20342041;chr3L_20341486_20342041;chr3L_20341522_20342041;chr3L_20341530_20342041;chr3L_20341629_20342041;chr3L_20341598_20342041;chr3L_20341759_20342041 chr3L_20341751_20342041 chr3L_20342042_20342306;chr3L_20341482_20341485 8.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA 1.0683559799999999e-10 K alternative_donor Pk61C,CE_chr3L_129889_141769,I_chr3L_132531_133824,I_chr3L_133962_134014 chr3L + chr3L_132056_135457;chr3L_131934_135457;chr3L_131959_135457 chr3L_132531_135457 chr3L_135458_135842;chr3L_131849_131933 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016378900699999999 K alternative_donor Dp,I_chr2R_9111166_9112971,REI_chr2R_9113257_9113316 chr2R + chr2R_9112640_9112971;chr2R_9112646_9112971 chr2R_9112663_9112971 chr2R_9112972_9113071;chr2R_9112620_9112639 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0036120000000000002 N alternative_donor Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19562143_19562326 chr2R_19562175_19562326 chr2R_19562327_19562386;chr2R_19561937_19562142 2.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Rbp2,I_chrX_16343528_16343906 chrX + chrX_16344535_16345307 chrX_16344634_16345307 chrX_16345308_16345592;chrX_16344347_16344534 5.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001274 K alternative_donor fs(1)h,I_chrX_7950171_7952371,RI_chrX_7954192_7954783,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7954192_7954935 chrX_7954192_7954909 chrX_7954092_7954191;chrX_7954936_7954951 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024205999999999998 K alternative_donor Treh,I_chr2R_16972565_16972702,I_chr2R_16975359_16975442,RI_chr2R_16975359_16975842,I_chr2R_16975364_16975842 chr2R + chr2R_16974443_16975285 chr2R_16974918_16975285 chr2R_16975286_16975358;chr2R_16974405_16974442 76.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.21 NA 54.08 3.5722750145399999e-07 K alternative_donor CG1746,I_chr3R_27044771_27044867,I_chr3R_27044771_27044990,I_chr3R_27044771_27045027,RI_chr3R_27044771_27045110,I_chr3R_27044771_27045132,RI_chr3R_27044771_27045188,I_chr3R_27044771_27045193,RI_chr3R_27044771_27045268 chr3R - chr3R_27044771_27044867;chr3R_27044771_27045188;chr3R_27044771_27045257;chr3R_27044771_27045132;chr3R_27044771_27045027;chr3R_27044771_27045110;chr3R_27044771_27044831;chr3R_27044771_27044990 chr3R_27044771_27044895 chr3R_27044671_27044770;chr3R_27045258_27045273 0.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA 0.0 K alternative_donor CalpA chr2R + chr2R_15312652_15313538 chr2R_15312744_15313538 chr2R_15313539_15313723;chr2R_15312580_15312651 94.00 NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 79.41 NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.310840230841999e-06 K alternative_donor lig,CI_chr2R_3962006_3962916,RI_chr2R_3962875_3962977 chr2R + chr2R_3955872_3957375;chr2R_3955586_3957375;chr2R_3955788_3957375 chr2R_3955517_3957375 chr2R_3957376_3957784;chr2R_3955509_3955516 96.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 80.00 75.00 NA 50.00 57.14 73.91 NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.19 NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor l(2)37Ce,RI_chr2L_19132432_19132483,I_chr2L_19134277_19143634,RI_chr2L_19145845_19146761 chr2L + chr2L_19132417_19132483 chr2L_19132432_19132483 chr2L_19132484_19132583;chr2L_19132357_19132416 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002415 N alternative_donor Acox57D-d chr2R + chr2R_17276686_17277563 chr2R_17277146_17277563 chr2R_17277564_17277658;chr2R_17276376_17276685 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019902 N alternative_donor par-1,RI_chr2R_15355419_15356294,F_chr2R_15362147_15365138,RI_chr2R_15363358_15365120,I_chr2R_15365210_15370456 chr2R + chr2R_15344481_15347299 chr2R_15347232_15347299 chr2R_15347300_15348121;chr2R_15343700_15344480 9.52 NA NA NA 20.00 NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CSN5 chr3R + chr3R_12296786_12296850;chr3R_12296683_12296850 chr3R_12296792_12296850 chr3R_12296851_12297070;chr3R_12296215_12296682 68.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021422 K alternative_donor CG30389,CEF_chr2R_17041552_17043191,I_chr2R_17044803_17047935 chr2R - chr2R_17041672_17042219 chr2R_17041672_17042048 chr2R_17041640_17041671;chr2R_17042220_17042432 18.52 NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA 52.87 NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG11309,I_chr3L_21297192_21297708 chr3L - chr3L_21297192_21297542;chr3L_21297192_21297487 chr3L_21297192_21297389 chr3L_21297092_21297191;chr3L_21297543_21297554 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043351000000000001 K alternative_donor RpL14 chr3L + chr3L_8594138_8594413 chr3L_8594238_8594413 chr3L_8594414_8594515;chr3L_8594108_8594137 2.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA 15.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor cryptocephal,RI_chr2L_21312044_21312124,I_chr2L_21312209_21314626 chr2L + chr2L_21318417_21318484 chr2L_21318420_21318484 chr2L_21318485_21318548;chr2L_21318351_21318416 90.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor ben chrX + chrX_13890789_13892127;chrX_13890791_13892127;chrX_13890793_13892127;chrX_13890762_13892127;chrX_13890795_13892127;chrX_13890990_13892127;chrX_13890831_13892127;chrX_13890768_13892127;chrX_13890648_13892127 chrX_13891016_13892127 chrX_13892128_13892800;chrX_13890644_13890647 0.00 NA NA 16.67 NA NA NA 50.00 20.00 NA NA 50.00 NA NA NA 20.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 3.0052823925384328e-32 K alternative_donor att-ORFA,att-ORFB,RI_chr3R_16380642_16382206 chr3R - chr3R_16380642_16383128 chr3R_16380642_16382206 chr3R_16380542_16380641;chr3R_16383129_16383136 12.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.015442000000000001 K alternative_donor 14-3-3zeta,I_chr2R_5987356_5991764,I_chr2R_5987603_5991760,I_chr2R_5988662_5991760,I_chr2R_5988666_5991760,I_chr2R_5988919_5991760,I_chr2R_5988931_5991760,I_chr2R_5990647_5991760,I_chr2R_5991249_5991760,I_chr2R_5991689_5991760,I_chr2R_5993610_5993957,I_chr2R_5993331_5994971 chr2R + chr2R_5987244_5991760;chr2R_5987237_5991760 chr2R_5987356_5991760 chr2R_5991761_5991860;chr2R_5987235_5987236 61.58 NA NA NA 39.44 NA NA NA 48.28 80.00 NA NA NA NA NA NA 47.69 44.69 NA NA NA NA 71.93 NA NA NA 74.42 76.67 NA 75.44 NA NA NA NA 89.66 90.77 40.82 NA NA NA NA NA NA 72.41 NA 78.82 NA NA NA NA 80.65 NA 75.56 86.27 NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor AIF chr2L + chr2L_2152463_2152662;chr2L_2152271_2152662 chr2L_2152466_2152662 chr2L_2152663_2152944;chr2L_2152233_2152270 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8383699999999998e-07 K alternative_donor woc,I_chr3R_23089174_23089688,I_chr3R_23089174_23089695,I_chr3R_23096096_23096561 chr3R - chr3R_23089174_23089688;chr3R_23089174_23089498 chr3R_23089174_23089695 chr3R_23089074_23089173;chr3R_23089696_23089772 1.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018717999999999999 K alternative_donor dorsal,RI_chr2L_17438018_17439189,FI_chr2L_17449369_17450215,noncoding_3500,RI_chr2L_17450002_17450219 chr2L - chr2L_17449369_17450325;chr2L_17449369_17449875;chr2L_17449369_17450219;chr2L_17449369_17450310 chr2L_17449369_17450215 chr2L_17449296_17449368;chr2L_17450326_17450359 1.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00029100000000000003 N alternative_donor RhoGAP18B chrX - chrX_19038625_19040000 chrX_19038625_19038713 chrX_19038597_19038624;chrX_19040001_19040175 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014388 K alternative_donor RpS15Aa chrX - chrX_13231573_13231635;chrX_13231573_13231639 chrX_13231573_13231643 chrX_13231538_13231572;chrX_13231644_13231706 44.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5000000000000001e-05 K alternative_donor Mi-2 chr3L - chr3L_19881715_19903142 chr3L_19881715_19881800 chr3L_19881638_19881714;chr3L_19903143_19903321 44.93 NA NA NA 58.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.42 NA 61.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.49 57.81 56.86 NA NA NA NA NA 57.41 NA NA NA NA 70.18 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor IP3K2,I_chrX_13216481_13219804 chrX + chrX_13215388_13219804 chrX_13215512_13219804 chrX_13219805_13219869;chrX_13215310_13215387 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038642999999999997 K alternative_donor I_chr3R_1183570_1183645,CG16708 chr3R - chr3R_1187483_1193642 chr3R_1187483_1193578 chr3R_1185701_1187482;chr3R_1193643_1194012 5.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9107008e-05 N alternative_donor RpS27A,Ip259 chr2L + chr2L_10408387_10408738 chr2L_10408622_10408738 chr2L_10408739_10409132;chr2L_10408376_10408386 10.68 NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.79 NA NA NA 40.00 57.89 22.47 34.62 NA NA NA NA 52.63 50.00 NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA 40.62 NA 23.81 NA NA 42.22 NA NA 37.04 NA NA NA 22.62 0.0 K alternative_donor Lip4 chr2L + chr2L_10530670_10530855 chr2L_10530676_10530855 chr2L_10530856_10531517;chr2L_10530314_10530669 29.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Eph,I_chr4_631523_634240,I_chr4_631555_631910,I_chr4_631643_631910,I_chr4_639690_640473,I_chr4_640676_640879,RI_chr4_640804_640863 chr4 + chr4_631555_631910;chr4_631523_631910 chr4_631643_631910 chr4_631911_632010;chr4_631455_631522 0.00 NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0024450000000000001 K alternative_donor dwg,RI_chrX_2622297_2622355,RI_chrX_2622297_2622430,RI_chrX_2622435_2622577,RI_chrX_2627170_2627263 chrX + chrX_2622297_2622577 chrX_2622435_2622577 chrX_2622578_2622677;chrX_2622197_2622296 5.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5000000000000002e-05 K alternative_donor akirin,I_chr3L_7363173_7364806,I_chr3L_7363177_7364806,I_chr3L_7363177_7364831,I_chr3L_7363211_7364831,I_chr3L_7363731_7364806,I_chr3L_7364126_7364806,RI_chr3L_7364737_7364806 chr3L + chr3L_7363177_7364831;chr3L_7363211_7364831 chr3L_7363169_7364831 chr3L_7364832_7364906;chr3L_7363111_7363168 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.49 NA NA 57.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor D1,RI_chr3R_5065631_5065691,I_chr3R_5065631_5065695,I_chr3R_5065631_5065697 chr3R - chr3R_5065631_5065767;chr3R_5065631_5065697;chr3R_5065631_5065695 chr3R_5065631_5065691 chr3R_5065531_5065630;chr3R_5065768_5065790 59.77 NA NA 73.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.97 NA NA NA NA 74.77 NA NA 72.57 40.00 NA NA 41.86 40.48 NA NA NA NA 2.2040503396471511e-14 K alternative_donor CG17721,RI_chr3R_7061265_7061322 chr3R + chr3R_7061229_7061322 chr3R_7061265_7061322 chr3R_7061323_7061422;chr3R_7061165_7061228 12.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062469999999999999 K alternative_donor glo,I_chr3R_7644679_7644739,REI_chr3R_7644679_7644932,RI_chr3R_7644683_7644880,I_chr3R_7647556_7647628 chr3R - chr3R_7644683_7644880;chr3R_7644683_7644739;chr3R_7644683_7644908;chr3R_7644683_7644743 chr3R_7644683_7644932 chr3R_7644583_7644682;chr3R_7644933_7644980 91.36 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4091999999999998e-08 K alternative_donor CG10080 chr2R + chr2R_17517559_17517991 chr2R_17517589_17517991 chr2R_17517992_17518052;chr2R_17517196_17517558 30.56 NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012217 K alternative_donor Rph,I_chrX_10647710_10648325,RI_chrX_10649048_10651427 chrX - chrX_10647710_10651427 chrX_10647710_10648325 chrX_10647610_10647709;chrX_10651428_10651527 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 1.48877698719e-06 K alternative_donor Rip11,E_chrX_18532733_18533695,RI_chrX_18530353_18530870,RI_chrX_18530742_18530870,RI_chrX_18544139_18544185 chrX - chrX_18530907_18531445 chrX_18530907_18531363 chrX_18530871_18530906;chrX_18531446_18531606 10.67 NA NA NA NA 20.88 NA NA NA NA 21.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0215199999999998e-13 K alternative_donor CG9775,I_chr3R_464132_464367,I_chr3R_466059_466296 chr3R - chr3R_465475_465734 chr3R_465475_465590 chr3R_465356_465474;chr3R_465735_466058 17.54 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.35 NA NA NA 52.17 NA NA NA NA 40.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Fps85D,I_chr3R_5194729_5194776,I_chr3R_5216796_5218450 chr3R - chr3R_5195433_5198098 chr3R_5195433_5196736 chr3R_5195058_5195432;chr3R_5198099_5198299 100.00 NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 80.00 NA NA NA NA NA NA 5.1044511689600011e-12 N alternative_donor CG15211,EF_chrX_10666660_10666923 chrX + chrX_10666660_10671993 chrX_10667200_10671993 chrX_10671994_10672161;chrX_10666577_10666659 100.00 NA NA 70.00 50.00 61.11 NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA 66.67 NA 60.00 69.23 70.18 NA NA 66.67 61.90 45.45 NA 43.33 43.59 30.00 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 52.63 50.00 NA NA NA NA 58.70 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 41.67 NA 0.0 K alternative_donor Rab30,I_chr2L_7032178_7032236 chr2L - chr2L_7032178_7032244;chr2L_7032178_7032310;chr2L_7032178_7032321 chr2L_7032178_7032236 chr2L_7032078_7032177;chr2L_7032322_7032336 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0039430000000000003 K alternative_donor CG1317 chr3L - chr3L_2368426_2368629 chr3L_2368426_2368620 chr3L_2368013_2368425;chr3L_2368630_2370048 21.10 NA NA 45.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA 39.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.4310072741731213e-10 K alternative_donor gbb chr2R + chr2R_19739125_19739205 chr2R_19739129_19739205 chr2R_19739206_19740772;chr2R_19739106_19739124 90.48 NA NA NA NA NA 68.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044745 K alternative_donor ire-1,FI_chr3R_15689914_15690042 chr3R - chr3R_15683407_15686368 chr3R_15683407_15686212 chr3R_15682963_15683406;chr3R_15686369_15686483 26.53 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7185750000000001e-06 K alternative_donor CG15072,RI_chr2R_14576128_14579545,I_chr2R_14589693_14590032 chr2R + chr2R_14575874_14579545;chr2R_14576017_14579545;chr2R_14576049_14579545;chr2R_14576056_14579545;chr2R_14576154_14579545 chr2R_14576247_14579545 chr2R_14579546_14579571;chr2R_14575805_14575873 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2543542985542628e-06 K alternative_donor cype chr2L + chr2L_5327287_5327502 chr2L_5327351_5327502 chr2L_5327503_5327676;chr2L_5327227_5327286 2.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025165 K alternative_donor Gbeta13F,I_chrX_15754284_15755184,RI_chrX_15754356_15755268,I_chrX_15754356_15755409,RI_chrX_15755345_15755409 chrX + chrX_15754284_15755409;chrX_15754356_15755409 chrX_15755345_15755409 chrX_15755410_15755509;chrX_15754256_15754283 8.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.31 24.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG1578,RI_chrX_11709573_11709680,I_chrX_11709573_11710263,RI_chrX_11709573_11710335,noncoding_23225,I_chrX_11710380_11710454 chrX - chrX_11709573_11709680;chrX_11709573_11710458;chrX_11709573_11710335;chrX_11709573_11710454 chrX_11709573_11710263 chrX_11709473_11709572;chrX_11710459_11710479 0.00 NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 12.50 NA NA NA 12.50 NA 12.50 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0929236933894917e-12 K alternative_donor Arp14D,RE_chrX_16445264_16446372 chrX - chrX_16443182_16443251;chrX_16443182_16443253 chrX_16443182_16443249 chrX_16442302_16443181;chrX_16443254_16443445 52.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018915999999999999 K alternative_donor Pk61C,I_chr3L_143454_143514 chr3L + chr3L_143218_143514 chr3L_143454_143514 chr3L_143515_143614;chr3L_142943_143217 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 31.25 NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16326733_16327197 chrX_16326745_16327197 chrX_16327198_16328171;chrX_16324959_16326732 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 77.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00057399999999999997 K alternative_donor trbd chr3R - chr3R_5535271_5535611;chr3R_5535271_5536695 chr3R_5535271_5536202 chr3R_5535110_5535270;chr3R_5536696_5536730 77.27 NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA 42.31 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 59.26 65.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor bur,I_chr2L_21177679_21177901,I_chr2L_21177679_21178250,I_chr2L_21177960_21179329 chr2L - chr2L_21177679_21179329 chr2L_21177679_21177901 chr2L_21177579_21177678;chr2L_21179330_21179429 2.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Tango5,noncoding_22970,I_chrX_10659836_10661185 chrX - chrX_10656468_10658202;chrX_10656468_10658389 chrX_10656468_10658117 chrX_10656442_10656467;chrX_10658390_10658400 9.09 NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033207 K alternative_donor RpL31,CG1827 chr2R + chr2R_5474844_5474951;chr2R_5474789_5474951 chr2R_5474734_5474951 chr2R_5474952_5475211;chr2R_5474727_5474733 97.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K alternative_donor CkIIbeta,I_chrX_11686847_11687475,I_chrX_11687161_11687475,I_chrX_11689220_11690898 chrX + chrX_11687025_11687475;chrX_11686979_11687475;chrX_11686948_11687475 chrX_11687313_11687475 chrX_11687476_11687551;chrX_11686929_11686947 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.36 NA NA NA 0.018974999999999999 K alternative_donor CG2310,I_chr3R_25318474_25319142 chr3R - chr3R_25318474_25319136;chr3R_25318474_25319163;chr3R_25318474_25319142;chr3R_25318474_25318925;chr3R_25318474_25318971;chr3R_25318474_25319004;chr3R_25318474_25319167 chr3R_25318474_25319093 chr3R_25318374_25318473;chr3R_25319168_25319224 7.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.30 NA NA NA NA NA NA NA 25.86 NA NA NA NA NA NA 25.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG15814,I_chrX_17743744_17743940 chrX - chrX_17744102_17744321 chrX_17744102_17744245 chrX_17743941_17744101;chrX_17744322_17744390 40.00 NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031328000000000002 K alternative_donor CG15609,C_chr2R_12899322_12900789,I_chr2R_12902708_12903184 chr2R - chr2R_12902708_12903184;chr2R_12902708_12903163;chr2R_12902708_12903198 chr2R_12902708_12903167 chr2R_12902608_12902707;chr2R_12903199_12903284 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.26 NA NA NA NA NA NA NA NA 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.148838e-06 N alternative_donor CG9940 chrX - chrX_13601748_13612161 chrX_13601748_13603401 chrX_13601629_13601747;chrX_13612162_13612298 14.29 NA NA NA NA NA 25.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.27 NA NA NA 28.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor hd chr3R - chr3R_1200113_1200171 chr3R_1200113_1200167 chr3R_1199955_1200112;chr3R_1200172_1200353 5.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024878999999999998 K alternative_donor Rga,Spec2 chr3R - chr3R_1434742_1435371 chr3R_1434742_1435353 chr3R_1434172_1434741;chr3R_1435372_1435603 68.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.5000000000000006e-05 K alternative_donor cryptocephal,noncoding_4181,I_chr2L_21311307_21311752,RI_chr2L_21312044_21312124,I_chr2L_21312209_21314626 chr2L + chr2L_21311307_21311752;chr2L_21311532_21311752;chr2L_21311215_21311752 chr2L_21311033_21311752 chr2L_21311753_21311852;chr2L_21310948_21311032 82.61 NA NA 95.98 NA NA NA 94.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.18 NA 58.31 57.38 NA NA 65.32 NA 92.92 NA NA 69.13 NA NA 62.07 NA NA NA NA 66.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.12 NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor I_chr3R_16141663_16144698,CG5077,I_chr3R_16147605_16147670 chr3R + chr3R_16146174_16147197 chr3R_16146597_16147197 chr3R_16147198_16147358;chr3R_16145951_16146173 12.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG3919 chr3L + chr3L_14405237_14405355 chr3L_14405285_14405355 chr3L_14405356_14405772;chr3L_14405135_14405236 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0030219999999999999 K alternative_donor l(2)k05819,I_chr2L_4396173_4396266 chr2L + chr2L_4396128_4396809;chr2L_4396407_4396809 chr2L_4396173_4396809 chr2L_4396810_4396906;chr2L_4396073_4396127 44.83 NA NA 59.80 NA NA NA NA NA NA 65.52 NA 33.33 NA NA NA NA 61.67 64.52 NA NA NA NA NA NA 80.33 NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Pak,RI_chr3R_2181143_2181934 chr3R + chr3R_2176677_2180635 chr3R_2177074_2180635 chr3R_2180636_2180902;chr3R_2176656_2176676 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015449999999999999 K alternative_donor norpA,I_chrX_4219265_4219380 chrX + chrX_4254739_4255998 chrX_4255142_4255998 chrX_4255999_4256951;chrX_4254649_4254738 50.00 NA NA NA NA NA 73.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00011984229 K alternative_donor CG5537,I_chr3L_5804425_5804485 chr3L + chr3L_5804421_5804485 chr3L_5804425_5804485 chr3L_5804486_5804585;chr3L_5804325_5804420 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.70878e-07 K alternative_donor I_chr2L_11009331_11009442,dUTPase,I_chr2L_11011380_11011453 chr2L + chr2L_11011394_11011471;chr2L_11011419_11011471 chr2L_11011380_11011471 chr2L_11011472_11011553;chr2L_11011335_11011379 72.09 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.00 82.83 84.55 NA 39.68 NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA 88.89 88.39 87.86 NA 42.86 NA NA NA NA NA 88.04 51.28 NA 84.39 NA NA 86.32 89.19 NA 82.73 84.78 NA 0.0 K alternative_donor psq,RI_chr2R_6449696_6467831 chr2R + chr2R_6445882_6449190 chr2R_6446039_6449190 chr2R_6449191_6449459;chr2R_6445413_6445881 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021961999999999999 K alternative_donor TBPH,I_chr2R_19748981_19749882,I_chr2R_19748981_19749921,I_chr2R_19748984_19749882,I_chr2R_19748984_19749899 chr2R - chr2R_19748984_19749899;chr2R_19748984_19750012 chr2R_19748984_19749783 chr2R_19748884_19748983;chr2R_19750013_19750013 84.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7463225779999998e-08 K alternative_donor CG2924,I_chrX_2163288_2163676,I_chrX_2163738_2163863,I_chrX_2163738_2164440,I_chrX_2163738_2164560,I_chrX_2168373_2168893 chrX - chrX_2163738_2164440;chrX_2163738_2164670 chrX_2163738_2164731 chrX_2163677_2163737;chrX_2164732_2164736 76.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034105999999999997 K alternative_donor PMCA,I_chr4_371836_372509,I_chr4_374602_374976,RI_chr4_376108_379129,I_chr4_376108_379459,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_376108_379257 chr4_376108_379175 chr4_376008_376107;chr4_379258_379263 88.89 NA NA 78.05 NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.05 NA NA NA 5.3986017932764467e-11 K alternative_donor None chrU + chrU_1182323_1183262;chrU_1179335_1183262 chrU_1178980_1183262 1.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0011490000000000001 K alternative_donor CG6695 chr3R + chr3R_20483336_20484042;chr3R_20483291_20484042 chr3R_20483332_20484042 chr3R_20484043_20484133;chr3R_20483238_20483290 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0067340000000000004 K alternative_donor dmondo,I_chr2L_21301528_21308287,I_chr2L_21308811_21309579,I_chr2L_21308811_21310000,I_chr2L_21308827_21310000,I_chr2L_21309092_21309579,I_chr2L_21309092_21309938,RI_chr2L_21309092_21310000 chr2L - chr2L_21309092_21310000;chr2L_21309092_21309945;chr2L_21309092_21309994;chr2L_21309092_21309938 chr2L_21309092_21309579 chr2L_21308992_21309091;chr2L_21310001_21310009 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012726991200000002 K alternative_donor Dsp1,I_chrX_16231287_16231413 chrX + chrX_16227752_16228333;chrX_16227804_16228333;chrX_16227677_16228333;chrX_16227797_16228333 chrX_16228273_16228333 chrX_16228334_16228446;chrX_16227667_16227676 79.17 NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA 66.67 NA NA 1.4099714563833763e-12 K alternative_donor Magi,I_chr2R_17020420_17029043,I_chr2R_17026738_17027105,I_chr2R_17026738_17029359 chr2R - chr2R_17026738_17029043 chr2R_17026738_17027105 chr2R_17026638_17026737;chr2R_17029044_17029143 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG16936,RI_chr2R_20655101_20655166,I_chr2R_20660319_20660496 chr2R - chr2R_20655101_20655161;chr2R_20655101_20655476;chr2R_20655101_20655166 chr2R_20655101_20655620 chr2R_20655001_20655100;chr2R_20655621_20655665 95.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA 81.48 NA 83.05 NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.85 NA 81.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG7414,I_chr3L_21819515_21819581 chr3L + chr3L_21819853_21820193 chr3L_21820136_21820193 chr3L_21820194_21820958;chr3L_21819575_21819852 28.72 NA NA NA NA NA 39.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.53 NA NA NA NA 42.77 NA NA NA NA NA NA NA 39.34 NA NA NA NA NA NA 46.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.86 0.0 K alternative_donor CG14939,RI_chr2L_11812683_11813150 chr2L - chr2L_11812683_11813633;chr2L_11812683_11813724 chr2L_11812683_11813150 chr2L_11812583_11812682;chr2L_11813725_11813792 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA 9.2619051986995199e-09 N alternative_donor bel,I_chr3R_4484110_4485922 chr3R - chr3R_4481629_4481708 chr3R_4481629_4481699 chr3R_4480932_4481628;chr3R_4481709_4483565 16.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020289999999999999 K alternative_donor CG8184,I_chrX_15620707_15620769 chrX + chrX_15617113_15617265;chrX_15617158_15617265 chrX_15617191_15617265 chrX_15617266_15618411;chrX_15615597_15617112 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.35 NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5535001519030004e-05 K alternative_donor CG10737 chr2R + chr2R_15062592_15063752;chr2R_15062754_15063752 chr2R_15062814_15063752 chr2R_15063753_15063852;chr2R_15062387_15062591 69.23 NA NA 51.59 NA 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA 86.42 54.64 NA NA NA NA NA 51.20 NA NA NA NA 50.00 53.70 NA NA 82.83 NA 35.44 54.86 56.96 NA 42.24 NA NA NA 89.66 NA NA NA NA 84.91 NA 57.76 NA 43.75 NA NA NA NA NA 56.48 NA NA 0.0 K alternative_donor CG4896,REI_chr2L_1179197_1179859,I_chr2L_1191535_1191648 chr2L + chr2L_1177862_1177947 chr2L_1177869_1177947 chr2L_1177948_1178044;chr2L_1177765_1177861 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023258999999999998 N alternative_donor TSG101 chr3L + chr3L_16835972_16836255 chr3L_16835977_16836255 chr3L_16836256_16836333;chr3L_16835892_16835971 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016251000000000002 K alternative_donor Eip78C,I_chr3L_21255841_21256095 chr3L + chr3L_21233904_21256095 chr3L_21255841_21256095 chr3L_21256096_21256195;chr3L_21233887_21233903 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Hsc70-4 chr3R + chr3R_11068903_11070081 chr3R_11068907_11070081 chr3R_11070082_11072336;chr3R_11068878_11068902 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025597999999999999 K alternative_donor Myb,RI_chrX_15752571_15753225 chrX - chrX_15751579_15751673;chrX_15751579_15751709;chrX_15751579_15751749 chrX_15751579_15751682 chrX_15749823_15751578;chrX_15751750_15751876 8.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0036879999999999999 K alternative_donor kis,RI_chr2L_231035_231947,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_231035_231962 chr2L_231035_231947 chr2L_230935_231034;chr2L_231963_232047 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00027 K alternative_donor CG31716,I_chr2L_10397648_10398034 chr2L + chr2L_10399689_10399767;chr2L_10399677_10399767 chr2L_10399713_10399767 chr2L_10399768_10400679;chr2L_10399595_10399676 20.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.50 NA NA NA NA NA NA 6.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1289600000000001e-06 K alternative_donor CG31531,I_chr3R_485548_485960,I_chr3R_485608_485960,noncoding_14584,I_chr3R_486122_506500,I_chr3R_496573_505950,I_chr3R_523978_526879 chr3R + chr3R_485616_485960;chr3R_485399_485960 chr3R_485608_485960 chr3R_485961_486060;chr3R_485382_485398 42.86 NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA 62.96 60.61 NA NA NA 62.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5263399102786794e-10 K alternative_donor CG15618,RI_chrX_19759043_19759112 chrX - chrX_19759043_19759117 chrX_19759043_19759112 chrX_19758943_19759042;chrX_19759118_19759212 11.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8281600000000006e-07 K alternative_donor Tfb1 chr2R + chr2R_10250584_10250749 chr2R_10250627_10250749 chr2R_10250750_10251018;chr2R_10250565_10250583 10.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6204817000000004e-05 K alternative_donor Pi3K92E,I_chr3R_16459436_16459551,I_chr3R_16459436_16459848 chr3R - chr3R_16459436_16460267;chr3R_16459436_16460340;chr3R_16459436_16460287;chr3R_16459436_16459551 chr3R_16459436_16459848 chr3R_16459336_16459435;chr3R_16460341_16460435 3.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016556999999999999 K alternative_donor CG15609,C_chr2R_12899322_12900789,I_chr2R_12902708_12903184 chr2R - chr2R_12896448_12897557 chr2R_12896448_12897005 chr2R_12896351_12896447;chr2R_12897558_12897678 20.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.54 NA NA NA NA NA 32.99 NA NA NA NA NA 31.58 NA NA 38.78 NA 10.13 NA NA NA NA NA NA NA 30.97 0.0 K alternative_donor Traf-like,I_chrX_16309163_16309641,I_chrX_16309212_16309689,I_chrX_16309561_16309641,I_chrX_16309561_16309689,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16309561_16309689;chrX_16309163_16309689 chrX_16309619_16309689 chrX_16309690_16309741;chrX_16309112_16309162 95.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.76 NA NA NA 85.00 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.48 0.0 K alternative_donor I_chr3L_20306985_20307177,CG6680 chr3L + chr3L_20310517_20310578 chr3L_20310521_20310578 chr3L_20310579_20310888;chr3L_20310328_20310516 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020250000000000001 K alternative_donor CG33506,RI_chr2R_10745870_10745924 chr2R - chr2R_10745870_10745928 chr2R_10745870_10745924 chr2R_10745770_10745869;chr2R_10745929_10746024 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012628 K alternative_donor e(y)3,I_chrX_19530503_19530884,I_chrX_19530503_19531405 chrX - chrX_19530503_19531650;chrX_19530503_19530884;chrX_19530503_19532222 chrX_19530503_19531405 chrX_19530403_19530502;chrX_19532223_19532322 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.07 NA NA NA 17.14 NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.31 0.0 K alternative_donor E2f,CG6353 chr3R - chr3R_17487942_17488440 chr3R_17487942_17488436 chr3R_17486978_17487941;chr3R_17488441_17488464 6.06 NA NA 20.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014808 K alternative_donor CG17002 chr2R + chr2R_2874439_2875142 chr2R_2874454_2875142 chr2R_2875143_2875164;chr2R_2874339_2874438 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031186999999999999 N alternative_donor CG8678,RI_chr2L_21213167_21213227 chr2L - chr2L_21214648_21220259 chr2L_21214648_21215016 chr2L_21213917_21214647;chr2L_21220260_21220516 28.21 NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA 46.15 NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 3.689720340252401e-15 N alternative_donor Pvf2 chr2L - chr2L_7083729_7084481 chr2L_7083729_7083829 chr2L_7083186_7083728;chr2L_7084482_7084625 31.82 NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 45.16 45.45 50.00 NA 46.67 56.52 50.00 42.86 NA NA NA NA NA 54.17 NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.7826737570336018e-38 N alternative_donor prominin-like,I_chr3L_3121200_3123087 chr3L - chr3L_3117406_3117833 chr3L_3117406_3117486 chr3L_3117346_3117405;chr3L_3117834_3117973 7.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Vha16,I_chr2R_2519645_2520499,RI_chr2R_2519646_2519840,I_chr2R_2519646_2520292,I_chr2R_2519646_2520298,I_chr2R_2519775_2520499 chr2R - chr2R_2519646_2519828 chr2R_2519646_2519810 chr2R_2519546_2519645;chr2R_2519829_2519868 22.70 NA NA NA NA NA 39.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.67 NA NA 34.34 NA NA NA NA NA NA 37.88 NA NA NA 35.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RpL17,I_chrX_6637182_6638207,RI_chrX_6637182_6637528,I_chrX_6637182_6637973,snoRNA:Psi28S-1232 chrX - chrX_6637182_6638178;chrX_6637182_6638141;chrX_6637182_6637982 chrX_6637182_6638228 chrX_6637093_6637181;chrX_6638229_6638235 55.56 NA NA NA NA NA 31.11 NA NA 88.64 NA NA 29.73 NA NA NA NA NA NA NA NA 87.07 NA NA NA NA 74.42 83.33 NA 88.64 NA 91.74 95.43 NA 80.39 83.02 NA NA NA 89.08 91.61 NA NA 84.26 83.91 89.47 NA 93.57 NA 77.55 NA NA 91.97 NA NA NA 80.46 93.86 0.0 K alternative_donor plexA,RI_chr4_1036247_1047588,RI_chr4_1040642_1047395,RI_chr4_1044307_1046841,RF_chr4_1044307_1047399 chr4 - chr4_1044307_1047588;chr4_1044307_1047399 chr4_1044307_1047395 chr4_1044207_1044306;chr4_1047589_1047625 38.46 NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1089744152539999e-05 N alternative_donor unc-5,E_chr2R_11238100_11240757,I_chr2R_11252444_11252570 chr2R + chr2R_11238100_11244325 chr2R_11243996_11244325 chr2R_11244326_11244514;chr2R_11238000_11238099 25.93 NA NA 14.29 NA NA 51.85 NA NA NA NA 40.43 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8727837587301918e-12 K alternative_donor lqfR,I_chr3R_18240000_18243534,I_chr3R_18243588_18243830 chr3R + chr3R_18240000_18243830 chr3R_18243588_18243830 chr3R_18243831_18243930;chr3R_18239900_18239999 28.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA 51.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.84 NA NA NA 16.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA 8.1445264460497741e-12 K alternative_donor sdk,I_chrX_581050_581605,I_chrX_581108_581660,I_chrX_625220_634459,I_chrX_636395_636562 chrX + chrX_581160_581605;chrX_581043_581605;chrX_580974_581605 chrX_581108_581605 chrX_581606_581705;chrX_580950_580973 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0907180000000004e-06 N alternative_donor Spase12 chr3R - chr3R_25316476_25316531 chr3R_25316476_25316527 chr3R_25316407_25316475;chr3R_25316532_25316612 1.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG11360,noncoding_20761,I_chr4_701221_705206,I_chr4_705000_705206 chr4 + chr4_691793_701065;chr4_692243_701065 chr4_692014_701065 chr4_701066_701220;chr4_691790_691792 63.16 NA NA 33.33 25.00 NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9835911900560127e-08 K alternative_donor CG13585,I_chr2R_20419710_20419962,E_chr2R_20420167_20420418 chr2R + chr2R_20419160_20419962 chr2R_20419258_20419962 chr2R_20419963_20420062;chr2R_20419149_20419159 55.56 NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033239999999999999 K alternative_donor oaf chr2L + chr2L_2495889_2496398 chr2L_2495927_2496398 chr2L_2496399_2497357;chr2L_2495570_2495888 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001147 K alternative_donor CG1407,RI_chr2R_5918919_5919093,I_chr2R_5918925_5919213,RI_chr2R_5918952_5919084,RI_chr2R_5918952_5919093 chr2R - chr2R_5918952_5919093 chr2R_5918952_5919084 chr2R_5918927_5918951;chr2R_5919094_5919184 24.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024459999999999999 K alternative_donor zip,I_chr2R_20878796_20879147 chr2R - chr2R_20898140_20898992;chr2R_20898140_20898898 chr2R_20898140_20898834 chr2R_20897903_20898139;chr2R_20898993_20898996 33.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.62 NA NA 22.62 54.24 61.36 64.52 59.26 NA 76.92 NA 43.88 44.12 22.95 NA NA NA NA 55.74 NA 60.00 47.22 NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA 50.00 65.00 51.61 NA 76.92 NA 47.83 NA NA 0.0 K alternative_donor cnc,I_chr3R_19014852_19016738,I_chr3R_19046366_19046507,I_chr3R_19046619_19047567 chr3R - chr3R_19035606_19043600 chr3R_19035606_19035704 chr3R_19035330_19035605;chr3R_19043601_19044848 5.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA 17.65 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor AGO1,I_chr2R_9844856_9845327 chr2R - chr2R_9844856_9845466 chr2R_9844856_9845327 chr2R_9844756_9844855;chr2R_9845467_9845645 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00064599999999999998 K alternative_donor Zn72D,RF_chr3L_16100887_16102721,I_chr3L_16105199_16105253 chr3L - chr3L_16105199_16105299;chr3L_16105199_16105253;chr3L_16105199_16105318 chr3L_16105199_16105431 chr3L_16105099_16105198;chr3L_16105432_16105487 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001647 K alternative_donor pAbp,I_chr2R_14027838_14028996 chr2R + chr2R_14028460_14028992 chr2R_14028922_14028992 chr2R_14028993_14029177;chr2R_14028264_14028459 21.54 NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.08 41.07 70.83 61.11 NA 38.60 45.45 44.44 NA NA NA NA NA NA 33.33 55.56 NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.11 NA 37.84 38.24 NA NA 33.33 54.84 NA 0.0 K alternative_donor CG7510,I_chr3L_17622707_17622884 chr3L + chr3L_17621448_17621526 chr3L_17621472_17621526 chr3L_17621527_17621595;chr3L_17621379_17621447 45.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0072490000000000002 K alternative_donor CG5594,CG2812 chr2R + chr2R_19797333_19799199 chr2R_19797357_19799199 chr2R_19799200_19799391;chr2R_19797201_19797332 92.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014596 K alternative_donor BicD,Aac11,I_chr2L_17475843_17475910 chr2L - chr2L_17475355_17475534 chr2L_17475355_17475407 chr2L_17474918_17475354;chr2L_17475535_17475615 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.05 NA NA NA NA NA NA NA 80.95 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 81.11 NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.52 2.1807453330938884e-21 K alternative_donor Wwox,I_chr2L_8000434_8000497,Spn28D chr2L - chr2L_8000434_8003283 chr2L_8000434_8000497 chr2L_8000366_8000433;chr2L_8003284_8003463 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.12 NA NA NA NA 3.23 3.2200000000000004e-14 K alternative_donor CG12703 chrX + chrX_19645123_19645380;chrX_19645198_19645380;chrX_19645200_19645380;chrX_19645202_19645380;chrX_19644924_19645380 chrX_19645171_19645380 chrX_19645381_19645579;chrX_19644833_19644923 84.44 NA NA 70.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0059259999999999998 K alternative_donor Fak56D,F_chr2R_15323055_15323097 chr2R - chr2R_15319898_15321006 chr2R_15319898_15320100 chr2R_15319808_15319897;chr2R_15321007_15321146 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0921749999999994e-12 K alternative_donor Nc73EF,I_chr3L_16950628_16951334,I_chr3L_16950952_16952198,I_chr3L_16951588_16952198,I_chr3L_16951626_16952198,I_chr3L_16952138_16952198,I_chr3L_16952985_16955434,I_chr3L_16953768_16954599 chr3L + chr3L_16948643_16952198 chr3L_16948692_16952198 chr3L_16952199_16952207;chr3L_16948635_16948642 8.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028049999999999999 K alternative_donor sop,RI_chr2L_9897132_9897211 chr2L - chr2L_9897132_9897472 chr2L_9897132_9897211 chr2L_9897032_9897131;chr2L_9897473_9897825 3.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.13 15.56 26.67 27.27 NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG5059,I_chr3L_20509233_20511440,I_chr3L_20509985_20510360 chr3L - chr3L_20509233_20512316 chr3L_20509233_20512067 chr3L_20509133_20509232;chr3L_20512317_20512503 90.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.78 NA NA NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0926000000000001e-06 K alternative_donor mfas,I_chr3R_7811954_7812017,I_chr3R_7818597_7818853,I_chr3R_7818607_7818853,RI_chr3R_7818607_7818970 chr3R - chr3R_7818575_7818970 chr3R_7818575_7818853 chr3R_7818507_7818574;chr3R_7818971_7818995 13.46 NA NA NA NA NA 28.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor rho-7,noncoding_6143 chr2R - chr2R_7876069_7876127 chr2R_7876069_7876123 chr2R_7876008_7876068;chr2R_7876128_7876254 2.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA 19.05 NA NA NA NA NA 15.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4180134646830001e-06 N alternative_donor Lag1,RI_chrX_6153758_6153930,I_chrX_6153758_6155077,RI_chrX_6153758_6161036,I_chrX_6160907_6161036 chrX - chrX_6153758_6155077;chrX_6153758_6154631;chrX_6153758_6153930;chrX_6153758_6161036;chrX_6153758_6154193;chrX_6153758_6154358 chrX_6153758_6160439 chrX_6153658_6153757;chrX_6161037_6161136 86.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.93 NA 0.0 K alternative_donor CG40228,noncoding_14406,RI_chr3LHet_2190419_2190470 chr3LHet - chr3LHet_2190419_2190556;chr3LHet_2190419_2190563;chr3LHet_2190419_2190548;chr3LHet_2190419_2190561 chr3LHet_2190419_2190470 chr3LHet_2190319_2190418;chr3LHet_2190564_2190570 6.59 NA NA NA NA NA 26.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Sug,noncoding_12057 chr3L + chr3L_11681439_11682207 chr3L_11681445_11682207 chr3L_11682208_11683255;chr3L_11681252_11681438 12.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020981 K alternative_donor wge chr3R - chr3R_18543064_18545592 chr3R_18543064_18543161 chr3R_18542929_18543063;chr3R_18545593_18545739 3.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor I_chrX_7993650_7995126,Gclc chrX - chrX_8009614_8010024 chrX_8009614_8009706 chrX_8009450_8009613;chrX_8010025_8010150 4.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor I_chr2L_19388570_19389922,CG17544 chr2L - chr2L_19393657_19398346;chr2L_19393657_19398350 chr2L_19393657_19398334 chr2L_19393497_19393656;chr2L_19398351_19398401 27.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4895500000000003e-07 K alternative_donor iPLA2-VIA chr3L - chr3L_9856717_9857106;chr3L_9856717_9857292 chr3L_9856717_9856876 chr3L_9856421_9856716;chr3L_9857293_9857459 12.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 23.08 26.09 NA NA NA 22.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8178667095162491e-21 K alternative_donor CG11984,I_chr3R_4837327_4837766,I_chr3R_4845450_4845598 chr3R - chr3R_4839215_4839655;chr3R_4839215_4839561;chr3R_4839215_4839851;chr3R_4839215_4839889;chr3R_4839215_4839799 chr3R_4839215_4839728 chr3R_4839038_4839214;chr3R_4839890_4839901 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 27.27 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA 11.11 NA NA NA 1.1541663704335232e-10 K alternative_donor Cht2,I_chr3L_1754361_1754605,I_chr3L_1754361_1754860 chr3L - chr3L_1754361_1755586;chr3L_1754361_1754860 chr3L_1754361_1754605 chr3L_1754261_1754360;chr3L_1755587_1755934 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.014423 K alternative_donor Imp,I_chrX_10699490_10700695,RI_chrX_10699665_10700501,RI_chrX_10699665_10700695 chrX - chrX_10699665_10700474;chrX_10699665_10700695 chrX_10699665_10700501 chrX_10699565_10699664;chrX_10700696_10700795 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00030090265500000001 K alternative_donor CG32529 chrX + chrX_19781447_19793044 chrX_19781526_19793044 chrX_19793045_19793075;chrX_19781430_19781446 23.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 2.921742901584e-06 K alternative_donor unc-13,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_924098_924986 chr4_924098_924258 chr4_923998_924097;chr4_924987_925545 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8816970696500401e-09 K alternative_donor endos,I_chr3L_14024099_14024488,I_chr3L_14024103_14024158,I_chr3L_14024103_14024546,noncoding_12505,I_chr3L_14024496_14024546 chr3L - chr3L_14024103_14024546;chr3L_14024103_14024158;chr3L_14024103_14024407 chr3L_14024103_14024488 chr3L_14024003_14024102;chr3L_14024547_14024588 93.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7360000000000005e-08 K alternative_donor msn,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586265,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2585739_2586265;chr3L_2585739_2586402;chr3L_2585739_2586413 chr3L_2585739_2586036 chr3L_2585639_2585738;chr3L_2586414_2586502 12.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-05 K alternative_donor Rbf chrX - chrX_693047_693348 chrX_693047_693123 chrX_692311_693046;chrX_693349_693680 3.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.037918 K alternative_donor CG7324,I_chr3L_21335553_21335702,I_chr3L_21340055_21342206 chr3L - chr3L_21335553_21336030 chr3L_21335553_21335702 chr3L_21335453_21335552;chr3L_21336031_21336197 1.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9e-05 K alternative_donor G-salpha60A chr2R + chr2R_19830338_19831752;chr2R_19830349_19831752 chr2R_19830125_19831752 chr2R_19831753_19832263;chr2R_19830091_19830124 92.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA 68.42 NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA 77.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.896462452013947e-07 N alternative_donor CG31619 chr2L + chr2L_21711411_21712768 chr2L_21711681_21712768 chr2L_21712769_21712966;chr2L_21711315_21711410 5.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Cctgamma chr3R + chr3R_12473409_12473557;chr3R_12473318_12473557;chr3R_12473479_12473557;chr3R_12473424_12473557;chr3R_12473464_12473557 chr3R_12473420_12473557 chr3R_12473558_12473651;chr3R_12473311_12473317 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0000000000000002e-11 K alternative_donor CG4699 chr3R + chr3R_11624133_11624442;chr3R_11624190_11624442;chr3R_11624127_11624442 chr3R_11624200_11624442 chr3R_11624443_11624758;chr3R_11623809_11624126 51.79 NA NA 29.67 28.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Pkc98E chr3R + chr3R_24865713_24866817 chr3R_24865795_24866817 chr3R_24866818_24867147;chr3R_24865708_24865712 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049508000000000003 K alternative_donor CG4119 chrX + chrX_5560355_5560409;chrX_5560351_5560409 chrX_5560347_5560409 chrX_5560410_5560501;chrX_5560114_5560346 48.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.6480578000000002e-05 K alternative_donor Taz,I_chr2R_8641602_8641912,I_chr2R_8641633_8641971,I_chr2R_8648027_8648303 chr2R - chr2R_8641633_8641971 chr2R_8641633_8641912 chr2R_8641533_8641632;chr2R_8641972_8642012 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015284000000000001 K alternative_donor Cg25C,I_chr2L_5029811_5029873 chr2L + chr2L_5029811_5030136;chr2L_5029747_5030136 chr2L_5029637_5030136 chr2L_5030137_5030237;chr2L_5029620_5029636 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA 60.42 NA NA NA 4.4489064947453995e-09 K alternative_donor CG11347,I_chr3L_4412551_4417819 chr3L + chr3L_4419173_4419428 chr3L_4419263_4419428 chr3L_4419429_4419663;chr3L_4418782_4419172 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0041799999999999997 K alternative_donor CG33156 chr2R - chr2R_9437422_9439612 chr2R_9437422_9439456 chr2R_9437104_9437421;chr2R_9439613_9439932 89.44 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9411340000000002e-06 K alternative_donor CG31955,RI_chr2L_3712446_3712767 chr2L - chr2L_3712446_3712767 chr2L_3712446_3712497 chr2L_3712346_3712445;chr2L_3712768_3712862 88.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.00 77.88 74.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.26 65.57 70.93 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA 72.73 NA 78.21 78.26 77.57 NA 69.53 77.14 NA 0.0 K alternative_donor MB8.chr3R.pasa.66,Alh,I_chr3R_2924206_2924272,I_chr3R_2927820_2933442,RI_chr3R_2946518_2946663 chr3R - chr3R_2924206_2924276 chr3R_2924206_2924272 chr3R_2924106_2924205;chr3R_2924277_2924372 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038043 K alternative_donor Graf,RI_chrX_15652351_15654288,RI_chrX_15652363_15654157,RI_chrX_15652363_15654499,RI_chrX_15654228_15654288 chrX - chrX_15652363_15654272;chrX_15652363_15654499 chrX_15652363_15654157 chrX_15652357_15652362;chrX_15654500_15654599 33.33 NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1850707788000003e-06 K alternative_donor lig,CI_chr2R_3962006_3962916,I_chr2R_3962357_3962977,RI_chr2R_3962875_3962977 chr2R + chr2R_3961577_3962977;chr2R_3961910_3962977 chr2R_3962006_3962977 chr2R_3962978_3963016;chr2R_3961479_3961576 97.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG9674,I_chr3L_16793055_16793171,I_chr3L_16793055_16793190,I_chr3L_16793055_16800660 chr3L - chr3L_16793055_16793196;chr3L_16793055_16793173 chr3L_16793055_16793200 chr3L_16792955_16793054;chr3L_16793201_16793268 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00040200000000000001 N alternative_donor Aldolase,I_chr3R_22083764_22086684 chr3R - chr3R_22082030_22082195;chr3R_22082030_22082575 chr3R_22082030_22082256 chr3R_22081992_22082029 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.00 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA 71.43 0.0 K alternative_donor Sdc,RI_chr2R_17286086_17286391,I_chr2R_17286089_17286391,I_chr2R_17286819_17367595,I_chr2R_17324594_17367595 chr2R - chr2R_17286089_17286679 chr2R_17286089_17286391 chr2R_17286037_17286088;chr2R_17286680_17286818 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.89 NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA 27.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG32809,RI_chrX_1585391_1586471,a6,I_chrX_1589508_1589564 chrX - chrX_1589508_1589572 chrX_1589508_1589564 chrX_1589408_1589507;chrX_1589573_1589664 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1e-05 K alternative_donor CG34039 chr3L + chr3L_14553189_14554958 chr3L_14553919_14554958 chr3L_14554959_14555099;chr3L_14553171_14553188 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 75.00 66.67 NA NA 66.67 NA NA NA 55.56 66.67 NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 9.9857694035515669e-20 K alternative_donor RI_chrX_1796525_1796585,mip130,I_chrX_1820956_1821011,CG11596 chrX + chrX_1821927_1822366 chrX_1821953_1822366 chrX_1822367_1822613;chrX_1821726_1821926 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5312000000000001e-06 K alternative_donor CG11790,CG11791 chr3R + chr3R_20876091_20876902;chr3R_20875669_20876902 chr3R_20876340_20876902 chr3R_20876903_20877278;chr3R_20875600_20875668 70.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.74 48.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.16 NA NA NA 55.56 33.33 0.0 K alternative_donor CG7611,I_chr3L_21516702_21517821 chr3L + chr3L_21516706_21517821;chr3L_21516330_21517821;chr3L_21516399_21517821;chr3L_21517168_21517821;chr3L_21516501_21517821;chr3L_21516918_21517821;chr3L_21516343_21517821;chr3L_21516728_21517821 chr3L_21516722_21517821 chr3L_21517822_21517920;chr3L_21516311_21516329 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA 2.4814334999999996e-10 K alternative_donor ftz-f1,I_chr3L_18790575_18790636 chr3L - chr3L_18746544_18747413 chr3L_18746544_18746932 chr3L_18746285_18746543;chr3L_18747414_18747612 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.33 NA NA 21.05 NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.102344142242961e-12 K alternative_donor kis,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_242745_250756 chr2L_242745_242800 chr2L_242645_242744;chr2L_250757_250774 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 25.00 20.00 33.33 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 4.6682233062337721e-17 K alternative_donor stc chr2L + chr2L_15114214_15114299 chr2L_15114235_15114299 chr2L_15114300_15114310;chr2L_15114049_15114213 18.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA 30.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.4235999999999994e-07 K alternative_donor Gp150,I_chr2R_18205316_18205386,I_chr2R_18213233_18213308 chr2R + chr2R_18205274_18205386;chr2R_18205316_18205386;chr2R_18205282_18205386 chr2R_18205243_18205386 chr2R_18205387_18205459;chr2R_18205216_18205242 86.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.12 NA 61.16 NA 60.42 66.67 54.43 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA 71.43 NA NA 68.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor CG42231,chif,CaBP1 chr2L - chr2L_16349473_16351926 chr2L_16349473_16349986 chr2L_16347464_16349472;chr2L_16351927_16352093 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA 3.5210349999999997e-06 K alternative_donor CG15309,RI_chrX_10102328_10103556,RI_chrX_10102328_10104750 chrX - chrX_10102328_10106185 chrX_10102328_10104040 chrX_10102228_10102327;chrX_10106186_10106379 13.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.038337000000000003 K alternative_donor CG17471,I_chr4_1215995_1216053,I_chr4_1216718_1217333,I_chr4_1217104_1217410 chr4 - chr4_1217104_1217473;chr4_1217104_1217333;chr4_1217104_1217383 chr4_1217104_1217302 chr4_1217009_1217103;chr4_1217474_1217480 0.00 NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022492000000000002 K alternative_donor I_chr2R_17169674_17170491,CG10069,I_chr2R_17169897_17170495,I_chr2R_17170432_17170491,I_chr2R_17171765_17171886 chr2R + chr2R_17170432_17170491;chr2R_17170336_17170491;chr2R_17169885_17170491;chr2R_17170070_17170491 chr2R_17169897_17170491 chr2R_17170492_17170591;chr2R_17169869_17169884 80.77 NA NA NA NA NA 54.05 61.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5447199999999998e-07 N alternative_donor RI_chrX_8608147_8608508,I_chrX_8608169_8608438,l(1)G0020 chrX - chrX_8610980_8611119 chrX_8610980_8611115 chrX_8610747_8610979;chrX_8611120_8612089 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.89 13.51 NA NA NA NA NA NA NA 12.50 12.20 NA NA NA NA NA 14.29 NA NA 13.16 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.43 NA NA NA NA NA 10.34 NA 3.3686217133731134e-16 K alternative_donor Hel25E,I_chr2L_5540301_5540396 chr2L - chr2L_5540301_5540971;chr2L_5540301_5540396 chr2L_5540301_5540424 chr2L_5540201_5540300;chr2L_5540972_5541090 5.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG5537,I_chr3L_5804425_5804485 chr3L + chr3L_5805019_5805164 chr3L_5805080_5805164 chr3L_5805165_5805330;chr3L_5804976_5805018 92.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0074019999999999997 K alternative_donor E(bx),I_chr3L_246324_246699 chr3L - chr3L_246324_246885;chr3L_246324_246438;chr3L_246324_246408;chr3L_246324_246794;chr3L_246324_246382;chr3L_246324_246388 chr3L_246324_246427 chr3L_246224_246323;chr3L_246886_246901 25.00 NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.81 NA NA NA 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 7.2609732190894073e-13 K alternative_donor Iswi chr2R + chr2R_8524243_8524348 chr2R_8524287_8524348 chr2R_8524349_8524495;chr2R_8524226_8524242 4.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021672 K alternative_donor tacc,I_chr3R_570388_572101,I_chr3R_574271_574512 chr3R - chr3R_560576_560886;chr3R_560576_560847 chr3R_560576_560883 chr3R_560204_560575;chr3R_560887_561068 34.59 NA 24.24 NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA 22.43 19.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.27 NA NA NA NA 24.09 NA NA NA NA 45.33 23.91 24.37 NA 23.58 NA NA 24.14 NA NA 23.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 10.22 0.0 K alternative_donor scu,RhoGAP16F chrX + chrX_17987656_17989117;chrX_17988131_17989117;chrX_17987638_17989117 chrX_17988127_17989117 chrX_17989118_17990486;chrX_17987544_17987637 21.43 NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 50.00 NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Keap1 chr3R - chr3R_12902616_12905594;chr3R_12902616_12905148 chr3R_12902616_12905144 chr3R_12902299_12902615;chr3R_12905595_12905636 0.00 NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6819999999999986e-09 K alternative_donor l(2)k01209,I_chr2R_13308079_13310771,I_chr2R_13309452_13310771,RI_chr2R_13310877_13311160 chr2R + chr2R_13309417_13311160;chr2R_13308486_13311160;chr2R_13308079_13311160 chr2R_13309452_13311160 chr2R_13311161_13311260;chr2R_13307979_13308078 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.35 NA 29.03 54.67 NA NA NA 30.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0670103664116779e-09 K alternative_donor CG3558,RI_chr2L_2995071_2997790 chr2L + chr2L_2993464_2993544;chr2L_2993410_2993544;chr2L_2993444_2993544 chr2L_2993378_2993544 chr2L_2993545_2994408;chr2L_2993028_2993377 92.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.08 NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6458899999999999e-07 K alternative_donor noncoding_18450,CG6982,CG17618,CG17618_CG6982 chr3R + chr3R_18552824_18554564 chr3R_18553214_18554564 chr3R_18554565_18554629;chr3R_18552763_18552823 14.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00011 K alternative_donor CG32537,CG32536 chrX - chrX_19169562_19170509 chrX_19169562_19170250 chrX_19169433_19169561;chrX_19170510_19170572 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.26 8.1095858513484865e-14 K alternative_donor sd,noncoding_23930,RI_chrX_15706472_15707633,RI_chrX_15706568_15707633 chrX + chrX_15706305_15707881;chrX_15706564_15707881 chrX_15706472_15707881 chrX_15707882_15708324;chrX_15706259_15706304 22.22 NA NA 50.00 NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA 51.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2538154998242064e-12 K alternative_donor vkg,I_chr2L_5027222_5027297,I_chr2L_5027222_5028118 chr2L - chr2L_5027222_5028118;chr2L_5027222_5027351 chr2L_5027222_5027297 chr2L_5027122_5027221;chr2L_5028119_5028218 14.29 NA NA NA NA NA NA 25.64 NA NA NA 24.39 NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2139212612818816e-10 K alternative_donor CG41099,I_chr3RHet_1688505_1705884,RI_chr3RHet_1703294_1705884 chr3RHet - chr3RHet_1703298_1705901 chr3RHet_1703298_1705884 chr3RHet_1702561_1703297;chr3RHet_1705902_1705984 77.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA 0.0071859999999999997 K alternative_donor Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,RI_chr3L_16045275_16045854,RI_chr3L_16045275_16046111,RI_chr3L_16045277_16046104,I_chr3L_16045316_16046104,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16045316_16046104;chr3L_16045277_16046104;chr3L_16045275_16046104 chr3L_16045251_16046104 chr3L_16046105_16046204;chr3L_16045216_16045250 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.96 NA NA 79.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.07 1.5280304909999998e-09 K alternative_donor RhoGDI chr3L + chr3L_19921875_19923914;chr3L_19921911_19923914 chr3L_19922009_19923914 chr3L_19923915_19924114;chr3L_19921868_19921874 93.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0999999999999999e-05 K alternative_donor rl,I_chr2RHet_199154_207044,RI_chr2RHet_203476_203577,RI_chr2RHet_203592_207044,I_chr2RHet_232696_247338,RI_chr2RHet_240197_247338 chr2RHet + chr2RHet_198760_198981 chr2RHet_198817_198981 chr2RHet_198982_199153;chr2RHet_198753_198759 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019071999999999999 K alternative_donor kar,I_chr3R_8510245_8510617,I_chr3R_8510258_8513437,I_chr3R_8514177_8514930 chr3R - chr3R_8510245_8513437;chr3R_8510245_8510655 chr3R_8510245_8510617 chr3R_8510234_8510244;chr3R_8513438_8513461 0.00 NA NA NA NA NA NA 20.00 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Nedd4,I_chr3L_17526753_17527450,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17526749_17527450;chr3L_17526950_17527450 chr3L_17526753_17527450 chr3L_17527451_17527550;chr3L_17526708_17526748 24.44 NA NA 10.71 NA 51.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.87973421864e-07 K alternative_donor Mpk2,I_chr3R_19977468_19977530,F_chr3R_19985127_19985197 chr3R - chr3R_19977468_19977567 chr3R_19977468_19977530 chr3R_19977368_19977467;chr3R_19977568_19977630 2.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042866000000000001 N alternative_donor Ser,I_chr3R_23013597_23017227 chr3R - chr3R_23017847_23019665 chr3R_23017847_23018224 chr3R_23017228_23017846;chr3R_23019666_23019964 18.18 NA 42.86 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA 36.36 NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG12753,CG14894,RI_chr3R_12268071_12268135,RI_chr3R_12268071_12268141,RI_chr3R_12268071_12268661,Pak3 chr3R - chr3R_12268071_12268661;chr3R_12268071_12268145;chr3R_12268071_12268141;chr3R_12268071_12268135 chr3R_12268071_12268124 chr3R_12267971_12268070;chr3R_12268662_12268688 88.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Taf6 chr3L + chr3L_19594248_19594309 chr3L_19594250_19594309 chr3L_19594310_19594484;chr3L_19594013_19594247 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2945513000000001e-05 N alternative_donor blow,RI_chr2R_3470434_3470776 chr2R - chr2R_3472863_3474487 chr2R_3472863_3474436 chr2R_3472561_3472862;chr2R_3474488_3474581 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035500000000000002 K alternative_donor I_chr3L_3151185_3151263,CG32280 chr3L + chr3L_3165222_3167941;chr3L_3165255_3167941;chr3L_3165352_3167941;chr3L_3165704_3167941;chr3L_3165407_3167941 chr3L_3165390_3167941 chr3L_3167942_3168265;chr3L_3165212_3165221 0.00 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017624999999999998 K alternative_donor row,I_chr2R_11098574_11098633 chr2R - chr2R_11098574_11099081 chr2R_11098574_11098633 chr2R_11098474_11098573;chr2R_11099082_11099172 11.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.47 NA 1.0917553399999999e-10 K alternative_donor CG17490 chr2L + chr2L_22431120_22432684;chr2L_22431088_22432684;chr2L_22431020_22432684 chr2L_22431301_22432684 chr2L_22432685_22433056;chr2L_22431014_22431019 87.04 NA NA NA 65.00 NA 72.34 72.92 NA NA NA NA NA 74.07 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA 68.42 71.43 NA NA NA NA 1.7338050504080625e-15 N alternative_donor CG30492,C_chr2R_3522706_3523025,CG30494,RI_chr2R_3536203_3536977,I_chr2R_3543397_3543455 chr2R + chr2R_3528123_3535801 chr2R_3533932_3535801 chr2R_3535802_3535913;chr2R_3527622_3528122 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.54 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA 11.43 NA NA 1.9544071910400003e-17 K alternative_donor foi,I_chr3L_8520658_8520733,I_chr3L_8524905_8524976 chr3L + chr3L_8518753_8523659;chr3L_8518490_8523659 chr3L_8518805_8523659 chr3L_8523660_8524249;chr3L_8518407_8518489 91.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.42298e-06 K alternative_donor CG8446 chr2R + chr2R_12084078_12084196 chr2R_12084108_12084196 chr2R_12084197_12084416;chr2R_12083895_12084077 45.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.14 NA NA NA NA NA NA NA NA 67.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00037574198399999999 N alternative_donor CG8051,I_chrX_19198128_19201351 chrX - chrX_19198128_19199326;chrX_19198128_19201671 chrX_19198128_19199330 chrX_19198028_19198127;chrX_19201672_19201734 0.00 NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA 12.50 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA 0.0 K alternative_donor RpL28,RI_chr3L_3221710_3221877,I_chr3L_3221982_3222744,snoRNA:Or-CD11c,snoRNA:Or-CD11b,snoRNA:Or-CD11a,I_chr3L_3222575_3222787 chr3L - chr3L_3221982_3222152;chr3L_3221982_3222574;chr3L_3221982_3222926;chr3L_3221982_3222365;chr3L_3221982_3222847 chr3L_3221982_3222787 chr3L_3221882_3221981;chr3L_3222927_3222958 4.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 31.75 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.29 24.49 26.83 37.50 NA NA NA NA NA NA NA 26.00 NA NA 25.00 38.10 NA NA 47.37 NA 24.29 NA NA 0.0 K alternative_donor ph-d chrX - chrX_2015658_2017014 chrX_2015658_2015729 chrX_2015184_2015657;chrX_2017015_2017061 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031960000000000002 K alternative_donor mri,RI_chr3L_201061_201173,I_chr3L_212783_212843 chr3L + chr3L_201759_201816 chr3L_201763_201816 chr3L_201817_202165;chr3L_201441_201758 6.00 NA NA 29.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.30 NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.7653399999999997e-12 K alternative_donor Roughened,I_chr3L_1861677_1861777,I_chr3L_1861677_1861929,I_chr3L_1861677_1862177 chr3L - chr3L_1861677_1862060;chr3L_1861677_1862177 chr3L_1861677_1861777 chr3L_1861577_1861676;chr3L_1862178_1862277 3.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG34123,I_chr2R_11159045_11159622,RI_chr2R_11160894_11162043,I_chr2R_11167854_11168411 chr2R - chr2R_11154968_11155346 chr2R_11154968_11155310 chr2R_11154735_11154967;chr2R_11155347_11155470 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6479999999999999e-09 K alternative_donor scrib,I_chr3R_22362324_22363015,I_chr3R_22381374_22399575,I_chr3R_22406745_22416162,I_chr3R_22416440_22420970,I_chr3R_22425016_22429281 chr3R + chr3R_22362244_22363092;chr3R_22362120_22363092;chr3R_22362315_22363092;chr3R_22362254_22363092;chr3R_22362224_22363092;chr3R_22362142_22363092 chr3R_22362324_22363092 chr3R_22363093_22363115;chr3R_22362112_22362119 15.87 NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA 28.12 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA 28.95 NA 30.77 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor vlc chr2R + chr2R_1589953_1590371;chr2R_1589894_1590371;chr2R_1589805_1590371;chr2R_1590318_1590371;chr2R_1589807_1590371;chr2R_1590294_1590371;chr2R_1589722_1590371;chr2R_1589693_1590371 chr2R_1589799_1590371 chr2R_1590372_1590451;chr2R_1589612_1589692 58.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 0.0 N alternative_donor Tpi chr3R - chr3R_25959817_25960000;chr3R_25959817_25959972 chr3R_25959817_25959887 chr3R_25959232_25959816;chr3R_25960001_25960005 1.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.57 NA NA NA NA NA 15.91 38.46 NA NA NA 18.00 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG17528,RI_chr2R_706735_711409,I_chr2R_706735_711443,I_chr2R_707374_711443 chr2R - chr2R_707442_711443;chr2R_707442_711615 chr2R_707442_711409 chr2R_706793_707441;chr2R_711616_711627 47.06 NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA 75.00 NA NA NA 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0889669813057167e-06 K alternative_donor CG1024 chr3R - chr3R_2203902_2204191 chr3R_2203902_2204127 chr3R_2203688_2203901;chr3R_2204192_2205676 30.00 NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023370000000000001 K alternative_donor CG18812,I_chr2R_3617214_3617883,I_chr2R_3617214_3622585 chr2R - chr2R_3617214_3622881 chr2R_3617214_3617883 chr2R_3617147_3617213;chr2R_3622882_3623125 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG16940,I_chr3L_212740_212843,I_chr3L_212783_212843,noncoding_9585,Kaz1-ORFA_Kaz1-ORFB chr3L + chr3L_212785_212843;chr3L_212308_212843 chr3L_212788_212843 chr3L_212844_212943;chr3L_212275_212307 15.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA 33.33 NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0039642536e-07 K alternative_donor CG5694,RI_chr2L_10229956_10231366 chr2L - chr2L_10229956_10231282;chr2L_10229956_10231538 chr2L_10229956_10231394 chr2L_10229856_10229955;chr2L_10231539_10231648 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.7999999999999997e-05 K alternative_donor gish chr3R + chr3R_12100604_12100675;chr3R_12100598_12100675 chr3R_12100608_12100675 chr3R_12100676_12100891;chr3R_12100535_12100597 45.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.56 57.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6971683703000004e-08 K alternative_donor RpL35,I_chrX_5566913_5567030,I_chrX_5567168_5567220 chrX + chrX_5566913_5567030;chrX_5566556_5567030 chrX_5566909_5567030 chrX_5567031_5567130;chrX_5566554_5566555 87.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.83 NA NA NA NA NA NA 56.11 NA NA NA 76.69 NA NA NA NA NA NA NA NA 70.99 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RPA2,RI_chr2L_20925851_20925909 chr2L - chr2L_20925851_20925913 chr2L_20925851_20925909 chr2L_20925751_20925850;chr2L_20925914_20925975 1.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0000000000000002e-06 K alternative_donor Ssdp,RI_chr3R_14022843_14025255 chr3R - chr3R_14022843_14024928 chr3R_14022843_14024423 chr3R_14022743_14022842;chr3R_14024929_14025096 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000107 N alternative_donor CG11200 chr2R - chr2R_16194142_16196065 chr2R_16194142_16195651 chr2R_16193920_16194141;chr2R_16196066_16196078 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.2000000000000002e-05 K alternative_donor CG31650,I_chr2L_5042885_5042960,I_chr2L_5042888_5042983,I_chr2L_5042891_5042964,I_chr2L_5042891_5043016,RI_chr2L_5042935_5042983,I_chr2L_5043017_5043077 chr2L - chr2L_5042888_5043077;chr2L_5042888_5042983 chr2L_5042888_5042960 chr2L_5042835_5042887;chr2L_5043078_5043083 74.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.05 NA NA NA 9.0688660662599996e-12 K alternative_donor cul-2,I_chr2L_21659273_21659705,I_chr2L_21659761_21659839,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21659273_21659839 chr2L_21659761_21659839 chr2L_21659840_21659939;chr2L_21659173_21659272 4.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 0.0 N alternative_donor CG16971,CG33229,I_chr3L_225856_225909,RI_chr3L_225919_226004,I_chr3L_229245_230186 chr3L + chr3L_224184_224972;chr3L_224779_224972 chr3L_224886_224972 chr3L_224973_225140;chr3L_224174_224183 12.75 23.50 NA 37.83 NA NA NA 2.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.01 NA NA 25.32 35.33 32.91 66.42 58.09 NA NA NA NA NA NA NA 42.01 NA 25.20 NA NA 31.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.14 NA NA 25.00 NA 0.0 K alternative_donor Nipped-B,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_616057_617208;chr2R_616057_616318;chr2R_616057_616311 chr2R_616057_616283 chr2R_615957_616056;chr2R_617209_617308 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.5865337999999997e-05 K alternative_donor fwd,RI_chr3L_319514_319746 chr3L - chr3L_314318_319746 chr3L_314318_318990 chr3L_313024_314317;chr3L_319747_319846 62.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001408 K alternative_donor mys,I_chrX_7958795_7961094 chrX + chrX_7955904_7957872;chrX_7955908_7957872;chrX_7955914_7957872;chrX_7956114_7957872;chrX_7955901_7957872;chrX_7956125_7957872;chrX_7955967_7957872 chrX_7955759_7957872 chrX_7957873_7958492;chrX_7955741_7955758 85.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 97.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.74 69.23 NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA 72.88 64.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 70.00 NA NA 56.25 NA NA 72.15 NA 0.0 K alternative_donor Ten-a chrX + chrX_12097912_12098171;chrX_12097945_12098171;chrX_12098018_12098171;chrX_12098012_12098171 chrX_12098030_12098171 chrX_12098172_12098306;chrX_12097907_12097911 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048640999999999997 K alternative_donor smi35A,E_chr2L_14222082_14233578,E_chr2L_14222082_14233893,RI_chr2L_14233579_14233647 chr2L - chr2L_14229537_14233578;chr2L_14229537_14233893 chr2L_14229537_14233647 chr2L_14229532_14229536;chr2L_14233894_14233993 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 5.9215457280000003e-08 K alternative_donor CG42507,Trl,I_chr3L_14745733_14745798,CI_chr3L_14750431_14753667,I_chr3L_14754175_14754238 chr3L - chr3L_14744876_14746433;chr3L_14744876_14746310 chr3L_14744876_14745798 chr3L_14744367_14744875;chr3L_14746434_14746571 47.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.51 NA NA NA NA NA NA NA NA 58.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG30005,I_chr2R_5495525_5495581 chr2R + chr2R_5495523_5495581 chr2R_5495525_5495581 chr2R_5495582_5495681;chr2R_5495425_5495522 0.00 NA NA NA NA NA 10.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00024568143600000003 K alternative_donor mthl3 chr2R - chr2R_13338538_13340067;chr2R_13338538_13340031;chr2R_13338538_13339957;chr2R_13338538_13340007 chr2R_13338538_13338593 chr2R_13338407_13338537;chr2R_13340068_13340078 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.1920284380000008e-14 N alternative_donor CG14253,E_chr3R_22806425_22807258 chr3R + chr3R_22806824_22807254;chr3R_22806425_22807254;chr3R_22806454_22807254 chr3R_22806725_22807254 chr3R_22807255_22807473;chr3R_22806325_22806424 2.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Syx16,RI_chrX_20264319_20264376 chrX - chrX_20264319_20264380 chrX_20264319_20264376 chrX_20264219_20264318;chrX_20264381_20264476 1.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0052969999999999996 K alternative_donor Nhe2,I_chr2L_21122390_21122912 chr2L + chr2L_21124522_21125346 chr2L_21124615_21125346 chr2L_21125347_21125439;chr2L_21124443_21124521 2.78 NA NA 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010429000000000001 K alternative_donor CG32687,I_chrX_10377592_10378408 chrX - chrX_10377592_10379743 chrX_10377592_10378408 chrX_10377492_10377591;chrX_10379744_10380660 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0011689999999999999 K alternative_donor Rab5,I_chr2L_2361586_2364444,RI_chr2L_2361586_2364627,I_chr2L_2361586_2364794 chr2L - chr2L_2361586_2364640;chr2L_2361586_2364480;chr2L_2361586_2364836;chr2L_2361586_2365060;chr2L_2361586_2364302;chr2L_2361586_2364594;chr2L_2361586_2364312 chr2L_2361586_2364889 chr2L_2361486_2361585;chr2L_2365061_2365065 54.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA 31.25 33.33 28.57 NA 36.00 26.53 NA NA 20.83 NA NA NA 34.29 25.00 NA NA 37.04 NA 30.43 NA 29.41 NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA 27.78 0.0 K alternative_donor I_chr2R_7171366_7171418,fbl6,dare chr2R - chr2R_7176066_7176572;chr2R_7176066_7177174 chr2R_7176066_7176897 chr2R_7175150_7176065;chr2R_7177175_7177253 72.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 58.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.2001685119999996e-08 K alternative_donor CG12384,I_chr2R_7245925_7246462,RI_chr2R_7245930_7246231,RI_chr2R_7245930_7246259 chr2R - chr2R_7245930_7246462 chr2R_7245930_7246231 chr2R_7245841_7245929;chr2R_7246463_7246526 3.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Atg7,I_chr2R_14508838_14508931 chr2R - chr2R_14508838_14510509 chr2R_14508838_14508931 chr2R_14508738_14508837;chr2R_14510510_14510674 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1704218143939996e-06 K alternative_donor Chc,RI_chrX_15728405_15729273,I_chrX_15728405_15729401,I_chrX_15728946_15729357 chrX - chrX_15728405_15729260;chrX_15728405_15729370;chrX_15728405_15729476;chrX_15728405_15729319 chrX_15728405_15729357 chrX_15728305_15728404;chrX_15729477_15729501 87.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0040689999999999997 K alternative_donor CG2818 chr2L + chr2L_3714584_3714646;chr2L_3714574_3714646 chr2L_3714492_3714646 chr2L_3714647_3716104;chr2L_3714467_3714491 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012086685000000001 K alternative_donor milt,I_chr2L_7038283_7040472,I_chr2L_7038944_7040472,I_chr2L_7051093_7051366 chr2L + chr2L_7038279_7040472 chr2L_7038944_7040472 chr2L_7040473_7040572;chr2L_7038273_7038278 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.2000000000000003e-05 K alternative_donor CG4699 chr3R + chr3R_11619752_11620550;chr3R_11619772_11620550;chr3R_11619570_11620550;chr3R_11619776_11620550 chr3R_11619676_11620550 chr3R_11620551_11621301;chr3R_11619539_11619569 74.07 NA NA NA NA NA NA 85.71 NA 30.00 NA NA NA NA NA 87.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.993777632e-09 K alternative_donor Btk29A,I_chr2L_8262681_8277370,I_chr2L_8298341_8298782,I_chr2L_8298341_8300884 chr2L - chr2L_8298341_8300817;chr2L_8298341_8300714 chr2L_8298341_8300505 chr2L_8298241_8298340;chr2L_8300818_8301040 80.00 NA NA NA NA NA NA 68.57 NA NA 63.64 NA NA NA 64.00 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA 56.25 64.71 NA 63.16 NA 1.2779084392547269e-32 K alternative_donor chic,RI_chr2L_5976783_5980950,I_chr2L_5979705_5979818,I_chr2L_5979705_5979941,RI_chr2L_5979705_5979951,I_chr2L_5979705_5979953,I_chr2L_5979705_5980025,I_chr2L_5979705_5980213,I_chr2L_5979705_5980370,I_chr2L_5979705_5980558,I_chr2L_5979705_5980632,I_chr2L_5979705_5980639,RI_chr2L_5979705_5980734 chr2L - chr2L_5979705_5980952;chr2L_5979705_5980950 chr2L_5979705_5980846 chr2L_5979605_5979704;chr2L_5980953_5981025 6.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA 2.456e-08 K alternative_donor CG8173,I_chrX_17602681_17603175 chrX - chrX_17602681_17603214 chrX_17602681_17603175 chrX_17602581_17602680;chrX_17603215_17603275 2.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029633 N alternative_donor mfrn,I_chr3R_23770737_23770817,I_chr3R_23771063_23771153,I_chr3R_23771063_23772599 chr3R - chr3R_23771063_23772915;chr3R_23771063_23771153 chr3R_23771063_23771137 chr3R_23770974_23771062;chr3R_23772916_23773724 2.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16323441_16324653 chrX_16324290_16324653 chrX_16324654_16324797;chrX_16323093_16323440 20.55 NA NA NA NA NA NA 8.53 NA NA 10.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.55 NA NA NA NA NA NA 37.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor Syb chr2R - chr2R_6137333_6137873;chr2R_6137333_6138451 chr2R_6137333_6138021 chr2R_6137005_6137332;chr2R_6138452_6138649 7.37 NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA 40.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.77 NA NA NA NA NA NA 20.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor F_chr2L_15260838_15261717,cul-3 chr2L - chr2L_15271144_15271322;chr2L_15271144_15271202 chr2L_15271144_15271833 chr2L_15270905_15271143;chr2L_15271834_15271894 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.82 NA NA NA NA NA 53.57 42.86 NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.71 0.0 K alternative_donor CG11486,RE_chr3L_3084894_3085203 chr3L + chr3L_3081761_3083732 chr3L_3082228_3083732 chr3L_3083733_3083809;chr3L_3081699_3081760 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA 63.64 NA NA NA NA NA 68.42 NA NA NA NA NA NA 46.15 61.54 56.25 NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA 54.55 7.8687093552591744e-22 K alternative_donor shot,I_chr2R_9754481_9757364,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9770053_9781634 chr2R_9770053_9771599 chr2R_9769906_9770052;chr2R_9781635_9782097 92.16 NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Aldh-III,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3357578_3357898 chr2R_3357578_3357636 chr2R_3357478_3357577;chr2R_3357899_3358120 3.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor gpp,I_chr3R_2271795_2272181,CG33324 chr3R + chr3R_2270033_2272181 chr3R_2271795_2272181 chr3R_2272182_2272281;chr3R_2269544_2270032 21.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.88 NA NA NA NA NA NA 9.26 NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA 8.82 NA NA NA NA NA 9.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor fs(1)h,I_chrX_7938425_7938871,I_chrX_7938425_7938878,I_chrX_7938449_7944184,I_chrX_7950171_7952371,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7938425_7944184;chrX_7938425_7938871 chrX_7938425_7938878 chrX_7938366_7938424;chrX_7944185_7944284 14.71 NA NA NA NA NA NA 27.88 NA 2.13 NA 26.27 NA NA NA NA 26.09 NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG14741 chr3R - chr3R_7897251_7898049 chr3R_7897251_7898007 chr3R_7897104_7897250;chr3R_7898050_7898194 71.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.08 NA NA NA NA NA NA 81.88 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.61 NA 82.09 NA NA NA 82.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.64 2.1667690281097379e-15 K alternative_donor fs(1)h,I_chrX_7950171_7952371,I_chrX_7954192_7955240 chrX - chrX_7944590_7945403 chrX_7944590_7945391 chrX_7944470_7944589;chrX_7945404_7945562 20.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00083199999999999995 K alternative_donor rut,I_chrX_14718760_14718821 chrX - chrX_14686462_14687506 chrX_14686462_14687158 chrX_14685281_14686461;chrX_14687507_14688185 93.33 NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00028895912999999995 N alternative_donor MED10,I_chr3L_16225377_16225479 chr3L + chr3L_16225377_16225485 chr3L_16225424_16225485 chr3L_16225486_16225579;chr3L_16225277_16225376 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042231999999999999 K alternative_donor CG18624,RI_chrX_7787450_7787620,RI_chrX_7787450_7787687,RI_chrX_7787524_7787687 chrX - chrX_7787524_7787782 chrX_7787524_7787620 chrX_7787424_7787523;chrX_7787783_7787787 18.65 NA 5.62 NA 6.57 4.38 NA NA 8.55 NA 5.49 NA NA NA 5.52 NA 6.48 5.36 8.61 5.52 7.63 47.62 NA NA NA NA 63.16 NA 69.23 NA NA NA NA 8.13 NA 50.00 NA NA NA NA NA 6.06 7.69 47.37 NA NA NA NA 8.29 NA NA NA NA NA 4.85 NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG7816,R_chr3R_25691122_25691551,RI_chr3R_25691122_25692883,RI_chr3R_25691122_25694436 chr3R - chr3R_25691122_25694365 chr3R_25691122_25694254 chr3R_25691022_25691121;chr3R_25694366_25694618 81.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01192 K alternative_donor Nedd4,I_chr3L_17532828_17532882,I_chr3L_17532828_17533787,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17532828_17533790 chr3L_17532837_17533790 chr3L_17533791_17533887;chr3L_17532728_17532827 77.42 NA NA NA NA NA 51.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6999999999999997e-05 K alternative_donor CG2519 chr3R - chr3R_1372457_1373328 chr3R_1372457_1373058 chr3R_1372178_1372456;chr3R_1373329_1373473 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K alternative_donor Rap2l,I_chr2R_19951753_19952256,RI_chr2R_19952181_19952256 chr2R + chr2R_19951097_19952256;chr2R_19951753_19952256 chr2R_19952181_19952256 chr2R_19952257_19952356;chr2R_19950576_19951096 5.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Pcmt chr3R - chr3R_1378768_1378992 chr3R_1378768_1378947 chr3R_1378542_1378767;chr3R_1378993_1379397 4.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030294999999999999 K alternative_donor F_chr3R_19799277_19802225,CG5902,Rab7 chr3R + chr3R_19812438_19812753 chr3R_19812669_19812753 chr3R_19812754_19812932;chr3R_19812343_19812437 28.57 NA NA NA NA NA NA NA 16.90 NA NA NA NA NA NA 15.31 NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA 64.00 NA NA NA NA NA NA 75.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 0.0 K alternative_donor CG11367,CG32454,I_chr3L_22724590_22725116 chr3L + chr3L_22722194_22725116 chr3L_22724590_22725116 chr3L_22725117_22725134;chr3L_22721249_22722193 11.11 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 22.22 NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1726793693695031e-10 K alternative_donor CG2017 chr3R - chr3R_1686127_1687468;chr3R_1686127_1688092;chr3R_1686127_1687510 chr3R_1686127_1687891 chr3R_1685454_1686126;chr3R_1688093_1688097 60.98 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 48.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.70 NA NA NA 72.73 77.14 NA 2.2951445154094731e-17 K alternative_donor CG10277,I_chr3R_2208983_2210253,I_chr3R_2211939_2212057 chr3R + chr3R_2209240_2210702;chr3R_2209244_2210702 chr3R_2208983_2210702 chr3R_2210703_2210980;chr3R_2208883_2208982 95.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_donor Adar,I_chrX_1668256_1682696,I_chrX_1674594_1674717 chrX + chrX_1673292_1674094 chrX_1673403_1674094 chrX_1674095_1674277;chrX_1673123_1673291 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048758999999999997 K alternative_donor Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11821325_11821703 chr2R_11821325_11821603 chr2R_11821304_11821324;chr2R_11821704_11822085 8.27 NA NA 22.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4937028920000001e-09 K alternative_donor EI_chr2L_13164741_13164824,Sfmbt chr2L - chr2L_13170785_13171381 chr2L_13170785_13171312 chr2L_13169657_13170784;chr2L_13171382_13171665 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 13.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG14872,REI_chr3R_11334285_11334336 chr3R - chr3R_11334285_11334385 chr3R_11334285_11334336 chr3R_11334185_11334284;chr3R_11334386_11334436 12.12 NA NA NA NA NA 26.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010095 K alternative_donor arm,I_chrX_1790787_1794076,I_chrX_1793073_1793336,I_chrX_1793073_1793350,I_chrX_1793073_1793389,I_chrX_1793073_1793734,I_chrX_1793073_1794406,RI_chrX_1795648_1795745,I_chrX_1798310_1798525,I_chrX_1798315_1798577 chrX - chrX_1793073_1793794;chrX_1793073_1793431 chrX_1793073_1793413 chrX_1793013_1793072;chrX_1793795_1793834 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 0.00035319143700000003 K alternative_donor CG31038,I_chr3R_25702915_25703648,I_chr3R_25705533_25722419,I_chr3R_25727788_25727905 chr3R + chr3R_25702915_25703648;chr3R_25702989_25703648;chr3R_25702895_25703648;chr3R_25702897_25703648;chr3R_25702901_25703648;chr3R_25702838_25703648 chr3R_25702970_25703648 chr3R_25703649_25703748;chr3R_25702831_25702837 16.67 NA 36.36 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00068772250800000002 K alternative_donor Mical,I_chr3R_5834577_5835458,I_chr3R_5843939_5844218,I_chr3R_5847106_5863537,I_chr3R_5863483_5863537,I_chr3R_5863613_5868513 chr3R - chr3R_5840828_5840905 chr3R_5840828_5840896 chr3R_5840712_5840827;chr3R_5840906_5840969 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021332 K alternative_donor Mgat2,I_chr3R_25845406_25845472,I_chr3R_25845406_25846373 chr3R - chr3R_25845406_25847371;chr3R_25845406_25846373;chr3R_25845406_25847670 chr3R_25845406_25845472 chr3R_25845317_25845405;chr3R_25847671_25847898 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor mld,atl chr3R + chr3R_20451535_20457504 chr3R_20451677_20457504 chr3R_20457505_20457813;chr3R_20451524_20451534 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038539999999999998 K alternative_donor Ptp10D,CEF_chrX_11516219_11517862,I_chrX_11516225_11516345 chrX + chrX_11516219_11517785;chrX_11516213_11517785;chrX_11516391_11517785 chrX_11516225_11517785 chrX_11517786_11518234;chrX_11516125_11516212 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.002843 K alternative_donor lok,RI_chr2L_20063248_20063377 chr2L + chr2L_20062013_20062147 chr2L_20062064_20062147 chr2L_20062148_20062305;chr2L_20061782_20062012 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.61 NA NA NA 19.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00019475788500000001 K alternative_donor CG14442,I_chrX_6586147_6586435 chrX - chrX_6586898_6587143 chrX_6586898_6587125 chrX_6586436_6586897;chrX_6587144_6589034 67.86 NA NA 92.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00045950980599999996 K alternative_donor ps,I_chr3R_5243723_5265067,I_chr3R_5243723_5270765,noncoding_15575,I_chr3R_5245770_5265067,I_chr3R_5245770_5269732,I_chr3R_5269733_5270765 chr3R + chr3R_5243723_5257753 chr3R_5245770_5257753 chr3R_5257754_5258205;chr3R_5243705_5243722 87.50 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 71.43 62.50 NA 76.92 NA 100.00 100.00 75.00 100.00 NA 66.67 100.00 100.00 NA 76.92 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA 100.00 0.0 K alternative_donor CG1553 chr2R - chr2R_3692444_3692926 chr2R_3692444_3692605 chr2R_3691017_3692443;chr2R_3692927_3693071 17.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005855 N alternative_donor CG8229,CG33199 chr2R - chr2R_4836447_4838210;chr2R_4836447_4836515 chr2R_4836447_4837350 chr2R_4835619_4836446;chr2R_4838211_4838296 40.52 NA 29.15 NA NA NA 55.87 NA NA NA 51.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.91 NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 54.02 29.97 NA NA NA NA NA NA 57.92 NA NA NA 5.26 NA NA NA 29.05 NA NA 30.13 NA 27.27 NA NA 52.92 17.71 0.0 N alternative_donor CG1115,F_chr3R_1052705_1053045 chr3R + chr3R_1052701_1053045;chr3R_1052718_1053045 chr3R_1052705_1053045 chr3R_1053046_1053145;chr3R_1052605_1052700 2.13 NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA 14.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1027244061008001e-05 K alternative_donor opa1-like,I_chr2R_10119470_10120234,I_chr2R_10121848_10121900,I_chr2R_10122128_10122197,I_chr2R_10122334_10122393 chr2R - chr2R_10119470_10120234;chr2R_10119470_10120229 chr2R_10119470_10120220 chr2R_10119370_10119469;chr2R_10120235_10120334 29.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor Fpps chr2R - chr2R_7194465_7194765 chr2R_7194465_7194535 chr2R_7194370_7194464;chr2R_7194766_7195007 1.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor ena chr2R + chr2R_15029352_15029711;chr2R_15029330_15029711 chr2R_15029276_15029711 chr2R_15029712_15029859;chr2R_15029150_15029275 50.00 NA NA NA NA NA NA 21.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0052230000000000002 K alternative_donor X11L,I_chrX_17497609_17497728,RE_chrX_17497873_17498103 chrX + chrX_17497505_17497728 chrX_17497609_17497728 chrX_17497729_17497739;chrX_17497189_17497504 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001351 K alternative_donor CG7337,I_chr2L_1910010_1910066,RI_chr2L_1911951_1913208,RI_chr2L_1912284_1913208,I_chr2L_1938620_1938887,I_chr2L_1942183_1942233 chr2L + chr2L_1912235_1913208;chr2L_1911870_1913208;chr2L_1911951_1913208 chr2L_1912284_1913208 chr2L_1913209_1913308;chr2L_1911851_1911869 27.75 NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4337942498800001e-07 N alternative_donor CG1494 chrX + chrX_21159081_21159147;chrX_21159059_21159147 chrX_21158242_21159147 chrX_21159148_21159527;chrX_21157788_21158241 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0085769999999999996 K alternative_donor bon chr3R + chr3R_16433390_16433716 chr3R_16433396_16433716 chr3R_16433717_16433800;chr3R_16432003_16433389 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013236 K alternative_donor CG13551,I_chr2R_19265701_19270570 chr2R - chr2R_19270646_19270887 chr2R_19270646_19270842 chr2R_19270612_19270645;chr2R_19270888_19270938 6.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.23 17.95 NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.45 NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1739880512184732e-13 K alternative_donor cul-2,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21661637_21662083 chr2L_21662021_21662083 chr2L_21662084_21662183;chr2L_21661537_21661636 1.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_donor lark,noncoding_11093,REI_chr3L_7332718_7333975,RI_chr3L_7334219_7334452 chr3L + chr3L_7332718_7333975 chr3L_7333871_7333975 chr3L_7333976_7334075;chr3L_7332618_7332717 57.14 NA NA 35.71 NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.71 NA NA NA 41.67 40.00 41.18 NA 41.18 36.36 43.75 NA 36.00 27.59 45.16 NA NA 38.89 36.36 NA NA 33.33 NA NA 46.15 34.29 NA NA 42.11 46.15 NA 44.83 NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Spred,I_chr2R_10655876_10656868 chr2R - chr2R_10650580_10651335 chr2R_10650580_10650923 chr2R_10650424_10650579;chr2R_10651336_10651504 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor osa,I_chr3R_13542657_13542834,I_chr3R_13542657_13543500,I_chr3R_13542657_13543662,I_chr3R_13542657_13543668,I_chr3R_13543730_13543786 chr3R - chr3R_13542657_13543968;chr3R_13542657_13543500;chr3R_13542657_13543662;chr3R_13542657_13542834;chr3R_13542657_13543668 chr3R_13542657_13543677 chr3R_13542557_13542656;chr3R_13543969_13544017 80.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA 7.0416287999999999e-05 K alternative_donor Sap47 chr3R + chr3R_11779957_11780304 chr3R_11779978_11780304 chr3R_11780305_11780405;chr3R_11779880_11779956 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035614 K alternative_donor E2f,I_chr3R_17452573_17458606,R_chr3R_17452574_17485937,CG6353 chr3R - chr3R_17452573_17458645 chr3R_17452573_17457854 chr3R_17452474_17452572;chr3R_17458646_17458706 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 97.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.52 94.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.782e-14 K alternative_donor mael chr3L + chr3L_22717525_22717583;chr3L_22717501_22717583 chr3L_22717513_22717583 chr3L_22717584_22717785;chr3L_22717334_22717500 43.17 NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030197000000000002 K alternative_donor Dcp2,F_chr3L_15815909_15816023,F_chr3L_15817090_15817547 chr3L - chr3L_15817090_15819385;chr3L_15817090_15818570 chr3L_15817090_15817547 chr3L_15816990_15817089;chr3L_15819386_15819487 2.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor par-1,I_chr2R_15348122_15353660,RI_chr2R_15348122_15356294,EF_chr2R_15349994_15351814,F_chr2R_15349994_15351846,noncoding_8037,FI_chr2R_15350149_15351814,I_chr2R_15350437_15351814,I_chr2R_15350437_15351825,I_chr2R_15350905_15351814,RI_chr2R_15355419_15356294,F_chr2R_15362147_15365138,RI_chr2R_15363358_15365120,I_chr2R_15365210_15370456 chr2R + chr2R_15350149_15351814;chr2R_15350285_15351814;chr2R_15350437_15351814 chr2R_15350905_15351814 chr2R_15351815_15351914;chr2R_15350068_15350148 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00048791828800000004 K alternative_donor I_chr2L_8029734_8029787,Cka,CG7429 chr2L + chr2L_8031338_8032059;chr2L_8031163_8032059;chr2L_8031036_8032059;chr2L_8031309_8032059 chr2L_8030840_8032059 chr2L_8032060_8032641;chr2L_8030749_8030839 86.36 67.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG7843,I_chr2R_1972736_1972822 chr2R - chr2R_1971513_1972012 chr2R_1971513_1971673 chr2R_1971446_1971512;chr2R_1972013_1972292 12.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor nonA,I_chrX_16265109_16265346 chrX + chrX_16259676_16265346 chrX_16265109_16265346 chrX_16265347_16265446;chrX_16259620_16259675 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 28.57 NA NA NA 22.22 NA NA 28.57 37.50 NA 30.00 25.00 NA NA NA NA NA NA 35.00 9.52 NA NA 36.36 18.18 30.00 36.36 26.09 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA 15.15 0.0 K alternative_donor Elp3 chr2L + chr2L_4444833_4444894 chr2L_4444837_4444894 chr2L_4444895_4444963;chr2L_4444769_4444832 29.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.11 NA 0.00030945431500000001 K alternative_donor Rcd6,I_chr2R_16518342_16520460,I_chr2R_16518620_16518916,RI_chr2R_16520388_16520855 chr2R - chr2R_16518620_16520294;chr2R_16518620_16520855 chr2R_16518620_16518916 chr2R_16518520_16518619;chr2R_16520856_16520918 29.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 9.0707228098837197e-09 K alternative_donor Dlic chrX + chrX_11048699_11049066 chrX_11048724_11049066 chrX_11049067_11049261;chrX_11048472_11048698 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor yps,I_chr3L_12115255_12115627,RI_chr3L_12115255_12115645,I_chr3L_12115255_12115669,I_chr3L_12115877_12115936 chr3L - chr3L_12115255_12115775 chr3L_12115255_12115645 chr3L_12115155_12115254;chr3L_12115776_12115867 6.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.09 NA NA NA NA NA NA 22.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG31224 chr3R - chr3R_14482908_14484481 chr3R_14482908_14482961 chr3R_14481887_14482907;chr3R_14484482_14485019 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8576504999999999e-05 K alternative_donor CG18317,RI_chr2L_1718492_1723881 chr2L - chr2L_1718492_1718674;chr2L_1718492_1718739 chr2L_1718492_1718695 chr2L_1718421_1718491;chr2L_1718740_1718903 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG3884,I_chr2R_8837592_8837657 chr2R - chr2R_8837592_8839677 chr2R_8837592_8837657 chr2R_8837492_8837591;chr2R_8839678_8839836 85.45 NA NA 71.52 NA NA NA NA NA NA NA 96.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor CG32529 chrX + chrX_19795641_19795900;chrX_19795687_19795900 chrX_19795522_19795900 chrX_19795901_19798251;chrX_19794649_19795521 97.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor xmas-1,xmas-2 chrX - chrX_17048134_17049045 chrX_17048134_17048464 chrX_17048122_17048133;chrX_17049046_17051545 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 58.82 NA NA 46.15 NA NA NA 56.25 61.11 NA NA 55.17 NA 50.00 42.86 46.67 53.85 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA 0.0 K alternative_donor CG1674,F_chr4_252231_252560,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_251522_252560;chr4_252254_252560 chr4_252227_252560 chr4_252561_252603;chr4_251483_251521 90.00 NA NA NA NA 66.67 NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 66.67 1.699020731511424e-13 K alternative_donor miple2,I_chr3L_271508_273549,I_chr3L_271695_273549,I_chr3L_271922_273549,I_chr3L_274251_274594 chr3L + chr3L_271792_273549;chr3L_271217_273549;chr3L_271695_273549 chr3L_273391_273549 chr3L_273550_273649;chr3L_271209_271216 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3920097655894253e-16 K alternative_donor rtGEF,I_chr2L_20359184_20360012,I_chr2L_20359856_20360012 chr2L + chr2L_20356802_20360012 chr2L_20359856_20360012 chr2L_20360013_20360112;chr2L_20356590_20356801 4.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.64 NA NA NA NA NA 15.57 NA NA NA NA NA NA NA 14.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor GstS1,I_chr2R_12981955_12982033,I_chr2R_12981964_12982021 chr2R - chr2R_12981964_12982033 chr2R_12981964_12982021 chr2R_12981864_12981963;chr2R_12982034_12982121 0.00 NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041341000000000003 K alternative_donor Oatp74D,I_chr3L_17500359_17500724 chr3L + chr3L_17494579_17500724 chr3L_17500359_17500724 chr3L_17500725_17500824;chr3L_17494545_17494578 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Cep135,RI_chr3L_15120510_15120565 chr3L + chr3L_15120385_15120565 chr3L_15120510_15120565 chr3L_15120566_15120665;chr3L_15120117_15120384 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5414300000000001e-07 K alternative_donor Indy chr3L - chr3L_18825085_18833472 chr3L_18825085_18833375 chr3L_18825047_18825084;chr3L_18833473_18833593 19.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3864989406720018e-12 K alternative_donor prel chr2R + chr2R_5311931_5312043 chr2R_5311966_5312043 chr2R_5312044_5312420;chr2R_5311837_5311930 96.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.04233 K alternative_donor RpL5,I_chr2L_22428750_22428846 chr2L - chr2L_22429111_22429352 chr2L_22429111_22429268 chr2L_22428847_22429110;chr2L_22429353_22429396 98.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.06 63.32 NA NA 73.38 69.15 NA NA NA NA NA NA 35.42 50.26 NA NA 74.16 79.97 74.83 NA 57.73 NA NA NA NA 86.74 NA NA NA NA 86.92 0.0 K alternative_donor RhoGAP15B chrX + chrX_16843485_16845017 chrX_16843611_16845017 chrX_16845018_16847301;chrX_16842887_16843484 12.20 NA NA 22.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor CG3191,CG3091,I_chrX_2147635_2147990 chrX - chrX_2145388_2146756 chrX_2145388_2145704 chrX_2145228_2145387;chrX_2146757_2146893 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010369 K alternative_donor tou,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7480248,RI_chr2R_7479681_7486880,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7479681_7503083 chr2R_7479681_7480463 chr2R_7479581_7479680;chr2R_7503084_7503231 6.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor RpL27A,E_chr2L_4457411_4457977,I_chr2L_4458058_4458120 chr2L - chr2L_4458058_4458288;chr2L_4458058_4458274;chr2L_4458058_4458140 chr2L_4458058_4458162 chr2L_4457978_4458057;chr2L_4458289_4458357 8.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.47 NA NA NA 22.77 NA 35.67 NA NA NA NA NA NA 23.71 23.16 22.31 22.73 26.63 NA NA NA 20.16 NA NA NA NA NA NA 23.81 NA NA 31.68 NA 21.29 NA NA 0.0 K alternative_donor exba,I_chr3R_1425087_1425925,I_chr3R_1425813_1426009,I_chr3R_1425890_1426125,I_chr3R_1425890_1426209,RI_chr3R_1426370_1426736 chr3R - chr3R_1425813_1426125;chr3R_1425813_1426209 chr3R_1425813_1426009 chr3R_1425790_1425812;chr3R_1426210_1426225 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032191999999999998 K alternative_donor CG31998,I_chr4_225419_226294 chr4 - chr4_225419_226474;chr4_225419_226284 chr4_225419_226366 chr4_225319_225418;chr4_226475_226518 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA 66.67 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2011966359999995e-09 K alternative_donor alt,I_chr3R_13503901_13504925,RI_chr3R_13503901_13505368,I_chr3R_13503901_13507824 chr3R - chr3R_13503901_13508178;chr3R_13503901_13508123;chr3R_13503901_13508180 chr3R_13503901_13507816 chr3R_13503801_13503900;chr3R_13508181_13508234 15.65 NA NA 3.23 4.00 NA NA NA NA NA 32.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 38.46 NA NA NA NA NA 36.36 40.00 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.2569347952782965e-23 K alternative_donor CG31712,I_chr2L_9935570_9935951,CREI_chr2L_9938511_9938564,RI_chr2L_9942818_9944294,I_chr2L_9944682_9947179 chr2L - chr2L_9935570_9937237 chr2L_9935570_9935951 chr2L_9935486_9935569;chr2L_9937238_9937510 65.91 51.22 NA 53.97 NA NA NA NA NA NA NA NA 54.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA 40.00 NA NA 50.00 48.61 NA NA NA NA NA NA NA 48.78 NA NA NA 36.54 NA NA NA NA NA NA NA 54.55 52.00 NA NA NA 42.50 0.0 K alternative_donor CG30015,I_chr2R_6743814_6744285,HL05382 chr2R - chr2R_6750461_6762075 chr2R_6750461_6761358 chr2R_6750328_6750460;chr2R_6762076_6762097 73.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.15 NA 55.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00038383872599999998 K alternative_donor CG4165,I_chrX_5317784_5317881,I_chrX_5321743_5321838 chrX + chrX_5316160_5316612;chrX_5316300_5316612;chrX_5315965_5316612 chrX_5316313_5316612 chrX_5316613_5317050;chrX_5315939_5315964 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 25.00 NA NA 12.50 NA 20.00 NA NA NA NA NA NA 12.50 NA 2.36246986785744e-14 K alternative_donor F_chr3L_6602496_6609177,CG8398 chr3L + chr3L_6606753_6608997 chr3L_6606922_6608997 chr3L_6608998_6609696;chr3L_6606636_6606752 59.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021520000000000001 K alternative_donor tho2 chr2L - chr2L_2138159_2139629 chr2L_2138159_2138345 chr2L_2137984_2138158;chr2L_2139630_2139673 30.30 NA NA NA 17.65 17.14 NA NA NA NA NA 19.54 NA NA NA 80.00 NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 16.98 NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG32163 chr3L + chr3L_16580348_16580609;chr3L_16580557_16580609 chr3L_16580506_16580609 chr3L_16580610_16580996;chr3L_16580335_16580347 0.00 NA NA NA NA NA 21.05 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00053446617899999998 K alternative_donor Tak1,I_chrX_20388150_20389255 chrX - chrX_20388150_20388725;chrX_20388150_20389255 chrX_20388150_20392250 chrX_20388050_20388149;chrX_20392251_20392299 82.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.42 NA NA NA NA NA NA NA NA 92.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor myoglianin,RI_chr4_712986_714006,E_chr4_716066_716347,RI_chr4_716066_716482,RI_chr4_716153_716613,E_chr4_716172_716351 chr4 - chr4_715043_716708;chr4_715043_716482;chr4_715043_716613;chr4_715043_715839 chr4_715043_716322 chr4_714007_715042;chr4_716709_716712 11.11 NA NA 28.00 NA NA NA 41.38 NA NA NA 29.17 NA NA NA 36.84 NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA 31.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8699237117425704e-21 K alternative_donor su(f),I_chrXHet_77570_78035 chrXHet + chrXHet_77832_78035;chrXHet_77570_78035 chrXHet_77736_78035 chrXHet_78036_78135;chrXHet_77470_77569 95.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00072900000000000005 K alternative_donor BtbVII,I_chr3L_3150858_3150927,I_chr3L_3151185_3151263 chr3L + chr3L_3150843_3150927 chr3L_3150858_3150927 chr3L_3150928_3151027;chr3L_3150758_3150842 3.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020209999999999998 K alternative_donor Gpo-1,I_chr2R_11747621_11747699,EI_chr2R_11747445_11747699,I_chr2R_11749758_11750187,I_chr2R_11756325_11756380 chr2R - chr2R_11748259_11749386 chr2R_11748259_11749143 chr2R_11748106_11748258;chr2R_11749387_11749428 72.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA 55.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA 47.06 NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA 1.2117052685987138e-11 K alternative_donor Paip2,I_chr3R_8809774_8809832 chr3R + chr3R_8809770_8809832 chr3R_8809774_8809832 chr3R_8809833_8809932;chr3R_8809674_8809769 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8e-05 K alternative_donor osa chr3R - chr3R_13522309_13523386 chr3R_13522309_13523377 chr3R_13522092_13522308;chr3R_13523387_13523635 11.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022315999999999999 N alternative_donor CG10353,I_chrX_11775936_11778830,I_chrX_11778617_11778830,RI_chrX_11780885_11780988 chrX - chrX_11775936_11777234;chrX_11775936_11776058;chrX_11775936_11777220;chrX_11775936_11777133 chrX_11775936_11776142 chrX_11775836_11775935;chrX_11777235_11777654 23.33 NA NA NA NA NA 12.00 NA NA 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA 12.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor shi,RI_chrX_15786633_15786860,RE_chrX_15793108_15795563 chrX + chrX_15786474_15786860;chrX_15786603_15786860;chrX_15786285_15786860;chrX_15786615_15786860;chrX_15786200_15786860 chrX_15786394_15786860 chrX_15786861_15786960;chrX_15786192_15786199 0.00 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 5.9080628378326499e-16 K alternative_donor lola,I_chr2R_6375932_6376866,RI_chr2R_6376649_6376866,I_chr2R_6421474_6423519,I_chr2R_6421904_6422354 chr2R - chr2R_6376649_6419543 chr2R_6376649_6376866 chr2R_6376621_6376648;chr2R_6419544_6419624 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Ptp99A,I_chr3R_25302126_25302175 chr3R + chr3R_25302126_25307191 chr3R_25305548_25307191 chr3R_25307192_25307198;chr3R_25302026_25302125 100.00 NA NA NA NA 66.67 NA NA 83.33 66.67 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 66.67 85.71 NA 83.33 NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 66.67 75.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG10602 chr2L - chr2L_18857404_18857541;chr2L_18857404_18857511 chr2L_18857404_18857587 chr2L_18857177_18857403;chr2L_18857588_18857700 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049119999999999997 K alternative_donor Tsp42Ea,CG30159 chr2R + chr2R_2880561_2880625 chr2R_2880566_2880625 chr2R_2880626_2881652;chr2R_2880504_2880560 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.5783699999999992e-06 K alternative_donor Fs(2)Ket,I_chr2L_20734991_20735252,I_chr2L_20735091_20735305,I_chr2L_20735170_20735252,I_chr2L_20738976_20749527 chr2L + chr2L_20735170_20735252;chr2L_20734991_20735252 chr2L_20735091_20735252 chr2L_20735253_20735352;chr2L_20734943_20734990 95.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 3.158088e-06 K alternative_donor CG5484 chr3R + chr3R_22543749_22544049;chr3R_22543734_22544049 chr3R_22543722_22544049 chr3R_22544050_22544588;chr3R_22543570_22543721 94.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.09 NA NA NA NA NA NA NA NA 84.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6117659999999998e-06 K alternative_donor RluA-2,I_chr2L_10480906_10481097 chr2L + chr2L_10477593_10481097 chr2L_10480906_10481097 chr2L_10481098_10481197;chr2L_10477493_10477592 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Abl,I_chr3L_16622304_16639909,RI_chr3L_16652567_16654512 chr3L - chr3L_16618375_16619627 chr3L_16618375_16619372 chr3L_16616737_16618374;chr3L_16619628_16619716 18.64 NA NA 56.07 4.92 NA 40.40 NA NA NA 29.03 36.36 44.64 NA NA 29.49 NA NA 29.11 NA NA NA NA NA 28.95 31.15 29.76 NA 34.15 NA NA NA NA NA NA 52.22 NA NA NA NA 40.96 NA NA 31.52 NA NA NA 34.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor CG41320 chr3LHet + chr3LHet_1532849_1545754 chr3LHet_1545188_1545754 chr3LHet_1545755_1545890;chr3LHet_1532736_1532848 0.00 NA NA NA NA NA 20.00 NA 12.50 NA NA 50.00 NA NA NA 20.00 NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_donor noncoding_4622,CE_chr2R_2237053_2237111 chr2R - chr2R_2237036_2237093;chr2R_2237036_2237086 chr2R_2237036_2237090 chr2R_2236997_2237035;chr2R_2237094_2237159 59.55 100.00 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 1.2610312043904405e-20 K alternative_donor sli,RI_chr2R_11794739_11809143 chr2R - chr2R_11761183_11761827 chr2R_11761183_11761794 chr2R_11761040_11761182;chr2R_11761828_11761954 7.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016983999999999999 K alternative_donor tws,I_chr3R_5960899_5960978,CG6241 chr3R - chr3R_5959310_5960163;chr3R_5959310_5960101;chr3R_5959310_5960041;chr3R_5959310_5960049;chr3R_5959310_5960182;chr3R_5959310_5960026;chr3R_5959310_5960158;chr3R_5959310_5959679 chr3R_5959310_5959789 chr3R_5958937_5959309;chr3R_5960183_5960224 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 12.50 NA 25.00 NA 11.11 20.00 25.00 11.11 11.11 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA 16.67 11.11 NA NA NA NA 33.33 NA NA 19.05 NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor MED26,I_chr4_807836_808040,I_chr4_807836_808089 chr4 - chr4_807836_808040;chr4_807836_808077 chr4_807836_808006 chr4_807736_807835;chr4_808078_808140 3.03 NA NA 14.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0066740000000000002 K alternative_donor cact,I_chr2L_16313451_16314337,RI_chr2L_16314859_16315116,I_chr2L_16323518_16323594,I_chr2L_16324901_16326020 chr2L - chr2L_16313451_16314450 chr2L_16313451_16314337 chr2L_16313351_16313450;chr2L_16314451_16314708 9.63 NA NA 22.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.78 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.833231925600001e-14 K alternative_donor exd chrX + chrX_15887147_15887504;chrX_15886884_15887504;chrX_15886821_15887504;chrX_15886888_15887504;chrX_15886827_15887504;chrX_15886958_15887504;chrX_15886802_15887504 chrX_15887006_15887504 chrX_15887505_15887806;chrX_15886739_15886801 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00032781416500000005 K alternative_donor CaMKII,I_chr4_1069766_1069812,I_chr4_1071236_1071307,RI_chr4_1071236_1071315,RI_chr4_1071489_1071968,I_chr4_1071675_1071813,I_chr4_1071675_1071884 chr4 - chr4_1071236_1071968;chr4_1071236_1071884;chr4_1071236_1071813;chr4_1071236_1072054 chr4_1071236_1071319 chr4_1071136_1071235;chr4_1072055_1072059 100.00 NA NA 81.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039703000000000002 K alternative_donor ZnT63C chr3L + chr3L_3303853_3304601;chr3L_3303837_3304601 chr3L_3304022_3304601 chr3L_3304602_3304665;chr3L_3303742_3303836 4.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999993e-12 K alternative_donor CG17082,I_chr2R_632143_635290,R_chr2R_642176_644740,I_chr2R_644094_644145,I_chr2R_644671_645137,I_chr2R_645254_645312 chr2R + chr2R_632192_632274;chr2R_631984_632274;chr2R_632196_632274;chr2R_632085_632274 chr2R_632143_632274 chr2R_632275_632399;chr2R_631970_631983 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024839 K alternative_donor CG11163,I_chr2R_1666219_1669711 chr2R - chr2R_1666219_1670203;chr2R_1666219_1669803;chr2R_1666219_1670325;chr2R_1666219_1670281 chr2R_1666219_1670219 chr2R_1666119_1666218;chr2R_1670326_1670328 22.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 4.35 NA NA NA NA NA NA NA 3.0886199400000006e-10 K alternative_donor CG7530,I_chr3R_10556352_10557136,eff chr3R - chr3R_10556352_10557105;chr3R_10556352_10557148;chr3R_10556352_10557126;chr3R_10556352_10557198 chr3R_10556352_10557130 chr3R_10556252_10556351;chr3R_10557199_10557231 58.33 75.86 NA NA NA NA 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.31 NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2917493204479997e-12 K alternative_donor LamC chr2R - chr2R_10458817_10458964 chr2R_10458817_10458881 chr2R_10458387_10458816;chr2R_10458965_10459687 30.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA 9.38 14.71 NA NA NA 7.14 NA NA NA 11.11 NA 10.71 12.00 NA 3.0949543855164224e-18 K alternative_donor CG4239,I_chrX_16279725_16280317 chrX + chrX_16279721_16281003;chrX_16279725_16281003 chrX_16279372_16281003 chrX_16281004_16281322;chrX_16279353_16279371 93.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 8.1334559999999989e-09 K alternative_donor drk,RI_chr2R_9389255_9389317,I_chr2R_9389597_9389751,I_chr2R_9389597_9389907,I_chr2R_9389597_9389940,I_chr2R_9389597_9390151,I_chr2R_9389597_9390271,I_chr2R_9389714_9390195 chr2R - chr2R_9389597_9390151;chr2R_9389597_9389907;chr2R_9389597_9389940;chr2R_9389597_9390293;chr2R_9389597_9389751;chr2R_9389597_9390264;chr2R_9389597_9389753;chr2R_9389597_9389757 chr2R_9389597_9390195 chr2R_9389497_9389596;chr2R_9390294_9390295 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.77 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.33 NA NA 78.12 NA 2.47095219526848e-10 K alternative_donor Atg18,I_chr3L_8182683_8182941 chr3L + chr3L_8180503_8180578;chr3L_8180319_8180578 chr3L_8180294_8180578 chr3L_8180579_8180676;chr3L_8180118_8180293 88.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 98.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042410000000000003 K alternative_donor Pten,I_chr2L_10256507_10256803,F_chr2L_10259663_10260253 chr2L - chr2L_10260585_10260741;chr2L_10260585_10260853 chr2L_10260585_10260729 chr2L_10260254_10260584;chr2L_10260854_10260860 45.30 NA NA NA NA NA NA 68.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00052600672699999989 K alternative_donor CG15881,RI_chr3L_19799338_19799394,RI_chr3L_19799338_19799408,Kap-alpha1 chr3L + chr3L_19798419_19799405;chr3L_19798903_19799405 chr3L_19799338_19799405 chr3L_19799406_19799494;chr3L_19798405_19798418 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.1000000000000004e-05 K alternative_donor cnn,I_chr2R_9333096_9336723,I_chr2R_9333096_9336812,RI_chr2R_9334834_9336719,I_chr2R_9347031_9370659 chr2R - chr2R_9334834_9336723;chr2R_9334834_9336812;chr2R_9334834_9336719 chr2R_9334834_9336501 chr2R_9334744_9334833;chr2R_9336813_9336819 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.30 NA NA NA NA NA NA NA 0.0075529999999999998 K alternative_donor I_chr3R_8822346_8822403,CG7518 chr3R + chr3R_8827698_8828350 chr3R_8828286_8828350 chr3R_8828351_8828431;chr3R_8827671_8827697 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1100000000000004e-09 K alternative_donor CG31278,noncoding_15893,RI_chr3R_6533509_6533568 chr3R - chr3R_6533509_6533960;chr3R_6533509_6533579 chr3R_6533509_6533568 chr3R_6533409_6533508;chr3R_6533961_6534040 9.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA 34.69 NA NA NA 22.22 NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor cul-2,RI_chr2L_21657668_21657832,noncoding_4226,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21657668_21657832;chr2L_21657742_21657832 chr2L_21657777_21657832 chr2L_21657833_21657932;chr2L_21657659_21657667 16.00 NA NA NA NA NA 38.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.49 NA 5.36 2.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG42507,Trl,EI_chr3L_14750431_14750893,I_chr3L_14750431_14750985,CI_chr3L_14750431_14753667,I_chr3L_14754175_14754238 chr3L - chr3L_14750431_14750762;chr3L_14750431_14751007;chr3L_14750431_14750893;chr3L_14750431_14750583 chr3L_14750431_14750941 chr3L_14750331_14750430;chr3L_14751008_14751008 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000217956046 N alternative_donor I_chrX_4000307_4003527,CG4857 chrX + chrX_4011929_4011996;chrX_4011315_4011996;chrX_4011270_4011996 chrX_4011429_4011996 chrX_4011997_4012308;chrX_4011093_4011269 0.00 NA NA 25.00 NA NA 24.14 NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 24.00 NA NA NA NA 23.68 NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA 29.03 NA NA NA NA NA 10.34 16.28 NA 19.57 28.57 NA NA NA NA 25.00 23.91 NA 16.13 NA NA NA 28.57 NA 23.08 NA 0.0 N alternative_donor CG9674,I_chr3L_16785706_16785748,I_chr3L_16793055_16800660 chr3L - chr3L_16789438_16792144 chr3L_16789438_16791271 chr3L_16788351_16789437;chr3L_16792145_16792272 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor l(2)05714,RI_chr2L_4970785_4971075,CRE_chr2L_4970785_4971082,I_chr2L_4970785_4973718,RI_chr2L_4971343_4973718 chr2L - chr2L_4970785_4971086;chr2L_4970785_4973718 chr2L_4970785_4971053 chr2L_4970685_4970784;chr2L_4973719_4973787 0.00 NA 20.00 NA NA 20.00 NA NA 12.50 NA NA 12.50 NA NA NA NA 33.33 20.00 NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA 20.00 16.67 NA 25.00 NA 16.67 NA 16.67 NA 20.00 NA 25.00 14.29 12.50 NA 20.00 11.11 14.29 NA 14.29 14.29 12.50 16.67 NA NA NA 25.00 16.67 NA NA 0.0 K alternative_donor jing,I_chr2R_2505678_2506068 chr2R + chr2R_2501376_2501609;chr2R_2501545_2501609;chr2R_2501482_2501609;chr2R_2501388_2501609 chr2R_2501514_2501609 chr2R_2501610_2503238;chr2R_2501342_2501375 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.008744 K alternative_donor Aats-pro chr3L - chr3L_2651281_2651341 chr3L_2651281_2651333 chr3L_2651213_2651280;chr3L_2651342_2651593 6.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020101000000000001 K alternative_donor R_chr2L_8083458_8089184,R_chr2L_8083458_8089393,Bsg,I_chr2L_8088454_8089057,I_chr2L_8107426_8107747 chr2L + chr2L_8083458_8089184;chr2L_8083522_8089184;chr2L_8083588_8089184;chr2L_8083637_8089184 chr2L_8083687_8089184 chr2L_8089185_8089284;chr2L_8083444_8083457 14.29 27.27 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00069742602000000004 K alternative_donor AnnIX chr3R + chr3R_16891137_16893167;chr3R_16891124_16893167;chr3R_16891033_16893167 chr3R_16891008_16893167 chr3R_16893168_16893221;chr3R_16890951_16891007 48.80 NA 70.79 73.73 NA 69.44 NA 73.25 NA NA NA NA NA 61.26 74.76 NA 64.00 65.18 71.04 66.67 NA NA 10.20 2.70 11.43 71.95 17.39 21.05 NA NA 70.28 69.05 84.85 72.88 NA NA 3.85 11.54 14.58 62.32 71.43 68.10 70.54 NA 80.00 NA 8.70 75.61 76.24 5.56 13.56 12.50 NA 11.76 71.95 10.26 10.00 83.72 0.0 N alternative_donor HDAC4,F_chrX_13159070_13159174,I_chrX_13170581_13179235,I_chrX_13178996_13179235 chrX - chrX_13165623_13166434 chrX_13165623_13166422 chrX_13165515_13165622;chrX_13166435_13166489 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035314999999999999 K alternative_donor mia chr3R - chr3R_1374911_1375314 chr3R_1374911_1375297 chr3R_1374048_1374910;chr3R_1375315_1375484 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0053530000000000001 N alternative_donor CG31156,F_chr3R_18435204_18436237,EFI_chr3R_18436373_18436443 chr3R - chr3R_18435204_18436443 chr3R_18435204_18435694 chr3R_18435104_18435203;chr3R_18436444_18436543 12.50 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022492000000000002 K alternative_donor Ptp4E,EI_chrX_4842231_4842425 chrX + chrX_4833234_4834454;chrX_4833203_4834454;chrX_4833308_4834454;chrX_4833338_4834454 chrX_4833364_4834454 chrX_4834455_4834880;chrX_4833197_4833202 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 16.67 NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3913797220753439e-19 K alternative_donor Tango13,I_chrX_13480088_13480998,I_chrX_13483861_13483954 chrX + chrX_13480088_13483954 chrX_13480126_13483954 chrX_13483955_13484054;chrX_13479988_13480087 4.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0031770000000000001 K alternative_donor CG4822,I_chr2L_120081_120199,I_chr2L_120266_120420,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_120081_120199 chr2L_120081_120167 chr2L_119981_120080;chr2L_120200_120265 90.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020055511 K alternative_donor cul-2,I_chr2L_21658962_21659119,I_chr2L_21661637_21661945,I_chr2L_21662021_21662083 chr2L + chr2L_21658855_21659094 chr2L_21658962_21659094 chr2L_21659095_21659272;chr2L_21658557_21658854 55.56 NA NA 39.00 37.50 NA NA 27.88 34.71 NA 38.64 NA 25.49 38.18 40.62 30.93 36.11 32.73 33.80 30.00 31.03 75.69 NA NA 82.09 NA NA 88.24 NA NA 41.30 NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA 40.57 38.78 NA NA NA NA NA 33.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.9038323002195372e-64 K alternative_donor ORMDL chr3L + chr3L_21628870_21629086 chr3L_21628905_21629086 chr3L_21629087_21629299;chr3L_21628718_21628869 8.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 25.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6126080000000004e-05 K alternative_donor CG3609,I_chr2L_2373706_2374488,RI_chr2L_2373723_2374295 chr2L - chr2L_2373723_2374488 chr2L_2373723_2373935 chr2L_2373623_2373722;chr2L_2374489_2374588 3.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 42.86 NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 25.00 NA NA NA NA 17.65 NA 14.29 NA 25.00 22.22 NA NA NA NA NA 25.00 NA 6.0199637587272124e-34 K alternative_donor CG12163,I_chr3R_1068862_1077145,RI_chr3R_1069977_1077139 chr3R - chr3R_1069977_1077145 chr3R_1069977_1077139 chr3R_1069877_1069976;chr3R_1077146_1077239 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA 22.92 NA NA NA 40.00 20.00 NA NA NA 10.34 14.81 NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA 25.00 NA 26.32 0.0 K alternative_donor I_chrX_2066779_2066838,Cyp4d2,E_chrX_2071218_2072285,Cyp4ae1,pn chrX + chrX_2068074_2071183 chrX_2071097_2071183 chrX_2071184_2071199;chrX_2068005_2068073 50.00 NA NA 66.67 NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA 33.33 20.00 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 NA NA 0.00 NA NA NA 0.00 25.00 NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1087860637778633e-40 K alternative_donor CaMKI,I_chr4_467862_471815,I_chr4_471136_473243,I_chr4_472116_472527,I_chr4_473338_473410,I_chr4_473338_473428,I_chr4_473517_473601 chr4 + chr4_472081_473243 chr4_472116_473243 chr4_473244_473337;chr4_472016_472080 18.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014988 K alternative_donor SdhA,I_chr2R_15283283_15283411,I_chr2R_15283319_15283369 chr2R - chr2R_15283283_15283415 chr2R_15283283_15283369 chr2R_15283219_15283282;chr2R_15283416_15283469 40.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 13.33 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.9910986440000004e-08 K alternative_donor cnc,I_chr3R_19014852_19016738,I_chr3R_19046366_19046507,I_chr3R_19046619_19047567 chr3R - chr3R_19046366_19047563;chr3R_19046366_19047567 chr3R_19046366_19046507 chr3R_19046266_19046365;chr3R_19047568_19047667 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.2063163e-05 K alternative_donor tomosyn,I_chrX_12531219_12531470,I_chrX_12534873_12541731,noncoding_23357,I_chrX_12548772_12549203 chrX + chrX_12543216_12545142;chrX_12542817_12545142 chrX_12543084_12545142 chrX_12545143_12545259;chrX_12542700_12542816 28.57 NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1754375844124e-05 K alternative_donor faf,RI_chr3R_27603474_27603893,I_chr3R_27620212_27620267,RI_chr3R_27624356_27624427 chr3R + chr3R_27613446_27613523 chr3R_27613461_27613523 chr3R_27613524_27613919;chr3R_27612869_27613445 85.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001024 K alternative_donor CaMKI,I_chr4_466377_467256,I_chr4_466377_467726,I_chr4_467072_467446,I_chr4_467378_467424,I_chr4_471136_473243,I_chr4_473338_473428,I_chr4_473517_473601 chr4 + chr4_466912_467256;chr4_466816_467256;chr4_466858_467256;chr4_466798_467256;chr4_466896_467256 chr4_467113_467256 chr4_467257_467272;chr4_466792_466797 50.00 NA 33.33 30.00 NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.2346863741201993e-15 K alternative_donor tral,I_chr3L_12511355_12511540,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12511325_12511537 chr3L_12511355_12511537 chr3L_12511538_12511767;chr3L_12511255_12511324 73.79 NA NA NA NA NA NA NA NA 62.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.79 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor Lnk,RI_chr3R_21714780_21715376 chr3R + chr3R_21714419_21715376;chr3R_21714788_21715376 chr3R_21714614_21715376 chr3R_21715377_21715476;chr3R_21714271_21714418 72.41 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.86 NA NA 61.82 NA NA NA 53.70 57.14 53.57 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 54.05 50.00 NA NA NA NA 58.97 NA NA 52.38 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 57.14 NA NA 1.8361176978216339e-33 K alternative_donor CG34449,I_chrX_9222628_9227416,RI_chrX_9232665_9233022,RI_chrX_9249209_9250033,RI_chrX_9249212_9250033,RI_chrX_9249212_9250244 chrX - chrX_9227656_9231026 chrX_9227656_9230957 chrX_9227417_9227655;chrX_9231027_9231270 85.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.67 NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1377036554359996e-06 K alternative_donor CG8468 chr2R + chr2R_10107616_10108112;chr2R_10107651_10108112;chr2R_10107621_10108112 chr2R_10107548_10108112 chr2R_10108113_10108270;chr2R_10107405_10107547 80.90 NA NA NA NA NA 65.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.86 NA NA NA NA 95.70 NA NA 92.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.52 0.0 K alternative_donor CG8080,REI_chr2R_4979159_4979234,I_chr2R_4979276_4979936 chr2R - chr2R_4979159_4979936 chr2R_4979159_4979234 chr2R_4979059_4979158;chr2R_4979937_4980036 8.33 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4940700000000003e-06 K alternative_donor CG1622,REI_chrX_13191277_13191339,RI_chrX_13191703_13191779,I_chrX_13191916_13192167,I_chrX_13192409_13192738,EI_chrX_13192857_13192928 chrX + chrX_13191685_13191779 chrX_13191703_13191779 chrX_13191780_13191847;chrX_13191617_13191684 2.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor app,RI_chr3L_12201038_12201989,I_chr3L_12257837_12259754,I_chr3L_12257984_12259754,RI_chr3L_12258006_12259754,I_chr3L_12259361_12259754 chr3L - chr3L_12258011_12259754 chr3L_12258011_12258691 chr3L_12257721_12258010;chr3L_12259755_12259854 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 0.00073771790000000002 K alternative_donor Samuel,I_chr2L_11055477_11056411,RI_chr2L_11055477_11066544,RI_chr2L_11055480_11056411 chr2L - chr2L_11055480_11066544 chr2L_11055480_11056411 chr2L_11055380_11055479;chr2L_11066545_11066644 16.67 NA NA 33.33 NA NA NA NA 28.57 NA NA NA 50.00 NA NA 50.00 NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 100.00 50.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.5275754402911178e-30 K alternative_donor E_chr4_592469_594231,Ephrin,I_chr4_595055_597604,RI_chr4_596272_596341 chr4 + chr4_592646_594238;chr4_592490_594238;chr4_592593_594238;chr4_592469_594238;chr4_592410_594238;chr4_592798_594238 chr4_592737_594238 chr4_594239_594331;chr4_592404_592409 0.00 NA NA 18.18 NA NA 13.64 10.53 NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA 15.38 33.33 NA NA NA NA 16.67 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3640215983900723e-23 K alternative_donor chico chr2L - chr2L_10246040_10247024;chr2L_10246040_10246755;chr2L_10246040_10246867;chr2L_10246040_10246899 chr2L_10246040_10246184 chr2L_10245878_10246039;chr2L_10247025_10247051 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001103 K alternative_donor larp,F_chr3R_24151542_24153876,I_chr3R_24160430_24160932,I_chr3R_24160430_24160971,RI_chr3R_24160430_24161527 chr3R - chr3R_24160430_24160932;chr3R_24160430_24160971;chr3R_24160430_24160975;chr3R_24160430_24160979;chr3R_24160430_24161939;chr3R_24160430_24161527 chr3R_24160430_24161729 chr3R_24160330_24160429;chr3R_24161940_24162125 73.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.76 0.0 K alternative_donor CG32803,I_chrX_1795648_1795700,RI_chrX_1795648_1795745,I_chrX_1798310_1798525,I_chrX_1798315_1798577 chrX - chrX_1795648_1795832 chrX_1795648_1795745 chrX_1795548_1795647;chrX_1795833_1795845 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-06 K alternative_donor CG3321,RI_chr3R_10154615_10155360 chr3R + chr3R_10152811_10152974;chr3R_10152906_10152974;chr3R_10152911_10152974 chr3R_10152850_10152974 chr3R_10152975_10153473;chr3R_10152803_10152810 91.23 NA NA NA NA NA 80.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0471856249999998e-09 K alternative_donor rin,I_chr3R_9476825_9476895 chr3R + chr3R_9472923_9474639 chr3R_9473269_9474639 chr3R_9474640_9476216;chr3R_9472709_9472922 39.55 NA NA 14.29 28.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.45 NA NA NA NA NA NA 27.27 NA 27.27 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.40 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG33558,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,EI_chr2R_2820947_2821570,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2817876_2818978;chr2R_2817876_2819347 chr2R_2817876_2818567 chr2R_2817851_2817875;chr2R_2819348_2819447 26.32 NA NA NA NA NA 50.00 47.62 NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA 48.39 NA NA 46.15 NA 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.71 NA 0.0 K alternative_donor RI_chrX_1936386_1947849,RI_chrX_1945968_1947849,CG4313 chrX + chrX_1945968_1947849 chrX_1947339_1947849 chrX_1947850_1947949;chrX_1945868_1945967 73.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032433999999999998 K alternative_donor RpL12,I_chr2R_19948517_19948682 chr2R + chr2R_19947968_19948035 chr2R_19947973_19948035 chr2R_19948036_19948097;chr2R_19947923_19947967 31.46 NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 5.45 NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA NA 3.46 15.09 NA NA 2.04 NA 9.43 NA 8.77 NA NA NA NA 15.58 NA NA 6.67 7.14 16.41 0.0 K alternative_donor Mapmodulin,I_chr2R_13756314_13756411,RI_chr2R_13756314_13756450,I_chr2R_13756314_13756571 chr2R - chr2R_13756314_13758833 chr2R_13756314_13756571 chr2R_13756214_13756313;chr2R_13758834_13759000 11.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.41 NA 0.0 N alternative_donor I_chr2R_17543813_17543881,CG10320 chr2R + chr2R_17545799_17545850;chr2R_17545767_17545850;chr2R_17545615_17545850;chr2R_17545686_17545850;chr2R_17545690_17545850 chr2R_17545781_17545850 chr2R_17545851_17545985;chr2R_17545613_17545614 26.92 NA 11.36 14.04 7.41 7.41 NA 10.61 12.26 NA NA 11.94 2.86 NA 8.70 15.38 6.82 NA 8.33 8.89 NA NA NA NA NA 11.90 NA NA NA NA 11.11 NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA 9.02 9.52 NA NA NA NA NA 8.45 NA NA NA NA 77.78 9.23 NA NA NA 0.0 K alternative_donor CG14767,RI_chr2R_4610372_4610761 chr2R - chr2R_4607290_4607359 chr2R_4607290_4607347 chr2R_4607151_4607289;chr2R_4607360_4607537 48.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0070109999999999999 K alternative_donor M(2)21AB,I_chr2L_107839_110405,I_chr2L_107957_108587,I_chr2L_110878_111037,I_chr2L_112022_112689,RI_chr2L_132256_132482 chr2L + chr2L_108347_108587;chr2L_108102_108587;chr2L_107839_108587 chr2L_108227_108587 chr2L_108588_108687;chr2L_107833_107838 75.00 NA NA NA 85.71 NA NA 64.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA 53.57 NA NA 51.72 85.92 NA NA NA 50.00 NA NA 88.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4032443161547061e-28 K alternative_donor Osi19 chr3R + chr3R_2161894_2162001 chr3R_2161921_2162001 chr3R_2162002_2162010;chr3R_2161644_2161893 65.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 0.025381000000000001 K alternative_donor Hr39,I_chr2L_21256047_21256260 chr2L + chr2L_21237347_21238280;chr2L_21237385_21238280;chr2L_21237421_21238280;chr2L_21237364_21238280;chr2L_21237397_21238280 chr2L_21237405_21238280 chr2L_21238281_21238529;chr2L_21237247_21237346 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00052745978000000001 K alternative_donor CG6597 chr3L + chr3L_20295938_20296166;chr3L_20295603_20296166 chr3L_20295972_20296166 chr3L_20296167_20296215;chr3L_20295573_20295602 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA 11.11 NA NA 33.33 NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4868293422400001e-13 N alternative_donor None chrU - chrU_4028377_4028681 chrU_4028377_4028479 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.88 NA 0.031560999999999999 K alternative_donor Nacalpha,I_chr2R_8648027_8648303 chr2R - chr2R_8648027_8648309;chr2R_8648027_8648231 chr2R_8648027_8648305 chr2R_8647927_8648026;chr2R_8648310_8648314 21.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.92 NA NA NA 88.10 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.11 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor CREF_chr3R_5589662_5589762,CG8500 chr3R + chr3R_5610483_5611473 chr3R_5610546_5611473 chr3R_5611474_5611635;chr3R_5610477_5610482 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0055269999999999998 K alternative_donor CG9932,I_chr2L_13025498_13027193,I_chr2L_13031395_13035824 chr2L - chr2L_13025498_13027065;chr2L_13025498_13027344 chr2L_13025498_13026528 chr2L_13025398_13025497;chr2L_13027345_13027744 77.31 NA 64.52 NA NA 64.29 NA 58.06 NA NA 59.52 64.89 44.19 NA NA NA 64.58 NA 60.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.53 NA 95.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor flr chr3L + chr3L_13406076_13406416 chr3L_13406174_13406416 chr3L_13406417_13406538;chr3L_13405928_13406075 2.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_donor chinmo chr2L + chr2L_1651412_1652774;chr2L_1651430_1652774 chr2L_1651713_1652774 chr2L_1652775_1653511;chr2L_1651300_1651411 84.00 NA NA NA NA NA NA NA 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001088142336 K alternative_donor Cdk4,RI_chr2R_12471503_12471656 chr2R + chr2R_12467202_12468346;chr2R_12467432_12468346;chr2R_12467241_12468346;chr2R_12467275_12468346;chr2R_12467474_12468346;chr2R_12467225_12468346;chr2R_12467227_12468346;chr2R_12467039_12468346 chr2R_12467261_12468346 chr2R_12468347_12468520;chr2R_12467030_12467038 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.2394810999999997e-05 K alternative_donor Lerp chr3R - chr3R_22688433_22688824;chr3R_22688433_22688796;chr3R_22688433_22688494 chr3R_22688433_22688772 chr3R_22688359_22688432;chr3R_22688825_22688828 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA 0.00063995049200000001 K jcn_only_AA AnnIX,I_chr3R_16895383_16895999 chr3R + chr3R_16894742_16896445 chr3R_16894742_16895999 chr3R_16894560_16894741;chr3R_16896446_16896495 22.34 NA NA 2.81 11.34 NA 7.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.91 9.49 12.29 NA NA 60.68 NA NA NA 8.96 NA NA 39.16 NA NA NA 42.29 12.10 NA 60.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.99 NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA brm,I_chr3L_15968197_15968325 chr3L - chr3L_15975300_15975367 chr3L_15975312_15975367 chr3L_15975368_15975432;chr3L_15975223_15975299 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019673 K jcn_only_AA CG12582 chr3R + chr3R_29885_29940;chr3R_29885_29934 chr3R_29885_29987 chr3R_29816_29884;chr3R_29988_30053 9.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA how chr3R + chr3R_17897152_17897460 chr3R_17897152_17897418 chr3R_17897055_17897151;chr3R_17897461_17897763 16.20 NA NA NA NA NA 52.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5135884562510001e-06 N jcn_only_AA HDAC4,F_chrX_13159070_13159174,I_chrX_13170581_13179235,I_chrX_13178996_13179235 chrX - chrX_13164676_13165514;chrX_13164646_13165514 chrX_13164727_13165514 chrX_13165515_13165622;chrX_13164424_13164645 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00016200000000000001 K jcn_only_AA CG13822,RI_chr3R_19503360_19503522 chr3R + chr3R_19503360_19503577 chr3R_19503360_19503522 chr3R_19503260_19503359;chr3R_19503578_19503622 1.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041959000000000003 K jcn_only_AA MP1,RI_chr3R_134150_134311 chr3R + chr3R_134150_134341 chr3R_134150_134311 chr3R_134050_134149;chr3R_134342_134411 7.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031307000000000001 N jcn_only_AA None chrU - chrU_1092478_1092545 chrU_1092492_1092545 83.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA 1.2055241951999999e-06 K jcn_only_AA CG9086,CEI_chrX_16859981_16861527,I_chrX_16861895_16862053 chrX - chrX_16861753_16862542 chrX_16861895_16862542 chrX_16862543_16862684;chrX_16861528_16861752 82.93 NA NA 49.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039056 K jcn_only_AA CG1637,I_chrX_10767112_10767168,I_chrX_10767807_10771447,I_chrX_10769621_10769824 chrX - chrX_10767742_10771447;chrX_10770030_10771447;chrX_10770033_10771447 chrX_10766073_10771447 chrX_10771448_10771547 79.43 NA NA 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0737315146879999e-06 N jcn_only_AA CkIIalpha,I_chr3L_23092989_23093344,RI_chr3L_23094196_23095221 chr3L + chr3L_23092824_23093344;chr3L_23092824_23093319 chr3L_23092824_23092891 chr3L_23092680_23092823;chr3L_23093345_23093444 0.00 NA NA NA NA NA 48.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000484 N jcn_only_AA ras chrX + chrX_10640260_10640453 chrX_10640260_10640321 chrX_10640109_10640259;chrX_10640454_10641105 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00034900000000000003 K jcn_only_AA CG2604 chr3R - chr3R_1048869_1048971 chr3R_1048911_1048971 chr3R_1048972_1048994;chr3R_1047347_1048868 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038492999999999999 K jcn_only_AA 14-3-3epsilon,I_chr3R_14068632_14073155,RI_chr3R_14074062_14074138,I_chr3R_14074016_14074138 chr3R + chr3R_14073874_14073954;chr3R_14073874_14073939;chr3R_14073874_14073942 chr3R_14073874_14073936 chr3R_14073693_14073873;chr3R_14073955_14074015 45.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.77 NA NA NA NA NA NA NA 57.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG30109,CG30108,I_chr2R_13557316_13557647 chr2R + chr2R_13557138_13557647 chr2R_13557138_13557191 chr2R_13556976_13557137;chr2R_13557648_13557747 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001877 K jcn_only_AA Pak,RI_chr3R_2181143_2181934 chr3R + chr3R_2183063_2184004 chr3R_2183063_2183596 chr3R_2182472_2183062;chr3R_2184005_2184744 0.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3999999999999999e-05 N jcn_only_AA SD23414,CG9132,I_chrX_16696492_16696589 chrX - chrX_16692699_16692782 chrX_16692718_16692782 chrX_16692783_16692991;chrX_16691549_16692698 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012359999999999999 K jcn_only_AA RI_chr3R_5165997_5180143,CG33936,I_chr3R_5167726_5180143,R_chr3R_5168211_5180143,RI_chr3R_5168214_5168297,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5168214_5180143 chr3R_5168214_5168297 chr3R_5168114_5168213;chr3R_5180144_5180232 16.11 NA NA 46.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.78 NA NA NA NA NA NA NA 42.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1030714999999999e-10 N jcn_only_AA nimC1,I_chr2L_13975880_13975977 chr2L - chr2L_13975880_13976476 chr2L_13976221_13976476 chr2L_13976477_13976753;chr2L_13975780_13975879 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000531 K jcn_only_AA Usp7,I_chrX_11919055_11919146,I_chrX_11922059_11922456 chrX - chrX_11919079_11919146;chrX_11919055_11919146 chrX_11919091_11919146 chrX_11919147_11919211;chrX_11918989_11919054 78.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0071960000000000001 N jcn_only_AA CG8790 chr3R + chr3R_9190952_9191016;chr3R_9190952_9193285;chr3R_9190952_9193295 chr3R_9190952_9193460 chr3R_9190661_9190951 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0052480000000000001 K jcn_only_AA lgs,RI_chr4_463390_463489 chr4 - chr4_463016_463489 chr4_463390_463489 chr4_463490_463589 12.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00046000000000000001 N jcn_only_AA CG31751,RI_chr2L_18677311_18677391,RI_chr2L_18677473_18677932 chr2L + chr2L_18677473_18677932;chr2L_18677473_18678838 chr2L_18677473_18682264 chr2L_18677392_18677472 0.00 NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034270000000000002 N jcn_only_AA CG14939,RI_chr2L_11812683_11813150 chr2L - chr2L_11811446_11811593 chr2L_11811500_11811593 chr2L_11811594_11812682;chr2L_11810098_11811445 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 N jcn_only_AA Droj2,RI_chr3R_9207981_9208471,RI_chr3R_9208529_9209185 chr3R + chr3R_9207981_9209956;chr3R_9207981_9208471 chr3R_9207981_9209185 chr3R_9207926_9207980;chr3R_9209957_9210301 97.98 NA NA 81.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG18854,RI_chr2L_9789598_9789790,I_chr2L_9789694_9789790,REI_chr2L_9789718_9789790,I_chr2L_9790307_9790615,I_chr2L_9790310_9790556 chr2L - chr2L_9789733_9789790;chr2L_9789740_9789790;chr2L_9789718_9789790;chr2L_9789751_9789790;chr2L_9789598_9789790 chr2L_9789694_9789790 chr2L_9789791_9789832;chr2L_9789594_9789597 6.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5000000000000003e-05 K jcn_only_AA Sin3A,RI_chr2R_8468118_8468706,I_chr2R_8473578_8480185,RI_chr2R_8479951_8480233 chr2R - chr2R_8468118_8468706 chr2R_8468136_8468706 chr2R_8468707_8468806;chr2R_8468018_8468117 87.18 NA NA NA NA NA 56.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.5523770000000006e-06 K jcn_only_AA tay,I_chrX_15774035_15774320,I_chrX_15779977_15780538,RI_chrX_15780874_15781045,I_chrX_15783766_15785978 chrX - chrX_15774035_15774320 chrX_15774255_15774320 chrX_15774321_15774420;chrX_15773935_15774034 96.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG31033,RI_chr3R_25658089_25658914 chr3R - chr3R_25658089_25658914;chr3R_25658071_25658914 chr3R_25658095_25658914 chr3R_25658915_25659003;chr3R_25657989_25658070 17.89 NA NA 50.75 NA NA 52.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.0173487791439203e-10 K jcn_only_AA mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179 chr3L + chr3L_21908110_21908213 chr3L_21908110_21908201 chr3L_21907993_21908109;chr3L_21908214_21908295 74.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 99.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-06 K jcn_only_AA CG4980 chr3R - chr3R_23747816_23747920 chr3R_23747854_23747920 chr3R_23747921_23748082;chr3R_23746995_23747815 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00046000000000000001 N jcn_only_AA CG31710 chr2L - chr2L_9703179_9703267 chr2L_9703182_9703267 chr2L_9703268_9703605;chr2L_9702964_9703178 0.00 NA NA 35.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.93 NA 39.02 NA 1.2227586630779519e-08 K jcn_only_AA I_chr2R_19695638_19696332,Nxt1,RI_chr2R_19699261_19699317,CG4797 chr2R - chr2R_19699248_19699317 chr2R_19699261_19699317 chr2R_19699318_19699386;chr2R_19699179_19699247 10.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025384 K jcn_only_AA mip120,I_chr2R_9394299_9394351,RI_chr2R_9394299_9395019,EfTuM chr2R + chr2R_9394299_9395019;chr2R_9394299_9394351 chr2R_9394299_9397293 chr2R_9394199_9394298 72.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.43 NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00019252986200000001 N jcn_only_AA I_chrX_16309561_16309689,hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16323441_16323563;chrX_16323441_16323548 chrX_16323441_16324653 chrX_16323093_16323440;chrX_16324654_16324797 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00067900000000000002 K jcn_only_AA CG12945,I_chr3R_5615604_5615859,I_chr3R_5615807_5615858,RI_chr3R_5616467_5616560 chr3R - chr3R_5616467_5616560 chr3R_5616494_5616560 chr3R_5616561_5616629;chr3R_5616402_5616466 91.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0026710000000000002 K jcn_only_AA Nhe2,I_chr2L_21122390_21122912 chr2L + chr2L_21124522_21125346 chr2L_21124522_21125316 chr2L_21124443_21124521;chr2L_21125347_21125439 35.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038997999999999998 K jcn_only_AA akirin,I_chr3L_7363173_7364806,I_chr3L_7363177_7364806,I_chr3L_7363177_7364831,I_chr3L_7363211_7364831,I_chr3L_7363731_7364806,I_chr3L_7364126_7364806,RI_chr3L_7364737_7364806 chr3L + chr3L_7363169_7364831 chr3L_7363169_7364806 chr3L_7363111_7363168;chr3L_7364832_7364906 78.18 NA NA 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.5292000000000002e-06 N jcn_only_AA CG15099 chr2R - chr2R_14725051_14725138 chr2R_14725074_14725138 chr2R_14725139_14725207;chr2R_14724985_14725050 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG6199 chr3L - chr3L_11192493_11195314 chr3L_11195174_11195314 chr3L_11195315_11195440;chr3L_11192366_11192492 0.00 NA NA NA NA NA 10.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030242999999999999 K jcn_only_AA spz chr3R - chr3R_22892176_22892329 chr3R_22892203_22892329 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22892041_22892175 69.35 NA NA 81.75 NA NA 82.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.49 NA NA NA NA 53.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.28 NA 0.0 K jcn_only_AA CG9992 chrX - chrX_16277545_16278620;chrX_16277559_16278620 chrX_16277201_16278620 chrX_16278621_16278914 31.63 NA NA 63.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0049709999999999997 K jcn_only_AA CG31999,I_chr4_240711_240769,I_chr4_243657_244182 chr4 - chr4_239517_240516 chr4_240423_240516 chr4_240517_240654 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022787000000000002 N jcn_only_AA TepIV,EI_chr2L_19548696_19549582 chr2L + chr2L_19548696_19549858;chr2L_19548696_19549582 chr2L_19548696_19551681 chr2L_19548596_19548695 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023222 N jcn_only_AA CG33967 chr3R - chr3R_10528292_10528612 chr3R_10528308_10528612 chr3R_10528613_10528911;chr3R_10526678_10528291 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA alt chr3R - chr3R_13500526_13500610 chr3R_13500546_13500610 chr3R_13500611_13500733;chr3R_13499903_13500525 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 N jcn_only_AA CG13900,I_chr3L_830745_830907 chr3L - chr3L_830745_830907;chr3L_830715_830907;chr3L_830814_830907 chr3L_830729_830907 chr3L_830908_831007;chr3L_830702_830714 98.85 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8129999999999999e-07 N jcn_only_AA noncoding_4622,CE_chr2R_2237053_2237111 chr2R - chr2R_2237032_2237090 chr2R_2237036_2237090 chr2R_2237091_2237159;chr2R_2236997_2237031 60.64 NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0073930000000000003 K jcn_only_AA prominin-like,I_chr3L_3121200_3123087 chr3L - chr3L_3121200_3127652 chr3L_3127026_3127652 chr3L_3127653_3127699 80.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA gce chrX + chrX_15211516_15211645 chrX_15211516_15211580 chrX_15211376_15211515;chrX_15211646_15212206 5.85 NA NA NA NA NA 35.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7e-05 N jcn_only_AA CG8108,EI_chr3L_9859462_9859590,chr3L_9859594_9859878.0 chr3L + chr3L_9859462_9860377;chr3L_9859462_9859590 chr3L_9859462_9860413 chr3L_9859414_9859461;chr3L_9860414_9860844 90.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG13807 chr3L + chr3L_2263295_2263374 chr3L_2263295_2263355 chr3L_2262781_2263294;chr3L_2263375_2263666 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7e-05 N jcn_only_AA CG1674,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_261460_263113;chr4_261460_263086 chr4_261460_261555 chr4_261360_261459;chr4_263114_263305 0.00 NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000455 K jcn_only_AA CG15609,C_chr2R_12899322_12900789,I_chr2R_12902708_12903184 chr2R - chr2R_12900214_12900789 chr2R_12900280_12900789 chr2R_12900790_12900889;chr2R_12899457_12900213 100.00 NA NA NA NA NA 81.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010055 K jcn_only_AA tral,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12510160_12510527 chr3L_12510160_12510515 chr3L_12509677_12510159;chr3L_12510528_12511057 13.79 NA NA 30.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.70 NA NA 27.27 NA NA 26.22 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA msn,I_chr3L_2558033_2560115,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2558393_2560115;chr3L_2558390_2560115 chr3L_2558036_2560115 chr3L_2560116_2560215;chr3L_2557936_2558035 27.84 NA NA NA NA NA 50.76 NA NA NA NA NA 14.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.29 46.26 13.80 NA NA NA NA NA NA NA NA 43.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.85 NA 41.82 38.98 NA NA NA NA NA 45.49 NA 0.0 K jcn_only_AA dnc,I_chrX_3150245_3150319,I_chrX_3150351_3152643 chrX + chrX_3226580_3228183 chrX_3226580_3228177 chrX_3226475_3226579;chrX_3228184_3228364 72.47 NA NA 96.88 NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0813140000000001e-09 N jcn_only_AA slik,I_chr2R_20286707_20287372,REI_chr2R_20287415_20287722,I_chr2R_20288968_20289185,I_chr2R_20289332_20290093 chr2R - chr2R_20283680_20283755 chr2R_20283699_20283755 chr2R_20283756_20283824;chr2R_20283566_20283679 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-06 K jcn_only_AA rin,I_chr3R_9476825_9476895 chr3R + chr3R_9472923_9473104;chr3R_9472923_9473143 chr3R_9472923_9474639 chr3R_9472709_9472922 44.91 NA NA 75.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.12 69.60 76.79 NA NA NA NA NA NA 66.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA endos,I_chr3L_14024099_14024488,I_chr3L_14024103_14024158,I_chr3L_14024103_14024546,noncoding_12505,I_chr3L_14024496_14024546 chr3L - chr3L_14024103_14024488 chr3L_14024158_14024488 chr3L_14024489_14024495;chr3L_14024003_14024102 3.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048143999999999999 K jcn_only_AA CG7843,I_chr2R_1972736_1972822 chr2R - chr2R_1971896_1972012;chr2R_1971883_1972012 chr2R_1971513_1972012 chr2R_1972013_1972292 90.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014799999999999999 N jcn_only_AA CG31431 chr3R + chr3R_17697863_17697938;chr3R_17697863_17697989 chr3R_17697863_17698131 chr3R_17697704_17697862;chr3R_17698132_17698247 100.00 NA NA NA NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG6664 chr3L - chr3L_17007987_17008086 chr3L_17008005_17008086 chr3L_17008087_17008177;chr3L_17007093_17007986 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0028909999999999999 N jcn_only_AA Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11821304_11821703 chr2R_11821325_11821703 chr2R_11821704_11822085;chr2R_11820289_11821303 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0000000000000002e-06 K jcn_only_AA Rbp1-like,R_chrX_13277657_13278332 chrX - chrX_13275077_13278332 chrX_13277657_13278332 chrX_13278333_13278432;chrX_13274199_13275076 24.04 NA NA 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.8999999999999998e-05 N jcn_only_AA Pmi,PGRP-LD chr3L + chr3L_5775409_5775770 chr3L_5775409_5775724 chr3L_5775097_5775408;chr3L_5775771_5775948 35.50 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045752000000000001 K jcn_only_AA I_chr2L_8029734_8029787,Cka,CG7429 chr2L + chr2L_8036299_8036381 chr2L_8036299_8036357 chr2L_8035821_8036298;chr2L_8036382_8036576 35.85 NA NA NA NA NA 22.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.46 57.44 NA NA NA NA NA NA NA 11.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Syb chr2R - chr2R_6138650_6139432 chr2R_6138719_6139432 chr2R_6139433_6139489;chr2R_6138448_6138649 26.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.43 8.582579199999999e-11 K jcn_only_AA RpL15 chr3LHet + chr3LHet_2397820_2398143;chr3LHet_2397820_2398127 chr3LHet_2397820_2398049 chr3LHet_2397802_2397819;chr3LHet_2398144_2398454 3.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016452000000000001 N jcn_only_AA wun2,I_chr2R_5304606_5304660 chr2R + chr2R_5304841_5304916 chr2R_5304841_5304899 chr2R_5304772_5304840;chr2R_5304917_5305073 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K jcn_only_AA oho23B,I_chr2L_2856176_2856244,I_chr2L_2856573_2856630,RI_chr2L_2856673_2856772 chr2L + chr2L_2856306_2856391 chr2L_2856306_2856376 chr2L_2856279_2856305;chr2L_2856392_2856568 99.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Pkc98E chr3R + chr3R_24867963_24870088 chr3R_24867963_24868547 chr3R_24867889_24867962 22.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8000000000000002e-05 K jcn_only_AA rok,RI_chrX_16526333_16526477 chrX - chrX_16521501_16521628 chrX_16521528_16521628 chrX_16521629_16521903;chrX_16521334_16521500 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9035664000000006e-05 K jcn_only_AA betaTub60D chr2R + chr2R_20198354_20198418 chr2R_20198354_20198415 chr2R_20198245_20198353;chr2R_20198419_20198660 53.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039234999999999999 K jcn_only_AA I_chr2L_100704_100835,CG11377 chr2L + chr2L_103435_103877 chr2L_103435_103515 chr2L_103006_103434;chr2L_103878_104103 83.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA 94.34 NA 53.29 93.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.3762035763544001e-11 N jcn_only_AA CG7091,RI_chr3R_8805541_8805680,I_chr3R_8809774_8809832 chr3R + chr3R_8804251_8804598 chr3R_8804251_8804579 chr3R_8803691_8804250;chr3R_8804599_8804832 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027358 N jcn_only_AA Gprk2 chr3R + chr3R_27259611_27279032 chr3R_27259611_27259861 chr3R_27259181_27259610;chr3R_27279033_27279128 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 31.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA 2.3790488049e-06 K jcn_only_AA I_chr3R_22696095_22697413,Rb97D chr3R - chr3R_22699278_22699581 chr3R_22699401_22699581 chr3R_22699582_22699720;chr3R_22698253_22699277 39.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010796999999999999 K jcn_only_AA RI_chr2L_8218680_8218853,Pvr,I_chr2L_8229012_8229080,I_chr2L_8230332_8238998 chr2L - chr2L_8221968_8222225 chr2L_8222115_8222225 chr2L_8222226_8222376;chr2L_8221488_8221967 90.71 73.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.78 NA NA 0.0 K jcn_only_AA tacc,I_chr3R_570388_572101,I_chr3R_574271_574512 chr3R - chr3R_563485_567573;chr3R_563461_567573 chr3R_563503_567573 chr3R_567574_568885;chr3R_563195_563460 62.77 NA NA NA NA NA 32.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048570000000000002 N jcn_only_AA RhoGAP18B chrX - chrX_19047302_19047377 chrX_19047314_19047377 chrX_19047378_19047520;chrX_19047061_19047301 0.00 NA NA NA NA NA 25.53 41.94 27.94 NA NA 27.08 NA NA NA 35.48 NA 28.81 34.38 32.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.42 NA NA 24.10 NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0710570031416828e-26 K jcn_only_AA cic chr3R + chr3R_16125516_16125689 chr3R_16125516_16125674 chr3R_16125423_16125515;chr3R_16125690_16125874 84.25 NA NA 71.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 98.47 96.26 NA 66.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.533316901376816e-08 K jcn_only_AA Zyx102EF,I_chr4_1079131_1080044,I_chr4_1079946_1080044,RI_chr4_1079959_1080044,I_chr4_1080463_1081366,REF_chr4_1081261_1081452,F_chr4_1081280_1081398,F_chr4_1081280_1081452 chr4 - chr4_1079978_1080044;chr4_1079959_1080044 chr4_1079915_1080044 chr4_1080045_1080072;chr4_1079859_1079914 45.71 NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0066369999999999997 K jcn_only_AA CG3262 chr2L + chr2L_22240104_22240169 chr2L_22240104_22240153 chr2L_22239906_22240103;chr2L_22240170_22240402 41.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG7843,I_chr2R_1972736_1972822 chr2R - chr2R_1968540_1969240 chr2R_1968921_1969240 chr2R_1969241_1969345;chr2R_1968340_1968539 54.50 NA NA NA NA NA 34.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0014227551800000001 N jcn_only_AA faf,RI_chr3R_27603474_27603893,I_chr3R_27620212_27620267,RI_chr3R_27624356_27624427 chr3R + chr3R_27604481_27605081 chr3R_27604481_27604751 chr3R_27603894_27604480;chr3R_27605082_27605230 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.20 NA NA NA NA NA 21.43 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5093167e-11 K jcn_only_AA eIF2B-delta chr2R + chr2R_19274146_19274312;chr2R_19274146_19274464 chr2R_19274146_19274529 chr2R_19274016_19274145 85.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013964000000000001 K jcn_only_AA CG8005,noncoding_11293 chr3L + chr3L_8191584_8191652 chr3L_8191584_8191641 chr3L_8191314_8191583;chr3L_8191653_8191878 88.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022232999999999999 K jcn_only_AA CG15514 chr3R - chr3R_25686337_25686428 chr3R_25686358_25686428 chr3R_25686429_25687281;chr3R_25685755_25686336 50.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00093704528999999999 K jcn_only_AA CG42542,I_chr3R_11024452_11024586 chr3R + chr3R_11025433_11027745 chr3R_11025433_11026407 chr3R_11025292_11025432 5.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027421999999999998 N jcn_only_AA CG2201 chr2L - chr2L_21618111_21623365 chr2L_21623130_21623365 chr2L_21623366_21623540;chr2L_21618011_21618110 34.11 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6500529382399998e-06 N jcn_only_AA CG34140,CG34140_Mkp,noncoding_9561 chr3L - chr3L_184068_184131 chr3L_184073_184131 chr3L_184132_184197;chr3L_184008_184067 79.46 NA 100.00 NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6997867147388774e-08 K jcn_only_AA Flo-2 chrX + chrX_14818447_14820768;chrX_14818447_14824779;chrX_14818447_14820798 chrX_14818447_14819678 chrX_14818259_14818446 12.50 NA NA 55.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8999999999999999e-05 N jcn_only_AA CG18228 chr3R - chr3R_4087273_4087522;chr3R_4087322_4087522 chr3R_4087428_4087522 chr3R_4087523_4087669;chr3R_4087045_4087272 0.00 NA NA NA NA NA 25.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014643445599999999 K jcn_only_AA Hrb98DE,I_chr3R_24425722_24428493,I_chr3R_24426291_24426781,RI_chr3R_24429041_24431183 chr3R + chr3R_24426291_24426439 chr3R_24426291_24426427 chr3R_24426191_24426290;chr3R_24426440_24426915 43.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019626999999999999 K jcn_only_AA noncoding_23420,hep chrX - chrX_12975077_12975545 chrX_12975152_12975545 chrX_12975546_12976097;chrX_12974671_12975076 39.31 NA NA 60.62 NA NA 16.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.03 2.0004384740639998e-17 K jcn_only_AA X11L,I_chrX_17497609_17497728,RE_chrX_17497873_17498103 chrX + chrX_17497505_17497746 chrX_17497505_17497728 chrX_17497189_17497504;chrX_17497747_17497828 97.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047168000000000002 K jcn_only_AA Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3354556_3354987 chr2R_3354822_3354987 chr2R_3354988_3355138;chr2R_3354549_3354555 92.44 NA NA NA NA NA NA 75.47 NA NA NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5001199999999997e-05 K jcn_only_AA Strn-Mlck,I_chr2R_11838019_11838662 chr2R - chr2R_11837971_11838662 chr2R_11838019_11838662 chr2R_11838663_11838663;chr2R_11837919_11837970 3.75 NA NA NA NA NA 16.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Dsp1,I_chrX_16228447_16229355,I_chrX_16231287_16231413 chrX + chrX_16228447_16230320;chrX_16228447_16230323 chrX_16228447_16230299 chrX_16228347_16228446;chrX_16230324_16230776 14.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023701 K jcn_only_AA CG1140,I_chr3L_1964610_1964836 chr3L + chr3L_1964610_1965074;chr3L_1964610_1965059 chr3L_1964610_1964836 chr3L_1964541_1964609;chr3L_1965075_1965273 2.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00077499999999999997 K jcn_only_AA CG5630 chr3R + chr3R_16752700_16754401 chr3R_16752700_16752909 chr3R_16752493_16752699;chr3R_16754402_16754407 98.98 NA NA 60.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CHES-1-like,I_chrX_7584030_7588818 chrX - chrX_7584030_7590509 chrX_7588919_7590509 chrX_7590510_7590564;chrX_7583930_7584029 0.00 NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016056999999999998 N jcn_only_AA JhI-26,I_chr2R_12177114_12177266 chr2R + chr2R_12178257_12178348;chr2R_12178257_12178308 chr2R_12178257_12178432 chr2R_12177457_12178256;chr2R_12178433_12178520 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 N jcn_only_AA CG30193,CG30190 chr2R + chr2R_18815153_18817321 chr2R_18815153_18816610 chr2R_18815039_18815152;chr2R_18817322_18817596 100.00 NA NA 86.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0052690000000000002 K jcn_only_AA fbp,I_chr2L_19762832_19763529,RI_chr2L_19763745_19764069 chr2L - chr2L_19763745_19764069;chr2L_19763498_19764069 chr2L_19762832_19764069 chr2L_19764070_19764120 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00064700000000000001 K jcn_only_AA CG10424,RI_chr3L_19090338_19090405 chr3L - chr3L_19090328_19090405 chr3L_19090338_19090405 chr3L_19090406_19090505;chr3L_19090238_19090327 8.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027181 N jcn_only_AA Moca-cyp chr3R + chr3R_24167182_24167348;chr3R_24167182_24167249;chr3R_24167182_24167243;chr3R_24167182_24167260 chr3R_24167182_24167906 chr3R_24167094_24167181;chr3R_24167907_24167936 58.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.52 NA 91.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Rbp1,Mcm5 chr3R + chr3R_6610646_6611879 chr3R_6610646_6611124 chr3R_6610279_6610645;chr3R_6611880_6612229 24.70 NA NA 46.36 NA NA NA NA NA NA 50.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.87 NA NA NA NA 1.0964322062730001e-05 K jcn_only_AA CG12582 chr3R + chr3R_23285_23458 chr3R_23285_23350 chr3R_23137_23284;chr3R_23459_23593 1.83 NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.9874999999999995e-08 N jcn_only_AA CG8839,I_chr2R_8229288_8231538 chr2R - chr2R_8228920_8228992 chr2R_8228935_8228992 chr2R_8228993_8229287;chr2R_8228715_8228919 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA bon chr3R + chr3R_16435123_16435685 chr3R_16435123_16435661 chr3R_16434948_16435122;chr3R_16435686_16436022 12.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1e-05 K jcn_only_AA cenB1A chr3R + chr3R_18947355_18947549 chr3R_18947355_18947528 chr3R_18947059_18947354;chr3R_18947550_18947666 74.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017849999999999999 K jcn_only_AA gem,I_chr2R_6015083_6015660 chr2R + chr2R_6016198_6016327 chr2R_6016198_6016288 chr2R_6016086_6016197;chr2R_6016328_6016534 20.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048793999999999997 K jcn_only_AA gish chr3R + chr3R_12127074_12127544 chr3R_12127074_12127526 chr3R_12126967_12127073;chr3R_12127545_12127876 25.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.46 NA NA NA NA NA NA NA 60.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.4928999999999996e-14 K jcn_only_AA SelR,I_chr3R_6691367_6692250,I_chr3R_6692461_6692530,I_chr3R_6694098_6694160 chr3R - chr3R_6689548_6692250 chr3R_6689581_6692250 chr3R_6692251_6692350;chr3R_6689071_6689547 15.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034562000000000002 N jcn_only_AA CkIIbeta,I_chrX_11686847_11687475,I_chrX_11687161_11687475,I_chrX_11689220_11690898 chrX + chrX_11687552_11687884 chrX_11687552_11687830 chrX_11687476_11687551;chrX_11687885_11687933 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA NTPase chr2L - chr2L_2881305_2881381 chr2L_2881321_2881381 chr2L_2881382_2882511;chr2L_2881215_2881304 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG18619,RI_chr2L_10264634_10264691,RI_chr2L_10264634_10264699,I_chr2L_10264634_10264770,RI_chr2L_10265562_10265628 chr2L + chr2L_10264265_10264551 chr2L_10264265_10264548 chr2L_10264122_10264264;chr2L_10264552_10264633 44.08 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5986239369999999e-07 N jcn_only_AA EF_chr2R_8548702_8595112,nemy chr2R - chr2R_8561434_8563629;chr2R_8563548_8563629;chr2R_8561431_8563629 chr2R_8560845_8563629 chr2R_8563630_8563736 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026044000000000001 K jcn_only_AA deltaCOP,I_chrX_1754047_1754089,I_chrX_1755132_1755191,E_chrX_1755139_1755188,I_chrX_1757755_1757801 chrX - chrX_1754655_1754718 chrX_1754658_1754718 chrX_1754719_1755131;chrX_1754460_1754654 27.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038935999999999998 N jcn_only_AA stc chr2L + chr2L_15114214_15114299;chr2L_15114214_15114311 chr2L_15114214_15114448 chr2L_15114049_15114213;chr2L_15114449_15115753 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012400000000000001 K jcn_only_AA Fur1,I_chr3R_21179590_21179870,CEI_chr3R_21210600_21222433,I_chr3R_21257704_21287086 chr3R - chr3R_21177936_21179870;chr3R_21177915_21179870 chr3R_21179590_21179870 chr3R_21179871_21179970;chr3R_21177839_21177914 1.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2999999999999999e-05 K jcn_only_AA CG32394,RI_chr3L_6731199_6731803,dikar chr3L - chr3L_6730773_6731803 chr3L_6731199_6731803 chr3L_6731804_6731903;chr3L_6730635_6730772 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032490999999999999 K jcn_only_AA mus210,RI_chr2R_11200323_11202068,RI_chr2R_11200323_11202128,chr2R_11200326_11200570.0,chr2R_11200670_11201286.0 chr2R + chr2R_11200323_11202122 chr2R_11200323_11202068 chr2R_11200223_11200322;chr2R_11202123_11202168 3.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6816091000000001e-05 K jcn_only_AA Usp7,I_chrX_11922059_11922456 chrX - chrX_11922059_11922456 chrX_11922073_11922456 chrX_11922457_11922556;chrX_11921983_11922058 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0083510000000000008 K jcn_only_AA CG3635 chr2L + chr2L_22183467_22183599;chr2L_22183467_22183607 chr2L_22183467_22183527 chr2L_22183394_22183466;chr2L_22183608_22183915 40.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.46 NA NA NA NA 58.22 NA NA NA NA NA NA 63.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9539055000000019e-10 N jcn_only_AA CG17119,sav chr3R - chr3R_18880054_18880450 chr3R_18880351_18880450 chr3R_18880451_18880553;chr3R_18880008_18880053 100.00 NA NA NA 88.39 NA NA NA NA NA 87.00 NA NA NA NA NA 88.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5641448264000001e-08 N jcn_only_AA None chrU + chrU_1179335_1184352;chrU_1179335_1184082 chrU_1179335_1183262 96.83 NA NA 74.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.44 NA 7.3628224000000002e-10 K jcn_only_AA CG11148,I_chr4_886499_886547,RI_chr4_886921_887162 chr4 - chr4_886478_886556 chr4_886499_886556 chr4_886557_886647;chr4_886399_886477 87.30 NA NA 99.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014154 N jcn_only_AA Vps13,I_chr2R_3464510_3464571 chr2R + chr2R_3454389_3456383 chr2R_3454389_3454650 chr2R_3454371_3454388 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.92 NA 53.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.97589045e-10 N jcn_only_AA Kr-h1 chr2L + chr2L_6083741_6091609;chr2L_6083741_6092994 chr2L_6083741_6084867 chr2L_6083642_6083740 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG4360 chr3R - chr3R_16151875_16152037 chr3R_16151951_16152037 chr3R_16152038_16152520;chr3R_16150089_16151874 13.45 NA NA 30.81 NA NA 30.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.2811200000000008e-07 K jcn_only_AA Eip63E,I_chr3L_3607397_3607501 chr3L + chr3L_3578481_3593328 chr3L_3578481_3588041 chr3L_3578289_3578480 55.38 NA NA 81.97 NA NA 16.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.76944395936e-07 K jcn_only_AA CG15347,I_chrX_8353371_8353552,I_chrX_8353371_8354203,I_chrX_8353497_8353552 chrX - chrX_8353371_8354798 chrX_8353416_8354798 chrX_8354799_8354949;chrX_8353271_8353370 7.20 NA NA NA NA NA 25.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA par-1,mei-W68,RI_chr2R_15355419_15356294,F_chr2R_15362147_15365138,RI_chr2R_15363358_15365120,I_chr2R_15365210_15370456 chr2R + chr2R_15344481_15347299 chr2R_15344481_15345476 chr2R_15343700_15344480 5.31 NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00060599999999999998 K jcn_only_AA CG5514,RI_chr3R_23768206_23768306,Gp93 chr3R + chr3R_23767856_23768306;chr3R_23767856_23768309 chr3R_23767856_23768156 chr3R_23765429_23767855;chr3R_23768310_23768406 14.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0083510000000000008 N jcn_only_AA Xrp1,I_chr3R_14741648_14750799,I_chr3R_14750298_14750799 chr3R + chr3R_14749868_14750799 chr3R_14749868_14750009 chr3R_14749792_14749867;chr3R_14750800_14750899 0.00 NA NA 31.37 NA NA NA NA NA 27.78 NA NA 43.24 NA NA NA NA NA 21.82 25.42 30.77 17.97 21.88 NA NA NA NA 22.33 NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA 24.47 40.00 22.67 NA 23.85 NA NA NA NA NA 23.33 24.19 NA NA NA NA NA NA NA 8.8516215341405852e-40 K jcn_only_AA Nop60B,RI_chr2R_20063248_20063455,I_chr2R_20063248_20063949,F_chr2R_20073291_20073744 chr2R + chr2R_20063248_20063455 chr2R_20063248_20063439 chr2R_20063148_20063247;chr2R_20063456_20063555 98.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Upf1,I_chrX_11799010_11799076 chrX - chrX_11798981_11799067 chrX_11799010_11799067 chrX_11799068_11799388;chrX_11798910_11798980 62.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021740000000000002 N jcn_only_AA Trc8 chr3R - chr3R_25326236_25326440;chr3R_25325222_25326440 chr3R_25326221_25326440 chr3R_25326441_25326615 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021507999999999999 K jcn_only_AA Spf45 chr2L - chr2L_22960834_22960931 chr2L_22960877_22960931 chr2L_22960932_22961115;chr2L_22959877_22960833 85.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028355000000000002 K jcn_only_AA Spn,I_chr3L_2511764_2512148 chr3L - chr3L_2508866_2509363 chr3L_2508908_2509363 chr3L_2509364_2509500;chr3L_2508639_2508865 30.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.74 NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000366622932 N jcn_only_AA CG32138 chr3L + chr3L_14058259_14058688;chr3L_14058259_14058715 chr3L_14058259_14059498 chr3L_14058172_14058258;chr3L_14059499_14060368 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG40467 chr3LHet - chr3LHet_722704_789080;chr3LHet_787757_789080 chr3LHet_787974_789080 chr3LHet_789081_789255;chr3LHet_722418_722703 0.00 NA NA 41.03 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9626063999999998e-05 N jcn_only_AA CG42394,noncoding_15936,E_chr3R_6675742_6676058 chr3R + chr3R_6677211_6677344;chr3R_6677211_6677262 chr3R_6677211_6677270 chr3R_6677007_6677210;chr3R_6677345_6677430 81.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5646964916413545e-07 K jcn_only_AA Atg18,I_chr3L_8182683_8182941 chr3L + chr3L_8181681_8182401 chr3L_8181681_8182386 chr3L_8180913_8181680;chr3L_8182402_8182545 35.29 NA NA NA NA 12.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00015710873000000002 K jcn_only_AA CG7987,RI_chr3R_10400799_10401492 chr3R - chr3R_10400782_10401492;chr3R_10400799_10401492 chr3R_10400608_10401492 chr3R_10401493_10401559;chr3R_10400270_10400607 52.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003473 K jcn_only_AA CG17838,I_chr3R_16623576_16628011 chr3R + chr3R_16623576_16624036 chr3R_16623576_16624012 chr3R_16623476_16623575;chr3R_16624037_16624131 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1e-05 K jcn_only_AA I_chr2L_19644636_19644695,REI_chr2L_19702035_19702145,Nf-YB chr2L + chr2L_19736209_19736289 chr2L_19736209_19736272 chr2L_19736042_19736208;chr2L_19736290_19736580 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032207 K jcn_only_AA CG14253,E_chr3R_22806425_22807258 chr3R + chr3R_22806425_22807258;chr3R_22806425_22807235;chr3R_22806425_22809684 chr3R_22806425_22807254 chr3R_22806325_22806424 58.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01951 K jcn_only_AA CE_chrX_20766225_20927825,CG1529,RI_chrX_20902550_20902613 chrX - chrX_20902550_20902613 chrX_20902561_20902613 chrX_20902614_20902713;chrX_20902450_20902549 22.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005084 K jcn_only_AA Tango13,I_chrX_13480088_13480998,I_chrX_13483861_13483954 chrX + chrX_13480088_13483954 chrX_13480088_13480998 chrX_13479988_13480087;chrX_13483955_13484054 0.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K jcn_only_AA Zasp52,I_chr2R_11661472_11663280,I_chr2R_11690993_11701987 chr2R - chr2R_11662263_11664682 chr2R_11663013_11664682 chr2R_11664683_11664791;chr2R_11661933_11662262 98.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K jcn_only_AA rtGEF,I_chr2L_20359856_20360012 chr2L + chr2L_20356802_20360012 chr2L_20356802_20356875 chr2L_20356590_20356801 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.98 NA NA 15.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.44936592563e-06 K jcn_only_AA CG3714,I_chr2L_4190825_4191774,I_chr2L_4192969_4193324,I_chr2L_4195905_4196470,I_chr2L_4196780_4197306,RI_chr2L_4196780_4197951,I_chr2L_4196815_4197306,I_chr2L_4196815_4197951 chr2L - chr2L_4196780_4197146 chr2L_4196815_4197146 chr2L_4197147_4197191;chr2L_4196715_4196779 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0065729999999999998 N jcn_only_AA klar,I_chr3L_462559_472609,RI_chr3L_517594_539898 chr3L - chr3L_451328_452837 chr3L_451772_452837 chr3L_452838_453488;chr3L_451127_451327 94.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 N jcn_only_AA CG32594 chrX + chrX_14918988_14924618 chrX_14918988_14919783 chrX_14918583_14918987;chrX_14924619_14924880 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5570000000000001e-09 N jcn_only_AA CG12207,I_chr3R_10115172_10115963,RE_chr3R_10124392_10124511 chr3R + chr3R_10126741_10126965 chr3R_10126741_10126949 chr3R_10126142_10126740;chr3R_10126966_10127961 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0060850000000000001 K jcn_only_AA msn,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2564696_2565600 chr3L_2564756_2565600 chr3L_2565601_2565613;chr3L_2564397_2564695 63.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.31 NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.385944400000001e-11 K jcn_only_AA RecQ5 chr3L - chr3L_14623293_14623619 chr3L_14623545_14623619 chr3L_14623620_14624918;chr3L_14622841_14623292 8.27 NA NA NA NA NA 38.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036415000000000003 N jcn_only_AA kay,noncoding_19957,E_chr3R_25616137_25617114 chr3R + chr3R_25599544_25617114 chr3R_25599544_25599635 chr3R_25598998_25599543;chr3R_25617115_25617214 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.97 14.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.5679999999999997e-09 N jcn_only_AA tral,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12508673_12509676 chr3L_12508673_12509658 chr3L_12508464_12508672;chr3L_12509677_12510159 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA wech,I_chr2R_3373673_3377000,I_chr2R_3373673_3377045,I_chr2R_3373673_3377324,I_chr2R_3376705_3376837 chr2R - chr2R_3373673_3376837;chr2R_3376324_3376837 chr2R_3376705_3376837 chr2R_3376838_3376937 8.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049190999999999999 K jcn_only_AA CG32344,RI_chr3L_321550_321914,I_chr3L_326540_326703,RI_chr3L_326725_326866 chr3L - chr3L_321361_321914;chr3L_321364_321914 chr3L_321550_321914 chr3L_321915_322014;chr3L_321242_321360 6.45 NA NA 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024875999999999999 K jcn_only_AA Msp-300,I_chr2L_5197634_5197866 chr2L + chr2L_5203743_5204462 chr2L_5203743_5204450 chr2L_5203116_5203742;chr2L_5204463_5204592 61.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.58 NA NA NA NA NA NA 82.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6807499999999999e-13 K jcn_only_AA CG3760,CG3770,CG12851 chr2R + chr2R_20826366_20826496 chr2R_20826366_20826478 chr2R_20826283_20826365;chr2R_20826497_20826740 28.16 NA NA 48.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.18 NA NA NA NA NA NA NA 12.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA Pxn,I_chr3L_2629527_2629921 chr3L - chr3L_2629579_2629913;chr3L_2629613_2629913;chr3L_2629585_2629913;chr3L_2629684_2629913;chr3L_2629527_2629913 chr3L_2629597_2629913 chr3L_2629914_2629921;chr3L_2629427_2629526 6.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA RPA2,RI_chr2L_20925851_20925909 chr2L - chr2L_20925824_20925913 chr2L_20925851_20925913 chr2L_20925914_20925975;chr2L_20925751_20925823 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Pitslre,I_chr3L_20764965_20765781,I_chr3L_20764965_20766192,I_chr3L_20764965_20766212,I_chr3L_20766064_20766192,I_chr3L_20766064_20766215,RI_chr3L_20766064_20766893,I_chr3L_20766311_20766664,I_chr3L_20766311_20766893,I_chr3L_20766773_20766893 chr3L + chr3L_20764965_20765704;chr3L_20764965_20766215 chr3L_20764965_20766893 chr3L_20764896_20764964;chr3L_20766894_20766993 64.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036241000000000002 K jcn_only_AA RpS27A,Ip259 chr2L + chr2L_10408387_10409710 chr2L_10408387_10408738 chr2L_10408376_10408386;chr2L_10409711_10410051 11.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.52 NA NA NA NA NA NA NA 25.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG10737 chr2R + chr2R_15062814_15063770;chr2R_15062814_15063692 chr2R_15062814_15063752 chr2R_15062592_15062813;chr2R_15063771_15063852 5.10 NA NA NA NA NA 22.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00022900000000000001 K jcn_only_AA Cap-G,CG34439 chr2R + chr2R_9046609_9047235 chr2R_9046609_9047038 chr2R_9046522_9046608;chr2R_9047236_9047380 58.82 NA NA 93.13 NA NA NA 79.41 NA 26.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.54 NA 15.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA mor chr3R - chr3R_11795125_11795603 chr3R_11795317_11795603 chr3R_11795604_11795814;chr3R_11794297_11795124 66.67 NA NA NA NA 21.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA 92.59 NA 43.36 NA NA NA NA NA NA NA 91.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA RpL36,RI_chrX_522912_523358,I_chrX_522932_523360,I_chrX_522949_523360 chrX - chrX_522932_523360;chrX_522949_523360 chrX_522912_523360 chrX_523361_523436;chrX_522849_522911 97.34 NA NA NA NA NA 82.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Spred,I_chr2R_10655876_10656868 chr2R - chr2R_10650514_10651335 chr2R_10650580_10651335 chr2R_10651336_10651504;chr2R_10650450_10650513 90.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000184 N jcn_only_AA Dscam,I_chr2R_3212243_3212342,F_chr2R_3219886_3228832,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3208270_3209087 chr2R_3208884_3209087 chr2R_3209088_3209151;chr2R_3207156_3208269 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020687000000000001 K jcn_only_AA simj,I_chr3L_10680263_10680313 chr3L + chr3L_10679362_10680175 chr3L_10679362_10680151 chr3L_10679064_10679361;chr3L_10680176_10680262 6.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0058710000000000004 K jcn_only_AA CG3409,I_chr2R_2591946_2592739,RI_chr2R_2593704_2599587 chr2R - chr2R_2591946_2592739 chr2R_2592092_2592739 chr2R_2592740_2592839;chr2R_2591846_2591945 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021210000000000001 K jcn_only_AA Gbeta13F,I_chrX_15754284_15755167,I_chrX_15754284_15755184,RI_chrX_15754356_15755268,I_chrX_15754356_15755409,RI_chrX_15755345_15755409 chrX + chrX_15754284_15755172;chrX_15754284_15755148;chrX_15754284_15755021;chrX_15754284_15755184;chrX_15754284_15755256;chrX_15754284_15754777;chrX_15754284_15755416;chrX_15754284_15755268 chrX_15754284_15755409 chrX_15754256_15754283 79.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0060549999999999996 K jcn_only_AA Fer1HCH,I_chr3R_26212319_26213496,I_chr3R_26213132_26213185 chr3R - chr3R_26213273_26213496;chr3R_26213365_26213496 chr3R_26213325_26213496 chr3R_26213497_26213534;chr3R_26213186_26213272 56.77 NA NA 41.43 NA NA 69.63 NA NA NA NA NA 75.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.30 NA NA 37.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA capu,I_chr2L_3884519_3902594,I_chr2L_3887800_3888648,I_chr2L_3887896_3888648 chr2L - chr2L_3889785_3893261;chr2L_3887557_3893261 chr2L_3887800_3893261 chr2L_3893262_3893604 1.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000348 K jcn_only_AA cora,F_chr2R_15122674_15122975,I_chr2R_15129291_15129988 chr2R + chr2R_15117159_15122975 chr2R_15117159_15122625 chr2R_15116929_15117158 96.67 NA NA 77.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.6848000000000001e-08 N jcn_only_AA Rpn2,CG11897 chr3R + chr3R_24980396_24980472 chr3R_24980396_24980457 chr3R_24979418_24980395;chr3R_24980473_24981742 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA wge chr3R - chr3R_18542387_18542655;chr3R_18542390_18542655 chr3R_18542354_18542655 chr3R_18542656_18542685;chr3R_18540256_18542353 63.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0053940000000000004 K jcn_only_AA fax chr3L - chr3L_16398937_16400120 chr3L_16398946_16400120 chr3L_16400121_16400459;chr3L_16398602_16398936 86.69 NA NA NA NA NA 48.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG4829,I_chrX_16717240_16717547 chrX + chrX_16717240_16717619;chrX_16717240_16717547 chrX_16717240_16717889 chrX_16717140_16717239;chrX_16717890_16718151 1.76 NA NA NA 29.01 33.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA l(1)G0334,I_chrX_4596624_4596856,I_chrX_4596625_4596762 chrX + chrX_4596625_4596856 chrX_4596625_4596724 chrX_4596525_4596624;chrX_4596857_4596862 22.73 NA NA NA NA NA 54.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.06 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA CG13923,CG12022 chr3L + chr3L_1803568_1805009 chr3L_1803568_1803794 chr3L_1803433_1803567 69.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015579000000000001 K jcn_only_AA ena chr2R + chr2R_15046858_15047299 chr2R_15046858_15047287 chr2R_15046625_15046857;chr2R_15047300_15047324 23.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026173999999999999 K jcn_only_AA Khc-73 chr2R - chr2R_11409610_11410378 chr2R_11409634_11410378 chr2R_11410379_11410524;chr2R_11409507_11409609 13.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017849999999999999 K jcn_only_AA CG6904,I_chr3R_10970962_10971422,I_chr3R_10970962_10972151,I_chr3R_10970962_10972185,I_chr3R_10970962_10972512,I_chr3R_10970962_10972522 chr3R - chr3R_10970962_10973196 chr3R_10971295_10973196 chr3R_10973197_10973329 2.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N jcn_only_AA CG17159,CG17162,noncoding_25215 chrXHet - chrXHet_66049_66121 chrXHet_66052_66121 chrXHet_66122_66324;chrXHet_64549_66048 34.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 1.331420862672e-05 K jcn_only_AA CG9674,I_chr3L_16785451_16785540,I_chr3L_16785706_16785748,I_chr3L_16793055_16800660 chr3L - chr3L_16785451_16785540;chr3L_16785436_16785540 chr3L_16784791_16785540 chr3L_16785541_16785640 92.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-06 N jcn_only_AA CG42354,CG42353 chrX - chrX_15989427_15989490 chrX_15989430_15989490 chrX_15989491_15989723;chrX_15989002_15989426 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00024350126000000002 K jcn_only_AA CG1832,I_chr2L_22167179_22167302,I_chr2L_22168644_22168740 chr2L - chr2L_22167239_22167302 chr2L_22167254_22167302 chr2L_22167303_22167402;chr2L_22167050_22167238 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0038059999999999999 N jcn_only_AA CG3287,I_chr2R_2700203_2700285 chr2R + chr2R_2701259_2702564 chr2R_2701259_2701541 chr2R_2700678_2701258;chr2R_2702565_2703029 69.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 88.83 NA NA NA 89.51 86.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.75 0.0 N jcn_only_AA CG32369,noncoding_11198 chr3L - chr3L_7774151_7796368 chr3L_7796250_7796368 chr3L_7796369_7797807;chr3L_7774032_7774150 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.4442489999999999e-05 N jcn_only_AA CG1416,I_chr2L_21758100_21758179,I_chr2L_21758143_21758183,I_chr2L_21758143_21758209 chr2L + chr2L_21758143_21758201;chr2L_21758143_21758209;chr2L_21758143_21758183 chr2L_21758143_21758205 chr2L_21758116_21758142;chr2L_21758210_21758279 0.00 NA NA NA NA NA NA 16.30 NA 25.00 NA NA NA 17.91 23.73 17.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.392431927366388e-12 K jcn_only_AA TMS1 chr3L + chr3L_16407594_16407920;chr3L_16407594_16407905;chr3L_16407594_16407914;chr3L_16407594_16407902 chr3L_16407594_16407893 chr3L_16407384_16407593;chr3L_16407921_16408056 59.11 NA NA 45.72 NA NA 39.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.95 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.55 NA 78.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K jcn_only_AA Nedd4,I_chr3L_17532828_17532882,I_chr3L_17532828_17533787,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17532828_17533787;chr3L_17532828_17533790 chr3L_17532828_17532882 chr3L_17532728_17532827;chr3L_17533791_17533887 6.67 NA NA 68.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000002e-05 K jcn_only_AA dwg,RI_chrX_2622297_2622355,RI_chrX_2622297_2622430,RI_chrX_2622435_2622577,RI_chrX_2627170_2627263 chrX + chrX_2622297_2622355;chrX_2622297_2622430 chrX_2622297_2622577 chrX_2622197_2622296;chrX_2622578_2622677 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.68 NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.9800000000000004e-10 K jcn_only_AA Pect,I_chr2L_13207997_13208109,E_chr2L_13208285_13210076 chr2L + chr2L_13208778_13209492;chr2L_13208778_13209501;chr2L_13208778_13209471 chr2L_13208778_13209435 chr2L_13208665_13208777;chr2L_13209502_13209599 20.37 NA NA 45.40 NA NA NA NA NA NA NA NA 36.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette I_chr2R_4783150_4783708,Ggamma1,noncoding_5300 chr2R + chr2R_4789028_4789832 chr2R_4789028_4789645;chr2R_4789783_4789832 chr2R_4789646_4789782 chr2R_4789007_4789027;chr2R_4789833_4790635 16.88 NA NA NA NA NA 30.82 38.46 32.31 NA 45.56 37.89 46.73 32.23 NA NA 38.36 NA 42.03 NA 31.73 NA NA NA NA 34.02 NA NA NA NA NA NA NA 28.29 NA NA NA NA NA NA NA 29.65 27.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.29 NA 27.21 NA NA 5.11 0.0 K cassette gish,I_chr3R_12125412_12126290 chr3R + chr3R_12124273_12126966 chr3R_12124273_12125312;chr3R_12125412_12126966 chr3R_12125313_12125411 chr3R_12124192_12124272;chr3R_12126967_12127073 12.33 NA 22.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.26 NA NA NA NA NA 0.0 K cassette PRL-1,I_chr2L_16247385_16247503,I_chr2L_16250028_16250080 chr2L - chr2L_16247385_16248601 chr2L_16247385_16247503;chr2L_16247765_16248601 chr2L_16247504_16247764 chr2L_16247285_16247384;chr2L_16248602_16248768 11.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.83 33.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette sqd,I_chr3R_9462248_9471474,I_chr3R_9468150_9468236,I_chr3R_9470417_9471474 chr3R - chr3R_9462248_9468020 chr3R_9462248_9462692;chr3R_9462801_9468020 chr3R_9462693_9462800 chr3R_9462148_9462247;chr3R_9468021_9468149 13.46 NA NA NA NA NA 3.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.91 NA NA NA NA NA NA NA NA 24.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 0.0 N cassette CG11873,I_chr3R_24900749_24922953 chr3R + chr3R_24890335_24922953 chr3R_24890335_24900684;chr3R_24900749_24922953 chr3R_24900685_24900748 chr3R_24889554_24890334;chr3R_24922954_24923053 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0099319999999999999 K cassette CG41378,I_chr2RHet_1545717_1605870,I_chr2RHet_1545717_1621473,I_chr2RHet_1545717_1621569,I_chr2RHet_1606049_1607768,RI_chr2RHet_1606049_1621284 chr2RHet - chr2RHet_1545717_1621569;chr2RHet_1545717_1621473 chr2RHet_1545717_1605870;chr2RHet_1606049_1621473,chr2RHet_1606049_1621569 chr2RHet_1605871_1606048 chr2RHet_1545666_1545716;chr2RHet_1621570_1621573 86.67 NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.66 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG11486,RE_chr3L_3084894_3085203 chr3L + chr3L_3083810_3085203 chr3L_3083810_3084807;chr3L_3084901_3085203 chr3L_3084808_3084900 chr3L_3083733_3083809;chr3L_3085204_3085298 8.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.61 NA NA NA NA NA 21.28 NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Myo61F,mtacp1,I_chr3L_1330291_1330865,I_chr3L_1330291_1331279,RI_chr3L_1330929_1331041,l(3)02640 chr3L + chr3L_1330291_1331041 chr3L_1330291_1330862;chr3L_1330929_1331041 chr3L_1330863_1330928 chr3L_1330191_1330290;chr3L_1331042_1331054 29.52 NA NA 48.89 NA NA 42.19 NA NA NA NA NA 39.80 NA NA NA NA NA NA NA NA 15.33 NA NA NA NA NA NA 43.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.76 NA NA 19.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette spri,I_chrX_10404621_10469422,I_chrX_10413811_10440661,I_chrX_10417598_10440661 chrX - chrX_10413811_10438418;chrX_10413811_10469422;chrX_10413811_10440661 chrX_10413811_10416835;chrX_10417598_10440661,chrX_10417598_10469422,chrX_10417598_10438418 chrX_10416836_10417597 chrX_10413711_10413810;chrX_10469423_10469435 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5449664000000007e-05 K cassette Stim chrX - chrX_15831788_15832790 chrX_15831788_15832264;chrX_15832369_15832790 chrX_15832265_15832368 chrX_15831624_15831787;chrX_15832791_15833231 3.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00050600000000000005 N cassette IP3K2,I_chrX_13216481_13219804 chrX + chrX_13213081_13221380 chrX_13213081_13219804;chrX_13220889_13221380 chrX_13219805_13220888 chrX_13212448_13213080;chrX_13221381_13221630 58.00 NA NA NA NA NA 80.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA 72.88 NA 76.27 NA NA NA NA 72.26 NA NA 77.78 NA NA NA NA 72.29 NA NA NA 73.26 NA NA 72.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.648377285487778e-23 N cassette Galpha49B,I_chr2R_8504706_8504960,I_chr2R_8506056_8506112 chr2R + chr2R_8504447_8505299 chr2R_8504447_8504576;chr2R_8504706_8505299 chr2R_8504577_8504705 chr2R_8504292_8504446;chr2R_8505300_8505429 100.00 NA NA 83.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1240803999999997e-05 N cassette Pde8,I_chr2R_19563512_19564565 chr2R + chr2R_19553559_19561808 chr2R_19553559_19559498;chr2R_19559612_19561808 chr2R_19559499_19559611 chr2R_19553474_19553558;chr2R_19561809_19561865 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1516,I_chr2R_5743716_5743899,I_chr2R_5746990_5747874,RI_chr2R_5752988_5757801 chr2R - chr2R_5740711_5742015 chr2R_5740711_5741187;chr2R_5741236_5742015 chr2R_5741188_5741235 chr2R_5740053_5740710;chr2R_5742016_5743525 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00042400000000000001 K cassette Abl,I_chr3L_16622304_16639909,RI_chr3L_16652567_16654512 chr3L - chr3L_16622307_16639909 chr3L_16622307_16624476;chr3L_16624531_16639909 chr3L_16624477_16624530 chr3L_16621763_16622306;chr3L_16639910_16640009 19.77 NA NA NA NA NA 4.44 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.00 NA NA NA NA NA NA NA 6.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3628356234054003e-10 K cassette rut,I_chrX_14718760_14718821 chrX - chrX_14690156_14692907 chrX_14690156_14691324;chrX_14691556_14692907 chrX_14691325_14691555 chrX_14689682_14690155;chrX_14692908_14693198 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00028836295200000001 K cassette yki chr2R - chr2R_19953837_19954685 chr2R_19953837_19954083;chr2R_19954240_19954685 chr2R_19954084_19954239 chr2R_19953784_19953836;chr2R_19954686_19954777 78.61 NA NA 54.80 NA NA 89.51 NA NA NA 91.67 NA NA NA NA NA NA 97.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.4267949119199998e-18 K cassette Crk,RI_chr4_231302_233315,I_chr4_231307_232253 chr4 + chr4_231307_233253 chr4_231307_232479;chr4_232609_233253 chr4_232480_232608 chr4_231208_231306;chr4_233254_233355 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA 42.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.97 NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.77 4.7763603388449993e-16 K cassette norpA,I_chrX_4219265_4219380 chrX + chrX_4247647_4251072 chrX_4247647_4247976;chrX_4248057_4251072 chrX_4247977_4248056 chrX_4247500_4247646;chrX_4251073_4251309 72.73 NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CkIIalpha,I_chr3L_23092989_23093344,RI_chr3L_23094196_23095221 chr3L + chr3L_23093106_23095221;chr3L_23092824_23095221;chr3L_23090858_23095221 chr3L_23090858_23093344,chr3L_23093106_23093344,chr3L_23092824_23093344;chr3L_23093458_23095221 chr3L_23093345_23093457 chr3L_23090727_23090857;chr3L_23095222_23095321 43.18 NA NA NA 28.57 NA 30.14 NA NA 29.41 NA NA 23.81 58.54 NA NA NA 70.83 NA NA 55.56 60.71 56.00 NA 30.00 NA 28.95 NA 61.11 60.00 NA 65.00 NA NA 61.54 64.29 NA NA NA 59.18 55.00 NA 53.33 NA 54.55 65.62 NA NA NA NA NA NA 54.55 61.54 54.76 NA 30.61 76.47 0.0 K cassette beta-Spec chrX + chrX_17561772_17562308 chrX_17561772_17562139;chrX_17562191_17562308 chrX_17562140_17562190 chrX_17561603_17561771;chrX_17562309_17562415 1.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27798276_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27683694_27690853 chr3R_27683694_27690318;chr3R_27690353_27690853 chr3R_27690319_27690352 chr3R_27683601_27683693;chr3R_27690854_27691047 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3554550536000001e-07 K cassette CG15609,I_chr2R_12898038_12898391,C_chr2R_12899322_12900789,I_chr2R_12902708_12903184 chr2R - chr2R_12898041_12898658 chr2R_12898041_12898391;chr2R_12898482_12898658 chr2R_12898392_12898481 chr2R_12897841_12898040;chr2R_12898659_12899053 90.00 NA NA NA NA NA 67.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0427748000000009e-05 K cassette CG13124,I_chr2L_9905292_9905551,I_chr2L_9905292_9905677,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9905084_9905874;chr2L_9905053_9905874 chr2L_9905053_9905137,chr2L_9905084_9905137;chr2L_9905292_9905874 chr2L_9905138_9905291 chr2L_9904827_9905052;chr2L_9905875_9905971 34.78 NA NA 14.14 19.15 NA 13.64 NA NA NA NA NA 22.58 NA NA 18.52 20.00 NA NA 23.81 19.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette MESK2,RI_chr2R_17398771_17398908,I_chr2R_17401067_17401713 chr2R + chr2R_17389985_17397622;chr2R_17389985_17397610;chr2R_17389985_17398371 chr2R_17389985_17394799;chr2R_17395228_17397610,chr2R_17395228_17398371,chr2R_17395228_17397622 chr2R_17394800_17395227 chr2R_17389891_17389984;chr2R_17398372_17398565 88.89 NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.32 NA NA NA NA NA 54.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2345620948798e-09 K cassette betaInt-nu chr2L + chr2L_21053362_21054993 chr2L_21053362_21053457;chr2L_21053645_21054993 chr2L_21053458_21053644 chr2L_21053285_21053361;chr2L_21054994_21055744 66.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Gug,R_chr3L_8444636_8444874,I_chr3L_8455244_8456103 chr3L + chr3L_8443558_8455071 chr3L_8443558_8444874;chr3L_8445229_8455071 chr3L_8444875_8445228 chr3L_8443524_8443557;chr3L_8455072_8455186 91.67 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8992444653512002e-05 K cassette smi35A,E_chr2L_14222082_14233578,E_chr2L_14222082_14233893,RI_chr2L_14233579_14233647 chr2L - chr2L_14222082_14233893;chr2L_14222082_14233578;chr2L_14222082_14233647 chr2L_14222082_14229458;chr2L_14229537_14233893,chr2L_14229537_14233578,chr2L_14229537_14233647 chr2L_14229459_14229536 chr2L_14222060_14222081;chr2L_14233894_14233993 66.97 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047085000000000002 K cassette CG32982,I_chr2L_9127467_9148754,EF_chr2L_9135385_9148841,F_chr2L_9149162_9154658 chr2L + chr2L_9127467_9154658;chr2L_9127467_9148754 chr2L_9127467_9135117;chr2L_9135385_9148754,chr2L_9135385_9154658 chr2L_9135118_9135384 chr2L_9127456_9127466;chr2L_9154659_9154758 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 2.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K cassette CG4266,I_chr2R_17052549_17053657 chr2R - chr2R_17052549_17054234 chr2R_17052549_17053063;chr2R_17053380_17054234 chr2R_17053064_17053379 chr2R_17052449_17052548;chr2R_17054235_17054339 85.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.36 NA NA NA NA 42.07 NA NA NA NA 72.64 NA NA NA NA 69.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG33558,I_chr2R_2813804_2817753,I_chr2R_2814327_2817753,I_chr2R_2816342_2817327,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2816779_2817753;chr2R_2816342_2817753 chr2R_2816342_2817327,chr2R_2816779_2817327;chr2R_2817604_2817753 chr2R_2817328_2817603 chr2R_2816242_2816341;chr2R_2817754_2817762 85.00 NA NA NA 44.00 61.54 NA 58.06 NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA 66.67 70.83 NA NA NA NA NA 71.43 73.33 NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG1674,I_chr4_253475_257020,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_254972_260939;chr4_254972_257894 chr4_254972_257020;chr4_257102_257894,chr4_257102_260939 chr4_257021_257101 chr4_254893_254971;chr4_260940_261024 87.50 NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3589099999999999e-05 K cassette CG12946,noncoding_15730,I_chr3R_5599701_5600032,I_chr3R_5609682_5609889 chr3R - chr3R_5599358_5600041;chr3R_5599358_5600032 chr3R_5599358_5599459;chr3R_5599701_5600032,chr3R_5599701_5600041 chr3R_5599460_5599700 chr3R_5599286_5599357;chr3R_5600042_5600132 75.00 NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6201020725761685e-12 K cassette Chro,RI_chr3L_22871119_22871250,I_chr3L_22871351_22871733 chr3L - chr3L_22871119_22871733 chr3L_22871119_22871250;chr3L_22871351_22871733 chr3L_22871251_22871350 chr3L_22871037_22871118;chr3L_22871734_22871779 22.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031335000000000002 K cassette CG16791 chr3R - chr3R_17149949_17163398 chr3R_17149949_17160248;chr3R_17160491_17163398 chr3R_17160249_17160490 chr3R_17149943_17149948;chr3R_17163399_17163498 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010921 K cassette bl,I_chr2R_16481586_16483061 chr2R + chr2R_16475250_16483061 chr2R_16475250_16477121;chr2R_16477173_16483061 chr2R_16477122_16477172 chr2R_16475071_16475249;chr2R_16483062_16483161 4.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Mical,I_chr3R_5834577_5835458,RI_chr3R_5842549_5844218,I_chr3R_5843939_5844218,I_chr3R_5847106_5863537,I_chr3R_5863483_5863537,I_chr3R_5863613_5868513 chr3R - chr3R_5841649_5844218 chr3R_5841649_5842011;chr3R_5842549_5844218 chr3R_5842012_5842548 chr3R_5841385_5841648;chr3R_5844219_5844280 88.64 NA NA NA 72.73 NA 71.43 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0595003709821526e-15 K cassette shot,I_chr2R_9754481_9757364,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9770053_9788941 chr2R_9770053_9787870;chr2R_9787955_9788941 chr2R_9787871_9787954 chr2R_9769906_9770052;chr2R_9788942_9789041 36.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette th,I_chr3L_16036172_16039584,I_chr3L_16036172_16043557 chr3L - chr3L_16033166_16039584 chr3L_16033166_16037613;chr3L_16037791_16039584 chr3L_16037614_16037790 chr3L_16033066_16033165;chr3L_16039585_16039684 3.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K cassette NFAT,RI_chrX_13543535_13546911,I_chrX_13544101_13544542 chrX + chrX_13544101_13548816 chrX_13544101_13546911;chrX_13547539_13548816 chrX_13546912_13547538 chrX_13544001_13544100;chrX_13548817_13549237 45.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.28 NA 25.58 NA NA NA NA 31.71 33.33 25.49 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette unc-104,I_chr2R_12643956_12644305,RI_chr2R_12650846_12659758 chr2R - chr2R_12641658_12643391 chr2R_12641658_12641747;chr2R_12641775_12643391 chr2R_12641748_12641774 chr2R_12641468_12641657;chr2R_12643392_12643503 35.71 NA NA 100.00 NA NA 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0305960999999997e-05 K cassette rtGEF,I_chr2L_20359856_20360012 chr2L + chr2L_20360813_20364296 chr2L_20360813_20361968;chr2L_20362827_20364296 chr2L_20361969_20362826 chr2L_20360564_20360812;chr2L_20364297_20365220 5.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.78 NA NA NA NA NA NA NA 18.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette pod1 chrX + chrX_6703171_6703517 chrX_6703171_6703406;chrX_6703440_6703517 chrX_6703407_6703439 chrX_6703097_6703170;chrX_6703518_6703690 33.33 NA NA NA 16.33 NA NA NA NA 11.54 NA NA NA NA NA 15.71 100.00 NA NA NA NA 68.75 16.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG32017,RI_chr4_1161994_1164252 chr4 - chr4_1161994_1164252 chr4_1161994_1164074;chr4_1164192_1164252 chr4_1164075_1164191 chr4_1161988_1161993;chr4_1164253_1164352 96.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette scrib,I_chr3R_22406745_22416162,I_chr3R_22416440_22420970,I_chr3R_22425016_22429281 chr3R + chr3R_22416440_22424298 chr3R_22416440_22423368;chr3R_22423846_22424298 chr3R_22423369_22423845 chr3R_22416340_22416439;chr3R_22424299_22424434 55.91 NA NA 44.44 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA 44.44 NA NA 10.00 41.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA 43.33 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA 36.36 42.11 0.0 K cassette Mlf,noncoding_7111,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11825951;chr2R_11825385_11825951;chr2R_11824089_11825951 chr2R_11825385_11825619,chr2R_11824086_11825619,chr2R_11824089_11825619;chr2R_11825773_11825951 chr2R_11825620_11825772 chr2R_11823989_11824085;chr2R_11825952_11826483 1.68 NA NA 12.03 NA NA NA NA NA NA NA NA 13.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette didum,I_chr2R_3393005_3393348 chr2R + chr2R_3390534_3391153 chr2R_3390534_3390676;chr2R_3390701_3391153 chr2R_3390677_3390700 chr2R_3390307_3390533;chr2R_3391154_3391267 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00127988563 N cassette RhoGAP18B chrX - chrX_19040176_19047060 chrX_19040176_19044843;chrX_19045993_19047060 chrX_19044844_19045992 chrX_19040076_19040175;chrX_19047061_19047301 100.00 NA NA NA NA NA NA 88.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.10 NA 2.5999999999999997e-23 K cassette nmo,I_chr3L_8010749_8032974 chr3L + chr3L_8040701_8042968 chr3L_8040701_8041169;chr3L_8041544_8042968 chr3L_8041170_8041543 chr3L_8040607_8040700;chr3L_8042969_8043978 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0017756660099999999 K cassette RI_chrX_7172561_7252693,CG1677,I_chrX_7178792_7252693,RI_chrX_7179818_7179946 chrX - chrX_7178792_7179946 chrX_7178792_7179393;chrX_7179882_7179946 chrX_7179394_7179881 chrX_7178692_7178791;chrX_7179947_7180046 11.90 NA NA 26.67 NA NA NA 24.14 NA NA NA NA NA 28.57 NA 22.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 23.53 22.22 NA NA 23.08 NA NA NA 22.22 30.43 NA NA NA NA NA NA 38.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.12 2.6922783223736027e-31 K cassette CG12065,CE_chrX_8469528_8477573 chrX + chrX_8480279_8481290 chrX_8480279_8480584;chrX_8480642_8481290 chrX_8480585_8480641 chrX_8480019_8480278;chrX_8481291_8481558 3.04 NA NA 14.92 NA NA NA NA NA NA NA 19.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Nedd4,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17535485_17536604,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17535485_17536604 chr3L_17535485_17535689;chr3L_17535913_17536604 chr3L_17535690_17535912 chr3L_17535417_17535484;chr3L_17536605_17536704 74.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000274701888 K cassette spz chr3R - chr3R_22892607_22894865;chr3R_22892388_22894865;chr3R_22892388_22893079 chr3R_22892607_22892843,chr3R_22892388_22892843;chr3R_22892922_22893079,chr3R_22892922_22894865 chr3R_22892844_22892921 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22894866_22895053 44.31 NA 58.86 NA NA NA 26.42 NA NA 30.53 64.00 NA 63.35 NA NA 54.37 NA NA NA 59.53 54.81 NA NA NA NA NA NA NA 23.60 NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA 28.05 NA NA NA NA NA NA NA 27.60 NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16059930_16063219 chr3L_16059930_16061212;chr3L_16062044_16063219 chr3L_16061213_16062043 chr3L_16059713_16059929;chr3L_16063220_16063364 64.33 NA 54.29 81.19 NA NA 48.72 38.14 NA 44.00 44.86 NA 36.46 NA NA NA NA 51.06 NA 50.27 47.52 47.49 NA NA NA 51.02 NA 47.33 NA NA 78.07 NA NA NA NA NA NA NA NA 52.11 NA NA NA NA 47.20 NA NA NA NA NA NA NA 76.26 NA NA NA NA 75.56 0.0 K cassette CG6206,I_chr2L_10459281_10459879,I_chr2L_10459518_10459620,I_chr2L_10459518_10459661 chr2L + chr2L_10459281_10459879;chr2L_10459518_10459879 chr2L_10459518_10459661,chr2L_10459281_10459661;chr2L_10459796_10459879 chr2L_10459662_10459795 chr2L_10459181_10459280;chr2L_10459880_10459979 3.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021763999999999999 K cassette CG10103,noncoding_10997 chr3L - chr3L_6747908_6748519;chr3L_6747594_6748519 chr3L_6747594_6748172,chr3L_6747908_6748172;chr3L_6748224_6748519 chr3L_6748173_6748223 chr3L_6747493_6747593;chr3L_6748520_6749258 34.29 NA NA NA NA NA 22.88 NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.16 NA NA NA NA NA NA 20.34 NA NA NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG18854,RI_chr2L_9789598_9789790,I_chr2L_9789694_9789790,REI_chr2L_9789718_9789790,I_chr2L_9790307_9790615,I_chr2L_9790310_9790556 chr2L - chr2L_9789616_9789790 chr2L_9789616_9789674;chr2L_9789751_9789790 chr2L_9789675_9789750 chr2L_9789594_9789615;chr2L_9789791_9789832 22.88 NA NA 38.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.14 NA NA 11.30 NA NA 11.57 NA NA NA NA NA NA 7.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Cct1,Cct2 chr3L + chr3L_1546307_1550713 chr3L_1546307_1546598;chr3L_1546677_1550713 chr3L_1546599_1546676 chr3L_1546118_1546306;chr3L_1550714_1551288 11.93 NA NA NA NA NA NA NA NA 24.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0724349999999999e-06 K cassette cp309,I_chr3L_15074145_15074432 chr3L - chr3L_15066295_15067783;chr3L_15066295_15067424 chr3L_15066295_15066406;chr3L_15066431_15067783,chr3L_15066431_15067424 chr3L_15066407_15066430 chr3L_15066244_15066294;chr3L_15067784_15068947 75.00 55.56 NA NA NA NA 43.75 NA 57.14 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4861451284905823e-18 K cassette l(1)G0196,RI_chrX_21900456_21904036,I_chrX_21900456_21904601 chrX + chrX_21900456_21904471 chrX_21900456_21904030;chrX_21904142_21904471 chrX_21904031_21904141 chrX_21900356_21900455;chrX_21904472_21904538 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 0.000309513468 K cassette CG2519 chr3R - chr3R_1370791_1371914 chr3R_1370791_1371392;chr3R_1371465_1371914 chr3R_1371393_1371464 chr3R_1370469_1370790;chr3R_1371915_1372122 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.032231e-05 K cassette bip2,RI_chr4_481674_487126,RI_chr4_483128_487126,RI_chr4_483144_483680,RI_chr4_486609_487126 chr4 - chr4_483128_487126 chr4_483128_483680;chr4_485367_487126 chr4_483681_485366 chr4_483044_483127;chr4_487127_487226 90.00 NA NA 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA 79.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette noncoding_23420,hep chrX - chrX_12977132_12979628 chrX_12977132_12978277;chrX_12978604_12979628 chrX_12978278_12978603 chrX_12976641_12977131;chrX_12979629_12979784 73.08 NA NA 91.84 NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA 88.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4331718569318984e-10 K cassette caz,noncoding_24110,RI_chrX_16183147_16183258,RI_chrX_16183356_16185973 chrX + chrX_16182991_16183258 chrX_16182991_16183059;chrX_16183147_16183258 chrX_16183060_16183146 chrX_16182887_16182990;chrX_16183259_16183355 75.00 NA NA 88.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.11 NA NA NA NA 86.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.45 NA NA 85.96 NA NA NA NA NA 91.94 NA NA 85.71 NA NA 0.0 K cassette Reps,I_chr2L_11105525_11105656 chr2L - chr2L_11103170_11103843 chr2L_11103170_11103322;chr2L_11103410_11103843 chr2L_11103323_11103409 chr2L_11100956_11103169;chr2L_11103844_11104280 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1074200000000001e-07 K cassette Rala chrX - chrX_3600285_3602776 chrX_3600285_3601400;chrX_3601525_3602776 chrX_3601401_3601524 chrX_3599901_3600284;chrX_3602777_3602951 67.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.29 NA NA NA NA NA 2.4699440721795837e-09 K cassette shot,I_chr2R_9754481_9757364,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9758844_9759483 chr2R_9758844_9759170;chr2R_9759231_9759483 chr2R_9759171_9759230 chr2R_9758799_9758843;chr2R_9759484_9759658 84.17 NA NA NA 66.36 69.72 45.00 NA NA NA 54.84 NA NA NA NA NA 96.36 NA NA NA 68.27 96.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.44 0.0 K cassette HDAC4,F_chrX_13159070_13159174,I_chrX_13170581_13179235,I_chrX_13178996_13179235 chrX - chrX_13165623_13176198 chrX_13165623_13170467;chrX_13170581_13176198 chrX_13170468_13170580 chrX_13165515_13165622;chrX_13176199_13176262 93.52 NA NA 81.48 NA NA 76.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.33 81.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette ena chr2R + chr2R_15029860_15046238 chr2R_15029860_15039409;chr2R_15039533_15046238 chr2R_15039410_15039532 chr2R_15029730_15029859;chr2R_15046239_15046560 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00024800000000000001 K cassette CtBP chr3R + chr3R_8847365_8851110 chr3R_8847365_8850545;chr3R_8850767_8851110 chr3R_8850546_8850766 chr3R_8847142_8847364;chr3R_8851111_8851987 37.14 NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010364999999999999 K cassette Vrp1,I_chr2R_17996482_17997091,I_chr2R_17996511_17997091,I_chr2R_17997529_17997692 chr2R - chr2R_17996286_17997091 chr2R_17996286_17996355;chr2R_17996485_17997091 chr2R_17996356_17996484 chr2R_17995991_17996285;chr2R_17997092_17997191 7.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.78 NA NA NA NA NA NA 40.98 NA NA 17.50 34.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG6838,I_chr3L_22709306_22709668 chr3L - chr3L_22709303_22709668;chr3L_22709306_22709668 chr3L_22709303_22709397,chr3L_22709306_22709397;chr3L_22709515_22709668 chr3L_22709398_22709514 chr3L_22709206_22709302;chr3L_22709669_22709768 96.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000231 K cassette sba,I_chr3R_19721149_19722571 chr3R - chr3R_19721220_19722784 chr3R_19721220_19721930;chr3R_19722331_19722784 chr3R_19721931_19722330 chr3R_19720204_19721219;chr3R_19722785_19722913 91.67 NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000319 K cassette Sdc,I_chr2R_17282542_17285569,RI_chr2R_17286086_17286391,I_chr2R_17286089_17286391,I_chr2R_17286819_17367595,I_chr2R_17324594_17367595 chr2R - chr2R_17282551_17286679;chr2R_17282551_17286391 chr2R_17282551_17285569;chr2R_17286089_17286679,chr2R_17286089_17286391 chr2R_17285570_17286088 chr2R_17282383_17282550;chr2R_17286680_17286818 83.42 NA NA 93.68 NA NA NA NA NA NA 68.75 NA 48.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.27 NA NA NA 93.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette E_chr3R_6935653_7037028,nocturnin,I_chr3R_7023571_7030286,RI_chr3R_7026291_7032627,I_chr3R_7029508_7030286 chr3R + chr3R_7029508_7032627;chr3R_7026291_7032627;chr3R_7023571_7032627 chr3R_7026291_7030286,chr3R_7023571_7030286,chr3R_7029508_7030286;chr3R_7030554_7032627 chr3R_7030287_7030553 chr3R_7023471_7023570;chr3R_7032628_7032727 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA 64.29 NA NA NA NA 6.1353056988451515e-10 K cassette crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11797742_11798664 chr2L_11797742_11797828;chr2L_11798042_11798664 chr2L_11797829_11798041 chr2L_11797682_11797741;chr2L_11798665_11799010 93.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Ten-m,EI_chr3L_22298865_22299141,I_chr3L_22374182_22399991 chr3L - chr3L_22297630_22300646 chr3L_22297630_22298066;chr3L_22298865_22300646 chr3L_22298067_22298864 chr3L_22297346_22297629;chr3L_22300647_22300652 72.08 NA NA NA NA 57.89 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA 40.00 NA 48.39 NA NA 54.84 NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 6.1600620850690546e-31 K cassette CLIP-190,I_chr2L_17385896_17394432,RI_chr2L_17386394_17394432,I_chr2L_17394493_17404060,I_chr2L_17401291_17404060,I_chr2L_17401582_17402303 chr2L + chr2L_17385896_17400395;chr2L_17389531_17400395;chr2L_17386394_17400395 chr2L_17386394_17394429,chr2L_17389531_17394429,chr2L_17385896_17394429;chr2L_17394493_17400395 chr2L_17394430_17394492 chr2L_17385796_17385895;chr2L_17400396_17400464 96.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012337000000000001 N cassette brat,I_chr2L_19134277_19143634,EI_chr2L_19145845_19145958,RI_chr2L_19145845_19146761 chr2L + chr2L_19134277_19166084 chr2L_19134277_19145793;chr2L_19145845_19166084 chr2L_19145794_19145844 chr2L_19134177_19134276;chr2L_19166085_19166125 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028886999999999999 K cassette RhoGAPp190,I_chrX_17544272_17544863,I_chrX_17546225_17546531 chrX - chrX_17537281_17540552 chrX_17537281_17537713;chrX_17538212_17540552 chrX_17537714_17538211 chrX_17537059_17537280;chrX_17540553_17540618 74.07 NA NA 44.07 NA NA 61.70 62.07 NA NA 51.43 60.24 42.11 56.52 62.00 NA 59.46 NA 38.24 NA 52.38 NA NA NA NA 55.81 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette sda,I_chr3R_22742285_22742350,RI_chr3R_22750984_22752737 chr3R + chr3R_22752154_22764166;chr3R_22750984_22764166 chr3R_22752154_22761680,chr3R_22750984_22761680;chr3R_22762014_22764166 chr3R_22761681_22762013 chr3R_22750884_22750983;chr3R_22764167_22764353 13.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.96 NA NA NA NA NA 39.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.4284000000000006e-07 K cassette sli,RI_chr2R_11794739_11809143 chr2R - chr2R_11772994_11773603 chr2R_11772994_11773089;chr2R_11773162_11773603 chr2R_11773090_11773161 chr2R_11772856_11772993;chr2R_11773604_11773675 91.30 NA NA NA NA NA 65.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00085499999999999997 K cassette CG34123,RI_chr2R_11160894_11162043,I_chr2R_11167854_11168411 chr2R - chr2R_11168549_11169910 chr2R_11168549_11168723;chr2R_11168884_11169910 chr2R_11168724_11168883 chr2R_11168412_11168548;chr2R_11169911_11169983 91.67 NA NA 39.13 NA NA 75.00 NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Su(z)12 chr3L - chr3L_19912391_19913253 chr3L_19912391_19912458;chr3L_19912621_19913253 chr3L_19912459_19912620 chr3L_19911385_19912390;chr3L_19913254_19914086 53.70 NA NA 9.30 NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette 14-3-3zeta,I_chr2R_5993610_5993957,I_chr2R_5993331_5994971 chr2R + chr2R_5993331_5994971 chr2R_5993331_5994138;chr2R_5994303_5994971 chr2R_5994139_5994302 chr2R_5993231_5993330;chr2R_5994972_5995071 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0024130000000000002 K cassette Ctr1A,I_chrX_6558480_6559032 chrX + chrX_6559720_6560882 chrX_6559720_6560272;chrX_6560303_6560882 chrX_6560273_6560302 chrX_6559472_6559719;chrX_6560883_6561458 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K cassette mthl10 chr3L - chr3L_333717_334974;chr3L_333641_334974 chr3L_333641_333941,chr3L_333717_333941;chr3L_334120_334974 chr3L_333942_334119 chr3L_333522_333640;chr3L_334975_335169 96.15 NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.97 NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2142235303999999e-19 K cassette sw chrX - chrX_20101692_20104496;chrX_20101668_20104496;chrX_20101671_20105848;chrX_20101671_20104496 chrX_20101671_20103190,chrX_20101692_20103190,chrX_20101668_20103190;chrX_20103239_20104496,chrX_20103239_20105848 chrX_20103191_20103238 chrX_20101619_20101667;chrX_20105849_20105976 26.09 NA NA 38.46 NA 36.36 NA NA NA 56.25 NA NA 14.29 NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA 10.71 NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 0.0 K cassette CG42595,I_chr2RHet_3155517_3174709,RI_chr2RHet_3175044_3179353,RI_chr2RHet_3179300_3179586,I_chr2RHet_3179481_3179586 chr2RHet - chr2RHet_3179300_3179586;chr2RHet_3175044_3179586 chr2RHet_3179300_3179353,chr2RHet_3175044_3179353;chr2RHet_3179481_3179586 chr2RHet_3179354_3179480 chr2RHet_3174944_3175043;chr2RHet_3179587_3179598 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 55.56 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 1.7662305739493377e-07 K cassette CG11870,I_chr3R_6124314_6124732 chr3R + chr3R_6124314_6125355 chr3R_6124314_6124723;chr3R_6124781_6125355 chr3R_6124724_6124780 chr3R_6124214_6124313;chr3R_6125356_6125474 4.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035570999999999998 K cassette Fur1,I_chr3R_21179590_21179870,CEI_chr3R_21210600_21222433,RI_chr3R_21257704_21264109,I_chr3R_21257704_21287086 chr3R - chr3R_21243687_21298203 chr3R_21243687_21257638;chr3R_21257704_21298203 chr3R_21257639_21257703 chr3R_21243660_21243686;chr3R_21298204_21298210 100.00 NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0097599999999999996 K cassette Dap160,I_chr2L_21139943_21140007 chr2L - chr2L_21138031_21138711 chr2L_21138031_21138112;chr2L_21138359_21138711 chr2L_21138113_21138358 chr2L_21137757_21138030;chr2L_21138712_21139602 84.81 NA NA 55.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 97.73 NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.3922897100799993e-07 N cassette CG9153,Myo61F chr3L + chr3L_1314321_1314885 chr3L_1314321_1314472;chr3L_1314710_1314885 chr3L_1314473_1314709 chr3L_1314158_1314320;chr3L_1314886_1315612 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7e-05 N cassette htt,I_chr3R_24527763_24528033,I_chr3R_24542203_24543363 chr3R + chr3R_24547720_24550721 chr3R_24547720_24549542;chr3R_24549792_24550721 chr3R_24549543_24549791 chr3R_24547532_24547719;chr3R_24550722_24551085 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0061409999999999998 K cassette CG6995 chr3R + chr3R_20644572_20646818 chr3R_20644572_20645450;chr3R_20646490_20646818 chr3R_20645451_20646489 chr3R_20644527_20644571;chr3R_20646819_20646968 97.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3000000000000003e-05 K cassette Pkn,CI_chr2R_5143544_5146344,E_chr2R_5159680_5162493,I_chr2R_5159680_5171332,I_chr2R_5171635_5172166 chr2R - chr2R_5155482_5171332 chr2R_5155482_5159489;chr2R_5159680_5171332 chr2R_5159490_5159679 chr2R_5155160_5155481;chr2R_5171333_5171432 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG11155,I_chr4_1151213_1151903,I_chr4_1152220_1152710,I_chr4_1152585_1152687 chr4 + chr4_1152585_1154500 chr4_1152585_1152710;chr4_1153200_1154500 chr4_1152711_1153199 chr4_1152485_1152584;chr4_1154501_1154522 70.09 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3995418521470005e-05 K cassette Ndae1,I_chr2L_7234342_7234526 chr2L - chr2L_7234998_7237686 chr2L_7234998_7236144;chr2L_7236352_7237686 chr2L_7236145_7236351 chr2L_7234527_7234997;chr2L_7237687_7237790 28.57 NA NA 10.59 NA NA 10.17 NA NA 55.56 NA NA 4.55 NA NA NA NA NA NA NA 11.43 NA NA NA NA NA NA 47.27 NA NA NA NA 48.65 NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA 48.89 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 69.77 0.0 K cassette tai,I_chr2L_9191814_9206231 chr2L + chr2L_9243901_9245385 chr2L_9243901_9244262;chr2L_9244587_9245385 chr2L_9244263_9244586 chr2L_9243648_9243900;chr2L_9245386_9245712 24.72 NA 41.38 NA NA NA NA 5.17 NA NA NA NA 8.57 NA NA NA 44.44 NA NA 9.60 NA NA 37.24 NA NA NA NA NA NA NA NA 39.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG32809,CEI_chrX_1578779_1579219,I_chrX_1579313_1579679,CEI_chrX_1579569_1579679,RI_chrX_1585391_1586471,I_chrX_1589508_1589564 chrX - chrX_1578779_1579679 chrX_1578779_1579219;chrX_1579569_1579679 chrX_1579220_1579568 chrX_1578679_1578778;chrX_1579680_1579763 72.73 58.82 NA NA 60.00 NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA 60.00 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA 48.15 60.00 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 1.3249514368961487e-23 K cassette CG8176,I_chr3R_5348614_5348964 chr3R + chr3R_5348614_5349923 chr3R_5348614_5349257;chr3R_5349519_5349923 chr3R_5349258_5349518 chr3R_5348514_5348613;chr3R_5349924_5350029 33.33 NA NA NA NA NA NA 22.04 NA NA NA 21.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.21 NA 45.74 NA NA NA 55.56 NA NA NA NA 54.76 NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA 56.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.5600734085489839e-27 K cassette wls chr3L - chr3L_11160709_11161236 chr3L_11160709_11160918;chr3L_11161015_11161236 chr3L_11160919_11161014 chr3L_11159717_11160708;chr3L_11161237_11162713 6.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018040343400000001 K cassette mib2 chr2L + chr2L_19035866_19038084 chr2L_19035866_19037803;chr2L_19037972_19038084 chr2L_19037804_19037971 chr2L_19035761_19035865;chr2L_19038085_19038754 98.89 NA NA 79.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K cassette CG13900,I_chr3L_830745_830907 chr3L - chr3L_830342_830907 chr3L_830342_830621;chr3L_830729_830907 chr3L_830622_830728 chr3L_830034_830341;chr3L_830908_831007 15.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.55 NA NA NA NA 36.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Rala,noncoding_21767 chrX - chrX_3604282_3613395 chrX_3604282_3610504;chrX_3610701_3613395 chrX_3610505_3610700 chrX_3604102_3604281;chrX_3613396_3613464 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.43 NA NA NA NA NA 31.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0984641320770576e-07 K cassette inaE chrX + chrX_13695807_13696099 chrX_13695807_13695934;chrX_13696042_13696099 chrX_13695935_13696041 chrX_13695777_13695806;chrX_13696100_13696204 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00097099999999999997 K cassette Slip1,RI_chr4_684967_689045,I_chr4_685717_686576,RI_chr4_685717_689045,RI_chr4_687548_689045 chr4 + chr4_687559_689755 chr4_687559_689045;chr4_689201_689755 chr4_689046_689200 chr4_686581_687558;chr4_689756_690313 71.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.61 NA NA NA 54.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.00 60.53 NA 60.00 60.78 46.15 NA NA NA 55.56 NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.8004895855055184e-23 N cassette CG7207 chr3L - chr3L_8281321_8282812 chr3L_8281321_8282269;chr3L_8282584_8282812 chr3L_8282270_8282583 chr3L_8280928_8281320;chr3L_8282813_8282969 100.00 NA NA 65.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette PhKgamma,I_chrX_11590183_11590435,I_chrX_11596563_11597322 chrX + chrX_11592631_11597322;chrX_11593440_11597322 chrX_11592631_11594653,chrX_11593440_11594653;chrX_11595161_11597322 chrX_11594654_11595160 chrX_11592533_11592630;chrX_11597323_11597422 84.38 NA NA NA 70.97 NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.15 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG6912 chr3R - chr3R_10962115_10962431 chr3R_10962115_10962204;chr3R_10962254_10962431 chr3R_10962205_10962253 chr3R_10962052_10962114;chr3R_10962432_10962439 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette rump,I_chr3R_5338175_5338299 chr3R - chr3R_5333109_5335157 chr3R_5333109_5334012;chr3R_5334152_5335157 chr3R_5334013_5334151 chr3R_5331980_5333108;chr3R_5335158_5335257 79.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA 97.17 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA 67.82 47.32 68.85 62.04 60.00 NA NA NA 56.10 66.67 NA 62.93 69.16 67.72 NA 98.81 59.48 57.69 61.36 NA 54.02 NA NA NA NA NA 64.89 NA NA NA 68.51 0.0 K cassette E_chr2RHet_2881760_2912543,eIF-4B,I_chr2RHet_2903246_2912532,I_chr2RHet_2904787_2912543,I_chr2RHet_2912605_2917250 chr2RHet + chr2RHet_2903246_2915424 chr2RHet_2903246_2912543;chr2RHet_2912605_2915424 chr2RHet_2912544_2912604 chr2RHet_2903146_2903245;chr2RHet_2915425_2915456 84.25 NA NA 68.32 NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6336702587200012e-06 K cassette Nup153,I_chrX_16495232_16495296 chrX + chrX_16500042_16501965 chrX_16500042_16500894;chrX_16501033_16501965 chrX_16500895_16501032 chrX_16499883_16500041;chrX_16501966_16502033 96.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048682999999999997 N cassette Nhe2,I_chr2L_21122390_21122912 chr2L + chr2L_21128063_21131230;chr2L_21128063_21132033 chr2L_21128063_21128778;chr2L_21129083_21132033,chr2L_21129083_21131230 chr2L_21128779_21129082 chr2L_21127850_21128062;chr2L_21132034_21132685 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040901 K cassette msn,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586265,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2579521_2586402 chr3L_2579521_2585604;chr3L_2585716_2586402 chr3L_2585605_2585715 chr3L_2579455_2579520;chr3L_2586403_2586502 97.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000102 K cassette Bruce chr3R - chr3R_6146553_6147186 chr3R_6146553_6146876;chr3R_6146949_6147186 chr3R_6146877_6146948 chr3R_6145768_6146552;chr3R_6147187_6147304 30.43 NA NA 11.76 NA NA 9.52 NA NA NA NA NA NA NA NA 49.32 NA NA NA NA NA 69.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7607101184000003e-14 K cassette B4,I_chr2L_13513474_13549131,I_chr2L_13547133_13549131,I_chr2L_13547162_13547692,I_chr2L_13547304_13549131 chr2L - chr2L_13535027_13549131 chr2L_13535027_13546910;chr2L_13547162_13549131 chr2L_13546911_13547161 chr2L_13534907_13535026;chr2L_13549132_13549231 82.14 NA NA NA NA NA 92.31 NA NA NA NA 93.10 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3207934174986739e-12 K cassette Tif-IA,RI_chr2L_22250854_22257652 chr2L + chr2L_22250854_22257652 chr2L_22250854_22253745;chr2L_22253922_22257652 chr2L_22253746_22253921 chr2L_22250754_22250853;chr2L_22257653_22257752 96.39 NA NA 71.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.53 NA NA 74.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Kdm4B chr2R - chr2R_9075414_9085717 chr2R_9075414_9085181;chr2R_9085665_9085717 chr2R_9085182_9085664 chr2R_9075201_9075413;chr2R_9085718_9085796 89.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 7.1662874185249188e-10 K cassette Doa,I_chr3R_24715823_24718923,I_chr3R_24747391_24747896 chr3R + chr3R_24715823_24726545 chr3R_24715823_24718923;chr3R_24720785_24726545 chr3R_24718924_24720784 chr3R_24715727_24715822;chr3R_24726546_24726744 34.46 NA NA NA NA NA 53.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 23.27 NA NA NA NA NA NA 22.64 NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA 23.46 NA 45.16 NA NA NA NA NA 14.50 0.0 K cassette CG8486,I_chr2L_8182451_8183191 chr2L + chr2L_8180030_8182304 chr2L_8180030_8181983;chr2L_8182050_8182304 chr2L_8181984_8182049 chr2L_8179872_8180029;chr2L_8182305_8182450 94.23 NA NA NA NA NA 65.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 73.91 NA NA NA NA NA NA 46.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CLIP-190,I_chr2L_17394493_17404060,I_chr2L_17401291_17404060,I_chr2L_17401582_17402303 chr2L + chr2L_17401582_17404729;chr2L_17401582_17404060;chr2L_17401291_17404060 chr2L_17401582_17402374,chr2L_17401291_17402374;chr2L_17402486_17404060,chr2L_17402486_17404729 chr2L_17402375_17402485 chr2L_17401191_17401290;chr2L_17404730_17404840 100.00 NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011599999999999999 K cassette CG32000,I_chr4_154340_157504,I_chr4_154551_155461,I_chr4_157794_157864 chr4 + chr4_157794_158016 chr4_157794_157864;chr4_157959_158016 chr4_157865_157958 chr4_157699_157793;chr4_158017_158243 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01883 K cassette SPoCk,I_chr3L_22776339_22776519,I_chr3L_22777865_22778359 chr3L + chr3L_22766817_22770210 chr3L_22766817_22768074;chr3L_22768238_22770210 chr3L_22768075_22768237 chr3L_22766783_22766816;chr3L_22770211_22771924 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.62 NA NA NA NA NA NA NA 84.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1622,I_chrX_13191916_13192167,I_chrX_13192409_13192738,EI_chrX_13192857_13192928 chrX + chrX_13191916_13192738 chrX_13191916_13192167;chrX_13192221_13192738 chrX_13192168_13192220 chrX_13191816_13191915;chrX_13192739_13192838 2.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1718 chrX - chrX_21169962_21171177 chrX_21169962_21170570;chrX_21170637_21171177 chrX_21170571_21170636 chrX_21169373_21169961;chrX_21171178_21171339 80.00 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.022525 K cassette CG42270,I_chrX_17615384_17615455,I_chrX_17639729_17640603 chrX + chrX_17615649_17640603 chrX_17615649_17630230;chrX_17630303_17640603 chrX_17630231_17630302 chrX_17615456_17615648;chrX_17640604_17640703 2.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.48 12.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette lap,I_chr3R_3017854_3019314 chr3R + chr3R_3016519_3017110 chr3R_3016519_3016853;chr3R_3016887_3017110 chr3R_3016854_3016886 chr3R_3016443_3016518;chr3R_3017111_3017213 96.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029172 K cassette Syb chr2R - chr2R_6137333_6138383 chr2R_6137333_6137873;chr2R_6138092_6138383 chr2R_6137874_6138091 chr2R_6137005_6137332;chr2R_6138384_6138649 6.03 NA NA 34.58 NA NA NA NA NA NA 26.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette spen,I_chr2L_187184_187481,I_chr2L_200676_200752 chr2L + chr2L_163002_183760 chr2L_163002_175360;chr2L_175448_183760 chr2L_175361_175447 chr2L_162988_163001;chr2L_183761_185082 70.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036456000000000002 K cassette Pfk,I_chr2R_5999081_6000140,E_chr2R_6001157_6001630 chr2R + chr2R_6000676_6002421;chr2R_6001157_6002421 chr2R_6000676_6001630,chr2R_6001157_6001630;chr2R_6001740_6002421 chr2R_6001631_6001739 chr2R_6000521_6000675;chr2R_6002422_6002610 32.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA 9.89 NA NA NA NA NA 19.23 15.00 NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Rph,I_chrX_10644396_10644958,I_chrX_10646283_10647245,I_chrX_10647710_10648325,RI_chrX_10649048_10651427 chrX - chrX_10645816_10647245 chrX_10645816_10645935;chrX_10646283_10647245 chrX_10645936_10646282 chrX_10644959_10645815;chrX_10647246_10647345 24.00 NA NA 52.38 NA NA NA 50.00 NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9285745348250717e-09 K cassette step,F_chr2L_21743072_21746336,I_chr2L_21743972_21757163,RI_chr2L_21747333_21756553 chr2L - chr2L_21743972_21753218;chr2L_21743972_21756553 chr2L_21743972_21746151;chr2L_21747333_21756553,chr2L_21747333_21753218 chr2L_21746152_21747332 chr2L_21743872_21743971;chr2L_21756554_21756559 73.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.27 NA NA NA NA NA NA 85.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.72 NA NA NA 86.15 NA NA 85.35 NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 83.33 9.1893681295415996e-28 K cassette CG17549,I_chr2L_19387937_19387993,I_chr2L_19388570_19389922 chr2L - chr2L_19387770_19388039 chr2L_19387770_19387861;chr2L_19387937_19388039 chr2L_19387862_19387936 chr2L_19387538_19387769;chr2L_19388040_19388093 76.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 56.76 52.63 NA 62.50 NA 61.29 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.40 0.0 K cassette Sec16,I_chrX_12501913_12502010,I_chrX_12502899_12502973 chrX + chrX_12494475_12497042 chrX_12494475_12495615;chrX_12495931_12497042 chrX_12495616_12495930 chrX_12491379_12494474;chrX_12497043_12497499 1.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9336950000000001e-05 K cassette tan,R_chr3L_6048520_6048578,R_chr3L_6048608_6048676 chr3L + chr3L_6048520_6048816 chr3L_6048520_6048676;chr3L_6048764_6048816 chr3L_6048677_6048763 chr3L_6048508_6048519;chr3L_6048817_6048925 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039272000000000001 K cassette CREF_chr3R_5589662_5589762,CG8481 chr3R + chr3R_5593863_5594644;chr3R_5594297_5594644 chr3R_5594297_5594466,chr3R_5593863_5594466;chr3R_5594561_5594644 chr3R_5594467_5594560 chr3R_5593583_5593862;chr3R_5594645_5594706 12.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00058799999999999998 K cassette CG1399,I_chr2R_3574133_3574191 chr2R - chr2R_3571806_3572478 chr2R_3571806_3572226;chr2R_3572269_3572478 chr2R_3572227_3572268 chr2R_3571618_3571805;chr2R_3572479_3572576 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046079000000000002 N cassette Dscam,F_chr2R_3219886_3228832,F_chr2R_3226043_3235353,F_chr2R_3227948_3235353,F_chr2R_3228738_3235353,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3219886_3235353 chr2R_3219886_3231783;chr2R_3232075_3235353 chr2R_3231784_3232074 chr2R_3219786_3219885;chr2R_3235354_3235453 100.00 56.25 58.82 40.00 NA NA 61.90 53.57 NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA 60.00 46.15 NA NA 0.0 N cassette Slip1,RI_chr4_684967_689045,I_chr4_685717_686576,RI_chr4_685717_689045,RI_chr4_687548_689045 chr4 + chr4_685932_686576 chr4_685932_686085;chr4_686263_686576 chr4_686086_686262 chr4_685883_685931;chr4_686577_686676 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette DppIII,CG7352 chr3R + chr3R_4170206_4170814 chr3R_4170206_4170530;chr3R_4170746_4170814 chr3R_4170531_4170745 chr3R_4170198_4170205;chr3R_4170815_4171121 45.74 NA 30.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.62 NA NA NA NA NA NA 65.66 NA NA NA NA NA 15.79 67.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette wdb,I_chr3R_23394314_23406731,I_chr3R_23394314_23406794,I_chr3R_23394314_23407159,RI_chr3R_23394314_23407186,I_chr3R_23394314_23407412,I_chr3R_23394314_23407715,I_chr3R_23394314_23407721,RI_chr3R_23406048_23406731,RI_chr3R_23406048_23406794,I_chr3R_23406048_23406928,RI_chr3R_23406048_23407402 chr3R - chr3R_23394314_23406865;chr3R_23394314_23407402;chr3R_23394314_23406928;chr3R_23394314_23407723 chr3R_23394314_23405878;chr3R_23406048_23407402,chr3R_23406048_23406928,chr3R_23406048_23407723,chr3R_23406048_23406865 chr3R_23405879_23406047 chr3R_23394214_23394313;chr3R_23407724_23407815 13.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0034840000000000001 K cassette alph,I_chr3R_25417890_25422962 chr3R + chr3R_25423196_25423885 chr3R_25423196_25423497;chr3R_25423631_25423885 chr3R_25423498_25423630 chr3R_25423141_25423195;chr3R_25423886_25424323 46.41 NA NA 35.98 27.27 28.28 31.89 NA NA NA NA 61.95 79.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA 34.55 NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA 32.41 NA NA 35.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 30.84 NA NA NA NA NA 0.0 K cassette shot,I_chr2R_9754481_9757364,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9758202_9758798 chr2R_9758202_9758344;chr2R_9758417_9758798 chr2R_9758345_9758416 chr2R_9758027_9758201;chr2R_9758799_9758843 98.83 NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Zn72D,RF_chr3L_16100887_16102721,I_chr3L_16105199_16105253 chr3L - chr3L_16100887_16102721 chr3L_16100887_16101951;chr3L_16102155_16102721 chr3L_16101952_16102154 chr3L_16100787_16100886;chr3L_16102722_16102821 35.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.81 NA NA NA NA NA NA NA NA 57.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1354000000000001e-07 N cassette CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1525393_1526333;chr3L_1525393_1527189 chr3L_1525393_1525641;chr3L_1525704_1527189,chr3L_1525704_1526333 chr3L_1525642_1525703 chr3L_1525293_1525392;chr3L_1527190_1527240 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 32.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 50.00 22.22 NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA 0.0 K cassette f-cup,RI_chr3R_9522069_9522165,I_chr3R_9524004_9524059,EI_chr3R_9524613_9524789 chr3R - chr3R_9522069_9522548 chr3R_9522069_9522163;chr3R_9522491_9522548 chr3R_9522164_9522490 chr3R_9521969_9522068;chr3R_9522549_9522949 0.00 NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2424999999999999e-08 K cassette lilli chr2L + chr2L_2890917_2946708 chr2L_2890917_2945029;chr2L_2945793_2946708 chr2L_2945030_2945792 chr2L_2890451_2890916;chr2L_2946709_2947435 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1968149999999996e-06 K cassette unk,I_chr3R_18980963_18981530 chr3R - chr3R_18980963_18981530 chr3R_18980963_18981161;chr3R_18981272_18981530 chr3R_18981162_18981271 chr3R_18980935_18980962;chr3R_18981531_18981630 100.00 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018159999999999999 K cassette Akap200,I_chr2L_8426446_8426873 chr2L + chr2L_8428068_8430280 chr2L_8428068_8428319;chr2L_8429463_8430280 chr2L_8428320_8429462 chr2L_8427615_8428067;chr2L_8430281_8431026 21.64 NA 33.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.02 NA NA NA NA 31.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.82 NA NA 48.25 NA 10.78 NA NA NA NA NA NA NA 52.81 0.0 N cassette tacc,I_chr3R_570388_572101,I_chr3R_574271_574512 chr3R - chr3R_569905_574512 chr3R_569905_570185;chr3R_570388_574512 chr3R_570186_570387 chr3R_569435_569904;chr3R_574513_574612 100.00 NA NA 86.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012201999999999999 K cassette CG10069,I_chr2R_17169897_17170495,I_chr2R_17170432_17170491,I_chr2R_17171765_17171886 chr2R + chr2R_17171617_17171886 chr2R_17171617_17171728;chr2R_17171765_17171886 chr2R_17171729_17171764 chr2R_17171048_17171616;chr2R_17171887_17171986 17.14 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.8581091999999995e-05 K cassette uzip,I_chr2R_20916008_20916468 chr2R + chr2R_20899701_20915225 chr2R_20899701_20900155;chr2R_20900230_20915225 chr2R_20900156_20900229 chr2R_20899595_20899700;chr2R_20915226_20915262 97.67 NA NA 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.40 NA NA NA NA NA NA 87.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.2511685400000001e-07 K cassette I_chr3R_17177101_17200781,mod(mdg4),I_chr3R_17180812_17181479,RI_chr3R_17181280_17181474,I_chr3R_17181974_17182126 chr3R - chr3R_17180812_17200781;chr3R_17181280_17200781 chr3R_17180812_17181479,chr3R_17181280_17181479;chr3R_17181974_17200781 chr3R_17181480_17181973 chr3R_17180712_17180811;chr3R_17200782_17200881 60.00 NA 47.73 NA 45.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.21 NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette spir,I_chr2L_20334199_20334626,I_chr2L_20336550_20339058 chr2L + chr2L_20343948_20345524 chr2L_20343948_20345172;chr2L_20345260_20345524 chr2L_20345173_20345259 chr2L_20343743_20343947;chr2L_20345525_20345670 41.18 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.0581341004000009e-08 K cassette Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16057418_16059122 chr3L_16057418_16058147;chr3L_16058535_16059122 chr3L_16058148_16058534 chr3L_16057330_16057417;chr3L_16059123_16059129 85.25 NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8103254000000008e-05 K cassette Ser,I_chr3R_23013597_23017227 chr3R - chr3R_23013597_23017227 chr3R_23013597_23014068;chr3R_23014187_23017227 chr3R_23014069_23014186 chr3R_23013497_23013596;chr3R_23017228_23017327 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021815999999999999 K cassette I_chrX_10148341_10149525,noncoding_22888,I_chrX_10152994_10153223 chrX - chrX_10149624_10152910 chrX_10149624_10151700;chrX_10152051_10152910 chrX_10151701_10152050 chrX_10149593_10149623;chrX_10152911_10152993 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA 33.33 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA 40.00 NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3844906675827539e-12 K cassette Dscam,I_chr2R_3212243_3212342,F_chr2R_3219886_3228832,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3208270_3210064 chr2R_3208270_3209087;chr2R_3209155_3210064 chr2R_3209088_3209154 chr2R_3207156_3208269;chr2R_3210065_3210223 91.55 NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001011876338 N cassette CG15547,I_chr3R_26712627_26714606,RI_chr3R_26713323_26714382 chr3R - chr3R_26708650_26708849 chr3R_26708650_26708704;chr3R_26708794_26708849 chr3R_26708705_26708793 chr3R_26707547_26708649;chr3R_26708850_26709639 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K cassette CG9240,Pis chrX - chrX_15596696_15597216 chrX_15596696_15596845;chrX_15597121_15597216 chrX_15596846_15597120 chrX_15596546_15596695;chrX_15597217_15597351 2.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1021,I_chr3R_2217711_2231099,I_chr3R_2217711_2231390,RI_chr3R_2217711_2231463,I_chr3R_2217742_2218601,I_chr3R_2217742_2219453,I_chr3R_2218465_2231390,RI_chr3R_2218465_2231463,I_chr3R_2218682_2231463,I_chr3R_2219634_2231390,I_chr3R_2231383_2231463 chr3R - chr3R_2218465_2231463;chr3R_2217711_2219453;chr3R_2217711_2231463;chr3R_2218465_2219453 chr3R_2218465_2218601,chr3R_2217711_2218601;chr3R_2218682_2219453,chr3R_2218682_2231463 chr3R_2218602_2218681 chr3R_2217642_2217710;chr3R_2231464_2231490 65.22 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.37 25.00 NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 37.50 52.00 NA 48.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Aldolase,I_chr3R_22083764_22086684 chr3R - chr3R_22082030_22082654 chr3R_22082030_22082195;chr3R_22082346_22082654 chr3R_22082196_22082345 chr3R_22081992_22082029;chr3R_22082655_22082854 8.49 NA NA NA NA NA NA NA NA 19.42 NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA 20.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8623000000000008e-14 K cassette Anxb11,I_chrX_16314152_16315813 chrX - chrX_16313083_16314082 chrX_16313083_16313236;chrX_16313804_16314082 chrX_16313237_16313803 chrX_16312701_16313082;chrX_16314083_16314148 53.91 NA NA 34.69 43.08 NA NA 40.00 NA NA 41.18 NA 31.11 NA 37.89 NA 39.39 NA 35.06 NA 40.62 91.50 NA NA NA 43.08 NA NA 78.75 77.11 NA NA 83.00 NA NA NA NA NA NA NA 80.85 NA 41.07 NA 76.61 NA NA 75.82 NA NA NA 42.86 NA NA 41.84 NA NA 75.56 0.0 K cassette Vha100-1,I_chr3R_24958227_24960770,RI_chr3R_24959152_24959582,I_chr3R_24959804_24960770,CE_chr3R_24962426_24962797 chr3R + chr3R_24958227_24959582;chr3R_24958227_24960770 chr3R_24958227_24958993;chr3R_24959152_24959582,chr3R_24959152_24960770 chr3R_24958994_24959151 chr3R_24958127_24958226;chr3R_24960771_24960870 54.55 NA NA NA 35.82 40.54 NA 43.69 43.87 NA NA 38.51 76.92 NA NA NA 43.64 40.62 68.52 38.89 NA 43.68 NA NA 71.74 NA NA 70.67 69.90 NA 33.07 NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA 67.65 NA 42.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette mth chr3L - chr3L_343653_344106 chr3L_343653_343954;chr3L_344040_344106 chr3L_343955_344039 chr3L_343440_343652;chr3L_344107_344301 12.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA 76.67 NA NA 40.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.84 0.0 K cassette DCAP,RI_chr2R_6183553_6192101,I_chr2R_6188094_6192101 chr2R + chr2R_6183553_6192128;chr2R_6183553_6192101 chr2R_6183553_6187994;chr2R_6188094_6192101,chr2R_6188094_6192128 chr2R_6187995_6188093 chr2R_6183453_6183552;chr2R_6192129_6192201 45.49 NA 28.57 NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 30.77 NA NA 25.00 NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG8929 chr2R + chr2R_16214899_16215831;chr2R_16214899_16215371 chr2R_16214899_16214948;chr2R_16215075_16215371,chr2R_16215075_16215831 chr2R_16214949_16215074 chr2R_16214792_16214898;chr2R_16215832_16216526 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.82 NA NA NA NA 3.2759999999999999e-09 K cassette dgt1,CG7824 chr3R - chr3R_25680766_25681674 chr3R_25680766_25680851;chr3R_25681371_25681674 chr3R_25680852_25681370 chr3R_25680427_25680765;chr3R_25681675_25682075 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.57 NA NA NA NA NA 23.26 NA NA NA NA NA 21.88 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG31158,CI_chr3R_18432763_18433113,CG31159 chr3R + chr3R_18431293_18432918 chr3R_18431293_18432549;chr3R_18432763_18432918 chr3R_18432550_18432762 chr3R_18431075_18431292;chr3R_18432919_18433030 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette pum,I_chr3R_4898752_4906279,I_chr3R_4989351_5039481 chr3R - chr3R_4906745_4982839 chr3R_4906745_4967041;chr3R_4967054_4982839 chr3R_4967042_4967053 chr3R_4906280_4906744;chr3R_4982840_4983072 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048710999999999997 K cassette CG4266,I_chr2R_17052549_17053657 chr2R - chr2R_17054548_17055100 chr2R_17054548_17054676;chr2R_17054950_17055100 chr2R_17054677_17054949 chr2R_17054404_17054547;chr2R_17055101_17055688 19.61 NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA 30.00 NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA 64.71 NA NA 36.00 NA NA 44.19 31.37 NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 30.19 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA 0.0 K cassette CG16833,I_chr2L_10994022_10994325,I_chr2L_10994919_10997334 chr2L + chr2L_10989875_10991058;chr2L_10989871_10991058 chr2L_10989871_10990095,chr2L_10989875_10990095;chr2L_10990784_10991058 chr2L_10990096_10990783 chr2L_10989656_10989870;chr2L_10991059_10991885 41.67 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA 56.00 31.48 NA NA NA NA 53.66 NA NA 30.99 NA NA NA NA NA NA 29.23 NA NA NA NA NA 30.56 NA NA NA 0.0 K cassette CG17698 chr3L + chr3L_23741161_23741523 chr3L_23741161_23741239;chr3L_23741393_23741523 chr3L_23741240_23741392 chr3L_23741051_23741160;chr3L_23741524_23741816 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017500999999999999 K cassette CG10737 chr2R + chr2R_15061627_15062081 chr2R_15061627_15061843;chr2R_15061871_15062081 chr2R_15061844_15061870 chr2R_15061209_15061626;chr2R_15062082_15062288 98.57 NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG13900,I_chr3L_830745_830907 chr3L - chr3L_827002_827422 chr3L_827002_827181;chr3L_827237_827422 chr3L_827182_827236 chr3L_826946_827001;chr3L_827423_827469 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG17528,RI_chr2R_706735_711409,I_chr2R_706735_711443,I_chr2R_707374_711443 chr2R - chr2R_706735_711443;chr2R_706735_711409;chr2R_706735_711615 chr2R_706735_706792;chr2R_707442_711409,chr2R_707442_711615,chr2R_707442_711443 chr2R_706793_707441 chr2R_706635_706734;chr2R_711616_711627 100.00 NA NA 88.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0056290000000000003 K cassette CG6854,E_chr3L_15091621_15103920,RI_chr3L_15102059_15102345 chr3L + chr3L_15091617_15103915;chr3L_15091617_15102643 chr3L_15091617_15101715;chr3L_15102059_15102643,chr3L_15102059_15103915 chr3L_15101716_15102058 chr3L_15091548_15091616;chr3L_15103916_15104086 17.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.787346e-06 K cassette CG33107 chr3R - chr3R_18409246_18409420 chr3R_18409246_18409316;chr3R_18409364_18409420 chr3R_18409317_18409363 chr3R_18409093_18409245;chr3R_18409421_18409651 81.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1603750000000005e-06 N cassette I_chrX_19573364_19573474,Mer,E_chrX_19584965_19587100,CG14229 chrX - chrX_19585968_19586333 chrX_19585968_19586064;chrX_19586275_19586333 chrX_19586065_19586274 chrX_19585731_19585967;chrX_19586334_19587282 79.55 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 57.89 NA 91.46 NA NA NA NA NA NA NA 57.66 8.7381232199815366e-29 K cassette Gug,R_chr3L_8444636_8444874,I_chr3L_8455244_8456103 chr3L + chr3L_8461805_8462509 chr3L_8461805_8461966;chr3L_8462024_8462509 chr3L_8461967_8462023 chr3L_8461647_8461804;chr3L_8462510_8462593 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041355999999999997 K cassette CG34394,I_chr2L_3365674_3365965 chr2L - chr2L_3361444_3362998 chr2L_3361444_3362415;chr2L_3362719_3362998 chr2L_3362416_3362718 chr2L_3360996_3361443;chr2L_3362999_3363195 23.81 NA NA 43.33 NA NA NA 46.88 41.67 NA NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA 34.29 NA NA NA 44.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1287477133225848e-13 K cassette Mmp1,E_chr2R_20560380_20562585,I_chr2R_20564123_20565214,I_chr2R_20569965_20572193 chr2R - chr2R_20559830_20562585 chr2R_20559830_20560073;chr2R_20560375_20562585 chr2R_20560074_20560374 chr2R_20559732_20559829;chr2R_20562586_20562664 57.73 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.78 NA NA NA NA NA NA NA NA 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.138783984425e-05 K cassette CG3714,I_chr2L_4190825_4191774,I_chr2L_4191897_4192632,I_chr2L_4192178_4192632,I_chr2L_4192969_4193324,I_chr2L_4195905_4196470,RI_chr2L_4196780_4197951,I_chr2L_4196815_4197306,I_chr2L_4196815_4197951 chr2L - chr2L_4190825_4193309 chr2L_4190825_4192632;chr2L_4192969_4193309 chr2L_4192633_4192968 chr2L_4190725_4190824;chr2L_4193310_4193481 21.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.21 NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA 40.74 NA NA NA NA 11.21 NA 36.00 NA 32.04 NA 31.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA 10.14 11.30 NA NA 7.22 NA 0.0 N cassette par-1,RI_chr2R_15348122_15356294,I_chr2R_15355073_15356294,RI_chr2R_15355419_15356294,I_chr2R_15359251_15360944,F_chr2R_15362147_15365138,RI_chr2R_15363358_15365120,I_chr2R_15365210_15370456 chr2R + chr2R_15348122_15358101;chr2R_15353200_15358101 chr2R_15353200_15356294,chr2R_15348122_15356294;chr2R_15357844_15358101 chr2R_15356295_15357843 chr2R_15348022_15348121;chr2R_15358102_15358317 42.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035013000000000002 K cassette CG34408,I_chrX_10120689_10121004 chrX + chrX_10116620_10118951;chrX_10117489_10118951 chrX_10117489_10118346,chrX_10116620_10118346;chrX_10118539_10118951 chrX_10118347_10118538 chrX_10116359_10116619;chrX_10118952_10119092 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014212899999999998 K cassette Liprin-alpha chr2L + chr2L_6726719_6727862 chr2L_6726719_6727193;chr2L_6727335_6727862 chr2L_6727194_6727334 chr2L_6726599_6726718;chr2L_6727863_6728780 97.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0033180000000000002 K cassette CG9331,I_chr2L_20824494_20826632,I_chr2L_20825513_20825658 chr2L + chr2L_20824631_20825667;chr2L_20824631_20825658 chr2L_20824631_20825283;chr2L_20825513_20825658,chr2L_20825513_20825667 chr2L_20825284_20825512 chr2L_20824625_20824630;chr2L_20825668_20825758 63.64 75.00 52.78 NA 47.37 50.00 NA NA NA NA 75.86 50.00 27.27 NA 52.94 NA 51.52 NA 48.15 51.32 NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA 52.50 NA 45.45 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA 50.00 NA NA 40.00 53.33 NA 75.61 76.19 NA NA NA NA NA 37.35 0.0 K cassette CG2316,I_chr4_208796_210623,I_chr4_209150_214298,I_chr4_209369_210623,I_chr4_209875_213969,RI_chr4_209875_214450,I_chr4_210688_213991,RI_chr4_210688_214450 chr4 - chr4_208796_209050 chr4_208796_208855;chr4_208996_209050 chr4_208856_208995 chr4_208696_208795;chr4_209051_209147 94.12 NA NA 83.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.72 NA NA NA NA 67.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette hrg chr2R - chr2R_15551990_15553029 chr2R_15551990_15552051;chr2R_15552172_15553029 chr2R_15552052_15552171 chr2R_15551451_15551989;chr2R_15553030_15553735 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012725999999999999 K cassette CG40263,F_chr2RHet_1265687_1293040,RI_chr2RHet_1324541_1328409 chr2RHet - chr2RHet_1324541_1335781;chr2RHet_1324541_1335106 chr2RHet_1324541_1333289;chr2RHet_1333469_1335106,chr2RHet_1333469_1335781 chr2RHet_1333290_1333468 chr2RHet_1324446_1324540;chr2RHet_1335782_1335833 23.77 NA NA NA NA NA 10.00 4.88 12.50 NA 93.33 NA NA 11.90 NA NA 7.69 NA 9.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 NA NA NA NA NA 69.23 0.0 N cassette CG31531,noncoding_14584,I_chr3R_486122_506500,I_chr3R_496573_505950,I_chr3R_523978_526879 chr3R + chr3R_486122_522912 chr3R_486122_496518;chr3R_496573_522912 chr3R_496519_496572 chr3R_486022_486121;chr3R_522913_523263 100.00 NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA 7.6703061999999996e-10 K cassette CG5594,CG2812 chr2R + chr2R_19810553_19811938 chr2R_19810553_19811524;chr2R_19811618_19811938 chr2R_19811525_19811617 chr2R_19810445_19810552;chr2R_19811939_19812072 98.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5032879999999999e-06 K cassette R_chr2L_8083458_8089184,R_chr2L_8083458_8089393,Bsg,I_chr2L_8107426_8107747 chr2L + chr2L_8083522_8089393 chr2L_8083522_8083901;chr2L_8084391_8089393 chr2L_8083902_8084390 chr2L_8083444_8083521;chr2L_8089394_8089493 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 50.00 60.00 NA NA NA NA 27.27 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4986903884424993e-16 K cassette CG6145,noncoding_6597 chr2R - chr2R_9426855_9432812;chr2R_9426855_9434019 chr2R_9426855_9429665;chr2R_9430069_9432812,chr2R_9430069_9434019 chr2R_9429666_9430068 chr2R_9426755_9426854;chr2R_9434020_9434119 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA NA NA 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2374560000000001e-05 N cassette CG3563,R_chr3R_10568322_10613785,I_chr3R_10615218_10615284,F_chr3R_10620137_10620250 chr3R + chr3R_10568314_10613778;chr3R_10575996_10613778 chr3R_10568314_10589932,chr3R_10575996_10589932;chr3R_10590015_10613778 chr3R_10589933_10590014 chr3R_10568222_10568313;chr3R_10613779_10614341 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.22 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG11138 chrX - chrX_12467443_12475604 chrX_12467443_12467757;chrX_12467848_12475604 chrX_12467758_12467847 chrX_12466805_12467442;chrX_12475605_12477211 61.11 NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024312 N cassette l(3)02640 chr3L + chr3L_1335289_1337270 chr3L_1335289_1335943;chr3L_1336017_1337270 chr3L_1335944_1336016 chr3L_1335041_1335288;chr3L_1337271_1337370 100.00 NA NA NA NA NA 88.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.23 NA 86.90 NA NA NA NA NA NA NA NA 88.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6593876000000006e-16 K cassette Ctr1A chrX + chrX_6555835_6559032 chrX_6555835_6556272;chrX_6556375_6559032 chrX_6556273_6556374 chrX_6555724_6555834;chrX_6559033_6559111 37.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.29 NA NA NA NA NA NA NA 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 16.50 NA NA NA NA NA NA 19.75 73.08 NA NA NA NA NA NA 17.95 NA NA NA NA 19.10 NA 2.119084921588176e-17 K cassette CG8671,I_chr2L_21275807_21277205 chr2L + chr2L_21275807_21281131;chr2L_21275807_21279883 chr2L_21275807_21277277;chr2L_21278430_21281131,chr2L_21278430_21279883 chr2L_21277278_21278429 chr2L_21275724_21275806;chr2L_21281132_21281337 62.07 47.19 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA 42.55 NA NA 43.56 NA NA NA NA 46.81 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA 51.52 NA NA NA NA NA NA NA 43.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG6643,I_chr3R_20370792_20375406 chr3R + chr3R_20374862_20377050;chr3R_20370792_20377050 chr3R_20370792_20375406,chr3R_20374862_20375406;chr3R_20375487_20377050 chr3R_20375407_20375486 chr3R_20370747_20370791;chr3R_20377051_20377534 86.32 NA NA NA NA NA NA NA NA 51.85 70.51 NA 70.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.51 NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG3114,RI_chrX_168562_168685 chrX - chrX_165909_167215;chrX_165647_167215 chrX_165909_166454,chrX_165647_166454;chrX_166917_167215 chrX_166455_166916 chrX_165521_165646;chrX_167216_167420 28.18 NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0027399999999999998 K cassette pgant5,I_chr2L_5074530_5077534,I_chr2L_5075830_5077076,I_chr2L_5079575_5093241 chr2L - chr2L_5074530_5077534;chr2L_5075830_5077534 chr2L_5074530_5077076,chr2L_5075830_5077076;chr2L_5077258_5077534 chr2L_5077077_5077257 chr2L_5074430_5074529;chr2L_5077535_5077634 98.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0044099999999999999 K cassette CG8979 chr2R - chr2R_7855985_7856244 chr2R_7855985_7856051;chr2R_7856137_7856244 chr2R_7856052_7856136 chr2R_7855789_7855984;chr2R_7856245_7856313 5.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044670000000000001 K cassette sdt,C_chrX_8118081_8119117,I_chrX_8131684_8131842 chrX + chrX_8098337_8104435 chrX_8098337_8102829;chrX_8104072_8104435 chrX_8102830_8104071 chrX_8098206_8098336;chrX_8104436_8104713 20.93 NA NA 52.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6020099289999994e-09 K cassette CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8989685_8991387;chrX_8990009_8991387 chrX_8989685_8990798,chrX_8990009_8990798;chrX_8990859_8991387 chrX_8990799_8990858 chrX_8989428_8989684;chrX_8991388_8991487 27.03 NA NA 16.39 NA NA NA NA NA NA 12.00 NA NA NA NA NA NA NA 11.90 NA NA 16.18 NA NA NA 13.64 NA 16.98 8.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette plx chr3R + chr3R_1533664_1534220 chr3R_1533664_1533742;chr3R_1533905_1534220 chr3R_1533743_1533904 chr3R_1532906_1533663;chr3R_1534221_1535108 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6999999999999999e-05 N cassette unc-13,I_chr4_897821_902468,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_897821_903242;chr4_897821_902468;chr4_897821_903586 chr4_897821_899476;chr4_899619_903242,chr4_899619_903586,chr4_899619_902468 chr4_899477_899618 chr4_897721_897820;chr4_903587_903686 65.38 NA NA 28.33 NA NA 34.21 40.62 NA NA NA 50.00 NA NA NA 77.55 NA 80.95 NA NA NA 42.22 48.72 53.85 45.95 NA 40.00 45.45 50.00 NA NA NA NA NA NA 54.55 53.85 NA NA 78.43 53.85 NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA 0.0 K cassette C3G chrX - chrX_6680846_6681383 chrX_6680846_6681128;chrX_6681282_6681383 chrX_6681129_6681281 chrX_6680189_6680845;chrX_6681384_6681553 94.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.55 NA NA NA NA NA 49.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Jupiter,I_chr3R_7417030_7419354,I_chr3R_7418347_7445425,RI_chr3R_7442793_7445425 chr3R - chr3R_7417030_7419354 chr3R_7417030_7418088;chr3R_7418347_7419354 chr3R_7418089_7418346 chr3R_7416930_7417029;chr3R_7419355_7419454 99.36 NA NA 81.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Haspin chr2RHet + chr2RHet_3200480_3234342 chr2RHet_3200480_3215266;chr2RHet_3215563_3234342 chr2RHet_3215267_3215562 chr2RHet_3200469_3200479;chr2RHet_3234343_3234575 96.00 NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.1880519999999996e-06 K cassette CG4822,I_chr2L_120081_120199,I_chr2L_120266_120420,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_120081_120420 chr2L_120081_120167;chr2L_120266_120420 chr2L_120168_120265 chr2L_119981_120080;chr2L_120421_120430 31.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.47 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1419199999999999e-07 K cassette CRMP,I_chr3R_1401648_1403314 chr3R + chr3R_1401648_1402757;chr3R_1401648_1403314 chr3R_1401648_1401896;chr3R_1402136_1403314,chr3R_1402136_1402757 chr3R_1401897_1402135 chr3R_1401548_1401647;chr3R_1403315_1403414 81.53 NA NA 31.82 NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.16 NA NA NA NA NA 68.18 NA NA 0.0 N cassette crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11800323_11803784 chr2L_11800323_11802286;chr2L_11803675_11803784 chr2L_11802287_11803674 chr2L_11800155_11800322;chr2L_11803785_11803898 100.00 NA NA 73.91 NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA 74.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.8574418833932456e-17 K cassette I_chr3L_12398261_12403200,Gap69C chr3L - chr3L_12408970_12409374 chr3L_12408970_12409044;chr3L_12409105_12409374 chr3L_12409045_12409104 chr3L_12408095_12408969;chr3L_12409375_12409579 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA NA 83.33 79.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0879352389821901e-12 N cassette Dif,dorsal,RI_chr2L_17438018_17439189,I_chr2L_17442335_17442399,FI_chr2L_17449369_17450215,RI_chr2L_17450002_17450219 chr2L - chr2L_17438213_17441800 chr2L_17438213_17439189;chr2L_17439298_17441800 chr2L_17439190_17439297 chr2L_17438150_17438212;chr2L_17441801_17441879 100.00 NA NA 36.92 NA NA 70.21 85.00 NA NA NA 80.00 41.94 NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.91 NA 87.04 NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette babo chr2R + chr2R_4842357_4846611 chr2R_4842357_4844533;chr2R_4844662_4846611 chr2R_4844534_4844661 chr2R_4842239_4842356;chr2R_4846612_4846839 39.45 NA NA NA NA NA 65.85 NA NA NA NA 88.24 NA NA NA NA NA NA NA 82.76 NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8369535759999997e-12 N cassette Wwox,I_chr2L_8000434_8000497,Spn28D chr2L - chr2L_8000237_8003283 chr2L_8000237_8000303;chr2L_8000434_8003283 chr2L_8000304_8000433 chr2L_8000108_8000236;chr2L_8003284_8003463 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 100.00 NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7519789507200005e-19 K cassette CrebB-17A,I_chrX_18261213_18269281,I_chrX_18265640_18266060,I_chrX_18265982_18266063 chrX + chrX_18267489_18269875 chrX_18267489_18269281;chrX_18269420_18269875 chrX_18269282_18269419 chrX_18267320_18267488;chrX_18269876_18270084 59.65 NA NA NA NA NA 43.14 NA NA NA 40.00 84.62 NA NA NA NA 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.68 48.61 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.43 NA NA NA 0.0 N cassette CaMKII,RI_chr4_1067398_1067889,I_chr4_1069766_1069812,RI_chr4_1071236_1071315,RI_chr4_1071489_1071968,I_chr4_1071675_1071813,I_chr4_1071675_1071884 chr4 - chr4_1065875_1068078 chr4_1065875_1067889;chr4_1068017_1068078 chr4_1067890_1068016 chr4_1065782_1065874;chr4_1068079_1068201 100.00 NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4904029999999999e-05 K cassette CG7337,I_chr2L_1910010_1910066,I_chr2L_1938620_1938887,I_chr2L_1942183_1942233 chr2L + chr2L_1937584_1938507 chr2L_1937584_1937865;chr2L_1937911_1938507 chr2L_1937866_1937910 chr2L_1937441_1937583;chr2L_1938508_1938619 59.42 NA NA NA NA NA 23.19 NA NA NA 22.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9519360000000014e-11 K cassette bif,I_chrX_11581793_11583233,REI_chrX_11585551_11586831 chrX + chrX_11583577_11587579 chrX_11583577_11586831;chrX_11587211_11587579 chrX_11586832_11587210 chrX_11583234_11583576;chrX_11587580_11588761 9.47 NA NA NA NA NA 21.33 NA NA NA NA NA 53.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette l(1)G0196,I_chrX_21890195_21895316,I_chrX_21900456_21904601 chrX + chrX_21896112_21897326;chrX_21896112_21897314 chrX_21896112_21897011;chrX_21897231_21897326,chrX_21897231_21897314 chrX_21897012_21897230 chrX_21895869_21896111;chrX_21897327_21897813 4.17 NA NA NA NA NA 25.32 NA NA NA NA NA 59.18 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.22 NA NA 14.29 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette cac chrX - chrX_11830877_11833727 chrX_11830877_11832953;chrX_11833155_11833727 chrX_11832954_11833154 chrX_11830725_11830876;chrX_11833728_11833752 50.00 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041465000000000002 K cassette trol,I_chrX_2387249_2389980,I_chrX_2389272_2395659,I_chrX_2391522_2395659 chrX - chrX_2389762_2395659;chrX_2388671_2395659;chrX_2392665_2395659;chrX_2391522_2395659;chrX_2387249_2395659 chrX_2387249_2393243,chrX_2388671_2393243,chrX_2389762_2393243,chrX_2392665_2393243,chrX_2391522_2393243;chrX_2393712_2395659 chrX_2393244_2393711 chrX_2387149_2387248;chrX_2395660_2395759 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Amph,I_chr2R_8498227_8498492 chr2R + chr2R_8497142_8498083 chr2R_8497142_8497246;chr2R_8497382_8498083 chr2R_8497247_8497381 chr2R_8496734_8497141;chr2R_8498084_8498226 2.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0490000000000001e-09 K cassette CG34408,I_chrX_10120689_10121004 chrX + chrX_10120055_10120547 chrX_10120055_10120212;chrX_10120405_10120547 chrX_10120213_10120404 chrX_10119840_10120054;chrX_10120548_10120688 100.00 NA NA NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062100000000000002 K cassette PP2A-B' chr3R + chr3R_13993929_13995378;chr3R_13993590_13995378 chr3R_13993929_13995205,chr3R_13993590_13995205;chr3R_13995271_13995378 chr3R_13995206_13995270 chr3R_13993510_13993589;chr3R_13995379_13995820 68.75 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA 50.00 NA 53.85 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA 28.57 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 4.1691313054075334e-20 K cassette Trf2,I_chrX_8318346_8318408 chrX + chrX_8304723_8317216 chrX_8304723_8312383;chrX_8312460_8317216 chrX_8312384_8312459 chrX_8304315_8304722;chrX_8317217_8317452 90.00 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02366 K cassette p130CAS chr3L + chr3L_167620_172060 chr3L_167620_168580;chr3L_168851_172060 chr3L_168581_168850 chr3L_167476_167619;chr3L_172061_174510 94.12 NA NA 78.08 NA NA NA NA NA NA 80.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.19 NA NA NA NA NA 68.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Adar,I_chrX_1668256_1682696,I_chrX_1674594_1674717 chrX + chrX_1674859_1676968 chrX_1674859_1675750;chrX_1675917_1676968 chrX_1675751_1675916 chrX_1674718_1674858;chrX_1676969_1677068 50.00 NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA 15.38 NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5845004219494342e-09 N cassette msn,I_chr3L_2558033_2560115,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2558390_2561931;chr3L_2558036_2563817;chr3L_2558390_2563817 chr3L_2558390_2560115,chr3L_2558036_2560115;chr3L_2560296_2561931,chr3L_2560296_2563817 chr3L_2560116_2560295 chr3L_2557936_2558035;chr3L_2563818_2563917 97.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette Rip11,E_chrX_18532733_18533695,RI_chrX_18530353_18530870,RI_chrX_18530742_18530870,RI_chrX_18544139_18544185 chrX - chrX_18530353_18531445;chrX_18530353_18531363 chrX_18530353_18530870;chrX_18530907_18531445,chrX_18530907_18531363 chrX_18530871_18530906 chrX_18530253_18530352;chrX_18531446_18531606 50.54 NA 66.67 71.07 28.38 22.88 37.45 NA NA NA NA 72.04 72.48 60.77 NA 81.62 NA NA NA NA NA 67.69 NA NA NA 61.34 NA NA NA 66.67 63.16 64.20 62.96 NA NA NA NA NA 35.22 NA NA NA NA NA 35.26 NA NA 64.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.12 0.0 K cassette RhoGAP71E,I_chr3L_15583097_15589765 chr3L + chr3L_15594396_15599758;chr3L_15595616_15599758 chr3L_15595616_15597935,chr3L_15594396_15597935;chr3L_15598381_15599758 chr3L_15597936_15598380 chr3L_15594333_15594395;chr3L_15599759_15600439 26.32 NA NA NA NA 13.98 NA NA NA 6.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.93 NA NA NA 15.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.94 12.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG32138 chr3L + chr3L_14062028_14063021;chr3L_14062028_14062991 chr3L_14062028_14062185;chr3L_14062497_14063021,chr3L_14062497_14062991 chr3L_14062186_14062496 chr3L_14061908_14062027;chr3L_14063022_14063741 26.13 NA NA 9.97 NA NA NA NA NA NA 16.08 58.87 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Nrx-IV chr3L + chr3L_12142009_12145276;chr3L_12142009_12144919 chr3L_12142009_12144310;chr3L_12144508_12145276,chr3L_12144508_12144919 chr3L_12144311_12144507 chr3L_12141892_12142008;chr3L_12145277_12145418 38.46 NA NA 20.31 NA 27.91 NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA 21.62 NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA 0.0 K cassette I_chr2L_6956220_6956307,sip2_CG9188 chr2L - chr2L_6963555_6963938 chr2L_6963555_6963743;chr2L_6963856_6963938 chr2L_6963744_6963855 chr2L_6961895_6963554;chr2L_6963939_6964073 17.86 NA NA NA NA NA NA 35.85 NA 4.65 NA NA NA NA NA 36.14 NA NA NA NA NA 40.62 NA NA NA 34.48 NA NA NA NA NA NA NA 28.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7581028003620937e-19 K cassette CG32264,RI_chr3L_3769407_3803313 chr3L - chr3L_3722523_3723638 chr3L_3722523_3722859;chr3L_3723106_3723638 chr3L_3722860_3723105 chr3L_3722156_3722522;chr3L_3723639_3723872 80.00 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.24 1.1329909443936001e-10 N cassette CG32529 chrX + chrX_19781526_19794648 chrX_19781526_19793044;chrX_19794006_19794648 chrX_19793045_19794005 chrX_19781512_19781525;chrX_19794649_19795521 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5414210000000001e-06 K cassette CG10353,I_chrX_11775936_11778830,I_chrX_11778617_11778830,RI_chrX_11780885_11780988 chrX - chrX_11777655_11780988;chrX_11775936_11780988 chrX_11777655_11778830,chrX_11775936_11778830;chrX_11779138_11780988 chrX_11778831_11779137 chrX_11775836_11775935;chrX_11780989_11781085 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0070039999999999998 K cassette skd chr3L - chr3L_20995298_20998077 chr3L_20995298_20996835;chr3L_20997286_20998077 chr3L_20996836_20997285 chr3L_20995117_20995297;chr3L_20998078_20998762 5.94 NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5763099999999999e-07 N cassette CG5604 chr2L - chr2L_10290491_10292209 chr2L_10290491_10291106;chr2L_10291144_10292209 chr2L_10291107_10291143 chr2L_10290351_10290490;chr2L_10292210_10292339 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00026699999999999998 N cassette Nos,I_chr2L_10826086_10826539 chr2L - chr2L_10823110_10825673 chr2L_10823110_10823760;chr2L_10823853_10825673 chr2L_10823761_10823852 chr2L_10823027_10823109;chr2L_10825674_10825685 65.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Ptp4E,EI_chrX_4842231_4842425 chrX + chrX_4847655_4849003 chrX_4847655_4848167;chrX_4848658_4849003 chrX_4848168_4848657 chrX_4847526_4847654;chrX_4849004_4849551 98.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG11665,I_chr2R_1530001_1531096,RI_chr2R_1535330_1540011 chr2R - chr2R_1531547_1540003 chr2R_1531547_1535226;chr2R_1535330_1540003 chr2R_1535227_1535329 chr2R_1531322_1531546;chr2R_1540004_1540300 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01942 K cassette Taf4,I_chr3L_16107821_16107893 chr3L + chr3L_16107821_16108768 chr3L_16107821_16107893;chr3L_16107944_16108768 chr3L_16107894_16107943 chr3L_16107721_16107820;chr3L_16108769_16108930 4.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3169999999999999e-08 K cassette svr,RI_chrX_421417_421591 chrX + chrX_391423_396017 chrX_391423_393881;chrX_394642_396017 chrX_393882_394641 chrX_391354_391422;chrX_396018_396253 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.08 NA NA NA NA NA NA NA 1.6146852566800001e-11 K cassette CG33558,RI_chr2R_2813804_2816013,I_chr2R_2813804_2817753,I_chr2R_2816342_2817327,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2813804_2814174 chr2R_2813804_2813977;chr2R_2814097_2814174 chr2R_2813978_2814096 chr2R_2813704_2813803;chr2R_2814175_2814326 8.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K cassette E_chr3R_7821802_7831079,Ect3 chr3R + chr3R_7825162_7826930 chr3R_7825162_7825486;chr3R_7825598_7826930 chr3R_7825487_7825597 chr3R_7825014_7825161;chr3R_7826931_7827152 5.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA 32.00 NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6576100535999998e-08 N cassette CG7777,I_chr2R_7323928_7328572 chr2R + chr2R_7327836_7329439 chr2R_7327836_7328572;chr2R_7329126_7329439 chr2R_7328573_7329125 chr2R_7327692_7327835;chr2R_7329440_7329695 100.00 NA NA 87.14 NA NA 86.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4639999999999998e-15 K cassette CG1358,I_chr2R_3485171_3489936 chr2R - chr2R_3485171_3489936 chr2R_3485171_3485720;chr2R_3485863_3489936 chr2R_3485721_3485862 chr2R_3485071_3485170;chr2R_3489937_3490036 97.83 NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3600000000000007e-08 K cassette AGO1,I_chr2R_9844856_9845327 chr2R - chr2R_9838423_9840553;chr2R_9838423_9842191 chr2R_9838423_9839118;chr2R_9839194_9840553,chr2R_9839194_9842191 chr2R_9839119_9839193 chr2R_9837637_9838422;chr2R_9842192_9842260 94.34 NA NA 77.36 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette crol,I_chr2L_11799403_11802904 chr2L - chr2L_11803899_11809125;chr2L_11803899_11808013 chr2L_11803899_11806047;chr2L_11806158_11809125,chr2L_11806158_11808013 chr2L_11806048_11806157 chr2L_11803785_11803898;chr2L_11809126_11809399 78.55 NA NA 48.91 NA NA 61.99 NA NA NA 54.00 NA NA NA NA NA NA 64.35 NA 90.58 68.42 NA NA NA 66.00 NA NA 63.80 46.88 NA NA NA NA NA NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA 68.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Dystrophin chr3R + chr3R_15418846_15420221;chr3R_15418846_15420090 chr3R_15418846_15419517;chr3R_15419821_15420221,chr3R_15419821_15420090 chr3R_15419518_15419820 chr3R_15418545_15418845;chr3R_15420222_15420680 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 19.35 NA NA NA 33.33 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 19.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette SF1 chr3R + chr3R_13367524_13369221 chr3R_13367524_13368136;chr3R_13368213_13369221 chr3R_13368137_13368212 chr3R_13367424_13367523;chr3R_13369222_13369374 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.27 NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA 73.17 75.38 NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.87 78.75 NA NA NA NA NA NA NA 4.3087103727362751e-19 K cassette Rtnl1,I_chr2L_4994995_5006383,RE_chr2L_4994997_5008180,I_chr2L_4999386_5000201,I_chr2L_5027222_5028118 chr2L - chr2L_4994995_5008180;chr2L_4994995_5004613 chr2L_4994995_5004171;chr2L_5004208_5008180,chr2L_5004208_5004613 chr2L_5004172_5004207 chr2L_4994897_4994994;chr2L_5008181_5008280 11.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG42321,I_chr2R_9326329_9326436,I_chr2R_9326353_9326436 chr2R - chr2R_9303463_9306491;chr2R_9303121_9306491 chr2R_9303463_9304079,chr2R_9303121_9304079;chr2R_9305334_9306491 chr2R_9304080_9305333 chr2R_9302939_9303120;chr2R_9306492_9306590 66.67 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3297442365000001e-07 K cassette mys,I_chrX_7958795_7961094 chrX + chrX_7958795_7961094;chrX_7959566_7961094 chrX_7958795_7960130,chrX_7959566_7960130;chrX_7960216_7961094 chrX_7960131_7960215 chrX_7958695_7958794;chrX_7961095_7961194 16.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.67 NA NA 6.34 NA NA NA NA NA 0.0 K cassette p120ctn,I_chr2R_482968_494268,I_chr2R_487593_493262 chr2R + chr2R_482968_486773 chr2R_482968_486413;chr2R_486654_486773 chr2R_486414_486653 chr2R_482868_482967;chr2R_486774_487425 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018044000000000001 K cassette I_chr2L_6323791_6325172,Gef26,I_chr2L_6330719_6330770 chr2L + chr2L_6329698_6330770 chr2L_6329698_6330122;chr2L_6330564_6330770 chr2L_6330123_6330563 chr2L_6329548_6329697;chr2L_6330771_6330832 71.59 NA NA NA 52.00 NA 53.85 NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.49 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.258309141449475e-16 K cassette fl(2)d,I_chr2R_9709063_9711788 chr2R - chr2R_9709063_9711296 chr2R_9709063_9709270;chr2R_9709631_9711296 chr2R_9709271_9709630 chr2R_9708963_9709062;chr2R_9711297_9711975 38.24 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.74 NA NA NA NA NA NA NA 22.86 73.97 NA NA NA NA NA 14.97 19.19 22.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 23.86 NA 88.00 0.0 K cassette CG34133,F_chr3R_25696884_25696960 chr3R + chr3R_25695777_25696960 chr3R_25695777_25696781;chr3R_25696872_25696960 chr3R_25696782_25696871 chr3R_25695572_25695776;chr3R_25696961_25697060 73.21 NA NA NA NA NA 46.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1939724768e-08 K cassette Pep,I_chr3L_17637180_17637918 chr3L - chr3L_17636827_17637990 chr3L_17636827_17637078;chr3L_17637180_17637990 chr3L_17637079_17637179 chr3L_17636463_17636826;chr3L_17637991_17638018 4.94 NA NA 43.39 NA NA NA NA NA NA NA 15.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette twin,RI_chr3R_20032242_20045321 chr3R - chr3R_20046066_20046836;chr3R_20046066_20047514 chr3R_20046066_20046253;chr3R_20046286_20046836,chr3R_20046286_20047514 chr3R_20046254_20046285 chr3R_20045937_20046065;chr3R_20047515_20047647 100.00 NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015479999999999999 K cassette CG3558,RI_chr2L_2995071_2997790 chr2L + chr2L_2997060_2997790 chr2L_2997060_2997491;chr2L_2997531_2997790 chr2L_2997492_2997530 chr2L_2996502_2997059;chr2L_2997791_2997890 17.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.82 6.00 NA 40.26 NA NA NA NA NA NA NA 6.47 32.14 NA NA NA NA NA 45.16 6.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.25 NA NA NA NA NA 0.0 K cassette dre4,I_chr3L_1875590_1875651,F_chr3L_1877432_1877517 chr3L - chr3L_1871918_1872581 chr3L_1871918_1872353;chr3L_1872471_1872581 chr3L_1872354_1872470 chr3L_1871528_1871917;chr3L_1872582_1872735 22.59 NA 9.61 48.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.30 NA 11.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Eps-15,I_chr2R_20660319_20660496 chr2R - chr2R_20660319_20660734 chr2R_20660319_20660463;chr2R_20660527_20660734 chr2R_20660464_20660526 chr2R_20660219_20660318;chr2R_20660735_20660822 86.54 NA NA 65.32 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.30 NA NA 66.10 NA NA NA NA NA NA 63.77 NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.00 0.0 K cassette RpS11,I_chr2R_8087545_8087698,I_chr2R_8087747_8088193 chr2R - chr2R_8087747_8088279 chr2R_8087747_8087932;chr2R_8088056_8088279 chr2R_8087933_8088055 chr2R_8087699_8087746;chr2R_8088280_8088293 2.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Ppn,F_chr3R_24347009_24347078 chr3R - chr3R_24348983_24349501;chr3R_24348983_24349755 chr3R_24348983_24349248;chr3R_24349420_24349501,chr3R_24349420_24349755 chr3R_24349249_24349419 chr3R_24348417_24348982;chr3R_24349756_24349939 54.23 NA 42.55 38.64 NA NA 39.13 NA NA 39.29 NA 39.36 30.00 NA NA NA 32.26 NA NA NA 34.38 NA NA NA NA 40.43 NA 36.36 41.67 NA NA NA 76.19 NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA 37.50 NA NA 65.22 69.70 NA NA NA NA 70.59 68.75 65.71 NA 67.44 70.00 NA 0.0 K cassette Dyrk3,I_chr4_1233845_1234170 chr4 - chr4_1233845_1234223;chr4_1233845_1234374 chr4_1233845_1234031;chr4_1234147_1234223,chr4_1234147_1234374 chr4_1234032_1234146 chr4_1233745_1233844;chr4_1234375_1234398 75.00 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0074269999999999996 K cassette CG11009,I_chr3L_12844823_12845526,I_chr3L_12845441_12845526 chr3L + chr3L_12844823_12845526;chr3L_12844823_12845715 chr3L_12844823_12845331;chr3L_12845378_12845526,chr3L_12845378_12845715 chr3L_12845332_12845377 chr3L_12844723_12844822;chr3L_12845716_12845816 39.05 NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA 54.89 53.09 NA NA 50.55 NA NA NA NA 59.02 53.85 27.59 NA 27.71 19.42 NA 52.08 10.62 NA 55.45 NA 59.85 NA NA NA NA 28.74 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.14 NA NA NA 20.83 NA 0.0 K cassette srp,I_chr3R_11825782_11827473,I_chr3R_11826508_11826910 chr3R + chr3R_11826508_11827473;chr3R_11825782_11827473 chr3R_11825782_11826910,chr3R_11826508_11826910;chr3R_11827129_11827473 chr3R_11826911_11827128 chr3R_11825682_11825781;chr3R_11827474_11827573 75.64 NA NA 64.12 NA NA 64.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.20 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.96 0.0 K cassette CG33111,noncoding_18661,I_chr3R_19633752_19633821 chr3R - chr3R_19627964_19632347 chr3R_19627964_19631481;chr3R_19631843_19632347 chr3R_19631482_19631842 chr3R_19627864_19627963;chr3R_19632348_19632486 58.82 NA NA 32.56 NA NA 30.43 41.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 37.50 NA NA NA NA 35.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6627420975782129e-15 K cassette lig,CI_chr2R_3962006_3962916,RI_chr2R_3962875_3962977 chr2R + chr2R_3963954_3965235 chr2R_3963954_3964764;chr2R_3964798_3965235 chr2R_3964765_3964797 chr2R_3963798_3963953;chr2R_3965236_3966123 15.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Galpha49B,I_chr2R_8504706_8504960,I_chr2R_8506056_8506112 chr2R + chr2R_8500357_8503411;chr2R_8500390_8503411 chr2R_8500357_8501759,chr2R_8500390_8501759;chr2R_8501851_8503411 chr2R_8501760_8501850 chr2R_8500333_8500356;chr2R_8503412_8503586 40.91 NA NA 30.59 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA 28.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.31 NA NA NA 0.0 K cassette trol,I_chrX_2384846_2385177,I_chrX_2387249_2389980,I_chrX_2391522_2395659 chrX - chrX_2384876_2385351 chrX_2384876_2385177;chrX_2385268_2385351 chrX_2385178_2385267 chrX_2384489_2384875;chrX_2385352_2385445 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG31522,I_chr3R_270285_272146,I_chr3R_270285_272461,I_chr3R_271138_271887,I_chr3R_272255_272359,RI_chr3R_273677_279264 chr3R - chr3R_270285_271887;chr3R_270285_272146 chr3R_270285_271053;chr3R_271138_271887,chr3R_271138_272146 chr3R_271054_271137 chr3R_270228_270284;chr3R_272147_272246 93.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016609999999999999 K cassette Cda5 chr2L - chr2L_29069_33844;chr2L_29069_34557 chr2L_29069_30393;chr2L_33271_34557,chr2L_33271_33844 chr2L_30394_33270 chr2L_29024_29068;chr2L_34558_34596 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0019499999999999999 N cassette unc-13,I_chr4_904268_919018,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_906518_919018 chr4_906518_907590;chr4_913467_919018 chr4_907591_913466 chr4_906418_906517;chr4_919019_919102 15.15 NA NA 32.79 NA NA 29.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA 3.45 2.78 NA 0.0 K cassette Strn-Mlck,I_chr2R_11838019_11838662 chr2R - chr2R_11835112_11836312;chr2R_11835109_11836312 chr2R_11835112_11835509,chr2R_11835109_11835509;chr2R_11836216_11836312 chr2R_11835510_11836215 chr2R_11834432_11835108;chr2R_11836313_11836490 88.57 NA NA 77.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9899999999999993e-14 K cassette CG6767,CREI_chr3L_9679564_9687332,I_chr3L_9680354_9682364,I_chr3L_9682549_9689638,I_chr3L_9682607_9687332,RE_chr3L_9679576_9682364,RI_chr3L_9679579_9682364 chr3L - chr3L_9679564_9687332 chr3L_9679564_9682364;chr3L_9682549_9687332 chr3L_9682365_9682548 chr3L_9679479_9679563;chr3L_9687333_9687431 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013946 K cassette CG17508 chr2R + chr2R_1496995_1498696 chr2R_1496995_1497568;chr2R_1497762_1498696 chr2R_1497569_1497761 chr2R_1496895_1496994;chr2R_1498697_1499080 90.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA 73.53 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette opa1-like,I_chr2R_10119470_10120234,I_chr2R_10121848_10121900,I_chr2R_10122128_10122197,I_chr2R_10122334_10122393 chr2R - chr2R_10121848_10122197 chr2R_10121848_10121947;chr2R_10122065_10122197 chr2R_10121948_10122064 chr2R_10121778_10121847;chr2R_10122198_10122227 37.74 NA NA 17.74 NA NA 24.62 NA NA NA NA NA NA NA NA 55.68 NA NA NA NA NA 54.03 NA NA 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9648981101863163e-19 K cassette CG1161 chr3R + chr3R_1181665_1182146 chr3R_1181665_1181724;chr3R_1181851_1182146 chr3R_1181725_1181850 chr3R_1181556_1181664;chr3R_1182147_1182246 98.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Rbp2,I_chrX_16343528_16343906 chrX + chrX_16345593_16345951 chrX_16345593_16345734;chrX_16345825_16345951 chrX_16345735_16345824 chrX_16345308_16345592;chrX_16345952_16346631 1.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.98 NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette tomosyn,I_chrX_12531219_12531470,I_chrX_12534873_12541731,noncoding_23357,I_chrX_12548772_12549203 chrX + chrX_12534873_12545142 chrX_12534873_12542569;chrX_12543084_12545142 chrX_12542570_12543083 chrX_12534773_12534872;chrX_12545143_12545259 90.00 NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016330000000000001 K cassette TepII,I_chr2L_7696207_7698724,I_chr2L_7696808_7697006,I_chr2L_7697158_7697976 chr2L - chr2L_7696207_7698724;chr2L_7696808_7698724;chr2L_7696207_7697976 chr2L_7696207_7697006,chr2L_7696808_7697006;chr2L_7697158_7697976,chr2L_7697158_7698724 chr2L_7697007_7697157 chr2L_7696107_7696206;chr2L_7698725_7698824 73.68 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 61.29 63.16 NA NA 47.83 NA 57.89 NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.11 0.0 K cassette CycG,I_chr3R_27427946_27436602,I_chr3R_27427953_27429034,I_chr3R_27427953_27431334,RE_chr3R_27427953_27436598 chr3R - chr3R_27427953_27436602 chr3R_27427953_27428792;chr3R_27428796_27436602 chr3R_27428793_27428795 chr3R_27427853_27427952;chr3R_27436603_27436698 4.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Actn,I_chrX_1922061_1924247,I_chrX_1922784_1923807,I_chrX_1922784_1923873 chrX - chrX_1922784_1924247;chrX_1922061_1924247 chrX_1922061_1923873,chrX_1922784_1923873;chrX_1923960_1924247 chrX_1923874_1923959 chrX_1921968_1922060;chrX_1924248_1924347 12.24 NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00018699999999999999 K cassette lt,I_chr2L_22817840_22817968,RI_chr2L_22820498_22823377,I_chr2L_22831575_22832085,I_chr2L_22832038_22832092,RI_chr2L_22832567_22832623 chr2L + chr2L_22820498_22832085 chr2L_22820498_22831505;chr2L_22831575_22832085 chr2L_22831506_22831574 chr2L_22820398_22820497;chr2L_22832086_22832154 83.33 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.62 NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG30115,E_chr2R_14444407_14448590 chr2R - chr2R_14443916_14445307 chr2R_14443916_14444228;chr2R_14444490_14445307 chr2R_14444229_14444489 chr2R_14441641_14443915;chr2R_14445308_14445521 23.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.020296999999999999 K cassette CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8993495_8995128;chrX_8992447_8995128 chrX_8993495_8994545,chrX_8992447_8994545;chrX_8994691_8995128 chrX_8994546_8994690 chrX_8992117_8992446;chrX_8995129_8995452 15.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.27 NA NA NA NA NA NA 5.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette Hcs,I_chr3R_1303481_1304607 chr3R + chr3R_1301523_1302262 chr3R_1301523_1302027;chr3R_1302041_1302262 chr3R_1302028_1302040 chr3R_1301185_1301522;chr3R_1302263_1303269 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035118999999999997 K cassette Nopp140,I_chr3L_21828330_21828566,I_chr3L_21828986_21829082 chr3L + chr3L_21827930_21828566 chr3L_21827930_21828170;chr3L_21828330_21828566 chr3L_21828171_21828329 chr3L_21827465_21827929;chr3L_21828567_21828666 25.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.09 NA NA 39.51 NA 37.74 40.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.31 NA 0.0 K cassette zormin,I_chr3L_2128755_2129053,RI_chr3L_2139943_2140057 chr3L - chr3L_2126671_2129053 chr3L_2126671_2127077;chr3L_2128761_2129053 chr3L_2127078_2128760 chr3L_2125239_2126670;chr3L_2129054_2129153 2.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.04 NA NA 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999998e-13 K cassette CycE,I_chr2L_15729157_15729277,I_chr2L_15737965_15746454 chr2L - chr2L_15737965_15746454;chr2L_15737965_15747832 chr2L_15737965_15740771;chr2L_15740900_15747832,chr2L_15740900_15746454 chr2L_15740772_15740899 chr2L_15737865_15737964;chr2L_15747833_15748266 94.44 NA NA NA NA NA 70.83 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6946134124695997e-10 K cassette sqd,I_chr3R_9462248_9471474,I_chr3R_9468150_9468236,I_chr3R_9470417_9471474 chr3R - chr3R_9468932_9471474 chr3R_9468932_9470080;chr3R_9470293_9471474 chr3R_9470081_9470292 chr3R_9468891_9468931;chr3R_9471475_9471574 9.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA 20.41 NA NA NA NA 45.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.24 0.0 K cassette CG11266,RI_chr2L_7033019_7034764,I_chr2L_7034274_7034764,I_chr2L_7034274_7035406,RI_chr2L_7034911_7035074,I_chr2L_7051093_7051366 chr2L + chr2L_7034274_7035406;chr2L_7033019_7035406 chr2L_7033019_7034764,chr2L_7034274_7034764;chr2L_7034913_7035406 chr2L_7034765_7034912 chr2L_7032919_7033018;chr2L_7035407_7035506 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.00 NA NA NA 9.7583517359699986e-10 K cassette Doa,I_chr3R_24715823_24718923,I_chr3R_24747391_24747896 chr3R + chr3R_24726745_24745946 chr3R_24726745_24745213;chr3R_24745290_24745946 chr3R_24745214_24745289 chr3R_24726546_24726744;chr3R_24745947_24746013 96.55 NA NA NA NA NA 71.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette bmm,I_chr3L_14772123_14772190 chr3L - chr3L_14770086_14770438 chr3L_14770086_14770205;chr3L_14770342_14770438 chr3L_14770206_14770341 chr3L_14769603_14770085;chr3L_14770439_14770707 10.87 NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 22.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.9497048799999999e-10 K cassette Mgat2,I_chr3R_25845406_25846373 chr3R - chr3R_25842597_25843987 chr3R_25842597_25843346;chr3R_25843707_25843987 chr3R_25843347_25843706 chr3R_25842497_25842596;chr3R_25843988_25844128 19.44 NA NA NA NA 6.90 8.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA 5.6113165147e-07 N cassette dco,RI_chr3R_26883647_26884261,RI_chr3R_26883651_26886096,I_chr3R_26884350_26884670,I_chr3R_26884350_26886671,I_chr3R_26884350_26886791,RI_chr3R_26884365_26886096,I_chr3R_26884365_26886798 chr3R - chr3R_26883651_26886798;chr3R_26883651_26886096 chr3R_26883651_26884261;chr3R_26884350_26886096,chr3R_26884350_26886798 chr3R_26884262_26884349 chr3R_26883551_26883650;chr3R_26886799_26886891 96.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette spin,I_chr2R_12013288_12013847 chr2R + chr2R_12020141_12023531 chr2R_12020141_12020333;chr2R_12020596_12023531 chr2R_12020334_12020595 chr2R_12020064_12020140;chr2R_12023532_12023630 96.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6000000000000002e-05 K cassette Tm1,I_chr3R_11120969_11125831,I_chr3R_11121267_11122312,I_chr3R_11121267_11124998 chr3R + chr3R_11120969_11125831;chr3R_11120969_11122312 chr3R_11120969_11121148;chr3R_11121267_11125831,chr3R_11121267_11122312 chr3R_11121149_11121266 chr3R_11120869_11120968;chr3R_11125832_11125902 73.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.37 NA NA NA NA 52.87 NA NA NA NA 60.55 59.65 NA NA 62.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.03 NA NA 63.11 51.49 NA 0.0 K cassette M(2)21AB,I_chr2L_110878_111037,I_chr2L_112022_112689,RI_chr2L_132256_132482 chr2L + chr2L_110878_112689;chr2L_110878_111906 chr2L_110878_111004;chr2L_111118_112689,chr2L_111118_111906 chr2L_111005_111117 chr2L_110778_110877;chr2L_112690_112789 3.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Jhebp29,RI_chr2R_20857941_20857992,RI_chr2R_20857941_20858127 chr2R + chr2R_20857941_20858127 chr2R_20857941_20857994;chr2R_20858072_20858127 chr2R_20857995_20858071 chr2R_20857841_20857940;chr2R_20858128_20858227 92.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9567559999999999e-06 K cassette pyd,I_chr3R_4654041_4664113,I_chr3R_4749124_4756437 chr3R - chr3R_4654041_4657863 chr3R_4654041_4654556;chr3R_4656728_4657863 chr3R_4654557_4656727 chr3R_4653941_4654040;chr3R_4657864_4657996 76.56 NA NA NA NA NA 87.95 87.23 NA NA NA NA 16.28 88.33 NA 86.96 NA NA NA NA NA NA NA 63.69 NA NA NA NA 63.33 NA 90.00 NA NA 86.92 NA 86.60 65.24 61.95 62.78 NA NA NA NA NA NA NA NA 86.81 90.83 63.92 65.36 NA NA 58.72 NA 65.94 NA 91.40 0.0 N cassette CG1578,RI_chrX_11709573_11710335,I_chrX_11710380_11710454 chrX - chrX_11707501_11709202 chrX_11707501_11708729;chrX_11708915_11709202 chrX_11708730_11708914 chrX_11707321_11707500;chrX_11709203_11709572 100.00 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.0000000000000002e-06 K cassette CG8486,I_chr2L_8182451_8183191 chr2L + chr2L_8175398_8176572;chr2L_8174699_8176572 chr2L_8175398_8175994,chr2L_8174699_8175994;chr2L_8176052_8176572 chr2L_8175995_8176051 chr2L_8174536_8174698;chr2L_8176573_8176806 33.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Hydr1 chr2R + chr2R_5020034_5021103;chr2R_5020273_5021103;chr2R_5020095_5021103;chr2R_5020492_5021103 chr2R_5020492_5020551,chr2R_5020095_5020551,chr2R_5020034_5020551,chr2R_5020273_5020551;chr2R_5020853_5021103 chr2R_5020552_5020852 chr2R_5020013_5020033;chr2R_5021104_5021275 33.33 NA NA 11.54 NA NA 20.00 11.54 23.21 43.75 52.63 57.14 NA NA NA 14.81 16.67 NA NA 16.33 NA 12.50 NA NA NA NA NA 58.33 NA NA NA 50.00 NA NA NA 18.18 NA 44.44 46.43 50.00 60.00 NA NA NA 46.67 47.83 NA 62.50 NA 53.85 44.44 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Ucp4A chrX + chrX_17739792_17740963 chrX_17739792_17740715;chrX_17740826_17740963 chrX_17740716_17740825 chrX_17739615_17739791;chrX_17740964_17741452 51.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00011900000000000001 K cassette PMCA,I_chr4_350028_350896,E_chr4_350055_363541,I_chr4_350064_350896,I_chr4_350959_363547,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_350055_352023;chr4_350055_363547 chr4_350055_350896;chr4_350966_363547,chr4_350966_352023 chr4_350897_350965 chr4_349964_350054;chr4_363548_363641 90.00 NA NA NA NA NA 54.55 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 75.00 NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA 70.59 NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 73.17 3.9125574669041443e-16 K cassette syd,I_chr3L_7924891_7925400 chr3L - chr3L_7919938_7921016 chr3L_7919938_7920859;chr3L_7920921_7921016 chr3L_7920860_7920920 chr3L_7919673_7919937;chr3L_7921017_7921217 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.026399999999999e-08 K cassette scny,I_chr3L_5763034_5768288 chr3L + chr3L_5767177_5768288 chr3L_5767177_5767513;chr3L_5767947_5768288 chr3L_5767514_5767946 chr3L_5767039_5767176;chr3L_5768289_5768388 6.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K cassette CG40263,F_chr2RHet_1265687_1293040,RI_chr2RHet_1324541_1328409 chr2RHet - chr2RHet_1286572_1324445;chr2RHet_1265687_1324445 chr2RHet_1286572_1293055,chr2RHet_1265687_1293055;chr2RHet_1293175_1324445 chr2RHet_1293056_1293174 chr2RHet_1265587_1265686;chr2RHet_1324446_1324530 43.65 NA NA NA NA NA NA NA 59.02 NA NA NA 60.00 NA 56.00 NA 62.50 57.14 NA 56.76 NA NA NA 31.58 20.00 32.00 53.85 NA 30.77 57.14 NA NA NA NA 33.33 33.33 NA 54.55 NA NA 13.79 55.26 NA NA 13.33 25.00 21.43 NA NA 21.43 59.09 NA 17.65 NA 65.22 26.32 25.00 15.62 0.0 K cassette Rcd1 chr2R - chr2R_10037324_10037730 chr2R_10037324_10037392;chr2R_10037459_10037730 chr2R_10037393_10037458 chr2R_10036739_10037323;chr2R_10037731_10037959 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00016100000000000001 K cassette CG11727,CREI_chrX_11327451_11328532 chrX - chrX_11330430_11331055 chrX_11330430_11330807;chrX_11330826_11331055 chrX_11330808_11330825 chrX_11329762_11330429;chrX_11331056_11331170 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.824805e-06 K cassette kis,I_chr2L_228282_230537,RI_chr2L_231035_231947,RI_chr2L_242745_242800,I_chr2L_242926_250756 chr2L - chr2L_228282_230537 chr2L_228282_229172;chr2L_229383_230537 chr2L_229173_229382 chr2L_228182_228281;chr2L_230538_230627 89.31 NA NA 63.78 NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.67 NA NA 76.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette simj,I_chr3L_10680263_10680313 chr3L + chr3L_10679362_10680337 chr3L_10679362_10680151;chr3L_10680263_10680337 chr3L_10680152_10680262 chr3L_10679064_10679361;chr3L_10680338_10680413 93.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.038547999999999999 N cassette CG1513,I_chr2R_5778649_5778739 chr2R - chr2R_5771508_5772126 chr2R_5771508_5771589;chr2R_5771712_5772126 chr2R_5771590_5771711 chr2R_5771402_5771507;chr2R_5772127_5772213 100.00 NA NA 78.46 NA NA 84.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.82 NA NA NA NA 89.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG10960,I_chr3L_12820683_12835879 chr3L - chr3L_12820683_12835879 chr3L_12820683_12828411;chr3L_12828450_12835879 chr3L_12828412_12828449 chr3L_12820583_12820682;chr3L_12835880_12835979 99.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0050629999999999998 N cassette CG9510 chr2L - chr2L_8942453_8942826 chr2L_8942453_8942508;chr2L_8942656_8942826 chr2L_8942509_8942655 chr2L_8941989_8942452;chr2L_8942827_8943071 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA 67.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.8064000000000003e-08 K cassette hppy,I_chr2R_15105700_15106080,I_chr2R_15106144_15108248 chr2R + chr2R_15105700_15111557;chr2R_15105700_15110744 chr2R_15105700_15108248;chr2R_15108288_15110744,chr2R_15108288_15111557 chr2R_15108249_15108287 chr2R_15105636_15105699;chr2R_15111558_15111891 19.35 NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0999999999999999e-05 K cassette CG30118,I_chr2R_14320281_14325712,I_chr2R_14325118_14325712 chr2R - chr2R_14320281_14325079 chr2R_14320281_14324101;chr2R_14324234_14325079 chr2R_14324102_14324233 chr2R_14320181_14320280;chr2R_14325080_14325117 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0026740000000000002 K cassette GlcAT-P,I_chr3L_11172482_11172633 chr3L - chr3L_11172817_11176733 chr3L_11172817_11175254;chr3L_11175744_11176733 chr3L_11175255_11175743 chr3L_11172634_11172816;chr3L_11176734_11177238 26.90 NA NA 39.66 8.86 7.69 13.43 NA NA NA 10.75 52.98 10.96 38.71 NA 41.03 NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA 44.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1578,I_chrX_11705375_11705673,I_chrX_11705375_11707320,RI_chrX_11709573_11710335,I_chrX_11710380_11710454 chrX - chrX_11705375_11707320 chrX_11705375_11705684;chrX_11706637_11707320 chrX_11705685_11706636 chrX_11705275_11705374;chrX_11707321_11707420 91.03 NA NA 56.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG14995,I_chr3L_4095875_4097205,I_chr3L_4096047_4096903 chr3L - chr3L_4095875_4097506;chr3L_4096979_4097506;chr3L_4096068_4097506 chr3L_4096979_4097205,chr3L_4095875_4097205,chr3L_4096068_4097205;chr3L_4097335_4097506 chr3L_4097206_4097334 chr3L_4095775_4095874;chr3L_4097507_4097804 41.42 NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA 63.16 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 28.57 22.73 NA NA NA NA NA 30.77 NA NA 29.03 NA NA NA 27.50 23.08 30.43 52.00 NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA 60.00 NA 30.00 55.56 NA NA 53.33 NA NA 0.0 K cassette prominin-like,I_chr3L_3121200_3123087 chr3L - chr3L_3117257_3117833 chr3L_3117257_3117345;chr3L_3117406_3117833 chr3L_3117346_3117405 chr3L_3117083_3117256;chr3L_3117834_3117973 94.57 NA NA 72.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG2950,I_chr2L_4844647_4845086,I_chr2L_4844952_4845086 chr2L - chr2L_4844773_4845253;chr2L_4844952_4845253 chr2L_4844773_4845086,chr2L_4844952_4845086;chr2L_4845159_4845253 chr2L_4845087_4845158 chr2L_4844712_4844772;chr2L_4845254_4845575 98.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018044000000000001 K cassette CG12090,I_chr3L_1525393_1526659 chr3L - chr3L_1528077_1531390 chr3L_1528077_1529105;chr3L_1529229_1531390 chr3L_1529106_1529228 chr3L_1528061_1528076;chr3L_1531391_1531522 88.89 NA NA 55.17 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.71 NA NA NA NA 77.27 NA NA NA 4.3349787249999995e-15 K cassette trx chr3R - chr3R_10101091_10104814;chr3R_10101091_10111930 chr3R_10101091_10102027;chr3R_10103265_10104814,chr3R_10103265_10111930 chr3R_10102028_10103264 chr3R_10099914_10101090;chr3R_10111931_10112601 97.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035430000000000003 K cassette Zn72D,RF_chr3L_16100887_16102721,I_chr3L_16105199_16105253 chr3L - chr3L_16104982_16105431 chr3L_16104982_16105097;chr3L_16105199_16105431 chr3L_16105098_16105198 chr3L_16103583_16104981;chr3L_16105432_16105487 92.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043334999999999999 K cassette smid,I_chr3L_7375166_7375310,I_chr3L_7375435_7375508 chr3L + chr3L_7375832_7375993 chr3L_7375832_7375884;chr3L_7375936_7375993 chr3L_7375885_7375935 chr3L_7375509_7375831;chr3L_7375994_7376334 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K cassette enc chr3L + chr3L_3833671_3836021 chr3L_3833671_3834270;chr3L_3834628_3836021 chr3L_3834271_3834627 chr3L_3833456_3833670;chr3L_3836022_3836934 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3902572691200001e-07 K cassette CG30193,CG30190,noncoding_8782 chr2R + chr2R_18817843_18819037 chr2R_18817843_18817911;chr2R_18818804_18819037 chr2R_18817912_18818803 chr2R_18817716_18817842;chr2R_18819038_18819238 12.36 NA NA NA NA NA 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.88 NA NA NA NA NA NA 28.95 NA NA NA 27.87 NA NA 39.13 NA NA NA NA 27.78 NA 24.32 NA NA NA NA 22.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette eIF-4E,RI_chr3L_9394049_9394139,RI_chr3L_9394054_9394756,I_chr3L_9394308_9394756,RI_chr3L_9394468_9394631,I_chr3L_9394468_9394659,I_chr3L_9394468_9395155,I_chr3L_9394468_9395240,I_chr3L_9394468_9395446,I_chr3L_9394819_9395198,I_chr3L_9394819_9395379 chr3L - chr3L_9394054_9395379 chr3L_9394054_9394139;chr3L_9394468_9395379 chr3L_9394140_9394467 chr3L_9393954_9394053;chr3L_9395380_9395409 85.04 NA NA 70.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.41 NA 74.90 66.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.95 NA NA NA NA 0.0 K cassette CG17838,I_chr3R_16623576_16628011,I_chr3R_16625404_16631668 chr3R + chr3R_16624132_16631668;chr3R_16624132_16631671 chr3R_16624132_16628011;chr3R_16628274_16631671,chr3R_16628274_16631668 chr3R_16628012_16628273 chr3R_16624037_16624131;chr3R_16631672_16631768 30.00 NA NA NA NA NA NA 16.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K cassette Taf1 chr3R + chr3R_2479013_2480191 chr3R_2479013_2479744;chr3R_2479844_2480191 chr3R_2479745_2479843 chr3R_2478682_2479012;chr3R_2480192_2480386 20.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041329999999999999 K cassette ens,I_chr3L_4130719_4131120 chr3L - chr3L_4127163_4130388;chr3L_4128974_4131120;chr3L_4127163_4131120 chr3L_4127163_4129650,chr3L_4128974_4129650;chr3L_4129792_4130388,chr3L_4129792_4131120 chr3L_4129651_4129791 chr3L_4126989_4127162;chr3L_4131121_4131220 84.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette kuz,E_chr2L_13550294_13551106,CE_chr2L_13558833_13594255,I_chr2L_13636762_13637287 chr2L + chr2L_13551667_13609790 chr2L_13551667_13558799;chr2L_13558833_13609790 chr2L_13558800_13558832 chr2L_13551569_13551666;chr2L_13609791_13609888 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG42574,I_chr3R_618802_618939,I_chr3R_621543_625413,I_chr3R_621546_625413 chr3R - chr3R_620787_625413;chr3R_621546_625413 chr3R_621546_622210,chr3R_620787_622210;chr3R_623420_625413 chr3R_622211_623419 chr3R_618940_620786;chr3R_625414_625513 40.98 NA NA 67.57 NA NA 28.57 NA NA NA 29.73 62.50 15.22 NA NA NA NA NA NA 67.65 28.95 56.64 NA NA NA 23.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.69 NA NA NA NA 24.24 NA NA 29.91 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG6448,I_chr2L_22146997_22156620 chr2L + chr2L_22146997_22156620 chr2L_22146997_22154797;chr2L_22155409_22156620 chr2L_22154798_22155408 chr2L_22146897_22146996;chr2L_22156621_22156720 99.01 NA NA 87.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00030699999999999998 K cassette CG30118,I_chr2R_14320281_14325712,I_chr2R_14325118_14325712 chr2R - chr2R_14325118_14325712 chr2R_14325118_14325444;chr2R_14325483_14325712 chr2R_14325445_14325482 chr2R_14325111_14325117;chr2R_14325713_14325780 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031558999999999997 K cassette CG7358,I_chrX_18784661_18784773 chrX - chrX_18784515_18784773 chrX_18784515_18784578;chrX_18784661_18784773 chrX_18784579_18784660 chrX_18784488_18784514;chrX_18784774_18784782 12.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000117 K cassette CG11163,I_chr2R_1666219_1669711 chr2R - chr2R_1662935_1663826 chr2R_1662935_1663234;chr2R_1663362_1663826 chr2R_1663235_1663361 chr2R_1662765_1662934;chr2R_1663827_1664096 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.97 NA 95.56 NA NA NA NA NA NA NA 96.88 48.65 NA 91.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.83 8.3230838018443212e-13 K cassette zip,I_chr2R_20878796_20879147 chr2R - chr2R_20884825_20887561 chr2R_20884825_20885800;chr2R_20885825_20887561 chr2R_20885801_20885824 chr2R_20884732_20884824;chr2R_20887562_20887683 94.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.13 70.69 NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.77 NA NA NA NA 82.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette I_chr3L_1494947_1496080,pUf68,I_chr3L_1499710_1499771,RI_chr3L_1499880_1501350 chr3L - chr3L_1499338_1501350;chr3L_1499338_1500244;chr3L_1499338_1501798 chr3L_1499338_1499771;chr3L_1499880_1501350,chr3L_1499880_1501798,chr3L_1499880_1500244 chr3L_1499772_1499879 chr3L_1499043_1499337;chr3L_1501799_1501892 8.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG14741 chr3R - chr3R_7899339_7900895 chr3R_7899339_7900180;chr3R_7900593_7900895 chr3R_7900181_7900592 chr3R_7899048_7899338;chr3R_7900896_7901144 34.99 NA NA NA 17.41 22.67 NA NA NA 24.04 19.59 NA 6.60 NA NA 57.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.11 49.47 NA 61.05 NA 52.94 NA NA 62.15 NA NA NA 15.57 NA NA NA NA 55.07 49.13 NA NA NA 24.00 NA NA 63.91 53.09 NA 47.50 56.21 51.67 0.0 K cassette Ephrin,I_chr4_595055_597604,RI_chr4_596272_596341 chr4 + chr4_595055_597604 chr4_595055_596327;chr4_596952_597604 chr4_596328_596951 chr4_594955_595054;chr4_597605_597704 98.36 NA NA 74.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000261 K cassette tou,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7474644_7475150 chr2R_7474644_7475042;chr2R_7475088_7475150 chr2R_7475043_7475087 chr2R_7474602_7474643;chr2R_7475151_7475216 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3876656499999989e-10 K cassette Dystrophin chr3R + chr3R_15308374_15310761 chr3R_15308374_15309625;chr3R_15310667_15310761 chr3R_15309626_15310666 chr3R_15308286_15308373;chr3R_15310762_15310994 72.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.21 NA NA NA NA NA 84.21 NA NA 85.07 87.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.12 NA NA 88.24 NA NA NA 87.50 NA 8.8090360233804693e-25 K cassette nrv2,I_chr2L_6791842_6794492,I_chr2L_6793397_6794492,I_chr2L_6793405_6793916,I_chr2L_6793405_6794499,I_chr2L_6793684_6794492 chr2L - chr2L_6791842_6794492 chr2L_6791842_6793227;chr2L_6793374_6794492 chr2L_6793228_6793373 chr2L_6791742_6791841;chr2L_6794493_6794592 95.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023814999999999999 K cassette bun,I_chr2L_12520177_12536274,I_chr2L_12537393_12537634,RI_chr2L_12540901_12546409 chr2L - chr2L_12477167_12536274 chr2L_12477167_12516483;chr2L_12517186_12536274 chr2L_12516484_12517185 chr2L_12477115_12477166;chr2L_12536275_12536374 22.81 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.79 NA NA NA NA NA 76.92 45.83 NA NA 40.00 52.38 NA NA 42.59 NA NA NA 34.29 41.94 NA NA NA 48.57 NA NA 51.72 NA 41.67 NA NA NA NA NA NA 36.73 43.33 0.0 K cassette msps,I_chr3R_11877071_11877796 chr3R + chr3R_11882514_11883273 chr3R_11882514_11883015;chr3R_11883112_11883273 chr3R_11883016_11883111 chr3R_11882014_11882513;chr3R_11883274_11883487 8.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG4822,I_chr2L_120081_120199,I_chr2L_120266_120420,I_chr2L_125267_128799,RI_chr2L_126228_126309 chr2L - chr2L_119236_119430 chr2L_119236_119287;chr2L_119376_119430 chr2L_119288_119375 chr2L_119227_119235;chr2L_119431_119554 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.042106999999999999 K cassette rdgB chrX + chrX_13664176_13665160 chrX_13664176_13664798;chrX_13664838_13665160 chrX_13664799_13664837 chrX_13664112_13664175;chrX_13665161_13665236 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045373999999999998 K cassette CG17471,RI_chr4_1213397_1214333,RI_chr4_1213397_1216053,RI_chr4_1214248_1214333,I_chr4_1214293_1214333,I_chr4_1215995_1216053,I_chr4_1216718_1217333,I_chr4_1217104_1217410 chr4 - chr4_1213397_1216053 chr4_1213397_1214333;chr4_1214486_1216053 chr4_1214334_1214485 chr4_1213332_1213396;chr4_1216054_1216153 96.36 NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.65 NA NA NA 74.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.48 2.4050738704034304e-16 K cassette PMCA,RI_chr4_370306_371228,I_chr4_370428_370481,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_370306_371228 chr4_370306_370355;chr4_370670_371228 chr4_370356_370669 chr4_370206_370305;chr4_371229_371316 97.83 NA NA 85.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.5427999999999989e-08 K cassette Nc73EF,F_chr3L_16952838_16955936,CE_chr3L_16952842_16955936,I_chr3L_16952985_16955434,I_chr3L_16953768_16954599 chr3L + chr3L_16952985_16954599;chr3L_16952985_16955434 chr3L_16952985_16953637;chr3L_16953768_16954599,chr3L_16953768_16955434 chr3L_16953638_16953767 chr3L_16952885_16952984;chr3L_16955435_16955513 38.00 NA NA 19.54 NA NA NA NA NA 20.69 27.12 12.04 27.91 NA NA NA NA NA 24.53 48.33 NA NA NA NA NA NA NA 26.76 22.22 NA NA NA NA NA NA 24.14 NA NA NA 26.53 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette MBD-like chr3R + chr3R_5385754_5386644 chr3R_5385754_5385996;chr3R_5386336_5386644 chr3R_5385997_5386335 chr3R_5385501_5385753;chr3R_5386645_5387357 11.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.33 NA NA NA NA NA 35.94 NA NA NA NA NA NA NA 23.26 NA NA NA NA NA NA NA NA 22.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette alt chr3R - chr3R_13501256_13501808 chr3R_13501256_13501363;chr3R_13501460_13501808 chr3R_13501364_13501459 chr3R_13500797_13501255;chr3R_13501809_13502471 25.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.54 NA NA NA NA 44.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6642240000000001e-06 K cassette cana,CG33695 chr2L + chr2L_11278486_11278754 chr2L_11278486_11278574;chr2L_11278674_11278754 chr2L_11278575_11278673 chr2L_11278394_11278485;chr2L_11278755_11279847 78.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039742 K cassette CG33523,RI_chr3L_5920177_5921323 chr3L + chr3L_5920167_5921636 chr3L_5920167_5921323;chr3L_5921397_5921636 chr3L_5921324_5921396 chr3L_5920077_5920166;chr3L_5921637_5921740 96.97 NA NA NA NA NA 83.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001379 K cassette PHGPx chr3L + chr3L_3326368_3327859 chr3L_3326368_3327342;chr3L_3327554_3327859 chr3L_3327343_3327553 chr3L_3326358_3326367;chr3L_3327860_3328183 6.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.97 20.97 22.00 NA 27.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.77 17.49 19.19 22.13 NA NA NA NA NA NA NA 23.77 NA NA 18.05 19.77 NA NA 37.04 NA 17.50 NA NA 0.0 K cassette Nipped-B,RI_chr2R_599551_607274,I_chr2R_616057_617208 chr2R - chr2R_615459_615937 chr2R_615459_615513;chr2R_615630_615937 chr2R_615514_615629 chr2R_615299_615458;chr2R_615938_615993 86.67 NA 74.29 76.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA 39.29 NA NA 48.15 68.18 NA NA 63.33 NA NA NA NA 68.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Zasp52,I_chr2R_11652341_11652627,RI_chr2R_11652953_11660545,RI_chr2R_11654219_11660545,I_chr2R_11690993_11701987 chr2R - chr2R_11652341_11661320 chr2R_11652341_11652627;chr2R_11657057_11661320 chr2R_11652628_11657056 chr2R_11652241_11652340;chr2R_11661321_11661384 9.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette unc-13,RI_chr4_892852_895828,RI_chr4_894198_895828,RI_chr4_897821_903586,I_chr4_899619_903586,I_chr4_902576_903242,I_chr4_906518_917117,I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_892852_895828 chr4_892852_893839;chr4_894198_895828 chr4_893840_894197 chr4_892753_892851;chr4_895829_895928 94.87 NA NA 77.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4000000000000005e-10 K cassette dlg1,I_chrX_11298230_11299306 chrX + chrX_11292856_11299306;chrX_11293850_11299306 chrX_11293850_11294820,chrX_11292856_11294820;chrX_11294866_11299306 chrX_11294821_11294865 chrX_11292753_11292855;chrX_11299307_11299406 35.29 NA NA 83.08 NA NA 8.86 NA NA NA 12.86 NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA 10.58 NA NA NA NA NA NA NA 17.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.40 NA NA NA NA NA 25.00 NA 21.05 NA 14.85 NA NA 16.22 NA 46.03 NA 14.89 21.49 0.0 K cassette CG4630,RI_chr2R_9103472_9103634,I_chr2R_9103765_9103852,I_chr2R_9103910_9104108,I_chr2R_9103956_9104108,RI_chr2R_9104206_9104265 chr2R - chr2R_9103765_9104108 chr2R_9103765_9103852;chr2R_9103956_9104108 chr2R_9103853_9103955 chr2R_9103665_9103764;chr2R_9104109_9104202 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.26 NA NA NA NA NA NA 71.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5064807160000002e-08 K cassette rgn chr3L + chr3L_21376185_21412706 chr3L_21376185_21404629;chr3L_21404679_21412706 chr3L_21404630_21404678 chr3L_21375636_21376184;chr3L_21412707_21412897 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0042750000000000002 K cassette Rheb,RI_chr3R_1395455_1395563,CRMP chr3R + chr3R_1395194_1395563 chr3R_1395194_1395296;chr3R_1395505_1395563 chr3R_1395297_1395504 chr3R_1395122_1395193;chr3R_1395564_1395663 89.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012260000000000001 K cassette I_chr2R_10059540_10059794,I_chr2R_10060189_10060261,cg,I_chr2R_10064197_10065344,I_chr2R_10064197_10068715,I_chr2R_10068194_10068715 chr2R + chr2R_10064197_10065365;chr2R_10064197_10065389 chr2R_10064197_10064679;chr2R_10064983_10065389,chr2R_10064983_10065365 chr2R_10064680_10064982 chr2R_10064117_10064196;chr2R_10065390_10065444 78.79 NA NA 60.83 NA NA 48.08 NA NA NA 57.69 92.00 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA 64.94 58.70 NA 89.57 89.29 59.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette KrT95D,I_chr3R_19825840_19825904 chr3R - chr3R_19826503_19829137 chr3R_19826503_19828143;chr3R_19828270_19829137 chr3R_19828144_19828269 chr3R_19825902_19826502;chr3R_19829138_19829486 93.43 NA NA NA NA NA NA NA NA 81.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette sd,RI_chrX_15706472_15707633,RI_chrX_15706568_15707633 chrX + chrX_15714587_15717219 chrX_15714587_15715041;chrX_15715807_15717219 chrX_15715042_15715806 chrX_15714456_15714586;chrX_15717220_15717260 19.40 NA NA 32.00 NA 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.22 NA NA NA 37.21 NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA 33.33 NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA 39.47 0.0 K cassette gro chr3R + chr3R_21871550_21872454 chr3R_21871550_21872260;chr3R_21872315_21872454 chr3R_21872261_21872314 chr3R_21871451_21871549;chr3R_21872455_21872631 91.49 NA NA NA NA NA 77.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA 72.00 NA 1.4537438310253439e-11 K cassette klett chrX - chrX_21499782_21501000 chrX_21499782_21499946;chrX_21500820_21501000 chrX_21499947_21500819 chrX_21499389_21499781;chrX_21501001_21501058 92.93 NA NA 77.94 NA NA NA NA NA NA NA NA 79.66 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.9723364937499999e-07 K cassette CG7841,RI_chr3L_15499446_15500898,I_chr3L_15500695_15500898,RI_chr3L_15500713_15500898 chr3L - chr3L_15499446_15500898 chr3L_15499446_15500572;chr3L_15500667_15500898 chr3L_15500573_15500666 chr3L_15499346_15499445;chr3L_15500899_15500998 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028221 K cassette cwo,noncoding_15870 chr3R + chr3R_6215160_6223084 chr3R_6215160_6222426;chr3R_6222543_6223084 chr3R_6222427_6222542 chr3R_6214846_6215159;chr3R_6223085_6223406 70.00 NA NA 94.44 NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.58 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.241121837715192e-10 K cassette ps,I_chr3R_5243723_5270765,I_chr3R_5245770_5269732,I_chr3R_5265428_5269732,I_chr3R_5265428_5270765,I_chr3R_5269733_5270765 chr3R + chr3R_5262841_5270765;chr3R_5258562_5270765;chr3R_5245770_5270765 chr3R_5258562_5269732,chr3R_5245770_5269732,chr3R_5262841_5269732;chr3R_5269799_5270765 chr3R_5269733_5269798 chr3R_5245740_5245769;chr3R_5270766_5270860 51.72 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA 76.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 41.07 NA NA NA 40.00 NA 0.0 K cassette CG4589,I_chr2R_20402394_20402462,I_chr2R_20402394_20402706 chr2R - chr2R_20400695_20402753 chr2R_20400695_20402058;chr2R_20402394_20402753 chr2R_20402059_20402393 chr2R_20398382_20400694;chr2R_20402754_20402806 100.00 NA NA 82.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0037109999999999999 N cassette inaE chrX + chrX_13697884_13698155 chrX_13697884_13697941;chrX_13698084_13698155 chrX_13697942_13698083 chrX_13697359_13697883;chrX_13698156_13698260 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019066 K cassette l(2)k09913 chr2R + chr2R_18954831_18958129 chr2R_18954831_18955469;chr2R_18955652_18958129 chr2R_18955470_18955651 chr2R_18954762_18954830;chr2R_18958130_18958411 95.77 NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0028760000000000001 K cassette SpdS,I_chr3R_5457577_5457950 chr3R + chr3R_5457577_5458098 chr3R_5457577_5457828;chr3R_5458023_5458098 chr3R_5457829_5458022 chr3R_5457477_5457576;chr3R_5458099_5458909 11.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1039371199999999e-10 N cassette Pvr,I_chr2L_8226604_8228082,I_chr2L_8229012_8229080,I_chr2L_8230332_8238998 chr2L - chr2L_8226607_8228493 chr2L_8226607_8228082;chr2L_8228258_8228493 chr2L_8228083_8228257 chr2L_8226458_8226606;chr2L_8228494_8229011 96.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.41 NA NA NA 84.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG4829,I_chrX_16717240_16717547 chrX + chrX_16711168_16717135 chrX_16711168_16716589;chrX_16716806_16717135 chrX_16716590_16716805 chrX_16711045_16711167;chrX_16717136_16717239 100.00 NA NA 89.15 NA NA 88.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG31619,I_chr2L_21725446_21728027 chr2L + chr2L_21719644_21727005;chr2L_21719644_21728027 chr2L_21719644_21725067;chr2L_21725446_21727005,chr2L_21725446_21728027 chr2L_21725068_21725445 chr2L_21719514_21719643;chr2L_21728028_21728127 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA 74.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.33 88.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27798276_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27707594_27784756;chr3R_27747397_27784756;chr3R_27707594_27759175 chr3R_27747397_27757793,chr3R_27707594_27757793;chr3R_27758337_27784756,chr3R_27758337_27759175 chr3R_27757794_27758336 chr3R_27707494_27707593;chr3R_27784757_27784846 17.65 NA NA NA 6.25 NA NA 5.00 NA NA NA NA 4.35 NA NA NA NA 3.45 7.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette loco,I_chr3R_18448629_18449211,I_chr3R_18456329_18462522 chr3R - chr3R_18448629_18461366;chr3R_18448629_18462522 chr3R_18448629_18455274;chr3R_18456329_18461366,chr3R_18456329_18462522 chr3R_18455275_18456328 chr3R_18448529_18448628;chr3R_18462523_18462622 78.12 65.22 NA 51.85 NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 64.71 57.14 3.8404377294241635e-23 K cassette Khc-73 chr2R - chr2R_11412243_11412519 chr2R_11412243_11412364;chr2R_11412407_11412519 chr2R_11412365_11412406 chr2R_11410580_11412242;chr2R_11412520_11412834 19.23 NA NA NA NA NA 6.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00042433357200000004 K cassette CG7185 chr3L - chr3L_8305851_8307056 chr3L_8305851_8306110;chr3L_8306252_8307056 chr3L_8306111_8306251 chr3L_8305384_8305850;chr3L_8307057_8307776 46.29 NA NA 32.14 30.56 31.34 22.22 NA NA NA NA NA 27.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 34.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.47 NA NA NA NA 32.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CSN8,I_chr2L_8365282_8365388,I_chr2L_8367210_8367311 chr2L + chr2L_8364980_8365152 chr2L_8364980_8365039;chr2L_8365105_8365152 chr2L_8365040_8365104 chr2L_8364870_8364979;chr2L_8365153_8365281 96.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.09 NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000197765128 K cassette cmet chr2L - chr2L_11266558_11267150 chr2L_11266558_11266881;chr2L_11267047_11267150 chr2L_11266882_11267046 chr2L_11262819_11266557;chr2L_11267151_11268052 15.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00096878238100000006 K cassette pbl chr3L - chr3L_7891955_7894714 chr3L_7891955_7893179;chr3L_7894554_7894714 chr3L_7893180_7894553 chr3L_7891823_7891954;chr3L_7894715_7894964 34.69 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.36 NA 45.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.54 NA NA NA NA NA 67.65 47.37 47.14 NA 52.94 49.53 NA NA NA NA NA NA 57.50 52.94 NA NA NA 48.84 NA NA 61.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG4896,REI_chr2L_1179197_1179859,I_chr2L_1191535_1191648 chr2L + chr2L_1179197_1179859 chr2L_1179197_1179451;chr2L_1179526_1179859 chr2L_1179452_1179525 chr2L_1179127_1179196;chr2L_1179860_1179937 63.07 NA NA 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7237999999999999e-08 K cassette pan chr4 + chr4_115242_120031;chr4_115629_120031 chr4_115242_118447,chr4_115629_118447;chr4_118602_120031 chr4_118448_118601 chr4_115049_115241;chr4_120032_120101 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0049540000000000001 K cassette CG33558,I_chr2R_2816779_2817354,EI_chr2R_2820947_2821570,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2822614_2822927 chr2R_2822614_2822719;chr2R_2822801_2822927 chr2R_2822720_2822800 chr2R_2822311_2822613;chr2R_2822928_2823185 96.55 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0044929999999999996 K cassette Eb1,RI_chr2R_2640290_2642206,I_chr2R_2640494_2642206,I_chr2R_2642491_2642549 chr2R + chr2R_2640494_2642206 chr2R_2640494_2640577;chr2R_2641009_2642206 chr2R_2640578_2641008 chr2R_2640394_2640493;chr2R_2642207_2642306 87.50 NA 63.64 63.33 NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA 48.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.6783511359387177e-16 K cassette CG14657 chr3R - chr3R_645633_646054 chr3R_645633_645832;chr3R_645989_646054 chr3R_645833_645988 chr3R_645516_645632;chr3R_646055_647174 18.75 NA NA NA NA NA 36.67 NA NA NA NA NA 89.47 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG40178,I_chr3LHet_1194286_1226423,I_chr3LHet_1281030_1306994 chr3LHet - chr3LHet_1257084_1315894 chr3LHet_1257084_1306994;chr3LHet_1307156_1315894 chr3LHet_1306995_1307155 chr3LHet_1256867_1257083;chr3LHet_1315895_1316109 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001573 K cassette e(r) chrX - chrX_8799418_8800141 chrX_8799418_8799537;chrX_8799622_8800141 chrX_8799538_8799621 chrX_8798761_8799417;chrX_8800142_8800333 95.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.21 NA NA 82.67 NA NA NA NA NA NA 74.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Pten,I_chr2L_10256507_10256803,F_chr2L_10259663_10260253 chr2L - chr2L_10256507_10257777 chr2L_10256507_10257394;chr2L_10257717_10257777 chr2L_10257395_10257716 chr2L_10256469_10256506;chr2L_10257778_10257993 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00081705766599999999 K cassette Tsp42Ee,RI_chr2R_2904593_2904783 chr2R + chr2R_2899841_2904517 chr2R_2899841_2900537;chr2R_2901155_2904517 chr2R_2900538_2901154 chr2R_2899753_2899840;chr2R_2904518_2904592 98.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0081829999999999993 K cassette CG17514 chr2RHet + chr2RHet_2776072_2814311 chr2RHet_2776072_2799749;chr2RHet_2800715_2814311 chr2RHet_2799750_2800714 chr2RHet_2775979_2776071;chr2RHet_2814312_2821170 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0032520000000000001 K cassette CG11367,I_chr3L_22724590_22725116 chr3L + chr3L_22722194_22725680 chr3L_22722194_22725116;chr3L_22725241_22725680 chr3L_22725117_22725240 chr3L_22721249_22722193;chr3L_22725681_22725842 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023622000000000001 K cassette shi,RI_chrX_15786633_15786860,RE_chrX_15793108_15795563 chrX + chrX_15793108_15795576 chrX_15793108_15793476;chrX_15793489_15795576 chrX_15793477_15793488 chrX_15793008_15793107;chrX_15795577_15795663 8.47 NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6000000000000003e-05 K cassette CaMKII,I_chr4_1059085_1065781,RI_chr4_1061742_1064093,RI_chr4_1061742_1065781,I_chr4_1061989_1065781,RI_chr4_1063745_1065781,I_chr4_1069766_1069812,RI_chr4_1071236_1071315,RI_chr4_1071489_1071968,I_chr4_1071675_1071813,I_chr4_1071675_1071884 chr4 - chr4_1059064_1065781;chr4_1059061_1065781;chr4_1059085_1065781;chr4_1060705_1065781 chr4_1060705_1064093,chr4_1059061_1064093,chr4_1059064_1064093,chr4_1059085_1064093;chr4_1064151_1065781 chr4_1064094_1064150 chr4_1059054_1059060;chr4_1065782_1065874 31.82 47.83 43.24 43.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 13.33 NA NA NA NA 42.86 NA 62.50 NA NA NA 16.67 NA 44.26 NA NA NA NA 20.00 43.75 NA NA NA 43.75 NA NA NA 17.86 NA NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA 20.51 0.0 K cassette eEF1delta chr2L + chr2L_10232660_10233756 chr2L_10232660_10233480;chr2L_10233562_10233756 chr2L_10233481_10233561 chr2L_10232278_10232659;chr2L_10233757_10234539 45.39 NA NA NA NA NA 21.19 NA NA NA 90.06 31.35 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.40 NA NA NA 33.54 25.44 56.91 59.82 23.84 NA NA NA NA NA NA 21.58 57.41 NA NA NA 30.69 NA NA NA 26.56 NA NA NA NA 56.16 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG17724,Kdm4B,seq chr2R - chr2R_9066519_9072281;chr2R_9067616_9072281 chr2R_9066519_9068494,chr2R_9067616_9068494;chr2R_9070740_9072281 chr2R_9068495_9070739 chr2R_9063672_9066518;chr2R_9072282_9072680 60.00 NA 48.48 NA NA NA 41.67 45.61 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA 44.74 48.19 NA NA NA NA NA 48.15 NA NA NA NA 48.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette shot,I_chr2R_9762249_9762363,I_chr2R_9771216_9771599,I_chr2R_9782813_9788941,I_chr2R_9791078_9791208 chr2R - chr2R_9753001_9753953 chr2R_9753001_9753565;chr2R_9753632_9753953 chr2R_9753566_9753631 chr2R_9752056_9753000;chr2R_9753954_9754137 99.52 NA NA NA NA NA NA NA NA 82.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Hrb27C,I_chr2L_6924401_6924743 chr2L + chr2L_6921441_6923783;chr2L_6921074_6923783;chr2L_6920862_6923783 chr2L_6921441_6922730,chr2L_6921074_6922730,chr2L_6920862_6922730;chr2L_6922827_6923783 chr2L_6922731_6922826 chr2L_6920793_6920861;chr2L_6923784_6924400 74.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.57 NA 62.37 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.86 NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG11063 chrX - chrX_13720986_13721372 chrX_13720986_13721075;chrX_13721154_13721372 chrX_13721076_13721153 chrX_13720820_13720985;chrX_13721373_13721542 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000834 K cassette I_chr3R_1303481_1304607,CG31550 chr3R + chr3R_1312607_1313556 chr3R_1312607_1312781;chr3R_1312900_1313556 chr3R_1312782_1312899 chr3R_1312598_1312606;chr3R_1313557_1314029 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.65 NA NA NA NA NA NA NA NA 42.50 NA NA NA 53.85 36.84 51.72 NA 50.00 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA 7.6057357770198218e-23 K cassette CG18659,E_chr2R_5011363_5019110,RI_chr2R_5013572_5014531,I_chr2R_5016147_5016997 chr2R - chr2R_5011651_5013055;chr2R_5011645_5013055 chr2R_5011645_5012248,chr2R_5011651_5012248;chr2R_5012726_5013055 chr2R_5012249_5012725 chr2R_5011194_5011644;chr2R_5013056_5013571 91.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Xrp1,I_chr3R_14741648_14750799,I_chr3R_14750298_14750799 chr3R + chr3R_14741648_14750799;chr3R_14744348_14750799 chr3R_14744348_14745144,chr3R_14741648_14745144;chr3R_14745235_14750799 chr3R_14745145_14745234 chr3R_14741548_14741647;chr3R_14750800_14750899 97.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette gukh,I_chr3R_14846503_14846650 chr3R + chr3R_14839172_14846650 chr3R_14839172_14841512;chr3R_14844206_14846650 chr3R_14841513_14844205 chr3R_14838988_14839171;chr3R_14846651_14846750 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014483076499999999 K cassette LBR chr2R + chr2R_17608123_17608452 chr2R_17608123_17608191;chr2R_17608380_17608452 chr2R_17608192_17608379 chr2R_17608017_17608122;chr2R_17608453_17608832 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012963000000000001 N cassette trol,I_chrX_2391522_2395659 chrX - chrX_2415822_2417437 chrX_2415822_2416256;chrX_2416455_2417437 chrX_2416257_2416454 chrX_2415567_2415821;chrX_2417438_2417562 100.00 NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Ptpmeg,I_chr3L_353688_353782,I_chr3L_355125_355175 chr3L + chr3L_347780_351366 chr3L_347780_348122;chr3L_348218_351366 chr3L_348123_348217 chr3L_347766_347779;chr3L_351367_351663 5.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG30020,I_chr2R_6778098_6778140 chr2R + chr2R_6775731_6775975 chr2R_6775731_6775787;chr2R_6775902_6775975 chr2R_6775788_6775901 chr2R_6775602_6775730;chr2R_6775976_6776326 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012648521200000001 K cassette Edem2 chr2L + chr2L_13195405_13195749 chr2L_13195405_13195580;chr2L_13195680_13195749 chr2L_13195581_13195679 chr2L_13195133_13195404;chr2L_13195750_13197281 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.007633 K cassette CG6084 chr3L - chr3L_11613766_11614313 chr3L_11613766_11614022;chr3L_11614204_11614313 chr3L_11614023_11614203 chr3L_11613759_11613765;chr3L_11614314_11614522 56.94 NA NA 11.56 NA NA NA 71.50 76.68 NA 79.63 40.62 79.49 NA NA NA NA 74.19 NA NA 75.93 NA NA NA NA 43.24 NA 11.90 34.85 NA 75.45 NA 42.50 NA NA 22.54 NA NA 37.35 34.35 37.62 NA NA NA 38.14 NA NA NA 71.07 40.28 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette wun,I_chr2R_5297151_5300729,I_chr2R_5297159_5300813 chr2R - chr2R_5288654_5289913 chr2R_5288654_5289280;chr2R_5289740_5289913 chr2R_5289281_5289739 chr2R_5288031_5288653;chr2R_5289914_5290090 23.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA 72.22 NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette vav chrX + chrX_19157989_19163516 chrX_19157989_19163289;chrX_19163399_19163516 chrX_19163290_19163398 chrX_19157914_19157988;chrX_19163517_19163684 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000126 K cassette CG5174,F_chr2R_14309059_14311473 chr2R + chr2R_14311992_14312376;chr2R_14311992_14312844 chr2R_14311992_14312111;chr2R_14312172_14312376,chr2R_14312172_14312844 chr2R_14312112_14312171 chr2R_14311831_14311991;chr2R_14312845_14312913 42.74 NA 56.29 29.28 NA NA 18.91 30.77 NA NA 22.88 23.55 NA NA NA 55.00 NA NA NA NA 28.93 14.15 NA NA NA 32.67 NA 56.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.12 32.23 56.78 NA NA NA NA NA NA NA 30.00 0.0 K cassette CG12304 chr3L + chr3L_15576982_15577386 chr3L_15576982_15577096;chr3L_15577196_15577386 chr3L_15577097_15577195 chr3L_15576765_15576981;chr3L_15577387_15577539 20.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 52.46 NA NA NA NA NA NA NA NA 10.42 NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette fon,I_chr2L_19385355_19385669,E_chr2L_19385377_19386086,CE_chr2L_19385715_19386086,I_chr2L_19388570_19389922 chr2L - chr2L_19385364_19385779;chr2L_19385355_19385779 chr2L_19385355_19385669,chr2L_19385364_19385669;chr2L_19385706_19385779 chr2L_19385670_19385705 chr2L_19385277_19385354;chr2L_19385780_19385792 36.84 NA NA NA NA NA 25.81 NA NA NA NA NA NA NA NA 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.81 21.74 21.43 NA NA NA NA NA NA NA 25.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.93 8.2889083594029473e-17 N cassette CG18659,E_chr2R_5011363_5019110,I_chr2R_5016147_5016997 chr2R - chr2R_5016147_5018987 chr2R_5016147_5018668;chr2R_5018864_5018987 chr2R_5018669_5018863 chr2R_5016047_5016146;chr2R_5018988_5019370 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.3e-05 N cassette Cg25C chr2L + chr2L_5030238_5030854 chr2L_5030238_5030741;chr2L_5030791_5030854 chr2L_5030742_5030790 chr2L_5030137_5030237;chr2L_5030855_5031802 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Fur1,I_chr3R_21179590_21179870,CEI_chr3R_21210600_21222433,I_chr3R_21257704_21287086 chr3R - chr3R_21180038_21181945 chr3R_21180038_21180669;chr3R_21181801_21181945 chr3R_21180670_21181800 chr3R_21179871_21180037;chr3R_21181946_21182064 4.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA 23.08 NA NA 24.14 NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.15 0.0 N cassette puc,CG7878,I_chr3R_3952846_3953762 chr3R + chr3R_3931818_3936798 chr3R_3931818_3933961;chr3R_3934101_3936798 chr3R_3933962_3934100 chr3R_3931090_3931817;chr3R_3936799_3937023 100.00 NA NA 70.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Rm62 chr3R - chr3R_1830849_1833758 chr3R_1830849_1831671;chr3R_1831837_1833758 chr3R_1831672_1831836 chr3R_1829739_1830848;chr3R_1833759_1834028 0.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette katanin-60 chr3R - chr3R_1056348_1057778 chr3R_1056348_1056714;chr3R_1057036_1057778 chr3R_1056715_1057035 chr3R_1055744_1056347;chr3R_1057779_1057940 97.22 NA NA 70.69 NA NA NA 86.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2051235999999994e-11 N cassette PMCA,I_chr4_371836_372509,I_chr4_373671_374568,I_chr4_376108_379519 chr4 - chr4_371317_372509 chr4_371317_371390;chr4_371836_372509 chr4_371391_371835 chr4_371229_371316;chr4_372510_372609 100.00 NA NA 89.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00099099999999999991 K cassette I_chr2R_13334737_13336615,I_chr2R_13334737_13336769,mthl3 chr2R - chr2R_13336331_13336769 chr2R_13336331_13336615;chr2R_13336708_13336769 chr2R_13336616_13336707 chr2R_13336084_13336330;chr2R_13336770_13336869 6.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.91 NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG8486,I_chr2L_8182451_8183191 chr2L + chr2L_8184851_8186116 chr2L_8184851_8185125;chr2L_8185279_8186116 chr2L_8185126_8185278 chr2L_8184815_8184850;chr2L_8186117_8186197 12.20 NA NA 1.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.81 NA NA NA NA NA 30.77 25.00 NA NA 30.77 NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.3056524948745205e-18 N cassette aru,I_chr2L_864795_867505 chr2L - chr2L_864795_865826 chr2L_864795_864876;chr2L_865061_865826 chr2L_864877_865060 chr2L_864695_864794;chr2L_865827_865847 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.52 NA NA NA NA NA NA 43.90 NA NA 26.53 NA NA NA NA NA NA NA 46.51 61.54 NA 60.00 42.50 NA NA NA NA NA 57.89 66.67 NA 65.08 NA NA 47.37 NA NA 61.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.41 0.0 K cassette DCAP,RI_chr2R_6183553_6192101,I_chr2R_6188094_6192101 chr2R + chr2R_6181439_6182116 chr2R_6181439_6181654;chr2R_6181688_6182116 chr2R_6181655_6181687 chr2R_6181366_6181438;chr2R_6182117_6182270 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00056400000000000005 K cassette MRP,I_chr2L_12727117_12729243,F_chr2L_12727117_12736035 chr2L + chr2L_12727117_12737958 chr2L_12727117_12728577;chr2L_12728799_12737958 chr2L_12728578_12728798 chr2L_12727017_12727116;chr2L_12737959_12738176 11.54 NA NA NA NA 26.32 21.67 24.44 24.56 NA NA 42.00 28.00 26.32 NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA 22.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette Cip4,I_chr3L_4363128_4363769,I_chr3L_4363386_4363987 chr3L - chr3L_4327918_4338066 chr3L_4327918_4336268;chr3L_4336320_4338066 chr3L_4336269_4336319 chr3L_4327773_4327917;chr3L_4338067_4338182 100.00 NA NA NA NA NA 68.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette slik,I_chr2R_20286707_20287372,REI_chr2R_20287415_20287722,I_chr2R_20288968_20289185,I_chr2R_20289332_20290093 chr2R - chr2R_20280727_20283565 chr2R_20280727_20281010;chr2R_20281038_20283565 chr2R_20281011_20281037 chr2R_20279743_20280726;chr2R_20283566_20283698 43.48 NA NA 18.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.69 NA NA NA NA NA 67.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.10 NA NA NA 59.15 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.95 1.0046845560360098e-19 N cassette CG7956,CE_chr3R_17350242_17350304 chr3R + chr3R_17350238_17351248 chr3R_17350238_17350300;chr3R_17350372_17351248 chr3R_17350301_17350371 chr3R_17350142_17350237;chr3R_17351249_17351485 66.90 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 47.50 NA NA NA NA NA NA 86.92 NA NA NA NA 49.09 NA NA 48.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.89 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA 0.0 N cassette CG32521,CREF_chrX_21082827_21152068,EF_chrX_21094675_21152068 chrX - chrX_21082827_21150208;chrX_21082827_21152072 chrX_21082827_21094606;chrX_21094675_21150208,chrX_21094675_21152072 chrX_21094607_21094674 chrX_21082727_21082826;chrX_21152073_21152168 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.88 NA NA NA NA NA NA 63.16 55.56 NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA 47.62 40.00 NA NA 58.82 41.67 NA NA NA NA 50.00 58.33 NA NA NA NA NA NA NA 1.5546170389853583e-34 N cassette Gprk2 chr3R + chr3R_27280223_27280928 chr3R_27280223_27280296;chr3R_27280487_27280928 chr3R_27280297_27280486 chr3R_27280117_27280222;chr3R_27280929_27281177 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010950000000000001 K cassette Stat92E,att-ORFB chr3R - chr3R_16363186_16364942 chr3R_16363186_16364266;chr3R_16364438_16364942 chr3R_16364267_16364437 chr3R_16362916_16363185;chr3R_16364943_16365057 6.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.46 17.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG31638,I_chr2L_6494875_6494937 chr2L + chr2L_6495105_6496056 chr2L_6495105_6495243;chr2L_6495869_6496056 chr2L_6495244_6495868 chr2L_6494938_6495104;chr2L_6496057_6496971 50.00 NA NA NA NA NA NA 28.30 NA 28.57 NA 34.78 25.93 NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA 29.41 NA NA 81.58 NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA 34.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.8159997040486379e-22 K cassette ham chr2L - chr2L_18776375_18779804 chr2L_18776375_18776471;chr2L_18776604_18779804 chr2L_18776472_18776603 chr2L_18776149_18776374;chr2L_18779805_18780331 54.74 NA NA 13.16 NA NA NA NA NA NA 96.97 NA 68.75 NA NA 66.10 NA NA NA NA 97.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 0.0 K cassette RI_chrX_8468338_8469380,I_chrX_8468338_8477573,CG12065,I_chrX_8469524_8477579,CE_chrX_8469528_8477573 chrX + chrX_8468441_8477573 chrX_8468441_8469386;chrX_8469524_8477573 chrX_8469387_8469523 chrX_8468351_8468440;chrX_8477574_8477673 88.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.60 NA NA NA NA NA NA 64.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette lqf,I_chr3L_7522287_7522807 chr3L + chr3L_7528745_7530075 chr3L_7528745_7529810;chr3L_7529870_7530075 chr3L_7529811_7529869 chr3L_7528643_7528744;chr3L_7530076_7530479 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 28.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 1.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG9044 chr2L + chr2L_5952628_5953415 chr2L_5952628_5952988;chr2L_5953058_5953415 chr2L_5952989_5953057 chr2L_5952445_5952627;chr2L_5953416_5954477 58.82 NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA 86.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.4612038000000008e-05 K cassette osa chr3R - chr3R_13520018_13521644 chr3R_13520018_13520555;chr3R_13521036_13521644 chr3R_13520556_13521035 chr3R_13519858_13520017;chr3R_13521645_13521833 12.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.20 NA NA 22.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.11 NA NA NA NA NA NA NA 28.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1674,I_chr4_253475_257020,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_252604_254890 chr4_252604_252904;chr4_253475_254890 chr4_252905_253474 chr4_252584_252603;chr4_254891_254971 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 83.33 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA 1.0965631917732106e-13 K cassette CG3209,I_chr2R_19957751_19959513,RI_chr2R_19957766_19960227,I_chr2R_19959163_19959513 chr2R + chr2R_19957766_19960227 chr2R_19957766_19959517;chr2R_19959748_19960227 chr2R_19959518_19959747 chr2R_19957666_19957765;chr2R_19960228_19960327 19.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.60 NA NA NA NA 46.51 NA NA 35.34 6.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.43 0.0 K cassette Mef2,I_chr2R_5804418_5804961,I_chr2R_5806354_5806933,CREFI_chr2R_5809509_5845628,I_chr2R_5814375_5816404,RI_chr2R_5846889_5846948 chr2R - chr2R_5804418_5805442;chr2R_5804397_5805442 chr2R_5804397_5804961,chr2R_5804418_5804961;chr2R_5805037_5805442 chr2R_5804962_5805036 chr2R_5804318_5804396;chr2R_5805443_5805858 44.22 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.00 NA NA 27.27 NA NA 14.29 20.83 NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA 28.00 NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette slgA,I_chrX_21247694_21251677,I_chrX_21253735_21253820 chrX + chrX_21247694_21251677;chrX_21247694_21250999 chrX_21247694_21250614;chrX_21250737_21251677,chrX_21250737_21250999 chrX_21250615_21250736 chrX_21247594_21247693;chrX_21251678_21251759 66.67 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 41.38 NA NA NA NA 20.00 41.67 NA NA NA NA 52.00 NA NA 37.50 NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette kuz,E_chr2L_13550294_13551106,CE_chr2L_13558833_13594255,F_chr2L_13635998_13637287,RI_chr2L_13636519_13636577,I_chr2L_13636762_13637287 chr2L + chr2L_13636214_13637287 chr2L_13636214_13636383;chr2L_13636762_13637287 chr2L_13636384_13636761 chr2L_13636100_13636213;chr2L_13637288_13637387 82.43 NA NA 93.08 52.63 47.83 NA NA NA NA NA 98.28 NA NA NA 97.80 NA 92.54 NA 97.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 97.40 95.12 NA 93.30 NA NA 96.08 NA NA NA 95.45 98.25 NA 100.00 NA 95.00 95.45 NA 97.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.10 0.0 K cassette CG5674 chr2L + chr2L_17963606_17971871;chr2L_17963606_17972262 chr2L_17963606_17969371;chr2L_17969519_17971871,chr2L_17969519_17972262 chr2L_17969372_17969518 chr2L_17963396_17963605;chr2L_17972263_17974832 96.23 NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00015100000000000001 K cassette syd,I_chr3L_7924891_7925400 chr3L - chr3L_7926335_7928477 chr3L_7926335_7926870;chr3L_7926892_7928477 chr3L_7926871_7926891 chr3L_7926098_7926334;chr3L_7928478_7929184 4.82 NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00040367778399999998 K cassette bbc,I_chr2R_9376554_9377246,REI_chr2R_9379401_9381986 chr2R - chr2R_9375638_9378939;chr2R_9375638_9377246 chr2R_9375638_9376421;chr2R_9376554_9377246,chr2R_9376554_9378939 chr2R_9376422_9376553 chr2R_9375479_9375637;chr2R_9378940_9379098 22.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.48 12.00 NA NA NA NA NA NA NA 8.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG33558,I_chr2R_2816779_2817354,RI_chr2R_2817876_2819347,I_chr2R_2820149_2820628,EI_chr2R_2820947_2821570,CREI_chr2R_2832933_2850384 chr2R - chr2R_2817876_2820628 chr2R_2817876_2818567;chr2R_2820203_2820628 chr2R_2818568_2820202 chr2R_2817851_2817875;chr2R_2820629_2820728 64.71 53.85 NA NA 54.55 38.89 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.84 49.09 NA 54.17 NA 54.17 NA NA NA NA NA NA NA 51.85 NA NA 48.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.00 NA NA 32.14 48.15 NA 54.17 42.86 NA NA NA NA 0.0 N cassette gish chr3R + chr3R_12100892_12115352 chr3R_12100892_12107802;chr3R_12108131_12115352 chr3R_12107803_12108130 chr3R_12100886_12100891;chr3R_12115353_12115561 46.43 NA 70.83 NA NA 78.05 NA NA NA NA NA NA 73.81 76.92 72.92 NA 78.79 NA 84.44 27.61 71.05 66.67 35.68 NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.35 34.55 NA 36.08 NA NA NA NA NA NA NA 72.41 34.95 NA NA 0.0 K cassette B52,F_chr3R_9488762_9491174,E_chr3R_9488770_9491174,RI_chr3R_9489655_9489713 chr3R + chr3R_9488774_9489733 chr3R_9488774_9489176;chr3R_9489655_9489733 chr3R_9489177_9489654 chr3R_9488692_9488773;chr3R_9489734_9489796 92.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0036110000000000001 K cassette Adar,I_chrX_1668256_1682696,I_chrX_1674594_1674717 chrX + chrX_1669772_1672644 chrX_1669772_1672405;chrX_1672594_1672644 chrX_1672406_1672593 chrX_1669733_1669771;chrX_1672645_1672732 48.48 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4029274166560002e-05 K cassette gus,I_chr2R_1009158_1009345,RI_chr2R_1009158_1011540,I_chr2R_1009346_1015730 chr2R - chr2R_1009158_1015730;chr2R_1009158_1009487 chr2R_1009158_1009241;chr2R_1009346_1015730,chr2R_1009346_1009487 chr2R_1009242_1009345 chr2R_1009058_1009157;chr2R_1015731_1015742 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016410000000000001 K cassette sdt,E_chrX_8118081_8119115,C_chrX_8118081_8119117,I_chrX_8131684_8131842 chrX + chrX_8118081_8121903 chrX_8118081_8119111;chrX_8120117_8121903 chrX_8119112_8120116 chrX_8117989_8118080;chrX_8121904_8122131 60.42 NA NA 87.93 NA NA NA NA NA NA 39.13 NA NA NA NA NA 17.39 48.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.58 NA NA NA NA NA 48.98 NA NA NA NA NA NA NA 47.50 NA NA NA NA 0.0 K cassette Ect4,I_chr3L_8075556_8086158,I_chr3L_8089973_8090123,I_chr3L_8089977_8091445,I_chr3L_8091826_8092243,I_chr3L_8098397_8101385,I_chr3L_8098758_8101738,I_chr3L_8100030_8101385 chr3L + chr3L_8089977_8091445;chr3L_8089973_8091445 chr3L_8089973_8090070,chr3L_8089977_8090070;chr3L_8090273_8091445 chr3L_8090071_8090272 chr3L_8089959_8089972;chr3L_8091446_8091545 73.33 NA NA NA 50.00 60.87 NA NA NA NA 56.25 NA NA NA 62.50 NA NA NA 62.16 NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2860083642309448e-24 N cassette CG32032 chr3L + chr3L_9086412_9086892 chr3L_9086412_9086719;chr3L_9086831_9086892 chr3L_9086720_9086830 chr3L_9086163_9086411;chr3L_9086893_9087041 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.17 NA NA NA NA NA NA 80.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N cassette ire-1,FI_chr3R_15689914_15690042 chr3R - chr3R_15683407_15686607 chr3R_15683407_15686368;chr3R_15686484_15686607 chr3R_15686369_15686483 chr3R_15682963_15683406;chr3R_15686608_15687013 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.3999999999999996e-05 N cassette Nos,I_chr2L_10826086_10826539 chr2L - chr2L_10807128_10812286 chr2L_10807128_10807290;chr2L_10807625_10812286 chr2L_10807291_10807624 chr2L_10806775_10807127;chr2L_10812287_10812302 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000112 K cassette mthl4 chr2R - chr2R_13333190_13333481 chr2R_13333190_13333255;chr2R_13333425_13333481 chr2R_13333256_13333424 chr2R_13332995_13333189;chr2R_13333482_13333736 90.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.10 NA NA 79.25 NA NA NA NA 66.67 NA NA 78.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Atpalpha,I_chr3R_16788018_16789830,I_chr3R_16792336_16798894,I_chr3R_16792925_16794113 chr3R + chr3R_16783890_16789446;chr3R_16785103_16789446 chr3R_16785103_16787936,chr3R_16783890_16787936;chr3R_16788018_16789446 chr3R_16787937_16788017 chr3R_16783790_16783889;chr3R_16789447_16789578 57.65 NA 46.43 43.06 31.07 28.33 31.05 41.94 NA NA 12.00 87.36 NA 43.70 43.97 44.83 27.86 44.79 42.75 72.77 27.96 NA NA 68.00 NA 44.00 NA NA 77.27 NA NA 70.37 NA 36.25 NA 71.32 NA NA NA NA NA 40.67 44.95 NA 76.27 68.07 NA 75.00 39.44 NA NA NA NA NA 44.52 NA NA NA 0.0 K cassette kst,I_chr3L_3365752_3365816,I_chr3L_3367008_3367514 chr3L + chr3L_3366311_3367514 chr3L_3366311_3366443;chr3L_3366963_3367514 chr3L_3366444_3366962 chr3L_3366200_3366310;chr3L_3367515_3367614 67.08 NA NA 94.81 NA NA 48.60 53.79 NA NA 48.26 NA 38.38 NA NA 94.49 54.86 50.10 NA NA NA 83.45 NA NA NA 54.86 NA 79.39 78.52 86.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.67 NA NA NA NA NA 53.64 NA NA NA NA NA 51.18 NA NA NA 0.0 K cassette Aldh-III,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3355332_3356864 chr2R_3355332_3355926;chr2R_3356043_3356864 chr2R_3355927_3356042 chr2R_3355296_3355331;chr2R_3356865_3357018 97.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00053899999999999998 K cassette I_chr2R_2754447_2755071,Spn4,CG9454 chr2R - chr2R_2764032_2764725 chr2R_2764032_2764100;chr2R_2764239_2764725 chr2R_2764101_2764238 chr2R_2763778_2764031;chr2R_2764726_2764867 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017201000000000001 K cassette Taf12,RI_chr3R_7504595_7505288,I_chr3R_7504949_7505288 chr3R - chr3R_7504907_7505288 chr3R_7504907_7505075;chr3R_7505121_7505288 chr3R_7505076_7505120 chr3R_7504849_7504906;chr3R_7505289_7505388 44.44 NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.35 NA 16.00 NA NA NA NA NA 1.5381347870996532e-07 K cassette CPTI,I_chr2R_6358255_6358734,I_chr2R_6358255_6359122,RI_chr2R_6358779_6358944,I_chr2R_6360956_6365128 chr2R - chr2R_6358255_6359122;chr2R_6358255_6358944 chr2R_6358255_6358718;chr2R_6358779_6359122,chr2R_6358779_6358944 chr2R_6358719_6358778 chr2R_6358234_6358254;chr2R_6359123_6359222 98.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016620000000000001 K cassette tou,I_chr2R_7468394_7468453,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7468904_7470519 chr2R_7468904_7469132;chr2R_7469651_7470519 chr2R_7469133_7469650 chr2R_7468454_7468903;chr2R_7470520_7474530 52.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.24 NA NA NA NA NA 63.82 NA NA NA NA NA 63.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9275509838199996e-13 K cassette sno chrX - chrX_13094938_13097742 chrX_13094938_13096772;chrX_13097091_13097742 chrX_13096773_13097090 chrX_13094500_13094937;chrX_13097743_13098183 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.351450799999999e-05 K cassette CG10737 chr2R + chr2R_15051681_15058190 chr2R_15051681_15052668;chr2R_15053032_15058190 chr2R_15052669_15053031 chr2R_15051670_15051680;chr2R_15058191_15058666 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA 7.8009504299999994e-08 K cassette CG31650,I_chr2L_5041540_5041687,RI_chr2L_5041540_5041697,RI_chr2L_5041540_5042490,I_chr2L_5042888_5042983,I_chr2L_5042891_5043016,RI_chr2L_5042935_5042983,I_chr2L_5043017_5043077 chr2L - chr2L_5041540_5042490 chr2L_5041540_5041688;chr2L_5041837_5042490 chr2L_5041689_5041836 chr2L_5041440_5041539;chr2L_5042491_5042590 99.12 NA NA 86.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020630000000000002 K cassette ssp4,I_chr2R_13409412_13411328,I_chr2R_13409412_13411588,I_chr2R_13414489_13414718,I_chr2R_13414818_13414880,I_chr2R_13418952_13419022 chr2R - chr2R_13410466_13411588;chr2R_13409406_13411588;chr2R_13408434_13411588;chr2R_13411077_13411588 chr2R_13408434_13411328,chr2R_13409406_13411328,chr2R_13410466_13411328,chr2R_13411077_13411328;chr2R_13411404_13411588 chr2R_13411329_13411403 chr2R_13408151_13408433;chr2R_13411589_13411688 48.15 NA 62.50 69.57 33.33 NA 15.58 63.46 NA 18.18 31.25 NA NA NA NA 66.67 67.65 NA NA 63.77 NA 13.56 NA NA 36.67 NA NA 25.71 30.56 NA NA 33.33 61.90 NA NA NA NA NA NA 24.05 29.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.88 58.33 0.0 K cassette glo,REI_chr3R_7644679_7644932,RI_chr3R_7644683_7644880,I_chr3R_7647556_7647628 chr3R - chr3R_7642480_7643727 chr3R_7642480_7642915;chr3R_7643061_7643727 chr3R_7642916_7643060 chr3R_7642334_7642479;chr3R_7643728_7643827 89.47 NA NA 72.73 NA NA NA NA NA 69.86 NA NA NA NA NA NA NA 99.88 NA NA NA NA NA NA 76.83 NA 78.63 NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette heph,I_chr3R_27699822_27771343,I_chr3R_27707594_27801169,RI_chr3R_27795508_27798223,RI_chr3R_27798276_27801169,I_chr3R_27801288_27801596 chr3R - chr3R_27784850_27805244;chr3R_27784850_27798223;chr3R_27784850_27801169 chr3R_27784850_27795477;chr3R_27795508_27798223,chr3R_27795508_27801169,chr3R_27795508_27805244 chr3R_27795478_27795507 chr3R_27784757_27784849;chr3R_27805245_27805341 30.77 NA NA NA NA NA NA NA 20.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6000000000000003e-05 K cassette HDAC4,F_chrX_13159070_13159174,I_chrX_13170581_13179235,I_chrX_13178996_13179235 chrX - chrX_13162296_13163860 chrX_13162296_13162726;chrX_13162874_13163860 chrX_13162727_13162873 chrX_13161355_13162295;chrX_13163861_13163991 99.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette caz,RI_chrX_16183356_16185973 chrX + chrX_16183356_16185973 chrX_16183356_16185089;chrX_16185125_16185973 chrX_16185090_16185124 chrX_16183259_16183355;chrX_16185974_16186073 70.11 NA NA NA NA 93.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.03 NA NA NA 55.70 NA 27.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG14619,RI_chrX_21860097_21868647,I_chrX_21865109_21865522,I_chrX_21869837_21869915 chrX + chrX_21860097_21868000 chrX_21860097_21864235;chrX_21865109_21868000 chrX_21864236_21865108 chrX_21859997_21860096;chrX_21868001_21868211 35.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.36 NA NA NA NA NA 24.51 NA 23.16 24.62 NA 22.22 NA NA 65.91 NA NA 67.61 NA NA 62.38 21.52 21.25 25.00 NA NA NA NA 23.86 NA NA 25.00 55.13 NA 23.08 23.81 22.03 NA 17.39 NA NA 20.51 64.52 9.0236397116443295e-57 K cassette Taf1 chr3R + chr3R_2480387_2480930 chr3R_2480387_2480707;chr3R_2480804_2480930 chr3R_2480708_2480803 chr3R_2480192_2480386;chr3R_2480931_2481770 3.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette vap,RI_chrX_15897976_15899352,I_chrX_15897976_15899654,I_chrX_15898011_15899654,I_chrX_15898427_15899017,RI_chrX_15898427_15899654,RI_chrX_15899237_15899352,I_chrX_15899237_15899654 chrX - chrX_15898120_15899352;chrX_15898120_15899017;chrX_15898120_15899654 chrX_15898120_15898360;chrX_15898478_15899654,chrX_15898478_15899017,chrX_15898478_15899352 chrX_15898361_15898477 chrX_15897748_15898119;chrX_15899655_15899705 56.41 68.18 NA NA NA NA NA 77.97 NA 29.17 NA 67.92 NA NA NA NA NA 29.03 NA 67.92 76.19 37.50 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 67.21 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Cp1,Aats-phe chr2R + chr2R_9852992_9854259 chr2R_9852992_9853109;chr2R_9853291_9854259 chr2R_9853110_9853290 chr2R_9852694_9852991;chr2R_9854260_9854474 43.33 NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6471700000000003e-06 K cassette CG6954,I_chr3R_18492801_18502630 chr3R + chr3R_18493765_18502630 chr3R_18493765_18501669;chr3R_18501921_18502630 chr3R_18501670_18501920 chr3R_18493705_18493764;chr3R_18502631_18502730 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045786 K cassette cora,I_chr2R_15125277_15130573,I_chr2R_15125940_15130208,I_chr2R_15129291_15129988 chr2R + chr2R_15129901_15130208 chr2R_15129901_15129994;chr2R_15130091_15130208 chr2R_15129995_15130090 chr2R_15129679_15129900;chr2R_15130209_15130308 99.08 NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette eIF4G,RI_chr4_947288_948286,I_chr4_948813_950447 chr4 - chr4_947288_950447 chr4_947288_948018;chr4_948778_950447 chr4_948019_948777 chr4_947188_947287;chr4_950448_950547 7.59 NA NA NA NA NA NA NA NA 21.15 21.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.86 NA NA NA NA NA NA 20.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette CG1674,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_261460_263795;chr4_261460_263891 chr4_261460_263113;chr4_263306_263891,chr4_263306_263795 chr4_263114_263305 chr4_261360_261459;chr4_263892_263991 96.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0048820000000000001 K cassette klar,I_chr3L_462559_472609,RI_chr3L_517594_539898 chr3L - chr3L_451772_454108 chr3L_451772_452837;chr3L_453489_454108 chr3L_452838_453488 chr3L_451127_451771;chr3L_454109_454405 97.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K cassette Stat92E,I_chr3R_16367780_16376442,I_chr3R_16367780_16377802,I_chr3R_16367815_16368548,att-ORFB chr3R - chr3R_16367276_16377802;chr3R_16367276_16376442 chr3R_16367276_16367401;chr3R_16367815_16376442,chr3R_16367815_16377802 chr3R_16367402_16367814 chr3R_16366245_16367275;chr3R_16377803_16377902 46.15 NA NA 25.45 NA NA 27.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.66 NA NA NA NA NA 57.76 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.63 35.66 NA NA NA NA NA NA NA 63.28 NA NA NA 35.24 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 34.78 0.0 K cassette I_chr2L_71805_74902,galectin,I_chr2L_72082_75077,RI_chr2L_72978_75077,RI_chr2L_73693_75077,RI_chr2L_74573_75077 chr2L + chr2L_74573_75077;chr2L_72978_75077;chr2L_73693_75077 chr2L_73693_74902,chr2L_72978_74902,chr2L_74573_74902;chr2L_75019_75077 chr2L_74903_75018 chr2L_72878_72977;chr2L_75078_75177 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA 73.08 NA NA NA NA NA 74.07 78.26 NA NA 78.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA 4.2280121016303074e-14 K cassette Pep,I_chr3L_17637180_17637918 chr3L - chr3L_17633154_17636462 chr3L_17633154_17634125;chr3L_17634356_17636462 chr3L_17634126_17634355 chr3L_17631217_17633153;chr3L_17636463_17636826 89.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.40 NA NA NA NA NA NA 76.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG13822,RI_chr3R_19503360_19503522 chr3R + chr3R_19503360_19503577 chr3R_19503360_19503522 chr3R_19503260_19503359;chr3R_19503578_19503622 2.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA 14.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6261871561999997e-08 K alternative_acceptor CG3714,I_chr2L_4190825_4191774,I_chr2L_4192969_4193324,I_chr2L_4195905_4196470,I_chr2L_4196780_4197306,RI_chr2L_4196780_4197951,I_chr2L_4196815_4197306,I_chr2L_4196815_4197951 chr2L - chr2L_4196780_4197146 chr2L_4196815_4197146 chr2L_4197147_4197191;chr2L_4196715_4196779 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00021800000000000001 K alternative_acceptor oho23B,I_chr2L_2856176_2856244,I_chr2L_2856573_2856630,RI_chr2L_2856673_2856772 chr2L + chr2L_2856306_2856391 chr2L_2856306_2856376 chr2L_2856279_2856305;chr2L_2856392_2856568 99.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Pi4KIIalpha chr3R - chr3R_1389068_1389263 chr3R_1389095_1389263 chr3R_1389264_1389309;chr3R_1388687_1389067 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015809 K alternative_acceptor CG9795,EI_chr3R_145575_147566,RI_chr3R_145613_145675 chr3R + chr3R_145613_147566 chr3R_145613_145675 chr3R_145513_145612;chr3R_147567_147666 31.03 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA 60.71 NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 1.9408201471599682e-26 K alternative_acceptor TMS1 chr3L + chr3L_16407594_16407920;chr3L_16407594_16407905;chr3L_16407594_16407914;chr3L_16407594_16407902 chr3L_16407594_16407893 chr3L_16407384_16407593;chr3L_16407921_16408056 46.95 NA NA 34.47 NA NA 29.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.23 NA NA NA NA NA NA NA NA 65.98 NA 67.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.29 0.0 N alternative_acceptor Xrp1,I_chr3R_14741648_14750799,I_chr3R_14750298_14750799 chr3R + chr3R_14749868_14750799 chr3R_14749868_14750009 chr3R_14749792_14749867;chr3R_14750800_14750899 18.52 NA NA 33.77 NA NA NA NA NA NA 40.00 NA 37.50 NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.5820159296596012e-09 K alternative_acceptor cic chr3R + chr3R_16125516_16125689 chr3R_16125516_16125674 chr3R_16125423_16125515;chr3R_16125690_16125874 75.71 NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 97.87 93.75 55.43 50.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6057844675198816e-12 K alternative_acceptor CG6043,I_chr2L_13267973_13268086 chr2L + chr2L_13274377_13274651;chr2L_13274377_13274642 chr2L_13274377_13274690 chr2L_13274310_13274376;chr2L_13274691_13274770 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039373999999999999 K alternative_acceptor CG3907,I_chr2R_19909065_19909249,I_chr2R_19909692_19909755 chr2R - chr2R_19909608_19909755;chr2R_19909692_19909755 chr2R_19909635_19909755 chr2R_19909756_19909779;chr2R_19909592_19909607 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043302 K alternative_acceptor ird5,I_chr3R_11874883_11874942,CG10185 chr3R - chr3R_11874534_11874942 chr3R_11874883_11874942 chr3R_11874943_11875042;chr3R_11873964_11874533 6.06 NA NA 17.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.6693599999999994e-05 K alternative_acceptor Strn-Mlck,I_chr2R_11838019_11838662 chr2R - chr2R_11837971_11838662 chr2R_11838019_11838662 chr2R_11838663_11838663;chr2R_11837919_11837970 3.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor I_chr3R_22696095_22697413,Rb97D chr3R - chr3R_22699278_22699581 chr3R_22699401_22699581 chr3R_22699582_22699720;chr3R_22698253_22699277 62.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4004999999999999e-08 K alternative_acceptor Bruce chr3R - chr3R_6141764_6141923 chr3R_6141797_6141923 chr3R_6141924_6143270;chr3R_6141518_6141763 96.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010073 K alternative_acceptor CG3760,CG3770,CG12851 chr2R + chr2R_20826741_20826796;chr2R_20826741_20826799 chr2R_20826741_20826793 chr2R_20826672_20826740;chr2R_20826800_20826860 82.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01085 N alternative_acceptor CG13807 chr3L + chr3L_2263295_2263374 chr3L_2263295_2263355 chr3L_2262781_2263294;chr3L_2263375_2263666 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021150000000000001 K alternative_acceptor CG17838,I_chr3R_16623576_16628011 chr3R + chr3R_16623576_16624036 chr3R_16623576_16624012 chr3R_16623476_16623575;chr3R_16624037_16624131 51.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4532000000000001e-07 K alternative_acceptor REG chrX + chrX_13106426_13106496 chrX_13106426_13106482 chrX_13106389_13106425;chrX_13106497_13106991 8.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor noncoding_23420,hep chrX - chrX_12975077_12975545 chrX_12975152_12975545 chrX_12975546_12976097;chrX_12974671_12975076 34.04 NA NA 57.03 NA NA 16.00 48.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA 47.06 63.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 22.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.36 0.0 K alternative_acceptor Zyx102EF,I_chr4_1079131_1080044,I_chr4_1079946_1080044,RI_chr4_1079959_1080044,I_chr4_1080463_1081366,REF_chr4_1081261_1081452,F_chr4_1081280_1081398,F_chr4_1081280_1081452 chr4 - chr4_1079978_1080044;chr4_1079959_1080044 chr4_1079915_1080044 chr4_1080045_1080072;chr4_1079859_1079914 55.56 NA NA NA NA NA 17.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0084290000000000007 K alternative_acceptor RI_chrX_502548_513324,CG13366,I_chrX_509497_513324,I_chrX_513176_513324,I_chrX_513519_513631 chrX - chrX_509546_513324 chrX_513176_513324 chrX_513325_513424;chrX_508807_509545 0.00 NA NA 18.18 25.00 NA 33.33 22.22 28.57 NA NA 18.18 20.00 16.67 33.33 66.67 NA NA 20.00 50.00 NA 33.33 14.29 NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 12.50 NA 22.22 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor zetaCOP chr3L - chr3L_16664943_16665553 chr3L_16665251_16665553 chr3L_16665554_16665644;chr3L_16664764_16664942 1.04 NA NA 11.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor hppy,I_chr2R_15066378_15066915,I_chr2R_15105700_15106080,I_chr2R_15106144_15108248 chr2R + chr2R_15066378_15066915;chr2R_15066378_15067003 chr2R_15066378_15066881 chr2R_15066360_15066377;chr2R_15067004_15067015 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0060200000000000002 K alternative_acceptor CG32364 chr3L - chr3L_8203336_8203412 chr3L_8203358_8203412 chr3L_8203413_8203481;chr3L_8203272_8203335 88.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 98.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035791000000000003 K alternative_acceptor Gbeta13F,I_chrX_15754284_15755167,I_chrX_15754284_15755184,RI_chrX_15754356_15755268,I_chrX_15754356_15755409,RI_chrX_15755345_15755409 chrX + chrX_15754356_15755184;chrX_15754356_15755256;chrX_15754356_15755268;chrX_15754356_15755409 chrX_15754356_15755172 chrX_15754256_15754355;chrX_15755410_15755509 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.11 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.2078936000000012e-05 N alternative_acceptor CG18854,RI_chr2L_9789598_9789790,I_chr2L_9789694_9789790,REI_chr2L_9789718_9789790,I_chr2L_9790307_9790615,I_chr2L_9790310_9790556 chr2L - chr2L_9789733_9789790;chr2L_9789740_9789790;chr2L_9789718_9789790;chr2L_9789751_9789790;chr2L_9789598_9789790 chr2L_9789694_9789790 chr2L_9789791_9789832;chr2L_9789594_9789597 11.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CCS,I_chr2R_6009946_6010014 chr2R - chr2R_6009946_6010014;chr2R_6009964_6010014 chr2R_6009951_6010014 chr2R_6010015_6010040;chr2R_6009884_6009945 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036575000000000003 K alternative_acceptor l(3)82Fd,I_chr3R_1147660_1148709 chr3R - chr3R_1120578_1121362 chr3R_1120602_1121362 chr3R_1121363_1121517;chr3R_1120028_1120577 71.43 NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01644 K alternative_acceptor noncoding_20684,R_chr4_488962_489782,I_chr4_490841_491639 chr4 + chr4_488621_489782 chr4_488621_489415 chr4_488555_488620;chr4_489783_489860 36.93 NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0050650000000000001 K alternative_acceptor ssp4,I_chr2R_13414489_13414718,I_chr2R_13414818_13414880,I_chr2R_13418952_13419022 chr2R - chr2R_13413919_13414338;chr2R_13413823_13414338 chr2R_13413922_13414338 chr2R_13414339_13414406;chr2R_13412209_13413822 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA 89.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019595999999999999 K alternative_acceptor CG42507,Trl,I_chr3L_14745733_14745798,CI_chr3L_14750431_14753667,I_chr3L_14754175_14754238 chr3L - chr3L_14744876_14745798 chr3L_14745733_14745798 chr3L_14745799_14745836;chr3L_14744367_14744875 60.77 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 0.00040935857999999998 K alternative_acceptor jet chr2L - chr2L_4948560_4948897 chr2L_4948772_4948897 chr2L_4948898_4949817;chr2L_4948202_4948559 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001237 K alternative_acceptor Usp7,I_chrX_11919055_11919146,I_chrX_11922059_11922456 chrX - chrX_11919091_11919146;chrX_11919055_11919146 chrX_11919079_11919146 chrX_11919147_11919211;chrX_11918989_11919054 27.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000135 K alternative_acceptor CG15514 chr3R - chr3R_25686337_25686428 chr3R_25686358_25686428 chr3R_25686429_25687281;chr3R_25685755_25686336 40.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030272 K alternative_acceptor Ate1 chr2R - chr2R_16144114_16144194 chr2R_16144135_16144194 chr2R_16144195_16144252;chr2R_16143941_16144113 4.71 NA NA 20.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0042950000000000002 K alternative_acceptor noncoding_13380,RI_chr3L_18858228_18858357 chr3L - chr3L_18857669_18858357 chr3L_18858228_18858357 chr3L_18858358_18858457;chr3L_18857324_18857668 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019826 K alternative_acceptor cic,RI_chr3R_16122222_16123529 chr3R + chr3R_16122222_16123529;chr3R_16122222_16124105 chr3R_16122222_16122818 chr3R_16122122_16122221;chr3R_16124106_16124254 2.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.57 NA NA NA NA NA 14.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG12030 chr3L + chr3L_649052_649178 chr3L_649052_649125 chr3L_648517_649051;chr3L_649179_649419 1.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Tango13,I_chrX_13480088_13480998,I_chrX_13483861_13483954 chrX + chrX_13480088_13483954 chrX_13480088_13480998 chrX_13479988_13480087;chrX_13483955_13484054 1.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG1815,I_chr3R_27501104_27501167,I_chr3R_27501104_27501176 chr3R + chr3R_27501104_27501176;chr3R_27501104_27501179 chr3R_27501104_27501167 chr3R_27501004_27501103;chr3R_27501180_27501267 52.38 NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.35 NA NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3867015231999989e-08 K alternative_acceptor CG6656,RI_chr3R_17702199_17702274,CG33092 chr3R + chr3R_17702199_17702296 chr3R_17702199_17702274 chr3R_17702099_17702198;chr3R_17702297_17702306 8.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0085609999999999992 K alternative_acceptor Rm62,RI_chr3R_1834029_1834277 chr3R - chr3R_1834029_1834272 chr3R_1834032_1834272 chr3R_1834273_1834276;chr3R_1833929_1834028 45.12 NA NA NA NA NA 77.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.07 73.68 67.86 15.34 NA NA NA NA 16.07 NA NA NA 67.86 NA NA 7.86 NA NA NA 15.00 14.04 NA NA 16.53 NA NA NA NA 15.38 78.57 NA NA NA 12.68 0.0 N alternative_acceptor CkIIbeta,I_chrX_11686847_11687475,I_chrX_11687161_11687475,I_chrX_11689220_11690898 chrX + chrX_11687552_11687884 chrX_11687552_11687830 chrX_11687476_11687551;chrX_11687885_11687933 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG17508,RI_chr2R_1496995_1497120 chr2R + chr2R_1496995_1497568;chr2R_1496995_1497637 chr2R_1496995_1497120 chr2R_1496895_1496994;chr2R_1497638_1497761 8.11 NA NA 19.74 NA NA 21.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6e-11 K alternative_acceptor betaTub60D chr2R + chr2R_20198354_20198418 chr2R_20198354_20198415 chr2R_20198245_20198353;chr2R_20198419_20198660 37.50 NA 25.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.4377531e-05 K alternative_acceptor AnnIX,I_chr3R_16895383_16895999 chr3R + chr3R_16894742_16896445 chr3R_16894742_16895999 chr3R_16894560_16894741;chr3R_16896446_16896495 16.03 NA NA 5.96 NA NA NA NA NA NA NA 27.07 26.09 NA NA 28.42 NA NA NA NA NA 43.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.47 NA NA NA NA 29.52 0.0 K alternative_acceptor Su(var)2-10,RI_chr2R_5006333_5006392 chr2R + chr2R_5006553_5008568;chr2R_5006553_5007804;chr2R_5006553_5008598 chr2R_5006553_5008282 chr2R_5006405_5006552;chr2R_5008599_5008637 49.02 NA NA 30.00 60.61 NA 66.67 60.98 59.04 NA 70.00 27.08 64.86 NA NA NA 27.59 NA NA NA 61.29 29.41 NA 35.71 NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.42 35.59 35.42 33.33 NA NA NA 67.65 38.64 36.36 NA NA 64.71 61.43 NA NA NA NA NA 62.50 NA NA 67.57 0.0 K alternative_acceptor mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179 chr3L + chr3L_21908110_21908213 chr3L_21908110_21908201 chr3L_21907993_21908109;chr3L_21908214_21908295 60.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 99.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K alternative_acceptor JTBR chr3L - chr3L_1802744_1802803 chr3L_1802754_1802803 chr3L_1802804_1802835;chr3L_1802008_1802743 47.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 92.31 NA NA 88.00 NA 81.82 NA NA NA NA NA NA 100.00 90.24 95.24 90.00 NA NA NA NA NA NA NA 90.91 NA NA NA NA NA NA NA NA 92.31 80.95 NA 4.9975967158583468e-33 K alternative_acceptor I_chr2L_19644636_19644695,REI_chr2L_19702035_19702145,Nf-YB chr2L + chr2L_19736209_19736289 chr2L_19736209_19736272 chr2L_19736042_19736208;chr2L_19736290_19736580 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041374000000000001 K alternative_acceptor CG4980 chr3R - chr3R_23747816_23747920 chr3R_23747854_23747920 chr3R_23747921_23748082;chr3R_23746995_23747815 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4e-05 N alternative_acceptor Moca-cyp chr3R + chr3R_24167182_24167348;chr3R_24167182_24167249;chr3R_24167182_24167243;chr3R_24167182_24167260 chr3R_24167182_24167906 chr3R_24167094_24167181;chr3R_24167907_24167936 27.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.90 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.38 62.50 77.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.70 0.0 K alternative_acceptor CG7970 chr3L + chr3L_1653044_1653141 chr3L_1653044_1653130 chr3L_1652975_1653043;chr3L_1653142_1653254 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00038000000000000002 K alternative_acceptor I_chr2L_13965397_13965694,RI_chr2L_13967695_13967746,nimB4 chr2L - chr2L_13969445_13969618 chr2L_13969461_13969618 chr2L_13969619_13969964;chr2L_13968897_13969444 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0071130000000000004 K alternative_acceptor C3G chrX - chrX_6681282_6681383 chrX_6681300_6681383 chrX_6681384_6681553;chrX_6681129_6681281 13.87 NA NA NA NA NA 25.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA 37.97 29.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.73 NA NA NA NA 30.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0594301589794241e-21 K alternative_acceptor CG2004,I_chrX_8608130_8608508,RI_chrX_8608147_8608508,I_chrX_8608169_8608438 chrX - chrX_8608130_8608508;chrX_8608147_8608508;chrX_8608150_8608508 chrX_8608169_8608508 chrX_8608509_8608538;chrX_8608069_8608129 95.00 NA NA NA NA NA 72.00 NA NA 84.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor RpL27A,E_chr2L_4457411_4457977,I_chr2L_4458058_4458120 chr2L - chr2L_4457290_4457374;chr2L_4457275_4457374 chr2L_4457319_4457374 chr2L_4457375_4457410;chr2L_4457188_4457274 0.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG8005,noncoding_11293 chr3L + chr3L_8191584_8191652 chr3L_8191584_8191641 chr3L_8191314_8191583;chr3L_8191653_8191878 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.009613 N alternative_acceptor I_chrX_16309561_16309689,hang,I_chrX_16328892_16329177,I_chrX_16335942_16337525 chrX + chrX_16323441_16323563;chrX_16323441_16323548 chrX_16323441_16324653 chrX_16323093_16323440;chrX_16324654_16324797 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.55 NA NA NA NA NA NA 69.51 NA NA NA 72.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.97 NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.97 0.0 K alternative_acceptor CG3689 chr3L + chr3L_9405083_9406302 chr3L_9405083_9405254 chr3L_9404917_9405082;chr3L_9406303_9406402 17.65 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA 31.65 NA NA NA NA NA NA NA 29.79 NA 28.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3440000000000003e-19 K alternative_acceptor Zyx102EF,I_chr4_1078380_1078835,I_chr4_1080463_1081366,REF_chr4_1081261_1081452,F_chr4_1081280_1081398,F_chr4_1081280_1081452 chr4 - chr4_1078666_1078835;chr4_1078644_1078835;chr4_1078782_1078835 chr4_1078778_1078835 chr4_1078836_1078848;chr4_1078433_1078643 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.33 14.81 60.00 NA NA NA NA NA 15.00 NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 6.25 55.00 NA 1.3086450210191941e-19 K alternative_acceptor RN-tre chr2R - chr2R_9877474_9878070 chr2R_9877492_9878070 chr2R_9878071_9878197;chr2R_9877190_9877473 98.63 NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048569000000000001 K alternative_acceptor I_chr2L_100704_100835,CG11377 chr2L + chr2L_103435_103877 chr2L_103435_103515 chr2L_103006_103434;chr2L_103878_104103 79.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.93 NA NA NA NA 58.90 49.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.02 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG2698,I_chr3R_3828169_3828941,I_chr3R_3828880_3828941,I_chr3R_3829483_3829715,I_chr3R_3830586_3830981 chr3R + chr3R_3829483_3829697;chr3R_3829483_3829709;chr3R_3829483_3829721 chr3R_3829483_3829555 chr3R_3829383_3829482;chr3R_3829722_3829815 35.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA 47.83 NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor psq,RI_chr2R_6449696_6467831 chr2R + chr2R_6500437_6500490 chr2R_6500437_6500484 chr2R_6500242_6500436;chr2R_6500491_6500880 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.40 0.00041148280000000002 K alternative_acceptor RpS3A,I_chr4_87533_87717,I_chr4_87549_87717,I_chr4_87549_87769 chr4 - chr4_87549_87717;chr4_87533_87717 chr4_87648_87717 chr4_87718_87817;chr4_87466_87532 74.06 NA NA NA 89.71 NA 88.14 NA NA 59.10 NA NA NA 85.67 NA NA NA NA 58.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.39 NA 84.38 85.21 NA NA NA NA NA 57.80 NA 88.00 84.25 NA NA 85.84 NA NA NA NA NA 61.85 58.33 92.95 NA NA 58.09 85.88 87.68 NA 0.0 K alternative_acceptor mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179 chr3L + chr3L_21901021_21907875 chr3L_21901021_21901163 chr3L_21900921_21901020;chr3L_21907876_21907932 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor HDAC4,F_chrX_13159070_13159174,I_chrX_13170581_13179235,I_chrX_13178996_13179235 chrX - chrX_13164676_13165514;chrX_13164646_13165514 chrX_13164727_13165514 chrX_13165515_13165622;chrX_13164424_13164645 2.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG10424,RI_chr3L_19090338_19090405 chr3L - chr3L_19090328_19090405 chr3L_19090338_19090405 chr3L_19090406_19090505;chr3L_19090238_19090327 4.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0016919999999999999 K alternative_acceptor l(2)NC136,I_chr2R_1545723_1546024 chr2R - chr2R_1545081_1545147;chr2R_1545003_1545147 chr2R_1545087_1545147 chr2R_1545148_1545722;chr2R_1544877_1545002 95.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023700000000000001 K alternative_acceptor svr,RI_chrX_421417_421591 chrX + chrX_396970_398700 chrX_396970_397394 chrX_396869_396969;chrX_398701_398818 43.75 NA NA NA NA NA 72.22 NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1289390530860004e-06 K alternative_acceptor CG3662,I_chr2L_822032_822857 chr2L + chr2L_824138_824218 chr2L_824138_824190 chr2L_823637_824137;chr2L_824219_824354 76.09 NA NA 91.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.62 NA NA NA NA NA NA NA 93.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1875423770000002e-07 K alternative_acceptor wge chr3R - chr3R_18539090_18539306;chr3R_18539087_18539306 chr3R_18539117_18539306 chr3R_18539307_18539565;chr3R_18538527_18539086 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032586999999999998 K alternative_acceptor CG8213 chr2R - chr2R_4858557_4858929 chr2R_4858755_4858929 chr2R_4858930_4862949;chr2R_4858370_4858556 22.22 NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0045909999999999996 K alternative_acceptor CG10433 chr2R - chr2R_17493699_17493972 chr2R_17493866_17493972 chr2R_17493973_17494122;chr2R_17493181_17493698 3.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Msp-300,I_chr2L_5197634_5197866 chr2L + chr2L_5203743_5204462 chr2L_5203743_5204450 chr2L_5203116_5203742;chr2L_5204463_5204592 45.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.66 NA NA NA NA NA NA 70.21 NA NA NA NA NA NA NA 28.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.4739986599999998e-16 K alternative_acceptor Nedd4,I_chr3L_17532828_17532882,I_chr3L_17532828_17533787,I_chr3L_17534504_17535990,I_chr3L_17536813_17536863 chr3L + chr3L_17532828_17533787;chr3L_17532828_17533790 chr3L_17532828_17532882 chr3L_17532728_17532827;chr3L_17533791_17533887 17.39 NA NA 75.76 NA NA 29.69 NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Mlf,noncoding_7111,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11824086_11824525 chr2R_11824089_11824525 chr2R_11824526_11824611;chr2R_11823989_11824085 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1341335999999996e-05 K alternative_acceptor CG9425,I_chr3L_14783173_14784369 chr3L + chr3L_14783173_14784369;chr3L_14783173_14784970 chr3L_14783173_14785138 chr3L_14783073_14783172;chr3L_14785139_14785560 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020479999999999999 K alternative_acceptor RecQ5 chr3L - chr3L_14623293_14623619 chr3L_14623545_14623619 chr3L_14623620_14624918;chr3L_14622841_14623292 7.83 NA NA NA NA NA 32.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.8000000000000001e-05 K alternative_acceptor CG9331,I_chr2L_20824494_20826632,I_chr2L_20825513_20825658 chr2L + chr2L_20825513_20825667 chr2L_20825513_20825658 chr2L_20825471_20825512;chr2L_20825668_20825758 78.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 95.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00098152083999999994 K alternative_acceptor CG4360 chr3R - chr3R_16151875_16152037 chr3R_16151951_16152037 chr3R_16152038_16152520;chr3R_16150089_16151874 25.19 NA 37.50 42.44 44.12 45.63 46.21 NA NA NA 42.70 NA NA NA NA 49.07 39.47 40.48 41.84 NA 43.68 NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA 45.16 13.43 12.72 NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA 13.28 13.04 NA 9.23 NA NA NA NA NA NA 41.44 NA NA 10.26 0.0 K alternative_acceptor CG3262 chr2L + chr2L_22240104_22240169 chr2L_22240104_22240153 chr2L_22239906_22240103;chr2L_22240170_22240402 29.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor RhoGAP18B chrX - chrX_19047302_19047377 chrX_19047314_19047377 chrX_19047378_19047520;chrX_19047061_19047301 79.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.71 NA NA NA 63.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.28 67.14 NA 67.86 NA NA NA 64.75 67.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.95 NA NA 8.6723674349249949e-18 N alternative_acceptor orb2,I_chr3L_8942860_8947477 chr3L - chr3L_8937621_8940927 chr3L_8939541_8940927 chr3L_8940928_8940989;chr3L_8935392_8937620 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 NA NA NA NA NA NA NA 87.50 0.00042778332800000004 K alternative_acceptor ena chr2R + chr2R_15046858_15047299 chr2R_15046858_15047287 chr2R_15046625_15046857;chr2R_15047300_15047324 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0059259999999999998 K alternative_acceptor dlg1,I_chrX_11298230_11299306 chrX + chrX_11283815_11284263 chrX_11283815_11284208 chrX_11283738_11283814;chrX_11284264_11284573 65.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036542999999999999 K alternative_acceptor coro,I_chr2R_2754447_2755071 chr2R - chr2R_2751039_2751782 chr2R_2751060_2751782 chr2R_2751783_2752076;chr2R_2750853_2751038 1.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG34394,I_chr2L_3365674_3365965,RI_chr2L_3365677_3365965 chr2L - chr2L_3365674_3367244;chr2L_3365677_3367244 chr2L_3365976_3367244 chr2L_3367245_3367719;chr2L_3365601_3365673 5.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1e-05 K alternative_acceptor CG3760,CG3770,CG12851 chr2R + chr2R_20826366_20826496 chr2R_20826366_20826478 chr2R_20826283_20826365;chr2R_20826497_20826740 19.35 NA NA 33.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA 8.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CHES-1-like,I_chrX_7584030_7588818 chrX - chrX_7584030_7590509 chrX_7588919_7590509 chrX_7590510_7590564;chrX_7583930_7584029 52.63 42.11 NA NA 35.71 NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA 29.41 33.33 NA NA NA NA NA NA NA 36.36 15.79 NA 25.00 NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG7843,I_chr2R_1972736_1972822 chr2R - chr2R_1968540_1969240 chr2R_1968921_1969240 chr2R_1969241_1969345;chr2R_1968340_1968539 45.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2040000000000002e-07 K alternative_acceptor Cap-H2 chr3R + chr3R_6589674_6589832;chr3R_6589674_6589871 chr3R_6589674_6589835 chr3R_6588751_6589673;chr3R_6589872_6590095 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.043820999999999999 N alternative_acceptor CG15099 chr2R - chr2R_14725051_14725138 chr2R_14725074_14725138 chr2R_14725139_14725207;chr2R_14724985_14725050 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Eph,I_chr4_631523_634240,I_chr4_632065_634240,I_chr4_632433_632707,I_chr4_632433_632988,I_chr4_639690_640473,I_chr4_640676_640879,RI_chr4_640804_640863 chr4 + chr4_632433_634240 chr4_632433_632707 chr4_632353_632432;chr4_634241_634340 4.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00010663488 K alternative_acceptor CG11790,CG11791 chr3R + chr3R_20875669_20876354;chr3R_20875669_20876902 chr3R_20875669_20876344 chr3R_20875600_20875668;chr3R_20876903_20877278 39.06 NA NA NA NA NA 28.85 NA 56.25 NA NA NA NA NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 55.00 NA NA 18.75 NA NA NA NA NA 28.57 NA NA 22.22 NA NA 16.98 67.80 18.00 NA NA NA NA NA NA NA 12.68 0.0 K alternative_acceptor Pcf11,RI_chr2R_10753287_10754988 chr2R - chr2R_10753272_10754988;chr2R_10753287_10754988;chr2R_10753581_10754988;chr2R_10753239_10754988 chr2R_10753557_10754988 chr2R_10754989_10755088;chr2R_10753187_10753238 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA 12.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 12.50 3.1609597922771813e-13 K alternative_acceptor CG18619,RI_chr2L_10264634_10264691,RI_chr2L_10264634_10264699,I_chr2L_10264634_10264770,RI_chr2L_10265562_10265628 chr2L + chr2L_10264265_10264551 chr2L_10264265_10264548 chr2L_10264122_10264264;chr2L_10264552_10264633 28.19 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.3505655299999999e-09 K alternative_acceptor CG12945,I_chr3R_5615604_5615859,I_chr3R_5615807_5615858,RI_chr3R_5616467_5616560 chr3R - chr3R_5616467_5616560 chr3R_5616494_5616560 chr3R_5616561_5616629;chr3R_5616402_5616466 87.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.7999999999999998e-05 N alternative_acceptor Rip11,E_chrX_18532733_18533695,RI_chrX_18530353_18530870,RI_chrX_18530742_18530870,RI_chrX_18544139_18544185 chrX - chrX_18530338_18530646 chrX_18530353_18530646 chrX_18530647_18530741;chrX_18530253_18530337 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor Gprk2 chr3R + chr3R_27259611_27279032 chr3R_27259611_27259861 chr3R_27259181_27259610;chr3R_27279033_27279128 30.00 NA NA 15.56 41.18 NA 41.46 NA 41.30 NA 8.33 NA NA NA NA NA NA 18.52 NA NA NA 10.26 NA NA NA NA NA 53.85 12.82 NA NA 44.44 NA NA NA 15.15 NA NA NA NA 52.38 NA NA 11.36 NA NA NA NA NA NA NA NA 15.00 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG3409,I_chr2R_2591946_2592739,RI_chr2R_2593704_2599587 chr2R - chr2R_2591946_2592739 chr2R_2592092_2592739 chr2R_2592740_2592839;chr2R_2591846_2591945 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.030561000000000001 N alternative_acceptor CG42394,noncoding_15936,E_chr3R_6675742_6676058 chr3R + chr3R_6677211_6677344;chr3R_6677211_6677270 chr3R_6677211_6677262 chr3R_6677007_6677210;chr3R_6677345_6677430 20.45 NA NA NA 5.26 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.12 2.38 NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG17233,I_chr3L_20232803_20232962,RI_chr3L_20232898_20232962 chr3L - chr3L_20232648_20232962;chr3L_20232714_20232962;chr3L_20232645_20232962 chr3L_20232711_20232962 chr3L_20232963_20233016;chr3L_20232147_20232644 36.36 NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA 13.04 NA NA NA NA NA 4.01662527e-18 K alternative_acceptor Imp,I_chrX_10699490_10700695,RI_chrX_10699665_10700501,RI_chrX_10699665_10700695 chrX - chrX_10699665_10700501;chrX_10699503_10700501 chrX_10699547_10700501 chrX_10700502_10700547;chrX_10699299_10699502 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 0.024490000000000001 K alternative_acceptor CG9776 chr3R - chr3R_153740_153858 chr3R_153800_153858 chr3R_153859_154129;chr3R_153532_153739 5.17 NA NA 41.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Imp,RI_chrX_10699665_10700695 chrX - chrX_10692578_10692651 chrX_10692599_10692651 chrX_10692652_10693026;chrX_10691869_10692577 9.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041870999999999998 K alternative_acceptor CG1140,I_chr3L_1964610_1964836 chr3L + chr3L_1964610_1965059;chr3L_1964610_1964836 chr3L_1964610_1965074 chr3L_1964541_1964609;chr3L_1965075_1965273 96.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Fer1HCH,I_chr3R_26212319_26213496,I_chr3R_26213132_26213185 chr3R - chr3R_26213273_26213496;chr3R_26213365_26213496 chr3R_26213325_26213496 chr3R_26213497_26213534;chr3R_26213186_26213272 50.00 NA NA 39.09 NA NA NA NA NA NA NA NA 66.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG42490,noncoding_3620,I_chr2L_18665287_18666474,RI_chr2L_18666413_18666474,CREI_chr2L_18666629_18666680 chr2L + chr2L_18665915_18666474 chr2L_18665915_18666352 chr2L_18665676_18665914;chr2L_18666475_18666511 54.43 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018877870079999999 K alternative_acceptor CG6340,I_chrX_15402291_15403750 chrX + chrX_15376571_15377231 chrX_15376571_15377214 chrX_15376446_15376570;chrX_15377232_15377453 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027314000000000001 K alternative_acceptor Cnx99A,I_chr3R_25144335_25145173,I_chr3R_25145243_25145309,I_chr3R_25145256_25145426 chr3R - chr3R_25145243_25145309 chr3R_25145256_25145309 chr3R_25145310_25145319;chr3R_25145174_25145242 98.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.044266 K alternative_acceptor CG17912,I_chr2L_16749189_16749266 chr2L + chr2L_16749189_16749290 chr2L_16749189_16749266 chr2L_16749153_16749188;chr2L_16749291_16749366 1.96 NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014333242 K alternative_acceptor betaInt-nu chr2L + chr2L_21053362_21053457 chr2L_21053362_21053426 chr2L_21053285_21053361;chr2L_21053458_21053644 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039004999999999998 K alternative_acceptor CG12112,CG12111 chrX - chrX_8453877_8453953 chrX_8453892_8453953 chrX_8453954_8454022;chrX_8453812_8453876 98.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0032169999999999998 K alternative_acceptor eIF5,RI_chrX_15883163_15883424,I_chrX_15883297_15883424,EI_chrX_15885411_15885854,RI_chrX_15885416_15885611 chrX - chrX_15883360_15883424;chrX_15883163_15883424;chrX_15883143_15883424 chrX_15883302_15883424 chrX_15883425_15883509;chrX_15883079_15883142 69.86 NA NA NA NA NA 83.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CrebA,I_chr3L_15541841_15542648 chr3L + chr3L_15543697_15544191 chr3L_15543697_15543963 chr3L_15543247_15543696;chr3L_15544192_15546314 28.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA 1.4437273276763567e-14 K alternative_acceptor pxb,I_chr3R_11504971_11505107 chr3R + chr3R_11504971_11510791 chr3R_11504971_11505107 chr3R_11504871_11504970;chr3R_11510792_11511026 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0024629999999999999 K alternative_acceptor Vha16,I_chr2R_2519645_2520499,RI_chr2R_2519646_2519840,I_chr2R_2519646_2520292,I_chr2R_2519646_2520298,I_chr2R_2519775_2520499 chr2R - chr2R_2519646_2520499 chr2R_2519775_2520499 chr2R_2520500_2520599;chr2R_2519546_2519645 14.06 NA NA NA NA NA 26.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG9399,I_chr3R_5403032_5403329 chr3R - chr3R_5399229_5399863;chr3R_5399255_5399863 chr3R_5399318_5399863 chr3R_5399864_5399874;chr3R_5399076_5399228 80.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01865 K alternative_acceptor hts,I_chr2R_15286599_15294119,I_chr2R_15311185_15312327,I_chr2R_15311303_15312026 chr2R - chr2R_15286305_15286530 chr2R_15286311_15286530 chr2R_15286531_15286598;chr2R_15286061_15286304 54.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.034335999999999998 K alternative_acceptor CG42555,CEI_chr2L_16889126_16889216,I_chr2L_16889126_16889955,F_chr2L_16889126_16890182 chr2L + chr2L_16889126_16891457 chr2L_16889126_16889216 chr2L_16889026_16889125;chr2L_16891458_16891557 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA 33.33 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA 9.1229904673584756e-18 K alternative_acceptor RpL15 chr3LHet + chr3LHet_2397820_2398049;chr3LHet_2397820_2398143 chr3LHet_2397820_2398127 chr3LHet_2397802_2397819;chr3LHet_2398144_2398454 80.45 NA 90.80 NA NA NA 69.05 NA NA 63.03 NA NA NA NA NA 68.88 NA NA NA NA NA NA NA 68.26 67.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.98 65.22 65.66 91.73 NA NA NA 91.90 NA NA 64.59 NA NA 62.00 NA 66.01 95.46 NA 90.68 68.72 67.64 91.65 0.0 K alternative_acceptor br,I_chrX_1517022_1518170,chrX_1531825_1532171.0,chrX_1532359_1533289.0,chrX_1533577_1534629.0,chrX_1535554_1536485.0 chrX + chrX_1531368_1537100 chrX_1531368_1536917 chrX_1531317_1531367;chrX_1537101_1537141 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023949000000000002 K alternative_acceptor CG7987,RI_chr3R_10400799_10401492 chr3R - chr3R_10400782_10401492;chr3R_10400799_10401492 chr3R_10400608_10401492 chr3R_10401493_10401559;chr3R_10400270_10400607 36.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00021900000000000001 K alternative_acceptor fax chr3L - chr3L_16398937_16400120 chr3L_16398946_16400120 chr3L_16400121_16400459;chr3L_16398602_16398936 78.45 NA NA NA NA NA 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG34140,CG34140_Mkp,noncoding_9561 chr3L - chr3L_184068_184131 chr3L_184073_184131 chr3L_184132_184197;chr3L_184008_184067 66.67 NA 100.00 NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.3125776689795959e-20 K alternative_acceptor aPKC,I_chr2R_10833552_10833654,RI_chr2R_10849347_10850391 chr2R - chr2R_10833596_10833654;chr2R_10832733_10833654 chr2R_10833552_10833654 chr2R_10833655_10833754;chr2R_10832714_10832732 4.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000195 K alternative_acceptor rok,RI_chrX_16526333_16526477 chrX - chrX_16521501_16521628 chrX_16521528_16521628 chrX_16521629_16521903;chrX_16521334_16521500 39.71 NA NA NA NA NA 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.1374705303000008e-08 K alternative_acceptor Galpha49B,I_chr2R_8504706_8504960,I_chr2R_8506056_8506112 chr2R + chr2R_8500357_8501648;chr2R_8500357_8501759 chr2R_8500357_8501071 chr2R_8500333_8500356;chr2R_8501760_8501850 83.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.65 NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0479974885370003e-05 K alternative_acceptor RpL28,I_chr3L_3221982_3222744,I_chr3L_3222575_3222787 chr3L - chr3L_3221982_3222787 chr3L_3222575_3222787 chr3L_3222788_3222844;chr3L_3221882_3221981 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_acceptor CG9086,CEI_chrX_16859981_16861527,I_chrX_16861895_16862053 chrX - chrX_16861753_16862542 chrX_16861895_16862542 chrX_16862543_16862684;chrX_16861528_16861752 87.34 NA NA 58.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019591000000000001 K alternative_acceptor PR2,I_chr2R_9032197_9036175 chr2R - chr2R_9032194_9036175 chr2R_9035960_9036175 chr2R_9036176_9036275;chr2R_9032097_9032193 19.23 NA NA 45.00 NA NA 35.29 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA 34.95 NA NA NA 29.55 30.00 NA NA 44.12 NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor unc-5,E_chr2R_11238100_11240757,I_chr2R_11252444_11252570 chr2R + chr2R_11246255_11247919 chr2R_11246255_11247482 chr2R_11246084_11246254;chr2R_11247920_11247973 3.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor I_chr3L_9481026_9484943,noncoding_11665 chr3L + chr3L_9481349_9481457;chr3L_9481349_9484943 chr3L_9481349_9481415 chr3L_9481282_9481348;chr3L_9484944_9485043 33.33 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor SelR,I_chr3R_6691367_6692250,I_chr3R_6692461_6692530,I_chr3R_6694098_6694160 chr3R - chr3R_6689548_6692250 chr3R_6689581_6692250 chr3R_6692251_6692350;chr3R_6689071_6689547 14.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.7741599999999997e-07 K alternative_acceptor I_chr2R_19695638_19696332,Nxt1,RI_chr2R_19699261_19699317,CG4797 chr2R - chr2R_19699248_19699317 chr2R_19699261_19699317 chr2R_19699318_19699386;chr2R_19699179_19699247 6.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018060000000000001 K alternative_acceptor CG32344,RI_chr3L_321550_321914,I_chr3L_326540_326703,RI_chr3L_326725_326866 chr3L - chr3L_321361_321914;chr3L_321364_321914 chr3L_321550_321914 chr3L_321915_322014;chr3L_321242_321360 7.69 NA NA 33.33 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7800308000000002e-05 K alternative_acceptor Upf2,I_chrX_7969268_7969358,I_chrX_7969312_7969358 chrX - chrX_7969312_7969358;chrX_7969268_7969358;chrX_7969293_7969358 chrX_7969303_7969358 chrX_7969359_7969458;chrX_7969212_7969267 42.86 NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025499999999999998 K alternative_acceptor capu,I_chr2L_3884519_3902594,I_chr2L_3887800_3888648,I_chr2L_3887896_3888648 chr2L - chr2L_3887557_3888648 chr2L_3887800_3888648 chr2L_3888649_3888710;chr2L_3886984_3887556 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010510000000000001 K alternative_acceptor Taf6 chr3L + chr3L_19594248_19594309 chr3L_19594248_19594296 chr3L_19594013_19594247;chr3L_19594310_19594484 74.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0092499999999999995 K alternative_acceptor gish chr3R + chr3R_12127074_12127544 chr3R_12127074_12127526 chr3R_12126967_12127073;chr3R_12127545_12127876 16.30 NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA 39.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA 44.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor gem,I_chr2R_6015083_6015660 chr2R + chr2R_6016198_6016327 chr2R_6016198_6016288 chr2R_6016086_6016197;chr2R_6016328_6016534 18.49 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.74 NA NA NA 37.50 NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.8142976195999998e-08 K alternative_acceptor RhoGAP71E,I_chr3L_15583097_15589765 chr3L + chr3L_15582377_15582458 chr3L_15582377_15582436 chr3L_15581999_15582376;chr3L_15582459_15583096 73.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA 52.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.0884561012920005e-05 K alternative_acceptor mub,RI_chr3L_21901021_21901163,I_chr3L_21908756_21909179 chr3L + chr3L_21914088_21914192;chr3L_21914088_21914153;chr3L_21914088_21914156 chr3L_21914088_21914141 chr3L_21914067_21914087;chr3L_21914193_21914427 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010146000000000001 K alternative_acceptor CG1440 chrX + chrX_8331328_8333141 chrX_8331328_8332952 chrX_8331282_8331327;chrX_8333142_8333791 26.42 NA NA 8.79 NA NA NA 6.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.215884727e-14 K alternative_acceptor RluA-2,I_chr2L_10480906_10481097 chr2L + chr2L_10481571_10481646;chr2L_10481571_10481629 chr2L_10481571_10481621 chr2L_10481509_10481570;chr2L_10481647_10481707 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041505 K alternative_acceptor Sap47,I_chr3R_11761076_11761674,I_chr3R_11761436_11761674,F_chr3R_11761635_11761698,E_chr3R_11761635_11761703 chr3R + chr3R_11761307_11761561;chr3R_11761307_11761674;chr3R_11761307_11761703 chr3R_11761307_11761698 chr3R_11761299_11761306;chr3R_11761704_11761774 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00034200000000000002 N alternative_acceptor ras chrX + chrX_10640260_10640453 chrX_10640260_10640321 chrX_10640109_10640259;chrX_10640454_10641105 2.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG14939,RI_chr2L_11812683_11813150 chr2L - chr2L_11811446_11811593 chr2L_11811500_11811593 chr2L_11811594_11812682;chr2L_11810098_11811445 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG7158 chr3L - chr3L_21668049_21668121;chr3L_21668063_21668121 chr3L_21668076_21668121 chr3L_21668122_21668273;chr3L_21667494_21668048 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0087209999999999996 K alternative_acceptor flfl,EI_chr3R_9513221_9513291,CG14367 chr3R + chr3R_9515908_9515995 chr3R_9515908_9515974 chr3R_9515635_9515907;chr3R_9515996_9516108 76.12 NA NA 55.10 NA NA NA 60.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.500178371864e-06 K alternative_acceptor CG31324,I_chr3R_21933065_21933306,F_chr3R_21933069_21950156 chr3R + chr3R_21933065_21950156 chr3R_21933065_21933306 chr3R_21932969_21933064;chr3R_21950157_21950256 2.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001126 N alternative_acceptor noncoding_4261 chr2L + chr2L_21930695_21930858 chr2L_21930695_21930816 chr2L_21930327_21930694;chr2L_21930859_21930947 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018557000000000001 K alternative_acceptor CG12582 chr3R + chr3R_23285_23458 chr3R_23285_23350 chr3R_23137_23284;chr3R_23459_23593 3.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor htt,I_chr3R_24527763_24528033,I_chr3R_24542203_24543363 chr3R + chr3R_24542203_24544152 chr3R_24542203_24543363 chr3R_24542103_24542202;chr3R_24544153_24544634 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor sdt,E_chrX_8118081_8119115,C_chrX_8118081_8119117,I_chrX_8131684_8131842 chrX + chrX_8118081_8119111 chrX_8118081_8118817 chrX_8117989_8118080;chrX_8119112_8119214 4.88 NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.05 NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.6973027599999998e-10 K alternative_acceptor RpL36,RI_chrX_522912_523358,I_chrX_522932_523360,I_chrX_522949_523360 chrX - chrX_522932_523360;chrX_522949_523360 chrX_522912_523360 chrX_523361_523436;chrX_522849_522911 94.87 NA NA NA NA NA 78.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor MP1,RI_chr3R_134150_134311 chr3R + chr3R_134150_134341 chr3R_134150_134311 chr3R_134050_134149;chr3R_134342_134411 6.25 NA NA 23.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6254400000000002e-07 K alternative_acceptor X11L,I_chrX_17497609_17497728,RE_chrX_17497873_17498103 chrX + chrX_17497505_17497746 chrX_17497505_17497728 chrX_17497189_17497504;chrX_17497747_17497828 96.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015037999999999999 K alternative_acceptor brat,I_chr2L_19134277_19143634,EI_chr2L_19145845_19145958,RI_chr2L_19145845_19146761 chr2L + chr2L_19145845_19166084 chr2L_19145845_19145958 chr2L_19145819_19145844;chr2L_19166085_19166125 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 25.00 25.00 33.33 NA NA NA NA NA 50.00 50.00 NA 33.33 33.33 NA 2.1845788404316322e-35 K alternative_acceptor bwa,I_chr2L_20069515_20073377,I_chr2L_20073310_20073377 chr2L + chr2L_20069515_20073377 chr2L_20069515_20072353 chr2L_20069415_20069514;chr2L_20073378_20073477 97.44 NA NA 79.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00296 K alternative_acceptor Dsp1,I_chrX_16228447_16229355,I_chrX_16231287_16231413 chrX + chrX_16228447_16230320;chrX_16228447_16230323 chrX_16228447_16230299 chrX_16228347_16228446;chrX_16230324_16230776 15.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.59 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.5190909999999998e-05 K alternative_acceptor Mitf,REI_chr4_1223922_1223965,I_chr4_1225890_1225947 chr4 + chr4_1223922_1223985;chr4_1223922_1224042 chr4_1223922_1223965 chr4_1223822_1223921;chr4_1224043_1224065 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00010038672000000001 N alternative_acceptor CG17159,CG17162,noncoding_25215 chrXHet - chrXHet_66049_66121 chrXHet_66052_66121 chrXHet_66122_66324;chrXHet_64549_66048 58.93 NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.50 NA 4.6132215660000001e-07 K alternative_acceptor CG12582 chr3R + chr3R_29885_29987;chr3R_29885_29940 chr3R_29885_29934 chr3R_29816_29884;chr3R_29988_30053 80.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor SmG chrX - chrX_16534047_16534125 chrX_16534064_16534125 chrX_16534126_16534194;chrX_16533995_16534046 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor nito,I_chr2R_3852832_3852883 chr2R + chr2R_3850109_3850273 chr2R_3850109_3850252 chr2R_3850045_3850108;chr2R_3850274_3850898 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00025000000000000001 K alternative_acceptor CG9855,I_chr3R_223384_223429 chr3R - chr3R_223363_223429 chr3R_223384_223429 chr3R_223430_223529;chr3R_223284_223362 2.60 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0059230000000000003 K alternative_acceptor tral,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12510160_12510527 chr3L_12510160_12510515 chr3L_12509677_12510159;chr3L_12510528_12511057 8.08 NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor tay,I_chrX_15774035_15774320,I_chrX_15779977_15780538,RI_chrX_15780874_15781045,I_chrX_15783766_15785978 chrX - chrX_15774035_15774320 chrX_15774255_15774320 chrX_15774321_15774420;chrX_15773935_15774034 97.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor I_chr2L_8029734_8029787,Cka,CG7429 chr2L + chr2L_8036299_8036381 chr2L_8036299_8036357 chr2L_8035821_8036298;chr2L_8036382_8036576 25.58 NA NA NA NA NA 14.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.15 41.75 NA NA NA NA NA NA NA 8.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG6179,RI_chrX_18274964_18275006 chrX + chrX_18274964_18275023 chrX_18274964_18275006 chrX_18274864_18274963;chrX_18275024_18275106 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036947000000000001 K alternative_acceptor CG9293,RI_chr2L_13386386_13386487,I_chr2L_13394941_13395015 chr2L - chr2L_13386258_13386487 chr2L_13386386_13386487 chr2L_13386488_13386508;chr2L_13386099_13386257 16.67 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001549 K alternative_acceptor bip2,RI_chr4_481674_487126,RI_chr4_483128_487126,RI_chr4_486609_487126 chr4 - chr4_485942_487126;chr4_485855_487126 chr4_486609_487126 chr4_487127_487226;chr4_485750_485854 5.00 NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7000000000000001e-10 K alternative_acceptor HP5 chrX + chrX_11350521_11350687 chrX_11350521_11350617 chrX_11349315_11350520;chrX_11350688_11350915 17.09 NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.00016845439200000002 N alternative_acceptor C3G chrX - chrX_6676710_6676802 chrX_6676726_6676802 chrX_6676803_6676928;chrX_6676644_6676709 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0045789999999999997 K alternative_acceptor betaggt-I,I_chr2L_4946222_4946668 chr2L + chr2L_4946222_4946906 chr2L_4946222_4946668 chr2L_4946122_4946221;chr2L_4946907_4947734 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9840000000000002e-09 K alternative_acceptor endos,I_chr3L_14024099_14024488,I_chr3L_14024103_14024158,I_chr3L_14024103_14024546,noncoding_12505,I_chr3L_14024496_14024546 chr3L - chr3L_14024103_14024488 chr3L_14024158_14024488 chr3L_14024489_14024495;chr3L_14024003_14024102 7.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0033080000000000002 K alternative_acceptor Cg25C,I_chr2L_5029811_5029873 chr2L + chr2L_5029811_5030136 chr2L_5029811_5029873 chr2L_5029711_5029810;chr2L_5030137_5030237 0.00 NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2e-12 K alternative_acceptor Myo31DF,I_chr2L_10506249_10506683,I_chr2L_10506446_10506542 chr2L - chr2L_10506107_10506683 chr2L_10506249_10506683 chr2L_10506684_10506780;chr2L_10505926_10506106 8.12 NA NA NA NA NA 30.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.30 NA NA NA 22.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor cenB1A chr3R + chr3R_18947355_18947549 chr3R_18947355_18947528 chr3R_18947059_18947354;chr3R_18947550_18947666 64.29 NA NA 44.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6081523999999997e-05 N alternative_acceptor CG33967 chr3R - chr3R_10528292_10528612 chr3R_10528308_10528612 chr3R_10528613_10528911;chr3R_10526678_10528291 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Mnt chrX + chrX_3587966_3592777;chrX_3587966_3592774;chrX_3587966_3592150 chrX_3587966_3592372 chrX_3587244_3587965;chrX_3592778_3593060 2.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA 28.57 NA NA NA NA 4.8099999999999999e-10 K alternative_acceptor Pitslre,I_chr3L_20764965_20765781,I_chr3L_20764965_20766192,I_chr3L_20764965_20766212,I_chr3L_20766064_20766192,I_chr3L_20766064_20766215,RI_chr3L_20766064_20766893,I_chr3L_20766311_20766664,I_chr3L_20766311_20766893,I_chr3L_20766773_20766893 chr3L + chr3L_20764965_20765704;chr3L_20764965_20766893 chr3L_20764965_20766215 chr3L_20764896_20764964;chr3L_20766894_20766993 4.88 NA NA 16.67 NA 16.67 NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA 15.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor MAPk-Ak2,RI_chrX_5655618_5656137,I_chrX_5656715_5657427,I_chrX_5656715_5657893,I_chrX_5656715_5657974 chrX - chrX_5656678_5658141 chrX_5656715_5658141 chrX_5658142_5658214;chrX_5656615_5656677 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.42 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.1077041760000006e-14 K alternative_acceptor Smc5,I_chr3L_21566234_21566275 chr3L + chr3L_21566234_21566289 chr3L_21566234_21566275 chr3L_21566134_21566233;chr3L_21566290_21566375 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0014779999999999999 K alternative_acceptor CG10737 chr2R + chr2R_15062814_15063770;chr2R_15062814_15063692 chr2R_15062814_15063752 chr2R_15062592_15062813;chr2R_15063771_15063852 5.47 NA NA NA NA NA 23.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Cp190,I_chr3R_11100788_11100846,F_chr3R_11104164_11104239 chr3R - chr3R_11100321_11100846;chr3R_11100334_11100846 chr3R_11100788_11100846 chr3R_11100847_11100931;chr3R_11099837_11100320 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0058329999999999996 K alternative_acceptor CG7375 chr3L - chr3L_8190803_8190878 chr3L_8190806_8190878 chr3L_8190879_8190964;chr3L_8190622_8190802 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033148999999999998 K alternative_acceptor CG1407,RI_chr2R_5918919_5919093,I_chr2R_5918925_5919213,RI_chr2R_5918952_5919084,RI_chr2R_5918952_5919093 chr2R - chr2R_5918925_5919093 chr2R_5918952_5919093 chr2R_5919094_5919184;chr2R_5918852_5918924 67.35 NA NA 48.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015797567099999999 K alternative_acceptor CG13124,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9905053_9905137 chr2L_9905084_9905137 chr2L_9905138_9905241;chr2L_9904827_9905052 35.48 NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0406171287399999e-07 N alternative_acceptor stc chr2L + chr2L_15114214_15114299;chr2L_15114214_15114311 chr2L_15114214_15114448 chr2L_15114049_15114213;chr2L_15114449_15115753 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG1969 chr3R + chr3R_25567092_25567489 chr3R_25567092_25567419 chr3R_25566873_25567091;chr3R_25567490_25567631 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.23604e-07 K alternative_acceptor Spf45 chr2L - chr2L_22960834_22960931 chr2L_22960877_22960931 chr2L_22960932_22961115;chr2L_22959877_22960833 81.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062249999999999996 K alternative_acceptor CG11055 chr2R + chr2R_16145258_16145691 chr2R_16145258_16145538 chr2R_16145189_16145257;chr2R_16145692_16148064 13.48 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.14 NA NA 38.46 NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1428922179406911e-14 N alternative_acceptor noncoding_4622,CE_chr2R_2237053_2237111 chr2R - chr2R_2237032_2237090 chr2R_2237036_2237090 chr2R_2237091_2237159;chr2R_2236997_2237031 42.48 NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003359 N alternative_acceptor CG12207,I_chr3R_10115172_10115963,RE_chr3R_10124392_10124511 chr3R + chr3R_10126741_10126965 chr3R_10126741_10126949 chr3R_10126142_10126740;chr3R_10126966_10127961 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00037800000000000003 K alternative_acceptor mbc,I_chr3R_19615584_19615649,I_chr3R_19625220_19625288 chr3R + chr3R_19625373_19625589 chr3R_19625373_19625465 chr3R_19625289_19625372;chr3R_19625590_19625680 7.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 0.030827 K alternative_acceptor CG1832,I_chr2L_22167179_22167302,I_chr2L_22168644_22168740 chr2L - chr2L_22167239_22167302 chr2L_22167254_22167302 chr2L_22167303_22167402;chr2L_22167050_22167238 15.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00068599999999999998 K alternative_acceptor spz chr3R - chr3R_22892176_22892329 chr3R_22892203_22892329 chr3R_22892330_22892387;chr3R_22892041_22892175 60.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 49.07 NA NA NA 42.22 47.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.41 NA 50.00 NA NA 48.64 NA NA NA NA NA NA 41.94 NA 0.0 K alternative_acceptor CG14133 chr3L - chr3L_11683209_11683325;chr3L_11683229_11683325 chr3L_11683239_11683325 chr3L_11683326_11683412;chr3L_11682731_11683208 22.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA 0.015096999999999999 K alternative_acceptor CG8949,I_chrX_16971474_16971708,I_chrX_16971501_16971713 chrX - chrX_16971474_16971713 chrX_16971501_16971713 chrX_16971714_16971808;chrX_16971401_16971473 5.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024421000000000002 K alternative_acceptor RpS27A,Ip259 chr2L + chr2L_10408387_10409710 chr2L_10408387_10408738 chr2L_10408376_10408386;chr2L_10409711_10410051 46.12 56.86 34.12 NA NA NA NA 34.30 NA 57.63 NA NA 33.15 NA 32.23 NA NA NA 34.30 34.14 34.31 68.28 71.17 NA NA 23.60 60.95 72.41 90.38 79.59 NA 63.27 74.55 31.39 78.88 82.87 71.42 64.62 NA 68.34 82.08 33.85 NA 78.98 NA 81.17 61.13 80.55 NA NA 78.88 56.33 65.44 83.59 NA NA NA 75.97 0.0 K alternative_acceptor Pak,RI_chr3R_2181143_2181934 chr3R + chr3R_2183063_2184004 chr3R_2183063_2183596 chr3R_2182472_2183062;chr3R_2184005_2184744 5.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG7091,RI_chr3R_8805541_8805680,I_chr3R_8809774_8809832 chr3R + chr3R_8804251_8804598 chr3R_8804251_8804579 chr3R_8803691_8804250;chr3R_8804599_8804832 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00070699999999999995 K alternative_acceptor SWAP,RI_chrX_936466_936762,I_chrX_936466_936835,RI_chrX_936919_937245,RI_chrX_938935_938985,I_chrX_941459_982652 chrX + chrX_936466_936762;chrX_936466_936966 chrX_936466_936835 chrX_936366_936465;chrX_936967_937018 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000118 K alternative_acceptor Pgi,I_chr2R_4801076_4801329 chr2R - chr2R_4801072_4801214;chr2R_4801076_4801214 chr2R_4801134_4801214 chr2R_4801215_4801631;chr2R_4800976_4801071 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3681199999999999e-07 K alternative_acceptor enc chr3L + chr3L_3832544_3832616 chr3L_3832544_3832601 chr3L_3832451_3832543;chr3L_3832617_3832758 13.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031255999999999999 K alternative_acceptor CG34408,I_chrX_10120689_10121004 chrX + chrX_10120689_10121444;chrX_10120689_10121381 chrX_10120689_10121435 chrX_10120589_10120688;chrX_10121445_10121990 94.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0088719999999999997 K alternative_acceptor mor chr3R - chr3R_11795125_11795603 chr3R_11795317_11795603 chr3R_11795604_11795814;chr3R_11794297_11795124 72.79 NA NA NA NA 37.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.96 NA NA NA NA NA 42.31 NA NA NA 95.00 NA 47.79 NA NA NA NA NA NA NA 92.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor Pxn,I_chr3L_2629527_2629921 chr3L - chr3L_2629579_2629913;chr3L_2629613_2629913;chr3L_2629585_2629913;chr3L_2629684_2629913;chr3L_2629527_2629913 chr3L_2629597_2629913 chr3L_2629914_2629921;chr3L_2629427_2629526 6.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG17119,sav chr3R - chr3R_18880054_18880450 chr3R_18880351_18880450 chr3R_18880451_18880553;chr3R_18880008_18880053 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029180000000000001 K alternative_acceptor Tango2,RI_chrX_13543535_13546911,I_chrX_13544101_13544542 chrX + chrX_13511970_13512305 chrX_13511970_13512134 chrX_13511850_13511969;chrX_13512306_13512435 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.00 NA NA NA 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.6721634e-05 K alternative_acceptor CG4829,I_chrX_16717240_16717547 chrX + chrX_16717240_16717619;chrX_16717240_16717547 chrX_16717240_16717889 chrX_16717140_16717239;chrX_16717890_16718151 1.60 NA NA NA 25.66 31.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor brm,I_chr3L_15968197_15968325 chr3L - chr3L_15975300_15975367 chr3L_15975312_15975367 chr3L_15975368_15975432;chr3L_15975223_15975299 51.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014666999999999999 K alternative_acceptor Cip4,I_chr3L_4363128_4363769,I_chr3L_4363386_4363987 chr3L - chr3L_4363128_4363987 chr3L_4363386_4363987 chr3L_4363988_4364067;chr3L_4363028_4363127 3.31 NA NA NA NA NA 23.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Gpo-1,EI_chr2R_11747445_11747699,I_chr2R_11749758_11750187,I_chr2R_11756325_11756380 chr2R - chr2R_11748259_11750187;chr2R_11748228_11750187 chr2R_11749758_11750187 chr2R_11750188_11750219;chr2R_11748106_11748227 3.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4999999999999997e-05 K alternative_acceptor CG7849 chr2R + chr2R_1964611_1964665 chr2R_1964611_1964654 chr2R_1964481_1964610;chr2R_1964666_1964878 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.2112152000000006e-05 K alternative_acceptor l(2)k05819,I_chr2L_4396173_4396266 chr2L + chr2L_4396173_4396809 chr2L_4396173_4396266 chr2L_4396143_4396172;chr2L_4396810_4396906 6.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.63 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 0.0 K alternative_acceptor gce chrX + chrX_15211516_15211645 chrX_15211516_15211580 chrX_15211376_15211515;chrX_15211646_15212206 4.55 NA NA NA NA NA 25.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor msn,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2564696_2565600 chr3L_2564756_2565600 chr3L_2565601_2565613;chr3L_2564397_2564695 70.00 58.49 NA NA NA 53.85 NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.85 46.73 49.41 48.08 NA 50.00 36.59 NA NA NA NA 59.62 NA 52.78 NA 52.88 59.68 53.09 57.69 NA NA NA NA NA NA 34.38 NA NA 36.84 43.75 NA NA 33.33 NA 56.25 50.00 NA 0.0 K alternative_acceptor Spred,I_chr2R_10655876_10656868 chr2R - chr2R_10650514_10651335 chr2R_10650580_10651335 chr2R_10651336_10651504;chr2R_10650450_10650513 89.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA 69.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1171239999999992e-05 N alternative_acceptor CG8080,I_chr2R_4979276_4979936,CG13741 chr2R - chr2R_4979276_4979936;chr2R_4979159_4979936 chr2R_4979377_4979936 chr2R_4979937_4980036;chr2R_4979059_4979158 3.34 NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Mocs1,I_chr3L_11064230_11064309 chr3L + chr3L_11064230_11064658 chr3L_11064230_11064309 chr3L_11064151_11064229;chr3L_11064659_11065510 2.17 NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3398965135459998e-06 K alternative_acceptor CG15814,I_chrX_17743744_17743940 chrX - chrX_17743744_17743940 chrX_17743844_17743940 chrX_17743941_17744040;chrX_17743644_17743743 98.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.005143 K alternative_acceptor tacc,I_chr3R_570388_572101,I_chr3R_574271_574512 chr3R - chr3R_563485_567573;chr3R_563461_567573 chr3R_563503_567573 chr3R_567574_568885;chr3R_563195_563460 62.86 NA NA NA NA NA 34.48 NA NA NA 40.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.83 NA 33.33 NA NA NA NA NA 5.0113320894000003e-11 K alternative_acceptor cni,RI_chr2L_16309575_16309999,I_chr2L_16323518_16323594,I_chr2L_16324901_16326020 chr2L - chr2L_16310624_16310690;chr2L_16310641_16310690 chr2L_16310637_16310690 chr2L_16310691_16310700;chr2L_16310441_16310623 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.14 NA NA NA NA NA NA NA 31.11 NA NA 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.29 NA NA NA 35.90 36.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA 7.8241441552990674e-12 K alternative_acceptor cic chr3R + chr3R_16126135_16126356 chr3R_16126135_16126329 chr3R_16125939_16126134;chr3R_16126357_16126761 77.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015809 K alternative_acceptor Ptp4E,EI_chrX_4842231_4842425 chrX + chrX_4847655_4848167;chrX_4847655_4847757 chrX_4847655_4848149 chrX_4847526_4847654;chrX_4848168_4848168 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Src42A chr2R + chr2R_1898274_1898445 chr2R_1898274_1898436 chr2R_1898115_1898273;chr2R_1898446_1898614 74.07 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018886863629999999 K alternative_acceptor Rbp1,Mcm5 chr3R + chr3R_6610646_6611879 chr3R_6610646_6611124 chr3R_6610279_6610645;chr3R_6611880_6612229 25.00 NA NA 50.57 NA NA NA 50.43 NA NA NA NA 48.15 NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA NA 13.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.82 10.62 10.44 NA 11.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG14741 chr3R - chr3R_7900616_7900895;chr3R_7900613_7900895 chr3R_7900593_7900895 chr3R_7900896_7901144;chr3R_7900525_7900592 22.08 NA NA 7.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA 45.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.10 2.4867323285220412e-08 N alternative_acceptor CG17025,I_chr3R_9289511_9290079 chr3R - chr3R_9284268_9291428 chr3R_9289511_9291428 chr3R_9291429_9291828;chr3R_9284057_9284267 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG17082,I_chr2R_644671_645137,I_chr2R_645254_645312 chr2R + chr2R_645254_645312;chr2R_645254_645316 chr2R_645254_645306 chr2R_645185_645253;chr2R_645317_645382 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027262999999999999 K alternative_acceptor Spn5,CG6687 chr3R - chr3R_11030270_11032070 chr3R_11030273_11032070 chr3R_11032071_11032377;chr3R_11029272_11030269 76.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013979999999999999 K alternative_acceptor CG7766,I_chrX_8993495_8994545,I_chrX_8991338_8991387 chrX - chrX_8989685_8990798 chrX_8990009_8990798 chrX_8990799_8990858;chrX_8989428_8989684 73.91 NA NA NA NA NA 46.38 NA NA NA 92.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.06 NA NA NA NA NA 84.78 94.86 87.76 NA 86.61 88.73 NA NA 87.02 87.91 NA 84.38 NA NA NA NA 88.64 NA NA NA 84.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG4585,I_chr2R_19752558_19752634 chr2R - chr2R_19751932_19752634 chr2R_19752558_19752634 chr2R_19752635_19752734;chr2R_19750513_19751931 4.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.6099999999999992e-10 N alternative_acceptor Iap2,I_chr2R_11824086_11824186,REI_chr2R_11824089_11824525,CEI_chr2R_11826763_11827279 chr2R - chr2R_11821304_11821703 chr2R_11821325_11821703 chr2R_11821704_11822085;chr2R_11820289_11821303 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.5999999999999998e-05 K alternative_acceptor Pabp2,I_chr2R_4020297_4020426 chr2R + chr2R_4020581_4020645 chr2R_4020581_4020642 chr2R_4020447_4020580;chr2R_4020646_4020713 7.41 NA NA NA NA NA 20.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00022882195600000001 K alternative_acceptor CG14235,noncoding_24847,CG18809,noncoding_24848 chrX - chrX_19635202_19638294;chrX_19635236_19638294 chrX_19635199_19638294 chrX_19638295_19638317;chrX_19634765_19635198 59.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010511 K alternative_acceptor CG17233,RI_chr3L_20232898_20232962 chr3L - chr3L_20228778_20229533 chr3L_20229429_20229533 chr3L_20229534_20231010;chr3L_20228602_20228777 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000172019288 K alternative_acceptor CG5060,RI_chr3R_16115918_16116080 chr3R + chr3R_16115918_16116092 chr3R_16115918_16116080 chr3R_16115818_16115917;chr3R_16116093_16116180 13.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028594999999999999 K alternative_acceptor Tao-1,E_chrX_19467010_19469645 chrX - chrX_19467498_19469390 chrX_19469008_19469390 chrX_19469391_19470002;chrX_19467324_19467497 6.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Syb chr2R - chr2R_6138650_6139432 chr2R_6138719_6139432 chr2R_6139433_6139489;chr2R_6138448_6138649 26.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.31 0.0 K alternative_acceptor tsh,I_chr2L_21829859_21830276 chr2L + chr2L_21829859_21833370 chr2L_21829859_21830276 chr2L_21829759_21829858;chr2L_21833371_21833470 4.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG31908 chr2L - chr2L_7026982_7027193 chr2L_7027020_7027193 chr2L_7027194_7027261;chr2L_7026724_7026981 96.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.00 0.040941999999999999 N alternative_acceptor CG5706,I_chr3R_20078025_20078083 chr3R - chr3R_20078010_20078087 chr3R_20078025_20078087 chr3R_20078088_20078118;chr3R_20077925_20078009 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049338 N alternative_acceptor CG8108,EI_chr3L_9859462_9859590,chr3L_9859594_9859878.0 chr3L + chr3L_9859462_9860377;chr3L_9859462_9859590 chr3L_9859462_9860413 chr3L_9859414_9859461;chr3L_9860414_9860844 80.33 NA NA 61.33 NA NA 59.74 69.66 NA NA NA NA NA NA NA 55.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.76 NA NA NA NA NA NA NA 91.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor trbl,I_chr3L_20390576_20390678 chr3L - chr3L_20390576_20393525 chr3L_20393312_20393525 chr3L_20393526_20394677;chr3L_20390476_20390575 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.78 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.128e-08 K alternative_acceptor RI_chr3R_5165997_5180143,CG33936,I_chr3R_5167726_5180143,R_chr3R_5168211_5180143,RI_chr3R_5168214_5168297,RI_chr3R_5183458_5183705 chr3R + chr3R_5168214_5180143 chr3R_5168214_5168297 chr3R_5168114_5168213;chr3R_5180144_5180232 6.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA 24.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG13900,I_chr3L_830745_830907 chr3L - chr3L_830745_830907;chr3L_830715_830907;chr3L_830729_830907 chr3L_830814_830907 chr3L_830908_831007;chr3L_830702_830714 1.52 NA NA NA NA NA NA NA NA 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5999999999999999e-05 K alternative_acceptor akirin,I_chr3L_7363173_7364806,I_chr3L_7363177_7364806,I_chr3L_7363177_7364831,I_chr3L_7363211_7364831,I_chr3L_7363731_7364806,I_chr3L_7364126_7364806,RI_chr3L_7364737_7364806 chr3L + chr3L_7363169_7364831 chr3L_7363169_7364806 chr3L_7363111_7363168;chr3L_7364832_7364906 82.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.22 NA NA 42.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.85 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG40191,I_chr2RHet_391475_391828,I_chr2RHet_392279_392824 chr2RHet + chr2RHet_391927_392824 chr2RHet_391927_391975 chr2RHet_391829_391926;chr2RHet_392825_392923 94.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000118 K alternative_acceptor tou,I_chr2R_7468394_7468453,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7468368_7468453 chr2R_7468394_7468453 chr2R_7468454_7468553;chr2R_7468294_7468367 32.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.97 NA NA NA NA 20.18 17.76 NA NA NA NA 78.33 NA NA 60.00 NA NA NA NA 20.81 NA NA NA 57.28 NA NA NA NA 70.50 NA 78.66 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 58.94 0.0 K alternative_acceptor CoVa,I_chr3R_7645367_7645428 chr3R + chr3R_7645367_7645432 chr3R_7645367_7645409 chr3R_7645359_7645366;chr3R_7645433_7645528 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.03 NA NA 18.75 21.43 NA NA 45.00 NA 20.31 NA NA 0.0 K alternative_acceptor Prat chr3R - chr3R_3737336_3737415 chr3R_3737339_3737415 chr3R_3737416_3737540;chr3R_3735310_3737335 67.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024621000000000001 K alternative_acceptor CG3635 chr2L + chr2L_22183467_22183599;chr2L_22183467_22183607 chr2L_22183467_22183527 chr2L_22183394_22183466;chr2L_22183608_22183915 40.37 NA NA NA NA NA 54.40 NA NA 54.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.68 NA NA 54.02 NA NA NA NA NA NA 51.46 NA NA NA 64.77 NA NA NA NA 51.49 NA NA 53.59 NA 51.14 NA 55.90 NA NA NA 56.00 NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor sec23,I_chr3R_1474873_1475080,I_chr3R_1474899_1475080,I_chr3R_1474960_1475051,I_chr3R_1477727_1478102 chr3R + chr3R_1474899_1475093 chr3R_1474899_1475080 chr3R_1474877_1474898;chr3R_1475094_1475151 89.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.27 NA NA NA NA NA 65.62 NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA 60.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5178545225930244e-09 K alternative_acceptor dwg,RI_chrX_2622297_2622355,RI_chrX_2622297_2622430,RI_chrX_2622435_2622577,RI_chrX_2627170_2627263 chrX + chrX_2622297_2622355;chrX_2622297_2622430 chrX_2622297_2622577 chrX_2622197_2622296;chrX_2622578_2622677 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 54.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG7956 chr3R + chr3R_17352625_17352984 chr3R_17352625_17352877 chr3R_17351551_17352624;chr3R_17352985_17353123 82.76 NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA NA 67.57 NA NA NA NA NA NA 52.38 54.55 NA NA 44.44 NA NA 50.00 71.43 NA NA 66.67 52.38 NA NA NA 63.16 71.43 63.64 34.48 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA 40.00 0.0 N alternative_acceptor CG40467 chr3LHet - chr3LHet_722704_789080;chr3LHet_787974_789080 chr3LHet_787757_789080 chr3LHet_789081_789255;chr3LHet_722418_722703 100.00 NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0018500000000000001 K alternative_acceptor MED1 chr3L - chr3L_21623009_21624032 chr3L_21623014_21624032 chr3L_21624033_21625939;chr3L_21621425_21623008 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.027741999999999999 K alternative_acceptor Hsc70-4,EI_chr3R_11068693_11068772 chr3R + chr3R_11068693_11070081 chr3R_11068693_11068772 chr3R_11068632_11068692;chr3R_11070082_11072336 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018169999999999999 K alternative_acceptor CG42533,F_chr2L_7476906_7476978 chr2L - chr2L_7474506_7476978 chr2L_7476906_7476978 chr2L_7476979_7477078;chr2L_7474406_7474505 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.3299999999999998e-09 K alternative_acceptor CG5938,EI_chr3R_23100734_23100898,RI_chr3R_23101686_23102014 chr3R + chr3R_23100734_23101112 chr3R_23100734_23100898 chr3R_23100634_23100733;chr3R_23101113_23101275 9.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00064599999999999998 K alternative_acceptor cl chr2L + chr2L_5520236_5520304;chr2L_5520236_5520301 chr2L_5520236_5520286 chr2L_5520216_5520235;chr2L_5520305_5520545 65.38 NA NA NA NA 52.05 52.07 NA 82.45 NA NA NA NA NA 50.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.29 NA NA 45.95 NA NA NA NA 36.00 NA NA NA NA 52.75 NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG2604 chr3R - chr3R_1048869_1048971 chr3R_1048911_1048971 chr3R_1048972_1048994;chr3R_1047347_1048868 58.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.36 NA NA NA NA 47.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0012067546400000002 N alternative_acceptor slik,I_chr2R_20286707_20287372,REI_chr2R_20287415_20287722,I_chr2R_20288968_20289185,I_chr2R_20289332_20290093 chr2R - chr2R_20283680_20283755 chr2R_20283699_20283755 chr2R_20283756_20283824;chr2R_20283566_20283679 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021949999999999999 K alternative_acceptor CG5630 chr3R + chr3R_16752700_16754401 chr3R_16752700_16752909 chr3R_16752493_16752699;chr3R_16754402_16754407 98.72 NA NA 64.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor RanBPM chr2R + chr2R_6317289_6318384 chr2R_6317289_6318038 chr2R_6317228_6317288;chr2R_6318385_6319420 17.86 NA NA NA 5.13 NA NA NA NA NA NA NA 5.00 NA NA NA 5.00 NA 2.38 NA 6.67 47.83 NA NA NA NA NA NA 51.43 NA NA NA 44.83 NA NA 50.00 NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.33 1.8361918508192188e-27 K alternative_acceptor Aats-gly,CG6854 chr3L + chr3L_15088286_15088373 chr3L_15088286_15088354 chr3L_15088282_15088285;chr3L_15088374_15090790 2.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG14425,Sxl,CG14425_Sxl,CEFI_chrX_6981717_6984166,CEF_chrX_6984538_6992033 chrX - chrX_6979988_6981646 chrX_6980012_6981646 chrX_6981647_6981689;chrX_6979652_6979987 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039373999999999999 K alternative_acceptor CG31650,I_chr2L_5042885_5042960,I_chr2L_5042888_5042983,I_chr2L_5042891_5042964,I_chr2L_5042891_5043016,RI_chr2L_5042935_5042983,I_chr2L_5043017_5043077 chr2L - chr2L_5042888_5042983;chr2L_5042891_5042983 chr2L_5042935_5042983 chr2L_5042984_5043016;chr2L_5042835_5042887 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0014619786500000003 K alternative_acceptor Iswi chr2R + chr2R_8524243_8524328;chr2R_8524243_8524316 chr2R_8524243_8524348 chr2R_8524226_8524242;chr2R_8524349_8524495 89.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7210947399999998e-09 K alternative_acceptor CG1646,RI_chr3R_24638061_24638116,RI_chr3R_24638209_24638280,I_chr3R_24641816_24641874 chr3R + chr3R_24637877_24637948;chr3R_24637877_24637958 chr3R_24637877_24638116 chr3R_24637841_24637876;chr3R_24638117_24638208 91.94 NA NA NA NA NA 78.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00054048141599999995 K alternative_acceptor Spn,I_chr3L_2511764_2512148 chr3L - chr3L_2508866_2509363 chr3L_2508908_2509363 chr3L_2509364_2509500;chr3L_2508639_2508865 23.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA 3.23 NA NA 63.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7291341679999999e-09 K alternative_acceptor CG7120,I_chr3L_8393044_8393104,I_chr3L_8393044_8393116 chr3L + chr3L_8393044_8393181 chr3L_8393044_8393104 chr3L_8392944_8393043;chr3L_8393182_8393204 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000386 K alternative_acceptor CG16971,I_chr3L_225856_225909,I_chr3L_225919_225983,RI_chr3L_225919_226004,I_chr3L_229245_230186 chr3L + chr3L_225919_226219;chr3L_225919_226004 chr3L_225919_225983 chr3L_225910_225918;chr3L_226220_226256 38.39 NA NA NA NA NA 25.37 NA NA NA NA NA NA NA 51.85 NA NA NA 24.85 23.11 NA 56.33 NA NA NA 51.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 53.77 NA NA NA NA 24.65 50.34 22.76 52.56 NA NA NA NA 25.36 25.30 NA NA NA NA NA 22.00 NA NA 58.16 0.0 K alternative_acceptor I_chr4_913576_919018,I_chr4_924098_927699,RI_chr4_927771_929704,CG32021,RI_chr4_928193_928245,I_chr4_928482_929704,noncoding_20815,I_chr4_929811_932812 chr4 - chr4_927771_929704;chr4_928551_929704 chr4_928482_929704 chr4_929705_929804;chr4_927741_927770 25.30 NA 14.63 49.02 NA NA NA 9.62 NA NA 67.50 NA NA NA 40.00 46.81 NA 13.89 50.00 43.12 NA NA 47.32 NA NA 14.71 NA NA 35.45 NA NA NA NA NA 15.25 NA 40.00 NA NA 14.39 39.29 NA 12.90 NA 42.86 11.65 40.28 NA NA NA NA 10.71 35.56 NA NA 42.42 40.00 50.77 0.0 K alternative_acceptor fra chr2R + chr2R_8445281_8445949;chr2R_8445281_8446375 chr2R_8445281_8445922 chr2R_8445263_8445280;chr2R_8446376_8446583 60.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 85.71 88.89 80.00 NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA 20.00 76.47 NA NA NA NA NA 80.95 NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA 27.27 7.8738537738477043e-26 N alternative_acceptor CG3287,I_chr2R_2700203_2700285 chr2R + chr2R_2701259_2702564 chr2R_2701259_2701541 chr2R_2700678_2701258;chr2R_2702565_2703029 73.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.07 NA NA NA NA NA NA 59.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8612099999999999e-07 K alternative_acceptor CG5646,I_chr3R_23386250_23386484,I_chr3R_23386287_23386484 chr3R - chr3R_23386250_23386484;chr3R_23386220_23386484;chr3R_23386287_23386484 chr3R_23386237_23386484 chr3R_23386485_23386584;chr3R_23386187_23386219 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 86.21 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1003648164499995e-07 K alternative_acceptor CG11652,I_chr3L_11689925_11689974 chr3L - chr3L_11688679_11689974 chr3L_11689925_11689974 chr3L_11689975_11690074;chr3L_11688579_11688678 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0092390000000000007 K alternative_acceptor CG1021,I_chr3R_2217711_2231099,I_chr3R_2217711_2231390,RI_chr3R_2217711_2231463,I_chr3R_2217742_2218601,I_chr3R_2217742_2219453,I_chr3R_2218465_2231390,RI_chr3R_2218465_2231463,I_chr3R_2218682_2231463,I_chr3R_2219634_2231390,I_chr3R_2231383_2231463 chr3R - chr3R_2217742_2218601;chr3R_2217711_2218601 chr3R_2218465_2218601 chr3R_2218602_2218681;chr3R_2217642_2217710 26.09 NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.11 NA NA NA NA NA 4.6912813267134387e-08 N alternative_acceptor alt chr3R - chr3R_13500526_13500610 chr3R_13500546_13500610 chr3R_13500611_13500733;chr3R_13499903_13500525 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor cerv,RI_chrX_15471783_15471843 chrX - chrX_15471783_15471843 chrX_15471799_15471843 chrX_15471844_15471943;chrX_15471683_15471782 61.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012244 K alternative_acceptor AP-1gamma,I_chrX_9003790_9007675 chrX + chrX_9003790_9004854 chrX_9003790_9004650 chrX_9003721_9003789;chrX_9004855_9004862 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.75 NA NA NA NA NA NA 91.67 NA NA NA 96.15 NA NA 88.89 NA NA NA 87.50 93.33 NA NA NA NA NA NA 95.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.91 9.2360641348714538e-19 K alternative_acceptor Rbp1-like,R_chrX_13277657_13278332 chrX - chrX_13275077_13278332 chrX_13277657_13278332 chrX_13278333_13278432;chrX_13274199_13275076 59.26 48.65 70.83 NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 39.71 36.96 48.15 75.00 NA 35.42 NA 72.97 NA 38.64 36.00 NA 40.54 30.16 NA 32.50 35.85 NA 30.23 73.08 NA 76.47 26.32 48.33 34.00 32.04 NA 46.15 NA NA NA 33.33 NA 39.02 NA 44.93 0.0 K alternative_acceptor CG15609,C_chr2R_12899322_12900789,I_chr2R_12902708_12903184 chr2R - chr2R_12900214_12900789 chr2R_12900280_12900789 chr2R_12900790_12900889;chr2R_12899457_12900213 100.00 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0090570000000000008 K alternative_acceptor Cf2,I_chr2L_4882802_4882864 chr2L - chr2L_4882493_4882864;chr2L_4882366_4882864 chr2L_4882802_4882864 chr2L_4882865_4882964;chr2L_4881215_4882365 22.22 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0459100000000003e-07 K alternative_acceptor tra2,I_chr2R_10491279_10491488,REFI_chr2R_10491644_10491701 chr2R - chr2R_10491007_10491488 chr2R_10491431_10491488 chr2R_10491489_10491563;chr2R_10490853_10491006 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA 26.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.619592e-06 K alternative_acceptor CG6845,I_chr3L_148414_148465,I_chr3L_148414_148475,I_chr3L_148414_148489 chr3L + chr3L_148414_148465;chr3L_148414_148475;chr3L_148414_148489 chr3L_148414_148461 chr3L_148350_148413;chr3L_148490_148555 87.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011701 N alternative_acceptor CG18228 chr3R - chr3R_4087273_4087522;chr3R_4087322_4087522 chr3R_4087428_4087522 chr3R_4087523_4087669;chr3R_4087045_4087272 13.04 NA NA NA NA NA 29.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7612575000000005e-05 N alternative_acceptor RpS20 chr3R + chr3R_16647996_16648154 chr3R_16647996_16648139 chr3R_16647888_16647995;chr3R_16648155_16648294 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Upf1,I_chrX_11799010_11799076 chrX - chrX_11798981_11799067 chrX_11799010_11799067 chrX_11799068_11799388;chrX_11798910_11798980 63.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00089499999999999996 K alternative_acceptor Eaf,RI_chr2R_3294566_3294636,I_chr2R_3294566_3294656,RI_chr2R_3294566_3294714,I_chr2R_3294566_3295255,I_chr2R_3294591_3295244 chr2R - chr2R_3294566_3295244 chr2R_3294591_3295244 chr2R_3295245_3295302;chr2R_3294491_3294565 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023098 K alternative_acceptor CG11006,F_chr3L_12799159_12799339 chr3L + chr3L_12799438_12799952;chr3L_12799438_12799955;chr3L_12799438_12800078;chr3L_12799438_12799967 chr3L_12799438_12800192 chr3L_12799340_12799437;chr3L_12800193_12800930 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG32394,RI_chr3L_6731199_6731803,dikar chr3L - chr3L_6730773_6731803 chr3L_6731199_6731803 chr3L_6731804_6731903;chr3L_6730635_6730772 10.34 NA NA 28.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA 26.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor Rab2,I_chr2R_2584435_2585553 chr2R + chr2R_2585891_2585965 chr2R_2585891_2585950 chr2R_2585554_2585890;chr2R_2585966_2586134 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9999999999999996e-06 K alternative_acceptor SdhA,I_chr2R_15283283_15283411,I_chr2R_15283319_15283369 chr2R - chr2R_15283283_15283369 chr2R_15283319_15283369 chr2R_15283370_15283469;chr2R_15283219_15283282 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 53.57 NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.1923299071646199e-13 K alternative_acceptor CG17689 chr3L + chr3L_13501646_13502149 chr3L_13501646_13501975 chr3L_13500035_13501645;chr3L_13502150_13502434 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1e-05 N alternative_acceptor CG31431 chr3R + chr3R_17697863_17698131;chr3R_17697863_17697989 chr3R_17697863_17697938 chr3R_17697704_17697862;chr3R_17698132_17698247 2.76 NA NA NA NA NA 13.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG11148,I_chr4_886499_886547,RI_chr4_886921_887162 chr4 - chr4_886478_886556 chr4_886499_886556 chr4_886557_886647;chr4_886399_886477 80.95 NA NA 97.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.024011000000000001 N alternative_acceptor Dscam,I_chr2R_3212243_3212342,F_chr2R_3219886_3228832,FI_chr2R_3229124_3235353,FI_chr2R_3236481_3242386,I_chr2R_3244812_3249222,FI_chr2R_3249373_3251385,FI_chr2R_3251554_3255892 chr2R - chr2R_3208270_3209087 chr2R_3208884_3209087 chr2R_3209088_3209151;chr2R_3207156_3208269 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0023410000000000002 K alternative_acceptor CG18170,CG33230,ABCB7 chr3L + chr3L_1620555_1620918 chr3L_1620555_1620816 chr3L_1620428_1620554;chr3L_1620919_1621042 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0999999999999999e-05 K alternative_acceptor east,CR_chrX_1912038_1912737 chrX + chrX_1912972_1913090 chrX_1912972_1913072 chrX_1912738_1912971;chrX_1913091_1913539 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025284999999999998 K alternative_acceptor CG13124,RI_chr2L_9907784_9908405,I_chr2L_9908142_9908424,I_chr2L_9908175_9908424,I_chr2L_9911150_9911296 chr2L - chr2L_9907848_9908424;chr2L_9908142_9908424 chr2L_9907784_9908424 chr2L_9908425_9908505;chr2L_9907756_9907783 78.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.9230516864869994e-06 K alternative_acceptor Cap-G,CG34439 chr2R + chr2R_9046609_9047235 chr2R_9046609_9047038 chr2R_9046522_9046608;chr2R_9047236_9047380 41.67 NA NA 88.33 NA NA NA 70.87 NA 21.43 NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA 69.91 NA 6.67 NA NA NA NA NA NA NA 21.28 NA NA 19.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor foi,I_chr3L_8520658_8520733,I_chr3L_8524905_8524976 chr3L + chr3L_8520658_8523659 chr3L_8520658_8520733 chr3L_8520558_8520657;chr3L_8523660_8524249 100.00 NA NA 50.00 NA NA NA 75.00 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA 83.33 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 75.00 NA 75.00 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.3544669302029283e-35 N alternative_acceptor Rpn2,CG11897 chr3R + chr3R_24980396_24980472 chr3R_24980396_24980457 chr3R_24979418_24980395;chr3R_24980473_24981742 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 67.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG32767,RI_chrX_4978019_4978605 chrX - chrX_4976273_4978605 chrX_4978019_4978605 chrX_4978606_4978705;chrX_4975519_4976272 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00028120811999999998 K alternative_acceptor wun,I_chr2R_5291118_5291211,I_chr2R_5297151_5300729,I_chr2R_5297159_5300813 chr2R - chr2R_5290341_5291211 chr2R_5291118_5291211 chr2R_5291212_5291311;chr2R_5290161_5290340 3.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.46 NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor msn,I_chr3L_2558033_2560115,F_chr3L_2558036_2563817,I_chr3L_2558390_2561931,I_chr3L_2558393_2560115,I_chr3L_2579521_2586402,I_chr3L_2585716_2586402,I_chr3L_2585733_2586036,I_chr3L_2585739_2586413 chr3L - chr3L_2558393_2560115;chr3L_2558390_2560115 chr3L_2558036_2560115 chr3L_2560116_2560215;chr3L_2557936_2558035 21.34 NA NA NA NA NA 41.24 NA NA NA NA NA 9.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Hr78,I_chr3L_21490089_21490390,CG33214 chr3L - chr3L_21490008_21490390;chr3L_21489978_21490390;chr3L_21490023_21490390 chr3L_21490089_21490390 chr3L_21490391_21490490;chr3L_21489920_21489977 0.00 NA NA 15.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.03057 K alternative_acceptor CG14614,REI_chrX_21856047_21856229,RI_chrX_21856896_21857109 chrX - chrX_21856896_21857109;chrX_21856924_21857109 chrX_21857041_21857109 chrX_21857110_21857209;chrX_21856796_21856895 78.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047114000000000003 K alternative_acceptor CG5514,RI_chr3R_23768206_23768306,Gp93 chr3R + chr3R_23767856_23768306;chr3R_23767856_23768309 chr3R_23767856_23768156 chr3R_23765429_23767855;chr3R_23768310_23768406 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.83 NA NA NA NA NA 45.71 NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.6273000000000008e-13 K alternative_acceptor Nhe2,I_chr2L_21122390_21122912 chr2L + chr2L_21124522_21125346 chr2L_21124522_21125316 chr2L_21124443_21124521;chr2L_21125347_21125439 25.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001658 K alternative_acceptor wb chr2L + chr2L_14325555_14326434 chr2L_14325555_14325695 chr2L_14324897_14325554;chr2L_14326435_14327053 40.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011421000000000001 K alternative_acceptor Fibp,RI_chr3L_19810268_19810326 chr3L - chr3L_19809762_19809819;chr3L_19809775_19809819 chr3L_19809780_19809819 chr3L_19809820_19809920;chr3L_19809693_19809761 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.6146219999999993e-08 K alternative_acceptor CG8128,I_chrX_15591697_15591816 chrX + chrX_15591697_15591816;chrX_15591697_15592355 chrX_15591697_15592065 chrX_15591597_15591696;chrX_15592356_15592720 11.11 NA NA NA NA NA 30.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0064029999999999998 K alternative_acceptor Nop60B,RI_chr2R_20063248_20063455,I_chr2R_20063248_20063949,F_chr2R_20073291_20073744 chr2R + chr2R_20063248_20063455 chr2R_20063248_20063439 chr2R_20063148_20063247;chr2R_20063456_20063555 98.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor rudimentary,I_chrX_16561903_16561969 chrX + chrX_16549643_16550417 chrX_16549643_16550361 chrX_16549413_16549642;chrX_16550418_16551189 2.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010200000000000001 K alternative_acceptor how chr3R + chr3R_17897152_17897460 chr3R_17897152_17897418 chr3R_17897055_17897151;chr3R_17897461_17897763 11.11 NA NA NA NA NA 39.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7457248000000005e-10 K alternative_acceptor dnc,I_chrX_3150245_3150319,I_chrX_3150351_3152643 chrX + chrX_3150245_3152643;chrX_3150245_3152646 chrX_3150245_3150319 chrX_3150235_3150244;chrX_3152647_3152733 30.00 NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0015610000000000001 K alternative_acceptor CG42248,I_chrX_705402_712468 chrX - chrX_713860_714537 chrX_714112_714537 chrX_714538_716002;chrX_713726_713859 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001384 K alternative_acceptor B4,I_chr2L_13513474_13549131,I_chr2L_13547133_13549131,I_chr2L_13547162_13547692,I_chr2L_13547304_13549131 chr2L - chr2L_13547304_13549131;chr2L_13547133_13549131 chr2L_13547162_13549131 chr2L_13549132_13549231;chr2L_13547062_13547132 75.00 NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040355000000000002 K alternative_acceptor RpL34b,CG9356 chr3R - chr3R_5226745_5226917 chr3R_5226748_5226917 chr3R_5226918_5226997;chr3R_5226664_5226744 4.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.43 NA 19.61 NA 28.33 18.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA 16.13 NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Psn,RI_chr3L_20430213_20430358 chr3L + chr3L_20425808_20425896 chr3L_20425808_20425866 chr3L_20425774_20425807;chr3L_20425897_20426106 94.74 NA 80.43 84.72 NA 83.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.8412993896559999e-06 K alternative_acceptor l(2)gd1,Gr32a chr2L + chr2L_11109508_11110158 chr2L_11109508_11110104 chr2L_11109356_11109507;chr2L_11110159_11110249 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000176223078 N alternative_acceptor SD23414,CG9132,I_chrX_16696492_16696589 chrX - chrX_16692699_16692782 chrX_16692718_16692782 chrX_16692783_16692991;chrX_16691549_16692698 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0047619999999999997 K alternative_acceptor Mbs,I_chr3L_16045251_16046108,RI_chr3L_16045275_16045854,RI_chr3L_16045275_16046111,RI_chr3L_16045277_16046104,I_chr3L_16045316_16046104,I_chr3L_16057100_16057329 chr3L + chr3L_16045251_16046104;chr3L_16045251_16046129;chr3L_16045251_16046108;chr3L_16045251_16046111 chr3L_16045251_16045854 chr3L_16045216_16045250;chr3L_16046130_16046204 35.14 NA NA NA NA NA NA NA NA 52.63 57.14 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.26 NA NA NA NA NA NA NA 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 7.8688808399861802e-17 K alternative_acceptor Dcp2,F_chr3L_15815909_15816023,F_chr3L_15817090_15817547 chr3L - chr3L_15815112_15815170 chr3L_15815115_15815170 chr3L_15815171_15815908;chr3L_15814221_15815111 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017323999999999999 N alternative_acceptor CG8839,I_chr2R_8229288_8231538 chr2R - chr2R_8228920_8228992 chr2R_8228935_8228992 chr2R_8228993_8229287;chr2R_8228715_8228919 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Hrb98DE,I_chr3R_24425722_24428493,I_chr3R_24426291_24426781,RI_chr3R_24429041_24431183 chr3R + chr3R_24426291_24426439 chr3R_24426291_24426427 chr3R_24426191_24426290;chr3R_24426440_24426915 30.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.033586999999999999 K alternative_acceptor rgn chr3L + chr3L_21413463_21413564 chr3L_21413463_21413540 chr3L_21413351_21413462;chr3L_21413565_21413789 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.58 NA NA NA NA NA 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0759286997599997e-06 K alternative_acceptor CG8726 chr2R - chr2R_3859035_3859141 chr2R_3859070_3859141 chr2R_3859142_3859511;chr2R_3858749_3859034 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0074390000000000003 K alternative_acceptor Nmnat chr3R + chr3R_20772018_20772675;chr3R_20772018_20772197 chr3R_20772018_20772605 chr3R_20771916_20772017;chr3R_20772676_20772744 61.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.00 77.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00101741696 K alternative_acceptor CG1646,I_chr3R_24640561_24640869,I_chr3R_24641816_24641874 chr3R + chr3R_24641449_24641521 chr3R_24641449_24641497 chr3R_24641204_24641448;chr3R_24641522_24641682 85.71 NA NA 98.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000106752285 K alternative_acceptor CG31344,RI_chr3R_11050688_11050804,I_chr3R_11054902_11054955 chr3R - chr3R_11050657_11050804 chr3R_11050688_11050804 chr3R_11050805_11050904;chr3R_11050588_11050656 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9129999999999995e-09 K alternative_acceptor Khc-73 chr2R - chr2R_11409610_11410378 chr2R_11409634_11410378 chr2R_11410379_11410524;chr2R_11409507_11409609 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.0000000000000007e-05 K alternative_acceptor CG40439,I_chr2L_22690863_22690905 chr2L - chr2L_22690855_22690905;chr2L_22690863_22690905 chr2L_22690836_22690905 chr2L_22690906_22691005;chr2L_22690763_22690835 94.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015805 N alternative_acceptor Rpn5 chr3R + chr3R_1615349_1615402 chr3R_1615349_1615399 chr3R_1615211_1615348;chr3R_1615403_1615415 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.0000000000000003e-05 K alternative_acceptor CG15347,I_chrX_8353371_8353552,I_chrX_8353371_8354203,I_chrX_8353497_8353552 chrX - chrX_8353371_8354798 chrX_8353416_8354798 chrX_8354799_8354949;chrX_8353271_8353370 7.17 NA NA NA NA NA 26.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor lama,I_chr3L_5346888_5347714 chr3L - chr3L_5340784_5347714 chr3L_5346888_5347714 chr3L_5347715_5347814;chr3L_5340732_5340783 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor tral,I_chr3L_12512171_12512251 chr3L + chr3L_12508673_12509676 chr3L_12508673_12509658 chr3L_12508464_12508672;chr3L_12509677_12510159 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor NijA chr3L - chr3L_10688468_10688728 chr3L_10688516_10688728 chr3L_10688729_10688804;chr3L_10688432_10688467 63.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.021805999999999999 K alternative_acceptor l(1)G0334,I_chrX_4596624_4596856,I_chrX_4596625_4596762 chrX + chrX_4596625_4596856 chrX_4596625_4596724 chrX_4596525_4596624;chrX_4596857_4596862 20.25 NA NA NA NA NA 48.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA NA 43.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor SNF4Agamma,I_chr3R_16982134_16982890 chr3R + chr3R_16982134_16983336;chr3R_16982134_16983164;chr3R_16982134_16983218;chr3R_16982134_16983159 chr3R_16982134_16982890 chr3R_16982126_16982133;chr3R_16983337_16983376 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA NA NA NA NA NA 0.018276000000000001 K alternative_acceptor Mmp1,E_chr2R_20560380_20562585,I_chr2R_20564123_20565214,I_chr2R_20569965_20572193 chr2R - chr2R_20559830_20562495 chr2R_20560840_20562495 chr2R_20562496_20562664;chr2R_20559732_20559829 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.99 0.0 N alternative_acceptor CG6664 chr3L - chr3L_17007987_17008086 chr3L_17008005_17008086 chr3L_17008087_17008177;chr3L_17007093_17007986 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000602 K alternative_acceptor Cip4,I_chr3L_4325411_4326640,I_chr3L_4363128_4363769,I_chr3L_4363386_4363987 chr3L - chr3L_4325384_4326983 chr3L_4325411_4326983 chr3L_4326984_4327170;chr3L_4325311_4325383 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021870000000000001 K alternative_acceptor CG9776 chr3R - chr3R_158200_158713 chr3R_158583_158713 chr3R_158714_158881;chr3R_158012_158199 7.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019826 K alternative_acceptor CG6454,I_chr3R_20175958_20178905 chr3R + chr3R_20175958_20177774 chr3R_20175958_20176448 chr3R_20175858_20175957;chr3R_20177775_20178073 9.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4e-05 K alternative_acceptor wge chr3R - chr3R_18542387_18542655;chr3R_18542390_18542655 chr3R_18542354_18542655 chr3R_18542656_18542685;chr3R_18540256_18542353 70.71 NA NA NA NA NA 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.2604700000000003e-07 K alternative_acceptor Atg18,I_chr3L_8182683_8182941 chr3L + chr3L_8181681_8182401 chr3L_8181681_8182386 chr3L_8180913_8181680;chr3L_8182402_8182545 26.67 NA NA 42.42 NA 9.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.3446805514263038e-09 K alternative_acceptor Sin3A,RI_chr2R_8468118_8468706,I_chr2R_8473578_8480185,RI_chr2R_8479951_8480233 chr2R - chr2R_8468118_8468706 chr2R_8468136_8468706 chr2R_8468707_8468806;chr2R_8468018_8468117 81.63 NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5461224999999999e-10 K alternative_acceptor mfas,I_chr3R_7811954_7812017,I_chr3R_7818597_7818853,I_chr3R_7818607_7818853,RI_chr3R_7818607_7818970 chr3R - chr3R_7818597_7818970;chr3R_7818575_7818970 chr3R_7818607_7818970 chr3R_7818971_7818995;chr3R_7818507_7818574 14.81 NA NA NA NA NA 39.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor mfas,I_chr3R_7811954_7812017,RI_chr3R_7818607_7818970 chr3R - chr3R_7815048_7817793;chr3R_7815051_7817793 chr3R_7815246_7817793 chr3R_7817794_7817801;chr3R_7814932_7815047 64.42 NA NA NA 76.61 NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG3348,RI_chr3R_23117734_23117847 chr3R - chr3R_23117716_23117847 chr3R_23117734_23117847 chr3R_23117848_23117947;chr3R_23117634_23117715 2.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.3655884000000001e-11 K alternative_acceptor CG11155,I_chr4_1151213_1151903,I_chr4_1152220_1152710,I_chr4_1152585_1152687 chr4 + chr4_1154699_1155719 chr4_1154699_1154777 chr4_1154501_1154698;chr4_1155720_1155720 18.18 NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035314999999999999 K alternative_acceptor I_chr2R_9844856_9845327,CG13349,RI_chr2R_9846641_9846709 chr2R - chr2R_9846605_9846709 chr2R_9846641_9846709 chr2R_9846710_9846809;chr2R_9846541_9846604 20.00 NA NA NA NA NA NA 31.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.47 41.53 30.43 41.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG17219,RFI_chr2L_3030576_3030666,GABPI chr2L + chr2L_3030576_3030669 chr2L_3030576_3030666 chr2L_3030562_3030575;chr2L_3030670_3030766 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.041023999999999998 N alternative_acceptor wun2,I_chr2R_5304606_5304660 chr2R + chr2R_5304841_5304916 chr2R_5304841_5304899 chr2R_5304772_5304840;chr2R_5304917_5305073 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.0000000000000001e-06 K alternative_acceptor Pdsw chr2L + chr2L_3466229_3466315 chr2L_3466229_3466297 chr2L_3466160_3466228;chr2L_3466316_3466416 6.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.24 27.08 21.21 NA 29.17 NA NA NA NA NA NA 32.14 NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.2546010838773602e-18 K alternative_acceptor CG32163 chr3L + chr3L_16580348_16580609 chr3L_16580348_16580505 chr3L_16580335_16580347;chr3L_16580610_16580996 76.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA 56.25 NA NA NA NA NA 5.5804215766499998e-07 K alternative_acceptor CG6860,RFI_chr2L_17371821_17372564 chr2L - chr2L_17368389_17372564 chr2L_17371821_17372564 chr2L_17372565_17372642;chr2L_17368289_17368388 13.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Fur1,I_chr3R_21179590_21179870,CEI_chr3R_21210600_21222433,I_chr3R_21257704_21287086 chr3R - chr3R_21177936_21179870;chr3R_21177915_21179870 chr3R_21179590_21179870 chr3R_21179871_21179970;chr3R_21177839_21177914 1.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Mocs1 chr3L + chr3L_11065511_11065569;chr3L_11065511_11065661 chr3L_11065511_11065549 chr3L_11064659_11065510;chr3L_11065662_11066454 2.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0084659999999999996 K alternative_acceptor CG31033,RI_chr3R_25658089_25658914 chr3R - chr3R_25658089_25658914;chr3R_25658071_25658914 chr3R_25658095_25658914 chr3R_25658915_25659003;chr3R_25657989_25658070 12.12 NA NA 36.84 NA NA 35.90 NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.5474322112499988e-16 K alternative_acceptor Atg18,I_chr3L_8182683_8182941 chr3L + chr3L_8180294_8180578;chr3L_8180294_8180586 chr3L_8180294_8180540 chr3L_8180118_8180293;chr3L_8180587_8180676 5.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1999999999999999e-05 K alternative_acceptor CG8043,CG11755 chr3R + chr3R_4502770_4502817;chr3R_4502770_4502843;chr3R_4502770_4502810 chr3R_4502770_4502834 chr3R_4502645_4502769;chr3R_4502844_4503955 90.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0032039999999999998 N alternative_acceptor CG1674,F_chr4_258186_259747,R_chr4_261460_261560,I_chr4_263840_263891,I_chr4_264634_265805 chr4 + chr4_261460_263113;chr4_261460_261555 chr4_261460_263086 chr4_261360_261459;chr4_263114_263305 64.71 NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K alternative_acceptor dnc,I_chrX_3150245_3150319,I_chrX_3150351_3152643 chrX + chrX_3226580_3228183 chrX_3226580_3228177 chrX_3226475_3226579;chrX_3228184_3228364 60.00 NA NA NA NA NA 25.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.35 NA NA 18.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3857818855999999e-08 K alternative_acceptor loj,F_chr3L_6089225_6089305 chr3L + chr3L_6088118_6088212 chr3L_6088118_6088192 chr3L_6088112_6088117;chr3L_6088213_6088443 80.00 NA NA NA NA NA NA 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0082299999999999995 K alternative_acceptor CE_chrX_20766225_20927825,CG1529,RI_chrX_20902550_20902613 chrX - chrX_20902550_20902613 chrX_20902561_20902613 chrX_20902614_20902713;chrX_20902450_20902549 16.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00050699999999999996 K alternative_acceptor 14-3-3epsilon,I_chr3R_14068632_14073155,RI_chr3R_14074062_14074138,I_chr3R_14074016_14074138 chr3R + chr3R_14073874_14073954;chr3R_14073874_14073939;chr3R_14073874_14073942 chr3R_14073874_14073936 chr3R_14073693_14073873;chr3R_14073955_14074015 26.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor Tif-IA chr2L + chr2L_22250315_22250432 chr2L_22250315_22250371 chr2L_22250120_22250314;chr2L_22250433_22250483 94.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012112 K alternative_acceptor pds5,RI_chr2R_7915738_7915799,I_chr2R_7922306_7922992 chr2R + chr2R_7915738_7916057 chr2R_7915738_7915799 chr2R_7915638_7915737;chr2R_7916058_7916160 21.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00029103619 K alternative_acceptor Pect,I_chr2L_13207997_13208109,E_chr2L_13208285_13210076 chr2L + chr2L_13208778_13209492;chr2L_13208778_13209501;chr2L_13208778_13209471 chr2L_13208778_13209435 chr2L_13208665_13208777;chr2L_13209502_13209599 18.87 NA NA 43.60 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor tou,I_chr2R_7468394_7468453,RI_chr2R_7474644_7475275,I_chr2R_7479681_7491857,I_chr2R_7504956_7505020 chr2R - chr2R_7469255_7470519 chr2R_7469651_7470519 chr2R_7470520_7474530;chr2R_7469133_7469254 10.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.216e-09 N alternative_acceptor CG1416,I_chr2L_21758100_21758179,I_chr2L_21758143_21758183,I_chr2L_21758143_21758209 chr2L + chr2L_21758143_21758201;chr2L_21758143_21758209;chr2L_21758143_21758183 chr2L_21758143_21758205 chr2L_21758116_21758142;chr2L_21758210_21758279 1.19 NA NA NA NA NA NA NA NA 16.87 NA NA NA 11.31 14.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor I_chr3L_834336_834491,CG13887,Gr61a chr3L + chr3L_837946_838048;chr3L_837946_838021 chr3L_837946_838012 chr3L_837877_837945;chr3L_838049_838624 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.78 37.74 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 29.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG17224,RI_chr2L_3017869_3017958,RI_chr2L_3018025_3018085,RI_chr2L_3018082_3018278,RI_chr2L_3022346_3022422,CG3605 chr2L - chr2L_3018025_3018163;chr2L_3018018_3018163;chr2L_3018082_3018163 chr2L_3018038_3018163 chr2L_3018164_3018185;chr2L_3017982_3018017 2.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.5188422999999998e-05 K alternative_acceptor mus210,RI_chr2R_11200323_11202068,RI_chr2R_11200323_11202128,chr2R_11200326_11200570.0,chr2R_11200670_11201286.0 chr2R + chr2R_11200323_11202122 chr2R_11200323_11202068 chr2R_11200223_11200322;chr2R_11202123_11202168 3.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 N alternative_acceptor NTPase chr2L - chr2L_2881305_2881381 chr2L_2881321_2881381 chr2L_2881382_2882511;chr2L_2881215_2881304 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor bon chr3R + chr3R_16435123_16435685 chr3R_16435123_16435661 chr3R_16434948_16435122;chr3R_16435686_16436022 7.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 20.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.6548999999999995e-08 K alternative_acceptor hppy,I_chr2R_15105700_15106080,I_chr2R_15106144_15108248 chr2R + chr2R_15108288_15111557 chr2R_15108288_15110744 chr2R_15108271_15108287;chr2R_15111558_15111891 84.85 NA NA NA NA NA 97.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 99.30 95.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor CG32138 chr3L + chr3L_14058259_14059498;chr3L_14058259_14058715 chr3L_14058259_14058688 chr3L_14058172_14058258;chr3L_14059499_14060368 4.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_acceptor RPA2,RI_chr2L_20925851_20925909 chr2L - chr2L_20925824_20925913 chr2L_20925851_20925913 chr2L_20925914_20925975;chr2L_20925751_20925823 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor I_chr2L_11009331_11009442,dUTPase,I_chr2L_11011380_11011453 chr2L + chr2L_11011419_11011482;chr2L_11011419_11011479 chr2L_11011419_11011471 chr2L_11011335_11011418;chr2L_11011483_11011553 81.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.52 NA NA NA NA NA NA NA 64.58 NA NA NA NA 66.08 NA NA NA NA 65.83 NA NA 63.86 63.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.29 0.0 K alternative_acceptor Axs,RI_chrX_16575605_16575790,RI_chrX_16575870_16575942 chrX - chrX_16575605_16575942 chrX_16575870_16575942 chrX_16575943_16576042;chrX_16575505_16575604 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.017691999999999999 K alternative_acceptor R_chr2L_8083458_8089184,R_chr2L_8083458_8089393,Bsg,I_chr2L_8088454_8089057,I_chr2L_8107426_8107747 chr2L + chr2L_8083637_8089393 chr2L_8083637_8089184 chr2L_8083592_8083636;chr2L_8089394_8089493 81.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.047898999999999997 K alternative_acceptor CG32202 chr3L + chr3L_18675478_18675538 chr3L_18675478_18675524 chr3L_18675302_18675477;chr3L_18675539_18675973 4.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062230000000000002 K alternative_acceptor Aldh-III,RE_chr2R_3355332_3355720,I_chr2R_3356541_3356614,RI_chr2R_3357578_3357636,I_chr2R_3361118_3361226,I_chr2R_3361349_3361499 chr2R - chr2R_3354556_3354987 chr2R_3354822_3354987 chr2R_3354988_3355138;chr2R_3354549_3354555 85.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016612999999999999 K alternative_acceptor CG30492,C_chr2R_3522706_3523025,RI_chr2R_3536203_3536977,I_chr2R_3543397_3543455 chr2R + chr2R_3528123_3535801 chr2R_3528123_3528336 chr2R_3527622_3528122;chr2R_3535802_3535913 16.67 NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA 53.57 NA 32.35 NA NA NA NA NA NA 31.08 NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA 31.82 NA NA 35.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG42596 chr2RHet + chr2RHet_1862145_1905052 chr2RHet_1862145_1862272 chr2RHet_1862028_1862144;chr2RHet_1905053_1905102 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor CG31158,CI_chr3R_18432763_18433113,CG31159 chr3R + chr3R_18433031_18433113 chr3R_18433031_18433110 chr3R_18432919_18433030;chr3R_18433114_18433213 16.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.035770000000000003 K alternative_acceptor CG17683,I_chr2R_18774_18869 chr2R + chr2R_18774_18851;chr2R_18774_18869 chr2R_18774_18826 chr2R_18768_18773;chr2R_18870_18969 85.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00038000000000000002 K alternative_acceptor CG15032,I_chrX_15200613_15200682 chrX + chrX_15200613_15204410 chrX_15200613_15200682 chrX_15200513_15200612;chrX_15204411_15205252 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_acceptor plx,noncoding_14842 chr3R + chr3R_1511993_1512866;chr3R_1511993_1512878 chr3R_1511993_1512762 chr3R_1511864_1511992;chr3R_1512879_1513091 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.018998000000000001 K alternative_acceptor CG11089 chr3R + chr3R_20702857_20704778 chr3R_20702857_20702940 chr3R_20702788_20702856;chr3R_20704779_20704841 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA 90.00 NA NA 76.00 NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.79 3.9555515560813736e-16 K alternative_acceptor Caki,I_chr3R_17645303_17645375 chr3R - chr3R_17644846_17645375 chr3R_17645303_17645375 chr3R_17645376_17645475;chr3R_17644740_17644845 19.70 NA NA 1.37 NA NA NA NA NA NA 6.25 NA NA NA NA 38.93 NA NA NA NA NA 46.00 NA NA NA NA NA NA 52.75 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 39.39 NA NA NA NA NA NA NA 46.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.22 0.0 K alternative_acceptor gish chr3R + chr3R_12100604_12100675;chr3R_12100604_12100709 chr3R_12100604_12100684 chr3R_12100535_12100603;chr3R_12100710_12100891 6.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00012999999999999999 K alternative_first_exon Mhcl chr3R - chr3R_11899125_11902835 chr3R_11899125_11900139 chr3R_11902836_11903063 chr3R_11900140_11901886 chr3R_11898756_11899124 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K alternative_first_exon CG7145 chr3L - chr3L_21832932_21833106;chr3L_21832932_21834330 chr3L_21832932_21833198,chr3L_21832932_21833150 chr3L_21834331_21834464 chr3L_21833199_21833227 chr3L_21832766_21832931 68.75 NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.61 NA 44.44 NA NA NA 52.94 NA NA 45.45 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1917047893760003e-30 K alternative_first_exon CG4050 chr2R - chr2R_17014639_17015906 chr2R_17014639_17014906 chr2R_17015907_17015995 chr2R_17014907_17015065 chr2R_17013411_17014638 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0021900000000000001 K alternative_first_exon Amun chrX - chrX_11607842_11608272;chrX_11607842_11608590,chrX_11607842_11608507 chrX_11607842_11608054 chrX_11608591_11608934 chrX_11608055_11608246 chrX_11607788_11607841 10.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0038909999999999999 K alternative_first_exon regucalcin chrX + chrX_11906584_11910035,chrX_11909600_11910035;chrX_11906562_11910035 chrX_11908555_11910035 chrX_11906467_11906561 chrX_11908452_11908554 chrX_11910036_11910754 73.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.07 NA NA NA NA NA NA 43.71 NA NA NA 45.50 NA NA NA NA NA NA NA 47.95 NA NA NA 48.98 NA NA 58.48 NA NA NA NA NA 87.45 NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG4199 chrX - chrX_1962457_1964222;chrX_1962457_1965392 chrX_1962457_1964499 chrX_1965393_1965869 chrX_1964500_1964607 chrX_1960468_1962456 10.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG5976 chr3L + chr3L_20467744_20468664 chr3L_20468598_20468664 chr3L_20467566_20467743 chr3L_20468070_20468597 chr3L_20468665_20470103 76.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029855 K alternative_first_exon CG33523 chr3L + chr3L_5920177_5921323,chr3L_5919935_5921323;chr3L_5921008_5921323;chr3L_5918725_5921323 chr3L_5920167_5921323 chr3L_5920882_5921007;chr3L_5918501_5918724 chr3L_5919971_5920166 chr3L_5921324_5921396 82.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 40.62 NA NA NA 52.27 NA NA NA NA NA NA NA 59.26 NA NA NA 61.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.66 0.0 N alternative_first_exon CG5004 chrX + chrX_17024772_17024996,chrX_17024712_17024996;chrX_17023319_17024996 chrX_17024604_17024996 chrX_17023183_17023318 chrX_17024456_17024603 chrX_17024997_17025192 23.70 NA NA NA NA NA 36.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9002672999999993e-05 K alternative_first_exon tmod chr3R + chr3R_26389204_26397530;chr3R_26359230_26397530 chr3R_26397152_26397530 chr3R_26388894_26389203;chr3R_26358605_26359229 chr3R_26396879_26397151 chr3R_26397531_26397683 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0031909999999999998 K alternative_first_exon wdp chr2R - chr2R_18195762_18197434,chr2R_18195762_18198647;chr2R_18195762_18199200 chr2R_18195762_18198588 chr2R_18199201_18199425 chr2R_18198589_18198811 chr2R_18195713_18195761 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.048634999999999998 K alternative_first_exon G-oalpha47A chr2R + chr2R_6327137_6335703 chr2R_6333130_6335703 chr2R_6325875_6327136 chr2R_6332752_6333129 chr2R_6335704_6335888 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00098700000000000003 K alternative_first_exon Pk61C chr3L + chr3L_135385_135457,chr3L_129909_135457,chr3L_134082_135457,chr3L_132936_135457,chr3L_131959_135457,chr3L_131934_135457;chr3L_132056_135457,chr3L_132531_135457;chr3L_132810_135457 chr3L_129889_135457 chr3L_131849_132055;chr3L_132733_132809 chr3L_129452_129888 chr3L_135458_135842 57.32 NA NA NA NA NA NA NA NA 82.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.95 NA NA NA NA 78.50 NA 73.85 NA NA NA NA 69.16 76.32 NA NA NA NA NA NA 80.39 NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA 0.0 K alternative_first_exon Imp chrX - chrX_10693027_10707281;chrX_10693027_10699298 chrX_10693027_10693783 chrX_10707282_10708126;chrX_10699299_10699502 chrX_10693784_10693957 chrX_10692652_10693026 24.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.24 10.87 NA NA NA NA NA NA NA 35.90 38.10 41.46 NA 4.17 NA NA NA NA 6.90 NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.06291928069669e-18 K alternative_first_exon CG31729 chr2L + chr2L_13291292_13297618 chr2L_13296746_13297618 chr2L_13290006_13291291 chr2L_13296349_13296745 chr2L_13297619_13298456 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.75 NA 61.02 NA 62.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.61 NA NA 61.46 NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA 51.67 0.0 K alternative_first_exon CG1553 chr2R - chr2R_3692444_3693730 chr2R_3692444_3692926,chr2R_3692444_3692605 chr2R_3693731_3693904 chr2R_3692927_3693047 chr2R_3691017_3692443 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.44 NA NA 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.24 23.08 NA NA NA NA NA NA NA 22.22 NA NA NA NA NA NA NA 1.289476488918781e-08 K alternative_first_exon CG33170 chr3L + chr3L_22858026_22858870 chr3L_22858797_22858870 chr3L_22857700_22858025 chr3L_22858586_22858796 chr3L_22858871_22858924 15.79 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 2.56 NA NA 2.94 NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA 8.9127547456621132e-09 N alternative_first_exon ash2 chr3R + chr3R_20477425_20477582,chr3R_20476974_20477582;chr3R_20476717_20477582 chr3R_20477353_20477582 chr3R_20476372_20476716 chr3R_20477249_20477352 chr3R_20477583_20477963 46.88 NA NA NA NA NA NA 62.50 NA 27.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 31.25 30.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.4596063531121153e-09 K alternative_first_exon Eip74EF chr3L - chr3L_17558826_17590559 chr3L_17558826_17567892 chr3L_17590560_17591067 chr3L_17567893_17569726 chr3L_17558457_17558825 96.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6140390000000001e-11 K alternative_first_exon CG9485 chr2R + chr2R_17201538_17201928,chr2R_17200086_17201928,chr2R_17201333_17201928,chr2R_17200593_17201928,chr2R_17201485_17201928;chr2R_17200246_17201928,chr2R_17200289_17201928 chr2R_17201222_17201928 chr2R_17200185_17200245 chr2R_17200926_17201221 chr2R_17201929_17202269 76.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.8383729999999999e-05 K alternative_first_exon CG34360 chr3R + chr3R_5701946_5756085 chr3R_5755449_5756085 chr3R_5700403_5701945 chr3R_5754639_5755448 chr3R_5756086_5756267 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 71.43 NA NA NA NA 71.43 33.33 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA 72.22 NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_first_exon Hr78 chr3L - chr3L_21488969_21490390 chr3L_21488969_21489526,chr3L_21488969_21489520 chr3L_21490391_21490585 chr3L_21489527_21489841 chr3L_21488699_21488968 97.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.9999999999999998e-06 K alternative_first_exon PNUTS chr2L + chr2L_870553_871340 chr2L_871275_871340 chr2L_870464_870552 chr2L_871096_871274 chr2L_871341_871576 40.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.93 NA NA 19.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.33 3.2288222032981938e-07 K alternative_first_exon prominin-like chr3L - chr3L_3121200_3122395,chr3L_3121200_3122592;chr3L_3121200_3127652 chr3L_3121200_3126866 chr3L_3127653_3127723 chr3L_3126867_3127216 chr3L_3120668_3121199 90.59 NA NA 78.54 77.52 79.53 NA NA NA NA 67.42 NA NA NA 76.71 79.12 NA NA NA NA 77.08 73.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG3125 chrX - chrX_5637946_5640804 chrX_5637946_5638388 chrX_5640805_5641257 chrX_5638389_5638591 chrX_5632694_5637945 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 43.90 NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5452878036623656e-07 K alternative_first_exon Indy chr3L - chr3L_18825085_18839135 chr3L_18825085_18833472,chr3L_18825085_18833375 chr3L_18839136_18839360 chr3L_18833473_18833602 chr3L_18825047_18825084 65.35 NA 77.45 NA 77.63 NA NA NA NA 49.23 NA NA NA NA 75.93 NA NA 77.38 NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA 26.92 33.33 50.51 NA 50.00 30.37 NA 50.91 38.96 NA NA NA 42.42 42.47 NA NA 50.00 47.06 46.24 NA 37.60 76.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG10249 chr2R - chr2R_10793459_10794529,chr2R_10793459_10794992;chr2R_10793459_10797728 chr2R_10793459_10793522 chr2R_10797729_10798374 chr2R_10793523_10793586 chr2R_10793019_10793458 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023698 K alternative_first_exon E(Pc) chr2R + chr2R_7340391_7340897,chr2R_7340381_7340897,chr2R_7340788_7340897,chr2R_7339807_7340897,chr2R_7339818_7340897;chr2R_7339889_7340897 chr2R_7340386_7340897 chr2R_7339722_7339888 chr2R_7340292_7340385 chr2R_7340898_7341974 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011957000000000001 K alternative_first_exon CG6231 chr3R - chr3R_15445103_15446336;chr3R_15445103_15453165 chr3R_15445103_15458055 chr3R_15446337_15446860;chr3R_15453166_15453476 chr3R_15458056_15458440 chr3R_15444807_15445102 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.028504999999999999 K alternative_first_exon Su(var)2-10 chr2R + chr2R_5003957_5004682 chr2R_5004357_5004682 chr2R_5003631_5003956 chr2R_5004125_5004356 chr2R_5004683_5005357 36.46 NA NA NA NA NA 53.49 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.93 49.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.8334464974200007e-15 K alternative_first_exon Stat92E chr3R - chr3R_16367815_16377802 chr3R_16367815_16376442 chr3R_16377803_16378034 chr3R_16376443_16376852 chr3R_16367402_16367814 82.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.22 NA 66.67 NA NA NA 66.67 64.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1356989757270837e-12 K alternative_first_exon CG1275 chr3L - chr3L_2253987_2255538;chr3L_2253987_2256605 chr3L_2253987_2257111 chr3L_2255539_2256011;chr3L_2256606_2256758 chr3L_2257112_2257409 chr3L_2253777_2253986 93.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon tacc chr3R - chr3R_563461_565232;chr3R_563461_565293 chr3R_563461_567573 chr3R_565233_565269;chr3R_565294_565365 chr3R_567574_569904 chr3R_563195_563460 81.82 NA NA NA 66.67 NA NA NA 67.16 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.00 NA 1.1517991344034563e-24 K alternative_first_exon ced-6 chr2R - chr2R_5325238_5329037,chr2R_5325238_5332177;chr2R_5325238_5329011,chr2R_5325238_5328696 chr2R_5325238_5328206 chr2R_5329012_5329065 chr2R_5328207_5328300 chr2R_5324925_5325237 78.40 NA NA NA 67.68 NA 65.16 64.76 66.59 NA 64.67 NA NA NA NA NA 63.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 89.46 NA NA NA 89.90 90.00 NA NA 91.95 NA NA NA NA 89.02 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG2246 chr3R - chr3R_26421349_26421442;chr3R_26421349_26427138,chr3R_26421349_26426922 chr3R_26421349_26425845 chr3R_26427139_26427211 chr3R_26425846_26426026 chr3R_26421112_26421348 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.7633920000000004e-05 K alternative_first_exon Akap200 chr2L + chr2L_8426446_8426873;chr2L_8415887_8426873 chr2L_8420065_8426873 chr2L_8415690_8415886 chr2L_8419874_8420064 chr2L_8426874_8427093 61.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 51.30 NA NA NA NA NA NA NA NA 49.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.58 NA NA NA NA 48.27 NA NA NA 50.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.68 0.0 K alternative_first_exon boi chrX - chrX_2341631_2344702 chrX_2341631_2341689 chrX_2344703_2344871 chrX_2341690_2341921 chrX_2340923_2341630 1.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA 0.034488999999999999 K alternative_first_exon tkv chr2L - chr2L_5241507_5242385;chr2L_5241507_5271265 chr2L_5241507_5242218 chr2L_5271266_5271353 chr2L_5242219_5242606 chr2L_5241369_5241506 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032201 K alternative_first_exon mip120 chr2R + chr2R_9394299_9397293 chr2R_9397233_9397293 chr2R_9393947_9394298 chr2R_9397123_9397232 chr2R_9397294_9398741 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 0.00061855617599999998 K alternative_first_exon trio chr3L - chr3L_1003822_1003911;chr3L_1003822_1009321 chr3L_1003822_1007216 chr3L_1009322_1009379 chr3L_1007217_1007775 chr3L_1003728_1003821 92.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.06 NA NA NA NA 0.000115 K alternative_first_exon larp chr3R - chr3R_24151542_24156502;chr3R_24151542_24159430;chr3R_24151542_24151775 chr3R_24151542_24153880 chr3R_24159431_24160429;chr3R_24151776_24151963 chr3R_24153881_24154005 chr3R_24151211_24151541 1.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon NAT1 chr2R + chr2R_8803656_8805499,chr2R_8805206_8805499,chr2R_8803837_8805499,chr2R_8805260_8805499;chr2R_8803570_8805499 chr2R_8805410_8805499 chr2R_8803502_8803569 chr2R_8805363_8805409 chr2R_8805500_8808364 4.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.1999999999999997e-05 K alternative_first_exon chic chr2L - chr2L_5979705_5979818,chr2L_5979705_5979951,chr2L_5979705_5979953,chr2L_5979705_5979959,chr2L_5979705_5980025,chr2L_5979705_5980558,chr2L_5979705_5980632,chr2L_5979705_5980639,chr2L_5979705_5980734,chr2L_5979705_5980846;chr2L_5979705_5980952,chr2L_5979705_5980950;chr2L_5979705_5980208 chr2L_5979705_5979939 chr2L_5980953_5981025;chr2L_5980209_5980481 chr2L_5979940_5980098 chr2L_5979412_5979704 83.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.49 72.44 NA NA 59.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.86 0.0 K alternative_first_exon CG4199 chrX - chrX_1965614_1966582;chrX_1965614_1967409,chrX_1965614_1967149;chrX_1965614_1965671 chrX_1965614_1965872 chrX_1967410_1967460;chrX_1965672_1965832 chrX_1965873_1966096 chrX_1965393_1965613 93.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Pi4KIIalpha chr3R - chr3R_1385916_1385973,chr3R_1385916_1386262;chr3R_1385916_1387988 chr3R_1385916_1386498 chr3R_1387989_1388616 chr3R_1386499_1387088 chr3R_1385797_1385915 5.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon ftz-f1 chr3L - chr3L_18748974_18790636 chr3L_18748974_18756428 chr3L_18790637_18791955 chr3L_18756429_18758839 chr3L_18748756_18748973 85.71 NA NA NA NA 63.64 NA 71.43 NA NA 63.64 NA 63.64 NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 66.67 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 75.00 57.14 NA NA 63.64 NA NA 70.00 NA 53.85 NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon scb chr2R + chr2R_11136989_11141550 chr2R_11140516_11141550 chr2R_11136290_11136988 chr2R_11140160_11140515 chr2R_11141551_11142541 88.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001946 N alternative_first_exon Ant2 chrX - chrX_10673729_10680838 chrX_10673729_10674025 chrX_10680839_10680978 chrX_10674026_10674153 chrX_10672923_10673728 88.29 NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA 100.00 100.00 NA NA NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 NA NA NA NA 100.00 5.5565970218353265e-24 K alternative_first_exon CG13784 chr2L - chr2L_7208582_7218908 chr2L_7208582_7209348 chr2L_7218909_7220029 chr2L_7209349_7209462 chr2L_7208417_7208581 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02256 K alternative_first_exon Rad23 chr4 + chr4_328916_330164 chr4_329706_330164 chr4_328723_328915 chr4_329039_329705 chr4_330165_330259 96.88 NA NA 52.31 NA NA NA NA NA NA NA 86.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon f-cup chr3R - chr3R_9524004_9524064;chr3R_9524004_9525813 chr3R_9524004_9524789 chr3R_9524065_9524581;chr3R_9525814_9525867 chr3R_9524790_9525263 chr3R_9523813_9524003 94.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00054199999999999995 K alternative_first_exon PP2A-B' chr3R + chr3R_13994669_13995205;chr3R_13993929_13995205;chr3R_13994844_13995205 chr3R_13993590_13995205 chr3R_13993859_13993928;chr3R_13994500_13994843 chr3R_13993451_13993589 chr3R_13995206_13995820 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00029999999999999997 K alternative_first_exon Pak chr3R + chr3R_2180077_2180635,chr3R_2179262_2180635,chr3R_2180318_2180635,chr3R_2179971_2180635;chr3R_2176677_2180635,chr3R_2177074_2180635 chr3R_2179973_2180635 chr3R_2176628_2176676 chr3R_2179811_2179972 chr3R_2180636_2180902 16.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.64 NA NA NA NA NA 29.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA 3.8171140623000006e-07 K alternative_first_exon hipk chr3L + chr3L_543278_547481 chr3L_546199_547481 chr3L_543070_543277 chr3L_546071_546198 chr3L_547482_548067 20.61 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.93 50.00 46.88 38.46 NA 43.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.69 43.75 56.00 NA NA NA NA 35.82 NA NA NA NA NA NA 42.37 NA NA 55.56 NA NA 46.15 4.26 0.0 K alternative_first_exon SC35 chr2L - chr2L_12433710_12434558 chr2L_12433710_12433834 chr2L_12434559_12434665 chr2L_12433835_12434045 chr2L_12433579_12433709 91.78 NA NA NA NA NA NA 52.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Doa chr3R + chr3R_24714257_24715487 chr3R_24715081_24715487 chr3R_24713799_24714256 chr3R_24714743_24715080 chr3R_24715488_24715606 43.82 NA NA NA NA NA 57.89 NA NA NA NA NA NA NA NA 58.42 NA NA NA NA NA 67.65 NA NA NA NA NA 68.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CAP chr2R + chr2R_6159586_6179999 chr2R_6172307_6179999 chr2R_6159407_6159585 chr2R_6166251_6172306 chr2R_6180000_6180377 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA 46.15 NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA 50.00 NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 26.67 0.0 K alternative_first_exon blot chr3L - chr3L_17402973_17414453 chr3L_17402973_17408320 chr3L_17414454_17414612 chr3L_17408321_17408861 chr3L_17402325_17402972 0.00 NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011707 K alternative_first_exon CtBP chr3R + chr3R_8837742_8845063,chr3R_8837881_8845063,chr3R_8844861_8845063,chr3R_8840915_8845063,chr3R_8837575_8845063,chr3R_8837419_8845063,chr3R_8843123_8845063,chr3R_8838056_8845063,chr3R_8842516_8845063,chr3R_8837594_8845063,chr3R_8837895_8845063,chr3R_8842742_8845063;chr3R_8837471_8845063 chr3R_8844599_8845063 chr3R_8837388_8837470 chr3R_8844512_8844598 chr3R_8845064_8845536 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00062375556000000007 K alternative_first_exon CG7536 chrX - chrX_17976413_17976512,chrX_17976413_17979226;chrX_17976413_17982398 chrX_17976413_17979230 chrX_17982399_17982565 chrX_17979231_17979495 chrX_17976252_17976412 56.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.47 NA NA NA 67.44 NA NA NA 68.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.49 2.4432165275135784e-11 K alternative_first_exon Pdp1 chr3L - chr3L_7813130_7818683;chr3L_7813130_7860340;chr3L_7813130_7823486 chr3L_7813130_7846282 chr3L_7818684_7820387;chr3L_7860341_7860472;chr3L_7823487_7824927 chr3L_7846283_7847289 chr3L_7813088_7813129 0.00 NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 25.00 NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA 33.33 50.00 NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG2911,Spec2 chr3R - chr3R_1448411_1449496 chr3R_1448411_1448469 chr3R_1449497_1449810 chr3R_1448470_1448873 chr3R_1447834_1448410 15.00 NA NA 34.38 NA NA 34.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA 1.7323748640000002e-08 K alternative_first_exon Vrp1 chr2R - chr2R_18000094_18000186;chr2R_18000094_18009397 chr2R_18000094_18003669,chr2R_18000094_18003655 chr2R_18000187_18000294;chr2R_18009398_18010042 chr2R_18003670_18003843 chr2R_17999715_18000093 18.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0069760000000000004 K alternative_first_exon CG5973 chr2L + chr2L_7443388_7443583,chr2L_7440963_7443583;chr2L_7437789_7443583 chr2L_7440852_7443583,chr2L_7440959_7443583,chr2L_7441757_7443583 chr2L_7437506_7437788 chr2L_7440823_7440851 chr2L_7443584_7443832 63.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 47.62 NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA 76.47 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 80.00 50.00 NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA 73.91 0.0 K alternative_first_exon Pfrx chrX + chrX_19400275_19400515,chrX_19400112_19400515;chrX_19398571_19400515;chrX_19390821_19400515;chrX_19400271_19400515 chrX_19392914_19400515 chrX_19398456_19398570;chrX_19390713_19390820;chrX_19399962_19400270 chrX_19392406_19392913 chrX_19400516_19402937 43.75 NA NA NA NA NA 21.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.019491000000000001 K alternative_first_exon fbl chr3L + chr3L_20381467_20381768,chr3L_20381664_20381768,chr3L_20381129_20381768;chr3L_20379955_20381768;chr3L_20381668_20381768;chr3L_20381102_20381768 chr3L_20377959_20381768 chr3L_20379392_20379954;chr3L_20381514_20381667;chr3L_20380716_20381101 chr3L_20377531_20377958 chr3L_20381769_20381947 79.73 NA NA 64.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.0000000000000004e-06 K alternative_first_exon CG12576 chrX - chrX_21878289_21882347 chrX_21878289_21879014 chrX_21882348_21882734 chrX_21879015_21879429 chrX_21876681_21878288 93.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.72 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon BEAF-32 chr2R + chr2R_10658570_10659304;chr2R_10658335_10659304 chr2R_10659148_10659304 chr2R_10657975_10658334 chr2R_10658443_10659147 chr2R_10659305_10660135 52.73 NA NA 65.88 NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.878655491e-08 K alternative_first_exon Gmap chrX + chrX_15381667_15397615 chrX_15393496_15397615 chrX_15381574_15381666 chrX_15393043_15393495 chrX_15397616_15400494 20.00 NA NA 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA 41.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.1455839919671774e-11 K alternative_first_exon psq chr2R + chr2R_6493563_6498054,chr2R_6493640_6498054;chr2R_6449696_6498054;chr2R_6471629_6498054 chr2R_6457648_6498054 chr2R_6449531_6449695;chr2R_6471199_6471628 chr2R_6457312_6457647 chr2R_6498055_6499020 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0075290000000000001 K alternative_first_exon fru chr3R - chr3R_14261513_14303785,chr3R_14261513_14339172;chr3R_14261513_14288988;chr3R_14261513_14340773 chr3R_14261513_14272422 chr3R_14288989_14289003;chr3R_14340774_14341065 chr3R_14272423_14273051 chr3R_14261365_14261512 87.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.013159000000000001 K alternative_first_exon slmo chr2L - chr2L_6047781_6048133 chr2L_6047781_6047899 chr2L_6048134_6048505 chr2L_6047900_6047941 chr2L_6046654_6047780 35.29 NA 56.41 58.33 65.12 NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA 59.09 61.29 NA 57.14 NA NA NA NA NA NA NA 8.70 NA NA NA 58.73 NA NA 67.80 NA NA NA NA NA NA NA 64.44 NA NA 53.52 12.82 11.76 NA 53.52 NA NA NA NA 10.00 NA NA 12.50 NA 5.1110252632070149e-43 K alternative_first_exon dpp chr2L + chr2L_2433918_2455056;chr2L_2429051_2455056;chr2L_2454909_2455056;chr2L_2450326_2455056 chr2L_2452415_2455056 chr2L_2428454_2429050;chr2L_2454739_2454908;chr2L_2449061_2450325 chr2L_2451007_2452414 chr2L_2455057_2455938 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA 59.09 50.00 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA 60.00 NA NA NA 50.00 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.537219115869086e-21 K alternative_first_exon CG17490 chr2L + chr2L_22431120_22432684;chr2L_22431020_22432684 chr2L_22431088_22432684,chr2L_22431301_22432684 chr2L_22430964_22431019 chr2L_22431059_22431087 chr2L_22432685_22433056 73.62 NA NA NA NA NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001297 K alternative_first_exon Actn chrX - chrX_1929235_1936079 chrX_1929235_1930439 chrX_1936080_1936344 chrX_1930440_1930500 chrX_1928988_1929234 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.003908 K alternative_first_exon Nacalpha chr2R - chr2R_8648027_8648309,chr2R_8648027_8648305 chr2R_8648027_8648231 chr2R_8648310_8648355 chr2R_8648232_8648272 chr2R_8647203_8648026 73.99 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.28 NA NA NA 16.18 NA NA NA NA NA NA NA NA 23.19 NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon pnr chr3R + chr3R_11852561_11864308 chr3R_11860829_11864308 chr3R_11851819_11852560 chr3R_11860112_11860828 chr3R_11864309_11864929 9.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG7816 chr3R - chr3R_25691122_25692883;chr3R_25691122_25693465;chr3R_25691122_25692901;chr3R_25691122_25691822;chr3R_25691122_25693711 chr3R_25691122_25694365,chr3R_25691122_25694254 chr3R_25693466_25693539;chr3R_25692902_25692936;chr3R_25691823_25691898;chr3R_25693712_25693793 chr3R_25694366_25694618 chr3R_25690779_25691121 43.08 32.49 NA 53.14 32.96 NA NA NA 30.10 30.94 NA NA NA NA NA NA NA 32.31 NA NA NA NA NA NA NA 59.03 NA NA NA 59.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.33 63.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.33 0.0 K alternative_first_exon CG42321 chr2R - chr2R_9310231_9323707;chr2R_9310231_9313017;chr2R_9310231_9311418 chr2R_9310231_9326111 chr2R_9313018_9313744;chr2R_9311419_9312241 chr2R_9326112_9326550 chr2R_9310107_9310230 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 84.62 NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.4553465099999995e-09 K alternative_first_exon CG33129 chr2L - chr2L_10966410_10967142;chr2L_10966410_10966501;chr2L_10966410_10968133 chr2L_10966410_10968437 chr2L_10966502_10966672;chr2L_10968134_10968206 chr2L_10968438_10968583 chr2L_10965993_10966409 35.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 49.09 NA NA NA NA NA 45.83 NA NA NA NA NA 45.71 49.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA 24.56 2.0097602572264733e-14 K alternative_first_exon shi chrX + chrX_15786451_15786860;chrX_15786200_15786860 chrX_15786285_15786860,chrX_15786603_15786860,chrX_15786615_15786860,chrX_15786474_15786860,chrX_15786394_15786860 chrX_15786149_15786199 chrX_15786274_15786284 chrX_15786861_15787183 87.84 NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.7074824000000005e-05 K alternative_first_exon CG13085,CG16771 chr2L + chr2L_19426895_19427208,chr2L_19426780_19427208;chr2L_19426808_19427208;chr2L_19427121_19427208 chr2L_19426699_19427208 chr2L_19426758_19426807;chr2L_19427087_19427120 chr2L_19426322_19426698 chr2L_19427209_19429224 82.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 96.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 95.88 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.3129030539999997e-08 K alternative_first_exon gro chr3R + chr3R_21868657_21868716,chr3R_21868266_21868716,chr3R_21868622_21868716;chr3R_21868626_21868716;chr3R_21867907_21868716,chr3R_21867987_21868716;chr3R_21868535_21868716 chr3R_21867624_21868716 chr3R_21868542_21868625;chr3R_21867852_21867906;chr3R_21868363_21868534 chr3R_21867432_21867623 chr3R_21868717_21869101 70.59 NA NA NA NA NA 56.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.90 NA NA NA NA 55.00 42.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.291957467532799e-11 K alternative_first_exon Fim chrX - chrX_17183071_17185283;chrX_17183071_17189085 chrX_17183071_17195392 chrX_17185284_17185701;chrX_17189086_17189491 chrX_17195393_17196011 chrX_17181960_17183070 68.44 NA NA NA NA NA NA NA NA 56.38 NA NA 81.55 NA NA NA NA NA NA NA 56.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA 52.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Dif chr2L - chr2L_17420114_17427655;chr2L_17420114_17432857 chr2L_17420114_17428007 chr2L_17432858_17433161 chr2L_17428008_17428195 chr2L_17420066_17420113 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.72 NA NA 72.22 78.69 NA NA NA 72.97 NA NA NA 84.38 NA NA NA 79.41 NA NA 83.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.18 4.3130009749365448e-27 K alternative_first_exon lola chr2R - chr2R_6421474_6421652,chr2R_6421474_6422304;chr2R_6421474_6422354;chr2R_6421474_6421682;chr2R_6421474_6428849 chr2R_6421474_6430409 chr2R_6422355_6422583;chr2R_6421683_6421862;chr2R_6428850_6429184 chr2R_6430410_6430794 chr2R_6421081_6421473 19.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.42 NA NA NA NA NA NA 5.28 NA NA NA 9.48 NA NA NA NA NA NA NA 9.15 NA NA NA 9.48 NA NA 7.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon siz chr3L + chr3L_21028402_21061813;chr3L_21041894_21061813 chr3L_21057802_21061813 chr3L_21027639_21028401;chr3L_21041326_21041893 chr3L_21057091_21057801 chr3L_21061814_21062365 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.10 NA NA NA NA NA 18.18 12.50 NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA 10.53 12.50 NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon SNF4Agamma chr3R + chr3R_17028308_17033340 chr3R_17031773_17033340 chr3R_17028174_17028307 chr3R_17030652_17031772 chr3R_17033341_17033389 35.62 NA NA NA NA NA NA NA 16.50 NA NA NA 20.45 NA NA NA 21.43 19.15 NA NA 19.44 66.43 54.17 NA 50.85 NA NA 51.35 56.00 54.84 NA NA 52.81 NA NA 55.71 NA NA NA 47.37 NA NA 21.43 NA 51.72 NA 47.17 49.30 NA 50.00 NA NA NA NA 22.58 NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon cnc chr3R - chr3R_19023699_19035063 chr3R_19023699_19025874 chr3R_19035064_19035142 chr3R_19025875_19026372 chr3R_19023622_19023698 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.029076999999999999 K alternative_first_exon RpL27A chr2L - chr2L_4458058_4458120,chr2L_4458058_4458140,chr2L_4458058_4458274;chr2L_4458058_4458288 chr2L_4458058_4458162 chr2L_4458289_4458373 chr2L_4458163_4458270 chr2L_4457740_4458057 24.70 NA 6.03 2.46 9.14 5.95 NA 2.21 13.49 34.86 8.28 NA 9.40 NA 4.91 11.33 5.29 NA 4.12 10.18 8.75 NA 46.21 37.88 41.10 6.02 49.52 40.00 59.32 41.18 NA NA NA 4.78 40.00 45.54 49.73 49.17 50.36 48.37 39.35 5.41 4.35 43.33 NA NA 41.13 NA 11.08 38.71 50.44 NA NA 55.47 5.14 46.84 NA NA 0.0 N alternative_first_exon Xrp1 chr3R + chr3R_14744064_14745144;chr3R_14741648_14745144 chr3R_14744348_14745144 chr3R_14740690_14741647 chr3R_14743978_14744347 chr3R_14745145_14745234 45.96 NA NA NA 34.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.99 NA NA NA NA NA NA 58.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.25 NA 0.0 K alternative_first_exon HmgZ chr2R - chr2R_17586106_17590177;chr2R_17586106_17591827 chr2R_17586106_17590181 chr2R_17591828_17591993 chr2R_17590182_17590413 chr2R_17585893_17586105 68.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.92 NA NA NA NA NA 81.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.2237282999999999e-10 K alternative_first_exon Bsg chr2L + chr2L_8088371_8089184,chr2L_8084059_8089184,chr2L_8083458_8089184,chr2L_8083687_8089184,chr2L_8083588_8089184,chr2L_8088517_8089184;chr2L_8083522_8089184,chr2L_8083637_8089184 chr2L_8088454_8089184 chr2L_8083422_8083521 chr2L_8088306_8088453 chr2L_8089185_8089736 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.62 NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA 6.2521911000000012e-05 N alternative_first_exon par-1 chr2R + chr2R_15355419_15356294,chr2R_15355073_15356294;chr2R_15348122_15356294;chr2R_15355147_15356294 chr2R_15353200_15356294 chr2R_15347300_15348121;chr2R_15355019_15355146 chr2R_15351815_15353199 chr2R_15356295_15357843 5.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_first_exon Rho1 chr2R + chr2R_11990604_11991115,chr2R_11991027_11991115,chr2R_11990362_11991115;chr2R_11990326_11991115,chr2R_11990398_11991115 chr2R_11990814_11991115 chr2R_11990293_11990325 chr2R_11990604_11990813 chr2R_11991116_11991279 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.24 NA NA NA NA NA NA NA 93.75 NA NA 84.85 NA NA NA NA NA NA 86.21 NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1787029762376198e-10 K alternative_first_exon CG8177 chr3L + chr3L_9758904_9764754;chr3L_9756800_9764754,chr3L_9757294_9764754 chr3L_9763604_9764754 chr3L_9756652_9756799 chr3L_9763383_9763603 chr3L_9764755_9765019 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.5000000000000003e-05 K alternative_first_exon Tret1-1 chr2R + chr2R_7558686_7560221 chr2R_7559804_7560221 chr2R_7558535_7558685 chr2R_7559466_7559803 chr2R_7560222_7560347 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG32103 chr3L - chr3L_12398261_12398433;chr3L_12398261_12405110 chr3L_12398261_12401209 chr3L_12405111_12405222 chr3L_12401210_12401746 chr3L_12398102_12398260 79.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.8000000000000007e-10 K alternative_first_exon CG4407 chrX - chrX_12797000_12797409;chrX_12797000_12797361 chrX_12797000_12797110 chrX_12797362_12797550 chrX_12797111_12797195 chrX_12796349_12796999 19.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.90 2.86 6.7368723839999993e-08 K alternative_first_exon Ard1,CG42455 chr3L + chr3L_9965498_9966193 chr3L_9966102_9966193 chr3L_9965343_9965497 chr3L_9965866_9966101 chr3L_9966194_9967123 17.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.86 NA NA 3.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.96 3.1803161400000006e-14 K alternative_first_exon svr chrX + chrX_391423_398700 chrX_396970_398700 chrX_390504_391422 chrX_396869_396969 chrX_398701_398818 92.31 NA NA 70.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00011073287500000001 K alternative_first_exon CG7023,CG7029 chr3R + chr3R_18577089_18592332 chr3R_18580991_18592332 chr3R_18576614_18577088 chr3R_18580783_18580990 chr3R_18592333_18592448 31.91 NA NA NA NA NA 45.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.015633999999999999 K alternative_first_exon Camta chr2R + chr2R_5337780_5354376 chr2R_5346263_5354376 chr2R_5337251_5337779 chr2R_5345207_5346262 chr2R_5354377_5354468 14.29 NA NA 32.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.62 NA NA 27.78 NA NA NA 27.27 NA NA NA NA NA 26.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Vha100-2 chr3R - chr3R_14219132_14222507;chr3R_14219132_14224713 chr3R_14219132_14222434 chr3R_14224714_14224876 chr3R_14222435_14222662 chr3R_14218994_14219131 10.16 NA NA 21.98 NA NA 21.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 22.37 NA NA NA NA NA 24.14 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.5262932552045994e-17 K alternative_first_exon orb2 chr3L - chr3L_8942860_8947477,chr3L_8942860_8947032 chr3L_8942860_8945918 chr3L_8947478_8947547 chr3L_8945919_8946333 chr3L_8942757_8942859 59.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046996000000000003 K alternative_first_exon Act5C chrX + chrX_5795047_5796722 chrX_5796130_5796722 chrX_5794897_5795046 chrX_5796013_5796129 chrX_5796723_5798210 21.99 NA NA 9.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.16 NA NA NA NA NA NA NA 37.89 NA 33.94 NA NA 43.15 42.93 46.59 NA NA NA NA NA NA 43.00 NA NA 32.75 NA NA NA 11.77 41.84 NA NA NA 34.31 NA NA NA NA NA 34.10 NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG3530 chr2R - chr2R_19281004_19283951 chr2R_19281004_19282439 chr2R_19283952_19284202 chr2R_19282440_19282926 chr2R_19280887_19281003 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6999999999999998e-05 K alternative_first_exon scramb1 chr3L - chr3L_10215202_10216967 chr3L_10215202_10216005 chr3L_10216968_10217337 chr3L_10216006_10216358 chr3L_10214711_10215201 1.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG34417 chrX + chrX_6437194_6445938 chrX_6440506_6445938 chrX_6437126_6437193 chrX_6440171_6440505 chrX_6445939_6446326 22.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.046955999999999998 K alternative_first_exon Myo61F chr3L + chr3L_1324630_1325994;chr3L_1325261_1325994;chr3L_1321181_1325994 chr3L_1318770_1325994 chr3L_1325124_1325260;chr3L_1321029_1321180 chr3L_1318482_1318769 chr3L_1325995_1326139 54.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 67.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.43 NA 64.91 NA NA 77.24 NA NA NA NA NA NA NA 65.74 NA NA NA 65.48 NA NA 65.62 NA 36.30 NA NA NA NA NA NA NA 70.52 0.0 K alternative_first_exon CG42245,MEP-1 chr3L + chr3L_2636996_2637067;chr3L_2636968_2637067;chr3L_2636002_2637067 chr3L_2633810_2637067 chr3L_2636905_2636967;chr3L_2635762_2636001 chr3L_2633538_2633809 chr3L_2637068_2639553 74.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.09 84.55 NA NA 84.67 NA NA NA NA NA NA NA 87.21 NA 63.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.31384913750864e-15 K alternative_first_exon CG42540 chr3L + chr3L_4556187_4563796 chr3L_4558053_4563796 chr3L_4556087_4556186 chr3L_4557275_4558052 chr3L_4563797_4563896 43.81 NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0024580000000000001 K alternative_first_exon CG32425 chr3L + chr3L_20502617_20503129;chr3L_20490526_20503129,chr3L_20491565_20503129 chr3L_20503061_20503129 chr3L_20490505_20490525 chr3L_20502734_20503060 chr3L_20503130_20503879 19.23 NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA 3.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.3803245573999997e-06 K alternative_first_exon Cyp4d1 chrX - chrX_2054282_2055613 chrX_2054282_2054415 chrX_2055614_2056160 chrX_2054416_2055053 chrX_2053658_2054281 31.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001386612162 N alternative_first_exon CG42245,MEP-1 chr3L + chr3L_2632974_2633537,chr3L_2632253_2633537;chr3L_2631917_2633537,chr3L_2632122_2633537 chr3L_2632467_2633537 chr3L_2631720_2631916 chr3L_2632277_2632466 chr3L_2633538_2633809 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.56 55.56 NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.1808675072000001e-07 K alternative_first_exon CG11652 chr3L - chr3L_11688679_11689514,chr3L_11688679_11689728;chr3L_11688679_11689974 chr3L_11688679_11689450 chr3L_11689975_11690086 chr3L_11689451_11689543 chr3L_11687910_11688678 18.90 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 0.017724 K alternative_first_exon CG18812 chr2R - chr2R_3607502_3609369;chr2R_3607502_3613193 chr2R_3607502_3609538 chr2R_3613194_3613294 chr2R_3609539_3610157 chr2R_3607348_3607501 43.10 NA NA NA NA NA NA NA NA 56.47 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.39 64.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.17 NA NA NA NA NA 54.47 NA NA NA NA NA NA NA 56.30 0.0 K alternative_first_exon Mvl chr3R - chr3R_16884191_16884912,chr3R_16884191_16885834,chr3R_16884191_16885988;chr3R_16884191_16886466 chr3R_16884191_16886003 chr3R_16886467_16886517 chr3R_16886004_16886375 chr3R_16883983_16884190 85.71 NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0245463999999999e-05 K alternative_first_exon CG3625 chr2L - chr2L_284969_290812;chr2L_284969_286306 chr2L_284969_285432 chr2L_286307_286527 chr2L_285433_285776 chr2L_284748_284968 64.71 NA NA NA NA NA NA 43.48 NA NA NA NA NA NA 43.48 42.86 NA NA NA NA NA 96.77 NA NA NA NA NA 85.71 89.47 NA NA NA 88.00 NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA 30.77 84.85 NA NA 92.00 NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 0.0 K alternative_first_exon CG7139 chr3L - chr3L_22063263_22063867 chr3L_22063263_22063385 chr3L_22063868_22064655 chr3L_22063386_22063538 chr3L_22062476_22063262 3.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0035000000000000001 K alternative_first_exon Trf4-1 chrX + chrX_8455293_8457185,chrX_8456196_8457185,chrX_8455902_8457185,chrX_8455795_8457185,chrX_8454992_8457185;chrX_8455225_8457185;chrX_8455100_8457185 chrX_8454847_8457185 chrX_8455113_8455224;chrX_8454960_8455099 chrX_8454668_8454846 chrX_8457186_8457580 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 58.33 NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA NA NA NA NA 60.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 4.3755094893138202e-08 K alternative_first_exon Rcd1 chr2R - chr2R_10039432_10040350 chr2R_10039432_10040098,chr2R_10039432_10039568 chr2R_10040351_10040624 chr2R_10040099_10040188 chr2R_10039112_10039431 37.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 26.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.88 NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0717815000000001e-10 K alternative_first_exon CG2747 chr3R - chr3R_3850792_3856366 chr3R_3850792_3852498 chr3R_3856367_3856505 chr3R_3852499_3852877 chr3R_3850375_3850791 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.00 NA NA NA NA NA 66.67 64.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.2332185440000003e-13 K alternative_first_exon Eip75B chr3L - chr3L_17962608_17986007 chr3L_17962608_17962743 chr3L_17986008_17986096 chr3L_17962744_17964539 chr3L_17962463_17962607 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0027169999999999998 K alternative_first_exon RhoGEF3 chr3L + chr3L_291398_298958;chr3L_293186_298958 chr3L_298140_298958 chr3L_292692_293185 chr3L_297802_298139 chr3L_298959_299016 10.39 NA NA NA NA NA 22.03 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA 23.68 NA NA NA NA NA NA NA NA 27.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG17896 chrX - chrX_386662_387420 chrX_386662_386775 chrX_387421_387527 chrX_386776_387056 chrX_384820_386661 5.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA NA 20.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.3480896000000001e-16 K alternative_first_exon SPoCk chr3L + chr3L_22766852_22770210,chr3L_22768238_22770210;chr3L_22768472_22770210;chr3L_22766817_22770210 chr3L_22743093_22770210 chr3L_22768418_22768471;chr3L_22766638_22766816 chr3L_22742544_22743092 chr3L_22770211_22771924 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.19 NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon spen chr2L + chr2L_182914_183760,chr2L_175448_183760;chr2L_163002_183760 chr2L_183420_183760 chr2L_162592_163001 chr2L_182871_183419 chr2L_183761_185082 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0123 N alternative_first_exon gish chr3R + chr3R_12107275_12107802,chr3R_12107266_12107802,chr3R_12107657_12107802,chr3R_12106734_12107802;chr3R_12100892_12107802 chr3R_12106747_12107802 chr3R_12099874_12100891 chr3R_12106630_12106746 chr3R_12107803_12108130 78.57 NA NA NA 58.33 38.46 NA NA NA NA NA NA 63.16 53.33 NA NA 50.00 NA 46.15 NA NA 57.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 NA NA 90.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.00 NA NA NA NA NA NA 2.3503288680278676e-30 K alternative_first_exon lig chr2R + chr2R_3955788_3957375,chr2R_3956442_3957375,chr2R_3956067_3957375;chr2R_3956340_3957375;chr2R_3957318_3957375 chr2R_3955517_3957375,chr2R_3955586_3957375,chr2R_3955872_3957375 chr2R_3956281_3956339;chr2R_3957252_3957317 chr2R_3955486_3955516 chr2R_3957376_3957784 93.47 NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 59.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 NA NA 78.95 NA NA NA NA NA 83.33 NA NA NA NA NA NA 80.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.14 0.0 N alternative_first_exon SMSr chr3L - chr3L_7369009_7370035;chr3L_7369009_7373720 chr3L_7369009_7369748 chr3L_7373721_7374617 chr3L_7369749_7369880 chr3L_7368505_7369008 13.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023432999999999999 K alternative_first_exon CG42669 chr3L + chr3L_2461269_2463056 chr3L_2462985_2463056 chr3L_2460978_2461268 chr3L_2462861_2462984 chr3L_2463057_2464572 38.38 NA NA NA NA NA NA 54.78 NA 25.45 NA 51.22 61.64 53.33 56.82 60.87 NA NA 55.70 NA NA 18.40 28.21 NA 23.29 NA NA 12.96 26.92 26.44 NA NA 22.22 NA NA NA 26.76 NA 26.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.59 NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Alh chr3R - chr3R_2927820_2944679 chr3R_2927820_2932799 chr3R_2944680_2944770 chr3R_2932800_2934139 chr3R_2927321_2927819 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 2.4682790000000002e-06 K alternative_first_exon spri chrX - chrX_10386366_10390822 chrX_10386366_10386532 chrX_10390823_10391080 chrX_10386533_10387769 chrX_10385539_10386365 47.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.81 NA NA NA NA 57.58 NA NA NA NA NA NA NA 59.18 NA NA NA NA NA NA 59.70 NA NA NA NA 36.62 NA NA NA 27.66 NA 0.0 K alternative_first_exon dl chr2L - chr2L_17443006_17445248;chr2L_17443006_17448277 chr2L_17443006_17449295 chr2L_17445249_17445567;chr2L_17448278_17448510 chr2L_17449296_17449368 chr2L_17442652_17443005 95.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0028440000000000002 N alternative_first_exon CG15211 chrX + chrX_10666660_10671993 chrX_10667200_10671993 chrX_10666577_10666659 chrX_10666825_10667199 chrX_10671994_10672161 100.00 NA NA 71.43 66.67 75.00 NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA 66.67 NA 69.23 75.00 76.09 NA NA 75.00 75.00 60.00 NA 62.07 57.58 42.11 NA 75.00 NA NA NA NA NA 60.00 72.22 67.74 NA NA NA NA 74.47 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 59.09 NA 0.0 K alternative_first_exon CG17159,CG17162 chrXHet - chrXHet_69232_75198;chrXHet_69232_71032;chrXHet_69232_75524 chrXHet_69232_75430,chrXHet_69232_75279,chrXHet_69232_75250 chrXHet_71033_71449;chrXHet_75525_75553 chrXHet_75431_75487 chrXHet_69195_69231 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.38 NA NA NA 31.71 NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA 21.21 60.00 NA 55.88 NA 22.22 NA NA NA 27.27 33.33 NA 27.27 NA NA NA 56.52 NA NA NA NA NA 30.77 0.0 K alternative_first_exon Keap1 chr3R - chr3R_12902616_12905148;chr3R_12902616_12905594,chr3R_12902616_12905144 chr3R_12902616_12903539 chr3R_12905595_12905665 chr3R_12903540_12903820 chr3R_12902299_12902615 69.00 NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 100.00 NA 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 1.444569778829476e-07 K alternative_first_exon alt chr3R - chr3R_13503901_13504925,chr3R_13503901_13505368;chr3R_13503901_13507816;chr3R_13503901_13504865;chr3R_13503901_13504373 chr3R_13503901_13508180,chr3R_13503901_13508178,chr3R_13503901_13508123 chr3R_13507817_13507965;chr3R_13504866_13505009;chr3R_13504374_13504425 chr3R_13508181_13508234 chr3R_13502559_13503900 58.71 NA 71.43 NA 72.92 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 69.57 NA NA 72.73 NA NA NA NA NA NA NA 72.00 NA 44.00 29.41 47.83 NA NA NA NA 31.25 33.33 70.00 72.22 NA NA 42.86 71.57 NA NA 76.47 40.00 NA 35.29 NA NA 40.74 NA NA NA 69.57 69.23 48.57 33.33 0.0 K alternative_first_exon GstD9 chr3R - chr3R_8192634_8193249;chr3R_8192634_8194924 chr3R_8192634_8193260 chr3R_8194925_8194987 chr3R_8193261_8193286 chr3R_8191902_8192633 54.01 NA NA 32.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA 1.8820028394845992e-09 K alternative_first_exon CG31522 chr3R - chr3R_273677_273730,chr3R_273677_273734,chr3R_273677_273755;chr3R_273677_278913 chr3R_273677_276193 chr3R_278914_279036 chr3R_276194_276540 chr3R_273423_273676 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00014808463699999999 K alternative_first_exon gw chr4 - chr4_679135_680594,chr4_679135_680693,chr4_679135_681128,chr4_679135_682359;chr4_679135_679976;chr4_679135_680546,chr4_679135_680503,chr4_679135_680270,chr4_679135_680185 chr4_679135_681206,chr4_679135_681054 chr4_679977_680181;chr4_680547_680557 chr4_681207_681222 chr4_678528_679134 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.6632590999999999e-09 K alternative_first_exon itp chr2R + chr2R_20428544_20442876 chr2R_20433214_20442876 chr2R_20427465_20428543 chr2R_20432950_20433213 chr2R_20442877_20443094 18.84 NA NA NA NA NA 30.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.87 NA NA NA NA NA NA NA 7.77 NA 8.51 7.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.51 NA NA NA NA NA 8.16 NA NA NA NA 5.43 0.0 K alternative_first_exon Hsc70-3 chrX - chrX_11699076_11699138,chrX_11699076_11699335,chrX_11699076_11699923,chrX_11699076_11700062;chrX_11699076_11699321;chrX_11699076_11700901 chrX_11699076_11700276,chrX_11699076_11700110 chrX_11699322_11699393;chrX_11700902_11701212 chrX_11700277_11700394 chrX_11698930_11699075 49.58 NA NA NA NA NA NA NA NA 27.69 NA NA 61.08 NA 60.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.32 NA 34.57 38.97 NA 29.22 35.03 NA 36.30 NA NA NA NA 29.62 35.39 NA NA 21.89 32.43 19.47 NA 21.40 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.36 30.13 0.0 K alternative_first_exon Vha16-1 chr2R - chr2R_2519646_2519840;chr2R_2519646_2520499 chr2R_2519646_2519828,chr2R_2519646_2519810 chr2R_2520500_2520633 chr2R_2519829_2519886 chr2R_2519532_2519645 46.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.72 NA NA NA NA NA NA NA 32.59 NA NA 57.99 NA 32.20 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 56.90 NA NA NA 57.96 NA 0.0 K alternative_first_exon CG7029 chr3R + chr3R_18611128_18612727;chr3R_18592449_18612727 chr3R_18611146_18612727 chr3R_18592333_18592448 chr3R_18610206_18611145 chr3R_18612728_18614239 6.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA 29.63 NA NA NA NA NA NA NA 17.50 23.33 NA 17.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG31064 chr3R - chr3R_23059404_23064246 chr3R_23059404_23062584 chr3R_23064247_23064803 chr3R_23062585_23063568 chr3R_23058970_23059403 13.04 NA NA 40.00 NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon dnc chrX + chrX_3208642_3215073;chrX_3189487_3215073;chrX_3140719_3215073 chrX_3175189_3215073 chrX_3189314_3189486;chrX_3140328_3140718 chrX_3173980_3175188 chrX_3215074_3215250 91.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA 80.00 NA 80.00 NA NA NA NA NA NA 77.27 NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA 78.95 NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA 1.1348381698413482e-25 K alternative_first_exon capu chr2L - chr2L_3887557_3893261;chr2L_3887557_3889430 chr2L_3887557_3888648 chr2L_3893262_3893604;chr2L_3889431_3890031 chr2L_3888649_3888824 chr2L_3886984_3887556 13.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.67 NA NA 28.07 NA NA 32.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.56 2.1293362446720002e-12 K alternative_first_exon stck chr3R + chr3R_4182496_4184192;chr3R_4182818_4184192;chr3R_4183179_4184192 chr3R_4184127_4184192 chr3R_4182689_4182817;chr3R_4183057_4183178 chr3R_4184058_4184126 chr3R_4184193_4184312 70.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.15 NA NA NA NA NA NA NA NA 83.59 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.001698997132 K alternative_first_exon apt chr2R + chr2R_19484322_19484414,chr2R_19453742_19484414;chr2R_19471499_19484414;chr2R_19455916_19484414;chr2R_19452574_19484414 chr2R_19468992_19484414 chr2R_19471332_19471498;chr2R_19455581_19455915;chr2R_19452420_19452573 chr2R_19468615_19468991 chr2R_19484415_19484520 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0047029999999999997 K alternative_first_exon Rtnl1 chr2L - chr2L_5004208_5008180 chr2L_5004208_5004613 chr2L_5008181_5009744 chr2L_5004614_5004923 chr2L_5004172_5004207 13.79 NA NA 30.77 NA NA 34.78 48.00 36.21 NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 3.64 NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA NA NA NA 31.58 NA NA NA NA NA 43.40 NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Mhcl chr3R - chr3R_11916813_11921526 chr3R_11916813_11918566 chr3R_11921527_11921670 chr3R_11918567_11919872 chr3R_11916390_11916812 0.00 NA NA NA NA NA 14.29 NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.9252280000000016e-06 K alternative_first_exon CG18135,CG3808 chr3L - chr3L_18985826_18986825;chr3L_18985826_18988530 chr3L_18985826_18991100 chr3L_18986826_18987093;chr3L_18988531_18988907 chr3L_18991101_18991383 chr3L_18983122_18985825 48.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.71 NA NA NA NA NA NA NA NA 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.37 NA 8.620732548516e-06 K alternative_first_exon Msp-300 chr2L + chr2L_5144786_5146992 chr2L_5146704_5146992 chr2L_5142003_5144785 chr2L_5146386_5146703 chr2L_5146993_5147298 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.35 50.00 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.498606716645295e-08 K alternative_first_exon CG13551 chr2R - chr2R_19270646_19270887 chr2R_19270646_19270842 chr2R_19270888_19270944 chr2R_19270843_19270871 chr2R_19270612_19270645 16.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.78 37.84 NA NA NA NA NA 47.37 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.27 NA NA NA NA NA NA 39.34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5985715157891074e-13 K alternative_first_exon Cg25C chr2L + chr2L_5029637_5030136 chr2L_5029747_5030136,chr2L_5029811_5030136 chr2L_5029615_5029636 chr2L_5029665_5029746 chr2L_5030137_5030237 79.66 NA NA 67.50 60.00 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 65.22 60.61 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.22 52.94 NA 65.08 NA NA NA NA NA NA NA 53.06 NA NA 62.50 NA NA 66.20 62.22 NA NA NA 48.89 NA 53.70 NA NA 65.00 0.0 K alternative_first_exon MED6 chr3R - chr3R_5593601_5594085;chr3R_5593601_5593886 chr3R_5593601_5593698 chr3R_5594086_5594211;chr3R_5593887_5593976 chr3R_5593699_5593832 chr3R_5593573_5593600 78.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.9999999999999999e-06 K alternative_first_exon CkIIbeta chrX + chrX_11686701_11687475,chrX_11687161_11687475,chrX_11686779_11687475;chrX_11686720_11687475 chrX_11686948_11687475,chrX_11686979_11687475,chrX_11687025_11687475,chrX_11687313_11687475 chrX_11686569_11686719 None chrX_11687476_11687551 54.69 67.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.00 38.33 NA 42.86 NA 69.05 NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA 73.91 NA NA 71.11 68.75 71.43 NA 78.05 NA NA NA NA 67.57 44.44 66.67 NA NA 75.64 0.0 K alternative_first_exon Mmp1 chr2R - chr2R_20569965_20574525;chr2R_20569965_20572229 chr2R_20569965_20575418 chr2R_20574526_20574897;chr2R_20572230_20572613 chr2R_20575419_20575704 chr2R_20569737_20569964 49.49 NA NA NA 59.79 NA NA NA NA 32.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.27 NA NA 28.40 19.43 NA NA NA NA NA NA 39.18 20.69 NA NA NA 29.13 38.54 NA 13.66 NA 59.74 NA NA NA NA NA NA 63.39 14.00 0.0 K alternative_first_exon CG11334 chr3R - chr3R_27287691_27288551 chr3R_27287691_27287756 chr3R_27288552_27288730 chr3R_27287757_27287900 chr3R_27287536_27287690 3.92 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.016763 K alternative_first_exon Pde8 chr2R + chr2R_19556891_19559498;chr2R_19557901_19559498 chr2R_19553559_19559498 chr2R_19556630_19556890;chr2R_19557425_19557900 chr2R_19553474_19553558 chr2R_19559499_19559611 89.13 NA NA NA NA NA NA NA NA 73.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.6584000000000001e-08 K alternative_first_exon cu chr3R + chr3R_7023571_7030286;chr3R_7026291_7030286 chr3R_7029508_7030286 chr3R_7026138_7026290 chr3R_7028754_7029507 chr3R_7030287_7030553 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.7041351291255201e-10 K alternative_first_exon eIF-4a chr2L + chr2L_5981836_5983009 chr2L_5982822_5983009 chr2L_5981759_5981835 chr2L_5982524_5982821 chr2L_5983010_5983236 14.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.51 31.08 NA NA NA 28.16 43.44 NA 36.74 NA NA NA NA 48.38 45.57 NA NA NA 31.66 NA NA NA 42.25 NA 35.49 NA NA NA 25.45 32.55 NA NA 54.82 NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Pax chr2L - chr2L_19410644_19410844;chr2L_19410644_19411536;chr2L_19410644_19419868 chr2L_19410644_19426205 chr2L_19411537_19411719;chr2L_19419869_19420191 chr2L_19426206_19426424 chr2L_19410480_19410643 82.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.27 NA NA NA NA NA NA 72.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon lolal chr2R - chr2R_14043671_14043736,chr2R_14043671_14043740,chr2R_14043671_14043901,chr2R_14043671_14044074,chr2R_14043671_14044191,chr2R_14043671_14044461,chr2R_14043671_14045189,chr2R_14043671_14045264,chr2R_14043671_14045285;chr2R_14043671_14043772;chr2R_14043671_14044260,chr2R_14043671_14044251;chr2R_14043671_14045350 chr2R_14043671_14045477,chr2R_14043671_14045446 chr2R_14043773_14043823;chr2R_14044261_14044395;chr2R_14045351_14045444 chr2R_14045478_14045487 chr2R_14043397_14043670 60.87 NA 78.00 71.93 NA NA NA 71.43 NA 42.86 NA NA 72.73 NA NA NA 72.73 NA NA NA NA NA 23.53 16.67 NA NA 14.29 36.84 NA NA NA NA NA NA 35.00 NA NA NA 14.29 NA NA NA NA 47.62 NA NA 38.89 NA NA 31.82 33.33 NA 33.33 41.67 NA 28.57 28.57 76.99 0.0 K alternative_first_exon Snp chr2R + chr2R_17951233_17955931,chr2R_17955706_17955931;chr2R_17948766_17955931,chr2R_17949087_17955931 chr2R_17954788_17955931 chr2R_17948458_17948765 chr2R_17954413_17954787 chr2R_17955932_17956176 73.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.049334999999999997 K alternative_first_exon shep chr3L - chr3L_5163541_5212049 chr3L_5163541_5177314 chr3L_5212050_5212385 chr3L_5177315_5177893 chr3L_5163287_5163540 87.93 NA NA NA NA NA NA NA NA 71.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.33 NA 74.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.24 72.29 68.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.33 NA NA NA 75.00 NA 0.0 K alternative_first_exon CG42637,Gyc76C chr3L - chr3L_19783355_19783974;chr3L_19783355_19786553 chr3L_19783355_19783983 chr3L_19786554_19786663 chr3L_19783984_19784141 chr3L_19783064_19783354 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 26.32 NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA 2.6451238124159999e-05 K alternative_first_exon PRL-1 chr2L - chr2L_16250159_16251240;chr2L_16250159_16257075 chr2L_16250159_16251623 chr2L_16257076_16257603 chr2L_16251624_16251786 chr2L_16250081_16250158 31.65 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.99 NA NA NA NA NA NA NA NA 18.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 19.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon E2f chr3R - chr3R_17452573_17458645,chr3R_17452573_17463474;chr3R_17452573_17471237 chr3R_17452573_17457854 chr3R_17471238_17471265 chr3R_17457855_17458744 chr3R_17452414_17452572 82.69 NA NA NA NA NA NA NA NA 97.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 92.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon NFAT chrX + chrX_13519623_13543409 chrX_13539838_13543409 chrX_13518790_13519622 chrX_13539217_13539837 chrX_13543410_13543534 19.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.156e-09 N alternative_first_exon desat1 chr3R + chr3R_8269076_8270520,chr3R_8267942_8270520,chr3R_8269415_8270520;chr3R_8265434_8270520;chr3R_8269860_8270520;chr3R_8269445_8270520 chr3R_8267331_8270520 chr3R_8265322_8265433;chr3R_8269763_8269859;chr3R_8269304_8269444 chr3R_8267149_8267330 chr3R_8270521_8270840 51.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 64.88 NA NA NA NA NA NA 62.17 NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon tai chr2L + chr2L_9167439_9191614 chr2L_9177631_9191614 chr2L_9166802_9167438 chr2L_9177122_9177630 chr2L_9191615_9191813 83.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 54.55 NA NA NA NA NA 0.001967 K alternative_first_exon Gpo-1 chr2R - chr2R_11748259_11750201;chr2R_11748259_11749386,chr2R_11748259_11749143;chr2R_11748259_11750187 chr2R_11748259_11748565 chr2R_11749387_11749454;chr2R_11750188_11750251 chr2R_11748566_11748849 chr2R_11748106_11748258 16.13 NA NA NA NA NA NA 33.33 31.91 NA NA NA NA 38.10 NA 42.22 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.04 5.71 NA NA NA 5.17 4.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6663152055192679e-20 N alternative_first_exon bs chr2R + chr2R_20232198_20262937 chr2R_20235984_20262937 chr2R_20231236_20232197 chr2R_20235735_20235983 chr2R_20262938_20263289 97.37 NA NA 74.36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Ack chr3L + chr3L_4104119_4110497 chr3L_4108984_4110497 chr3L_4103567_4104118 chr3L_4108205_4108983 chr3L_4110498_4111639 66.67 NA NA NA 84.21 81.48 NA NA NA NA NA 50.60 NA NA NA 82.50 80.00 NA NA 52.48 NA 81.03 NA NA 51.35 NA NA 79.49 34.25 NA 79.41 NA NA NA 83.33 53.49 NA NA NA 48.84 45.16 NA 80.77 41.94 37.78 45.10 55.81 39.53 NA 80.77 NA 54.76 38.10 41.94 NA NA 47.06 50.00 0.0 K alternative_first_exon CG14438 chrX + chrX_6650734_6654020 chrX_6653928_6654020 chrX_6650355_6650733 chrX_6653770_6653927 chrX_6654021_6654243 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012640999999999999 K alternative_first_exon arm chrX - chrX_1793073_1793389,chrX_1793073_1793734,chrX_1793073_1793794,chrX_1793073_1794406;chrX_1793073_1794076;chrX_1793073_1793431,chrX_1793073_1793413 chrX_1793073_1794542 chrX_1794077_1794222;chrX_1793432_1793643 chrX_1794543_1794673 chrX_1793013_1793072 30.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 18.31 NA NA NA 42.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 40.91 NA NA 18.62 NA NA NA 42.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4146738791682836e-09 K alternative_first_exon Ald chr3R - chr3R_22083764_22086879;chr3R_22083764_22086875;chr3R_22083764_22085523;chr3R_22083764_22084708 chr3R_22083764_22087057 chr3R_22086876_22087046;chr3R_22085524_22085554;chr3R_22084709_22084996 chr3R_22087058_22087313 chr3R_22082947_22083763 62.31 77.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 72.43 NA NA NA NA NA NA NA 44.86 86.99 89.30 83.23 NA 81.22 NA 43.29 36.07 NA 35.91 18.85 NA NA 47.62 90.57 91.03 89.82 NA 32.45 NA NA NA 34.19 44.07 88.28 34.22 NA 87.79 87.88 88.20 75.35 84.55 NA 88.57 89.81 29.95 0.0 N alternative_first_exon CG31751 chr2L + chr2L_18677473_18682264 chr2L_18679162_18682264 chr2L_18677203_18677472 chr2L_18678722_18679161 chr2L_18682265_18682389 100.00 NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0020639999999999999 K alternative_first_exon CG10602 chr2L - chr2L_18857404_18858951 chr2L_18857404_18857587,chr2L_18857404_18857541,chr2L_18857404_18857511 chr2L_18858952_18859075 None chr2L_18857177_18857403 97.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.01882 K alternative_first_exon fs(1)h chrX - chrX_7954192_7954783,chrX_7954192_7955332;chrX_7954192_7955408,chrX_7954192_7955296 chrX_7954192_7954935,chrX_7954192_7954909 chrX_7955409_7955469 chrX_7954936_7954950 chrX_7953900_7954191 80.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.64 64.44 60.00 NA NA 62.07 NA NA 53.85 NA NA NA NA 66.67 NA 70.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.75 63.16 NA NA NA NA NA NA 0.0 N alternative_first_exon Tpi chr3R - chr3R_25959817_25959887;chr3R_25959817_25960000 chr3R_25959817_25959972 chr3R_25960001_25960321 chr3R_25959973_25960000 chr3R_25959232_25959816 99.40 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.1000000000000003e-05 K alternative_first_exon CG2201 chr2L - chr2L_21618111_21623365 chr2L_21618111_21618708,chr2L_21618111_21618495 chr2L_21623366_21623599 chr2L_21618709_21618772 chr2L_21618004_21618110 24.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.039218000000000003 K alternative_first_exon tacc chr3R - chr3R_570388_574512 chr3R_570388_571563,chr3R_570388_571518 chr3R_574513_574777 chr3R_571564_572136 chr3R_570186_570387 7.07 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 21.05 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00015899999999999999 K alternative_first_exon Cct1 chr3L + chr3L_1550352_1550713,chr3L_1546677_1550713,chr3L_1548401_1550713,chr3L_1547412_1550713;chr3L_1547590_1550713;chr3L_1549911_1550713 chr3L_1546307_1550713 chr3L_1547334_1547589;chr3L_1549880_1549910 chr3L_1546081_1546306 chr3L_1550714_1551288 85.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.89 NA NA NA NA NA NA 72.12 NA NA NA NA NA NA 0.00076980018500000008 K alternative_first_exon CG8331 chr2R + chr2R_10059732_10059794;chr2R_10058228_10059794 chr2R_10058957_10059794 chr2R_10057971_10058227 chr2R_10058648_10058956 chr2R_10059795_10060027 6.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.13 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Sema-1b chr2R - chr2R_13566288_13566648;chr2R_13566288_13566564;chr2R_13566288_13570399 chr2R_13566288_13570897 chr2R_13566565_13566747;chr2R_13570400_13570499 chr2R_13570898_13571000 chr2R_13565777_13566287 41.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA 0.00021320189800000004 N alternative_first_exon aop chr2L - chr2L_2160583_2160921,chr2L_2160583_2161009,chr2L_2160583_2161012,chr2L_2160583_2161164;chr2L_2160583_2177846 chr2L_2160583_2161232 chr2L_2177847_2178749 chr2L_2161233_2161522 chr2L_2159312_2160582 28.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 39.68 NA NA NA NA NA 55.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.16 NA NA NA NA NA NA NA 43.14 NA NA NA 46.94 NA 0.0 K alternative_first_exon CLIP-190 chr2L + chr2L_17385896_17394429;chr2L_17386394_17394429 chr2L_17389531_17394429 chr2L_17385561_17385895;chr2L_17386146_17386393 chr2L_17389341_17389530 chr2L_17394430_17394492 6.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 0.0 K alternative_first_exon Hph chr3R + chr3R_1090138_1092474,chr3R_1092390_1092474;chr3R_1083844_1092474 chr3R_1090925_1092474,chr3R_1091360_1092474 chr3R_1082763_1083843 chr3R_1090666_1090924 chr3R_1092475_1092754 24.24 NA NA 40.50 NA NA 45.90 44.76 NA NA NA NA NA NA NA 47.66 NA NA 43.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 48.84 NA NA 43.14 NA NA 13.76 NA 14.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.67 NA NA NA NA 12.87 0.0 K alternative_first_exon tkv chr2L - chr2L_5221651_5241368 chr2L_5221651_5236335 chr2L_5241369_5241506 chr2L_5236336_5237358 chr2L_5221463_5221650 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Hrb98DE chr3R + chr3R_24425722_24426439 chr3R_24426291_24426439 chr3R_24425529_24425721 chr3R_24426109_24426290 chr3R_24426440_24426917 63.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.74 NA NA NA 52.04 47.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.09 51.88 NA 43.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 43.45 0.0 K alternative_first_exon robo chr2R - chr2R_18587540_18587701;chr2R_18587540_18588382 chr2R_18587540_18587595 chr2R_18588383_18588467 chr2R_18587596_18587853 chr2R_18587307_18587539 12.77 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.18 NA NA NA 40.91 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0659673226591998e-05 K alternative_first_exon CG8547 chr2R - chr2R_10151721_10155203 chr2R_10151721_10154843 chr2R_10155204_10155419 chr2R_10154844_10155124 chr2R_10151634_10151720 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.040766999999999998 K alternative_first_exon Arf51F chr2R + chr2R_11210536_11210628;chr2R_11210218_11210628,chr2R_11210247_11210628 chr2R_11210546_11210628 chr2R_11209979_11210217 chr2R_11210327_11210545 chr2R_11210629_11210646 57.14 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.41 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 85.71 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.26 2.9567665595999999e-08 K alternative_first_exon CG4004 chrX + chrX_12638983_12640901 chrX_12639901_12640901 chrX_12638499_12638982 chrX_12639391_12639900 chrX_12640902_12641794 36.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.012640999999999999 K alternative_first_exon Papss chr3L + chr3L_19838731_19851477 chr3L_19841499_19851477 chr3L_19838397_19838730 chr3L_19841268_19841498 chr3L_19851478_19851592 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0010330000000000001 K alternative_first_exon ClC-a chr3R - chr3R_7628414_7636085 chr3R_7628414_7631754 chr3R_7636086_7636857 chr3R_7631755_7632283 chr3R_7628306_7628413 40.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 0.0071399999999999996 K alternative_first_exon whd chr2R - chr2R_6360956_6365864 chr2R_6360956_6362759 chr2R_6365865_6366073 chr2R_6362760_6362985 chr2R_6360774_6360955 53.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA 70.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9290264000000002e-05 K alternative_first_exon poly chr3R - chr3R_9188580_9190044;chr3R_9188580_9192481 chr3R_9188580_9190038 chr3R_9192482_9192629 chr3R_9190039_9190310 chr3R_9187574_9188579 38.46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.1932469999999989e-06 N alternative_first_exon LanB1 chr2L + chr2L_7814505_7814575;chr2L_7811773_7814575 chr2L_7814401_7814575 chr2L_7811440_7811772 chr2L_7814369_7814400 chr2L_7814576_7814651 18.92 NA NA NA 32.80 NA NA NA 32.09 NA 37.81 NA NA NA NA NA 33.73 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.4349625531647998e-23 K alternative_first_exon Argk chr3L - chr3L_9043460_9044229;chr3L_9043460_9055006 chr3L_9043460_9050642 chr3L_9044230_9044848;chr3L_9055007_9055567 chr3L_9050643_9050679 chr3L_9041962_9043459 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.42 NA NA NA NA NA 33.33 83.33 NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Atf6 chr2R + chr2R_1032364_1040293 chr2R_1036662_1040293 chr2R_1032202_1032363 chr2R_1034671_1036661 chr2R_1040294_1041693 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.036248000000000002 K alternative_first_exon ps chr3R + chr3R_5257591_5257750;chr3R_5245770_5257750;chr3R_5254375_5257750 chr3R_5243723_5257750 chr3R_5245317_5245769;chr3R_5254284_5254374 chr3R_5243664_5243722 chr3R_5257751_5258561 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0079970000000000006 N alternative_first_exon Not1 chr2R - chr2R_5463890_5465342;chr2R_5463890_5465689 chr2R_5463890_5465194 chr2R_5465690_5465985 chr2R_5465195_5465480 chr2R_5463683_5463889 18.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 7.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023286999999999999 K alternative_first_exon CG10365 chr3R + chr3R_19549425_19554388;chr3R_19549381_19554388,chr3R_19549452_19554388 chr3R_19554263_19554388 chr3R_19549086_19549380 chr3R_19554123_19554262 chr3R_19554389_19554881 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.67 NA NA NA NA NA NA NA 32.94 NA NA NA NA 39.13 NA NA NA 39.13 41.18 6.3231348512486671e-10 K alternative_first_exon Eip75B chr3L - chr3L_17952721_17962462 chr3L_17952721_17954104 chr3L_17962463_17962607 chr3L_17954105_17954914 chr3L_17952482_17952720 77.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.66 NA NA NA NA NA 59.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 57.45 NA NA NA NA NA NA NA NA 6.8794413000000003e-08 K alternative_first_exon ttk chr3R + chr3R_27550933_27552853,chr3R_27552215_27552853,chr3R_27552651_27552853;chr3R_27539992_27552853;chr3R_27551595_27552853 chr3R_27551054_27552853 chr3R_27539591_27539991;chr3R_27551503_27551594 chr3R_27550731_27551053 chr3R_27552854_27553156 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 74.19 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.023262999999999999 K alternative_first_exon Hrb27C chr2L + chr2L_6922369_6922730,chr2L_6921074_6922730,chr2L_6921492_6922730,chr2L_6922095_6922730;chr2L_6921441_6922730;chr2L_6921674_6922730,chr2L_6921799_6922730 chr2L_6920862_6922730 chr2L_6921286_6921440;chr2L_6921666_6921673 chr2L_6920693_6920861 chr2L_6922731_6922826 83.95 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 69.05 NA NA NA NA NA 73.68 NA NA NA NA NA NA NA 67.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 53.33 NA NA 73.58 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.7798642294763188e-12 K alternative_first_exon Dgp-1 chr2R - chr2R_14058825_14059942 chr2R_14058825_14058897 chr2R_14059943_14060112 chr2R_14058898_14058956 chr2R_14058473_14058824 86.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.27 65.71 NA NA 60.00 72.67 0.0 K alternative_first_exon Arf79F chr3L - chr3L_22863166_22863946;chr3L_22863166_22864559 chr3L_22863166_22865156,chr3L_22863166_22865023 chr3L_22863947_22864153;chr3L_22864560_22864855 chr3L_22865157_22865157 chr3L_22862942_22863165 60.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.45 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 3.8870601000000003e-05 K alternative_first_exon Pino chr2L - chr2L_1117517_1128128 chr2L_1117517_1118565 chr2L_1128129_1128345 chr2L_1118566_1119139 chr2L_1117444_1117516 29.07 NA NA 40.67 NA NA NA NA NA 17.07 NA NA NA 39.24 NA NA 40.58 NA 42.11 NA NA NA NA NA NA NA NA 18.67 NA NA 41.94 NA 15.60 41.89 NA NA NA NA 16.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.2529818857902371e-38 K alternative_first_exon bun chr2L - chr2L_12458224_12477114 chr2L_12458224_12460588 chr2L_12477115_12477166 chr2L_12460589_12461237 chr2L_12457138_12458223 68.87 NA NA NA 54.84 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 55.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.8785061009600006e-07 K alternative_first_exon CG17838 chr3R + chr3R_16598605_16617466;chr3R_16606550_16617466;chr3R_16616055_16617466 chr3R_16609303_16617466 chr3R_16598518_16598604;chr3R_16605654_16606549;chr3R_16615708_16616054 chr3R_16608705_16609302 chr3R_16617467_16617585 30.00 NA NA NA NA NA NA NA NA 17.95 NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.83 NA NA 55.56 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 NA NA NA 72.22 62.50 60.00 43.55 NA 52.94 NA NA 43.48 68.42 NA 61.90 64.71 59.38 0.0 K alternative_first_exon CG10107 chr3L - chr3L_6740090_6740958 chr3L_6740090_6740201 chr3L_6740959_6741070 chr3L_6740202_6740405 chr3L_6739971_6740089 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.08 0.014591 N alternative_first_exon C3G chrX - chrX_6683085_6685800;chrX_6683085_6689481;chrX_6683085_6694082;chrX_6683085_6683744 chrX_6683085_6697139 chrX_6685801_6685924;chrX_6689482_6689611;chrX_6694083_6694724;chrX_6683745_6685194 chrX_6697140_6697579 chrX_6682494_6683084 53.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00015300000000000001 K alternative_first_exon Mes2 chr3L + chr3L_22939041_22939369 chr3L_22939285_22939369 chr3L_22938759_22939040 chr3L_22939095_22939284 chr3L_22939370_22939670 17.18 NA 30.71 36.84 NA 28.70 47.14 46.01 33.33 6.09 NA 32.83 42.97 41.88 NA 56.41 35.19 NA 44.17 31.16 28.97 5.84 NA NA NA NA NA 6.54 NA NA 32.74 NA 3.61 40.72 NA NA NA NA NA NA 5.77 NA 34.78 NA 5.96 NA NA 6.49 40.45 NA NA NA NA NA 27.59 NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Su(z)2 chr2R + chr2R_8884317_8886781 chr2R_8884718_8886781 chr2R_8884030_8884316 chr2R_8884628_8884717 chr2R_8886782_8887003 17.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 37.93 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045844000000000003 K alternative_first_exon Idh chr3L - chr3L_8351006_8351115;chr3L_8351006_8353892 chr3L_8351006_8351949,chr3L_8351006_8351655 chr3L_8351116_8351225;chr3L_8353893_8354031 chr3L_8351950_8352117 chr3L_8349503_8351005 40.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.16 NA NA NA 16.67 NA 29.63 30.43 NA NA 29.41 NA 24.19 NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon crol chr2L - chr2L_11806158_11809125 chr2L_11806158_11808013 chr2L_11809126_11809433 chr2L_11808014_11808972 chr2L_11806048_11806157 13.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.9999999999999999e-06 K alternative_first_exon Ptp61F chr3L - chr3L_1346451_1350371 chr3L_1346451_1349198 chr3L_1350372_1350665 chr3L_1349199_1349542 chr3L_1346277_1346450 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.42 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon cenG1A chr2L + chr2L_13836433_13891299 chr2L_13879707_13891299 chr2L_13835567_13836432 chr2L_13878965_13879706 chr2L_13891300_13891532 34.21 NA NA 49.30 NA NA 61.54 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.85 NA NA 44.44 NA NA 78.72 56.92 NA 52.54 NA NA NA NA 49.15 22.08 NA NA NA 44.74 NA NA 49.23 NA NA NA NA NA 60.42 NA NA 17.39 NA NA NA NA 20.51 0.0 K alternative_first_exon CG7530 chr3R - chr3R_10556352_10557105,chr3R_10556352_10557130,chr3R_10556352_10557136,chr3R_10556352_10557148,chr3R_10556352_10557198;chr3R_10556352_10557126 chr3R_10556352_10556761 chr3R_10557127_10557231 chr3R_10556762_10556996 chr3R_10556233_10556351 3.51 NA NA NA NA NA 23.68 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K alternative_first_exon Trxr-1 chrX + chrX_8138258_8140126,chrX_8138531_8140126,chrX_8139272_8140126;chrX_8136765_8140126 chrX_8138093_8140126 chrX_8136517_8136764 chrX_8137625_8138092 chrX_8140127_8140472 24.57 NA NA NA NA NA NA NA NA 34.87 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.96 NA NA NA NA NA 40.54 36.94 NA NA NA 36.43 NA NA 34.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG1399 chr2R - chr2R_3568976_3570030 chr2R_3568976_3569045 chr2R_3570031_3571018 chr2R_3569046_3569339 chr2R_3568813_3568975 13.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.28 NA NA 25.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.49 NA NA NA 24.19 26.47 2.4718497527796801e-16 K alternative_first_exon CG33156 chr2R - chr2R_9437422_9438177;chr2R_9437422_9437491 chr2R_9437422_9439612,chr2R_9437422_9439456 chr2R_9438178_9438952;chr2R_9437492_9437780 chr2R_9439613_9439911 chr2R_9437104_9437421 100.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.8000000000000001e-05 K alternative_first_exon CG42353,CG42354 chrX - chrX_15989724_15991045 chrX_15989724_15990559 chrX_15991046_15991605 chrX_15990560_15990699 chrX_15989491_15989723 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 82.14 NA 84.21 NA NA NA NA 80.77 50.00 NA NA NA NA NA 45.45 41.94 NA NA NA 37.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.74 79.63 46.15 NA NA NA NA 82.76 NA NA NA 1.0796621477508442e-23 K alternative_first_exon cnc chr3R - chr3R_19014852_19017417;chr3R_19014852_19016068 chr3R_19014852_19016744,chr3R_19014852_19016561 chr3R_19017418_19017505;chr3R_19016069_19016141 chr3R_19016745_19016842 chr3R_19013599_19014851 26.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 11.11 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 8.77 15.38 NA NA NA NA 12.90 NA NA NA NA 12.00 NA NA NA 12.90 NA 15.62 NA NA NA NA NA NA NA NA 13.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 6.5917024899738807e-21 K alternative_first_exon CG6950 chr3R - chr3R_7647542_7647697;chr3R_7647542_7647913;chr3R_7647542_7647628 chr3R_7647542_7648144 chr3R_7647914_7647955;chr3R_7647629_7647839 chr3R_7648145_7648210 chr3R_7647002_7647541 63.30 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 12.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.02444 K alternative_first_exon CycG chr3R - chr3R_27427953_27428792,chr3R_27427953_27429034;chr3R_27427953_27436602 chr3R_27427953_27435041 chr3R_27436603_27436706 chr3R_27435042_27435583 chr3R_27427138_27427952 54.86 NA NA NA 39.77 NA NA NA NA 32.83 34.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.43 NA NA NA NA NA NA 30.63 44.84 NA NA 43.52 NA NA NA 69.12 26.33 NA 38.20 NA NA NA NA NA 37.23 NA NA NA NA NA 70.39 NA 39.56 NA NA NA 36.52 33.92 0.0 K alternative_first_exon CaMKI chr4 + chr4_466377_467256,chr4_466896_467256,chr4_466816_467256,chr4_466912_467256;chr4_466592_467256;chr4_467113_467256 chr4_466798_467256,chr4_466858_467256 chr4_466146_466591;chr4_466952_467112 chr4_466794_466797 chr4_467257_467272 40.40 NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.045404 K alternative_first_exon Tfb1 chr2R + chr2R_10250584_10250749 chr2R_10250627_10250749 chr2R_10250556_10250583 chr2R_10250599_10250626 chr2R_10250750_10251018 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 73.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.6408078000000001e-05 K alternative_first_exon UGP chr3L - chr3L_9347175_9351714 chr3L_9347175_9350682 chr3L_9351715_9352031 chr3L_9350683_9350991 chr3L_9347133_9347174 39.02 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.70 58.62 NA NA 20.00 20.00 NA NA NA 54.55 NA NA NA 17.39 NA NA NA NA NA NA 18.75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 15.62 1.9389942867075944e-19 K alternative_first_exon kay chr3R + chr3R_25607566_25617114,chr3R_25607413_25617114,chr3R_25617044_25617114,chr3R_25615618_25617114,chr3R_25616711_25617114,chr3R_25593310_25617114,chr3R_25616533_25617114;chr3R_25616577_25617114;chr3R_25608870_25617114 chr3R_25599544_25617114 chr3R_25614658_25616576;chr3R_25608333_25608869 chr3R_25598616_25599543 chr3R_25617115_25617442 18.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 28.85 NA NA NA NA NA NA 33.00 NA NA NA 33.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.46 NA NA NA NA 32.29 NA NA NA NA 42.03 0.0 K alternative_first_exon CG42231,chif chr2L - chr2L_16343305_16351926 chr2L_16343305_16344425 chr2L_16351927_16352600 chr2L_16344426_16349472 chr2L_16342822_16343304 75.00 NA NA 56.56 NA NA 45.37 59.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 90.00 NA NA NA 85.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 91.18 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon l(1)G0196 chrX + chrX_21889626_21895316 chrX_21894258_21895316 chrX_21889016_21889625 chrX_21893432_21894257 chrX_21895317_21895749 80.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 62.37 NA NA NA 69.23 67.41 70.33 NA NA 68.93 NA NA 61.90 69.44 NA NA 62.96 41.27 0.0 K alternative_first_exon CG4822 chr2L - chr2L_120081_120199;chr2L_120081_121632;chr2L_120081_120420 chr2L_120081_120167 chr2L_121633_121751;chr2L_120421_120742 chr2L_120168_120364 chr2L_119828_120080 47.83 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 72.73 34.44 NA NA 32.14 NA NA NA NA NA NA NA NA 60.34 NA 28.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG4673 chr3R - chr3R_21449128_21450310 chr3R_21449128_21449199 chr3R_21450311_21450382 chr3R_21449200_21449467 chr3R_21448894_21449127 9.38 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.7977599999999989e-07 K alternative_first_exon Kr-h1 chr2L + chr2L_6083741_6092994 chr2L_6092245_6092994 chr2L_6081808_6083740 chr2L_6091417_6092244 chr2L_6092995_6093707 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000126 K alternative_first_exon CG31523 chr3R - chr3R_294322_296218;chr3R_294322_304674,chr3R_294322_304354 chr3R_294322_296835 chr3R_304675_304729 chr3R_296836_297321 chr3R_294186_294321 80.95 NA NA NA NA NA NA NA NA 69.32 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 61.03 0.0 K alternative_first_exon CG11791 chr3R + chr3R_20876091_20876902;chr3R_20875669_20876902 chr3R_20876340_20876902 chr3R_20875514_20875668 chr3R_20876063_20876339 chr3R_20876903_20877278 82.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 93.69 NA NA NA 92.90 NA NA NA NA NA 94.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 60.00 1.735222272e-13 K alternative_first_exon Pde8 chr2R + chr2R_19545538_19552816 chr2R_19548057_19552816 chr2R_19545099_19545537 chr2R_19547895_19548056 chr2R_19552817_19553410 17.48 NA NA 29.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.51 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 3.1650999999999999e-14 K alternative_first_exon KrT95D chr3R - chr3R_19831718_19838704 chr3R_19831718_19832049 chr3R_19838705_19838952 chr3R_19832050_19832300 chr3R_19831410_19831717 26.23 NA NA NA 15.91 NA 38.56 NA NA NA NA NA NA NA NA 43.75 NA NA NA NA 15.66 NA NA 16.06 NA NA 12.78 NA NA NA NA 37.68 NA NA NA NA NA NA 6.21 NA 37.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.56 0.0 K alternative_first_exon CG5059 chr3L - chr3L_20509233_20512316,chr3L_20509233_20512067 chr3L_20509233_20510360,chr3L_20509233_20509798 chr3L_20512317_20512532 chr3L_20510361_20510393 chr3L_20508961_20509232 17.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.35 NA NA NA NA NA 6.25 3.03 NA NA NA NA NA NA NA 2.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00 NA NA NA NA NA NA 4.1738180649984003e-22 K alternative_first_exon CG6904 chr3R - chr3R_10970962_10971422,chr3R_10970962_10972151,chr3R_10970962_10972522,chr3R_10970962_10972786;chr3R_10970962_10972422;chr3R_10970962_10971039 chr3R_10970962_10973196 chr3R_10972423_10973121;chr3R_10971040_10971294 chr3R_10973197_10973329 chr3R_10969988_10970961 69.44 NA NA NA 89.47 NA NA 81.82 NA NA NA NA NA NA 83.67 NA NA 18.57 NA NA NA 48.28 40.62 36.36 NA 80.00 39.13 NA NA NA NA NA NA NA NA 37.50 NA 31.25 NA NA NA 80.72 NA NA NA NA NA 79.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon tra2 chr2R - chr2R_10491007_10491488 chr2R_10491007_10491238 chr2R_10491489_10491643 chr2R_10491239_10491430 chr2R_10490853_10491006 13.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.010489999999999999 K alternative_first_exon CG9674 chr3L - chr3L_16793055_16793173,chr3L_16793055_16793196;chr3L_16793055_16800632 chr3L_16793055_16793200 chr3L_16800633_16800828 chr3L_16793201_16793289 chr3L_16792584_16793054 14.29 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 36.36 NA NA NA NA NA 35.00 37.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.129898448e-09 K alternative_first_exon C1GalTA chr2L - chr2L_8945535_8950977,chr2L_8945535_8950769 chr2L_8945535_8946462 chr2L_8950978_8951200 chr2L_8946463_8946602 chr2L_8945358_8945534 20.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.09 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.70 NA NA 8.70 NA NA NA NA NA NA 33.64 3.6366191868383998e-10 K alternative_first_exon CG13585 chr2R + chr2R_20419624_20419962;chr2R_20419160_20419962,chr2R_20419258_20419962 chr2R_20419902_20419962 chr2R_20419138_20419159 chr2R_20419635_20419901 chr2R_20419963_20420064 29.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 53.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.026328000000000001 K alternative_first_exon Letm1 chr2R - chr2R_20402394_20402462,chr2R_20402394_20402670,chr2R_20402394_20402809;chr2R_20402394_20402785,chr2R_20402394_20402753 chr2R_20402394_20402651 chr2R_20402786_20402813 chr2R_20402652_20402738 chr2R_20402059_20402393 0.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.031375 K alternative_first_exon olf186-F chr2R + chr2R_13738966_13746762 chr2R_13745303_13746762 chr2R_13738384_13738965 chr2R_13743010_13745302 chr2R_13746763_13748075 95.74 NA 82.35 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG5946 chr3L - chr3L_11812008_11814933 chr3L_11812008_11812920 chr3L_11814934_11815282 chr3L_11812921_11813049 chr3L_11811354_11812007 45.24 24.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.025985000000000001 K alternative_first_exon CG12428 chr3R - chr3R_23531574_23532266;chr3R_23531574_23532276 chr3R_23531574_23531981,chr3R_23531574_23531786 chr3R_23532277_23532468 chr3R_23531982_23531987 chr3R_23531186_23531573 63.97 NA NA 42.11 NA NA NA NA NA NA NA 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 53.85 NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA NA NA NA 52.63 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA NA NA 5.707175538639052e-26 K alternative_first_exon CG12360 chr3R - chr3R_8855877_8856135 chr3R_8855877_8855943 chr3R_8856136_8856372 chr3R_8855944_8856018 chr3R_8855641_8855876 1.69 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00098700000000000003 N alternative_first_exon SelR chr3R - chr3R_6692683_6694160 chr3R_6692683_6693693 chr3R_6694161_6694379 chr3R_6693694_6694007 chr3R_6692531_6692682 10.81 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 34.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00031700000000000001 K alternative_first_exon CG3409 chr2R - chr2R_2593704_2602608 chr2R_2593704_2595149 chr2R_2602609_2603370 chr2R_2595150_2595463 chr2R_2592740_2593703 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0038909999999999999 K alternative_first_exon spi chr2L - chr2L_19571768_19571881,chr2L_19571768_19572142,chr2L_19571768_19572503,chr2L_19571768_19575517,chr2L_19571768_19577173;chr2L_19571768_19577185;chr2L_19571768_19575534 chr2L_19571768_19572499 chr2L_19577186_19577324;chr2L_19575535_19575587 chr2L_19572500_19572610 chr2L_19571572_19571767 19.32 NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 31.25 NA NA NA NA NA NA NA 31.31 39.08 NA NA NA NA NA NA NA 35.53 NA NA NA 34.48 NA NA 43.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 40.91 0.0 N alternative_first_exon CG10320 chr2R + chr2R_17545799_17545850,chr2R_17545690_17545850,chr2R_17545686_17545850,chr2R_17545767_17545850;chr2R_17545615_17545850 chr2R_17545781_17545850 chr2R_17545580_17545614 chr2R_17545628_17545780 chr2R_17545851_17545985 38.98 NA 19.05 NA 15.69 16.98 NA 20.63 NA 71.43 NA NA 10.53 NA 18.46 NA 16.28 NA 17.78 20.45 NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 17.54 17.50 NA NA NA NA 75.00 17.14 NA NA NA NA 84.21 22.22 NA NA NA 1.2553282148971299e-41 K alternative_first_exon JhI-21 chr2L - chr2L_12055360_12055714;chr2L_12055360_12055901 chr2L_12055360_12055479 chr2L_12055902_12055982 chr2L_12055480_12055587 chr2L_12055085_12055359 2.12 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 13.70 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.000145 K alternative_first_exon l(3)82Fd chr3R - chr3R_1124212_1125191 chr3R_1124212_1124283 chr3R_1125192_1125295 chr3R_1124284_1124499 chr3R_1123924_1124211 4.76 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 29.17 21.74 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.0906218412799997e-07 K alternative_first_exon CG1358 chr2R - chr2R_3493750_3507837;chr2R_3493750_3501438;chr2R_3493750_3501965 chr2R_3493750_3495926 chr2R_3507838_3507944;chr2R_3501439_3501727;chr2R_3501966_3502040 chr2R_3495927_3495958 chr2R_3493449_3493749 69.23 NA NA NA NA NA NA NA NA 25.00 90.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.0445434999999999e-05 K alternative_first_exon M6 chr3L + chr3L_21500724_21504190;chr3L_21501368_21504190 chr3L_21503381_21504190 chr3L_21500952_21501367 chr3L_21502981_21503380 chr3L_21504191_21504350 33.33 NA NA NA NA NA NA 8.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 80.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.006866e-06 K alternative_first_exon CG3714 chr2L - chr2L_4196780_4197095,chr2L_4196780_4197306,chr2L_4196780_4197872,chr2L_4196780_4197951;chr2L_4196780_4197964 chr2L_4196780_4197146 chr2L_4197965_4198058 chr2L_4197147_4197377 chr2L_4196475_4196779 69.32 NA NA NA NA NA 81.97 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.80 NA NA 85.92 84.62 NA NA NA NA NA NA 90.48 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 91.38 NA NA NA NA NA NA NA 26.32 0.0 K alternative_first_exon Atf-2 chr2R + chr2R_20758769_20765661 chr2R_20764821_20765661 chr2R_20757590_20758768 chr2R_20764231_20764820 chr2R_20765662_20766625 33.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.43 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.032181000000000001 K alternative_first_exon shep chr3L - chr3L_5212386_5269254;chr3L_5212386_5264439 chr3L_5212386_5240653 chr3L_5269255_5269463;chr3L_5264440_5266434 chr3L_5240654_5240943 chr3L_5212050_5212385 36.03 NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.014284 K alternative_first_exon Aats-lys chrX - chrX_9502326_9502751 chrX_9502326_9502454 chrX_9502752_9502917 chrX_9502455_9502688 chrX_9501662_9502325 18.98 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 35.43 NA NA NA NA 31.52 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.7316000000000005e-08 K alternative_first_exon RpL5 chr2L - chr2L_22429111_22429352 chr2L_22429111_22429268 chr2L_22429353_22429419 chr2L_22429269_22429350 chr2L_22428847_22429110 99.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.95 80.70 NA NA 87.04 84.56 NA NA NA NA NA NA 57.03 71.05 NA NA 87.48 NA 87.85 NA 76.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG6656 chr3R + chr3R_17701353_17702296 chr3R_17702199_17702296 chr3R_17701015_17701352 chr3R_17702070_17702198 chr3R_17702297_17702410 98.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 77.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0096270000000000001 N alternative_first_exon Mekk1 chr3R - chr3R_14564321_14564771;chr3R_14564321_14568722 chr3R_14564321_14565018 chr3R_14568723_14569280 chr3R_14565019_14565818 chr3R_14564120_14564320 59.80 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.0000000000000002e-06 K alternative_first_exon CaMKII chr4 - chr4_1071236_1071307,chr4_1071236_1071315,chr4_1071236_1071813,chr4_1071236_1072054;chr4_1071236_1071968;chr4_1071236_1074123 chr4_1071236_1071884,chr4_1071236_1071319 chr4_1071969_1071994;chr4_1074124_1074329 chr4_1071885_1071943 chr4_1071081_1071235 68.99 NA NA NA NA 52.94 54.55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 50.00 NA 47.06 NA NA 58.82 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 79.03 2.3366640280463997e-22 K alternative_first_exon CG34310,cup chr2L + chr2L_6670514_6674300 chr2L_6674229_6674300 chr2L_6669764_6670513 chr2L_6673963_6674228 chr2L_6674301_6674525 37.88 NA NA NA NA NA NA NA NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.14 26.85 18.66 25.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.37 NA NA NA NA NA NA 60.26 0.0 K alternative_first_exon CG2017 chr3R - chr3R_1686127_1687510,chr3R_1686127_1688016;chr3R_1686127_1686928,chr3R_1686127_1686711;chr3R_1686127_1687468 chr3R_1686127_1688092,chr3R_1686127_1687891 chr3R_1686929_1687019;chr3R_1687469_1687624 chr3R_1688093_1688116 chr3R_1685454_1686126 52.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.64 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 63.06 NA NA NA NA NA NA NA NA 65.89 62.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 38.04 NA 40.00 NA NA NA NA NA 65.06 NA NA 0.0 K alternative_first_exon shn chr2R + chr2R_7092334_7095749;chr2R_7077902_7095749 chr2R_7086507_7095749 chr2R_7077845_7077901 chr2R_7086376_7086506 chr2R_7095750_7097362 27.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.17 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0062979999999999998 N alternative_first_exon CG41378 chr2RHet - chr2RHet_1545717_1545955,chr2RHet_1545717_1547044,chr2RHet_1545717_1605870;chr2RHet_1545717_1621569,chr2RHet_1545717_1621473 chr2RHet_1545717_1605712 chr2RHet_1621570_1621578 chr2RHet_1605713_1606048 chr2RHet_1545386_1545716 86.21 NA NA 52.08 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 71.05 68.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 75.24 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG8920 chr2R + chr2R_16208192_16209182,chr2R_16208422_16209182;chr2R_16207528_16209182 chr2R_16208194_16209182 chr2R_16207300_16207527 chr2R_16208002_16208193 chr2R_16209183_16211729 86.96 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 66.67 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0095320000000000005 K alternative_first_exon Rab5 chr2L - chr2L_2361586_2361738,chr2L_2361586_2362590,chr2L_2361586_2362869,chr2L_2361586_2364302,chr2L_2361586_2364480,chr2L_2361586_2364594,chr2L_2361586_2364836;chr2L_2361586_2364640,chr2L_2361586_2364312;chr2L_2361586_2362674;chr2L_2361586_2365060;chr2L_2361586_2363404 chr2L_2361586_2364889 chr2L_2364641_2364697;chr2L_2362675_2362761;chr2L_2365061_2365362;chr2L_2363405_2363501 chr2L_2364890_2364952 chr2L_2361160_2361585 38.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 25.58 NA NA NA NA NA 18.33 19.54 15.89 NA 21.74 12.90 NA 24.39 11.76 NA NA NA 20.00 13.54 NA NA 20.37 NA 18.67 NA 15.91 NA NA NA NA 20.97 NA NA NA NA 14.67 0.0 K alternative_first_exon mrj chr2R - chr2R_12093585_12108627;chr2R_12093585_12097072;chr2R_12093585_12093676;chr2R_12093585_12109174 chr2R_12093585_12097694 chr2R_12097073_12097348;chr2R_12093677_12093767;chr2R_12109175_12109301 chr2R_12097695_12097904 chr2R_12093406_12093584 75.56 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 52.38 NA NA NA NA 47.06 NA NA NA NA NA NA NA 51.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.2097786600000002e-08 K alternative_first_exon tlk chrX + chrX_3656891_3675687,chrX_3634238_3675687,chrX_3674212_3675687,chrX_3618905_3675687;chrX_3615681_3675687;chrX_3674723_3675687;chrX_3667068_3675687 chrX_3670471_3675687,chrX_3671394_3675687 chrX_3615409_3615680;chrX_3674176_3674722;chrX_3666673_3667067 chrX_3670092_3670470 chrX_3675688_3677592 47.83 37.04 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 30.77 NA 3.924963e-05 K alternative_first_exon Rox8 chr3R - chr3R_19872214_19872659,chr3R_19872214_19872663,chr3R_19872214_19872909,chr3R_19872214_19873136,chr3R_19872214_19873214,chr3R_19872214_19873220,chr3R_19872214_19873550;chr3R_19872214_19873834;chr3R_19872214_19873682 chr3R_19872214_19873540 chr3R_19873835_19873987;chr3R_19873683_19873748 chr3R_19873541_19873678 chr3R_19871160_19872213 56.91 NA NA NA NA NA NA 32.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.011247 K alternative_first_exon ATPCL chr2R - chr2R_11887476_11887640,chr2R_11887476_11888411;chr2R_11887476_11888692 chr2R_11887476_11887599 chr2R_11888693_11888765 chr2R_11887600_11887789 chr2R_11887310_11887475 56.15 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 68.99 NA NA NA NA 67.31 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 70.54 NA NA 67.78 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5093711306764999e-10 K alternative_first_exon klar chr3L - chr3L_436850_443219 chr3L_436850_440493 chr3L_443220_443325 chr3L_440494_441079 chr3L_436674_436849 7.06 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.66 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 0.0 K alternative_first_exon 14-3-3zeta chr2R + chr2R_5987237_5991760,chr2R_5991249_5991760;chr2R_5987244_5991760,chr2R_5987356_5991760 chr2R_5988603_5991760,chr2R_5988683_5991760 chr2R_5987193_5987243 chr2R_5988537_5988602 chr2R_5991761_5991914 35.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 24.84 NA NA NA NA NA NA NA 25.17 NA NA NA NA 23.91 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 46.73 NA NA NA 48.15 NA NA NA NA NA NA 48.17 NA 21.35 NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG3563 chr3R + chr3R_10590015_10613778;chr3R_10575996_10613778;chr3R_10611165_10613778 chr3R_10568314_10613778 chr3R_10575928_10575995;chr3R_10610648_10611164 chr3R_10567309_10568313 chr3R_10613779_10614341 59.57 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 81.25 NA NA NA NA NA NA NA NA 74.55 NA NA NA NA NA NA NA 14.89 NA NA NA NA 73.17 NA NA NA NA NA NA NA 78.57 NA NA NA NA NA NA 70.59 NA NA NA NA NA NA NA NA 76.47 85.71 0.0 K alternative_first_exon Nc73EF chr3L + chr3L_16952138_16952198,chr3L_16950952_16952198,chr3L_16950606_16952198;chr3L_16948914_16952198;chr3L_16950615_16952198,chr3L_16950628_16952198 chr3L_16948643_16952198,chr3L_16948692_16952198 chr3L_16948864_16948913;chr3L_16950542_16950614 chr3L_16948605_16948642 chr3L_16952199_16952316 46.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 23.81 26.32 34.62 NA NA 15.79 NA NA NA NA NA NA 20.83 25.00 30.61 26.47 25.71 32.35 NA NA NA 36.36 NA 35.00 26.32 NA 58.23 17.65 17.07 NA NA 18.18 NA 24.00 NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG13349 chr2R - chr2R_9847615_9847752;chr2R_9847615_9847823 chr2R_9847615_9847732 chr2R_9847824_9847909 chr2R_9847733_9847817 chr2R_9847073_9847614 98.39 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 87.10 0.0085839999999999996 K alternative_first_exon galectin chr2L + chr2L_73586_74902,chr2L_74573_74902,chr2L_73898_74902;chr2L_72978_74902 chr2L_73693_74902 chr2L_72388_72977 chr2L_73485_73692 chr2L_74903_75018 31.25 48.33 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 42.03 NA 48.78 NA NA NA NA NA NA 19.23 NA 49.09 17.72 11.86 NA 14.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 1.5784231082583314e-25 K alternative_first_exon CG11984 chr3R - chr3R_4839215_4839655,chr3R_4839215_4839728,chr3R_4839215_4839799,chr3R_4839215_4839889,chr3R_4839215_4840394;chr3R_4839215_4839561;chr3R_4839215_4839851;chr3R_4839215_4839300;chr3R_4839215_4839966 chr3R_4839215_4840589,chr3R_4839215_4840474 chr3R_4839562_4839754;chr3R_4839852_4839944;chr3R_4839301_4839365;chr3R_4839967_4840095 chr3R_4840590_4840610 chr3R_4839038_4839214 57.53 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 45.71 NA NA 68.25 NA 36.00 NA NA NA 70.37 NA NA NA NA NA NA NA NA 68.29 NA 41.18 72.73 NA NA 46.88 NA 67.74 46.67 NA NA NA 47.50 NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon wech chr2R - chr2R_3373673_3377324,chr2R_3373673_3376837 chr2R_3373673_3375960 chr2R_3377325_3377343 chr2R_3375961_3376191 chr2R_3373390_3373672 53.12 NA NA NA NA NA NA 33.80 NA NA NA NA 34.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 33.33 NA NA NA 38.24 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 94.12 NA NA 29.31 NA 93.94 NA NA NA NA NA NA NA NA 7.7501713356768405e-18 K alternative_first_exon wapl chrX - chrX_2049760_2050421 chrX_2049760_2049820 chrX_2050422_2051546 chrX_2049821_2049977 chrX_2047147_2049759 17.50 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 4.76 NA NA NA NA NA 5.26 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 5.45 3.85 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 2.1331667837480002e-11 K alternative_first_exon RpL35 chrX + chrX_5566913_5567030;chrX_5566556_5567030 chrX_5566909_5567030 chrX_5566475_5566555 chrX_5566691_5566908 chrX_5567031_5567167 95.28 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 83.24 NA NA NA NA NA NA 78.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon Ptpmeg chr3L + chr3L_351229_351366,chr3L_348644_351366,chr3L_347747_351366,chr3L_351317_351366,chr3L_347741_351366,chr3L_348218_351366;chr3L_329026_351366 chr3L_347659_351366,chr3L_347780_351366 chr3L_328989_329025 chr3L_347463_347658 chr3L_351367_351778 88.89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 41.67 NA NA NA NA NA NA 76.92 NA NA NA NA NA 75.00 NA 77.27 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon pico chrX - chrX_19730788_19743974;chrX_19730788_19744895 chrX_19730788_19742099 chrX_19743975_19744083;chrX_19744896_19746084 chrX_19742100_19742536 chrX_19729677_19730787 9.23 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 20.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 9.9999999999999995e-07 K alternative_first_exon Hnf4 chr2L - chr2L_8690253_8698848;chr2L_8690253_8704360 chr2L_8690253_8691013 chr2L_8704361_8704540 chr2L_8691014_8691213 chr2L_8689814_8690252 63.79 NA NA 28.89 NA NA 34.21 31.91 45.98 NA NA NA 44.00 41.67 NA 30.00 NA NA NA NA NA 82.14 NA NA NA NA NA NA 77.42 89.77 NA 80.95 86.27 47.46 76.81 78.95 NA NA NA NA 81.67 NA 35.71 NA 80.68 NA NA 85.19 NA NA NA NA NA NA 44.44 NA NA 74.45 0.0 K alternative_first_exon CG9992 chrX - chrX_16277201_16278620 chrX_16277201_16277356 chrX_16278621_16278937 chrX_16277357_16277611 chrX_16276939_16277200 73.68 NA NA 43.18 NA NA 41.57 NA NA 91.67 NA 55.95 44.83 NA NA NA NA 92.16 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 86.49 NA NA NA NA NA NA NA 44.44 NA 88.00 NA 86.21 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0 K alternative_first_exon CG14619 chrX + chrX_21860097_21867984 chrX_21867359_21867984 chrX_21859450_21860096 chrX_21865703_21867358 35.71 NA NA 58.82 15.79 NA NA 17.65 NA NA NA NA 62.50 NA NA 54.55 NA NA NA NA NA NA 11.11 NA 23.53 NA NA 9.30 NA NA 50.00 60.00 58.62 NA NA NA NA 18.18 NA 53.85 50.00 NA NA NA 15.38 NA NA 50.00 NA NA 54.55 NA NA 12.50 11.11 NA 20.00 NA 0.0 N alternative_first_exon CG32280 chr3L + chr3L_3167902_3167941,chr3L_3165352_3167941,chr3L_3165407_3167941,chr3L_3165390_3167941;chr3L_3165222_3167941;chr3L_3165255_3167941 chr3L_3165704_3167941 chr3L_3165182_3165221;chr3L_3165230_3165254 chr3L_3165334_3165703 chr3L_3167942_3168265 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 10.00 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 16.67 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00020027167999999999 K alternative_first_exon Sply chr2R - chr2R_12977881_12979314 chr2R_12977881_12978863 chr2R_12979315_12979462 chr2R_12978864_12979161 chr2R_12977219_12977880 97.40 NA NA 87.10 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.00037500000000000001 K alternative_first_exon rdx chr3R - chr3R_9796825_9796989;chr3R_9796825_9849367;chr3R_9796825_9852599 chr3R_9796825_9807355 chr3R_9796990_9797520;chr3R_9849368_9849616;chr3R_9852600_9852666 chr3R_9807356_9809083 chr3R_9796674_9796824 42.86 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 27.27 NA 27.12 NA NA NA NA NA 78.08 NA NA NA NA NA 66.67 59.32 NA NA NA 64.00 NA NA NA 60.00 NA NA NA NA NA NA NA 65.62 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 0.0